1HJWA

Crystal structure of hcgp-39 in complex with chitin octamer
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
YKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFANISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKQHFTTLIKEMKAEFIKEAQPGKKQLLLSAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRFSNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASSETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGTLAYYEICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWALDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords CHITINASE-3 LIKE PROTEIN 1
publication title Structure and Ligand-Induced Conformational Change of the 39-kDa Glycoprotein from Human Articular Chondrocytes
pubmed doi rcsb
total genus 125
structure length 362
sequence length 362
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1hjwA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hjwA01
1J18A 5CLWA 1BYBA 2Q8XA 2VX4A 1BYCA 3DECA 4LGXA 3VPLA 1H09A 5HBFA 3B9AA 4AC1X 3CZKA 1TVNA 3FHQA 2FDMA 2ZE0A 3RDKA 3I3EA 3VGBA 5LA0A 1V6WA 5E70A 1TA3B 3WNMA 4AD2A 1G9HA 1FOBA 4B3KA 4K68A 4QP0A 1Q6DA 3MMUA 1XGZA 3W0KA 4HU0A 4D1JA 1MQPA 4D6DA 4UZSA 4EANA 3RJYA 5EMYA 3VD9A 1XSIA 1ITXA 2J8GA 1QHPA 3PZGA 3VGHA 5BYWA 1Y7VA 3BAKA 2WC4A 4W87A 3BCDA 3VD4A 2O92A 4ZE5A 3VNYA 1QNRA 1E5NA 2DGAA 1US2A 1HL8A 3HN3A 3MKKA 3VD7A 3VX1A 5DT7A 2Y5EA 1HJXA 4PMYA 2D0FA 1SFSA 4TVUA 3GNPA 4U2ZA 4U33A 5LA2A 3QOMA 3AIUA 3W26A 1XHGA 3EDEA 4UOJA 3NSNA 1J0KA 2ZXDA 3OBAA 1XCXA 2YL8A 2OSWA 4P7NA 4M80A 3AHYA 3PTQA 4MAZA 1QBBA 2J78A 2JIEA 3AIEA 2ZX6A 5CQ1A 1JAKA 2NT0A 3A4AA 4ML4A 2VCAA 1BG9A 2PWDA 2VNCA 1ODZA 1HF6A 5A8OA 1W32A 4W86A 3RM8A 5A3HA 4AEEA 2WZEA 1E6SM 3CHEA 5LA1A 4JL1A 2AOSA 1Q6FA 3VUPA 3VILA 1JZ5A 3K4AA 3N15A 1D7FA 2XVPA 3WF0A 4HOWA 3K1DA 3SCRA 4UFKA 1WZLA 5I79A 2WB5A 3VIKA 2J62A 1UR0A 1K9EA 3WH7A 2VJXA 2O9TA 2DPEA 1R86A 1UR9A 4LX4A 2V3DA 3WEOA 4DM1A 1XH0A 2VCCA 1KBBA 5I77A 3VM7A 5BXPA 1JD7A 3SUVA 4M24A 3ARZA 4WKFA 2WXDM 3UG5A 3DYPA 3ARYA 4DWSA 3WN6A 1CENA 3ZJKA 1UD6A 2XSBA 3SCQA 1E0WA 4TVCA 1ZBWA 4HA4A 1NWSA 2VT0A 3WY1A 4J27A 2EBNA 2CIPA 5DEZA 2VR4A 1YHTA 5AC4A 3BAYA 1XYZA 1UD2A 4W7WA 3EDDA 1JF6A 3AIRA 1G01A 2CNCA 1QPKA 5JIPA 4XV0A 2FH6A 3CUFA 5CGTA 2Z1SA 3MSDA 4OKDA 3GXFA 1GNXA 3MANA 4PUEA 4PYSA 1W9BM 4RL3A 2BV9A 2GJRA 1BVNP 1HX0A 1BG4A 4W84A 1WB0A 2G3IA 2AAAA 3EMQA 2B31A 2WVSA 4E8CA 4D1IA 3WNKA 4KWUA 2C7FA 3OLDA 1H41A 3AMGA 3TTOA 3AXHA 2CHNA 2EEXA 2EJ1A 1H0GA 3O6AA 3WD3A 4MAVA 1GJUA 2D3NA 2EPOA 3KEHA 2O9RA 2CITA 3WQWA 3OA5A 5JUVA 2X05A 5CG0A 4J3XA 3OLEA 3WQ8A 3B9EA 2OWCA 2PB1A 4KMQA 3RILA 1EOMA 3L4ZA 1CLXA 5E0FA 3TTYA 3BXWA 1E4IA 2GK1B 2DT3A 1BVZA 4M56A 4Q22A 2D23A 5A6BA 2E40A 3U7VA 2GUYA 5FD0A 1V6YA 5BXRA 3BAIA 3GXIA 1CGUA 6CGTA 3AOFA 5D9NA 4PMVA 3EYPA 1ITCA 4BF7A 1E6QM 2WBGA 1UKTA 2WBKA 3K8KA 5A6LA 1WDPA 1VBRA 4Y7EA 3SUSA 3UESA 1W1YA 2J7CA 3AXXA 4HPHA 3AYSA 3ZT5A 1Q4NX 5ABFA 1BGGA 2XGBA 1R85A 2A3AA 3N18A 2ZXAA 2O9OA 1D2KA 1IV8A 2XWEA 1CEOA 5I5RA 1E40A 2W61A 3W81A 2CXGA 3W27A 3KL5A 4PMZA 3WD0A 3AHXA 2V3FA 2X8RA 1GQIA 1JIBA 3AIQA 1W91A 1JXKA 1V3MA 1V02E 1E6ZA 1W9XA 2JFEX 1J11A 3IJ8A 3WFLA 4WJXA 4OOUA 1V0MA 1CZ1A 3SCSA 1OBAA 1R8LA 1WE5A 2RGMA 3SUUA 4EAMA 3OLGA 1OIMA 1CNVA 4AZGA 2PI6A 2W67A 3UR8A 1OSEA 1VEMA 2V3EA 4UFJA 4TX6A 4AYSA 1DP0A 3OZOA 5A8QA 4L4PA 2UY3A 7CGTA 5D9OA 1MW1A 5FKYA 5A6KA 4FLSA 2BY2A 4IISA 4ACZA 1J0HA 1EXPA 4GI8A 4J3WA 3KL3A 3CIVA 4BCEA 4M82A 3WNLA 4HPGA 3PZVA 1LL7A 1A47A 1NARA 4UNIA 5EFDA 3UR7A 2ZUTA 3AIWA 3PZTA 1GHRA 2YL9A 1ISZA 2DSWA 2VZTA 5A6MA 3MUIA 1O7AA 5CXPA 3WDPP 1GONA 1E70M 4P8WA 2WCAA 1VFMA 5FL0A 1SMAA 1WNOA 4L4OA 1P6WA 2DSVA 2VRQA 3POCA 1QHZA 4J7RA 6A3HA 2W4XA 1OT1A 2Y2WA 4UOQA 1XD0A 2XVKA 2FH8A 2PF0A 4UQ9A 1HP5A 1W1VA 4Z2JA 2IXVA 3CHFA 1JDAA 1UWRA 4PRWA 1WCGA 3VIFA 2WKLA 1EIBA 3N9KA 2GFTA 4MNJA 1UD8A 1JZ4A 3LPFA 1IZKA 4ATLA 2VQUA 3MUAA 3AS1A 2BY0A 1A3HA 4AD0A 3WQ6A 4QFUA 5C71A 3FXYA 5HPCA 4MTVA 4GXPA 5M03A 4HP5A 3UG3A 3ARSA 1V3LA 3T2PA 3FN9A 1QI2A 3VTRA 1CGWA 2XTKA 2VZSA 4E8DA 5CPQA 5D9PA 1OINA 2PWFA 2PBOA 1H11A 3SCWA 1VBUA 2WW5A 3PZQA 3WNNA 1CXIA 1UKPA 1UZ4A 3TA9A 3LPGA 5C8BB 3ZSSA 2PWEA 1QHOA 3WMBA 1KFWA 2XUCA 2Y8VA 1NH6A 5BRPA 3GXDA 3NDZA 1E15A 3CMJA 3WUGA 1JD9A 5M17A 1ESWA 1MWOA 2GVYA 3VKKA 5IFPA 3ARQA 1EDTA 2OWXA 1SYTA 2V3GA 1C7TA 1MQQA 4C7FA 4XUYA 2YLLA 3CZ8A 2CPUA 2F8QA 1TCMA 3KZSA 3KE0A 1CLVA 4RE4A 1TVPA 3AMLA 5FL1A 2D24A 3BMVA 1Q6EA 3AHZA 4JHOA 2JALA 5JBDA 1FHDA 1GOQA 1WO2A 4GINA 3L4VA 2X0HA 2ZX5A 3WF2A 4CVWA 2XYLA 1BLIA 3VMNA 1PX3A 2G3MA 2D3LA 2WC7A 2VZVA 4Z2IA 1RH9A 1HXJA 1V3HA 1KWKA 1DEDA 1K9DA 3WUEA 1HNYA 1KWGA 2BNJA 4HA3A 3SIMA 5BWFA 3N11A 1EO7A 1EOKA 3MU7A 1KR1A 1E6NA 1GUVA 2D0GA 3WEZA 4PBGA 1MFUA 3AJ7A 4Z2GA 1HJUA 1MYRA 3UETA 1V6XA 4MNLA 5IXEA 2AMGA 1VB9A 3ZQ9A 1XV8A 1GOIA 1K9TA 4P7LA 3EDJA 5M3WA 4PMXA 4JKLA 4AZCB 2VI0A 3ZJ7A 4QLJA 3ARRA 3T0AA 1QNOA 1H2JA 4F79A 4OBSA 3T09A 3WENA 5CGMA 1BF2A 4W8BA 3AZTA 3IAPA 4JKMA 3AZRA 5GQBA 3BLPX 3FW6A 2GJPA 4OZOA 1KCLA 2OSXA 4AD1A 4E4PA 2GSJA 4H8HA 1QOXA 4LXFA 3L4YA 3LMYA 2D2OA 2E9MA 1HT6A 3MMDA 5IFTA 1JI1A 1HVQA 1NWTA 1CXFA 4NF7A 3CPUA 3WL1A 1TG7A 2WPGA 1DWFM 1VIWA 3W53A 1QNQA 3OGRA 2ZXQA 1NOUA 2DSUA 4PTMA 3F5JA 3L2LA 2E3ZA 1CWYA 1QI3A 5HDRA 5IHRA 4TVDA 2GDUA 2WCGA 5D4YA 1LL6A 5ABGA 1W9VA 1WAWA 1HKKA 1Z32X 4UQEA 3F5KA 1K6AA 1UYQA 1VF8A 1UG6A 2QF8A 1H0IA 1HJSA 4OUEA 2GDVA 2DT1A 5CPTA 4J3UA 3ZSTA 1CBGA 4KGJA 4RE3A 1W9DM 4AMCA 3MUZ1 3GH5A 2JIWA 2VOTA 1JGIA 1UA3A 4QLKA 1DWHM 4CN6A 1CXHA 4JFVA 3ALGA 3RCNA 2WHKA 3VX0A 3A4XA 1U30A 3TTSA 1PEZA 1UWQA 4D6FA 3VIOA 3IJ7A 2EO7A 3L4XA 4LYQA 1DHKA 1ISYA 4TX8A 2WMIB 4HZ6A 3WUFA 3CZGA 2VVNA 2VCBA 2V5DA 3IJ9A 4GPNA 4JCMA 5I6SA 1OD0A 3WD4A 1RP9A 4AD3A 3UCQA 3WD1A 3AS3A 5JH8A 1VAHA 4MNKA 4ZE4A 2WK2A 3W29A 3SUWA 2WHJA 2EPMX 1JF5A 1J0YA 1J9YA 5BCAA 4Z2HA 4AIUA 3GZAA 1ISVA 1B3WA 1WKYA 2ZWZA 5AY7A 1EQPA 1W3HA 4W7VA 3FAWA 5A69A 1WZAA 2GJXA 3ZR6A 3WF1A 1V03A 1HN1A 4YPJA 3SCOA 5CSUA 2XVLA 3AI0A 3WMCA 3VIPA 1GOMA 1KQZA 1EQCA 5GNXA 3KL0A 3BAJA 2YA0A 3VIMA 2E0PA 3O9NA 5EB8A 2NW0A 1LWJA 4XZWA 3CHDA 2V38A 4WIWA 5AYIA 3A6OA 1ZJBA 1E3XA 4EE9A 1O6IA 4F9DA 3VVGA 1UHVA 4CD4A 2DSKA 2VUYA 1JL8A 2CBUA 3CGTA 3SCTA 1NQ6A 3GDBA 4MB1A 4ZEPA 1UD5A 1D3CA 5BXSA 1ZBVA 2D20A 3BSHA 1LQ0A 4AWEA 1KXTA 1ZJAA 4AD5A 2XM1A 2ZIDA 1HKJA 2J25A 4W8LA 1OGSA 3MUY1 2OLHA 1UWTA 1FP9A 4MJ4A 3GYCA 2DIEA 1V3JA 4WK9A 3AZSA 3AMCA 1Q6CA 1E6RA 1WDSA 1FH8A 3M7SA 2WKGA 1GQJA 3RO8A 1HL9A 2CKRA 1H5VA 1MW0A 2UY5A 4P8VA 4PMUA 4BS0A 5TD4A 2CBIA 1JZ8A 3OLIA 3I3BA 2VQTA 3N12A 2UY4A 3PZIA 1W3LA 4D72A 1FP8A 5JBEA 1C8YA 5EBAA 3SCVA 1QI0A 2W92A 3NUKA 5F7UA 2XG9A 4J3VA 1HVXA 4AEFA 2J77A 4GI6A 3S6TA 1F4AA 4UQAA 2WWCA 4U3CA 3WIJA 1FFQA 2J74A 3VGDA 1B3ZA 5DF0A 3TTQA 2IXUA 2YLAA 3HJEA 3OG2A 1W3JA 1JZ3A 2FHBA 2PWHA 4PMRA 4M81A 1JYXA 3T2OA 2J7HA 3SURA 3AMKA 1ZBCA 1SMDA 4CD6A 1GVYA 1HJVA 1CGTA 1BYAA 4LYPA 2XIIA 3U5YA 3VM5A 4UOZA 4CU8A 1MXDA 2WZHA 1BGAA 2X2YA 1G0CA 2Y24A 2G8ZA 4U31A 3ZM8A 4MDPA 3M46A 3WDJA 2G3NA 4V27A 2W91A 3N1AA 4Z2LA 5IDIA 1VENA 3B8SA 3WBEA 3ECQA 2VC9A 4JL2A 3T2QA 1OIFA 1PJ9A 4UFMA 3W4RA 1W3KA 1NP2A 5I78A 3WQ4A 1E71M 4UCFA 4P8XA 4D6EA 3MV01 4P7RA 5D9MA 3ALFA 4A3YA 1ZL1A 4ACYA 4KRTA 5E6ZA 3CHCA 3PZOA 4MDOA 1F4HA 1W2PA 1UQZA 4XB3A 3II1A 3G6LA 3THDA 1KCKA 2G4FA 3CUGA 1J10A 4LYRA 1GOOA 1OCQA 4J3TA 2D1ZA 3AS2A 2BVYA 2WVTA 1LG2A 2WAGA 3WKZA 2JEQA 3ARTA 2ESCA 1DWIM 4EKJA 1CGXA 2ZX8A 3MS8A 3PTMA 4CCCA 3VD3A 3LPOA 5DT5A 5FIPA 4CU6A 2YBTA 3AXIA 5A94A 3ZOAA 1GHSA 2ZX9A 4BA0A 1EDGA 1E3ZA 1JNDA 4XZBA 1JXJA 2YBUA 1W1TA 4M1RA 3AHVA 1M53A 1B90A 2WYSA 5GNZA 2G3JA 4HZ8A 4MB5A 3GH4A 1E6PA 3PZMA 4PSPA 1RD6A 3VD5A 1E56A 2WVVA 3RPMA 5ABEA 1EGZA 1UWUA 1GW1A 2WM0A 3PBGA 3WQ5A 5HXMA 2BVTA 5AYBA 1C92A 4HOXA 3PZNA 4CU7A 2VTFA 2OYMA 5M5DA 2W62A 2YKKA 2J8FA 4DWSC 4DM2A 4DWSB 3A3HA 5I2UA 1CXLA 3UEQA 1CIUA 3ZT6A 3QHMA 1TFVA 3VIJA 1CXKA 3K46A 4D71A 1ZB5A 1H1NA 1TZ7A 1UH3A 3WF4A 3PZUA 4BQ5A 2XPKA 3M07A 1EHNA 3CUIA 4GIAA 4HTYA 4MNMA 1GPFA 1TA3A 3AIVA 4ZXOA 1N82A 2JF6A 4CGTA 2UWFA 5A1AA 1B30A 3QHNA 2XIBA 3WFZA 3DHPA 3W82A 2YDSA 1QW9A 3BMWA 3VO0A 1OGBA 1GVIA 2DDXA 3EMZA 1UOKA 2DT0A 1LLOA 4PUDA 1R7AA 3KWXA 4URIA 1JZ7A 5FCZA 1FFRA 3QGVA 4GKLA 4S3JA 1E55A 1KQYA 1TUXA 1W9UA 2C8NA 2EQDA 8A3HA 3CZEA 1MVYA 4W5ZA 2E9BA 3W38A 4J28A 3NCOA 1H49A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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