1ILYA

Solution structure of ribosomal protein l18 of thermus thermophilus
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
90
structure length
90
Chain Sequence
RLRLSVFRSLKHIYAQIIDDEKGVTLVSASSLALKLKGNKTEVARQVGRALAEKALALGIKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Rna binding protein
molecule keywords RIBOSOMAL PROTEIN L18
publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Thermus thermophilus reveals a conserved RNA-binding fold.
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 18
structure length 90
sequence length 90
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ilyA00
4UY8O 3CC7N 1JJ2M 1Q86O 3CC2N 1VQ4N 4IO9L 3CMAN 2OTLN 1M90O 1K9MO 3CPWM 2ZJRL 1M1KO 3CC4N 3I56N 5JVGL 4IOAL 1YI2N 3CCQN 2ZJPL 1VQ7N 1VQ5N 4WFAL 3I55N 1K8AO 5HL7L 1VQNN 4IOCL 3CCSN 3CCLN 1QVGM 5GAHP 5GADP 1ILYA 3PIOL 5DM6L 2ZJQL 3OW2M 2QEXN 1VQLN 1VQ6N 3CCUN 1Q81O 3CCMN 4WF9L 1YHQN 2QA4N 5H1SQ 1VQPN 2OTJN 5MLCQ 1YIJN 5GAEP 3CCEN 3DLLL 1NJIO 4WFBL 1YITN 4WFNL 3G71N 3CMEN 3CCRN 1W2BM 1KC8O 3CCJN 1Q82O 5DM7L 1VQON 1S72N 3CD6N 3G6EN 5JVHL 5GAGP 1VQMN 3CXCM 1VQ9N 1YJNN 3CF5L 1YJWN 1KD1O 3G4SN 1VQKN 3CCVN 3PIPL 1N8RO 1QVFM 3J7ZO 1K73O 1OVYA 1Q7YO 4U67L 4WCEL 1VQ8N 1KQSM 1YJ9N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NKCA 1YAGA 1RILA 2D0BA 3AO1A 5AFUH 5C0YA 3LP0A 4H0OA 4C23A 1TYQB 4IOXA 1TK0A 3QERA 2YJEA 3VQBA 4G9ZA 5AQXA 3I8BA 2HHUA 4E3SA 1BA1A 4IO9L 1Y97A 1UWBA 5TKYA 4BGAA 3DWLA 1HNXK 1NJXA 1RT1A 5HL7L 4FLYA 1JCGA 3HJFA 4OGCA 4BR7A 4YFUA 3DM2A 1OH5A 4B3OA 4KAZA 4X62K 3KLFA 1GLFO 2BE2A 4AH9A 3ZETB 5GIPA 3DXMB 1UAXA 3OYGA 3TAFA 1J5EK 3SJHA 3L2QA 3JAMO 3WXKA 4I9LA 3IMXA 3QEVA 3THYA 1WB9A 5BPMA 1NMNA 3DRPA 4DCHA 2Z1GA 4IFEA 1BCOA 3FFIA 1RFQA 3TAMA 3CCEN 4DMNA 3TANA 2D0OA 3AV9A 5BR8K 4JS5A 3O9SA 1VSEA 1YITN 4MDBA 5J2NA 3A8YA 4BY9C 1W2BM 5EXWA 2LSNA 1TYQA 3QO9A 1QTMA 4JI6K 1BL3A 3VEVA 4GY2B 2HHTA 3VETA 4J2EA 3LDQA 4I9QA 3NVKA 4B3RK 1C1BA 2ZM6K 4BDZA 5F1XA 1TKZA 4JKCA 4EP4A 2W40A 2KTQA 4JV5K 4OKJA 3SQ2A 1GLJO 5E26A 2GWKA 5AZIB 4H5WA 3VESA 2QXLA 4WCEL 4KTWA 3TABA 1VQ8N 4BRFA 5KQ8A 2QWPA 3C6UA 3OYMA 1DTQA 2VGMA 4HVJA 2P5GA 2E6MA 4B1ZA 4DFJA 3TTCA 3O4WA 1NJWA 3QNNA 4DKWA 4H03B 3OYIA 1C6VA 1TUYA 2P9KB 4B8AB 1Q86O 2NRZA 2QWLA 4DTSA 1RBTA 5HRNA 3CFRA 1Q18A 4X64K 3KKSA 4YOWA 1J5OA 4W5NA 2WFBA 4Y1CA 1DEJA 2VWJA 3U3GA 3PX0A 4IFVA 4H5RA 2O4IA 3OBYA 2W6KA 4GKJK 2ZJPL 4IEIA 2NZTA 3F5TA 3D7EO 1K8AO 1C0MA 4BRLA 3G10A 3CCSN 2OPRA 3HTVA 4CEOA 4FJ5A 4CFBA 3PSFA 1HQUA 4CZLA 4BWJA 1RTHA 3ENOA 1E3MA 2ZQBA 2P9PB 4BREA 5B8HA 1NK8A 4B9TA 5AFUA 5AQQA 1XHZA 1NGDA 5BR9A 5AQVA 4CJSA 4JKFA 5H1SQ 4UQGA 1KFDA 3HO1A 3T1HK 2XY8A 4CF0A 1IG9A 1YIJN 5F2RA 4YY3K 1WN7A 3QINA 3RVCA 2UXCK 5JLFA 4H4OA 3IUCA 4JYAK 4A57A 4J2BA 3LANA 1RDWX 3VGMA 1HR0K 2FSKA 4CBUA 4A59A 5J1EA 3OYBA 3MN9A 4OKEA 1B9DA 5AQPA 3CCJN 3KZBA 3H6EA 4CJTA 4E89A 3CJBA 2ZE2A 2DPNA 4DQSA 5EU7A 5AQJA 4KI6A 3SAFA 1JXBA 4DLGA 1HPZA 2QM1A 4ICLA 3AAPA 4BG9A 4KHWA 2O8EA 3VMFB 1Z6RA 2OANA 3B8AX 4CJ7A 2D5RA 3C95A 2YV0X 1YVNA 1GOAA 4DUYK 4DSFA 3KLGA 4ILJA 3SQ4A 4CZFA 5FPEA 3ID8A 4M7XA 4OKKA 3NGZA 2NNWA 1CZAN 5KPZA 4KTQA 1TL3A 3VF6A 1RDAA 3SZ2A 1T03A 2OPPA 4C8LA 1UOCA 3CC7N 1A5WA 4CD1A 3MAQA 3SAHA 1VQ4N 1FW6A 2VG6A 1HNIA 5JICA 4BG8A 1V4TA 2F7TA 5CYMA 1RTDA 4FM0A 3S3OA 3CPWM 1WSHA 2OCEA 3ZSZA 1ZXOA 4CHZA 4LFCK 5ADXH 3HVTA 1BDGA 3VEXA 3OJUA 1MWMA 2KZMA 4FWKA 4BRKA 3QIOA 1BI4A 1LOTB 4JKHA 1KVCA 1SV5A 4FO0A 3AVAA 4O5BA 5GADP 3UB5A 1OKJA 3T69A 3C7NA 3ZX2A 4JD2B 1NK9A 1MU2A 2WONA 1HNZK 1I94K 1J6ZA 3TSQA 2O8BB 2PFUA 2Z1JA 3KWIA 3QMLA 4H4MA 1WNSA 5LJWA 4JS4A 3AVKA 3EL2A 5LMUK 4PQUA 1DGKN 1S6QA 3NDKA 3TTDA 1DT9A 4GMJB 3RR8A 2A5XA 4FW1A 4DHYA 4N76A 2G8IA 3SPZA 4LF4K 4RG8A 4O8UA 1IKVA 4WFNL 1L3SA 4M3WA 3GG4A 3HOTA 1JLGA 4B9MA 3AVCA 1G15A 4KHQA 4BDYA 4NCGA 2H3GX 2G8WA 3O5BA 1RT5A 4XH1A 3VQ8A 5E41A 1QQCA 1HNVA 3VTIA 1U04A 3LDOA 2ETJA 2BDPA 2NRRA 2P51A 2XY5A 4CFAA 5DK5A 5M1KA 3LAKA 4JI2K 3I0SA 1Q8IA 1SZ2A 4X66K 5EX5A 4J2DA 1B9FA 4DV1K 3NF6A 4DFKA 1Z25A 4F8RA 4V19S 3WQTA 2QI2A 4EFHA 2V7ZA 3KTQA 3MWTA 3D2EA 4X65K 4HTLA 2NRTA 2IAJA 2O8BA 3WNGA 2HHWA 3VQDA 1NMDA 1ZBFA 4YORA 4EHTA 4R5PA 1U6ZA 3DI6A 3WXIA 1X9JA 4GVEA 2PYJA 2AP1A 4H0VB 3A5NC 1D9DA 3J80O 4DTOA 3MCPA 2O8CA 1W0HA 1BU6O 1OVQA 1FK9A 4HUGA 1ASVA 1P90A 5BRDA 1FXXA 1IBMK 2VGNA 3ITHA 2G8VA 4PHTX 3U8XA 5AZJA 1U49A 3OW2M 4FYDA 4DSKA 5AQZA 2D0PA 1W9HA 4BRDA 1U2VA 4WF9L 3HRGA 3T7ZA 1CZBA 1RBRA 5D3GA 1QHTA 4CJWA 5GIOA 2AJQA 3OYKA 3R6MA 1TK5A 2VQEK 1FKOA 5ADXA 4A5BA 3S3MA 3SV4A 1HJRA 2IVPA 4EAHD 1XUPO 3G71N 3L8BA 3CCRN 5CY4A 1T44A 1VK0A 3BDPA 1ATRA 2G8UA 3VA3A 1GOBA 4CHQA 4M63C 2KQ2A 2YKMA 4YOUA 5AQSA 4CD3A 5GAGP 3MXMA 4E7LA 1KTQA 4C1NK 2ZGZA 3ULEB 1Z05A 5C12A 2GBZA 5KPRA 3D6RA 4FW2A 4DS5A 3T19A 4BGBA 2KLAA 4CHOA 1QVFM 1ASWA 4OLBA 1JL2A 1T6DA 3LP3A 3TAPA 2P9LB 2GUPA 4NYNA 2HF3A 1BCMA 5AQGA 1Q9XA 1T7PA 5EOYA 4CJLA 4FLWA 4LFAK 4CHPA 2P9NA 1RDBA 1EETA 3PUFA 2KFZA 4CZKA 1BHLA 4CEBA 3THVA 2HHQA 1RT6A 4RCHA 2NRXA 4I6MB 2UUAK 3L4IA 5HOOA 3VQ5A 1M1KO 3I8DA 1D9FA 4CBXA 4IOAL 3VPZA 2KKZA 3L6QA 4H8KA 4B9VA 4WQ5A 4FJMA 3EO3A 3V6DA 1VQ7N 3LALA 3MK6A 2JWKA 4E1MA 4E19A 4K25A 3AVMA 3BEXA 1IJJA 2GWJA 4FL9A 3P83D 2YHYA 4ISGA 3U4LA 5KPTA 4ELVA 4FJJA 4N56A 3ZX0A 1WAFA 1Z26A 1HQEA 2ZJQL 2IDOA 4IJNA 2FXUA 3D0PA 2YKNA 4MDAA 3OS0A 4WE1A 2QEXN 1KVBA 1TVRA 1BWFO 3E66A 1Q81O 4M3YA 5KQDA 4B1XB 1WBDA 2GV9A 4CZIA 4CJRA 1VQPN 3HPHA 4K8ZA 4BR5A 3R3LA 5KGWA 4NYFA 2YHXA 1HPMA 5EY4A 4RW7A 3T3FA 1NK5A 2YHAA 1ATNA 4IEEA 4F9OA 5C10A 1L3TA 3V9SA 1X1PA 4GV9A 3AGRA 3WUHA 3KKRA 4DSIA 4HCCA 4Z4FA 4Z94A 1S1UA 2KW4A 4K43A 2JWLA 3F9KA 4BR0A 4CIGA 4DQ8A 4LF9K 5HROA 1VQON 3AO5A 3DMJA 1JL1A 3MXIA 3G6EN 3L3VA 1A5XA 2ZGYA 1RNHA 3HBTA 5HP1A 4KH4A 4DF8A 2VWKA 2I5JA 3HXMA 3G4SN 1KSPA 3J7ZO 1K73O 2W6LA 1BUPA 1R59O 4DR6K 4JN4A 1IBKK 3SUPA 4FWPA 3HSCA 3ZT3A 3CIPA 4LC9B 4AM6A 1VRUA 5IWAK 3CM6A 3VQ7A 1R0AA 4FJKA 4PY5A 3ATVA 3TAQA 4M7YA 4DTNA 4GVMA 1SS6A 1WSFA 1HKBA 2HBMA 3DLGA 5FRNA 3QNOA 2WC9A 5F0XA 5HRSA 2GELA 3THYB 3C6AA 2AA4A 3MN5A 1VSDA 3V81A 3DOLA 2IVOA 2CGKA 4DV5K 5JVGL 1NGGA 1I39A 4NB4A 3TI0A 3KLIA 3NGIA 4ILGB 1CXQA 1KRPA 1DKGD 3P39A 1KLNA 1HX1A 3DLBA 1NGHA 4CJFA 4RTFD 4M3UA 4HTUA 4I2PA 3LWMA 4KHYA 3IAYA 1ASUA 3SAGA 3U9DA 1BA0A 2FSJA 3TAGA 1IKXA 4N41A 2PZSA 3GE1A 1WSGA 3IG1A 3AA3A 4BC5A 4E7HA 1EX4A 3DLHA 4CGDA 3SJJA 4B1VA 4FLTA 3L2UA 4FLXA 3RMBA 4DR1K 3EEQA 1KAXA 1JLQA 1LAWA 5JS1A 1E4FT 3LZJA 3EN9A 3GBTA 3M8PA 1NJZA 5BPLA 5CHIA 1UA0A 3NMUA 2ZWHA 3A2FA 3V1RA 3NH1A 3DLRA 4E1NA 4PUOA 4J2AA 3Q7CA 2G8FA 3RSEA 4FPAA 3C0BA 3O9UA 4FCYA 3F9MA 2ZF5O 1NBWA 3HOSA 3QBXA 3FR0A 4FJ8A 4O5FA 4PKHA 3W3DA 4IDKA 3HK2A 3EY1A 4XIUA 4CF1A 2RF2A 4DTPA 4MO5A 5M1QA 1ZBIA 1OH6A 4BE2A 1QHAA 1BIUA 3SUOA 3A0IX 4OJRA 4C8MA 5JMVA 5BN8A 1SL2A 3AVHA 3AO4A 4IJAA 3CM5A 3ZSQA 3RMAA 3SNNA 2ATQA 4CF9A 3MECA 3EE8A 2A1RA 4BRGA 5KGXA 3H46O 3EE9A 2QK9A 4B9SA 2A3ZA 2Q2RA 1NG9A 4DQPA 2UXDK 2YCHA 1LCUA 1YXQA 5HLFA 1VSHA 3CC4N 4FVUA 3DXKB 3AO2A 4C8NA 1QSLA 1D4XA 3M8RA 3QBWA 1HNWK 1EWRA 1JLBA 3H1VX 1S1VA 3V1QA 4CGFA 1OH8A 4Z4EA 4DR7K 2Q36A 2YX6A 3T1AA 2YHBA 3ZT1A 4FLZA 3ZSXA 2RN2A 1VSMA 4GV3A 4KH6A 4FWLA 1N33K 4O0IA 2Q3SA 4DSLA 3AVJA 5C42A 4BWMA 2O8EB 3C6TA 4FXDA 3C6HA 1NOZA 3KK2A 3AARA 3VQ9A 3CQ8A 1GLAG 3VGLA 4AHSA 4YOTA 1GLDG 4H5TA 3DLLL 3O6WA 4RW4A 3L2VA 4M3XA 2XO7A 4CESA 3SQ0A 4L8RB 2UUBK 1SL1A 4DUZK 3MEEA 3PX4A 1NOYA 1ATSA 2I7PA 3ZT2A 3OYJA 4CEQA 1X3MA 1BO5O 4FWQA 2OZMA 4ID5A 4BACA 3HYFA 3OYLA 5HBMA 4JI3K 4F2SA 4B9LA 2IS3A 4CJ4A 2NLXA 5KRTA 3LP2A 1VSJA 2P9IB 1RT2A 3BF3A 3AVNA 3DXKA 3CCVN 2BANA 3V9UA 3U9ZA 1MDUB 3ENHA 3H08A 1N8RO 4PKGA 3WNEA 4Q5VA 1K6YA 3RWUA 3GL1A 4JK9A 4DSJA 2Q0UA 3O3HA 2WTUA 3R8EA 4AHTA 1CZ9A 1BI4B 4B9QA 3NHGA 4A62A 3NF9A 3FZLA 4JI4K 1E4GT 3AO3A 3FLCO 3M1FA 3QEIA 3C7NB 4W5TA 4CEAA 5AQFA 3WQUA 4ISEA 2Q31A 4CGHA 3SMSA 3N4QA 2O4GA 4DTRA 4CFCA 4LH4A 5I9EB 2YI1A 1TK8A 5FLXO 4W5OA 2CH5A 4BC4A 1K9MO 3K5OA 3PY8A 3JXUA 1VHXA 1HLUA 1EO1A 4PKIA 5CR4A 3I56N 3GOIA 2KZZA 1NK4A 3SV3A 1S1WA 1HMVA 2E8AA 2GX9A 4LD0A 4KV8A 3CJ1A 4F3OA 4FJ9A 3QEPA 4CJ3A 3E9LA 4B3SK 4O0JA 3BGRA 4WQ5C 2ASOA 3PO5A 3K9JA 4KRFA 4OX9K 1L3UA 3KLHA 2V51B 2P9IA 1N34K 1X9SA 2JGUA 1LV5A 5AJ3K 2Z1IA 4OGEA 4IKFA 4CJEA 3VEZA 1XNQK 2X6NA 4FZYA 1BG3A 2FBXA 3LDSA 3OA9A 3OTOK 1EXQA 5M1OA 4IDHA 4LF5K 4DU3A 5AQWA 1REVA 2GUIA 3LM2A 3VA0A 3D2EB 3NE6A 3S3NA 1RCHA 3O4QA 4FK0A 3AA2A 1J53A 4LF6K 5ELZA 3LL3A 1XQSC 3IDHA 2BUPA 4W5QA 2KHOA 3ZEUA 3BZKA 5BPNA 2O8CB 1HJOA 1JLFA 3AVBA 4EP5A 4QS8A 5AQYA 4CHNA 2D1KA 4BQLA 3OYDA 4CHYA 4BR2A 3VN5A 4ELTA 2F8SA 2GTDA 2V7YA 4BRQA 4DQIA 3ISNC 5AZJB 1BGXT 3SUNA 2A42A 3L2RA 4EIAA 1NJYA 2RE2A 4CEDA 2F96A 3CJ9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NKC A;  1YAG A;  1RIL A;  2D0B A;  3AO1 A;  5AFU H;  5C0Y A;  3LP0 A;  4H0O A;  4C23 A;  1TYQ B;  4IOX A;  1TK0 A;  3QER A;  2YJE A;  3VQB A;  4G9Z A;  5AQX A;  3I8B A;  2HHU A;  4E3S A;  1BA1 A;  4IO9 L;  1Y97 A;  1UWB A;  5TKY A;  4BGA A;  3DWL A;  1HNX K;  1NJX A;  1RT1 A;  5HL7 L;  4FLY A;  1JCG A;  3HJF A;  4OGC A;  4BR7 A;  4YFU A;  3DM2 A;  1OH5 A;  4B3O A;  4KAZ A;  4X62 K;  3KLF A;  1GLF O;  2BE2 A;  4AH9 A;  3ZET B;  5GIP A;  3DXM B;  1UAX A;  3OYG A;  3TAF A;  1J5E K;  3SJH A;  3L2Q A;  3JAM O;  3WXK A;  4I9L A;  3IMX A;  3QEV A;  3THY A;  1WB9 A;  5BPM A;  1NMN A;  3DRP A;  4DCH A;  2Z1G A;  4IFE A;  1BCO A;  3FFI A;  1RFQ A;  3TAM A;  3CCE N;  4DMN A;  3TAN A;  2D0O A;  3AV9 A;  5BR8 K;  4JS5 A;  3O9S A;  1VSE A;  1YIT N;  4MDB A;  5J2N A;  3A8Y A;  4BY9 C;  1W2B M;  5EXW A;  2LSN A;  1TYQ A;  3QO9 A;  1QTM A;  4JI6 K;  1BL3 A;  3VEV A;  4GY2 B;  2HHT A;  3VET A;  4J2E A;  3LDQ A;  4I9Q A;  3NVK A;  4B3R K;  1C1B A;  2ZM6 K;  4BDZ A;  5F1X A;  1TKZ A;  4JKC A;  4EP4 A;  2W40 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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