The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
GAVFIFVGALTVLFGAIAYGEVTAAAATGDAAAVQEAAVSAILGLIILLGINLGLVAATL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
|
| molecule keywords |
SENSORY RHODOPSIN II
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| publication title |
Molecular Basis of Transmembrane Signalling by Sensory Rhodopsin II-Transducer Complex
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Natronomonas pharaonis
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| total genus |
25
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-08-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix hairpin bin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2F95 B; 1T5E A; 3LNN A; 2V4D A; 1H2S B; 5JJE B; 5D5P A; 2F1M A; 4GYC B; 5JJJ B; 2F93 B; 4DK1 A; 3WB1 A; 4DK0 A; 3BRC A; 3WB0 A; 1RSO A; 1VF7 A; 5JJN B; 3WB2 A; 4L8J A; 5D5Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2H94 A; 2E5L B; 3SGI A; 3FAV B; 4DUY B; 2VRZ A; 5KLV H; 3DGE A; 2RMK B; 3Q4H B; 2Q7E A; 3TXS A; 3K0G A; 4K35 A; 4LF5 O; 1KBH A; 4CS2 A; 4IHJ A; 3F5T A; 1WB8 A; 1JFF B; 3CCE V; 5C8Y B; 4DV1 O; 2JGD A; 2WWW A; 2ZIN A; 4ASU G; 2E5L O; 3APQ A; 2BE3 A; 2B1I A; 3BA9 A; 4DUY O; 4MVR A; 2B5U A; 1E1Q G; 1SQX H; 2Z5U A; 2JEU A; 3CPW U; 1K3E A; 2GTS A; 2CGN A; 3SYP A; 3DC6 A; 3ZRV A; 5BZB A; 3DSQ A; 2NN4 A; 4EB6 A; 3L75 H; 1X59 A; 4DR5 O; 4KFM A; 4WFA V; 2EUL A; 3RVZ A; 2K1E A; 4UVA A; 4I50 B; 3OUS A; 3JAS B; 1NR7 A; 1NR1 A; 1Q90 D; 5K1X A; 1AVM A; 3VQV A; 2QWO B; 4OX9 B; 5FPR A; 3D8C A; 5B1B B; 4LNU A; 3HR0 A; 1FD9 A; 3J7A U; 4MVO A; 1F51 A; 3SR2 C; 1RM1 B; 4GX5 A; 3KKY A; 1R3I C; 3JCZ A; 2QWP B; 5J2T B; 4OX9 O; 3WB2 A; 1PNM A; 4JAS A; 2B9Z A; 4DR7 B; 1MA1 A; 2F23 A; 3ASN B; 2P67 A; 5B1A C; 1AJQ A; 1PM9 A; 1KKD A; 2R9R B; 2Q0O C; 2WA3 A; 2DYR C; 3L74 H; 3AG4 C; 3OFN G; 3I55 V; 1N0N A; 3AG4 B; 1WLE A; 3MHS C; 5CB4 B; 4L8J A; 1K5Q A; 3KCX A; 1QU7 A; 4X1K A; 2A0L A; 4J80 A; 2YUA A; 1YIT V; 1M1K W; 1IBL B; 5CBG A; 2WLJ A; 5GW7 A; 3CCQ V; 3SJA C; 4UCS A; 4DR7 O; 2WLL A; 3P3N A; 3D3I A; 5JQG A; 1Y74 A; 4JI1 B; 4LF8 B; 4FLW A; 2ARH A; 1FXK B; 1NI8 A; 3T4Z A; 1ZAU A; 1MZF A; 1T5E A; 3OMI B; 4X66 B; 3AK1 A; 5DM6 V; 2P4K A; 3DXR A; 1IBL O; 1I5X A; 5EC2 C; 3JSL A; 5JVD B; 3WB0 A; 4RQF A; 1K7D A; 4KHP B; 1VF5 B; 3ZMT A; 1GN4 A; 4LH6 A; 3W7T A; 3W7X A; 4FVM A; 3OTO B; 4DR2 B; 4JI1 O; 4NXN B; 5EYP B; 4LF8 O; 5BMV B; 1XBL A; 2CDY A; 1YIJ V; 2AHY A; 1H2S B; 3RYH A; 1IXM A; 4X66 O; 3ABK B; 4CC5 A; 1M56 B; 1SQG A; 2ETN A; 1UFI A; 5TIS Z; 2KQX A; 2DW4 A; 3TET A; 1BHB A; 3K08 A; 4D7T A; 2ZD9 A; 3CCL V; 2XAQ A; 1EBO A; 4BR6 A; 2Y0I A; 1YI2 V; 4UCT A; 4KHP O; 3N27 A; 5GON A; 1D5N A; 3OTO O; 1XL6 A; 2W6J G; 4DR2 O; 4NXN O; 4DXW A; 3AEI A; 3OE7 G; 4NYK A; 1GKF A; 2LFS A; 1Q3E A; 1P7B A; 3LDD A; 5KHJ A; 4B7E A; 4O4H B; 2QWN B; 4JI0 B; 3GWK C; 4XBF A; 3ZJZ A; 2BSK B; 2LFR A; 3ZN1 A; 3UO2 A; 1H2K A; 3OMN B; 3ABM C; 3RYI B; 2Q4P A; 5CA1 A; 5JJE B; 1KYO F; 3B40 A; 3STL C; 5GTH Z; 4JTC B; 4JI0 O; 2P6J A; 3QG5 A; 3A0R A; 3ETD A; 2EIL C; 4I0X A; 5LP6 C; 1QVG U; 4UCR A; 2EIN C; 5IJ0 A; 4TV9 A; 1D2D A; 1H38 A; 3GWO A; 2EZO A; 1B04 A; 3ZHT A; 5ITZ A; 3AG3 C; 3LDC A; 2Z0A A; 1FJG B; 1KB9 F; 4Z1M G; 4BIO A; 3H1L H; 2DN9 A; 3SYA A; 3ZN0 A; 4RUE A; 3IC7 A; 1EZJ A; 3E8G A; 5A2Q N; 2FYU H; 4GKK B; 5LA6 B; 3T1Y B; 2ZXW C; 3OR6 C; 4ZHQ A; 4LFA B; 5HFL A; 2BTQ B; 3ZS8 C; 3T2M A; 4PI0 A; 2QTO A; 5CA0 A; 2D2C B; 2DWE C; 1FJG O; 1HNZ B; 1DLB A; 4E4E A; 2CGO A; 3K06 A; 1BS3 A; 4KUM A; 1Q81 W; 3WFV A; 4OXS A; 1B06 A; 4LF7 O; 1VQK V; 5FL7 G; 1K92 A; 3G6E V; 4GX0 A; 3T1Y O; 1R1B A; 1R3K C; 3SPC A; 4HNA A; 4JYA B; 1OZ0 A; 1K8A W; 1PNL A; 3H1I H; 4LFA O; 4HAM A; 1ZLZ A; 1R6T A; 4X8A A; 4CH3 A; 1OCR B; 1ZX3 A; 3T1C A; 4UXN A; 4FMT A; 1HNZ O; 3UT5 A; 4R8C A; 2JDI G; 2PYL A; 1D5A A; 1B3Q A; 1BE3 H; 5LMU O; 2NNU A; 3U11 A; 4I4T B; 1DF5 A; 4YHH B; 1K4C C; 1OCZ C; 1AR4 A; 2OTL V; 4JYA O; 1OCZ B; 3OM3 B; 1NTM H; 4LWS B; 1LUW A; 4RAI A; 2ZNI A; 2W6I G; 3JAT A; 5EBW C; 3CC7 V; 1L8D A; 3ZMV A; 1GM8 A; 3VOU A; 3SPJ A; 3JCU Z; 3ASO B; 1VQ9 V; 4FFB B; 1LR1 A; 3K9S A; 2UXD B; 3CJH A; 3CYO A; 3ZHU A; 4YHH O; 5CN0 A; 3EXA A; 2DYS C; 3H9V A; 4X62 O; 4JAA A; 1AIL A; 3BEH A; 1WPX A; 1P49 A; 4QIW F; 3E89 A; 4X1I A; 1YDX A; 3S3W A; 1TUB A; 1XRE A; 3A0B Z; 2ZIM A; 4F6R B; 1FFX B; 2RJZ A; 4DRX B; 2Y0P A; 1XNR B; 1R73 A; 3QO7 A; 2EIJ C; 4O2A B; 4NR1 A; 4QGP A; 2CK3 G; 3ZHQ A; 3L9D A; 4UCU A; 3OT7 A; 2GHY A; 3HKD B; 2KB1 A; 2CTW A; 2DWD C; 3HKB B; 1WA8 A; 3U0Z A; 2ITC C; 3K03 A; 3CB2 A; 5KMG B; 3AK2 A; 4MSW C; 1XHZ A; 3RVY A; 3RYC A; 2F95 B; 1XNR O; 1M57 C; 2VQF B; 3SPH A; 2B1G A; 3JAK B; 1S77 D; 2Q69 A; 1OCO C; 1SET A; 1P84 F; 5KUM A; 4YJ2 A; 1OHH G; 1JJ2 U; 1LNQ A; 4BWA A; 1I94 B; 1JMK C; 3JAW B; 2VWJ A; 4GUN A; 3QO5 A; 4FZ0 A; 1M90 W; 1M5I A; 3GB7 C; 3OUF A; 4J11 A; 3K79 A; 3R66 A; 1NVP B; 1K34 A; 2XTA A; 4QPJ A; 2WLN A; 3J80 N; 1MMM A; 2VQF O; 4ZIB A; 4FLX A; 1E79 G; 4ABM A; 3B2E E; 1ZL8 B; 4TSF G; 2A06 H; 2YI9 A; 1R3J C; 3IGA C; 1N8R W; 2X6A A; 1MAB G; 2RN9 A; 1I94 O; 4NTX A; 5EZY B; 5KA6 A; 2OCC C; 2XAJ A; 3ETE A; 3P30 A; 1EN6 A; 1VQ6 V; 3AG1 C; 4PA4 A; 5HFM A; 1BL8 A; 1GM7 A; 4YJ3 B; 1K4D C; 2QKC A; 2JGU A; 3SYQ A; 2JS3 A; 2M7W A; 4LH7 A; 3MHH C; 2QE7 G; 2ADQ B; 5IJ9 A; 3NXS A; 1VQ7 V; 3H01 A; 1G6U A; 1ORQ C; 1WNS A; 2Y69 C; 2ZE6 A; 5IYZ A; 2DE0 X; 2QM4 A; 2VS0 A; 4PI2 A; 4X20 A; 2YXY A; 1JA8 A; 4NVP A; 3B09 A; 4JPR A; 3N2K A; 1XOU A; 5J2U B; 4CH4 A; 3C90 A; 3SPI A; 3CX5 F; 3K9A A; 4JYC A; 4IIJ B; 3CEI A; 1Y4M A; 2UXB B; 1QR8 A; 4RO2 A; 3TJT A; 1TGO A; 4PDR A; 2H8P C; 1GM9 A; 1SES A; 4CC6 A; 1BMF G; 1TVK A; 4J10 A; 3M99 B; 2KSD A; 2JVD A; 3K0D A; 4IHJ B; 3TXQ A; 4IGG A; 4PDV A; 3OD4 A; 1H2G A; 1KKC A; 1P7G A; 3H1K H; 4DK1 A; 2LP7 A; 1NKD A; 2A79 B; 4R7C A; 2A7W A; 2N74 A; 4MT8 A; 4DR5 B; 1V55 B; 4D6T H; 3CRR A; 2Y4T A; 2UXB O; 5B1O A; 4TQD A; 4X64 B; 1HDJ A; 4O4J B; 2BOC C; 4QPK A; 4K8Z A; 1PL0 A; 1S76 D; 4IYH A; 4LF6 B; 3CP1 A; 2PI4 A; 2JRI A; 3FAV A; 3SYC A; 4BIZ A; 2N04 A; 2KKW A; 4JAU A; 5K1P A; 4JZ2 A; 3CCV V; 3VBB A; 3Q4H A; 4ZKI A; 5LL6 Y; 3UM7 A; 1GH6 A; 3ZHR A; 2LO1 A; 2JS5 A; 2RQ6 A; 2YSU B; 1SQV H; 1KU9 A; 2OT5 A; 1JFF A; 3ABL B; 5C8Y A; 4JZG A; 4X64 O; 2LQT A; 4WFE A; 4W4L A; 1Z2G A; 1VMG A; 3ETG A; 4I55 A; 4LNU B; 2YXL A; 4LF6 O; 4A5U B; 1XMO B; 3OGC C; 3JAR A; 5B1B C; 5L3B A; 4HYO A; 2QA4 V; 1Q8I A; 3QNE A; 3QTC A; 2X7R B; 1ENV A; 1E1R G; 1RM1 C; 2ODM A; 3VQW A; 1AI5 A; 2W0F C; 1GN6 A; 4CH6 A; 5L3D A; 4MTG A; 1EN5 A; 4J7Z A; 4IT5 A; 5EBM C; 2YC0 A; 3OTF A; 5B3S B; 1GTO A; 1QR9 A; 4X1Y B; 4FZ1 A; 4Z2W A; 1SRY A; 2IBZ H; 1B6Q A; 4DV7 B; 1XMO O; 1IBK B; 2YI8 A; 3BAA A; 4XDK A; 2LJ2 A; 1URF A; 3ASN C; 3BCC H; 3K5N A; 1KP2 A; 2ZR2 A; 4TWK A; 3TK1 A; 2QTS A; 4DW0 A; 4WFH A; 1RPR A; 4X1K B; 1XDC A; 5BR8 B; 3CXH F; 5LMN B; 4B7K A; 1HR0 B; 4Z1V A; 1Q82 W; 2HKO A; 1THZ A; 2QWQ B; 2WLL B; 4PA3 A; 1NTK H; 4DV7 O; 3BHP A; 1SER A; 4EKW A; 1IBK O; 1FAF A; 1Y74 B; 4JTD B; 2ILM A; 1SQQ H; 1ROP A; 3ZRW B; 4B3M O; 3AG2 B; 1QQC A; 3B4S A; 2YIA A; 3WB1 A; 3JD4 A; 1SA0 B; 2RDC A; 1XL4 A; 2VQE B; 5BY1 A; 2PYJ A; 5KA5 A; 3DXR B; 2IH1 C; 1S3J A; 1H2M A; 1FXK C; 3TCU A; 4HZ3 A; 5L3G A; 5BR8 O; 2JK5 C; 2YIB D; 3T1H B; 5LMN O; 1HR0 O; 2NLJ C; 4W4K A; 3R65 A; 4FJC C; 4U7O A; 1QLE B; 1N36 O; 3G67 A; 1NVP D; 2V1D A; 4WBN B; 4PDM A; 4QNH B; 1WB7 A; 1KD1 W; 2E76 B; 4P9P A; 4FLZ A; 2DOS A; 4I5S A; 2R70 A; 4LR3 A; 3A0H Z; 3RYH B; 5KAF Z; 2UXX A; 1VQ8 V; 2VQE O; 2EIM B; 3D36 C; 3CRQ A; 4TT3 G; 3UO3 A; 3T1H O; 1DGS A; 2CH7 A; 4AI8 A; 1VF6 C; 1RFY A; 3ABK C; 1KP3 A; 1M56 C; 3N2G B; 4P30 A; 5JJJ B; 4K0K B; 1M93 A; 4ZBM A; 3SJQ C; 5GON B; 1VQN V; 1CXZ B; 3K04 A; 4UCO A; 4MTF A; 1MG1 A; 3VQX A; 3O65 A; 5IY5 B; 4WCE V; 2QM7 A; 2QSA A; 4Q20 A; 3HPL C; 3D36 A; 5EYP A; 2HVK C; 3S3X A; 3OW2 U; 4K0K O; 3ICX A; 5H9C A; 5L3C A; 1RSO A; 3L72 H; 5IYC O; 1VF6 A; 4KXR A; 4GCZ A; 3E35 A; 2IU0 A; 2WLM A; 3JYC A; 1VQO V; 3FYI B; 3WG7 B; 1NU1 H; 5JH7 A; 3CC4 V; 1S5J A; 4GKJ B; 2F93 B; 1S5H C; 5H5N A; 4G27 B; 1AP5 A; 2LW7 A; 4I0X B; 4O4L A; 2XAS A; 4O2B A; 1YZB A; 2ZCE A; 1S0V A; 1J95 A; 1V54 B; 3GVM A; 4DV0 B; 2Q68 A; 5IJ0 B; 5JJN B; 1MNG A; 2X0L A; 2HJD A; 4MVS A; 4DV5 B; 5LHI A; 2ZIO A; 2QKA A; 4JF3 A; 2K9P A; 4B3R B; 2P4V A; 4GKJ O; 3CCJ V; 1SC5 B; 3RN4 A; 1QVF U; 2EX3 A; 3FB8 C; 1YJW V; 4HBN A; 4TUY B; 3WU2 Z; 3FB5 C; 1NZ6 A; 3LSQ A; 3CRC A; 4DV0 O; 3CE2 A; 5E79 Z; 2R9I A; 4DUZ B; 2O57 A; 3SYO A; 1F23 A; 1Q6I A; 4LF7 B; 3ZMU A; 2ATK C; 4DV5 O; 4MVM A; 4JV5 B; 3OR7 C; 3LDE A; 2ITD C; 5H2F Z; 1SQF A; 4YIP A; 5LP6 A; 4K8X A; 4B3R O; 4GZR B; 4CBC A; 4JI4 B; 4XDL A; 5LXT B; 1JOY A; 4MTX A; 2WLI B; 2UUB B; 1XNQ B; 3NR7 A; 2ZE7 A; 4DUZ O; 5LMU B; 2ZM6 B; 2WLK A; 2GDS A; 3FYE B; 2XAG A; 1OCC B; 3B8M A; 2E3C A; 2IW5 A; 4EFB A; 5JCO C; 3RWR D; 4JV5 O; 2E75 B; 1XIL A; 5LOV B; 1GO3 F; 3RT3 C; 3JAL A; 5D5Q A; 3CCS V; 1OCR C; 4U3J B; 2BTQ A; 3CCR V; 2F43 G; 4JI4 O; 4FM1 A; 1HWY A; 3RFR A; 2GSM B; 2UUB O; 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2EIK B; 2E74 B; 1BHA A; 3CC2 V; 3ZMS A; 1BQZ A; 1VQL V; 3JD3 A; 4YJ2 B; 1Q86 W; 2P22 C; 4B3T O; 4F6R A; 1MOF A; 2YID A; 4JI7 B; 4DRX A; 3P32 A; 2AHZ A; 2ZE5 A; 1MSD A; 4RUF A; 3HKD A; 4B3S B; 3JD0 A; 4H0L B; 4DV6 B; 1GN3 A; 3K3W A; 1G4Y B; 4FLY A; 1AJN A; 4BIU A; 2XAF A; 2IH3 C; 3OGI B; 2XAH A; 2Q0A A; 1O9G A; 4X89 A; 1UPG A; 3E8F A; 4NTY A; 5KMG A; 4YXW G; 1QNM A; 1TA8 A; 1SZX A; 1LUV A; 2G38 A; 3E22 A; 4JI7 O; 2CTP A; 3CSX A; 2H3O A; 1YF2 A; 5F2V O; 1M4U A; 3JAK A; 3LNM B; 4CS3 A; 1PP9 H; 4FLV A; 3EHB B; 1FKA O; 4B3S O; 4KP4 A; 2GUZ A; 4DV6 O; 2AXT Z; 3JAW A; 2FKX A; 2F66 C; 3X2Q B; 2ZR3 A; 4E2L A; 1PL4 A; 3BAB A; 4TQF A; 2UUA B; 2L35 A; 1W0J G; 1GN2 A; 3CRM A; 4BAY A; 4X20 B; 3ZRX A; 3M8A A; 3CMA V; 3DTU B; 2HEP A; 3SPG A; 2HFE C; 1ZL8 A; 2CTR A; 2UXC B; 4JI2 B; 2L6L A; 1NJI W; 4WFG A; 4ZOL A; 5EZY A; 1RPO A; 3ZX6 A; 2QJ1 A; 3G6B A; 4K3A A; 2UUA O; 4TV8 A; 3C3S A; 1VIB A; 1K97 A; 1YJN V; 4YJ3 A; 2LGQ A; 3G71 V; 1TVK B; 1FS0 G; 2CUG A; 3UKM A; 1W0K G; 2WLH A; 4DR1 B; 3SDL A; 3OEE G; 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