1HJQA

Structure of two fungal beta-1,4-galactanases: searching for the basis for temperature and ph optimum.
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
332
structure length
332
Chain Sequence
ALQYKGVDWSSVMVEERAGVRYKNVNGQEKPLEYILAENGVNMVRQRVWVNPWDGNYNLDYNIQLARRAKAAGLGLYINFHYSDTWADPAHQTTPAGWPSDINNLAWKLYNYTLDSMNRFADAGIQVDIVSIGNEITQGLLWPLGKTNNWYNIARLLHSAAWGVKDSRLNPKPKIMVHLDNGWNWDTQNWWYTNVLSQGPFEMSDFDMMGVSFYPFYSASATLDSLRRSLNNMVSRWGKEVAVVETNWPTSCPYPRYQFPADVRNVPFSAAGQTQYIQSVANVVSSVSKGVGLFYWEPAWIHNANLGSSCADNTMFTPSGQALSSLSVFHRI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-1,4-GALACTANASE
publication title Structure of Two Fungal Beta-1,4-Galactanases: Searching for the Basis for Temperature and Ph Optimum
pubmed doi rcsb
source organism Humicola insolens
total genus 129
structure length 332
sequence length 332
ec nomenclature ec 3.2.1.89: Arabinogalactan endo-beta-1,4-galactanase.
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07745 Glyco_hydro_53 Glycosyl hydrolase family 53
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hjqA00
1CXKA 3VGDA 1JXKA 5C70A 2J47A 3OLDA 1MQPA 1R86A 1FA2A 1OBAA 1E40A 1SFSA 2CERA 2WPGA 4D6FA 1FFRA 4H41A 4QCEA 2WVTA 2A3AA 1KBBA 4AZCB 2O92A 3VGBA 2YOCA 4ZFMA 1H09A 3M07A 2WWDA 3GXDA 1E6SM 4KH2A 4AMCA 4CU8A 5M03A 1XCWA 3WMSA 4HMEA 3BCFA 4KRUA 3WUBA 2FH6A 4CCEA 3QGVA 3ZJ7A 1JZ8A 3J7HA 1JAKA 1W2VA 1ODZA 2CBVA 4H7VA 4J3WA 1UZ4A 2D0HA 1YQ2A 1TG7A 4MAZA 2E8YA 2GK1A 1AVAA 3FNDA 3K4AA 4UR9A 1W3JA 3FAWA 2PBGA 1CGXA 1W1YA 4CVWA 1PBGA 3EDEA 1C91A 4BQ2A 1RD6A 2GJPA 3GXIA 4ATWA 4BA0A 1GVYA 1XD0A 4UFMA 4D6DA 2WYSA 7CGTA 1ZBKA 4AD5A 3W26A 3N18A 2XFFA 4URIA 3ECQA 1FP9A 2F2HA 3W27A 4UQ9A 3SCOA 4RE3A 3NSXA 5JBFA 4M1RA 4PMDA 2PI6A 1I1XA 1JF5A 3IJ8A 2G3IA 3PZ9A 4PYSA 2WMIA 2XTKA 2NSXA 1KXVA 1US3A 1EDGA 2ZXAA 1FHDA 2GK1B 5A6JA 1QHPA 1JAEA 5BRPA 4AD4A 3DYPA 5CGTA 1GOOA 4XZWA 3WF2A 3AMLA 4D6IA 1MXGA 5A3HA 5A6SA 3PZOA 2TAAA 2WZIA 4WKFA 1Q6CA 4JL2A 3CUGA 3A47A 1TA3B 3ARXA 1QBAA 1HKJA 3SCUA 3CZEA 1JNDA 3WL1A 3AIRA 3CHFA 4W84A 1EOMA 2PWHA 2XM2A 5HBFA 4B3LA 2WMJA 3WDJA 3U5UA 3T2PA 3WFLA 3K4DA 2WAGA 1BF2A 2QMKA 4OKDA 1CPUA 1G5AA 3SCSA 2WMIB 1BTCA 5JIPA 4BCEA 5D9PA 1R87A 2YKKA 2WKLA 3QOKA 4K68A 3W4RA 3QHMA 4JFTA 4JCLA 2ZUMA 3WNNA 1TR1A 2PWDA 4AZHA 1GOQA 3VD3A 2J7CA 2V38A 3VGHA 2J7DA 5AYBA 5M17A 3GH4A 4FLOA 3L4WA 1U30A 3VOCA 1CXEA 1B30A 2VR5A 3T09A 2CESA 3WENA 4J7RA 1XC6A 3M6DA 3TTQA 4J3VA 3GDBA 5LYRA 4MNJA 2BVDA 2BVTA 3CZKA 4AIOA 2FHFA 3WDRA 2WMFA 3N04A 3WD2A 4UQCA 4J3TA 3PZQA 1L0PA 3AZTA 6A3HA 3ARQA 1OGGA 4OUEA 1WDPA 3PZUA 3ZT6A 3VMNA 3AHYA 4X9YA 5IHSA 5ABFB 1KXQA 4L4PA 5CPSA 1OD8A 4MPKA 3WDHA 1ODUA 3VGGA 3N11A 1GNXA 1OT1A 3II1A 2XWDA 2O9TA 1FH7A 1UKOA 1UH3A 2BHUA 1E43A 3AS2A 3VVGA 3AXHA 1E70M 3ARWA 4PCSA 4UNIA 3KEHA 2ZX5A 3NYDA 1CDGA 1LWJA 2A3HA 4F79A 1Y7VA 4GIAA 4TTGA 1PZ2A 3U7BA 5IFPA 4XX6A 2DQXA 3I3DA 5A6AA 2HISA 4H2CA 1WPCA 2QLYA 1CIUA 4AD0A 4OOZA 4UTFA 4J3XA 2YDQA 2XPKA 2WBGA 2W91A 3W25A 4J28A 3B9AA 1RPKA 4IM4A 3UR7A 2WMGA 3OLEA 3PZGA 1H41A 1GOWA 3W6LA 3WIJA 4AIEA 2DT0A 2AOSA 1QHZA 2J77A 2ZIDA 4IPLA 1PEZA 4W87A 1VJZA 2WZHA 3CBWA 5CPTA 2D3NA 2XM1A 4QLJA 2UY2A 1BPLB 4Z2GA 2WCGA 3VMPA 5A8QA 3OZOA 4D6GA 1QI2A 2BHZA 3WF4A 2WC7A 3WF0A 3OBAA 4X0NA 1UD2A 5M3WA 1JZ7A 3FW6A 2YBTA 5CGMA 5A6BA 1J18A 4QP0A 3RCNA 1HJVA 1CGWA 1FFQA 1CENA 3I3EA 1LF1A 1W1TA 4HA1A 4NF7A 2WVVB 1EA9C 2D1ZA 4YHGA 2PWEA 1QNOA 3CHDA 2ZX6A 3N12A 4JAWA 1MW0A 2UWFA 1M04A 1H1NA 2Q8XA 2WANA 5M5DA 1TMQA 2VZOA 1ESWA 1J0IA 1OM0A 1JZ2A 2CHNA 3ZQ9A 3W53A 4W7UA 1LL6A 1B3XA 1LL7A 3W81A 1UKTA 3AMGA 4U2ZA 5EB8A 3VDCA 5BYWA 1DWFM 5EFDA 1UD3A 1R8LA 4U5KA 1UHVA 3MMWA 1JDCA 2VQTA 2BNJA 4D6HA 2VX6A 2ZUWA 3WMCA 5GNYA 1BHGA 1ZBVA 2QMJA 3EDDA 4B9YA 1XCXA 4CVUA 4RL3A 2B31A 3VILA 3WQ6A 1SR0A 2BVYA 4M24A 2FGZA 3CZLA 2D0FA 1H3GA 4XUYA 1UWQA 1E9LA 4E4PA 4M8UA 1JFXA 1VRXA 3WD3A 2WCAA 4CGTA 5A1AA 3S6TA 4AC1X 1QPKA 4PMRA 3TA9A 1E6RA 3PTQA 1JZ3A 1HIZA 1V0KA 2BXYA 2EQDA 2MANA 3O6AA 5LA0A 2RGLA 2EPOA 4TVUA 1ZB5A 2W4XA 3ZJKA 4A3HA 4C7DA 2JIWA 1DWGM 1LQ0A 4D6JA 2PWGA 1UR4A 1WDQA 4OZOA 1W3KA 1MFUA 3VIHA 1E1FA 4OIFA 3ARSA 3O2LA 1ZJAA 1B3ZA 2CXGA 3WUFA 4H8VA 3ALGA 2VCAA 3QHOA 2O9RA 4KMQA 2VCBA 3FAXA 5DO8A 4A3YA 2G3MA 3MANA 4W5ZA 1ECEA 3ZM8A 2W63A 1KCKA 3PN8A 1B3WA 3OA5A 2BHYA 3UERA 4LXFA 4FK9A 3EMCA 1JD7A 4IISA 1NWTA 1HKKA 3WKZA 2J8GA 1UWRA 5I24A 1EOKA 4EK7A 2UY3A 2BY0A 3OG2A 1E71M 1W9DM 4PTMA 1GQIA 4MADA 4PMOA 5CLTA 4Z2HA 3SUWA 5E09A 1WE5A 3N9KA 4Z2JA 4ZENA 3W24A 5E9AA 1J11A 1UG6A 3QHNA 2BV9A 5AYIA 5DT5A 4TVCA 4GZJA 4M56A 1HJQA 3L4TA 2GSJA 3HU7A 5FOOA 2D23A 4ZE5A 4AWEA 1H11A 3GYCA 4B3KA 3AZSA 4LYPA 1JYNA 3CH9A 3TONA 5F7UA 1W9BM 4D6CA 3APGA 1GJWA 2OWCA 3SIMA 2V3DA 3PZMA 4YN5A 4A4AA 3D5HA 1CWYA 5A8MA 3ZT7A 2OSWA 3ZR5A 2J7EA 4HU8A 1W9UA 2JF7A 3B9EA 2XSAA 4JFSA 4JKMA 1RH9A 5FL1A 2AMGA 3PZTA 1UYQA 1V03A 4DWSB 3SCTA 3CZJA 4TX6A 1NWUA 1W1VA 1UQZA 1GHRA 1HL8A 3BSHA 3BH4A 2VVSA 2WW5A 5BRQA 2J79A 3VGEA 1GJUA 1OSEA 2CITA 2W62A 2J7HA 2NT0A 3DHUA 1BFNA 3MSDA 3IAQA 7TAAA 1J0KA 3DHPA 3RJYA 3MUY1 4BS0A 1BGGA 1TCMA 4GI6A 4KRTA 3WH5A 5HOSA 3UG5A 4UOQA 1E3XA 5AC5A 2GUYA 3BXWA 5I6SA 2D24A 2CBJA 4BQ4A 2DSUA 2XWEA 3SUSA 4UZUA 4PMYA 1JZ5A 4JKLA 5BXPA 1J12A 3RM4A 4DUXA 4ZEPA 1JF6A 3CTTA 1KB3A 3VD9A 4F66A 2Y2WA 4B9ZA 2JIEA 1DWAM 1LLOA 2E0PA 3BMWA 5IXEA 1C8YA 2VMFA 4AD2A 1HJUA 1TFVA 1KQZA 3WDPP 5I77A 2YDSA 3WELA 3WMBA 2C8NA 1XGZA 3GXMA 1UOKA 3AICA 1TUXA 3K1DA 5EMYA 2EPKX 1V08A 2NW0A 1WZAA 3K8LA 1Q6GA 1CECA 3MUAA 2DIEA 1QI0A 3NJ3A 4X0VA 2BFGA 4IUGA 5A69A 2J75A 2DSVA 3W82A 3ZMRA 2ZXDA 1D3CA 1P6WA 1QNSA 2FHCA 4WLCA 5EBAA 3HN3A 3NUKA 1DHKA 4GI9A 3WN6A 4PMXA 5AY7A 2ZUTA 5LA1A 1MW1A 1VENA 3L4ZA 4P7NA 1AQ0A 3ZSTA 2YBUA 2OSYA 2WC4A 3AHXA 1LG2A 4LX4A 2ZUNA 4AW7A 1CXIA 1E4IA 3L4UA 4W7VA 4UOJA 1V3KA 2D2OA 1SMDA 1CNVA 2W61A 4W8AA 4GZIA 4LYQA 1UWIA 4HMDA 1VFUA 4W89A 3OGVA 1HF6A 4XB3A 5ABGA 2E40A 3RIKA 4AIUA 1WDRA 5A2CA 3OZPA 3ZIZA 1YHTA 1HJWA 3WBAA 1E72M 3BAJA 5ECUA 4U3CA 1XRVA 2GDVA 5HXMA 3WDQA 4GQRA 3AXXA 2ZX7A 3FHQA 4KGJA 1KCLA 3PBGA 1R85A 1EHAA 1LL4A 1Q6DA 3L2LA 3U5YA 3SCVA 3EMQA 4AY1A 4MTVA 3E1F1 5AC4A 3VDAA 4S3KA 3THDA 2JEQA 4J27A 3AIBA 3ARUA 5E6YA 1BYDA 4AYSA 1KGUA 4AZ6A 4PTWA 2YJQA 4FLRA 2ZUSA 1X6LA 3FHAA 1AMYA 1GVIA 2CBIA 3N15A 2VRJA 1V6WA 5KZ6A 4XZBA 1M03A 2WM0A 2QHAA 1K6AA 4GI8A 1TVNA 1WP6A 3IK2A 2OWWA 2X0HA 1W9VA 1HJSA 3VIGA 4D71A 4Z2LA 2J8FA 5FKYA 2G3JA 3AHTA 4U5IA 3GH5A 5A6BD 5I2UA 4PTVA 4U33A 1NOFA 2YA0A 2UY5A 4UQAA 2CBUA 5I79A 5A6MA 1CZ1A 5DT7A 3PZVA 4OBRA 1HKIA 1E56A 2XHYA 3CUIA 3AQUA 2PF0A 5GPRA 4B16A 3T2OA 4CUCA 1C8XA 1U33A 3TOPA 1G01A 1HN1A 4DWSC 3BLKA 3FXYA 5CXPA 2YL9A 2PC8A 1FHLA 5CPQA 2VUYA 5DFAA 3LPOA 4H8UA 3AIVA 4QDMA 3SCQA 1E4NA 4MAVA 2VO5A 3ZJ6A 4IPNB 2D22A 2VT0A 4HZ8A 1BQCA 4YPJA 2VRQA 4UFKA 3SCPA 4E8DA 3AS3A 1VEOA 5KEZA 1OWQA 3VINA 3W37A 1EO5A 4P7OA 1QW9A 3OGRA 2WMKA 3NCOA 2BS9A 4TX8A 4AXNA 2D20A 4NZCA 4D1IA 1V3LA 4R27A 5CJ5A 2VL4A 1UH2A 2Y8KA 5HPCA 1XYFA 1BYBA 4PEEA 2J62A 1N82A 2D0GA 3OB8A 1GONA 1DWHM 4BF7A 3TTYA 2J7GA 1BG4A 5A2AA 1UR0A 4CCDA 4C7FA 4QCFA 5HDRA 4J3UA 1V02E 1HVQA 3VD4A 1DWJM 3HMCA 2V3FA 1Q4NX 1J0ZA 3RO8A 3CHEA 3ZSSA 3EBVA 3JUGA 3POHA 5I5RA 4U3AA 5BROA 1PX8A 2VX7A 4LQ1A 1WZKA 5EFFA 3AHVA 1UH4A 1WZMA 1UD5A 4KGLA 4RE2A 1UR1A 3A4AA 2WCSA 2QV4A 4HOZA 3WD4A 2ZE0A 1WCGA 1K9EA 1NWSA 2GJXA 5CSYA 5CG0A 1JXJA 3BAKA 1UUQA 2G3NA 3I3BA 1E73M 3GM8A 4P7QA 1ISXA 5BXTA 4TUFA 5CSUA 4AD3A 4JHZA 4YHEA 1R7OA 1W3LA 4E2OA 3VTRA 3NIYA 1ITXA 4S3JA 3L4VA 3WH7A 4CCCA 1KR1A 4DWSD 2Y8VA 1W2PA 4UFLA 1UZ1A 1VEPA 3T0AA 5BXRA 3SURA 4HA3A 3WF3A 3ARVA 2VQUA 3WBEA 3CGTA 5GQBA 2NT1A 1H4PA 4FMVA 4GXPA 3WD1A 5E0FA 1WNOA 2J7FA 2CCRA 3WD0A 1BVNP 1JGIA 4PUDA 1SMAA 3MMUA 1V6YA 1X1NA 2GJXB 2WLYA 2DSZA 4Q22A 2FHBA 3W0KA 3POCA 5JUVA 1XHGA 4UFHA 2WHLA 3SEPA 1NP0A 2W5FA 3AISA 1E5NA 2YL6A 3CPUA 1CXFA 1V3JA 4HOWA 4Z2IA 2VNCA 1HP4A 3A3HA 2ZX9A 4EANA 2V5CA 4WK9A 5BXSA 3GTNA 2EO7A 1JG9A 3SUTA 5A8NA 1PZ3A 1GQLA 2WHJA 1BAGA 1HNYA 2X2YA 1RP9A 2VRKA 1CBGA 3BC9A 3VPLA 3QR3A 1KBKA 4QLKA 3MS8A 4FLQA 2VCCA 3KL5A 1OT2A 3LPPA 1OIFA 1W9XA 1GZJA 3VMOA 1O7AA 4PSPA 1VFFA 1G94A 1US2A 4WIWA 4HPHA 1Q6EA 2WZEA 3PTKA 4UZSA 3S2CA 2EXOA 3KL3A 2W66A 3UG4A 1O6IA 4JCMA 2XSBA 1BG9A 1ISZA 3EDFA 3O9NA 1OIMA 7A3HA 2PWFA 4Y7EA 1UKQA 1NWRA 3G6MA 3NDZA 1JYVA 1S46A 4XV0A 2VJXA 4QLLA 5D9MA 3CLWA 3AFBA 1PPIA 3IJ9A 4FF5A 3A4XA 2V5DA 3UETA 2WMHA 1CYGA 1VBRA 4V28A 4M29A 1ISVA 1QI5A 1DWIM 4HOXA 1FP8A 1EGZA 3AIEA 3AMDA 5CZKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CXK A;  3VGD A;  1JXK A;  5C70 A;  2J47 A;  3OLD A;  1MQP A;  1R86 A;  1FA2 A;  1OBA A;  1E40 A;  1SFS A;  2CER A;  2WPG A;  4D6F A;  1FFR A;  4H41 A;  4QCE A;  2WVT A;  2A3A A;  1KBB A;  4AZC B;  2O92 A;  3VGB A;  2YOC A;  4ZFM A;  1H09 A;  3M07 A;  2WWD A;  3GXD A;  1E6S M;  4KH2 A;  4AMC A;  4CU8 A;  5M03 A;  1XCW A;  3WMS A;  4HME A;  3BCF A;  4KRU A;  3WUB A;  2FH6 A;  4CCE A;  3QGV A;  3ZJ7 A;  1JZ8 A;  3J7H A;  1JAK A;  1W2V A;  1ODZ A;  2CBV A;  4H7V A;  4J3W A;  1UZ4 A;  2D0H A;  1YQ2 A;  1TG7 A;  4MAZ A;  2E8Y A;  2GK1 A;  1AVA A;  3FND A;  3K4A A;  4UR9 A;  1W3J A;  3FAW A;  2PBG A;  1CGX A;  1W1Y A;  4CVW A;  1PBG A;  3EDE A;  1C91 A;  4BQ2 A;  1RD6 A;  2GJP A;  3GXI A;  4ATW A;  4BA0 A;  1GVY A;  1XD0 A;  4UFM A;  4D6D A;  2WYS A;  7CGT A;  1ZBK A;  4AD5 A;  3W26 A;  3N18 A;  2XFF A;  4URI A;  3ECQ A;  1FP9 A;  2F2H A;  3W27 A;  4UQ9 A;  3SCO A;  4RE3 A;  3NSX A;  5JBF A;  4M1R A;  4PMD A;  2PI6 A;  1I1X A;  1JF5 A;  3IJ8 A;  2G3I A;  3PZ9 A;  4PYS A;  2WMI A;  2XTK A;  2NSX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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