1HXJA

Crystal structure of the maize zm-p60.1 beta-glucosidase
Total Genus 189
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
189
sequence length
490
structure length
490
Chain Sequence
QMLSPSEIPQRDWFPSDFTFGAATSAYQIEGAWNEDGKGESNWDHFCHNHPERILDGSNSDIGANSYHMYKTDVRLLKEMGMDAYRFSISWPRILPKGTKEGGINPDGIKYYRNLINLLLENGIEPYVTIFHWDVPQALEEKYGGFLDKSHKSIVEDYTYFAKVCFDNFGDKVKNWLTFNEPQTFTSFSYGTGVFAPGRCSPGLDCAYPTGNSLVEPYTAGHNILLAHAEAVDLYNKHYKRDDTRIGLAFDVMGRVPYGTSFLDKQAEERSWDINLGWFLEPVVRGDYPFSMRSLARERLPFFKDEQKEKLAGSYNMLGLNYYTSRFSKNIDISPNYSPVLNTDDAYASQEVNGPDGKPIGPPMGNPWIYMYPEGLKDLLMIMKNKYGNPPIYITENGIGDVDTKETPLPMEAALNDYKRLDYIQRHIATLKESIDLGSNVQGYFAWSLLDNFEWFAGFTERYGIVYVDRNNNCTRYMKESAKWLKEFNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE
publication title Insights into the functional architecture of the catalytic center of a maize beta-glucosidase Zm-p60.1
pubmed doi rcsb
source organism Zea mays
total genus 189
structure length 490
sequence length 490
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2001-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hxjA00
5A6BD 1AQMA 4J3WA 4YHEA 3IJ7A 3PZMA 4JFSA 3F5JA 3I3BA 1K9DA 5CSYA 3AYSA 4J28A 1KGWA 1C7SA 2YL5A 3LPOA 1HJUA 2DGAA 4M24A 1BGGA 5DMYA 4MAZA 2VX5A 1B3YA 4ZXOA 4UOQA 1NOWA 1W9VA 4AZ6A 1QHPA 1E43A 1UD8A 1E5JA 4D6IA 3F5LA 4CD7A 1H49A 5HNNA 1CGYA 3NSMA 3A4AA 5LA2A 1TA3A 1CGUA 1JAEA 2UWFA 4JKKA 4BQ5A 2F61A 1BG4A 1FH7A 1OBAA 4UQ9A 1V3LA 1JF6A 4FLQA 4AMCA 4KWUA 2GDVA 2PB1A 4CN1A 4QCEA 2J7EA 2Y4SA 3BAYA 5D8WA 1LJYA 4MDPA 2YBTA 5HPCA 3O6AA 1X1NA 5A6KA 1W2VA 4AIOA 1KB3A 1EGZA 4HZ6A 2E9MA 2Z1SA 2X09A 4GPNA 3EMQA 3WDJA 4ATWA 1A3HA 1Q6GA 3WENA 2VR5A 4J3XA 1PZ2A 1CXFA 2QMJA 1CNVA 2ZUVA 2BY3A 4E8DA 2J78A 3T0BA 1HVXA 1M7XA 2NT1A 1GUVA 2JALA 4AZCA 4NZCA 3AIBA 2OSWA 1PPIA 4MTVA 3U5UA 1ZL1A 3M6DA 2EPOA 1QI0A 1B3XA 5IFTA 2VI0A 3FN9A 1CWYA 2FGLA 5CPQA 3OIHA 3NSXA 4GI8A 3UEQA 2WMHA 4HP5A 3WN6A 3ZJ8A 2E8YA 1B9ZA 2D1ZA 2J25A 2J7HA 2GFTA 2VCAA 2YJQA 3WKZA 3CH9A 1GVIA 3U57A 4AEFA 5ABEA 4QCFA 4GZEA 1XYFA 3OZPA 1UWIA 4H8UA 4UOZA 1UD2A 1ZJBA 4W93A 4PMOA 3PZTA 3SCRA 4V2XA 2BY2A 1SMAA 1GQJA 4W7UA 3UG3A 1GVYA 2WK2A 2W4XA 2XTKA 3T2PA 3BLPX 1W3KA 4GKLA 3WDHA 1EDTA 3SUTA 3PZNA 1R7OA 3K4AA 1AVAA 5E9AA 1HN1A 3AHXA 1MQRA 3TP4A 1NH6A 2C7FA 1PIFA 3RDKA 1K9EA 1FP9A 2GDUA 4IPNB 1V08A 2G41A 2VQTA 1YHTA 2JFEX 3CO4A 1N82A 4P8WA 1SMDA 1JZ4A 3SCUA 3ZT5A 1HF6A 1ZU8A 3AHVA 1NOFA 3GM8A 1UQYA 4HA4A 3MUY1 5ABFA 2BVTA 1J11A 3GXMA 4JIEA 1KXQA 1B3VA 3PTKA 1PAMA 3GH4A 3DYOA 4DM1A 4M56A 2J7GA 2WBGA 3HMCA 3VDBA 1BLIA 3VD4A 4N42A 1EIBA 1L8NA 3NUKA 1DWGM 4DUVA 4OZOA 4RE4A 1UUQA 2PWFA 2DSZA 4UQCA 1JNEA 5BROA 4H41A 4H7VA 4YPJA 1CYGA 1BSIA 1UD3A 1TG7A 4ATLA 3A3HA 1KGUA 1OB0A 2FDMA 2WC3A 3G6MA 3GZAA 3OLGA 1B90A 5IDIA 2WZHA 1E6SM 3ZJKA 3ALGA 1XH2A 5DO8A 3OLDA 4KH2A 4MAVA 3WBAA 2QPUA 3SEPA 1HJSA 4S3JA 1D7FA 1WDRA 3ZT6A 1J12A 3VM5A 3AS2A 4A3HA 1JI1A 5A95A 3HN3A 4P8VA 4RE2A 3LPPA 3IAQA 3RCNA 1F4AA 5E0FA 3T08A 3TTYA 1W9UA 2WANA 2WCSA 1G1YA 1JF5A 1HKKA 1UQZA 2ZXAA 1TA3B 4WIWA 3BLKA 1QVBA 2VNCA 2D20A 3AZTA 4U33A 1GOMA 4XZBA 2Y2WA 2EXOA 3T2QA 2W61A 4J7RA 4PYSA 2F8QA 3W6MA 1MXGA 3CBWA 2E9LA 1G94A 1E6RA 1WO2A 2D3NA 1GJUA 5ABHA 5HPOA 4HPGA 1CXEA 5BRQA 9CGTA 4AISA 4V27A 3N15A 4WKHA 1EHAA 1LLOA 2XWDA 2O9TA 3ARVA 3QGVA 5M3WA 3CHCA 2EEXA 2VCBA 3WIJA 2PWEA 1KQZA 2XFFA 3WH6A 3HU7A 2BFGA 4W88A 1ISWA 4GZJA 4LPCA 1C8YA 7A3HA 2DT3A 4AC1X 1OGSA 2W67A 3VNZA 2GUYA 1DWAM 4HA1A 5LA0A 2BXYA 4GZIA 1H0IA 1WDSA 4MADA 1GQIA 2DIJA 4PSPA 1E4IA 1FHDA 1KBBA 2WC4A 2CESA 4LYQA 1XSKA 8A3HA 4MB3A 3AICA 1H2JA 2ZIDA 4V28A 3L2MA 3OBAA 3WF2A 1GZJA 1FOBA 4TUFA 1EO7A 1FFRA 2E40A 3AZRA 2G3JA 3VMNA 1E6PA 3I3EA 4JHZA 4C7GA 1PX4A 1ISXA 4DWSB 2PF0A 1BF2A 1JZ2A 4PTMA 1NP0A 1E6XM 1UKOA 1J0JA 2CEQA 4JZ5A 1UWSA 2WXDM 1E15A 3N11A 1DTUA 3WH5A 2XM1A 3T2OA 1QNQA 1E4LA 2V3FA 1BTCA 2YL8A 1BHGA 4JCLA 4Z2KA 1XH0A 2FH6A 2BHYA 1Q6FA 4PTVA 4C7FA 5I23A 5JBDA 2G3MA 3KL3A 3ZOAA 4W7WA 3ZSSA 8CGTA 3PZ9A 3A6OA 4FLSA 1K9FA 2XIBA 3WNPA 3VIGA 1FP8A 1WNOA 2D3LA 1MFVA 5F7UA 3MMWA 2ZX5A 1S46A 2Y5EA 1B0IA 2WMKA 4M81A 2CERA 1C90A 4CCDA 4J3VA 3BH4A 3AJ7A 3VDCA 1JYWA 4WK9A 2XVKA 3S6TA 2J74A 2DEPA 1UH4A 3POCA 1XD1A 4D6FA 2CBUA 3VO0A 5TD4A 1W9BM 3VOCA 2XWEA 2BVDA 3BAIA 3QOMA 1A47A 4D6JA 1MQPA 1JFXA 4AZBA 4UZSA 4B15A 5BCAA 4QAWA 4QLLA 3FW6A 2WC7A 1DWJM 3IJ9A 1LF1A 2WW5A 4AD2A 3L4XA 3WNOA 4P7OA 1BG9A 4AD1A 2FHCA 4URIA 5A6LA 3LPFA 1V6WA 3NDZA 3DC0A 1GQKA 1CGVA 3AMKA 1UHVA 1WZAA 1EA9C 1ZBCA 3VTRA 1CEOA 3WDPP 1E56A 2UY5A 2XGBA 1KFWA 2GJPA 4BA0A 4UQDA 4TVCA 1QOXA 3WQ5A 1E9LA 3DHUA 1UKTA 4F66A 4K68A 4GO9A 4MJ2A 4UR9A 2V5CA 4X0VA 2XFRA 5HDRA 3GXIA 1LL6A 1RH9A 3U7BA 3ZM8A 4KGLA 1J0HA 1HP5A 2CKRA 4CU6A 3LPGA 1EO5A 4GI6A 1HJQA 1NWUA 3NCOA 2WBKA 4W8LA 1VEMA 3N9KA 3WQ6A 1KCKA 3THCA 3ECQA 3MKKA 1GOIA 1JI2A 1CGTA 1KGXA 1ESWA 1NM9A 1ZJAA 2QPSA 3LMYA 3UETA 2ZUUA 3EMZA 7TAAA 3HJEA 1CDGA 4UQAA 1CENA 5E6YA 4HA3A 1H3GA 4P7QA 4U2ZA 2D24A 1HP4A 3T09A 1HL9A 3PBGA 4B9ZA 3RJYA 3AZSA 4PTXA 2W92A 4WJXA 3O2LA 3RM8A 3L4UA 3UG5A 1JYNA 1WDPA 3VGHA 2YIHA 5CJ5A 3L2LA 4M29A 1M04A 1TMQA 1WZMA 2VVNA 3N17A 3WH9A 3W0KA 1QNOA 4UTFA 3CGTA 1XYZA 4Z2LA 3NJ3A 2EO7A 5E70A 1EQCA 1RPKA 4NRRA 3CHFA 1BVZA 4ATDA 3ZJ6A 3ZQ9A 2CYGA 2OWCA 4E2OA 1W1PA 3EDJA 4U31A 1JZ3A 1U33A 2V3EA 4CCCA 4MB4A 1W9XA 4PRWA 3GDBA 4Y7EA 1E3ZA 5A8MA 1HJVA 1CLVA 1E6NA 4UFHA 1XHGA 4GO8A 3QR3A 5E0CA 4J3UA 1I1XA 1CXHA 1V3HA 3A4XA 1W3HA 3AROA 5A8PA 3WF4A 3SUVA 1J0YA 2DH3A 2QMKA 1ITXA 4H8VA 2DT2A 3K8LA 3W81A 3WD3A 4B3KA 1EQPA 2GK1B 5E6ZA 4AEEA 3AFBA 1PZ3A 2YOCA 1GOOA 1C8XA 2VZVA 3CMGA 1WP6A 4XB3A 2WAGA 2ZXBA 1FH8A 1OGBA 4HMDA 3KZSA 1RP9A 4U2YA 2ZUTA 3MUIA 2WWDA 4QP0A 5BYWA 2C0HA 1CXKA 1JNDA 2WHKA 4KRUA 1UZ4A 5CQ1A 1V0NA 3W53A 1GNXA 3WF0A 4OOZA 3AXHA 3B8SA 2ESCA 1HXJA 1JFHA 2CKSA 3VX0A 1UD6A 1E40A 1TVPA 2VTFA 4BF7A 5AC4A 5I0DA 5D9NA 1W1VA 3N13A 1JYVA 4CVWA 1G5AA 3QOKA 4BQ4A 3BCFA 4JL1A 1JD9A 5A3HA 1E1FA 1XH1A 2DSKA 2HISA 2WMIB 5I6SA 2VUYA 4AZ7A 2MANA 2GJXB 5GQBA 1D2KA 3ALFA 5I79A 3AS3A 1JIBA 3VD9A 1E4MM 1UZ1A 4HMEA 4P8UA 3N04A 4YN5A 1W3JA 3WH8A 4ACZA 4LYRA 2ZX7A 1NOUA 2UY4A 2YKKA 3EDKA 3GH5A 2ZICA 2VT0A 5EB8A 1E71M 3CHEA 3ZMRA 2WKGA 1BVNP 4DUWA 1H5VA 4ACYA 1UR2A 4F79A 1ODZA 2WCAA 3TTSA 2J75A 5GNXA 1Q4NX 1MYRA 2JIWA 4L4PA 5A8QA 2FHBA 3CPUA 1GOKA 4XUYA 3W38A 1EOMA 1BYCA 2V38A 1EDQA 3BSGA 1DWIM 4D6HA 1G01A 5M03A 3MMUA 3CZKA 1OIFA 1OGGA 1EHNA 3AIRA 1WB0A 1JXKA 5E09A 1ISVA 3IK2A 4QDMA 1HJWA 4AXNA 1LWHA 3OLEA 1LG1A 3GNRA 1E55A 1FFQA 2A3AA 3W29A 4A3YA 2JIEA 2UY2A 4AZ5A 1GHSA 2RGMA 4PMUA 3CTTA 4EKJA 3W25A 4HOWA 1BYBA 2OWWA 3CZJA 1BQCA 5DF0A 1EH9A 2EPNA 4AYSA 1UKSA 3E1F1 3OLIA 3K4DA 5EFDA 3GYCA 3AHZA 1J0ZA 3FY1A 2HVMA 3CZGA 5DEZA 2IXVA 1BAGA 5FOOA 3VIOA 3WUFA 2WSPA 4P8XA 4UCFA 2CITA 4Z2HA 2D0GA 4BZYA 3RM9A 2X0HA 1Q6CA 1UWUA 4CD8A 3UESA 5C71A 4YHGA 3MV01 1V02A 2V5DA 1R7AA 4W8BA 4DWSC 1BGAA 3APGA 2XFYA 3VDAA 3G6LA 4U5IA 1UD5A 4UFIA 2W66A 3WMCA 4D1IA 1US3A 2GSJA 4NRSA 1P6WA 4Z2IA 5IHRA 4J3SA 2W5FA 2X2YA 3ZR6A 5D4YA 1OINA 1KXHA 3PZUA 3TTOA 3EDDA 3VGFA 1HIZA 1W2PA 1O7AA 2VMFA 1KCLA 2J47A 4N0RA 3WEOA 3K46A 1CXIA 1CTNA 1E0XA 5A2AA 4B9YA 5GNYA 3VMOA 2WHLA 2VOTA 3DYPA 3WNKA 2QLYA 2Q8XA 4TVDA 1OCQA 4PMYA 4PTWA 2VRKA 2BXZA 5I5RA 3WL1A 2WM0A 1C91A 1ZB5A 1VB9A 2XVLA 1R8LA 1PX8A 4HPHA 1CXLA 3VGDA 1V6UA 2W63A 4HZ8A 1UR0A 3IANA 1C3FA 5AYIA 1UR9A 2YDQA 2JF7A 3WH7A 1XCXA 5HXMA 1FH9A 2YA1A 1V6VA 4D6DA 4CCEA 2EQDA 3WUBA 2V3DA 4EAMA 1RD6A 1V6YA 3ARQA 3WQWA 2YL9A 2WVVA 1CBGA 1OM0A 3WUGA 3MUAA 3GXFA 3AOFA 3ZO9A 5LA1A 2VVSA 3ARXA 1ZS2A 4AD0A 1K9TA 4XZWA 5CSUA 1VEOA 2DSUA 2VX4A 1CGXA 4QLJA 4CN4A 4HU0A 1UD4A 5BRPA 1HKMA 1D3CA 3IAPA 4MDOA 4RL3A 3VIHA 1ZBVA 1E3XA 2BY0A 4AD4A 4AZCB 3BC9A 2VRJA 5BXTA 3ARWA 1VRXA 1WZKA 5IXEA 1WKYA 1XSIA 4W5ZA 1QBBA 3RPMA 5FD0A 1UKPA 2PWDA 3UERA 3OA5A 5EBAA 3KWXA 4M80A 1UH2A 5ABGA 1B1YA 1X6LA 1VENA 3ZT7A 3CUFA 2EPKX 1QNRA 3SUSA 3EMCA 4Z2JA 1GQLA 5JIWA 3AS1A 3FAXA 3RO8A 4PCSA 4D6CA 2XGIA 1J18A 2WHJA 1W91A 4AZIA 3PZGA 1SFSA 3T0AA 4AWEA 4ZFMA 3K8MA 2CBJA 3VIMA 3THDA 2ZX8A 1Y7VA 3K1DA 4LXFA 2YA2A 2BY1A 2VZTA 1ZBKA 2Y8VA 3W37A 4AD5A 2VX7A 4XV0A 5FL1A 2IXUA 4PSRA 2G3NA 5FIPA 2WB5A 4HOZA 4CD4A 6TAAA 4OBSA 4HTYA 1AMYA 5CZKA 5I2UA 1TVNA 3U7VA 1W9PA 2OLHA 5ABFB 5HOSA 2G8ZA 3VIPA 1CECA 4HMCA 1XC6A 3M46A 1UA7A 5ECUA 4IISA 2D0FA 4MJ4A 3VGGA 4AIUA 1HL8A 5FL0A 3SUUA 3GH7A 1J0IA 2ZUSA 4FMVA 1BYDA 3NIYA 4TX8A 4FF5A 1LG2A 1GONA 3OGSA 5AY7A 2O9OA 4F9JA 3I3DA 2PBOA 1J10A 1WE5A 2BHZA 1US2A 2BHUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5A6B D;  1AQM A;  4J3W A;  4YHE A;  3IJ7 A;  3PZM A;  4JFS A;  3F5J A;  3I3B A;  1K9D A;  5CSY A;  3AYS A;  4J28 A;  1KGW A;  1C7S A;  2YL5 A;  3LPO A;  1HJU A;  2DGA A;  4M24 A;  1BGG A;  5DMY A;  4MAZ A;  2VX5 A;  1B3Y A;  4ZXO A;  4UOQ A;  1NOW A;  1W9V A;  4AZ6 A;  1QHP A;  1E43 A;  1UD8 A;  1E5J A;  4D6I A;  3F5L A;  4CD7 A;  1H49 A;  5HNN A;  1CGY A;  3NSM A;  3A4A A;  5LA2 A;  1TA3 A;  1CGU A;  1JAE A;  2UWF A;  4JKK A;  4BQ5 A;  2F61 A;  1BG4 A;  1FH7 A;  1OBA A;  4UQ9 A;  1V3L A;  1JF6 A;  4FLQ A;  4AMC A;  4KWU A;  2GDV A;  2PB1 A;  4CN1 A;  4QCE A;  2J7E A;  2Y4S A;  3BAY A;  5D8W A;  1LJY A;  4MDP A;  2YBT A;  5HPC A;  3O6A A;  1X1N A;  5A6K A;  1W2V A;  4AIO A;  1KB3 A;  1EGZ A;  4HZ6 A;  2E9M A;  2Z1S A;  2X09 A;  4GPN A;  3EMQ A;  3WDJ A;  4ATW A;  1A3H A;  1Q6G A;  3WEN A;  2VR5 A;  4J3X A;  1PZ2 A;  1CXF A;  2QMJ A;  1CNV A;  2ZUV A;  2BY3 A;  4E8D A;  2J78 A;  3T0B A;  1HVX A;  1M7X A;  2NT1 A;  1GUV A;  2JAL A;  4AZC A;  4NZC A;  3AIB A;  2OSW A;  1PPI A;  4MTV A;  3U5U A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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