1H1NA

Atomic resolution structure of the major endoglucanase from thermoascus aurantiacus
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
AKVFQWFGSNESGAEFGSQNLPGVEGKDYIWPDPNTIDTLISKGMNIFRVPFMMERLVPNSMTGSPDPNYLADLIATVNAITQKGAYAVVDPHNYGRYYNSIISSPSDFETFWKTVASQFASNPLVIFDTDNEYHDMDQTLVLNLNQAAIDGIRSAGATSQYIFVEGNSWTGAWTWTNVNDNMKSLTDPSDKIIYEMHQYLDSDGSGTSATCVSSTIGQERITSATQWLRANGKKGIIGEFAGGADNVCETAITGMLDYMAQNTDVWTGAIWWAAGPWWGDYIFSMEPDNGIAYQQILPILTPYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO TYPE CELLULASE ENGI
publication title Atomic Resolution Structure of the Major Endoglucanase from Thermoascus Aurantiacus
pubmed doi rcsb
total genus 124
structure length 305
sequence length 305
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2002-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h1nA00
3SCNA 3SCVA 1E9LA 3K4AA 1V03A 3TOPA 4J3TA 1GHSA 3CUHA 5AYBA 3K4DA 3N11A 4ML4A 2E3ZA 1C7SA 2GUYA 1LG1A 1C93A 3MS8A 3DYOA 2BVDA 1CDGA 1L8NA 4XB3A 1R7AA 3MV11 4L4PA 2XGIA 5CJ5A 4CCDA 3LMYA 2Q8XA 3AMCA 1GPFA 3N13A 3ALGA 1QHPA 4GPNA 4N0RA 2AAAA 4AIUA 3A4WA 1VJZA 1B3ZA 2HVMA 3WH8A 1E1EA 1WNOA 4D6DA 4JAWA 4MAVA 5GPRA 4MB5A 2PF0A 1UHVA 1E3XA 4Z2LA 4J3VA 3VM5A 5FKYA 4J7RA 5E9AA 3CZJA 1E70M 3NSMA 1E56A 2CITA 3MUIA 4MPKA 3WBEA 3WUFA 4F66A 3K8MA 4ACZB 2XG9A 3IJ8A 3WDQA 3LPPA 4W8LA 3OZPA 1G1YA 3WD0A 4QCFA 1LF1A 4P7QA 1PZ2A 1K9FA 1JZ8A 2NW0A 2WBKA 2PWFA 2IXUA 5I0DA 1RP9A 4ATWA 4NF7A 1HKJA 3POCA 3SCOA 1UWIA 3EYPA 1C90A 1H5VA 1PZ3A 1V0KA 3AZTA 1AQMA 1F4AA 2BVTA 3ECQA 1TA3A 4J3SA 1BF2A 1CWYA 1UR2A 2EJ1A 4XZWA 2OLHA 4U31A 2UWFA 2ZWZA 3PZQA 3L4ZA 3AS3A 3VIPA 1CZ1A 4Z2JA 3KL0A 2XHYA 3UR8A 1U33A 3NCOA 3VMNA 4MAZA 1ITXA 3A4XA 1I1WA 3W82A 1GZJA 3VPLA 2JIEA 2JALA 2ZXAA 5HOSA 5D4YA 1WZKA 1BYCA 1ZBKA 4D6CA 1YQ2A 3OLIA 2VO5A 3CHCA 1ZB5A 4EE9A 5A2BA 1M03A 3SCWA 3SCPA 1KB3A 4W7WA 1I1XA 4YHGA 3MSGA 1MXDA 3GTNA 1RP8A 2XVKA 4AIEA 2BHUA 4NSBA 3II1A 4GZEA 3EBVA 1NQ6A 2VNCA 3WMSA 3TTSA 2WYSA 3WNMA 1XV8A 1TFVA 1W9VA 1D2KA 1KFWA 3PZUA 2WCAA 1CYGA 1HNYA 2VX7A 2YIHA 4J28A 3U5YA 3AI0A 3WEZA 4W7VA 5A6LA 4DM2A 4Z2HA 4AISA 4DWSC 2W92A 3W6MA 2VRKA 2Z1KA 4MADA 1K9DA 2QHAA 3GBDA 1BYBA 1EO5A 1EGZA 1XH1A 3DHUA 3VDCA 3VM7A 3WMBA 3G6MA 1HN1A 1KGUA 1UD8A 2ZXQA 3ARXA 4K68A 2ZICA 2EXOA 2OSWA 4BQ4A 1TVPA 1OGGA 1OT1A 2IXVA 2WZHA 3ZR6A 4FLSA 4H41A 2J7DA 2E9BA 5DFAA 1NH6A 1P6WA 5AC4A 2CBUA 3WNKA 1HF6A 1V6XA 2WMKA 4DUVA 1CEOA 3W81A 4E2OA 3T0AA 1LWHA 1V02A 5JUVA 4ACYA 1ISWA 1FA2A 1H4PA 4A4AA 2DQXA 1ITCA 2JF7A 4DWSB 2VZSA 2V3GA 7A3HA 4UFIA 1KBKA 4CD4A 2CEQA 1UR9A 3ZJ6A 1OT2A 2BFGA 1JZ4A 1VB9A 4C7FA 4FLQA 3AYRA 1EOKA 5CXPA 4LXFA 2D20A 2WBGA 1DEDA 4GIAA 1QI0A 3AXHA 3DECA 2JIWA 1E40A 5ABHA 2VX4A 3U57A 3K8KA 4U3CA 5I77A 2NSXA 1EDTA 2CBVA 2WNWA 3VDAA 4UOZA 1DTUA 3APGA 5CSUA 1M01A 2W62A 2XFYA 3WQ8A 1GOWA 2OWXA 4JFWA 4W84A 4M8UA 2G41A 4W5UA 5BXTA 1W1YA 1MFUA 3N1AA 5IHRA 4W87A 1QHZA 1E3ZA 4GKLA 1O6IA 2ZE0A 3OGVA 2JFEX 3D3AA 1QNSA 1JXKA 3KL3A 3WNNA 4CD7A 2WC3A 4GI6A 1QNQA 2WAGA 3PZNA 1JDDA 2YKKA 1GQJA 2FHBA 1BYAA 1E55A 4P8XA 3M46A 5E09A 1HKKA 1XCWA 3GH7A 4JKMA 3FXYA 3WDHA 1E43A 3FHAA 4AD1A 3BAKA 1OGBA 3VD4A 1UKSA 5CLWA 4AC1X 2EPMX 2VURA 3THDA 3CZKA 2OSXA 1W9BM 3FY1A 4F79A 3ZJ8A 1PIFA 2ZOXA 4TX6A 1N82A 4Z2IA 2ZXDA 4U2ZA 3FW6A 5F7UA 1LL6A 4JL2A 5D8WA 1BHGA 1VIWA 3WQVA 3U5UA 1SFSA 3DC0A 1R87A 2Y4SA 2CCRA 1BTCA 1CENA 1CIUA 1QVBA 4Q22A 4PN2A 3ARSA 1UA7A 4QP0A 5ECUA 1XHGA 1NWRA 3QHMA 2B31A 2C7FA 1GW1A 4AW7A 3VIOA 2CXGA 4D1JA 1CGYA 5C70A 4HTYA 2CKRA 1CPUA 1KWGA 5FL0A 4M56A 3WENA 3MSDA 1OIMA 5CG0A 4B3KA 3SCQA 2DSVA 3BAIA 1UWQA 2DSUA 5D9MA 2CETA 5I24A 3VOCA 2G3IA 2FGZA 3AQUA 4RE3A 1NP0A 5A8MA 3AMLA 3ZT7A 4U3AA 3AIEA 3FN9A 2EBNA 4HPGA 1G5AA 3SUWA 1ISYA 1BLIA 2E40A 2YA0A 4UZUA 1HVXA 1UR8A 3CMJA 8A3HA 3AIRA 4M24A 2OYKA 2GK1A 4CKQA 3UG4A 4WSKA 4W93A 1QBAA 1W91A 4WKFA 1EDGA 3W27A 3B9DA 2WZIA 3WL0A 4HA3A 1LJYA 1Q6DA 2DT1A 3ZT6A 2UY2A 2A3CA 5KZ6A 1E5NA 3CMGA 1UKOA 1QOXA 4DUWA 3W24A 5CPTA 3W25A 4RE4A 5LA1A 4N42A 1OBAA 3N12A 2XFRA 1DP0A 3TTQA 3W37A 3VIMA 4M80A 5I5RA 3WH6A 3OZOA 4CVUA 4PMRA 2ZUSA 2JEQA 3SIMA 2ESCA 4HMEA 4CVWA 4AZCA 4ATLA 2D0HA 4P7NA 3WQ4A 4F8XA 5KEZA 1MQQA 2EEXA 1QI3A 2YLAA 3CZ8A 1ZU8A 2YL8A 3L4VA 4OBRA 2EQDA 4H04A 3KE0A 1LLOA 1BFNA 3KL5A 3PTQA 1VJSA 3AIVA 4JFTA 3D5HA 1WZMA 3M07A 3MMUA 4KMQA 1VFUA 2ZUUA 1J0HA 5FIPA 4IPLA 5ABFA 1C8YA 1E72M 3OA5A 3N18A 1LL4A 4X9YA 4JHZA 4PMOA 3WDJA 1B31A 4PMXA 3FNDA 3BXWA 1W9XA 5BWFA 1VFFA 1HKIA 2BS9A 4PUDA 1UQZA 2FDMA 2J7HA 1S46A 2OYLA 3W38A 1NP2A 3S2CA 4HMCA 4P8UA 4CUCA 2F2HA 3IJ9A 3IANA 4AEEA 1FHDA 1Q6GA 2NT1A 1JAKA 1PJ9A 2VZOA 1UR1A 3LPGA 3WFZA 2WMGA 4GXPA 1UH4A 1W2VA 5BYWA 3WD4A 2W66A 1A3HA 2XTKA 4C7DA 3AXIA 3T09A 1CXEA 2WK2A 3VD7A 1B3VA 3HN3A 3CZLA 1EHAA 2EPLX 4PYSA 3CUGA 3RJXA 1GOIA 2J62A 4MJ4A 1GJUA 2WHLA 1OCQA 1J11A 1ZBWA 4BCEA 1BG4A 3BCFA 2YDRA 5IDIA 3U7BA 1ISVA 2WMFA 3PZ9A 3AHXA 1NOUA 4A3HA 5I2UA 4BF7A 3WH9A 1CXKA 4OJYA 3ARWA 1HL9A 2XJ7A 3BMVA 1CECA 3NSXA 2AMGA 2WLZA 1EXPA 4ACZA 1J0KA 1W2PA 3ZSTA 4P7LA 1OWQA 1GNXA 4KGLA 1G94A 5A6JA 3W29A 4FMVA 3ZM8A 4TOQA 5LYRA 2WHJA 2WPGA 4MTVA 5JBEA 4W89A 1J0YA 2ZX8A 1Z32X 3BAWA 1J0ZA 1K6AA 1QNPA 4AZ6A 1J0JA 1U30A 1V3KA 3WN6A 2J8GA 1VFOA 1CGVA 1IZJA 1WE5A 4R27A 2WVVB 3FAWA 2G4FA 2G3MA 4PSPA 4WKHA 5A8PA 4JCLA 1ISZA 1V0MA 3L4WA 4KGJA 3B8SA 3OG2A 2GDVA 4GI8A 3ARYA 3GXIA 1PBGA 1C8XA 3T2PA 2GVYA 2GDUA 3NDYA 1CXFA 2CHOA 1XD0A 1H49A 4OIFA 5LA0A 4JZ5A 2VZTA 5DEZA 3WUEA 4D6GA 4H8VA 3TA9A 4AZGA 2J4GA 4PEEA 3AISA 2D22A 4PUEA 1MWOA 1GJWA 4PTMA 3MUZ1 2VRQA 1C7TA 3WNPA 4ZFMA 3VDBA 1TMQA 3EMQA 3L2LA 1JF5A 3SURA 3AS2A 4L4OA 4OOZA 2DDXA 2BY0A 4Z2KA 4PMUA 2WVUA 3NUKA 4AD2A 1MW2A 1KWKA 4J3WA 1BGGA 1XRVA 4S3KA 4UQAA 4AY1A 2Y8VA 5A6BA 2IUZA 1GOQA 1MFVA 1KQZA 3OLDA 1V0NA 4UZSA 2GJPA 1CGWA 3BGAA 3EDKA 1C91A 2WM0A 4IUGA 2X0YA 1E1FA 3VIGA 4KWUA 4CU8A 4D1IA 4X0VA 4UOJA 2YJQA 4KRUA 1E15A 4QLLA 1F4HA 3MMDA 5BRPA 2YBUA 3QHNA 3RPMA 3VIHA 3RM9A 3GYCA 2FHCA 4URIA 3WH5A 1W9UA 1V6YA 4CD8A 1UG6A 1XH0A 3PZMA 3ZQ9A 1CNVA 2W67A 1LWJA 1E4NA 4B3LA 4DWSA 1H0IA 1GQIA 4MNMA 1B3XA 5A2AA 1XYFA 3TONA 4H2CA 4GO8A 2VL4A 1XCXA 3OGRA 3VGFA 2UY3A 2G3NA 1UKTA 4GINA 2ZIDA 5EFDA 3LPOA 1US2A 2BY1A 2Y8KA 4QLJA 3I3BA 1ZL1A 1EO7A 1QPKA 2ZX9A 4UFJA 2CBIA 1WDPA 1CGTA 5E6YA 4RL3A 3WDPP 3VGDA 4A3YA 2EPNA 5IXEA 5HPCA 4W85A 4B15A 5A2CA 2Y24A 2QPSA 5C71A 4U33A 1PPIA 2WHKA 2E9LA 1AQHA 2PWDA 3CO4A 3T0DA 1SR0A 4TUFA 1VENA 5TD4A 1GOKA 3VIJA 2VOTA 1KXVA 1ZJAA 2W5FA 3L4XA 2XYLA 3NIYA 1AVAA 1B9ZA 4PTWA 5M5DA 4AD5A 2J7GA 1W3LA 2WMIB 3SUVA 1TE1A 2W61A 1WZAA 5I78A 3GXFA 1ODZA 3VIKA 1R85A 1UH2A 3O2LA 4U2YA 5M17A 1FP8A 3RJYA 1ECEA 2PWGA 4PMQA 5D9PA 6TAAA 5HXMA 2VVNA 3DHPA 4BQ3A 2ZX7A 1J01A 3OGSA 4MDPA 5A95A 5CLTA 4WF7A 2AOSA 3AS0A 1DWHM 1OM0A 5A6BD 4LX4A 2A3EA 4PRWA 1DWIM 4AZHA 1XD1A 2E0PA 3NYDA 5CZKA 5A8NA 4WLCA 2JF6A 4CU6A 1W9DM 4UQEA 4H8HA 4CD5A 1JZ3A 2ZUNA 3HMCA 3E1F1 4LYQA 1O7AA 3WMCA 2ZWYA 2DH3A 2VI0A 1GQLA 2OWCA 4NI3A 3SEPA 1Y7VA 4D6EA 4M81A 4LPCA 5DF0A 1HVQA 4EAMA 1E6SM 3UG3A 1B90A 2OYMA 1BVNP 3WF4A 1GHRA 5CSYA 1X6NA 3VD9A 1KR0A 1VRXA 1FFRA 5AY7A 2J7CA 1JL8A 1HP4A 2VCAA 2WANA 4JFVA 4CGTA 2VR4A 2D1ZA 2X2YA 3HJEA 1J18A 1YHTA 4PBGA 5FOOA 4DWSD 3T0BA 2J47A 2E8ZA 3KZSA 4W8AA 2PBOA 3MU7A 3EDDA 3PZGA 3GXMA 2EPKX 2RGLA 4AZBA 1CGUA 2VT0A 8CGTA 5CPQA 3OLGA 5M3WA 4ATDA 4E8CA 1E0VA 1PX4A 4AWEA 1JAEA 3LPFA 1W9PA 1X1NA 1JYXA 2A3BA 2E4TA 1BSIA 1E6NA 2YA2A 1XC6A 1OD0A 3KEHA 5DMYA 4BA0A 5DT5A 3CH9A 1EA9C 1GVIA 3L4TA 1U2YA 2YL9A 2VX5A 3EDFA 5CPSA 2X8RA 3WKZA 1C92A 3K8LA 1US3A 2XFFA 3MO4A 3GH4A 2D3LA 1GORA 1B3WA 3RMEA 1R8LA 4AD4A 1V3IA 3F4VA 1BVZA 4LQ1A 5JBDA 3WL1A 3BSHA 3RILA 5A1AA 4TTGA 3VNZA 1SMDA 1TZ7A 2VC9A 3VUPA 4HA4A 4HPHA 4TVUA 3VILA 2X09A 1EH9A 4HZ7A 1HL8A 1XSIA 1DWFM 1GQKA 1ZS2A 5IHSA 3CUIA 1E71M 3FHQA 1KXQA 3BMWA 1E6PA 4PTXA 4AZIA 1VBRA 4HOWA 5CQ1A 4X0NA 3WF3A 4BQ5A 3W53A 3SUUA 4HZ6A 3SCUA 1JF6A 1JZ7A 3ARVA 2GJXB 1E73M 3NSNA 1BGAA 3T08A 5EB8A 1QW9A 2XVLA 3VX1A 1V3JA 4WK9A 2E8YA 2RGMA 2WMJA 3ARRA 1V3MA 1CGXA 1MYRA 1UA3A 1JZ2A 2BXZA 5E6ZA 3AHVA 4TXEA 4HOXA 2W91A 4AD3A 4UR9A 1OINA 5A8OA 4ZEPA 5AYIA 5E70A 2GSJA 1JZ6A 1JNEA 5GNZA 1UZ1A 5GNXA 1MVYA 1MW1A 4NRSA 1FH9A 2V3FA 2DSWA 3WQ6A 4PCSA 1JFXA 3BH4A 4HU8A 4FLOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SCN A;  3SCV A;  1E9L A;  3K4A A;  1V03 A;  3TOP A;  4J3T A;  1GHS A;  3CUH A;  5AYB A;  3K4D A;  3N11 A;  4ML4 A;  2E3Z A;  1C7S A;  2GUY A;  1LG1 A;  1C93 A;  3MS8 A;  3DYO A;  2BVD A;  1CDG A;  1L8N A;  4XB3 A;  1R7A A;  3MV1 1;  4L4P A;  2XGI A;  5CJ5 A;  4CCD A;  3LMY A;  2Q8X A;  3AMC A;  1GPF A;  3N13 A;  3ALG A;  1QHP A;  4GPN A;  4N0R A;  2AAA A;  4AIU A;  3A4W A;  1VJZ A;  1B3Z A;  2HVM A;  3WH8 A;  1E1E A;  1WNO A;  4D6D A;  4JAW A;  4MAV A;  5GPR A;  4MB5 A;  2PF0 A;  1UHV A;  1E3X A;  4Z2L A;  4J3V A;  3VM5 A;  5FKY A;  4J7R A;  5E9A A;  3CZJ A;  1E70 M;  3NSM A;  1E56 A;  2CIT A;  3MUI A;  4MPK A;  3WBE A;  3WUF A;  4F66 A;  3K8M A;  4ACZ B;  2XG9 A;  3IJ8 A;  3WDQ A;  3LPP A;  4W8L A;  3OZP A;  1G1Y A;  3WD0 A;  4QCF A;  1LF1 A;  4P7Q A;  1PZ2 A;  1K9F A;  1JZ8 A;  2NW0 A;  2WBK A;  2PWF A;  2IXU A;  5I0D A;  1RP9 A;  4ATW A;  4NF7 A;  1HKJ A;  3POC A;  3SCO A;  1UWI A;  3EYP A;  1C90 A;  1H5V A;  1PZ3 A;  1V0K A;  3AZT A;  1AQM A;  1F4A A;  2BVT A;  3ECQ A;  1TA3 A;  4J3S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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