1HKBA

Crystal structure of recombinant human brain hexokinase type i complexed with glucose and glucose-6-phosphate
Total Genus 334
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
334
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphotransferase
molecule keywords D-GLUCOSE 6-PHOSPHOTRANSFERASE
publication title The mechanism of regulation of hexokinase: new insights from the crystal structure of recombinant human brain hexokinase complexed with glucose and glucose-6-phosphate.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 334
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1997-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA03
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkbA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkbA04
2Q97A 2CH6A 3QBWA 2FSNA 3KZBA 1TYQB 1HKBA 3BF1A 3CQXA 2FSKA 4WQ5C 3IDHA 3LL3A 3ATUA 5AR0A 5AQZA 3WQTA 4BROA 3M6GA 3VETA 4MO4A 4L3QA 3L6QA 1HKGA 4MO5A 2WUSA 2CGJA 2HF4A 4PKHA 2P9UB 4CZLA 5EXWA 4XH5A 3O08A 5AQMA 4I6MA 4JAXA 5ADXH 4CZGA 2IVPA 3H3NO 1HJOA 4B1YB 3DXMA 4XH4A 5AQNA 3ZEUA 1P8ZA 3MN5A 3B8AX 4M63C 3CIPA 4IZ9A 2BUPA 4H5WA 4AM7A 4MLEA 5ELZA 4H5TA 3I33A 4MLHA 1GLBG 4JD2B 2QWOA 3GOIA 3MN9A 3LDQA 5F2RA 3FZLA 1S3XA 3A5OC 2AA4A 3MN6A 2Q31A 5BRDA 1K8KB 2P9IA 4K41A 3VEZA 2NLXA 4GNIA 2IVOA 4CZFA 4DCHA 5EOYA 3A5NC 3HM8A 3LDNA 5E26A 3D2FB 3O1BA 5E84A 3H1VX 5CE3A 3ENOA 3JS6A 4GY2B 5JICA 3MK6A 5ADXA 2V7ZA 4FWSA 4AM6A 1ZXOA 2YHXA 3O6WA 5AZIB 1BU6O 3O4WA 3VESA 1BO5O 2P9NB 1U2VB 4FPAA 2P9KA 2P9LB 4ISFA 3LM9A 3QMLA 2OANA 2V52B 4BR5A 4DB3A 5AQWA 5BREA 3FGUA 4A61A 2E20A 5BPMA 3RSEA 1GLEG 2I7PA 4BQLA 3DWLA 3U8XA 3VGLA 1HKCA 2FXUA 3SJHA 3WXIA 1ATNA 4BC5A 3H45C 2GEMA 4O8KA 2IVNA 2E8AA 3DXKB 1C0FA 3C7NB 3FFKB 2QWNA 5AQJA 1QQMA 4QS7A 1OKJA 3CI5A 3EO3A 3CHWA 5F0XA 1YVNA 3L0QA 3WUHA 5AQPA 4J8FA 4BRIA 3FLCO 4BRAA 4FOEA 2HOEA 3M1FA 2P9SA 4IXCA 1KXPA 2D0PA 4H0XB 4BR4A 3CQYA 3ZX2A 3WEEA 5BR9A 3VF4A 2J4RA 2NZTA 1ZBSA 4M7XA 3CJ9A 2E2PA 5FPDA 1ESVA 3LDLA 4EHTA 3D2EB 1NGGA 1Z05A 2QWMA 4FWMA 1RDWX 4QS9A 3WXJA 1T6DA 1QHAA 2YJEA 4BRGA 4BVPA 1QQNA 4BR7A 3OHRA 3S41A 1WUAA 2P9PA 1NWKA 3ENHA 3U9DA 3W3DA 4K43A 5KPZA 3MDQA 2ITMA 3HZ6A 3WXKA 3ID8A 4RWTA 3A8YA 2E2QA 3O8MA 1IJJA 3AAQA 4K25A 3EZWA 2Q2RA 5AZJA 5AQXA 1GLCG 1Z6RA 4BC2A 4JHDA 4DHYA 1NM1A 1T44A 2GTDA 1TUUA 3QBXA 1E4FT 4BRNA 4BRLA 3KHYA 3O80A 3A0IX 4FWLA 1GLAG 4BRCA 3WT0A 3F9MA 5JLHA 4A62A 3SMSA 3UKUB 3CERA 3GE1A 3VGKA 3EN9A 3M3ZA 3CETA 3EKUA 5TKYA 5FPEA 4BRPA 4RTFD 3SMPA 4NO7A 2CGLA 1KAXA 1HPMA 5BPNA 4CZIA 2GWKA 4PKGA 3A5MC 2HMPA 1G99A 2VWBA 4CZKA 2ASOA 4IJAA 3CJ1A 4CZJA 2Q36A 3O5BA 1MWMA 4IJNA 1QQOA 4I6MB 5KQDA 1V4SA 5AZIA 2ZGZA 4BR2A 5FPMA 4FWKA 1BA1A 2A3ZA 3DXMB 4QS8A 1LOTB 4XH1A 3ZEUB 5BN8A 1MA9B 4B1ZA 2P9LA 3DJCA 5KPRA 3BP8A 1NGDA 4KBOA 1X3MA 4PL7A 1NGAA 2CGKA 5EVZA 4CZEA 4Y0WA 1SZ2A 3G25A 3BEXA 4WQ4C 4PL8A 3R9PA 3UKRB 4H0TB 5AQHA 3W0LA 2V7YA 1YAGA 2AP1A 1JCGA 1S22A 1BOTO 3VEYA 4O5FA 3ZETA 4HWIA 4H5VA 3FZMA 1QZ5A 4ISGA 4WYBA 4A2AA 3H6EA 2P9IB 3AY9A 2A40A 4BVOA 4FO0A 4H5RA 1SAZA 4BRHA 5LJVA 1NGEA 3D7EO 1BA0A 3IMXA 3HBTA 5AFUH 2YI1A 3VEWA 3O1WA 4FWNA 3ULEA 4B9QA 1DKGD 4BREA 2E1YA 2ASPA 3IFRA 3SK3A 2QWRA 4CZHA 1GLDG 3FR0A 1GLLO 5BRFA 1NGBA 4HTLA 2P9KB 4BG8A 3MMVA 3QFPA 3CJ7A 2EWSA 1DGKN 1NGIA 4FOIA 3C0BA 2BTFA 4CI6A 1DEJA 3GL1A 3JXUA 3RSEB 4BQZA 3QICA 4BRQA 2NRHA 1NGHA 1HUXA 1TYQA 2ASMA 4B1WB 5F1XA 2PBDA 2QXLA 2FF3B 4B1XB 1Y64A 2VYPA 1QZ6A 5AQGA 3P4IA 1BG3A 2P9UA 3UE5A 3R6MA 1X3NA 1BDGA 5AFUA 1BUPA 4CD1A 3VENA 4B1VA 4JN4A 5AQVA 4BGAA 4BC3A 5KQ8A 3ZX3A 4H0VB 2E2OA 2H3GX 2D0OA 5BPLA 4EAHD 3FZFA 3VPZA 1NBWA 3QDKA 3CJCA 2Q0UA 4IWVA 3BF3A 1GLJO 3WEEB 1J6ZA 2W41A 3EKSA 3MCPA 1XQSC 1V4TA 4JD2A 4H03B 5AQTA 3AAPA 1WOQA 4B1UB 2QW9A 4YDUA 1HLUA 1X9JA 5AQUA 3HSCA 4E1JA 3R8EA 3KVGA 4K42A 4PKIA 5LJWA 1TUYA 4FL9A 1K8KA 2P9PB 3DAWA 4ISEA 4BR0A 1ATSA 5EY4A 3LDPA 3D2FA 2GUPA 3UB5A 2A42A 5KPTA 2W40A 4CJ7A 3FE1A 2Q0RA 4BR9A 3VF2A 5AZJB 4XEIA 4CBXA 4JHDB 2GWJA 5AQIA 5AQOA 4Z94A 3QB0A 3TPQA 3EL2A 2P9NA 3U4LA 1U2VA 1R59O 2V51B 2ZF5O 3WXLA 1JCFA 3I8BA 4FSVA 3UKRA 4RCHA 4BG9A 4H0YB 5AQFA 4EHUA 5EX5A 2PAVA 1GLFO 3ATVA 3VF6A 4BRFA 3WQUA 1LCUA 4FWOA 4DQ8A 2KHOA 2F9WA 4WQ5A 3GBTA 2ZGYA 1NGJA 1YUWA 1E4GT 3VEXA 2A6AA 1MDUB 3QFUA 2HF3A 2YHWA 2D1KA 1YXQA 4CD3A 1ATRA 2YCHA 5AQYA 3MN7A 2FSJA 2A5XA 2D4WA 1KAZA 1NLVA 3VERA 1ZC6A 1KAYA 1SQKA 2QWQA 4NB4A 4EIAA 1NGFA 3DXKA 4H0OA 3C7NA 1CZAN 5I9EB 5AQLA 3IUCA 4BRMA 1XUPO 2DPNA 2QWLA 3VEVA 2F9TA 1H1VA 4M7YA 2E88A 1EQYA 3FZHA 1NGCA 1IG8A 2GELA 2YHYA 2IIRA 2CH5A 5AQSA 3SLCA 5LY3A 1RGIA 1HX1A 4H0PA 3H46O 2ZWHA 4BRKA 3J8AA 1U6ZA 4JNEA 4CZMA 1JCEA 4BGBA 3ZETB 4A2BA 4FWRA 3D2EA 3U9ZA 3AARA 4FWQA 5BN9A 5AQKA 3CJAA 3GDQA 3ZX0A 1Q18A 4YDUC 1RFQA 1XC3A 2A41A 3VOVA 4FPBA 4F9OA 3L4IA 2E1ZA 4H5NA 4C23A 1T6CA 3VEOA 5BRHA 1NMDA 5JLFA 5FPNA 3H1QA 4CBWA 3BUZB 4WQ4A 2FLOA 3HI0A 3ULEB 5B8HA 4BC4A 2YJFA 1BWFO 1MWKA 3A5LC 4IO8A 2E2NA 5JMVA 4FWPA 3TU5A 4CBUA 4BRDA 2QWPA 4LC9B 2QM1A 3HTVA 2P9SB 2Q1NA 2UYTA 2I7NA 2VCPA 3FZKA 3LM2A 5AQRA 3VGMA 4EFHA 3GG4A 3H3OB 1D4XA 2FF6A 1C0GA 5AQQA 3UKUA 3LDOA 3CJBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QBWA 4B9TA 4E0DA 3CQXA 3TSQA 3KLHA 3NCIA 4BROA 2F4VK 3M6GA 1NOZA 3KLEA 3L6QA 4N5SA 3ZT3A 3F2KA 1HKGA 2WUSA 1OH8A 4PKHA 1NKEA 5CR4A 1S9GA 5SZTA 3SQ2A 3ZSWA 5HRNA 4DV5K 4DTSA 2HNYA 4E89A 5HP1A 1ITGA 2O8DA 4C1NK 3C65A 1VSFA 3CMAN 2FBXA 4JV5K 5ELZA 4H5TA 4CJFA 3AO3A 1ZBFA 4E19A 3HVTA 3C6HA 1JLBA 1VQ9N 4GW6A 3DLGA 4NCAA 1TKZA 4FJ7A 4K8ZA 2Q31A 1B9FA 4ILHA 4JKAA 4K41A 4DTRA 2NLXA 2FC0A 2IVOA 3WXMB 1NJIO 3ZSZA 4Z4IA 4DCHA 5EOYA 5E26A 5E84A 3A5NC 3LDNA 3D2FB 3QEXA 5GIPA 3G0ZA 3MK6A 4JS5A 4YNQA 5ADXA 2YHXA 1Q9YA 1WNSA 3VESA 2VQFK 4Y1CA 4CF1A 4OKEA 4FPAA 3TSPA 1RDCA 3RRGA 2OANA 4DB3A 2DFFA 5AQWA 3FGUA 2HHQA 3ID6A 1BCOA 3KJVA 4BQLA 3U8XA 4JLHA 4FW1A 3OYFA 2P5GA 2DTUA 3OJSA 3CFRA 1GOBA 4E1NA 2WTUA 1ZBIA 4O8KA 3DOLA 3VQ6A 4FZYA 3OYKA 3WNEA 4KFBA 1SKWA 4FZZA 3ULDA 3CI5A 4FLYA 2JWKA 4KHYA 3CHWA 1BCMA 5F0XA 5GAHP 5AQPA 1KFSA 4AILC 4OJRA 1Q8IA 4CJLA 4BDZA 4BRAA 3E1YA 1O13A 3I55N 1VQ7N 1S5JA 2GBZA 4IXCA 2D0PA 3ZSQA 2IDOA 4BR4A 3CQYA 3CCRN 3ZX2A 1RBVA 3SQ1A 3S3OA 2NZTA 3NH1A 4N76A 3VQ7A 2PZSA 3AO2A 4NLBA 3LDLA 4EHTA 1NGGA 3OYNA 1RDWX 1I3AA 4A5AA 1QHAA 4BRGA 4BR7A 4FM2A 3OHRA 5J2NA 1WUAA 3VQBA 1K6YA 3LZIA 5KPZA 1L3SA 1HYVA 3V6DA 4RWTA 5SWMA 2OZSA 2B6AA 3EZWA 2HBKA 3K9JA 4TSXA 2Q2RA 4JKGA 4WFBL 4E7LA 3O3GA 1T44A 2O8BA 2GTDA 3L3VA 4BRLA 1HQEA 3O9UA 1MU2A 4FWLA 3F9MA 5JLHA 1VK0A 2G8KA 3L2QA 5KRSA 4JI0K 1N33K 1N36K 3T1AA 2D5RA 1IH7A 3GE1A 5FPEA 3EKUA 2UU9K 1VQ8N 3BZCA 3SZ2A 4DQIA 1KAXA 1DLOA 2GWKA 2O8FA 4CHNA 4CZKA 4KHPK 2ASOA 5JS2A 3CJ1A 4CZJA 2Q36A 3A2FA 3CC7N 5KQDA 1V4SA 1U4BA 4DWIA 4L8RB 4CERA 1VSLA 4BWJA 3U3YA 2ZGZA 5FPMA 1CZBA 2ZJQL 3AGKA 3MEDA 2PFUA 3I0RA 1MA9B 5KPRA 3MXIA 3BP8A 4KBOA 4FJ9A 2WBNA 2YKNA 1EX4A 3K5LA 2CGKA 1NK8A 4OPKA 3LP0A 3QNOA 4WQ4C 3PX4A 1UWBA 4QOZB 4CF9A 2KW4A 3NVMA 1M90O 2NRRA 3NMUA 4B9VA 1YAGA 3KLFA 1LWCA 2OA8A 2XHBA 1TKDA 2R7YA 1NOYA 2F7TA 2X74A 1VSMA 4G1QA 3IAYA 3H6EA 5KGXA 1VQLN 4J2AA 2HHWA 4Q0BA 2A40A 4H5RA 4RW8A 4DKWA 3D0PA 3HT3A 1SL2A 1SAZA 1BI4A 2O4IA 4CJKA 1RBSA 1RBRA 1DKGD 2A1RA 1N32K 1GLDG 3FR0A 1U48A 4ELUA 4CHYA 4EZ6A 5KTQA 2P9KB 3CJ7A 3DRPA 3L2UA 3CPWM 4X62K 3J7YP 1DGKN 2FBTA 3V81A 2BTFA 1RCHA 3JXUA 4M3YA 4BQZA 5J1EA 1SL0A 1S1XA 2NRHA 1KTQA 1HUXA 4FJ8A 3QINA 3DM2A 3AA2A 4B1WB 4ILGB 3VQEA 1Y64A 4DR3K 2PYJA 2VYPA 2KFZA 1S72N 1KQSM 5AQGA 4O8UA 4MDBA 4U67L 3MWTA 3UE5A 2O8CB 1BUPA 5LMUK 5D3GA 3CCEN 3VPZA 1U04A 4KTWA 3HXMA 4IWVA 2NRXA 1J6ZA 2W41A 4CJEA 4FJXA 4HUGA 3AVNA 1C1BA 3MX2A 3OTOK 1ZYQA 1WOQA 1ZBLA 3KVGA 4K42A 3SBGA 3THXB 1IBLK 2P9PB 4FK2A 4DSKA 4ISEA 4YOTA 3VQPA 1NU0A 1D8YA 3D2FA 3DRSA 3VQAA 4CHZA 5EU7A 3F9KA 4CJ7A 3TAPA 3CCJN 3IS9A 4QAGA 5AZJB 3TANA 3NHGA 2YNIA 3M8PA 1Z25A 3TPQA 1HYSA 3BDPA 1WSGA 3BZKA 4H0YB 5EX5A 4DU3A 1JLEA 3VF6A 2QTDA 4OGCA 3ZT0A 4FWOA 2WFBA 3I56N 4DFPA 3LDSA 1S9EA 1NGJA 5C2FA 3VEXA 1HNZK 4IG0A 3QFUA 1VQKN 2YHWA 1RDDA 1YXQA 4LH5A 4AHUA 4CE9A 1WBBA 1KAZA 3VERA 4B3RK 3G71N 1REVA 2Z1IA 3LAMA 2GX9A 4DSEA 4BRMA 1RT5A 2DPNA 3SPYA 3AVKA 3P39A 4OGEA 4M7YA 4DSFA 2YNHA 1T05A 1CLQA 1RT6A 2GELA 4E1MA 2E5LK 3OYIA 1WAJA 2IIRA 1JLQA 4CEEA 3PLAA 5H1SQ 3D6RA 3TABA 1D5AA 3SV3A 4H0PA 1HX1A 1FKPA 2ZWHA 4KHQA 1A5XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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