1H61A

Structure of pentaerythritol tetranitrate reductase in complex with prednisone
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
SAEKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords PENTAERYTHRITOL TETRANITRATE REDUCTASE
publication title Crystal Structure of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase: "Flipped" Binding Geometries for Steroid Substrates in Different Redox States of the Enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacter cloacae
total genus 134
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1h61A00
3IVSA 2NUXA 4TU1A 1YYAA 5HR7A 5FESA 3NZ1A 3TFXA 3EXRA 4GUIA 2C13A 1A5CA 3L5AA 3T40A 3W7IA 3DBPA 3BLFA 2V2DA 4TO8A 1KTCA 4JTFA 2VFEA 3LERA 5D38A 3BO9A 1K7EA 4U4MA 3W83A 4UXDA 3IGSA 3ATYA 3A21A 1FDJA 1XUZA 5C5YA 4CCCA 5D09A 5F2MA 5CSRA 1SZEA 4LOCA 5KITA 3HJZA 5CGQA 1YDOA 3N34A 3QF0A 4DBDA 4GC4A 5SWUA 2P1FA 3RFAA 4JTTA 1AW1A 3CM4A 2BWGA 2V81A 3KRUA 3F1QA 4Y6GA 4EWND 3Q58A 3HB9A 3ZR4A 1GVQA 2JKEA 4G1KA 5D2TA 2FIQA 2NXIA 3DU0A 4JTUA 3IIPA 5F2LA 5EYWA 3NQMA 4N9CA 2EF9A 1AW5A 3I7SA 4IX0A 2ZTJA 1B3OA 2V8ZA 4MZ8A 4ZVJA 5BMXA 2DJLA 3M7WA 1DV7A 4Z08A 4HHPA 3UWUA 5DCBA 4NXKA 3W07A 4FB7A 3PSVA 2CLEA 4K7YA 4C1KA 3SY5A 3R2GA 1W5QA 3WFAA 7TIMA 3B03A 1VZWA 4E0CA 3RLUA 1T99A 2PRHA 3FOKA 3LBCA 5CPMA 1DVJA 1OFPA 1HFBA 1IXPA 1KFEA 1WV2A 3P8IA 2J9XA 3NQDA 2E5DA 2V9DA 4AWSA 2R14A 4WY0F 1NF7A 3TAOA 4AMAA 2E5BA 4OQVA 1GTHA 3P67A 4JNMA 2E77A 1PVNA 3QPYA 1OYBA 4MOZA 1T8XA 5H91A 3QMTA 3SIZA 5CZTA 2VKZG 2X1TA 4NJJA 3PG8A 3SGUA 3IGXA 3WK2A 2HS8A 3EWBX 4JTGA 2Z1BA 3DFQA 4WY0B 1KA9F 3TQVA 1TPUA 5EPDA 2PE4A 1VJIA 4OV4A 4JX4A 5G1TA 3W9ZA 1A5AA 1LBLA 2NXHA 2PCQA 3TXZA 5J5RA 4AWTA 1G4SA 1R47A 2NV1A 1Z44A 1UBSA 2FDSA 2QUVA 3LXAA 3FEMA 2DZTA 1W5NA 3I7RA 1W54A 2YDAA 1I2RA 1RV8A 1OFOA 2XN2A 3TQKA 4O4VA 1H1ZA 4EOUA 1Q6LA 2WSRA 3CIXA 4ZQMA 1I45A 1KM1A 3O6YX 4JXCA 2J24A 3NAVA 3SW6A 4I7WA 1GG1A 3NM1A 1W3IA 1TTPA 1MXSA 4Q4KA 2ZA2A 4Y90A 4UFHA 1A5BA 2QJIA 1QWGA 1VLIA 1SW7A 5D33A 4HIBA 2X2GA 5F4WA 1F73A 3NPUA 4YCOA 4KFNA 3M9YA 3HPXA 4S2BA 4DF0A 3M41A 2A7RA 2QCGA 3STFA 4Y96A 4JY9A 3MHGA 1RR2A 5TBOA 2C18A 4LY8A 4Q32A 2ZRYA 4JR5A 3H53A 3SSJA 5DELA 1TIMA 1UASA 2Y6ZA 5C6MA 4CQAA 1I8JA 1M5WA 2QCNA 5D02A 1IF2A 3NPWA 5LSMA 4M19A 1Y0EA 3GXTA 3SZ8A 5E1QA 5I3FA 4LVBA 1OFAA 2EAWA 3UWVA 3STGA 4TR9A 3MJYA 4EIVA 3TQ0A 3QMRA 3LRKA 3PM6A 4A3UA 3A5FA 2QEZA 3CQ0A 1W31A 2A5HA 1VRDA 3FYOA 2NLIA 2ABAA 1ICPA 2VEKA 3LB0A 1LRNA 1MEHA 3CTLA 3FJ6A 1N55A 5C2XA 4GNJA 3ZS4A 4LUIA 3CWOX 2ISWA 3MMTA 2ATSA 4O52A 2DZPA 1BTMA 2YW3A 3TROA 1YLVA 3FIGA 1XBYA 5LNVA 3LCLA 3MYOA 1K7FA 3MI2A 3EKZA 2Y62A 2VFIA 1R2SA 4IXXA 4ORIA 3TCEA 4NJIA 3WJXA 1QOQA 3THQA 3EKLA 4LC6A 3TW7A 1JRBA 1LOQA 2CFFA 2I9EA 4NNAA 4PFMA 3HGJA 4X9SA 4LVGA 1PS9A 3W7NA 3S1XA 2OX1A 4UR8A 4CCEA 1SZFA 2WSQA 5CPNA 4DQWA 4OWGA 5CPLA 1ZALA 2E6AA 3LHUA 4P2VA 3GR7A 1K8XA 2VFFA 3GKFA 4RX0A 1Q6RA 1JVNA 3E02A 5FF2A 4DO5A 3IRDA 2ZRZA 3PUOA 3I68A 3W7JA 2JGQA 4Y9AA 4GE8A 3L67A 4DBEA 3M6YA 2E09A 2X1SA 2DP3A 1ZHAA 1PL9A 2GOUA 2QCDB 1AG1O 3EX4A 5GVJA 4O15A 3N14A 3TSMA 5G4EA 1SO6A 3VE9A 5EMUA 3EB2A 1O60A 4H6KA 4JD4A 2YPIA 4POCA 1XBXA 3NQCA 3A22A 5I3HA 2VFDA 4O17A 3P61A 4TMBA 5LHFA 2VFHA 1DBTA 1LDCA 2RH9A 3N9SA 1NEYA 3BV4A 4CQ8A 1DOSA 3PWAA 4O19A 2VC6A 2BX7A 4UMCA 1XKYA 1JCLA 1L6YA 3O07A 2BZNA 1JCYA 1S5VA 1OABA 4UCGA 1RQEA 3EX6A 1EEPA 3W23A 3LHZA 5K4ZA 4IMEA 3KAOA 3G0UA 2FJKA 3DFPA 3LHTA 1OK6A 3M0ZA 4ONVA 3S8HA 3SFKA 2B7PA 4UTKA 3TC7A 3CPRA 1F2JA 1H62A 1B57A 2ABBA 4IUOA 2RFGA 1ADOA 1K02A 3TK7A 2B7QA 3C2EA 1RVGA 4O4WA 2JK2A 3DI0A 4CNOA 3HG4A 2BXVA 2Y70A 1U83A 1XFBA 3W1UA 2RHGA 2G97A 1VYSX 3W87A 4HNUA 3P81A 4K6AA 4UFMA 3PB0A 1TREA 3TMQA 2WV8A 4LVDA 4JN6A 5G2WA 2VEMA 3NQ8A 4M6VA 4IPJA 5LGZA 3FS2A 5HJLA 2DZXA 3W2KA 4BF9A 1ZJIA 3DH7A 1ME7A 4OV9A 1BWLA 3LGEA 5CZSA 3TX9A 4CNPA 4MJZA 4XZ9A 2C6QA 3GDRA 4DPPA 3PULA 1H5YA 5AYYA 2PURA 1VCGA 3LCHA 3NQFA 4GBUA 3GXPA 1JCJA 5E93A 3RLVA 3TNOA 4FNTA 1KFKA 3W2MA 5A5WA 2ZZ7A 2Z0IA 5LNWA 3VE7A 4NU7A 3TSDA 1KFCA 2Q8LA 3OVPA 2KZHA 4LNYA 4QJ1A 2NV2A 1FXQA 4AAJA 5BNKA 2NWSA 3MWAA 1SU5A 2JKPA 3GNNA 1AK5A 2Q3OA 4K38A 5D2WA 4ZMGA 1WOAA 5D2YA 1R46A 3ABOA 5K3VA 2P0OA 1JQVA 1WDWA 1Q3NA 5D04C 3EEGA 1GZGA 2EKCA 3BW2A 5E0KA 3VCRA 1RQBA 3U2OA 4BI5A 3TJXA 1R30A 3IIVA 3F4NA 2YXGA 1TPFA 1OX6A 4WOQA 4GXMA 3PR2A 1LOLA 1H7NA 2QCLA 4K37A 1WX0A 5EKYA 3NQEA 3PBWA 3IEBA 4MLRA 3R8RA 2Y63A 3N3MA 1ZAJA 1P5BA 1K03A 3PC0A 1DHPA 1CW2A 1QO5A 1LBMA 3W1TA 4FNQA 4O13A 3W1XA 4GUHA 4BI6A 5TQLA 2J9ZA 4O8RA 1J4EA 2ZBTA 3W6YA 3C61A 3W2UA 3P8JA 4UFLA 5FEPA 3A5VA 3H54A 1EX5A 3JR2A 4GUJA 3C56A 4JTKA 5DY2A 3TE9A 4HPJA 3BW4A 1F6PA 4LV4A 3TU9A 1OFDA 3GKAA 3N73A 1XM3A 3FKKA 5BMWA 5LGXA 1YXCA 3PBYA 2DZUA 1AL7A 4DELA 2DORA 2R94A 1G4PA 4JS3A 3GIYA 2O7SA 2ZDRA 2C19A 4MJMA 4EF9A 1DL3A 1GQNA 4XKYB 1F7BA 5IM51 4N4QA 4HNTA 4LTSA 4L4LA 5G5IA 5HR6A 2WO5A 3MI6A 4O12A 1OF8A 1DKWA 4AVFA 1EP2A 1SW3A 4ADUA 5I3GA 1JCNA 2ZQ0A 5D05A 1L6WA 1JCXA 4DEFA 2GVGA 5AC7A 4HKPA 4ZQOA 3WK1A 3NPXA 4HSNA 3PB2A 3L0KA 1VCFA 3P62A 2TRSA 4IWWA 1GPWA 2V0TA 4E38A 3PBVA 4QIUA 5HWJA 5KINA 4W9TA 4M5PA 4MPQA 3K30A 3E12A 4A22A 2YYUA 4NZFA 3QEZA 3MP5A 3W1PA 4NX5A 3GXNA 3A9IA 1YTEA 4CCDA 1O95A 3DZ1A 3LCIA 1OFQA 2AQWA 1OFRA 3L68A 1H7WA 3G8RA 3IIXA 4ALDA 2VEIA 3EWWA 5F1VA 3OG3A 3BG3A 4XUGA 1KFJA 1VQTA 3FJLA 3UPBA 4PEKA 4O53A 1ZENA 3MW7A 3PAJA 5D30A 3QPZA 5AFDA 1LP6A 2QF7A 1TPVA 4FIQA 5FF4A 1LROA 1H51A 3QSTA 5FEXA 1N8FA 1FWRA 2FQIA 3LTSA 3O15A 5L6UA 1BWKA 2HS6A 2NX3A 3CWNA 3A23A 3BARA 1F05A 3S5YA 3TC6A 3FFSA 1VS1A 2O7QA 3TJLA 3UWQA 1GJPA 4JTLA 3IIZA 2FPTA 1H7PA 1TJRA 4IOTA 2YR1A 2VFGA 3HIJA 1LLZA 2E68A 4QNEA 1K8YA 3FKRA 4LWWA 3B04A 5AC8A 2BLEA 4QNWA 1IGSA 1C9DA 2C3ZA 3ABRA 1GWJA 3DFSA 5LKYA 4PL2A 3D0CA 3O63A 4UMBA 3DGRA 3C2RA 2XFWA 4WY0A 4Z0SA 4CNNA 2PC4A 1IXNA 3F03K 4ADSA 4LRSA 3WJZA 3W85A 1NF0A 1DJNA 1FCVA 3LCFA 2IQTA 4P61A 3W74A 4MY9A 1SFLA 1H7XA 2ZZ5A 1MSSA 3UZJA 3P5YA 3UNDA 3NZRA 1ZCOA 3NG3A 4PL1A 3AO0A 3I6RA 2WKJA 4IMGA 3L21A 3MO7A 4BI7A 1JQXA 4BFAA 1HTIA 3A24A 3T78A 3UWZA 1LYXA 2QCEA 1QCWA 3W7MA 2FLIA 3GVGA 1TV8A 3W1MA 3IGUA 3M44A 1KV8A 3G0SA 4M6PA 4UFJA 1W5PA 4WD0A 1NAL1 3QJAA 1OHLA 5L9FA 4KFOA 2Z6JA 4QISA 3VI2A 1JCMP 5K9XA 6ALDA 2NX1A 1QPQA 4Z0JA 3NL5A 3W1RA 4AH7A 3T55A 2ZFAA 1KTNA 3G3DA 1GOXA 3KOFA 1XBVA 3S5NA 2CLLA 2EGZA 2PRMA 4K36A 4O18A 1Z48A 4NX0A 4XTIA 4YLWA 1YTDA 1X1ZA 1QMLA 3V75A 3CC1A 2ZZ3A 4XBKA 4HPXA 2QDHA 3LHYA 4RCXA 2Y88A 3LBMA 2DZWA 4UTIA 1OYCA 1I2NA 5KSWA 4O10A 1JR1A 4WXZA 4HNVA 2HSAA 1LBFA 5ABTA 4RXGA 2QDGA 4Q33A 5DY3A 1NVMA 4LVAA 3SGZA 4NUWA 4FIRA 3I65A 2QUUA 3TA6A 1YDNA 4QAIA 1QAPA 3ZWSA 3ZWTA 1DJQA 1PHWA 4NNBA 3S5OA 3G1XA 4IMCA 1H7RA 1KFLA 2Y7GA 3TW6A 3LOTA 4WZHA 5F4XA 1J5TA 3GDLA 4RXFA 2ZTKA 4Z1AA 1ML1A 4UR7A 1H50A 1SPQA 1H61A 3STEA 2P10A 5DCEA 4UTTC 1QPOA 4LRTA 3USBA 4QQ3A 3B0UX 2GJLA 3RF9A 3MBFA 2YW4A 3NQAA 2BTMA 3KVMA 2E6FA 4FX6M 3UD6A 4UTWC 4MUZA 2YSWA 5LHEA 4YXGA 2FPYA 1O94A 3STCA 4IMDA 1GVFA 3R5EA 4WQ6A 5F4SA 4MVAA 1SUXA 3LDVA 3B8DA 4JY8A 3NL2A 3KXQA 1SSGA 5BRBA 1FWTA 4JGDA 4JYFA 1B9BA 1MZHA 1ICQA 2Q3RA 3E96A 2E1DA 4H4IA 4O1BA 3WJSA 3BG9A 1LRTA 2H8XA 4FXRA 4IQLA 4GFSA 1MEWA 4JX5A 4HNNA 2G5WA 2W79A 3MI3A 4NQ1A 2OJPA 2OT0A 1TPEA 4UTMA 3GZ3A 3LCGA 1G67A 4X2RA 3T7VA 2J6XA 1SO5A 3GR8A 1ME9A 3IVUA 2OZ0A 1H63A 2YYTA 4PC8A 1SO3A 2H3BA 4YL2A 5G4WA 3B4UA 3W7CA 2I14A 3L0GA 3G1FA 3Q37A 2B7NA 3TAKA 4C1LA 4UTTA 3NQVA 2A6NA 2ATMA 1VYPX 4UTUA 2QCDA 4H3DA 3R13A 4A2RA 2Y89A 5FEZA 1I4NA 2A7PA 4UFIA 2ZZ6A 4A2SA 1TTJA 5G1YA 1ME8A 4HT3A 2TYSA 4YCPA 5CSSA 1WBJA 3W84A 2J88A 3GDKA 4O50A 4O1DA 2H90A 2ZZ1A 2WJZA 1R2TA 1AMKA 3BGJA 4OGZA 2QJHA 1UB3A 4JDBA 4BK9A 1PHQA 1ONRA 4ZQCA 5CPOA 1FCBA 5DXYA 5HWNA 4ZZ9A 3B05A 2HMCA 2NUWA 3TIMA 3W86A 3EWYA 5AC6A 3THAA 5AHMA 1XUUA 1K3UA 3TDFA 1SO4A 5EA9A 3ZFHA 1ZY9A 3W1QA 3U8GA 3PG9A 1OK4A 3P7YA 3SECA 5HUPA 3LV6A 1D3HA 3ATZA 4E2BA 1TQJA 1TPH1 1LRQA 5AYZA 1KM6A 3V1PA 1Q6OA 2ISVA 2X16A 1VCVA 3LCWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4UOJ A;  3OZY A;  4TU1 A;  1NDZ A;  1SGJ A;  4WEV X;  3TFX A;  2XGI A;  3FEQ A;  4GUI A;  5JIW A;  3L5A A;  1LF1 A;  1E43 A;  5FAG A;  4TO8 A;  4JTF A;  2VFE A;  4U4M A;  4ZBC A;  1DTN A;  3IGS A;  1F07 A;  2VGI A;  4B4H A;  1IR1 A;  5F2M A;  4MNL A;  4QBX A;  1YDO A;  3SSZ A;  3AZS A;  5ABE A;  3GBD A;  2BWG A;  4HTY A;  3OZO A;  1OZM A;  4MJ2 A;  3KRU A;  5A6L A;  1XH2 A;  3WD2 A;  3U2Z A;  3ZR4 A;  2BVD A;  3L4Z A;  2FHC A;  1CBG A;  5D2T A;  1OB0 A;  5LIY X;  1RAL A;  4JTU A;  3OZP A;  4BEU A;  2EF9 A;  3VKA A;  3WEZ A;  2ZTJ A;  4XO7 A;  3THU A;  1GHS A;  1HL8 A;  5DCB A;  1NFP A;  2UY3 A;  2CLE A;  4K7Y A;  3I4K A;  4C1K A;  1MDL A;  3R2G A;  7TIM A;  3AS1 A;  1FWE C;  1VZW A;  4MB1 A;  9XIM A;  5HNU A;  3RLU A;  4HYW A;  3P0W A;  3GG1 A;  1BGG A;  1KFE A;  3P8I A;  1KRC C;  5FL0 A;  2E5D A;  2R14 A;  4AMA A;  1NM9 A;  4JNM A;  3CNY A;  1US0 A;  3QPY A;  5H91 A;  1UD8 A;  3SIZ A;  2VKZ G;  4NJJ A;  3IGX A;  2VC5 A;  2W3Z A;  1JZ4 A;  4JTG A;  3PAO A;  4Z17 A;  2V5C A;  1EX1 A;  4XB3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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