1IIHA

Structure of trypanosoma brucei brucei triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglycerate
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAIAKSGAFTGEVSLPILKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title The adaptability of the active site of trypanosomal triosephosphate isomerase as observed in the crystal structures of three different complexes.
pubmed doi rcsb
total genus 94
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2001-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1iihA00
2DZWA 3S5ZA 4X2RA 3EX6A 1YXYA 2FLIA 3G0UA 3LRKA 4JTKA 2ZRWA 3W2KA 1DHPA 3UWZA 4Q33A 2V30A 3T4CA 4M6PA 1D3GA 2WOQA 4RZ6A 1G4SA 3KX6A 2PRLA 3M1ZA 2VEPA 1T8XA 1P0KA 3C2OA 3WJWA 3PSWA 3ATYA 3UWYA 3PB0A 5CKSA 2GJLA 4HPJA 1LLZA 1TTQA 1YLVA 3NQMA 3P84A 5TQLA 4QAIA 2QDGA 1UASA 3BPWA 2G96A 4DBDA 4S2BA 1H7XA 3KVJA 4UTJA 3PS7A 1VH7A 4JTGA 5HWNA 1FWWA 2H8XA 3SR7A 4RKAA 3FFSA 4D2JA 3ZWSA 2EPHA 1SR9A 2FPYA 3MP4A 1PHQA 3TJXA 1JCLA 1Q3NA 1YTKA 2ISWA 2J88A 5U4NA 1E51A 3L65A 1MXSA 1A50A 3I7RA 3IGSA 2Z2UA 5D38A 5K4XA 2RH9A 3TQ0A 1QO5A 1OX4A 1OYBA 2J27A 2DZSA 2QKFA 4O18A 2AAMA 1TREA 1NVMA 2DU2A 2VOMA 2YSWA 5D2XA 4C1KA 2X2GA 1WBHA 3LI0A 4I9AA 3TW7A 4O14A 1EUAA 1WOBA 3GXTA 2B7NA 2VFEA 3W6YA 2GPTA 2ATSA 4BI5A 4DF2A 3C6CA 3EWXA 4UNLA 2VEIA 4N6FA 1OYAA 1WV2A 3MWAA 1AK5A 3VFLA 2OZ0A 4MJMA 5G4EA 4IUOA 4XBKA 3EB2A 2E5DA 3PB2A 5EPDA 1JQVA 3PUOA 1MEIA 4KFPA 4HSOA 5E0KA 1M7OA 4AAJA 3QYQA 4O13A 3RF9A 1EP2A 3A5FA 1PVNA 3A21A 2CFFA 4O28A 4UR7A 1H61A 4MY1A 5G2WA 3BG5A 3HGSA 1HFBA 4FNQA 2WNZA 3LI1A 2ABBA 1Q45A 1UUOA 1DJQA 1TSIA 1TQXA 2VEKA 3NL6A 3NQFA 3SSJA 3QMRA 3NXFA 1TRDA 1DL3A 3PBUA 3RK8A 2ZDRA 2QJIA 1SZEA 6TIMA 3UY8A 3IGXA 5AHFA 3G1HA 4JDYA 4FO4A 1K7FA 2WJZA 1H1ZA 4WY0B 1OHLA 4O19A 3EWBX 1Z44A 1G7UA 5FI8A 3B0VC 5L9FA 1I2PA 2EF9A 1C9DA 4FHAA 5AOUA 1B4EA 4UFJA 2BX7A 5I3JA 2W6RA 4B5NA 3W2LA 4M6VA 4HSNA 3QFEA 2D73A 3L67A 3MJYA 4ZQRA 1I2OA 4RV8A 1T96A 4UFHA 3W07A 4GWEA 5F2GA 4G1KA 1OK6A 4ZL1A 1JRBA 2V81A 5D2VA 1JCNA 3QH2A 3BGGA 3SGUA 1VLWA 1JCMP 2GVGA 2ATMA 2ISSA 4BWLA 3IGUA 4TIMA 1IF2A 2H8ZA 3OBKA 3FA5A 5DCBA 1AW2A 3O06A 3C4UA 2AGKA 1X1ZA 3O6CA 5LZLA 1JVNA 1K7EA 1WX0A 3CQ0A 2CU0A 3UXAA 1VYSX 3BLFA 1RQBA 3CWOX 4MZ1A 2WKJA 3QEZA 4JDBA 1QWGA 3TUUA 1F7BA 1MSSA 3OVQA 3VCRA 1GWJA 3E96A 5LKYA 1IXQA 1OFPA 2WV8A 3IEBA 4FNRA 2CWNA 4JNMA 2A1YA 3CPRA 4UXDA 4UTTC 1KV5A 1EPXA 4HNTA 4KKXA 4M7SA 2ZBTA 2YZRA 3LRLA 2QCLA 4BF9A 3P67A 3W23A 2VC6A 3C2FA 5D30A 1AW5A 4Y96A 3DFSA 1D9EA 1KFKA 2E6FA 2ZFAA 3ABOA 3KVMA 3W1MA 2ZZ7A 4AHQA 3IV3A 4Z1CA 2CLIA 3C2EA 4CQAA 3MBDA 4DO5A 1YTDA 1H7WA 2A7RA 4DXVA 3DKJA 4H3DA 1TPUA 3TR2A 3TSDA 4AHPA 1ML1A 1KLYA 4OV4A 3D0CA 4FF7A 1SFJA 3GR8A 2O7SA 3W7LA 1OFBA 4WZHA 4O0ZA 3KAOA 3KVLA 1XCFA 2OT1A 2Y62A 4LS2A 1ME7A 3I65A 4HHPA 1VCVA 3DFNA 5TIMA 4E38A 3BLIA 4JYDA 2B7PA 2VENA 4MZYA 3W1UA 4TO8A 2QR6A 4NJGA 1GVSA 3S5OA 4LRTA 2QAPA 3FYOA 3GDMA 1SSGA 1F6KA 4NVTA 4YWIA 1MEHA 1W31A 3C52A 3UNDA 3FLUA 4I7VA 2F7FA 1TPH1 5FESA 4L4MA 2GQAA 1UBSA 4JY9A 1H5YA 4NZJA 5D32A 3TNOA 4UTWC 2TPSA 3QMSA 3GYEA 3WK2A 3P7YA 1KA9F 1B4KA 4Z08A 3U6WA 3CTLA 3KXQA 4POCA 1O5KA 3HPXA 3O07A 3R8RA 5KZEA 3M7WA 4IMEA 5AYYA 3C0JA 2JK2A 3W7MA 5KSWA 1KFEA 3STCA 2ALDA 1FWNA 2YDAA 5KINA 3O05A 3E9AA 4XKYB 5D09A 1QFEA 5K3VA 1LRNA 1K8ZA 1P4CA 1TV5A 2TSYA 2YXGA 3GDKA 4FIRA 1EUNA 1HTIA 3DFPA 4NNAA 4N2YA 2CZEA 1LRQA 4O11A 3VE7A 3ATZA 3GR7A 2X1RA 3W1LA 3DHFA 2ZRUA 1J2WA 4CNPA 2NXGA 1L9WA 3UY7A 1GOXA 3ZFHA 4LT9A 2BTMA 5CPLA 3OVRA 4BR1A 5CZSA 1DOSA 2VELA 3A23A 5AC6A 5EBUA 1UCWA 2FIQA 2I1OA 3MHGA 1VJIA 4UFKA 1CW2A 4A29A 2NX3A 3F4WA 1KFBA 1LOQA 2A6LA 3HG3A 3M41A 4HNNA 5HR7A 2RFGA 4NT0A 3ABQA 4WQ6A 3W7QA 3CEPA 2YYTA 3GXNA 4IMFA 3MHUA 2VFHA 4Z0SA 1TTPA 5G5IA 3BG9A 3FJLA 4IPIA 2Y7EA 2ZTKA 1J4EA 1MZHA 1RD5A 3QPYA 3IVTA 4DF1A 1OJXA 4KFNA 2FFCA 5J5RA 2V2CA 2QCNA 2JKPA 1GZGA 1T0OA 3S5NA 4UTTA 3NR0A 3IIZA 1D3HA 3UPWA 1ADOA 3L5MA 5K9XA 4WX2A 1KW1A 2QDHA 4AXKA 3IVUA 1UB3A 2C18A 1QPQA 3B0PA 4HPXA 1ZENA 3N14A 5HINA 5GVJA 4IXHA 2OMAA 3I68A 3CEUA 4JICA 4O4VA 3QF0A 5LHEA 5DCDA 4EWND 4LVDA 4O1BA 1HO1A 3NQ8A 4NUWA 1YPFA 2I14A 3PG8A 3TROA 1FCBA 3G3MA 3CM4A 1RZMA 1DBTA 1W8SA 1XUZA 3HPZA 4QNEA 4UIOA 3BW3A 1GYLA 1HO4A 1TPFA 2Z0IA 2YW4A 1W56A 3B03A 1OFDA 2CW6A 3EWWA 3LERA 3RFAA 5C2XA 5AHLA 1O94A 1DKWA 2ZA2A 3P82A 2HTMA 2ZZ5A 3MI6A 4X3ZA 1U5JA 2P10A 4FEZA 3UXDA 5D05A 1ZAJA 1F5ZA 4O16A 1JCXA 2JGQA 1AG1O 4JTFA 5BMXA 2ZZ6A 3TAKA 4XTIA 1TV8A 1QNVA 4UNKA 4OQVA 3SY5A 3VI2A 5DY3A 2J9YA 1PIIA 3W7GA 3S1UA 4TU1A 2FTPA 3MBFA 3AO0A 4JTSA 3P5ZA 4IXXA 3MUXA 1XXXA 1TO3A 1GG1A 1N55A 3I7QA 2Y61A 4FX8A 4ALDA 3H53A 4LU0A 1T99A 1OFQA 3EXSA 1W3IA 2JGYA 5LNSA 2FDSA 1VRDA 1H51A 3WJSA 4BI7A 4AF0B 1Z48A 3TAOA 2XFWA 3UWQA 1LLWA 3G8EA 3TU9A 3W7HA 3M5ZA 3HB9A 3TSMA 6ALDA 1GG0A 3C56A 2G95A 3G1AA 3LX9A 5KMYA 1KM5A 2PC4A 4IPJA 3W7IA 3BG3A 1OYCA 1OX5A 3BVJA 4RX0A 3PAJA 3W7CA 4K39A 1PV8A 1NAL1 4EOUA 3NZRA 3DENA 1AW1A 2H3BA 4JXCA 3DU0A 3HGJA 4O1DA 2E6AA 3W87A 2DZPA 3G3DA 3R2GA 4ML9A 3WJXA 1XKYA 1CX9A 3TC7A 4NZFA 4WXYA 2E6DA 1UUMA 2Y88A 3CHVA 3T55A 2E5BA 1N7KA 1OFEA 1FWSA 1XBVA 1I45A 1FWTA 1OFAA 3PBWA 1Q6QA 5FEXA 2Z6IA 3HG2A 3M0ZA 4Y9AA 4CLMA 1G69A 5K2ZA 4JTJA 3KRZA 4DPQA 5AHEA 2ZRZA 3W1NA 1LORA 5DY2A 4WOZA 1GEQA 3IRDA 3N19B 4E0CA 3BLEA 1BWKA 3P74A 3QW3A 3MO7A 1EX5A 4DEFA 3W9ZA 3MP3A 4K36A 3C2RA 1F73A 3LTPA 3TFXA 3G0SA 3W83A 1WQ5A 2YYUA 1QR7A 1GTHA 5F4WA 3LBMA 3TMLA 5K9CA 3LTSA 4JTUA 2OT0A 1L6YA 5DLCA 3SIZA 3DXIA 1EP1A 3E02A 3W7JA 3N9SA 3LXAA 2ISVA 5LHFA 1XL9A 4ZQNA 3I7SA 2J6XA 3DZ1A 3CIXA 1SO4A 4JTLA 3WJYA 4O8RA 2QF7A 2FJKA 2NWRA 1Y0EA 1B3OA 3DGRA 3FKRA 1BKSA 3E12A 5KZMA 1JQXA 4JIPA 1OABA 1PCWA 3GAKA 2A5HA 4PL2A 3DFOA 3NYZA 3H54A 1W3NA 1DVJA 2GQ9A 1DJNA 1TRIA 5CZ0A 3W74A 4XZ9A 1SZNA 4N9EA 5I3FA 3S42A 1KM6A 4OT7A 4LVGA 1XI3A 4N9DA 2NX1A 3LXBA 3PSVA 4KFOA 1KFLA 3MI3A 1W5NA 3O6DA 1Q6OA 3TKFA 2V5LA 1WDWA 1QAPA 1KLZA 3C61A 2CLMA 3EX3A 5LNUA 1SZFA 1IXOA 4Y8FA 4KWVA 1QCWA 4ONVA 1GVRA 3TW6A 1VLIA 3NQCA 3NOEA 3DI0A 3L66A 2P0OA 2QAFA 3GAYA 2QUUA 3EX1A 5MHBA 1QO2A 3S0CA 1YYAA 1W5PA 2V2DA 5HNRA 2A6NA 3FEMA 3TA6A 2JKEA 2RHGA 3SI9A 2E1DA 1KM1A 3RLVA 3HQ1A 2X30A 1TPEA 4UUIA 3NGJA 1KM2A 1I8JA 4UC5A 3IIXA 2CLLA 2HSAA 1SUXA 2C1HA 3DI1A 1CI1A 3KHJA 1EEPA 1W37A 4IX0A 3T7VA 1ME8A 1XFBA 4LUJA 3W7DA 1QPOA 3G1FA 2YW3A 3GIYA 4JTHA 3P8IA 3LHTA 3CU2A 1O4UA 1WBJA 3EXRA 3H55A 4HT3A 3LHYA 4PC8A 4N9BA 1YDNA 3SZ8A 5ABTA 1LDCA 1TPC1 1A5CA 4NJJA 1P5BA 1I2QA 3W85A 1A5BA 1S5VA 2V5BA 2UV8G 5G1TA 3IVSA 1VYRA 4MJZA 1PL9A 4RK8A 3Q37A 4ZQOA 5EY5A 4Y6GA 3USBA 5K7JA 3LDVA 1G67A 4GUGA 1K7XA 1YXDA 1ZNNA 4QQ3A 4JYFA 1M7PA 4UTMA 2JBMA 5AC8A 3LBCA 3S1XA 1WXJA 3SECA 4M19A 3A24A 4FNPA 2RKXA 3W7RA 3IIPA 1HUVA 4R7JA 3CC1A 5A8GA 2A4AA 2VFDA 5I3GA 1XC4A 3BGJA 5FF7A 1JR1A 3GKFA 2XN2A 1BEUA 1IGSA 2X16A 2QCMA 2E6YA 3HG5A 2ZZ3A 4CCDA 3DH7A 3EWYA 1PS9A 3OEXA 1FQ0A 1A5SA 1HG3A 2TRSA 2A7PA 3W1RA 2RDTA 3W1XA 3QQ1A 1SO3A 4LV4A 2QCCA 3THAA 4BFAA 3QPZA 3OVPA 4W9TA 4U28A 3PF3A 4K6AA 4DELA 2NXHA 4IGHA 1GVFA 4A22A 4WY0F 4O12A 2ZTJA 3W1TA 2V82A 5CG7A 3TK7A 3W3OA 4JYEA 4ICNA 4PL1A 5AYXA 5D2TA 4JD4A 3QQ0A 1BWLA 5KITA 3W2JA 1K03A 2EHHA 1AL8A 3NL5A 3Q2DA 4NX5A 2CZFA 5TBOA 3S1WA 2B7OA 3P8JA 4MKNA 5HUPA 1RQEA 4ORIA 4TR9A 1F74A 5U7SA 3W7EA 3B0UX 1A5AA 4NU7A 5HWJA 3ABRA 2Y85A 3GLCA 5FF3A 5C6MA 4ADSA 3P80A 3W7KA 2WSQA 3ABSA 4FX7A 4RXGA 5D04C 1FXQA 3PBYA 1C29A 4JN6A 2Z1BA 3NPUA 2E77A 3L21A 5HQEA 2BLEA 2ZCGA 1EB3A 3STGA 1W5QA 3MI2A 4WUIA 2A7NA 5CGQA 3EKZA 2A21A 1H7PA 1R46A 1R2TA 3UZ5A 3NO5A 5D33A 3A5VA 4M6QA 3BW4A 1KTNA 3TFCA 5IM51 2X1TA 5LGXA 3P61A 3EX2A 1QMLA 2WO5A 1FXPA 3G1XA 3OG3A 1N8FA 2E68A 1L2UA 4MOZA 3L0GA 4R33A 4XBSA 1NEYA 1W1ZA 2NXIA 1NF0A 5AFDA 1TQJA 2OJPA 1VC4A 3NAVA 3EWZA 2VKZG 3M5YA 4PODA 3JRKA 4NJKA 3WK0A 4IMCA 4MVAA 3TE9A 4TMCA 4DQWA 3SJ3A 4AWSA 3IIOA 3CWNA 4O4WA 4AH7A 1UJPA 1PHWA 2GJNA 3GNDA 3HGRA 4P61A 2CZ5A 3EEGA 4QISA 2Y6ZA 4Y90A 3G1VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4TTG A;  3S5Z A;  3ZVH B;  2VUN A;  3K8K A;  3V5O A;  1DHP A;  1GUV A;  4OUE A;  3WML A;  1WZA A;  2V69 A;  1JG9 A;  3CXO A;  3C0L A;  1UR2 A;  4RZ6 A;  2PRL A;  3OPS A;  3C2O A;  1BYD A;  1E0X A;  3UWY A;  1QBB A;  4NRS A;  3P84 A;  2MUC A;  1NDY A;  3BPW A;  4DBD A;  1H7X A;  4JIR A;  4UTJ A;  2OGY A;  4NY2 A;  3AQU A;  3SR7 A;  4E5T A;  5LA1 A;  1JDF A;  2NQ9 A;  3ZWS A;  1BD0 A;  3CIV A;  4GKT A;  4IIB A;  1I6N A;  1PHQ A;  3TJX A;  1YTK A;  3ZYZ A;  5U4N A;  4HMN A;  2WBK A;  4LGX A;  1EOM A;  1DWJ M;  3IGS A;  3CWH A;  4EXQ A;  4A35 A;  4ZR8 A;  1NVM A;  2VOM A;  3MPG A;  1JPI A;  2DW6 A;  4HOX A;  2PF0 A;  3TW7 A;  3GXT A;  1V77 A;  3W53 A;  4J4K A;  3VDH A;  1AQH A;  4UNL A;  2BVT A;  1OYA A;  1O66 A;  3H7U A;  1UKP A;  4XBK A;  1UYQ A;  3PB2 A;  5EPD A;  2GFT A;  3IGH X;  1UJQ A;  4KFP A;  1WXZ A;  4IFR A;  2V38 A;  3EWC A;  2PGW A;  1X97 A;  4GIN A;  4JHM A;  4UR7 A;  4BZY A;  3BG5 A;  1JI2 A;  1HFB A;  1E1F A;  4J40 A;  4PYS A;  3LI1 A;  4JN7 A;  1IWP A;  2PAJ A;  1UUO A;  1DJQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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