1H0GA

Complex of a chitinase with the natural product cyclopentapeptide argadin from clonostachys
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords CHITINASE B
publication title High Resolution Inhibited Complexes of a Chitinase with Natural Product Cyclopentapeptides - Peptide Mimicry of a Carbohydrate Substrate
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 170
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1h0gA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1h0gA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h0gA01
2W91A 4UCFA 3AIQA 2VX6A 1UUQA 1CXEA 1KXQA 3ARZA 4CU6A 4J7RA 3WUGA 4CU8A 3D3AA 2UY2A 1GQLA 5ABFA 1J0HA 4GKLA 2PF0A 2C0HA 1E4IA 2WHLA 5M17A 3AIEA 5IHSA 5A6AA 1V3IA 2QHAA 3WNOA 4W5UA 1W2PA 2VX5A 1NM9A 2O9PA 3ZT6A 3LPGA 1J18A 4UZSA 3GXDA 1AQMA 1G94A 2J7HA 3KL5A 4ZE5A 2WMFA 4CU7A 2VX7A 2VI0A 2ZXAA 2YDQA 1WDQA 5BRQA 3SCRA 1O6IA 2XIBA 4FK9A 2WLZA 2YBTA 2UWFA 1EH9A 3ZJ8A 2X0HA 3OB8A 5JIWA 3KL3A 2CEQA 1E4LA 4W93A 3WELA 1CIUA 4ZE4A 5A6MA 2G3NA 2JE8A 4HZ8A 4M56A 1E55A 2F2HA 3SCUA 4P8WA 2DH2A 4MB5A 4JFSA 1XYFA 1W1PA 4GO9A 3ZMRA 1KCLA 2WWCA 2GJXB 4LX4A 3VPLA 2FHCA 3WKZA 3DYPA 1B0IA 4F9JA 5A8NA 5A6BD 1FP9A 4F66A 2QPSA 1J9YA 1PAMA 4WKHA 3MSGA 2J7FA 1YQ2A 1GPFA 4MNKA 2D20A 5I0DA 1D7FA 2WZHA 1UZ1A 5HDRA 4CVUA 1ZB5A 1BF2A 1W9UA 1MWOA 1BGAA 1GOOA 3W26A 2GUYA 1E6NA 1R85A 1HNYA 4A3HA 3CBWA 4ATDA 1HX0A 4ACYA 1B2YA 4IPLA 1JZ6A 3W82A 1E0VA 5LA2A 4FF5A 3BSGA 3ZJKA 2ZWYA 5EMYA 3AI0A 3PZIA 1YHTA 1TFVA 2DT3A 4ATLA 4AD3A 4RE4A 1V02E 1CGTA 5A6SA 1L8NA 2JIEA 4D6HA 4FMVA 4MJ4A 2DT0A 3RIKA 4D6EA 1NQ6A 3CHFA 1DWFM 4V27A 2XGBA 1H11A 4JCLA 1KQZA 2G8ZA 4MNLA 5E6ZA 3TOPA 3WIJA 3MMUA 1JFXA 3MS8A 3WF0A 1A47A 3W53A 2VX4A 1JXJA 1JI1A 3M46A 3OGRA 2D24A 2WMIA 1UWUA 1UR2A 3HMCA 1HKJA 4D6DA 2OYMA 1VB9A 3NSNA 4KRUA 5FL1A 2DH3A 3DYMA 3U57A 3G6LA 4MDOA 4D71A 5HBFA 2W66A 1Q6FA 2Q8XA 9CGTA 2VJXA 2VZUA 1R7OA 1V0LA 3OGVA 3BAIA 3D5HA 3W37A 4KMQA 3W6MA 3PZTA 5M3WA 3CHCA 4M81A 4B3LA 3LPOA 5GNYA 5I2UA 1W9DM 2D0HA 1BAGA 1CLXA 4MNJA 4HU0A 2EPKX 3OIHA 2PB1A 4DUWA 2WMGA 5AYBA 4Z2IA 2J7BA 3PZQA 3GYCA 4ZXOA 3MV01 2RTSA 4H8UA 2D49A 2VUYA 5ABHA 2BHUA 3MUAA 2GJXA 1CECA 4MAVA 1VJZA 3M6DA 3GXMA 1OBAA 2EPMX 1KR0A 4P7NA 4HU8A 4N0RA 1XHGA 1BLIA 1ITXA 5FKYA 1B3YA 2GJPA 2WMKA 1K9TA 3BAKA 4J28A 2Y8VA 3AYRA 2D23A 4JL1A 2V3EA 3BMWA 3K8LA 1W32A 1OIMA 5GPRA 1FHLA 4IUGA 4GZJA 3SUSA 3FXYA 3WL1A 3BAXA 1JAKA 2GDVA 5BXSA 2WSKA 4HA4A 3WENA 2AAAA 4DWSA 1E0WA 1B3WA 4OOZA 1G9HA 1B3VA 1QI5A 1H09A 3VGGA 3WNLA 3AS1A 4UTFA 3UEQA 4PUEA 1HKKA 4U2ZA 3FW6A 4U5IA 1QI4A 1B30A 2IUZA 5E0FA 1ED7A 4P7OA 3U5YA 3UG5A 3QHMA 1FFQA 3WD0A 4Z2HA 3THCA 3WH6A 1E6XM 1C7TA 2W92A 4AWEA 4CGTA 2E9LA 2J77A 4LGXA 1EDGA 1V3JA 1W1VA 4N42A 3POCA 3AZRA 2EPOA 2CBVA 2DDXA 4AZ6A 2CPUA 4KGLA 1GUVA 1E5JA 4WIWA 2Y4SA 3WMCA 3WY1A 1R87A 2XG9A 4PSRA 5AY7A 1VEOA 2WHJA 2Y24A 1H5VA 5BXTA 4BA0A 2D1ZA 4FLQA 2Z1SA 4PCTA 4NZCA 1RP9A 2E0PA 1BGGA 1M03A 1JD7A 3VIPA 1WZKA 3N04A 3T0BA 4IISA 1VAHA 4B9YA 1E1FA 2YL8A 1CXHA 3VGFA 1ESWA 3CZGA 2W4XA 3W38A 1OB0A 1RP8A 2IXVA 3CIVA 5A2CA 2W5FA 3QOMA 1JZ2A 2V5DA 2ZUUA 1KBKA 1PJ9A 3DC0A 3MANA 1TA3B 1I1XA 1KGUA 1TUXA 5GNXA 3WNNA 5BRPA 1E70M 1W3JA 5FL0A 2X0YA 1E3ZA 3W81A 3VIGA 2BHYA 5A8PA 4JCMA 1ZJBA 1W3LA 2WNWA 1BFNA 2EPNA 1CEOA 1E40A 1AMYA 3ZT5A 4X9YA 2CKSA 4Q7NA 5CQ1A 3WSUA 1UWSA 2QPUA 2WYSA 3A3HA 3WQ5A 4JFWA 5BROA 4P8XA 1VFUA 3RPMA 4WSKA 2DSKA 1ZU8A 3VMNA 1XC6A 1PX4A 3T2OA 1KWKA 1W9VA 4HMCA 4BZYA 1UWRA 4HMEA 1XSIA 4PMOA 4D6JA 5ABEA 2CESA 4CD8A 3GBEA 4YHGA 4PTWA 3VX1A 2YDRA 3CHDA 1J01A 2CKRA 3VINA 4EK7A 3TP4A 1DEDA 2EBNA 4J3SA 1GONA 4HPGA 5DF0A 1HN1A 1PEZA 2E8ZA 3MO4A 3ZQ9A 5CXPA 2GFTA 3ZT7A 3W27A 1WE5A 3BLKA 1PPIA 1E6SM 2WCGA 1UD5A 1J0JA 5A8OA 1TE1A 3BMVA 3NUKA 2YL5A 4AD4A 1BTCA 1UZ4A 4F8XA 4M8UA 4ZENA 4CD6A 4D1IA 3WF2A 7TAAA 2V3DA 4AD1A 4JAWA 2PWGA 3ARQA 1OD8A 3N11A 1GHSA 1DHKA 1E5NA 1XD1A 4P8UA 1UKTA 4UFKA 3IJ8A 1MFVA 1C91A 3NCOA 3FY1A 3WD3A 1W3KA 3GNPA 1QVBA 4EKJA 5D4YA 1JXKA 1K9EA 4PMVA 2WVTA 1NARA 3F5JA 4JFTA 3QHOA 1UQZA 4D6CA 3ARYA 1FH9A 2XFYA 5ABGA 3QOKA 3VM5A 1Q6CA 1NWSA 1TZ7A 2NW0A 3VKKA 5I77A 3WF3A 3WUFA 4AD5A 3MV11 4UR9A 1Q6EA 3SCSA 1NP2A 1XH1A 2WKGA 5I3DA 4AZIA 1M53A 4FLSA 4TX8A 2VOTA 3GZAA 2XWDA 3W0KA 2CERA 3WNPA 4TXEA 2EPLX 2FH6A 2J4GA 1MQPA 1TA3A 2BY2A 4HA3A 3SUTA 3CUFA 3T08A 1EO7A 3UETA 1E6QM 1OT1A 3MUZ1 3I3DA 1E56A 4QFUA 3HU7A 4B16A 1UR9A 3M7SA 2WZEA 4JKLA 2BVTA 3WH7A 3U5UA 1WDPA 4UNIA 2ZUTA 2Z1KA 4DM1A 3UESA 4MB3A 1B3ZA 4J27A 4HMDA 1E6RA 1WZAA 2XJ7A 3K1DA 2PBGA 2OSYA 2QLYA 4WJXA 2W63A 2XM1A 3J7HA 2JF7A 2D22A 4OIFA 3OLGA 5CG0A 5JBEA 2YJQA 2CXGA 1E4NA 2DT2A 4AZ5A 3WQWA 2WKLA 2BS9A 4GI9A 3L4ZA 6CGTA 2BV9A 2VO5A 1GVIA 3WH5A 1E73M 2D3NA 2BY1A 1HP4A 1VF8A 3BXWA 4WKAA 4OOUA 1VEPA 4TTGA 5C71A 5EFDA 4JKKA 1S46A 2WMIB 2A3AA 1CXKA 1XCWA 2E3ZA 2WCSA 3AIBA 2EQDA 2A3HA 4MDPA 2A3BA 1ISZA 4CD4A 4UQAA 1QI3A 3CZLA 1HXJA 5A1AA 4JZ5A 3T2PA 3MMWA 3ZSTA 4PBGA 3QGVA 4AZ7A 2J25A 4MJ2A 3WQVA 1W3HA 1EA9C 3VDAA 2GVYA 3WBEA 3SIMA 2XVGA 4HOZA 2ESCA 1XH2A 1GJWA 1JYWA 3ZJ7A 3ARXA 1XRVA 3IAQA 1OIFA 1NOFA 4WLCA 4HP5A 2X1IA 1DTUA 1P6WA 2VNCA 1NWUA 3RCNA 4CD5A 1W2VA 3VD4A 2O9RA 3MSDA 1DWHM 4NRRA 5LYRA 4QAWA 2YIHA 4FLOA 1WAWA 2X05A 3PZOA 1UOKA 4M82A 4RE2A 3L4VA 3MUIA 3I3EA 3AMDA 1AIWA 1HVQA 4AIEA 3VD9A 3ZIZA 4CN4A 2E9MA 5A69A 3WFZA 3CZ8A 4PTMA 5E0CA 2VURA 1XSKA 2J8FA 4ZFMA 3AZTA 1KGXA 4C7DA 1JG9A 1E3XA 3TONA 1JGIA 5BYWA 3AZSA 4PMDA 1FFRA 3NDZA 4QCFA 3RM8A 2GDUA 1KWGA 5E6YA 1EOKA 4DWSB 3VIHA 2RGMA 1GHRA 5BXPA 4W8AA 3A4WA 1H3GA 2WW5A 3EMQA 2WK2A 2J79A 2GSJA 1ZS2A 2Y2WA 5A2BA 4W5ZA 3GM8A 1FP8A 3PBGA 1SFSA 3T0AA 2UY5A 3N9KA 3B8SA 1GNXA 4GXPA 2WAGA 1HP5A 2BXZA 4U2YA 4QDMA 1EDQA 2G3IA 2J7EA 3I3BA 3BAWA 2PI6A 2ZE0A 1NP0A 1M04A 5ECUA 2HVMA 4PMYA 2WZIA 3N1AA 4W7VA 4AZCA 1DWAM 2F61A 4BF7A 4J3XA 2JEQA 3AIRA 4NI3A 1UA3A 4LYRA 2J7GA 1KR1A 2NT1A 1MQRA 4XX6A 2ZIDA 5CZKA 1V0MA 3ZSSA 4GO8A 1OT2A 1LLOA 2FDMA 3FHQA 2AMGA 2J78A 4MADA 3VIJA 2CITA 4M1RA 2DGAA 4W86A 5D9PA 3PTMA 4NF7A 3L4WA 3RM4A 3VMOA 1TG7A 1E72M 4GINA 3BCFA 4PMZA 1KXTA 1Z32X 1QBBA 3PZVA 1VBUA 3WF1A 3U7BA 3SCTA 4CCDA 1HJQA 4EAMA 1NWTA 1UR4A 5HXMA 3IK2A 5C8BB 3AROA 1HKMA 4L4PA 3VGEA 1GCYA 3ZM8A 2V3GA 2X8RA 1ISVA 4A3YA 2OWXA 3ZR5A 1MQQA 3ALFA 4GI6A 1H41A 1JZ8A 2OWWA 2CBJA 2EJ1A 4AXNA 5AYIA 1ZJAA 1BYAA 4AEEA 1HT6A 4GZEA 3BH4A 3A47A 4PMNA 3VNZA 3OG2A 5TD4A 1QW8A 4J3WA 3A4XA 3DECA 3AHTA 5BWFA 2ZX6A 2ZXDA 3KEHA 2VC9A 4JHZA 4M24A 1Q6GA 3OLIA 3SCQA 3L4UA 4XUYA 3RILA 1OINA 4NSBA 2VVSA 4PTVA 5A94A 1E15A 3AHYA 3B9DA 1K9FA 2CNCA 4DUXA 2PWHA 1WPCA 3EMCA 2Y5EA 4U5KA 5IFPA 3A4AA 1UD6A 2YOCA 4YHEA 3VOCA 3T2QA 3CMGA 1E71M 1FA2A 4AIUA 2BNJA 4B15A 1EOMA 1UH3A 3VMPA 3HJEA 4PSPA 1EQPA 2XPKA 5KZ6A 4Z2LA 3SUVA 1JI2A 1DWGM 3BLPX 1XH0A 1LL4A 2F8QA 2WC7A 4H04A 3WL0A 3AXXA 3TTOA 5A6LA 2OSXA 4OKDA 1VJSA 1SMAA 4RE3A 4CN6A 1C92A 1HJVA 3GDBA 1QNOA 3TTQA 3W28A 2O9OA 3AJ7A 4LYQA 1J10A 1PX3A 5CGTA 1LJYA 2G4FA 2OSWA 4Z2KA 1FH7A 3PZGA 1E0XA 3BC9A 3RDKA 2BY3A 3B9EA 4AC1X 3UCQA 3VDHA 2CIPA 1GOIA 3AIWA 1V3LA 1HVXA 3CLWA 1UR1A 1B90A 2FH8A 1UKQA 3CPUA 1MW2A 3EDEA 1CGUA 4B3KA 4DUVA 1JL8A 2VRQA 3VIMA 1M01A 5A6KA 2PBOA 5E70A 1HJXA 1GQJA 2OLHA 3VX0A 1NOWA 3EMZA 2YL9A 3SCPA 3WDPP 1PIGA 5I78A 4UFIA 3BSHA 2ZX8A 2ZUVA 3CZKA 4W88A 4BQ3A 1HJSA 3VIFA 4W8BA 3ARVA 3AS0A 4HOXA 1FOBA 4HA1A 1OCQA 2DSWA 1GJUA 4R27A 3VVGA 5HPOA 2A3EA 2YDSA 2FHBA 1GOMA 5M03A 4PRWA 4TTUA 3ARSA 2O92A 4KRTA 5JUVA 2WMHA 5A95A 2BVYA 5I23A 3PZUA 4ACZB 1L0PA 1QHZA 2XSBA 4L4OA 1VENA 1MXGA 4PYSA 3W6LA 4UFMA 2W62A 5AC4A 1UWIA 1JYXA 2WB5A 1EHNA 1JYNA 5CPQA 2ZX5A 2VTFA 2XVKA 3WEMA 4JIEA 3AYSA 1MXDA 4UQ9A 3NSMA 1B1YA 1X6NA 3RJYA 4V2XA 3AS3A 1V02A 2EO7A 4MB4A 3KZSA 4PTXA 1E4MM 1V3MA 2ZUSA 2NSXA 1JD9A 2D0GA 4Z2JA 5HNNA 4CKQA 1W1YA 1V6UA 4DWSD 4A4AA 2JFEX 3VIKA 3CH9A 2PWEA 3GNRA 1JZ3A 1ZBVA 5CLTA 2VCCA 5GQBA 1WDSA 2QMKA 3SCNA 4QLLA 1JYVA 4E8CA 1B9ZA 3CTTA 1XGZA 4JKMA 4W85A 4AZBA 5I6SA 1KBBA 4PN2A 4QCEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1DWJ M;  1A3H A;  2NT0 A;  1CEN A;  4D1J A;  1Q4N X;  3EBV A;  3SEP A;  2CHN A;  1QNS A;  2W67 A;  3T0D A;  1WKY A;  4GQQ A;  1WP6 A;  1O7A A;  1X6L A;  3WD1 A;  2WWD A;  1QNP A;  1WO2 A;  4H2C A;  3RM9 A;  2XUC A;  3O9N A;  3MUY 1;  2ZUM A;  1BYB A;  4YN5 A;  5ABF B;  2B31 A;  3GBD A;  3SCV A;  5DT7 A;  3ART A;  3EDF A;  4MB1 A;  1C8Q A;  4AZG A;  2ZOX A;  2DSZ A;  1V6W A;  1CGX A;  3KL0 A;  3E1F 1;  3WBA A;  2O9T A;  5M5D A;  1I1W A;  1WDR A;  3WH9 A;  4AD2 A;  1KFW A;  1KXV A;  2VCA A;  1XYZ A;  1HJW A;  5FCZ A;  3VDC A;  3DHU A;  5FOO A;  2W61 A;  1E6Z A;  4URI A;  4PMQ A;  1BG4 A;  1UKS A;  3CUI A;  1KB3 A;  2WXD M;  4P7Q A;  2WVV B;  4XZB A;  2C7F A;  2XM2 A;  1E6P A;  3ARU A;  5AC5 A;  3CMJ A;  4RL3 A;  4P7R A;  1CGV A;  2WBK A;  3CGT A;  4Q22 A;  1N82 A;  1JIB A;  4NRS A;  1LG1 A;  1CXF A;  2ZWZ A;  1QBA A;  1ODZ A;  5DEZ A;  1LF1 A;  1LWH A;  1ZBK A;  1SMD A;  2RGL A;  4CCC A;  4AMC A;  1GQI A;  4AIS A;  1JNE A;  4BCE A;  5A6B A;  2VL4 A;  1VFM A;  1UH4 A;  3SUR A;  2ZXQ A;  1LL6 A;  2VQU A;  1J0K A;  1J12 A;  2VZT A;  3CZJ A;  3B9A A;  5A8M A;  4HPH A;  1C7S A;  3LPF A;  4YPJ A;  3EDD A;  1HL8 A;  3RME A;  2VRJ A;  4E8D A;  5IFT A;  1VFO A;  4PMU A;  4QLK A;  1E1E A;  4UQC A;  4V28 A;  1GOQ A;  1GOW A;  1XV8 A;  1JDC A;  2X09 A;  1U33 A;  2ZX9 A;  2MAN A;  1E9L A;  3GXF A;  1CYG A;  2WBG A;  3AHX A;  2DEP A;  2G3M A;  3GH5 A;  2YA2 A;  2QF8 A;  2BFG A;  6TAA A;  1V6Y A;  4B9Z A;  1TMQ A;  7A3H A;  3UR7 A;  4MPK A;  5IHR A;  4X0V A;  4S3K A;  2XWE A;  4R5E A;  5DFA A;  5JIP A;  1LG2 A;  1US3 A;  4UFJ A;  3BCD A;  1KQY A;  2FGL A;  2VMF A;  1CPU A;  4UQD A;  4PCS A;  1ISX A;  1MYR A;  2WVU A;  3POH A;  1V6V A;  2XGI A;  1PZ3 A;  3CUG A;  4IPN B;  1HIZ A;  4UOJ A;  3OLE A;  4J3V A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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