1HJUA

Structure of two fungal beta-1,4-galactanases: searching for the basis for temperature and ph optimum.
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
332
structure length
332
Chain Sequence
ALTYRGVDWSSVVVEERAGVSYKNTNGNAQPLENILAANGVNTVRQRVWVNPADGNYNLDYNIAIAKRAKAAGLGVYIDFHYSDTWADPAHQTMPAGWPSDIDNLSWKLYNYTLDAANKLQNAGIQPTIVSIGNEIRAGLLWPTGRTENWANIARLLHSAAWGIKDSSLSPKPKIMIHLDNGWDWGTQNWWYTNVLKQGTLELSDFDMMGVSFYPFYSSSATLSALKSSLDNMAKTWNKEIAVVETNWPISCPNPRYSFPSDVKNIPFSPEGQTTFITNVANIVSSVSRGVGLFYWEPAWIHNANLGSSCADNTMFSQSGQALSSLSVFQRI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-1,4-GALACTANASE
publication title Structure of Two Fungal Beta-1,4-Galactanases: Searching for the Basis for Temperature and Ph Optimum
pubmed doi rcsb
source organism Thielavia heterothallica
total genus 133
structure length 332
sequence length 332
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.89: Arabinogalactan endo-beta-1,4-galactanase.
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07745 Glyco_hydro_53 Glycosyl hydrolase family 53
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hjuA00
1E55A 3DYMA 1E3XA 3RCNA 1H1NA 2WMGA 5I79A 1BGAA 4AC1X 3AIEA 2BY2A 1QBAA 3WEOA 1V3KA 4P7QA 3WEZA 1LQ0A 2YKKA 1C90A 3D3AA 1KR0A 1QOXA 1XD0A 4JHZA 4D6GA 3BSGA 4PTVA 4UZUA 5DT5A 1CECA 3CUGA 5CQ1A 3WF2A 4D6EA 1HKKA 4GZIA 1KBBA 3M7SA 5ECUA 4ATLA 5M03A 2UY5A 4B9ZA 2XIBA 4X0NA 1EHAA 1E1EA 1E4IA 2VO5A 4UQ9A 4UZSA 2VX5A 2CYGA 1E4MM 2W61A 4DM1A 1V6VA 4ZENA 4P8WA 2OWXA 1V3MA 3HMCA 2J8FA 3T0AA 1UWIA 2DGAA 4RE4A 5ABHA 5D8ZA 1C91A 2PBOA 5AYIA 2BNJA 1E73M 1CXFA 4RE2A 4AZIA 2QPSA 4HZ8A 2J8GA 1E5JA 1OINA 3CIVA 4UFHA 4IPNB 3CO4A 1XYFA 3DHUA 1ECEA 5DF0A 1BF2A 4B3LA 2EO7A 3QR3A 1R87A 1W2VA 5E6YA 1H11A 2WVSA 2WKGA 4HPHA 4DWSD 5CZKA 2ZXAA 4GZJA 1V0NA 3GYCA 1HKMA 3AXIA 3VIOA 1GHRA 2F61A 4UQAA 4ZXOA 5AC5A 1VRXA 4AYSA 4OZOA 1BAGA 1GCYA 1WE5A 1DWJM 3NSXA 2YL6A 1A3HA 2BHYA 2WHMA 3ZO9A 3VGFA 1JD7A 1MW0A 2XVKA 1UWSA 3BAKA 2VVNA 3VM5A 4N42A 3ZM8A 3AHYA 3BGAA 4W7WA 2J78A 2XM1A 1PX8A 4AZCB 4GQRA 1V0KA 2QMJA 1XD1A 2GJXA 2AMGA 4M1RA 4W93A 1W3HA 3EDFA 1JD9A 3AIUA 1GUVA 2ZUSA 2X1IA 2D23A 1V02A 5A95A 5DMYA 3VD9A 2WBKA 3THCA 4IPLA 1MQPA 4P7RA 2WHJA 1M04A 1QI0A 5EMYA 1W1TA 2OWCA 4B9YA 5IHRA 1C7TA 3NYDA 2RGLA 3GNRA 4CD6A 2WVVA 1K9FA 2A3EA 3VGEA 1ITCA 1UD8A 1XV8A 4LYQA 1RPKA 3WDJA 1KBKA 2XUCA 2W62A 5JIWA 3ZR6A 5D4YA 4BS0A 4KH2A 2J75A 3AS1A 4XZBA 5F7UA 2A3BA 2YIHA 1DEDA 4NZCA 1UYQA 2Y2WA 1JZ3A 2RGMA 3OZPA 4KRTA 4XB3A 3UR7A 3CGTA 2DQXA 2VX4A 2OYKA 2A3HA 2D24A 4XX6A 1PJ9A 9CGTA 5I3DA 2WANA 2OWWA 1GPFA 1QNSA 4GI6A 3AMCA 3AXHA 3QOKA 3WEMA 3NSNA 1B3YA 5A8OA 1TCMA 4W8BA 1OWQA 5E09A 1Q6DA 5BRPA 1LL6A 5IFPA 4JFWA 2QV4A 1EA9C 5DT7A 1W3KA 1PZ3A 2XIIA 1JZ2A 3U7VA 1JXKA 4GIAA 3VMNA 2QPUA 1JXJA 1XH2A 1D2KA 4FLRA 3I3EA 4V2XA 1K6AA 1KGWA 4J3UA 3PZNA 1CZ1A 2WKLA 4N0RA 3TTQA 5A8MA 4OOZA 1UD6A 1LWHA 1VFFA 2J62A 3POCA 1M7XA 3CMJA 1WCGA 5DFAA 1VJSA 1HP4A 4Z2HA 1MW1A 3GXMA 2DH3A 1G01A 3G6MA 1GHSA 1GQKA 1WZMA 2FGZA 3AHZA 3B9AA 3FAWA 3FAXA 3KL3A 3K46A 1O7AA 1VJZA 1K9TA 2VJXA 3N12A 5I77A 2PI6A 1V03A 1A47A 1C7SA 1VIWA 5I78A 4M81A 1IZJA 1CGYA 1H09A 3K8MA 3WUFA 4M82A 3AJ7A 2JF6A 1U33A 1IZKA 1CGXA 1W2PA 5E0CA 2DT1A 3T09A 1HF6A 3UETA 3PN8A 5E0FA 1W32A 4F79A 2VZSA 5C70A 2VVSA 4EE9A 1W1VA 4IM4A 1CGWA 4HZ7A 1J0KA 4W88A 1M03A 4KGJA 2BXYA 3IJ7A 3NJ3A 1XSIA 1WO2A 3WNOA 4UQCA 3VMOA 3PHAA 4W87A 1FH9A 4NI3A 3L4YA 4CU6A 2JIWA 2G3JA 3MMDA 1PEZA 4OBRA 1JZ7A 2CEQA 3PZIA 4PMUA 5I23A 5A1AA 2J77A 1MQQA 4NSBA 3RM8A 3U57A 2VQUA 2WXDM 1J11A 4NF7A 1OIFA 2G3IA 7CGTA 3ARTA 2WAGA 4QLJA 2FHFA 1EXPA 3A4AA 3MSGA 3OB8A 1D3CA 3N15A 3M6DA 4TTGA 3CZEA 1SFSA 4JFSA 5BRQA 4QLKA 3VNYA 4WK9A 2WCGA 3WH8A 4AXNA 3FXYA 3SCWA 4HA1A 3M07A 5LA1A 2PWDA 1J12A 2EPLX 1JFHA 2X8RA 3PZOA 2JFEX 2IXVA 3BAXA 4EK7A 4TVUA 4WKHA 4D6HA 4W5UA 3VDCA 3DHPA 1XH1A 1J9YA 1M01A 4WSKA 1FOBA 5I24A 2VR4A 4GPNA 2XVLA 4KRUA 1QBBA 1E56A 1CXKA 3GDBA 4BQ4A 2VRJA 4CCDA 1E1FA 3NSMA 3VIFA 1JNEA 4P8XA 4XUYA 2OYMA 4JFUA 1RP9A 1Q4NX 1UH2A 2DDXA 3AZSA 3L2LA 5HDRA 3ARXA 1XCWA 1C8QA 4HPGA 1E6QM 5GNYA 1JZ5A 3AHXA 3TOPA 1PAMA 1UR2A 1W91A 3G6LA 4UTFA 4PSRA 4PMZA 2DT0A 1BGGA 4YHEA 3L2MA 2OSYA 5JUVA 5CGMA 1EDGA 2CERA 1DHKA 6A3HA 4HU8A 1QHZA 3AMDA 3JUGA 1FH8A 4GQQA 3ZT6A 3BLPX 3M46A 1QNPA 3NDYA 4AD3A 4F9JA 2ZX9A 2CITA 2C7FA 5HNNA 3W6MA 3ZT7A 2WC4A 1QW8A 4LPCA 2WSPA 2GDVA 1JZ4A 5EB8A 5D9OA 5IFTA 1KXVA 1NWUA 3W24A 2WVUA 3B8SA 3VPLA 3WD0A 1O6IA 2XFRA 5AY7A 2XWDA 1TA3B 3VD7A 4XV0A 5DEZA 2WZIA 3CHDA 2DSZA 1OM0A 5EBAA 2ZX5A 1DTUA 4Z2KA 1EOMA 1TG7A 3WENA 1MYRA 1F4HA 4AD5A 5IXEA 5BXRA 1QI5A 3RJYA 1KCKA 2EPMX 1GW1A 3WH7A 2WWCA 8CGTA 3AICA 3L4WA 2ZOXA 3EMQA 2HVMA 3UEQA 1UZ1A 1W1PA 3MMUA 3SCTA 4Q22A 1HJWA 3MO4A 4D6IA 1GOIA 4MTVA 5FOOA 4JCMA 1ODUA 4H04A 1HKIA 5CPSA 3UG5A 4X0VA 3VIPA 1UWTA 5JBFA 2XFYA 2CESA 2WLZA 2WSKA 1BYAA 3VVGA 4TX6A 2YJQA 1UKOA 1UR1A 3TP4A 1GZJA 5E6ZA 4TX8A 3D5HA 1ZL1A 3CUJA 4M29A 1ZJBA 1TFVA 1LG1A 4AD0A 2J25A 1MXGA 4V27A 4EAMA 5FCZA 2YA0A 2VC9A 3FN9A 3GXFA 3LPPA 1J10A 1UWQA 3HJEA 1CYGA 1B90A 1PX3A 5M17A 1AMYA 1U30A 2W63A 4QP0A 3WNLA 2V3FA 1G1YA 1UA3A 1MW3A 4MJ4A 2WMKA 3N1AA 2ZXDA 3AIBA 1Q6FA 3PTKA 1UG6A 2PBGA 4JIEA 5LYRA 1E9LA 3TA9A 3T0DA 1WDPA 2NT1A 1AQMA 3PBGA 1LG2A 4YPJA 4D6FA 1OIMA 1QNOA 4BCEA 5A8PA 5CPQA 1Q6EA 1YHTA 1KB3A 1PPIA 3GXDA 2YBUA 3FNDA 1V6UA 1EDTA 3AIVA 4CD7A 3AROA 3VMPA 1EQCA 2OYLA 3II1A 2WW5A 4AZ6A 3OBAA 2EXOA 3VKKA 1ZBVA 2NW0A 2XVGA 3BC9A 3ARSA 2XTKA 4D6JA 1VEPA 2GVYA 3ARPA 1Z32X 4WF7A 1E40A 3KEHA 2VR5A 4W7VA 4HU0A 5A94A 3GH4A 4PMOA 2E9LA 3SURA 1ODZA 4PCTA 5ABEA 1GOQA 1HXJA 2GK1A 1LJYA 3MV11 1TUXA 2JALA 1OBAA 5GNZA 1BQCA 3DC0A 3CZKA 1NH6A 2V3EA 3MS8A 4J3XA 2D3NA 3EDEA 4AW7A 3KL5A 2DT2A 4AEEA 4BQ2A 3SUUA 3CZLA 3QHNA 3CLWA 3DYPA 4YHGA 1N82A 2XFFA 3CUHA 3OG2A 3WD1A 4K68A 4MB3A 2WB5A 2JIEA 4MB1A 3AS0A 4CVUA 1GOKA 4H7VA 1G5AA 2ZWZA 5GNXA 2O92A 2BV9A 4UQBA 2GUYA 3EDJA 3GH7A 5A6BD 3VIGA 4CVWA 3E1F1 3VD3A 4J3SA 4OKDA 2VZTA 3WF3A 3BCFA 1V02E 2D0FA 3AOFA 3AHTA 4J28A 5CLWA 1E6NA 3CUIA 3ARWA 4UFMA 4U5IA 1SR0A 3NCOA 4DWSA 2PWHA 5LA0A 3APGA 4PMRA 2GSJA 2EQDA 1UR8A 4UFLA 1OD8A 3KE0A 2EPNA 1HNYA 4LXFA 5AC4A 4HA3A 1XYZA 1BTCA 4U33A 4D71A 1J0ZA 3WD3A 3WDHA 1WDQA 1B3ZA 5JIPA 3EYPA 4OJYA 1NARA 1C8YA 3T0BA 2XSBA 3ARYA 1JDCA 2WMJA 2F8QA 3RM9A 2O9OA 4AISA 2D20A 2ZXQA 4DUXA 2EEXA 2X0HA 1FP9A 2J7FA 4W84A 1HJXA 2J4GA 5CPTA 5D8WA 1E0VA 1U2YA 2WCSA 1FFQA 4UQDA 1QHPA 2FGLA 2GFTA 3SCSA 5A6MA 4CN1A 1HL8A 2EPKX 4E4PA 1CXLA 4OIFA 4ZFMA 1P6WA 1WDSA 4JFTA 4NRSA 4DUWA 3W27A 4Z2IA 2BS9A 4U3CA 3T2PA 3WL0A 5A3HA 1XRVA 5EFDA 2BFGA 3SCNA 2XG9A 1J01A 4GO8A 4QLLA 4DM2A 1J0JA 5BCAA 3QHOA 4J3VA 4W8AA 2F2HA 4H41A 1BSIA 1C92A 3BSHA 1GJUA 1R85A 3OGSA 2PWEA 2J7EA 2YDQA 3K4AA 2E0PA 1OGGA 3T2QA 4CCEA 1B31A 1KWKA 4WSJA 5JBDA 3SCQA 2J7DA 4JZ5A 3WUBA 5A6LA 1J0HA 3OA5A 3CHFA 2EBNA 1VEOA 2UY3A 5JBEA 5CJ5A 2DSWA 2ZE0A 2YDSA 1UHVA 4PUEA 2WYSA 1UKTA 1E4LA 4PCSA 2YLAA 4P7OA 3HU7A 4D1IA 1JIBA 1W9PA 2D22A 1I75A 3N13A 2BVDA 1E4NA 2IUZA 4U31A 2YDRA 4HOZA 1NP0A 3SCOA 5HXMA 2FDMA 4PEEA 3WDIA 5CSYA 2WLYA 4PSPA 3VNZA 3CPUA 3CTTA 2CNCA 4H8HA 1CNVA 2WMHA 1KQZA 1XHGA 1JYNA 3SUWA 3LPOA 1V0LA 2VX7A 1JFXA 3PTMA 3VGDA 4WJXA 2CKSA 2W92A 2X09A 3IAPA 4AZ7A 3A3HA 5D9PA 4AZCA 1F4AA 1SYTA 2CETA 3GXIA 4BA0A 1FFRA 1B3XA 3AXXA 4D6DA 1G94A 1HKJA 4J3WA 3EDDA 4BQ5A 3MV01 4M80A 3WELA 3AMKA 4A4AA 3OIHA 3GNOA 2E4TA 1TZ7A 5FKYA 4TVCA 4UQEA 1QW9A 4LQ1A 3GZAA 2CBVA 3DYOA 3K1DA 3EDKA 2V5CA 1TR1A 2A3CA 1XH0A 1XSKA 2Y8VA 3EMCA 2WVTA 1MFVA 3O9NA 4HMCA 1UKQA 1QNQA 3ZJ7A 1GQLA 1CEOA 1JNDA 2XPKA 4UFJA 1EQPA 2ZX7A 1RD6A 4RL3A 2VZVA 1ESWA 3O2LA 3ARZA 2W66A 2XHYA 2WHLA 3KWXA 4WLCA 1B2YA 3VGHA 2WMFA 3W82A 1ZJAA 3AMLA 1OT2A 3AFBA 2ZUNA 1KGXA 1DWFM 4CU7A 1D7FA 1V6XA 1US2A 3AISA 4FK9A 3VGBA 3VU2A 1C3FA 4UFIA 5GQBA 4W7UA 1QNRA 1HJSA 1NWRA 4MADA 1IT0A 2J7HA 3BCDA 4JL2A 5CG0A 3VX0A 4X9YA 1BYCA 3WMCA 3MANA 1FP8A 4PMXA 1R8LA 2Z1KA 2WC3A 1HIZA 4UCFA 2J7CA 1Q6CA 1X1NA 1VEMA 5E70A 4GINA 2YOCA 4CD8A 1KGUA 5A2CA 4B15A 1E15A 3ZQ9A 3F4VA 5CXPA 3VIKA 1VBRA 4MDOA 3WD4A 3VDBA 5ABFA 4ACZB 1CTNA 1XGZA 3W25A 3A47A 1FHDA 4MAVA 1HN1A 4JKLA 1WPCA 2VL4A 3W29A 1C93A 8A3HA 3IK2A 4PYSA 2CBJA 4ATWA 3WDQA 2WK2A 2ZUMA 3RMEA 2J74A 3SCUA 1TVNA 1OGBA 3WQVA 5CSUA 1KXHA 2ZUUA 4W89A 3AYRA 4J7RA 2X2YA 1E6ZA 1L0PA 1KFWA 1JL8A 5BYWA 3VX1A 3OGRA 3LMYA 3SCPA 1NOFA 2VMFA 1CENA 3IAQA 2DPEA 4BF7A 3PZVA 3BAWA 5CGTA 1LL7A 3WDPP 4U2YA 1W9DM 1MWOA 3MKKA 4IUGA 4PMQA 2DEPA 4LYRA 4AZBA 3PTQA 4H2CA 3THDA 2W67A 2Q8XA 1WZKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E55 A;  3DYM A;  1E3X A;  3RCN A;  1H1N A;  2WMG A;  5I79 A;  1BGA A;  4AC1 X;  3AIE A;  2BY2 A;  1QBA A;  3WEO A;  1V3K A;  4P7Q A;  3WEZ A;  1LQ0 A;  2YKK A;  1C90 A;  3D3A A;  1KR0 A;  1QOX A;  1XD0 A;  4JHZ A;  4D6G A;  3BSG A;  4PTV A;  4UZU A;  5DT5 A;  1CEC A;  3CUG A;  5CQ1 A;  3WF2 A;  4D6E A;  1HKK A;  4GZI A;  1KBB A;  3M7S A;  5ECU A;  4ATL A;  5M03 A;  2UY5 A;  4B9Z A;  2XIB A;  4X0N A;  1EHA A;  1E1E A;  1E4I A;  2VO5 A;  4UQ9 A;  4UZS A;  2VX5 A;  2CYG A;  1E4M M;  2W61 A;  4DM1 A;  1V6V A;  4ZEN A;  4P8W A;  2OWX A;  1V3M A;  3HMC A;  2J8F A;  3T0A A;  1UWI A;  2DGA A;  4RE4 A;  5ABH A;  5D8Z A;  1C91 A;  2PBO A;  5AYI A;  2BNJ A;  1E73 M;  1CXF A;  4RE2 A;  4AZI A;  2QPS A;  4HZ8 A;  2J8G A;  1E5J A;  1OIN A;  3CIV A;  4UFH A;  4IPN B;  3CO4 A;  1XYF A;  3DHU A;  1ECE A;  5DF0 A;  1BF2 A;  4B3L A;  2EO7 A;  3QR3 A;  1R87 A;  1W2V A;  5E6Y A;  1H11 A;  2WVS A;  2WKG A;  4HPH A;  4DWS D;  5CZK A;  2ZXA A;  4GZJ A;  1V0N A;  3GYC A;  1HKM A;  3AXI A;  3VIO A;  1GHR A;  2F61 A;  4UQA A;  4ZXO A;  5AC5 A;  1VRX A;  4AYS A;  4OZO A;  1BAG A;  1GCY A;  1WE5 A;  1DWJ M;  3NSX A;  2YL6 A;  1A3H A;  2BHY A;  2WHM A;  3ZO9 A;  3VGF A;  1JD7 A;  1MW0 A;  2XVK A;  1UWS A;  3BAK A;  2VVN A;  3VM5 A;  4N42 A;  3ZM8 A;  3AHY A;  3BGA A;  4W7W A;  2J78 A;  2XM1 A;  1PX8 A;  4AZC B;  4GQR A;  1V0K A;  2QMJ A;  1XD1 A;  2GJX A;  2AMG A;  4M1R A;  4W93 A;  1W3H A;  3EDF A;  1JD9 A;  3AIU A;  1GUV A;  2ZUS A;  2X1I A;  2D23 A;  1V02 A;  5A95 A;  5DMY A;  3VD9 A;  2WBK A;  3THC A;  4IPL A;  1MQP A;  4P7R A;  2WHJ A;  1M04 A;  1QI0 A;  5EMY A;  1W1T A;  2OWC A;  4B9Y A;  5IHR A;  1C7T A;  3NYD A;  2RGL A;  3GNR A;  4CD6 A;  2WVV A;  1K9F A;  2A3E A;  3VGE A;  1ITC A;  1UD8 A;  1XV8 A;  4LYQ A;  1RPK A;  3WDJ A;  1KBK A;  2XUC A;  2W62 A;  5JIW A;  3ZR6 A;  5D4Y A;  4BS0 A;  4KH2 A;  2J75 A;  3AS1 A;  4XZB A;  5F7U A;  2A3B A;  2YIH A;  1DED A;  4NZC A;  1UYQ A;  2Y2W A;  1JZ3 A;  2RGM A;  3OZP A;  4KRT A;  4XB3 A;  3UR7 A;  3CGT A;  2DQX A;  2VX4 A;  2OYK A;  2A3H A;  2D24 A;  4XX6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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