1I2NA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant n35a
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTAPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTEVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords TRANSALDOLASE B
publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 134
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2nA00
1VRDA 2VEMA 4MLRA 3IVUA 3HG5A 1FCQA 3GLCA 3RNDA 3GR8A 4MOZA 1I2QA 1RQBA 4LOCA 1XUUA 3EWUA 4Y8FA 1Z48A 1GVSA 3G24A 4EOUA 1KTNA 1OFAA 2A85A 1J5TA 1F5ZA 4MZ8A 3W3OA 1SFJA 4I7WA 1DL3A 3LGEA 5ABTA 3W83A 5E0KA 3VI2A 5D30A 4WXZA 3S1WA 4IXXA 2PC4A 1VYSX 3PF3A 2YPIA 2YFNA 1FCBA 2EKCA 2QCLA 3NPXA 4OV9A 3BGJA 2B7PA 2KZHA 4GE8A 1SO6A 1Y0EA 3NL6A 1KM5A 1L6SA 4AWTA 1KM4A 1F74A 5C55A 2ZBTA 2ZRXA 3WJXA 4O53A 5F1UA 2XN2A 1OFQA 3C2FA 4AMAA 1OK4A 4DO6A 1F76A 3C3NA 5AOUA 3U2OA 3DFPA 4QQ3A 5G1TA 4RV8A 3LHYA 5KMYA 1T96A 5E1QA 2Y7EA 1F73A 1DKWA 4UTKA 1K8XA 3K30A 3VE9A 4NJKA 5U4NA 4PH6A 1W56A 3P74A 3R8RA 1JRCA 2WNZA 4L4MA 1OX6A 3IRDA 3IVTA 4JIQA 4LRTA 1QNVA 1GVOA 2Z0IA 4DQWA 1G4TA 4OBTA 3CM4A 3OIXA 2ABBA 4O18A 4O0KA 4FNUA 3W7CA 4O54A 3G1HA 1JCYA 2A6LA 2WJZA 1YDNA 5FF7A 1QPRA 4FX7A 1T99A 2QUVA 3IVSA 1X7FA 3HIJA 1JCJA 1KA9F 1TPH1 2NV1A 3NQVA 3OVRA 5I3HA 1Z42A 2QCGA 5TQLA 3PWAA 2TSYA 3MW7A 4GWEA 5SWUA 3HGRA 3LX9A 4UFLA 3L65A 4H6KA 1K03A 1UCWA 3T55A 4QITA 2QDHA 3EWZA 5FI8A 1KM2A 5E93A 1K8YA 4FNTA 3EWWA 2G97A 2DZSA 3C6CA 4K8EA 2ZZ1A 3M44A 5LNSA 3TMQA 4CCDA 5D2TA 2EGZA 3QSTA 5D02A 1OFDA 1HG3A 3DFQA 1TPDA 3N19B 5FF0A 1DBTA 4UXDA 4IMDA 1OVDA 2Q8LA 3GB6A 1N55A 3I7RA 2A4AA 3CTLA 2OMAA 3UWYA 3HGSA 3W1QA 3EX2A 1BWLA 3G1SA 4WX2A 2QKFA 1UUOA 1VCGA 4OT7A 3HB9A 1GOXA 1TB3A 4GUIA 2GPTA 1KFEA 3QEZA 1MSSA 4M6QA 4OU1A 1DJNA 4RX0A 2FLIA 1YXDA 2C16A 3S1XA 1TRIA 5FESA 3TR2A 5EPDA 3B0VC 3KVMA 3G1FA 2YCEA 5KZDA 2X16A 4YCPA 2QCNA 3O6CA 3M1ZA 4UTTA 4A2SA 2V2CA 3T78A 3NQ8A 1H7OA 2NWSA 4IXHA 4MYXA 4B5NA 5CPMA 3IEBA 3VNDA 1KBJA 3O05A 3EKLA 1TQJA 2G96A 1M7OA 4JN6A 1RVGA 4FNSA 4U28A 4ZQOA 4CCEA 1TCDA 3E02A 3NVTA 4AEOA 2VXNA 2YYTA 4CQAA 2E6FA 3P5YA 3W23A 4UNKA 1ZFJA 3NQGA 3QF0A 5MHBA 2E1DA 1DHPA 4MZYA 4N9EA 1YTDA 4MFDA 3N3MA 4DF2A 3NQ6A 3W6YA 3D0CA 4HHPA 3TROA 4DO4A 3S5NA 3LXCA 4RKAA 3AO0A 5EMUA 4TU1A 4DF1A 3GAKA 3IIVA 3W7RA 3GIYA 4MJZA 2ZZ7A 4KFPA 5HUPA 8TIMA 4JY9A 3CIWA 3BV4A 4AHOA 4FB7A 4WQ6A 1GQNA 2CZEA 1WA3A 3HGOA 3W76A 1KTBA 1LBFA 2Q3OA 3N9RA 3GR7A 2DZVA 4LS2A 3NM1A 1EUNA 4Z0SA 5K2ZA 1MZHA 2QAPA 1QO5A 3WJZA 4N9BA 4CNPA 4NUWA 2RH9A 1KFJA 3STCA 3O15A 1EWDA 4JTFA 3OG3A 3FYOA 1OYBA 2XN0A 2OT0A 3L9CA 3N34A 4PFMA 2J9XA 3G1VA 3F03K 3W86A 4OV4A 3P61A 1SUXA 4UTJA 1PHQA 3ABRA 3C56A 5BNKA 4LUJA 1B4KA 1VPXA 4IPJA 1B9BA 4O52A 3PM6A 3N2MA 1VYPX 1LRNA 2QJHA 2WSYA 4LT9A 1H1YA 4HNNA 1XBZA 3L0NA 4AH7A 3TDFA 3UWUA 4Z1AA 2A21A 1FXQA 1HO4A 2RFGA 3ATYA 4IMEA 1GVQA 3ZR4A 2DZXA 2YZRA 1SSGA 1XL9A 1BWKA 3CQ0A 5F4SA 3G1DA 3QSRA 1H7PA 4P2VA 3LBMA 1W8SA 1ICQA 3NM3A 2V82A 4IOTA 4JX4A 2C19A 5F2IA 2Q8ZA 3GAYA 1A5CA 3LERA 4ZMGA 3SECA 2ZZ6A 2X2GA 4LTSA 4O1BA 4H3DA 2V2DA 3M41A 2B4GA 3KHJA 3F1QA 3QZEA 2Z6JA 3W7GA 3EWYA 4DPPA 3TXVA 1A53A 1F6KA 1OYCA 3L0KA 3LXBA 1XUZA 1FWTA 4GUHA 3TQ0A 3NPUA 1H51A 2QCFA 3HPXA 1QDSA 2CZFA 2E09A 1V5XA 1SSDA 2ZRVA 3LI0A 2RKXA 4MLJA 2VFGA 4XBSA 4UFJA 3MUXA 2V0TA 3GDKA 4G1KA 5G4EA 1A50A 3W7EA 4HNTA 1T8XA 2V9DA 3NL3A 3W1LA 1OFOA 1O60A 4O14A 1YTKA 1JCXA 3PAJA 5FEXA 5CPLA 3ABQA 1QFEA 4AHQA 5CSSA 1LRQA 2CLIA 3EKZA 3SJ3A 1KBIA 1SU5A 3HG2A 4UTMA 3GYEA 4O4VA 3RLVA 1EIXA 1L6YA 4WJEA 5G2HA 4JYFA 1W54A 3DBPA 1ME8A 3GDLA 4FX8A 2EAWA 4E2BA 4MZ1A 3C2VA 1R46A 3NA8A 4JTTA 4BR1A 4LS1A 4TO8A 2VEIA 4BI6A 2QR6A 2XN1A 3W2JA 2Y61A 3R5EA 3C52A 1H7XA 1JR1A 2WNNA 3TUUA 1YPIA 1UJPA 3PBYA 4Q32A 3KFTA 3ABSA 3HG3A 3Q94A 1W0MA 4JIPA 4DPQA 2GQAA 3A23A 3A22A 4ZQNA 1SFLA 1VQTA 2FFCA 5D2XA 3ATZA 3O6YX 5AYYA 1D3GA 1ME9A 2QCHA 3DFTA 3H55A 4R34A 3UWVA 5LGZA 1LOLA 2E5BA 4QNEA 2DZPA 3FKKA 3SGZA 3E9AA 1FQ0A 1RQHA 4IJBA 3WK1A 2P10A 4ADSA 3B0PA 2QJGA 2CLHA 4GFSA 2QEZA 2BZNA 3IIZA 2QAFA 2BTMA 4QAIA 3P60A 5A8GA 3O63A 3FLUA 4JICA 4RZ6A 4FEZA 2VKZG 1F2JA 2A1YA 2C18A 1ZAHA 1O94A 1OK6A 1JVNA 3MMTA 3PG8A 4KWWA 1YDOA 5I3JA 3DKLA 4W9TA 1XBVA 5K4ZA 4ZQRA 4JTSA 4ADTA 3LTPA 3NQ7A 3S5OA 4JTJA 4ML9A 2ISVA 4N9DA 1O5XA 3G0SA 1O4UA 1TYGA 4MFEA 4MPQA 1NFBA 2JKPA 1OHLA 5TBOA 4UMAA 3CIXA 2NUYA 4FNRA 4WY0F 4ZL1A 4EWND 3GXTA 4K7VA 1QPQA 1WX0A 4RLIA 2E77A 1XDLA 1QWGA 2YDAA 2HSAA 1WYIA 3TW7A 3ANYA 4LVGA 4UTUA 1FDJA 3ABOA 5HR6A 2V81A 3NXFA 4MY8A 4ORMA 3MBFA 1ZY9A 3F4NA 1FCUA 1OFEA 2E68A 4MUZA 5BRBA 1RPXA 3EXRA 3HMJG 3CT7A 3NAVA 3W2NA 2H6RA 5AC8A 5EL1A 2YSWA 3G8EA 1I2RA 3LRLA 3GKFA 1RV8A 1KM3A 1P5BA 3A5VA 3PBVA 4FHAA 4NNBA 4QJ1A 4X3ZA 2HS8A 4JTKA 1K7EA 5DXXA 3B03A 4ZQCA 2XFWA 1PS9A 1YPFA 1EX5A 5I3GA 1ADOA 4I7VA 4NNCA 1TPVA 4XWUA 3TIMA 3MHGA 1LTDA 1W3TA 5TIMA 5HWMA 2YW4A 3U6WA 1YDVA 3N9SA 1KV8A 2B7NA 6ALDA 1JJKA 1LYXA 4JXCA 3FJ6A 3T4CA 2EPHA 3NR0A 3R89A 1FDZA 1WOAA 2PE4A 4HSNA 1SZGA 3UY7A 1G4PA 3TAOA 2LLEA 3PR2A 1SPQA 2BXVA 3BVJA 3R2GA 4JYDA 4NX0A 3SGUA 1LM1A 2D73A 3TNOA 3BPWA 4PL1A 1EEPA 1AW5A 3PY2A 4LY8A 3NOEA 1GT8A 2Y7DA 3LV5A 1YLVA 2E5CA 3CB8A 3O8AA 4GNJA 2C1HA 4AB4A 3HPZA 1X1OA 3W7NA 1DV7A 2O7QA 5DCEA 3I7QA 4O10A 3GZ3A 4HT3A 3TK7A 2A5HA 3M7WA 3W7QA 4Y96A 5HULA 4DXVA 1NF0A 2X1RA 4O57A 4GJ1A 3CWOX 4A3UA 1YXYA 3BARA 3PB0A 4DEFA 2WKJA 2CLFA 3FJLA 1GVRA 3RU6A 1J4EA 4WXYA 4K38A 1TV8A 3S9YA 4WOZA 4DF0A 2QJIA 3HBLA 4PC8A 3Q37A 3NYZA 2BLEA 3A24A 4ZZ9A 4S1FA 3NQFA 3GXNA 3S0CA 3OBKA 4Y6GA 4ADUA 1TTJA 4M7SA 3GDRA 3OHIA 3LOTA 5CG7A 3R12A 3F4WA 3IIXA 1G69A 4TMCA 2AGKA 2QCCA 5D04C 1WAUA 1W5NA 4UMCA 4UR7A 2QCEA 1KV5A 4M6VA 3O1NA 3I65A 2VELA 1AK5A 3KVLA 4ONVA 3ZFHA 1SR9A 1OFPA 1LP6A 4O28A 1GYLA 5CZTA 4PCFA 1FY6A 4NJJA 1W31A 1SO5A 1K02A 1NAL1 3LCGA 3LHWA 3UD6A 3W87A 4FF7A 4O19A 3IGSA 3TAKA 3HF3A 4UFHA 1FWWA 5LNUA 3W72A 5DXYA 3PC0A 2BX7A 3CLMA 3M6YA 2CFFA 3N73A 1UBSA 3MP5A 3SR7A 1AG1O 3I68A 3P81A 1H5YA 5AC6A 2ISWA 3VKJA 4EF8A 2V30A 1GTEA 3WK2A 1W1ZA 2C0AA 1GVFA 3BK0A 3W7IA 4CQ9A 1XXXA 2VOMA 3JRKA 1S5TA 4TR9A 2R91A 4NT0A 1N7KA 4CLMA 5K7JA 1QMLA 1H50A 1FWNA 5I3KA 4UTWC 3TFCA 2CZDA 3MO7A 1I2OA 1QPNA 4UMBA 1QOPA 1HTIA 4ICNA 3E49A 3GX9A 4WUIA 2EF9A 1SO4A 3TKFA 2NXHA 4Z08A 1OX4A 1RD5A 3DZ1A 4PA8A 2YW3A 5A5WA 1C9DA 5L6UA 1VJIA 3SZ8A 2TMDA 1ICPA 5IM51 3S6DA 1XFBA 4UC5A 5G5IA 3MI3A 4PL2A 2YXGA 1TPEA 2WO5A 5AYZA 5K9XA 2CWNA 3L68A 2PRLA 2VENA 3B8DA 3LCXA 4XZ9A 3NQCA 5C54A 3QPZA 2NWRA 4EVZA 1QCWA 1RZMA 3UWQA 1F05A 1Q6RA 4JTHA 2WPBA 3DGRA 4LUIA 4FX6M 1EP1A 3PB2A 2IQTA 4LV9A 4FNPA 4GUFA 4NJIA 4TIMA 1R2TA 1VLIA 1VS1A 5AC7A 3P80A 2QUUA 2A7RA 4BK9A 2FPVA 1EUAA 3S1UA 1NEYA 2ABAA 2CLMA 3E96A 2F7FA 3BLEA 2H8XA 3W1RA 3EX3A 1BTMA 3PUDA 3LDVA 1QAPA 3LHUA 4RZ4A 2J27A 4C1KA 3EXTA 1LDCA 1GWJA 4ZVJA 1LLZA 4CCCA 3L2IA 5BOOA 1MO0A 1KFLA 4NQ1A 3CHVA 3PG9A 4WY0B 2YYUA 3G3MA 4JDYA 4UR8A 3PSVA 3TV8A 4YMZA 2O7SA 3CC1A 2PURA 5D32A 2ALDA 2FB3A 4Z1CA 1U5JA 2ATSA 4HPJA 3QRHA 3G3DA 3HO8A 1VHCA 1G6CA 1I2PA 3SI9A 1N8FA 1H7WA 1TPFA 4Y90A 4POCA 5HR7A 4M19A 3QM3A 5IBXC 1O5KA 4RK8A 4LC8A 5HWNA 2NUXA 1CX9A 2YFOA 4UIOA 1SZEA 2DORA 3GNNA 4M7TA 2FDSA 3C8FA 2NX1A 1PL9A 3USBA 1A5BA 3NZ1A 4IMGA 3SFKA 2HTMA 2Y6ZA 2A0NA 1WQ5A 3NG3A 4JTGA 5FEPA 1P1XA 5KTLA 4S2CA 1Q6OA 2DZWA 3W1NA 4NXSA 3TCEA 1TREA 1EP2A 5HMSA 3BO9A 3DI1A 2J24A 1OX5A 1IGSA 1TPUA 3JS3A 1S5WA 3LCIA 2CLLA 4A21A 3UQNA 3BLFA 3TE9A 2R94A 2ZTJA 2CLOA 5FEZA 3S5YA 3LCWA 2ZCGA 4GXMA 2RDUA 1SZFA 2ZRYA 3FA5A 4WZHA 3W74A 2VFHA 4GC4A 3TSDA 1ME7A 2GUUA 2F84A 2FIQA 5KZEA 3VFLA 1M5WA 1M6JA 4ZQMA 3PS7A 4FXSA 5CGQA 1Q45A 2OX1A 3NZRA 4DBDA 1VZWA 1B4EA 2NV2A 1TMHA 4R7JA 3LM7A 2Y7FA 5CPOA 5EA9A 2FPYA 1QOQA 2C15A 1TV5A 3RFAA 1Q6QA 1W5MA 1W5QA 3QPYA 3TSBA 4JTIA 1ICSA 3MI2A 3HG4A 3STFA 3U8GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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