1HSJA

Sarr mbp fusion structure
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALAAAQTNAAAEFMSKINDINDLVNATFQVKKFFRDTKKKFNLNYEEIYILNHILRSESNEISSKEIAKCSEFKPYYLTKALQKLKDLKLLSKKRSLQDERTVIVYVTDTQKANIQKLISELEEYIKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/sugar binding protein
molecule keywords FUSION PROTEIN CONSISTING OF STAPHYLOCOCCUS ACCESSORY REGULA
publication title Crystal structure of the SarR protein from Staphylococcus aureus.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 143
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF12802 MarR_2 MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1hsjA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hsjA01
3M7GA 3VODA 1J2XA 2ONSA 4IY6A 2F35A 3T93B 3MP8A 2DSFA 1YIOA 3RIRA 1OVTA 4HX4A 2C6YA 4XLNF 3DP8A 4EJTA 3TTMA 1ZU0A 2DXYA 1RI7A 4M73A 2VBWA 4XIGQ 2VN2A 2KIUA 3BROA 1MDMB 5CM6A 3FASA 1D3KA 2REGA 2QENA 4WEPA 5HS7A 1B3EA 3BY6A 2PFBA 2ACJA 3OSRA 1RUNA 1XOCA 2XKOA 4HV6A 4MNUA 2ZXTA 4POWA 3CDHA 1MM7A 2HZTA 3EUHA 3HTSB 4QSEA 3E3VA 3H3ZA 4ZYGA 3DP6A 3DPTA 3ZKKA 2P5LC 3T9VA 4CICA 3L6GA 1DTZA 1AWCA 1MQDA 2VHAA 4IRIA 2O3FA 2QS3A 4G94A 2HOEA 2XAGA 1ZG5A 2PVUA 1B05A 3IAZA 1LNWA 1T0KA 5DCMB 4M9XA 3FJGA 3C32A 3F8FA 4KMFA 3MZ1A 4OENA 2RQPA 5DDGA 1YQAA 3SEVA 4RA1A 1SD5A 2Y7KA 2I58A 4N07A 1OLAA 3F23A 1B1BA 3KZYA 1DP7P 1IRGA 3KETA 3R26A 4U88A 3SESA 3PD8A 2NVUB 1I6QA 1B58A 1AH5A 4UVBA 5ILVA 3C18A 3N97A 4R74A 2DE4A 4U21A 2XXWA 2R7DA 3HTUA 3FHZA 1S29A 1L0OC 2MH9A 2Q89A 5L9SA 2STTA 2B3BA 3F8BA 3WU1B 1SW4A 2CZLA 2L02A 4NWCA 3S4UA 4RNSA 5AA4B 2OWSA 4H5FA 1TW2A 3H06B 4OESA 3LAPA 3V8LA 3F21A 3K69A 4EQ9A 3BOQA 1GR2A 3IOUA 1O7FA 4LJZF 1EV7A 4ENKA 5IT3A 3FF5A 2GHBA 4OZ9A 5LRSA 1GXPA 2DPUA 1MM6A 1BTJA 3DXJF 1HSLA 1XB4A 4TLMB 3IB1A 4HQEA 3F22A 2NRAC 3QK6A 4OMYA 2CO5A 1XMKA 3PUXE 3O6IA 5HDGA 5B70A 3KP6A 4KA4A 4L9TA 3K6WA 1OIBA 1W4MA 3HHGA 3GFJA 1MH4A 4Y15A 3IR1A 2P8TA 2PX1A 2Q2AA 2XXRA 2G9WA 1GHCA 3A09A 2RC4A 3QYTA 1ZH5A 4CXFA 3RT8A 3KOTA 3WTXC 5AA3A 4ESXA 2RVCA 2H5YA 1ZBMA 4XSXF 4ZH4F 3CTAA 3BKIB 1FSEA 1NNKA 1WVJA 5I59B 5LEJA 1U5TC 2HAVA 3G7WA 4A0XA 2QYOA 3CRBA 3C35A 3TO6A 5HLHA 4LG0A 5CLSA 2QZ8A 4CYDA 4YKJA 5LGTA 3FWEA 1K78B 3KFMA 4Q0CA 3HIFA 2QMXA 3IO6A 1G3TA 5FFXA 4I2OA 2XXVA 3ZPLA 2VD3A 2DAOA 4MEXF 1MXVA 5I59A 4QFPA 1T0FA 5H8SA 3SQNA 4IO3A 1BI1A 1PBPA 3N5LA 3GFLA 3KP2A 3RUMA 3CFLA 1DOTA 3J7AO 1EH3A 2HFHA 3E6MA 2EV6A 2Y7WA 4WXDA 5J1DA 1M5CA 1K78A 3H3GA 1ZRDA 4OYVA 2Z23A 2HTJA 1QZZA 3E6DA 3BPXA 3RPWA 3U94A 1I5ZA 1ZAOA 3D0SA 5B7DA 2DTRA 2CGPA 1DPPA 1O7TA 3C36A 3T8TA 3FX3A 2EB7A 4EXLA 1FPQA 1USYH 1USYE 2IA4A 2W57A 1VFDA 2M87A 4IB2A 2YLNA 5DD4A 2PLYA 1LLSA 4WXCA 5E1ZB 2EWNA 3TYHA 3HRMA 5FHNA 1N76A 2AIXA 3VEPA 3ILUB 1TFDA 2XX7A 2X0LA 4HW8A 4GVOA 3VLVA 2LNBA 4M71A 1IZ1A 3U93A 2F7CA 4I98B 5ICEA 5BUUA 3JV9A 2QBYA 5FHMA 1TQPA 3V8KA 1IXSB 2QM3A 2QMWA 2WTEA 4P0IA 2ADUA 2ONKE 1MGTA 2UVGA 1MPBA 2VODA 3V83A 1HQCA 1OPCA 3WTUC 3T96B 5BS6A 4KCCA 1XSXA 4YB7A 2EA4A 2ANJA 1T6SA 1ZJLA 2O51A 2D2WA 2Q8KA 2A07F 2K27A 4BDMA 2JPBA 1LB2A 4GFRA 4GXSB 1C0WA 4FJPA 3P7NA 3THIA 5D4SA 1IN6A 1QZYA 1P1NA 3DM0A 1FYMA 3B6QA 4YIFA 1ONVA 4HBLA 4GXAA 3QUFA 4M74A 3ISPA 1Y1ZA 2WKYA 3I3VA 1LAHE 4L18B 1PB9A 1TWYA 1VR5A 5BQTA 2O8XA 2O68A 4DDDA 1T38A 3G3GA 3BPVA 4G9YA 5BMZA 1FC3A 2B3FA 4ESFA 2OBPA 3KN8A 1D8KA 2VBYA 1S6LA 3E97A 4KYWA 3V7CA 4F39A 4B09A 3AXFA 4F3SA 4R2BA 4E0XA 4AIHA 4IO7A 3V8JA 5E20A 2HR3A 2P4WA 1P2FA 1TQMA 2G29A 1B4AA 1NH8A 4S05A 4GQOA 3MPKA 3ML6A 2FNPA 1D9VA 3TO9A 1QNTA 5DT6A 4IO6A 2DOJA 3GO5A 1ZG3A 3IO4A 1ZARA 1JXSA 1UTBA 3P9CA 5ITOA 5H8QB 4EJVA 2GFEA 2FBKA 1YYVA 3IRRA 1B0LA 4IJAA 4OETA 1U3EM 5AE4A 4C0RA 3K9TA 2BEOA 3FXUA 4NWDA 1HBXG 1ULYA 1SI0A 3M8EA 3SZPA 1J9IA 2THIA 3KN7A 4RK9A 1KQ0A 5AONA 2PBIA 3FZVA 4G6DA 2Z8FA 3UP9A 3MBPA 2D1HA 3W9VA 1R9LA 4EJOA 5ICCA 4FIMA 3PUYE 4KNYA 2IA2A 2XXUA 2Q88A 4DLDA 1LFGA 4PFTA 3C4MA 1J0RA 1YW7A 1SVXB 2UXXA 3WG9A 4LATA 3H7MA 3LBSA 5E18F 2QJEA 5ILSA 3RTWB 1B7UA 4RB1A 3K1NA 5L9OA 2JSCA 4M6YA 3G3IA 3M1EA 4P0GA 2ZKZA 3COAC 1ANFA 2CMOA 3NEUA 4GXOA 3MQ9A 4F29A 3LA7A 2YPNA 4KHZE 3DELB 4NF8B 3MQ0A 5D5UB 2ZYKA 2FMYA 3OV8A 4C1UA 3LAJA 2FU4A 2UYEA 3S9EA 1B6HA 4NHJA 4L17A 4DE8A 1MRPA 3GW2A 4G8XA 4GO1A 3FV2A 1YW8A 3IB2A 1R6ZA 2WV0A 3RKXA 4Q5TA 5IT9K 4F3GA 3GXOA 4YIIA 3IOWA 2JT1A 3FVGA 4LK0F 4FAJA 4F2QA 4M72A 1UIVA 5TPAB 1JEVA 4KMUX 3ECOA 4C1TA 2O0YA 4L9NA 1MXXA 1P1QA 4ZE9A 2W7YA 1D5VA 1B9NA 1P99A 4DXUA 3G3JA 5DEQA 5DEXA 1ZYRF 5AA2D 3N4MA 1XGNA 4HF1A 2A5TA 4B8XA 4EDPA 4BYYA 2HKOA 2H6BA 1Z6RA 3TGNA 3MVZA 3HV1A 5DUIA 4P9FA 4F1VA 5ICGA 4PFWA 5TPAA 1YS7A 1CE2A 4EJWA 4WKMA 4BDRA 3ECRA 3DFGA 1LCFA 1Z9CA 1M5DA 1F1ZA 5HDKA 1AL3A 3OOPA 5IT9Z 1ODDA 1II5A 1R36A 2UVJA 1MG1A 1G3WA 2Y7PA 3E3KA 3PFIA 3I5OA 4HCYA 4RK2A 2OQGA 2OK2A 1XS5A 2VOOA 4PP0A 3IWZA 1R1NA 1B3FA 1FSHA 4P5OA 4K3FA 1FQEA 1FTOA 1FBQA 1SYHA 4YKIA 3ECHA 3LQRA 2I4BA 1TT1A 1Y4TA 3RYRA 2VD2A 4KIBA 1DPUA 4R9FA 1URGA 4QLCU 3ZP5A 1MZBA 1Q1HA 3ABTA 3M9AA 1NKXA 4ESWA 4ZDMA 2FEZA 1A8FA 2PBWA 3W9WA 2EV5A 3V4GA 2H99A 1KU3A 4H8JA 5KK1A 3B73A 1Y20A 3N26A 1RNLA 4XBFA 3E6BA 5DV5A 1LAXA 2LSOA 2FBHA 1CF7B 1OYIA 1TQIA 2V3UA 3I58A 2ZCWA 3TFLA 2HXWA 2QRYA 5I2NB 4HDVA 3IKVA 4NMYA 3B6TA 2HEOA 1OMIA 3GXAA 5K1YA 3UGWA 1FP1D 3T9HB 4I1DA 1TFAA 4PCQA 2V6CA 1W7PA 4IHTA 2RKMA 3KOSA 4QSDA 2NNNA 3PU5A 4G7HF 4WEDA 1YG2A 3O2AA 4ESJA 2VOPA 3H6UA 1CF7A 2DPDA 2VBXA 4YMAA 5FHOA 2KRFA 5D5VB 1H9TA 1CGPA 4LK1F 2H94A 2UVIA 5LLQA 1Y3NA 1H9GA 4DCXA 1FQCA 1JHHA 4F31B 1A04A 1MY0A 5H8FB 4BDLA 2DE2A 4H1XA 4HDUA 3G3ZA 1A99A 4WWCA 2VT2A 3HRSA 3F6VA 4DQ2A 2QSXA 4H67A 3WE2A 3T66A 2A61A 2DU9A 5HLIA 1RKMA 1UCRA 4XLPF 2YR2A 4OIPF 4TV7A 3ZN0A 1IUYA 4R75A 3MVXA 2LAOA 4JSDA 1PDNC 1KYZA 1QKBA 3CUOA 2FQ3A 2QUFA 5ERIA 1B0HA 2JZYA 4LLNA 4JB7A 3F3XA 4U0YA 2R6GE 2DWAA 3MAJA 3HN0A 3Q5FA 2D3IA 3IORA 4OIOF 2NOOA 1N84A 4DXBA 4PDKA 1V3FA 4OFJA 1BP5A 4WX9A 2AL5A 3KE2A 4YICA 2BJJX 4FEBA 5F7VA 4HLYA 4N9HA 1NNPA 3TTKA 5ICFA 3BWGA 1Z91A 1B3GA 5J8CA 3OO7A 2EFQA 3RY3A 5K5OA 1R7JA 4EM0B 1BIBA 2HS5A 4D0PA 1Q1KA 5CRYA 1USSA 3WODF 3WU0A 3FVKA 5K2YA 3MZYA 1RZ4A 2Y48A 1HKQA 2EFPA 4P55A 3SEYA 5L3BA 5FB2A 1QKAA 4LONB 3DPLC 2FOKA 3ZKLA 1LSTA 2Z99A 4G68A 2HQRA 5K5QA 4UUVA 5JI6A 4G6QA 2GRVA 4GCVA 1QVSA 4EUOA 2OZUA 1IN5A 1PDAA 3DLNA 3KFWX 4MEYF 2P1SA 4YZZA 3UIFA 2DP8A 3BP8A 2H6CA 3C7JA 1YTVA 3JAMZ 4P9UA 1LEBA 4R6YA 3E13X 4RGSA 1B4HA 3Q29A 1B1HA 3R61A 2OAZA 3S9MC 1Y0UA 3GEZA 2Z22A 2I48A 2VBZA 2DWIA 1ZTYA 5DYHA 1SW1A 3FGSA 1O7LA 4IGTA 1BKAA 4OU0A 3KEOA 3EETA 4CDGA 3CO6C 3MWBA 4BDNA 4WCGA 3Q9SA 3O6BB 4NE4A 3T8RA 4I01A 2OD5A 1A7LA 3I54A 3K2DA 2Y0MA 1B7ZA 1NFTA 4F1UA 2ZMEA 3QU6A 3WTVC 1VE4A 4OWDA 2RGVA 1IN8A 1P92A 3MEXA 1D9YA 2HQ0A 3V8XB 3O97A 3HSTA 1BOAA 3KJTA 1DPEA 3Q9VA 4NF6B 1JW5A 4E0WA 1IEJA 1VSOA 1Z05A 3L9FA 1KGSA 3QP5A 3QXMA 1SAXA 2ZNYA 3D4CA 3U8QA 3UK4A 2E1CA 5DVJA 4GWOA 1W5SA 4O5VA 3WAFA 1GGGA 2NNYA 2HZKA 3H03A 5JFRA 1BC7C 3EHSA 3PPQA 5HM4B 1R1UA 4L0YB 4ZEKA 1XCVA 4NF6A 3SXYA 2JRTA 2HWVA 4ND9A 3QPHA 3OO6A 4RAZA 4KN4X 2A5SA 3F8CA 2LDUA 3VFZA 4RY1A 4MTEA 1FCKA 1L5TA 4NQWA 3WGIA 5I58A 3S9NC 2XHKA 1OR7A 4A12A 2A6HF 1XD7A 2IJLA 3SFZA 4IRGA 4ONYA 4GL0A 1R58A 2VE8A 2DK5A 1WI9A 1FQBA 4NF4B 4U23A 5I2KA 3ZMUA 3O9PA 3UA8A 3TQLA 4H6DA 3K6VA 1QQIA 3HCQA 5CMMA 3TAJA 2FF4A 4N13A 2NXOA 1QUKA 2BE5F 3TELA 1PUEE 4CO8A 2M30A 2QQAA 1HW5A 4LG0B 2QQBA 2F97A 1S7OA 2L3DA 3S2WA 4U7DA 2XX8A 2Z5UA 3MCZA 3IK6B 3T5XA 2F7BA 1D3YA 3A3UA 2HKXA 5HS9A 4NF4A 1FT9A 4A0YA 1SW2A 2O6AA 4AB5A 3ZQ7A 4GYIA 1B6AA 5F1RA 4L9VA 4FT8A 4EJUA 2JPCA 3LSFB 4F22A 2G7HA 4R79A 2DWJA 1S7YA 1SD4A 4RAYA 1G3SA 3TZAA 4AVPA 4K2EA 1WWXA 3DF8A 4OINF 3MWMA 3MP6A 3OENA 2X7PA 2MBFA 3LC8A 4JDFA 3T1BA 4JXIA 4ZECA 1SD6A 3TOAA 1EZOA 3K6UA 4HX7A 3KP5A 1JW4A 4Z0IA 1J1NA 2RCAA 1FTLA 3LSLA 2FYIA 4G77A 4U0VA 1WQ2A 2W24A 4IO2A 1JETA 1B59A 4WK8F 4R2FA 2XXHA 4XXUA 1KYWA 3GBAA 2FSWA 5EYFA 3H6VA 3KSJA 2VC0A 5LGNA 1KQ8A 1SMYF 1R5HA 2V9VA 4MFIA 4N0BA 5L3CA 4JWOA 2F34A 1FYLA 3I4PA 1U8RA 5KDTB 3HRUA 2DK8A 3ZMSA 4EMSA 1IAWA 1MH3A 1Y3PA 4EQ7A 1OQGA 3RDIA 3Q25A 3CSBA 3QRFF 5D4RA 3ZN1A 3B7DA 2QBYB 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