1H7RA

Schiff-base complex of yeast 5-aminolaevulinic acid dehydratase with succinylacetone at 2.0 a resolution.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
342
structure length
342
Chain Sequence
MHTAEFLETEPTEISSVLAGGYNHPLLRQWQSERQLTKNMLIFPLFISDNPDDFTEIDSLPNINRIGVNRLKDYLKPLVAKGLRSVILFGVPLIPGTKDPVGTAADDPAGPVIQGIKFIREYFPELYIICDVCLCEYTSHGHCGVLYDDGTINRERSVSRLAAVAVNYAKAGAHCVAPSDMIDGRIRDIKRGLINANLAHKTFVLSYAAKFSGNLYGPFRDAACSAPSNGDRKCYQLPPAGRGLARRALERDMSEGADGIIVKPSTFYLDIMRDASEICKDLPICAYHVSGEYAMLHAAAEKGVVDLKTIAFESHQGFLRAGARLIITYLAPEFLDWLDEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Dehydratase
molecule keywords 5-AMINOLAEVULINIC ACID DEHYDRATASE
publication title The X-Ray Structure of Yeast 5-Aminolaevulinic Acid Dehydratase Complexed with Substrate and Three Inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 116
structure length 342
sequence length 342
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2001-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1h7rA00
3DXIA 3M43A 2WSRA 2YYTA 1IIHA 1QCWA 2H8XA 4HNTA 2XN1A 5I3JA 1DKWA 3QW4B 3QMRA 3NA8A 5LNVA 4EF8A 3EWUA 5BOOA 1ICSA 1TPB1 1YADA 1L6YA 3SJ3A 3W70A 4LTSA 3GDTA 3DENA 3HBLA 3T7VA 4UTHA 5IM51 3ATZA 2RDTA 4OT7A 4QJ1A 1S5WA 3CLMA 1OFOA 3MP5A 1FWSA 1Z41A 2ZZ7A 3GX9A 3LRLA 1GOXA 3YPIA 1OFAA 5F2IA 3UPWA 1ZNNA 2DZPA 3B8DA 1G4EA 1TB3A 2WSQA 3QH2A 4LC6A 3QMTA 4CQAA 3HGJA 4FX7A 1OFBA 1D3HA 1P5BA 3IIVA 2QDGA 2Y70A 3HIJA 3LGEA 3LV5A 3WK3A 1XI3A 2CW6A 2X1TA 3LXBA 3NL2A 1TPEA 4LUJA 1SFJA 5HR7A 3STCA 3THQA 2YX0A 5EY5A 3MW7A 4GC4A 2EGZA 1I45A 3P5ZA 1J4EA 2YFNA 1YTDA 2Z1BA 3P74A 1RZMA 4NNAA 5FF3A 3GAYA 1FBAA 3UWUA 4EOUA 4OV9A 2HS8A 3G3DA 4WQ6A 3AO0A 3C2VA 3QJAA 3GR8A 2BLEA 3U8GA 5LZLA 1VYPX 3TE9A 3PVFA 3LCHA 4POCA 4TX9A 2EAWA 4HN4A 1DV7A 5D32A 4MY1A 2G5WA 5AC8A 4Z1CA 1LCOA 5D2YA 2C14A 3S1WA 3HGRA 4UR8A 2P0OA 3LTSA 4A2RA 2QCCA 5HWNA 3IGUA 1XXXA 1B4KA 2J9YA 4UTIA 3SZ8A 3LCWA 4O4WA 1M6JA 2VKZG 4QNWA 4K6AA 4NNBA 3W87A 3A21A 1SFLA 4EF9A 3G22A 5E93A 2C16A 1TIMA 4JTEA 2FJKA 2PC4A 2H3BA 1YDVA 1CI1A 4NZFA 3W7QA 3W3OA 4DBDA 5E1QA 5DCBA 1LOQA 1WOAA 1W8SA 3G18A 4O50A 3RLUA 4DF2A 1HG3A 2TPSA 3M5XA 3A22A 1OF6A 1AG1O 3PBVA 3GR7A 4GE8A 4O1AA 2FQIA 4N02A 3TW7A 1EWDA 1XBZA 2Z0IA 4LVGA 1O95A 3BV4A 3TMQA 1THFD 1KTNA 1FCVA 2DZSA 1ML1A 3IGXA 4HSNA 4UFKA 3UXDA 2A6NA 4DO6A 1TYGA 2FDSA 3B03A 3LHZA 5TBOA 1XDLA 4HNVA 3PY2A 2ZZ4A 1MO0A 1M7PA 4K37A 4K7VA 3FA5A 3Q58A 2IQTA 3WK1A 2WQPA 2OT1A 2VFHA 4MY9A 4YLWA 5EBUA 1ZY9A 4QNEA 3EX1A 3FFSA 3W2UA 2Y7FA 4HIBA 1GYNA 1TJPA 1FX6A 4JDYA 2QEZA 3DKLA 3ELFA 3I7SA 1QPNA 4AEOA 1XUZA 5GVJA 4JYDA 2I1OA 3G24A 4JGDA 4FHAA 1OX5A 1F6PA 3WFAA 2YXGA 4EIVA 3IIOA 2G97A 4IPJA 3TAOA 1A5SA 2VFGA 2CZ5A 2DORA 5F2GA 1JUEA 1SQ7A 4GRSA 1WA3A 3VI2A 2OCZA 1VHCA 1JQXA 3EWYA 4JTFA 4JS3A 1VLIA 4Q33A 4LW7A 2VOMA 4UFIA 1GG1A 4HPXA 3O63A 3BO9A 3GXNA 3TQKA 2V81A 4GFSA 3CEPA 3W7IA 3GAKA 5FEPA 3LLFA 3GKAA 4LRTA 3TIMA 3SR7A 4XQ6A 3PBUA 3LLDA 3VFLA 4BFAA 3M5ZA 1Q3NA 1Z48A 3HB9A 5KZDA 1TV7A 3BG5A 1SW3A 3TQ0A 4O10A 3NEVA 4KFPA 3M47A 3TAKA 4UTUA 4IQLA 2V2HA 2ZDRA 3CIWA 2FPYA 1H7WA 5D05A 3LRKA 4GUGA 1TSIA 1IXPA 3HPSA 3QQ1A 5I3GA 3M7WA 4TMCA 1FUYA 2ZRZA 3L21A 5C6MA 1TPVA 4ZL1A 4FX6M 4MPQA 5K4XA 4YMZA 1QPQA 2Y7GA 1JQVA 4M19A 1SZEA 3EXSA 1KTBA 3O15A 4I7VA 1L2UA 2QUUA 4PEKA 4U4MA 3HOJA 2HMCA 3QW3A 4O53A 1LP6A 4UTJA 1GG0A 4I7UA 5HUOA 2HTMA 3DFTA 5G2HA 3W7RA 3P60A 1AMKA 1Y0EA 3VE7A 1EEPA 1FQ0A 3QQ0A 2GJLA 4ADTA 4BI7A 3HG4A 4M7TA 4H3DA 4CCEA 1P0NA 1LDCA 2YW4A 1QAPA 4LVFA 3NQGA 1F05A 3NL6A 4CQ9A 1VCVA 3C52A 1FCQA 2ZCGA 5K3VA 2AQWA 3QF0A 3U6WA 4UFJA 3LRMA 4DF0A 1N55A 2GQ9A 2C15A 5IBXC 1VR6A 4IMGA 1DL3A 3E49A 1JCNA 3WJWA 3HF3A 3PUDA 5DCEA 4MIMA 2ATMA 1W3IA 3TNOA 4K39A 4QQ3A 2Q8ZA 3PUEA 8TIMA 2B0MA 1SPQA 2NX3A 5LHFA 3LB0A 5AYZA 4K36A 1FWTA 4JTUA 1C29A 3BW4A 5CPOA 2YW3A 4MLRA 2UV8G 4TR9A 4A3UA 4AWSA 4IWWA 4OU1A 3CWNA 3IEBA 2FTPA 3PAJA 2I9EA 1JCMP 4JTSA 1XCFA 2JBMA 1P1XA 1GZGA 4LT9A 3TJLA 3O8AA 1TPWA 4CNOA 2H3DA 3UZ5A 2VEKA 3C61A 5KSWA 2A5HA 4NVTA 3C0JA 4O1DA 1F2JA 1DQXA 1TV5A 1GT8A 4OV4A 4ADSA 4JYEA 5HULA 5KZEA 3W1XA 3W73A 4JDBA 3EXRA 2ABBA 2W79A 2ABAA 3W7LA 1Z44A 2A6LA 3LXAA 4OE7A 1OFRA 1GJPA 2FPVA 3HGSA 2X1RA 1VCFA 3TCEA 1XBYA 5DY3A 1H7NA 1L9WA 4FXRA 3GLCA 3USBA 2YPIA 3SIZA 4UTWC 2RKXA 1H1ZA 4AH7A 1G6CA 1GVRA 5IBXA 2GVLA 2C18A 1OG0A 2F7FA 4FX8A 1W5PA 2Y63A 2Y85A 4NU7A 3NVTA 1L6WA 3OVPA 3JRKA 3KOFA 4MLJA 3HQ1A 3GDMA 1TTPA 5AHFA 1O60A 4S1FA 4K8EA 5CKSA 4YL2A 2TYSA 1EA0A 4PODA 4HNNA 2QJIA 1OFEA 3DFOA 1Q6LA 3L67A 1XKYA 3G1HA 2JK2A 3H53A 1DJNA 1BTMA 1WQ5A 4IJBA 2Z6IA 4K38A 4O28A 2QCEA 1RQEA 1TTQA 3MYOA 3QC3A 4FNPA 5LKYA 2A7NA 4M6PA 4LU0A 4KWVA 3DFNA 3PG9A 1JCXA 3FYPA 1H1YA 1QPOA 1TPC1 4UTTC 1YTKA 1X8FA 1MSSA 4L4MA 3UWQA 3RF9A 1ME9A 1FY6A 1B57A 1S5VA 2VELA 2NUWA 2W0UA 3DBPA 3N9SA 3F1QA 4AF0A 2JGYA 1A5AA 3M6YA 1UJPA 1G69A 3OA3A 2CLEA 3BGGA 5AHNA 3L68A 2XN0A 2FB3A 1UUOA 1VYSX 2DP3A 2NXIA 3L5AA 3QEZA 2J6XA 2EHHA 3TK7A 4UTWA 3GXTA 4HNUA 1MEWA 5BRBA 1ZAJA 2ZTJA 5CSSA 1W5OA 4ADUA 1SO6A 2Z6JA 1O5KA 4DO5A 3NL3A 1TQXA 4UIOA 1KM0A 1S5TA 1F73A 1KFKA 1QO5A 2XFWA 2ALDA 5LNUA 1TCDA 3W1PA 3W2MA 1EP3A 4O17A 1WV2A 2GUUA 3TW6A 5EYWA 4GNJA 4O13A 3TKFA 2YZRA 4P2VA 1JCJA 1GVQA 1SZGA 3IV3A 1QOPA 1HL2A 4L4LA 2DJLA 2E6AA 2NX1A 1GQNA 3SY5A 4XUGA 3TSBA 3TC6A 3C2EA 2E5CA 5HNRA 1W31A 4Z1AA 3F03K 4CCCA 1W3TA 1VYRA 3RFAA 5EPDA 4OWGA 2FPTA 4WZHA 2YR1A 3GK0A 3HO8A 3PBYA 4QM1A 3PWAA 4FNQA 3S5NA 1YXYA 4R34A 5AFDA 5LGXA 3O16A 2V5BA 1TPUA 2CLFA 3NQMA 2A4AA 3NPXA 2WNQA 3HG2A 1F6KA 4RKAA 4H4IA 5F1VA 3VCRA 5HJLA 2CLHA 1DVJA 1I2NA 2ISVA 3NZ1A 4ZZ9A 3RNDA 1N7KA 3OG3A 3W1AA 4MYXA 1LORA 3P7YA 5D33A 2A0NA 4WOZA 4RX0A 3ZWSA 1KM4A 4ZQPA 2Z2UA 5LNWA 4BWLC 2LLEA 3MO7A 2QUTA 2NXHA 2ZA1A 3EB2A 1HUVA 1G4SA 3RLVA 4O8RA 3W2KA 3DZ1A 2ZZ6A 5HINA 4E2DA 1YXCA 3W7KA 3T40A 5DXYA 1UBSA 2QCDA 3NQVA 1GWJA 1TV8A 1I8JA 4AMAA 4FB7A 1SUXA 1PCKA 1XDMA 3SECA 2HSAA 3STGA 1MEIA 3KFTA 3OVQA 2NWRA 3W07A 4BK9A 1G7UA 1X1OA 4IXXA 3T55A 1KTCA 1TO3A 1T0OA 2JKPA 3R12A 2G95A 3LHVA 2ZBTA 3NZRA 1H61A 1MZHA 3SFKA 4CQ8A 1UASA 4O14A 3KVJA 3LERA 1WXJA 1BWKA 2EF9A 1KM1A 4U28A 4DBEA 4ORMA 1PVNA 4PCFA 3NPWA 3DI1A 3LI0A 1W5QA 3EWWA 3UY8A 1K02A 1NEYA 4FO4A 5CSRA 3THAA 1XUUA 3V1PA 3PG8A 4WX2A 2GVJA 3TUUA 3LCFA 3LHWA 4QIUA 1OYAA 5G1YA 1YDOA 4FIQA 1EX5A 1FDZA 3S42A 3DFQA 2BXVA 5HUPA 4HKPA 3NQ8A 3SSJA 1K7EA 1OYBA 1Q6RA 4TU1A 4BWLA 1FWWA 3GKFA 4A22A 2A2IA 1OX4B 3F4WA 2NV2A 3BARA 3TXVA 3F4NA 2E6DA 3W1LA 2YYUA 1FXPA 4NT0A 1UB3A 2VFEA 1JCLA 2QCLA 5K9CA 4JIPA 5D2VA 3MYPA 1W0MA 2ZRVA 2ZQ0A 3HPXA 3A24A 1VLWA 1D3GA 1U5JA 1SR9A 1SSDA 3NL5A 1LRQA 3O07A 3KVKA 3C2RA 3NPVA 3DH7A 1TRIA 1K8XA 1ADOA 4TIMA 5EA9A 1JR1A 3UWWA 3P8IA 3NQCA 2NZLA 3G0UA 3C8FA 2Q3RA 1TTJA 4JX5A 5F4WA 4EVZA 3O6YX 3H54A 3P81A 2BZNA 3W83A 1JRCA 4JR5A 1ICPA 3W1UA 3FIGA 3GDKA 1GPWA 2RDUA 3W1NA 1KFJA 2GQ8A 4I7WA 1C8VA 3A9IA 3CIXA 4JNMA 1I2QA 4JX4A 3HGOA 4N9CA 4FNUA 1DQWA 4M7SA 1OK4A 2QCFA 1UUMA 5DELA 3C2FA 3NQAA 1VHNA 2KZHA 2QDHA 3NAVA 3DGRA 4IGHA 3INPA 4Z08A 3NQ7A 3VKJA 4O0ZA 3G1AA 2GJNA 3MI6A 1DBTA 1YLVA 3RU6A 4TMBA 3GB6A 3HG3A 3ABQA 3P61A 3NM3A 1QPRA 3MBDA 1I2RA 1YPFA 5J5DA 4JTGA 1LBLA 5U7SA 1TRDA 4MVAA 4UTKA 4MYAA 5DXXA 4HPJA 3M1ZA 4UTLA 3N9RA 4M5PA 1KA9F 1NFBA 3N34A 3KVMA 2VFDA 3BW3A 4CNNA 1BEUA 3NQ6A 3W72A 4NJGA 1K3UA 4UNKA 3BG3A 1K7XA 2A7RA 3CEUA 2DZXA 2E1DA 3P84A 3W7HA 5AHLA 2CZFA 4QISA 1VCGA 2X16A 4MOZA 3S1VA 2WNNA 3G1FA 5J5RA 5KINA 1IXNA 1V5XA 4AAJA 4DPPA 2PRHA 5BMWA 1W37A 3GYEA 3C6CA 3UNDA 1YPIA 3H55A 4XWUA 2NLIA 1OX6A 1XC4A 1KW1A 3U2OA 3PB0A 3UYCA 1X7FA 2Y88A 3NPUA 1R2TA 1XL9A 2VEIA 2WNZA 3W84A 1DJQA 3T78A 4IX2A 4X22A 3E96A 4XTDA 4O12A 5BNKA 1VPXA 4O4VA 2QCGA 3WJZA 4DF1A 5AB3A 3IIZA 3LBMA 4RR4A 4KWWA 1I4NA 2ZA2A 1DOSA 4BR1A 2OX1A 1VGAA 3GXPA 1OABA 1UCWA 1F5ZA 4O15A 3KRSA 1KFEA 3PUOA 5DBUA 1SO4A 1QR7A 1ZJIA 2CLLA 3C3NA 5D03A 1GEQA 4XBSA 3W1MA 2ZRUA 2NUXA 4UUIA 3N2XA 3FKRA 1HFBA 2NWSA 3QRHA 3O6DA 3CB8A 5SWUA 4IMDA 2ZZ1A 2WPBA 4DO4A 5ABTA 1PIIA 1OFPA 1H7OA 3W6YA 3R13A 4WOQA 1SO5A 5BMXA 2VENA 3D0CA 1P4CA 4XKYB 3IRDA 2C3ZA 2C6QA 1KBIA 1JULA 1G4TA 2B7PA 3W7CA 4LRSA 2NXGA 1QOQA 4WY0B 5I3IA 1R46A 1GVOA 2YGYA 5HMSA 1GVFA 3C2OA 5D38A 3BLFA 2DJXA 4KFOA 4D2JA 4PC8A 3B0VC 1EIXA 3W7GA 1QMLA 3QSRA 3IVUA 4QAIA 3NR0A 3DHDA 4WJEA 3UWZA 4O19A 3G8RA 4ZQRA 4NQ1A 4Y9AA 3M9YA 1JUBA 2PRLA 5F4XA 3NQDA 1H5YA 4P61A 2RH9A 3G1VA 1Q45A 3N3MA 3KVLA 3UD6A 4S2BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DXI A;  2R9R A;  2WSR A;  2AL2 A;  5C8B B;  3B8S A;  4G2D A;  3OTR A;  4LF1 A;  3VKB A;  5AYB A;  3OOD A;  3E3H A;  2OLH A;  4B2D A;  4BF7 A;  5LNV A;  4EF8 A;  1TPB 1;  3MCM A;  3NUK A;  3SJ3 A;  4DUW A;  4LTS A;  2QV5 A;  2F8Q A;  4PB4 A;  4UTH A;  6XIM A;  1H41 A;  1TIW A;  3D3A A;  1Z41 A;  3V0T A;  5DT5 A;  1QT1 A;  1OFA A;  3REQ A;  2EPN A;  5EFD A;  3B8D A;  1A5N C;  3MZ2 A;  4P7O A;  1KR1 A;  3QMT A;  2HVO A;  4HHM A;  1OFB A;  1D3H A;  3EA3 A;  3TN3 A;  2Y70 A;  3ARX A;  3LGE A;  2X1T A;  1KRA C;  4LUJ A;  3LU2 A;  2G3J A;  3THQ A;  4CQB A;  5EY5 A;  3WH7 A;  1UA3 A;  1C9W A;  2X2Y A;  2YFN A;  4AUB A;  2Z1B A;  3NDZ A;  3P74 A;  4WGX A;  3EB3 A;  3RN6 A;  5FF3 A;  4MWA A;  2XVK A;  5LXE A;  3GAY A;  3WD0 A;  3G3D A;  2Z25 A;  4KW2 A;  3QJA A;  3GR8 A;  3GY1 A;  1A4L A;  4HHL A;  5LZL A;  3TE9 A;  2OWC A;  3UET A;  3BMX A;  2EAW A;  3EWC A;  1DV7 A;  3OLD A;  2G5W A;  2C14 A;  3MS8 A;  3WF0 A;  5HWN A;  1H09 A;  1XXX A;  1B4K A;  3KDN A;  4FLO A;  2J79 A;  3EA2 A;  4NNB A;  3BLO A; 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