1I2OA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant e96a
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTAVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords TRANSALDOLASE B
publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 138
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2oA00
1H51A 2C13A 4JYFA 2F7FA 3CLMA 4K37A 3A24A 3HJZA 3R12A 4P61A 1TSIA 3UZJA 5KINA 1TREA 3MYOA 3W73A 4FIQA 1P4CA 2Y70A 4ZQMA 1EIXA 2V9DA 3C52A 3OEXA 1GVFA 2YSWA 4UFMA 2DZVA 4Y90A 3LHUA 4QITA 1F76A 1W0MA 1ZNNA 1KFKA 4XKYA 3LB0A 3TKFA 4JS3A 3WJYA 3W1XA 4E0CA 5I3GA 2DZXA 3GNDA 3NL6A 5CGQA 2CZFA 3QPZA 2OJPA 3QM3A 5E93A 3GDMA 2RHGA 3BLIA 2RDWA 1TJPA 1FBAA 1QOQA 3BGJA 3NG3A 2Y7DA 3MI2A 3QW4B 2PRMA 2ZRXA 3P7YA 4P2VA 3OBKA 1T8XA 4CNOA 2JGYA 2R8WA 3G8EA 1SW3A 4K36A 4O57A 2FDSA 2B4GA 4K8HA 1B4KA 3EWYA 4M7SA 4HN4A 4UTTC 5F2GA 3WK1A 3G0XA 3TSDA 1ZHAA 4BI5A 2QJHA 2RDTA 3IGXA 4K8EA 5K7JA 2ZCGA 3KOFA 4AF0B 3E9AA 3TW7A 4FNTA 4UTWC 2Y88A 4U28A 1MEIA 3Q2DA 4J9JA 4JTEA 1CX9A 2FPYA 4OGZA 5AHFA 4GUGA 2X2GA 1PCWA 2GUUA 4FO4A 1J4EA 4IMDA 3FOKA 3PBVA 2E6YA 3WK2A 1G4PA 3TQKA 1VGAA 4RX0A 3DBPA 3N2MA 3IVSA 4NX5A 1XKYA 3PAJA 1I2QA 1TYGA 3DFOA 5TQLA 4JIQA 1TV8A 3L5AA 4ZL1A 5AHLA 5T26A 4UUIA 3PB0A 2QAPA 6TIMA 4E2BA 3SZ8A 4A2RA 5CKSA 2HS6A 2WOQA 1ME8A 2QR6A 4RXFA 5HR6A 1NVMA 1OYBA 3BG5A 2YFNA 4HPJA 1UB3A 2CU0A 3T4CA 4LVGA 5FI8A 2FLIA 1NAL1 2FIQA 4OU1A 1QO2A 4CNPA 3B8DA 5F4XA 3SECA 4HNNA 3BK0A 4FNPA 3TAKA 2HSAA 3SFKA 3TV8A 4AB4A 2TSYA 1VCVA 3DAQA 1Q6RA 4IX2A 3NR0A 2OZ0A 1PHQA 3B0VC 3IIXA 1ZJIA 1L9WA 3W7KA 3H53A 3LERA 4IMGA 3QW3A 3LHZA 3O16A 3P61A 1YTKA 3FIGA 3NDOA 3HO8A 5C2XA 3NXFA 2GVJA 3W2MA 2WNNA 3L5LA 3FFSA 3BVJA 4FF7A 4TO8A 2VFDA 2Y62A 3TX9A 4MZYA 3V75A 2GJLA 3TW6A 3LBCA 2P0OA 3W7IA 4A3UA 2Q3OA 3QQ0A 2ZA2A 2CLMA 3LOTA 3CPRA 3M5XA 3G18A 1WBHA 4DBDA 4MLRA 3C0JA 3W85A 1XXXA 2UV8G 1W3NA 3MBDA 2ISWA 1MO0A 1V5XA 3C8FA 4LTSA 1WOAA 1QFEA 3PBYA 5F1UA 1EP2A 1PCKA 4GXMA 3HF3A 3H55A 1GOXA 1FCVA 3CEUA 1LBFA 2WO5A 3LDVA 1KTCA 3HIJA 4FX6M 5EA9A 5C54A 1SU5A 3KAOA 1H50A 1YXYA 4OQVA 4FB7A 5HJLA 2C14A 4BWLA 3NEVA 1EP3A 4GRSA 1C8VA 1W5MA 1M6JA 5G2WA 1ZFJA 2I9EA 3HGSA 3EWZA 2H8ZA 3W7GA 2YXGA 4D2JA 1GTEA 5BMXA 3CU2A 5KZMA 4LUJA 4ADUA 2PRLA 3GDKA 4OE7A 4IXHA 3TMQA 4N9DA 1K8YA 2RH9A 4CQ9A 5EY5A 1GVRA 4UFKA 3IIOA 4XBKA 4TMCA 4MKNA 2WSYA 3BLFA 5H2ZA 3G24A 4O28A 5DXXA 2Y89A 4RZ5A 4OWGA 5IM51 4UTJA 4O17A 3N3MA 4PTNA 2FPTA 1QPQA 3F4WA 1PIIA 4G1KA 1R47A 4DBEA 4UTIA 5D30A 3CQ0A 3PBWA 1IF2A 3DFQA 4NX0A 3VFLA 1O5XA 3T7VA 4W9TA 4O19A 3S5OA 3M5YA 3MBFA 4JGDA 1HFBA 1KTNA 2NWSA 3A23A 3GNNA 1KLZA 1B3OA 3DH7A 1V7YA 3U2OA 3A5VA 2CW6A 2VXNA 1R2SA 2ZZ2A 3M5VA 1W1ZA 3DXIA 4KFNA 1ICQA 4MY9A 2V82A 4JTFA 1PHWA 4TU1A 1AW1A 5AHIA 1QWGA 1TQJA 3HGJA 2X1TA 4NNAA 4UTUA 4FX7A 1EWDA 4WUIA 3S6DA 4IQLA 5K4XA 5D05A 3TSMA 1FCUA 1KM5A 4O0ZA 3DI0A 3GX9A 3LV6A 3QQ1A 3UWVA 2V8ZA 1G69A 3PG8A 2C0AA 5D38A 3S1VA 3M0ZA 2ZZ3A 1FXQA 3LTYA 1F05A 2YYTA 1TJRA 5D2XA 2B0MA 4RXGA 1KV5A 1JR1A 2JKEA 3USBA 4XBSA 5IBXA 3S0CA 2J24A 3LM7A 1T96A 1I8JA 4QAIA 2E6AA 1WDWA 1IXQA 1PS9A 1TRDA 1AK5A 3G1DA 1M5WA 2PRHA 4JIPA 4LVDA 3HB9A 5DN1A 3FKKA 2X1UA 4NJGA 4DF1A 4M7TA 4JDYA 2CLFA 2H3DA 1VLIA 1TPFA 2AAMA 5AHMA 4ADSA 3UY7A 2Q8LA 4HSOA 4QQ3A 1H7NA 3W72A 1Z42A 4IJBA 1TQXA 2QCNA 5G2HA 3BG3A 3MWAA 1LP6A 1YDNA 1ZAJA 3S42A 3THAA 3UWYA 1W5NA 3L0GA 3UD6A 1LOSA 2E1DA 1K7XA 3MHFA 1P0KA 3G1AA 4UTLA 1OJXA 3KRZA 4ZZ9A 3C2FA 2YZRA 3U6WA 1G7VA 2NXHA 3AJXA 1X7FA 1JCLA 5AOUA 3NQ7A 1XM3A 2J9XA 3W7JA 1NF7A 5I3IA 3K30A 2ZRWA 4AXKA 5BOOA 1K3UA 3MJYA 2Y7EA 2ABAA 3FYPA 4DPQA 5BNKA 1AL7A 4TR9A 3HBLA 2Y6ZA 4AHOA 1QPOA 4PFMA 1WYIA 5GVJA 2J27A 5HINA 1DQXA 3EEGA 4HPXA 3FA5A 5AC7A 4UIOA 1OHLA 2BTMA 4K38A 1PVNA 3I6RA 1JUEA 4MOZA 2Z6JA 5EBUA 5K4ZA 1K7EA 2FFCA 2QUTA 3TJLA 4NQ1A 1LLZA 3W7NA 5KSWA 2J88A 1HG3A 3PSVA 4X2RA 4AEOA 1MXSA 4FNUA 5J5DA 4UCGA 4MZ8A 2EGZA 1LYXA 4Z1AA 1W5QA 1QNVA 4JTTA 3ZR4A 2FPVA 4IWWA 3UWZA 3NQFA 5ABTA 3L2IA 1W54A 3HGRA 3PG9A 1BEUA 1OVDA 2QAFA 3N2XA 1EWEA 2C6QA 3P8IA 4JX4A 4JTHA 1ONRA 5C6MA 4PCFA 3G3MA 2NZLA 2I14A 5LKYA 3GZ3A 2Z0IA 4UFIA 2A85A 1A5SA 1FXPA 4I7VA 3UY8A 3NL2A 4NU7A 4YL2A 2V30A 3UZ5A 4EVZA 3O05A 3GR8A 4AVFA 2TMDA 5FF0A 3O1NA 1SUXA 1O4UA 1IXNA 3RK8A 3W2LA 2G5WA 5AC6A 4MY8A 3T44A 3PBUA 3C2VA 1BTMA 1R30A 1Z44A 3TA6A 1L2UA 2YX0A 3MHGA 3LHVA 2B7PA 3KVMA 1TTJA 3L0NA 2NUWA 1FQ0A 4GUJA 3LCLA 1OK4A 4DO4A 3TU9A 4ORMA 3F1QA 3N14A 5EPDA 2E09A 4WXYA 1ADOA 3LCGA 4JY9A 2GJNA 2NV1A 4IXXA 3M6YA 2NUXA 1YXDA 4H6KA 3TIMA 1K7FA 5CSRA 4NNCA 3IV3A 3W7CA 5AFDA 1H7XA 4KKXA 3LLFA 4QJ1A 3CWOX 2Q8ZA 2GQ8A 4LRSA 4A2SA 4RK8A 3W1LA 3W86A 3TC6A 5HWJA 3EWBX 1NF0A 4ZQNA 1ME7A 1VYSX 5G2IA 1HL2A 2VEMA 4RLIA 3DKLA 1Z48A 5LNVA 3HG5A 3NQ2A 5EMUA 5C55A 3GAKA 2ZRUA 3O8AA 1ZALA 2QCCA 2W0UA 1PL9A 5C5YA 1WBJA 3SI9A 1HTIA 3O06A 3P67A 4L4LA 5AHEA 1KBJA 1OABA 2YR1A 3T78A 2H8XA 3W7PA 1NSJA 3G3DA 2DZWA 1ZAIA 3CM4A 4EF9A 4MFEA 4O12A 1FDJA 5DY3A 1OFBA 1CW2A 3LCHA 3E0IA 5FF2A 1AG1O 3R8RA 2VFHA 4IMFA 4MVAA 3TXZA 1H62A 4JTJA 2ZQ0A 1KM3A 1F74A 4YLWA 5FESA 1JVNA 3NQ6A 4RV8A 1M7PA 5FEZA 4LOCA 1LRTA 2VC6A 3QMRA 4OV9A 2CFFA 4O1AA 4EOUA 2ZYFA 4LVBA 4FXSA 1SSDA 1I2RA 1LCOA 3G1XA 2FB2A 3TNOA 2A7PA 1DQWA 2VEIA 2R14A 1JCJA 4YCPA 1KA9F 5HULA 5FEPA 4WOZA 5D2WA 3HGOA 1IGSA 3ANYA 3NA8A 4S2CA 3CT7A 3W7MA 2P1FA 4M6PA 4E38A 5HUOA 5G4WA 4MFDA 4H4IA 5AYZA 3W22A 2DZPA 4LV4A 3TROA 5HWNA 3LHTA 5KZEA 1W3IA 3O15A 3HMJG 4YCOA 4O0KA 1J2WA 4HT3A 3BG9A 3NYZA 4JTGA 1I2NA 1B9BA 3ZFHA 2DORA 4ZQOA 2VFIA 4K39A 1DOSA 3ATYA 1SO4A 4O8RA 3WJZA 3L21A 2HTMA 1XUZA 3MI6A 3P5YA 3GIYA 4NJHA 3KVJA 3TFXA 5FEWA 4RZ4A 2QJGA 1VYPX 4N4PA 4NUWA 2PE4A 2R94A 1OYAA 3W2NA 3LGEA 3VNDA 3P8JA 4DF0A 3P84A 1BKSA 1OFPA 2A7RA 3O6YX 1QMLA 1ML1A 2GQAA 2ZA3A 4N4QA 5H91A 3STFA 1TB3A 2AQWA 4Y9AA 2XFWA 5I3KA 1PV8A 3GXPA 3C61A 3EX3A 2QCMA 3LTPA 3THQA 2QCGA 3E02A 3KVKA 4UMAA 3SW6A 4LY8A 1GG1A 4UFJA 4O18A 1MZHA 4UMBA 3C4UA 4Y6GA 4XQ6A 4O4VA 4DQWA 1WOBA 4Z1DA 2WNQA 4LC6A 3ABRA 1H7WA 3LCXA 4JDBA 2WPBA 2W79A 1FWWA 3B05A 1GVQA 4N9EA 3TSBA 1H63A 1W3TA 1RPXA 2A0NA 4NXSA 4PEKA 3MP4A 4IPIA 5K9DA 2DJXA 5LHFA 3MP3A 3RNDA 2GOUA 1SO5A 4L4MA 1YPIA 3ABQA 5HNRA 1R2TA 4DELA 3W88A 4ML9A 1TV7A 3CIXA 3PR2A 4QIUA 5A8GA 2ZZ1A 4TIMA 2A2IA 1GJPA 4CCDA 4ZMGA 3FYOA 5EKYA 4N6FA 3CIWA 1QAPA 3W87A 1S5VA 1KFEA 3W9ZA 4YWIA 4UXDA 3F03K 4OHQA 3LI1A 2QJIA 2Z6IA 4EIVA 4R33A 3CC1A 3PUDA 1I4NA 5DY2A 4HNTA 1ZAHA 2E5DA 4IMCA 2CLIA 3EXRA 3FJLA 3UWQA 3NQEA 3EKZA 2HMCA 1TTPA 4O53A 1NEYA 4LVAA 3M1ZA 3M43A 5U7SA 4GUHA 1HO4A 1VZWA 3HOJA 3BV4A 3TAOA 1I2OA 1G7UA 1KBIA 6ALDA 4NZFA 4UMCA 1RVGA 1F5ZA 4CLMA 3Q94A 3RF9A 4BWLC 1ZENA 1SZGA 1XBXA 3DHDA 1O5KA 1SZNA 3BPWA 3KHJA 3DFPA 3LX9A 2B7NA 1W5OA 2Z2UA 1LRNA 1OFRA 3A9IA 4M6QA 3UQNA 3LBMA 1VCFA 2HS8A 3NPWA 2A4AA 3OG3A 3AO0A 4ZQRA 1KM0A 1QCWA 1VJIA 3NAVA 4FEZA 1RQEA 1WA3A 3GDRA 5FF3A 2X1SA 1W56A 4R34A 2PC4A 4IPJA 3QSTA 4Z1CA 4O1CA 2D73A 3GDLA 5LNWA 3B4UA 5HWMA 3EXSA 2VFFA 3MP5A 4HSNA 1ZCOA 3HQ1A 1NFBA 2BXVA 3UWWA 2CLHA 4A21A 1S5TA 4DEFA 5AN7A 5TBOA 1GT8A 1SO6A 2Y7FA 1OG0A 4PODA 5DCDA 1YXCA 2DZUA 4CCEA 3L67A 3UWUA 3C6CA 4NT0A 2H6RA 3LXBA 4O52A 2WNZA 4K6AA 5LNSA 1TPVA 2DP3A 4XTIA 1TV5A 4NJKA 2BX7A 2TYSA 3INPA 3STGA 3VCRA 4BK9A 4IUOA 3T40A 3NGJA 1Z41A 3W2JA 4N2YA 4AWUA 3LRMA 1JRBA 1JJKA 4JICA 1TPDA 2QDHA 4WJEA 3C3NA 2YDAA 4M19A 1LBMA 4DO6A 3LV5A 1IXOA 4CQ8A 4O54A 3PB2A 4X22A 5G1TA 5D04C 1GG0A 5D09A 1W31A 3I68A 3PF3A 3Q37A 1EP1A 4BF9A 3S1XA 5K9CA 3ABOA 1SFLA 2CLKA 3LCWA 3P74A 3STEA 2VFGA 1FX6A 3P80A 4UNKA 3GB6A 3NM1A 4DXVA 3QEZA 1G6CA 2V81A 4UR7A 3W3OA 4UTKA 1WXJA 1W8SA 3DKJA 3W23A 2VELA 3N19B 5I3HA 4WX2A 3NVTA 2QDGA 2QF7A 1Q45A 3I65A 2TPSA 5IBXC 1KFJA 1YTEA 3QSRA 2ATMA 4LU0A 3G0SA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QSF A;  2PWF A;  4EAY A;  3U7B A;  3AIU A;  1HN1 A;  3ECQ A;  4Q4P A;  1F3T A;  4P8V A;  3KBV A;  3HJZ A;  5KIN A;  1F61 A;  2J74 A;  4C6O A;  1B3Z A;  3K1D A;  1P0B A;  2GFT A;  2V5D A;  4ZGY A;  2YJQ A;  4C7G A;  2PP1 A;  3OEX A;  1UWU A;  2DZV A;  3T0B A;  4XKY A;  3TKF A;  4IGM A;  1QI0 A;  2P0I A;  1RA0 A;  1QOX A;  3OBE A;  3GSM A;  5DRI A;  1RH9 A;  3BMX A;  3WQD A;  4RE2 A;  1PDY A;  3EMC A;  2VZS A;  1ZRQ A;  3GDM A;  2RDW A;  3THU A;  1TV2 A;  1FBA A;  3NG3 A;  2OXN A;  4HVX A;  4PMX A;  5A6J A;  2ZWY A;  3QW4 B;  1U22 A;  4P2V A;  5FSD C;  1K9D A;  1GQJ A;  3OBK A;  1C91 A;  1L6F A;  4O57 A;  2FDS A;  1UKQ A;  2INE A;  2OKO A;  4M7S A;  1IEW A;  3WK1 A;  3VGH A;  3G0X A;  3TSD A;  3VII A;  4BI5 A;  2RDT A;  2D2H A;  3N29 A;  4K8E A;  4ZTX A;  2Z7G A;  3AHV A;  3TW7 A;  1S2U A;  4W7W A;  2O56 A;  4KRT A;  5C2G A;  2Y88 A;  4WIW A;  3HZ3 A;  2GUU A;  3FOK A;  2GDU A;  4WEV X;  4FS9 A;  4M81 A;  2PZ0 A;  1OQF A;  3KTS A;  4ZO9 A;  3WX7 A;  4ZFM A;  2E6Y A;  3WD2 A;  3WK2 A;  3VAV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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