The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
52
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
MLTAEDKKLIQQAWEKAASHQEEFGAEALTRMFTTYPQTKTYFPHFDLSPGSDQVRGHGKKVLGALGNAVKNVDNLSQAMAELSNLHAYNLRVDPVNFKLLSQCIQVVLAVHMGKDYTPEVHAAFDKFLSAVSAVLAEKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
PROTEIN (HEMOGLOBIN D)
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| publication title |
The structural and functional analysis of the hemoglobin D component from chicken.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
52
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MOC A; 3QJC B; 1MWC A; 4L7Y B; 110M A; 4KN3 A; 1N9F A; 1GVH A; 1H1X A; 1A3N A; 3HRW B; 5CN7 A; 1MLQ A; 3A5G A; 1Y35 A; 1TES A; 1BZ6 A; 5EUI A; 3ZJM A; 3WCT A; 2QFN A; 4LPI A; 1HDS A; 1YHU B; 2ZFB B; 2E2Y A; 1VWT B; 2V1I A; 1CPW A; 4NI0 B; 2RAO B; 2IG3 A; 1Q1F A; 3G53 A; 2ZT0 A; 2ZS0 B; 4U8U D; 1YE0 B; 1Y0T A; 1Y7D A; 1F5P A; 2W72 B; 2HBG A; 2WTH A; 1DXT B; 1SDL B; 1O1P A; 3S1I A; 3QJD B; 3O7N A; 1MLU A; 4KJT A; 3CY5 B; 3EU1 A; 3GDJ B; 4ESA A; 1J40 A; 1HSY A; 1YH9 B; 1KFR A; 1MNO A; 4TWU A; 1LJW A; 3IC0 A; 2HBD A; 1Y09 B; 4YU4 B; 1GDK A; 1VRF A; 2ZLV A; 1XZ7 B; 3UHI A; 1BVD A; 1MTK A; 3OO5 A; 2V1E A; 3ARL A; 5AZR A; 3GQR B; 2D5Z A; 1RVW A; 3QZZ A; 3AT5 B; 2VLZ A; 106M A; 1CQ2 A; 1SDK A; 1W92 A; 1CBM A; 4MPM A; 3ZOL A; 1M6M A; 1R1Y A; 5CNC A; 3ARK A; 1YGF B; 1QPW B; 1YMA A; 1Y5K B; 5E6E B; 3SDH A; 2ZT3 A; 3BJ2 B; 1Y0C A; 1O1M A; 1THB A; 3HEN A; 3OJ1 A; 1J3Z A; 1CH2 A; 2Z6N A; 1X9F C; 2AV3 A; 1HBH B; 2MYE A; 5CNG A; 1A01 B; 1J3F A; 3AQ6 A; 2ZLU B; 4HRT A; 1CLS A; 4F68 A; 3RJN B; 4X0L A; 3NG6 A; 1HDB A; 1LFY B; 1LFT A; 4O4T A; 5B84 A; 4N7O A; 1JEB A; 2VYW A; 1PBX B; 3OGB A; 3WCW B; 1ABY B; 2DXM B; 1G0A A; 3R5I A; 112M A; 4N7P A; 3D1A A; 4M4B A; 1M9P A; 2R1H B; 1G09 A; 2O5Q X; 4PQC A; 1MOD A; 2HCO B; 2MYB A; 3S65 A; 2EVP A; 4O2G A; 1SHR B; 1DUK A; 3OO4 B; 3UBC A; 1Y7Z B; 1NEJ B; 2Z6T A; 5HLU A; 1CP0 A; 2ZST A; 5C6E A; 3UHX A; 4OOD A; 1EBT A; 1LHS A; 2DN1 A; 1JW8 A; 4GZG A; 1S5X A; 2NX0 A; 3MJP A; 3KMF A; 1C40 B; 2ZSR A; 1G0B B; 1O1I B; 1Y5J B; 3TM9 A; 3VHB A; 1NZ5 A; 3D4X B; 1BUW A; 3GOU B; 1NZ4 A; 1BZ0 A; 1T1N B; 4MBN A; 1K1K B; 3VRE A; 2MBW A; 1OJ6 A; 4N8T B; 1CG5 B; 1MKO A; 4TYX A; 5HBI A; 3AG0 A; 1QXE A; 2ZT1 A; 1YVT B; 4F69 A; 3WFU A; 1Y4R B; 2GKM A; 2G0X A; 4N7N B; 1CH1 A; 4HRR A; 1O1L A; 1GLI A; 1SPG B; 2W6V B; 4NXA A; 5ILM A; 1MYT A; 1CO9 A; 2ZSO A; 2ZWJ A; 1BBB B; 1Y0W A; 2AA1 A; 2PGH A; 1SPE A; 1LH2 A; 1LFV A; 2YRS B; 2QFK A; 3ZH0 A; 1S5Y B; 4MQJ B; 5ILR A; 1LH3 A; 2D2N D; 3NMM B; 1MBS A; 2XKH A; 2OH8 A; 1J7Y B; 2R4W A; 3GYS B; 3QJC A; 1YG5 B; 3PEL A; 1GDL A; 2OLP A; 3G4U A; 1MTJ A; 2MGM A; 1HGB A; 1SI4 B; 1BZZ A; 1F63 A; 1UIW A; 2BLJ M; 3ARJ A; 1JL6 A; 2HHB A; 1CH5 A; 4HSW A; 1A3N B; 1LH5 A; 1LH1 A; 3LQD A; 5MBA A; 4AVE A; 2GTL C; 1Y35 B; 5EUI B; 1YCA A; 5EV5 A; 3WCT B; 1HDS B; 1MYF A; 1GZX A; 2OIF A; 2FAM A; 3PI4 A; 4MU5 A; 4ZVB A; 1YE2 A; 4F6I A; 1MNJ A; 3P5Q A; 1Y0T B; 3S66 B; 5EE4 C; 4BJA A; 1Y7D B; 1DXC A; 2VYY A; 1ITH A; 3ZOM A; 3QJE A; 1O1P B; 3V2V A; 2VEB A; 3ONZ B; 3EU1 B; 4ESA B; 1J40 B; 1JF4 A; 2EVK A; 3GLN A; 1LJW B; 3IC0 B; 3DHR A; 1A6N A; 4UUR A; 2HBD B; 1NQP B; 3QM7 A; 2O5L X; 5CMV A; 2ZLV B; 1VXE A; 3OO5 B; 3B75 A; 4O4Z A; 1N9I A; 1NIH A; 2G0R A; 2ZSX A; 2W6Y A; 2EKT A; 1ECA A; 3HYU A; 2D5Z B; 1RVW B; 1V07 A; 1A0Z A; 3UHW A; 4HHB A; 5HY8 B; 1YZI A; 3ASE A; 3KUN A; 4HBI A; 1SDK B; 2C0K A; 1NXF A; 5KER A; 1YIE A; 1QPW A; 4XS0 A; 1GCW A; 3ZHW A; 1R1Y B; 2VEE A; 1NWN A; 1HDA A; 2H35 B; 3WCU D; 3MYM A; 1JPB A; 1J41 A; 2HZ1 A; 1Y0C B; 3TLD A; 1O1M B; 1THB B; 3BOM A; 1MWD A; 3BCQ A; 2AUR A; 3WCV D; 2BWH A; 1EMY A; 1K0Y A; 1LFY A; 2Z6N B; 3A59 A; 1LH7 A; 4HRT B; 1CLS B; 2R50 A; 4X0L B; 3UHZ A; 1B86 A; 3NG6 B; 3WCW A; 1QI8 A; 2DXM A; 2HZ2 A; 4N7O B; 3D7O A; 2D60 A; 4ZVA A; 5JDO C; 4MBA A; 2QU0 A; 1G0A B; 1HGA A; 3R5I B; 2HCO A; 2R4Y A; 2VLY A; 3D1A B; 1M9P B; 1SHR A; 1G09 B; 1DM1 A; 1CH7 A; 3S65 B; 4MQH A; 1A4F A; 3O89 A; 1XCH A; 2W72 C; 2D2M B; 3ZJS A; 2HBF A; 2HBE A; 5B85 A; 1F5O A; 1C40 A; 2DN1 B; 1S5X B; 3MJP B; 3CIU A; 3WCP A; 1MLM A; 1BUW B; 2V1J A; 3UH5 A; 1BZ0 B; 3VRE B; 1UVX A; 1G9V A; 4FWX A; 4B3W A; 1YVT A; 1CP5 A; 4WJG 1; 1MKO B; 1YHE A; 1A0U A; 1VXD A; 3ZJI A; 1J7W A; 3A9M A; 1QXE B; 1YEU B; 2B7H A; 1A3O A; 3PT8 A; 2XKG A; 1UX9 A; 4HRR B; 1N9H A; 1GDI A; 1O1L B; 1GLI B; 1L2K A; 3G52 A; 4M4A A; 1HRM A; 2MYC A; 1IRD B; 1JL7 A; 3ODQ A; 1Y0W B; 2R80 A; 2D2N A; 2AA1 B; 4C44 A; 2PGH B; 1NZ2 A; 1BIJ A; 3BA2 A; 2LH1 A; 3UHH A; 2FRI X; 1J7Y A; 2BLH A; 3FH9 A; 3VRF A; 1Y4B A; 1ECO A; 1C7C A; 3ZJR A; 1COH A; 3MKB A; 3OVU C; 3OZU A; 2OHA A; 3KUO A; 1V4W A; 1NPG A; 3K3U A; 1SI4 A; 3PEL B; 3UHN A; 6HBI A; 1FAW A; 1HBI A; 2NRL A; 1HGB B; 2GNV A; 1BZZ B; 1UIW B; 2DN3 A; 2HHB B; 3WCW C; 2M6Z A; 3UH3 A; 1DO4 A; 2PEG A; 1XZ5 A; 2ZT2 A; 3LQD B; 3AQ5 A; 1MTI A; 2AUP A; 4FWY A; 4YU3 A; 1SWM A; 1Y2Z A; 3H58 A; 1MBO A; 2EF2 A; 3GQP A; 2ZFO D; 1XQ5 A; 3S66 A; 1GZX B; 5CHQ A; 3WTG A; 1YE2 B; 1CG8 B; 2MB5 A; 3ZJJ A; 2ZS1 A; 3P5Q B; 3WHM A; 5JDO D; 1FHJ A; 1U7R A; 2V1F A; 1YHU D; 4FWZ A; 3ONZ A; 7HBI A; 2XKI A; 1GBV A; 5HU6 A; 1MBI A; 3DHT A; 1MNI A; 3QJE B; 3EDB A; 5E83 A; 1Y22 B; 2G11 A; 2ZS0 D; 1XZU A; 2MGE A; 1NQP A; 5CN8 A; 3HEO A; 1RPS A; 1LA6 A; 1LFL A; 1BVC A; 3DHR B; 2GRZ A; 2LH5 A; 1CBL A; 1Y85 A; 1A9W E; 2GNW A; 1YGD A; 4G1V A; 1HLM A; 3B75 B; 1NIH B; 1OUU A; 3V2Z A; 1Y45 A; 3FS4 A; 5HY8 A; 1Y0D A; 1OFJ A; 3HYU B; 4H0B A; 1XZ2 A; 3ZJP A; 3GKV A; 1A0Z B; 3WCU A; 4HHB B; 1YZI B; 3D17 A; 1RSE A; 2QRW A; 1N9X A; 3BJ3 A; 2H35 A; 3OK5 A; 3M39 A; 3WI8 A; 5KER B; 2JHO A; 1YIE B; 4XS0 B; 3M3A A; 2GRH A; 1GCW B; 1Y46 A; 3GK9 A; 3UGZ A; 1DKE A; 3WCV A; 1HDA B; 1A00 A; 2W6W A; 3QM5 A; 1JWN A; 1J41 B; 3QZX A; 3BOM B; 1C7B A; 3BCQ B; 2VLX A; 5EYJ A; 2ZT4 A; 1K0Y B; 1JZL A; 4ROL A; 3A59 B; 5EU2 A; 2MGC A; 1CIK A; 1B86 B; 1QI8 B; 1NS9 A; 3D7O B; 5JDO F; 1Y83 A; 2D60 B; 3WCT C; 2QU0 B; 1HGA B; 2GKN A; 1QSH A; 5M3S A; 2D2M A; 1U7S A; 2O5B X; 3K9Z A; 1A4F B; 4MQH B; 1HAC A; 3AT6 A; 5JOM A; 4MQK A; 4ILZ A; 1IWH A; 1V4U A; 2ZS1 C; 2HBF B; 2HBE B; 3PI9 A; 4L2M A; 2BW9 M; 1V5H A; 3DUT A; 1DLY A; 1MLK A; 3CIU B; 5D5R A; 3QQR A; 1Y7C A; 1J7S A; 3UHV A; 1S0H A; 3WCP B; 3E55 A; 3WFT A; 3IC2 A; 1BIN A; 1MBN A; 4F6F A; 3ECX A; 4QAU A; 3UHE A; 1YEU A; 1G9V B; 2R4Z A; 1CIO A; 1YHE B; 3G4Y A; 1A0U B; 5SW7 A; 1Y01 B; 3PI3 A; 1J7W B; 4ROM A; 2B7H B; 1A3O B; 3PT8 B; 3OZV A; 3R0G A; 1IRD A; 5CNF A; 5EQM A; 2DC3 A; 3HF4 A; 1MYG A; 2BK9 A; 4M4A B; 1DXV A; 1RTE A; 3MJU A; 5AB8 A; 1MLR A; 5C6Y A; 3ODQ B; 2HHD A; 2R80 B; 3M3B A; 2D2N B; 3UH6 A; 1BIJ B; 1DO1 A; 3UHB A; 3A5B A; 4F6J A; 4PQB A; 1Y8W A; 3FH9 B; 3VRF B; 103M A; 1Y4B B; 2LH2 A; 3D1K A; 6HBW A; 1YIH A; 1C7C B; 1FDH A; 1ECD A; 5ILP A; 1COH B; 3MKB B; 1MNK A; 4OF9 A; 2VRY A; 1YMC A; 2ZSP A; 1V4W B; 5IKS A; 1XYE A; 1MYZ A; 1FAW B; 2DN2 A; 1JY7 A; 2DN3 B; 3NFE A; 1ABW B; 1BZ1 B; 4DC8 A; 2ZFO A; 4U8U A; 3MN0 A; 2M6Z B; 1MZ0 A; 2PEG B; 4WCH D; 1BJE A; 1UFP A; 1XZ5 B; 3W4U A; 1X9F D; 105M A; 2QMB B; 4YU3 B; 1Y2Z B; 2GLN A; 3GQP B; 4UIQ A; 1CG8 A; 1XQ5 B; 3MBA A; 2D2M C; 1OFK A; 2XYK A; 3MOU A; 1HBR A; 2SPL A; 4PNJ A; 3WTG B; 1LHT A; 4F6B A; 2ZS1 B; 3ORD A; 4F6D A; 3WHM B; 1R1X A; 1XZV A; 3WCT D; 1UVY A; 2W31 A; 1FHJ B; 1Y22 A; 2BKM A; 1JZK A; 3MVC A; 2Z6S A; 1GBV B; 3KMF C; 5HU6 B; 3DHT B; 5E83 B; 3G4V A; 1EWA A; 1Y4P A; 4F6G A; 4WJG A; 1V9Q A; 1XZU B; 2O5O X; 1RPS B; 1LA6 B; 1LFL B; 4G51 B; 2SPN A; 2VM0 A; 2MGB A; 2G0Z A; 1JP9 A; 4JAC A; 2G10 A; 1Y85 B; 1LFQ A; 3M38 A; 1YEQ A; 1YGD B; 4IRO A; 1MLL A; 1QSI A; 2FRJ X; 3UHY A; 2NSS A; 3LB2 A; 1QXD B; 1IT2 A; 3PT7 A; 1OUU B; 2H8F A; 1Y45 B; 3FS4 B; 5CN4 A; 1Y0D B; 1XZ2 B; 3EDA A; 3GKT A; 2D5X B; 1RTX A; 4MAX A; 1WVP A; 3GKV B; 3WCU B; 1OBM A; 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2O5T X; 6HBW B; 3D1K B; 1YIH B; 1HAB A; 2G3H A; 1MBA A; 2LHB A; 3UHQ A; 1FLP A; 1V4X A; 1GCV A; 3SZK A; 1Z8U B; 1XYE B; 1ABW A; 1BZ1 A; 2ZSQ A; 3ECL A; 1IBE A; 1S61 A; 2DN2 B; 1JY7 B; 2HHE A; 1FN3 A; 3NFE B; 1MLJ A; 4NI1 A; 2ZFO B; 1GBU A; 2QMB A; 4U8U B; 2H8D B; 1HBB A; 1O1O B; 2NRM A; 3W4U B; 2AV0 A; 1C7D A; 1HJT A; 1YVQ A; 5CN5 A; 2G14 A; 1IOP A; 1HBR B; 5CN9 A; 3LB3 A; 2MGJ A; 4MQC A; 4AVD A; 1VXB A; 3VRG A; 4ODC A; 1G08 A; 3ZJO A; 1RQA A; 1R1X B; 1HBA A; 1XZV B; 3NL7 A; 2W6X A; 1MLN A; 104M A; 1FSX A; 2NSR A; 4FC3 B; 1XY0 A; 2ZLT A; 1DXU A; 4VHB A; 1DO3 A; 4G51 A; 1F65 A; 1HBS A; 1MYH A; 1Y4P B; 3LR7 A; 3PI8 A; 1MLF A; 1YOG A; 3HHB A; 2OHB A; 4O35 A; 2MGL A; 2SPM A; 2CMM A; 1MBD A; 4TWV A; 1O1K A; 1QXD A; 2OH9 A; 1LFQ B; 2R4X A; 3MYN A; 1YEQ B; 4IRO B; 1QSI B; 1XZ4 A; 3QJB B; 3AQ9 A; 1Y5F A; 2ZLX A; 2D5X A; 3PT7 B; 2H8F B; 3LHB A; 1Y7G B; 1X46 A; 3UHD A; 2D2N C; 1MCY A; 1YOI A; 3E4N A; 1UFJ A; 4PQ6 A; 1NPF A; 5E29 B; 2HBC B; 1VHB A; 3S1J A; 3K8B B; 3PIA B; 1Y8I A; 2EB9 A; 1EW6 A; 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