The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Carbonmonoxy-Haemoglobin at 1.25 A Resolution
rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-09-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y4Q A; 1DO7 A; 1K1K B; 1XXT B; 2ZT0 A; 112M A; 3GQP B; 106M A; 2ZT3 A; 2M6Z A; 2PEG A; 1O1J A; 1V4U B; 2G0Z A; 3WTG B; 4N7P B; 4FWX A; 1MNO A; 3EU1 B; 2V1J A; 1VXD A; 3G46 A; 5E6E A; 1X46 A; 1YCB A; 1HSY A; 1BZ0 A; 1MYM A; 5D5R A; 4MPM A; 1JDO A; 3NL7 A; 5E29 A; 2MGE A; 1MYF A; 1FAW A; 3MVC A; 2HCO B; 1VWT A; 1WMU A; 1FSL A; 1YEO A; 2G0R A; 5CHQ A; 5D1V A; 2ZSY A; 3MKB A; 4TWV A; 1MTK A; 1RVW A; 4N7O A; 6HBW B; 1CH7 A; 1O1N B; 4ZVA A; 1K1K A; 1GZX B; 3GKT A; 1XXT A; 3LQD B; 1Y85 A; 2FRF A; 3G52 A; 3S65 B; 2W72 C; 3UHU A; 1YIE B; 5KDQ B; 2FAL A; 2PGH B; 3WTG A; 3GK9 A; 2Z8A A; 3IC2 A; 3OZU A; 3WCW C; 1CBM A; 1LHS A; 1HDA B; 1A01 A; 1PBX B; 2W72 B; 1WVP A; 1MYT A; 5AZR A; 3D7O B; 3QJB A; 3AT5 B; 3AQ9 A; 1A9W E; 2D5X B; 1SDL B; 1HBH B; 3PT8 B; 1BZ1 B; 1Y4G A; 2HCO A; 1YEU A; 2MGL A; 2ZT2 A; 1BUW A; 2D5Z A; 1MNK A; 3ZH0 A; 1LFV B; 1LFL B; 1YVT B; 5F0B A; 1DXT B; 1O1N A; 5CN8 A; 1G0A B; 1GZX A; 3LQD A; 4UUR A; 3S65 A; 1YIE A; 1H97 A; 1HLM A; 2PGH A; 4U8U C; 1Y4V B; 1EW6 A; 2R1H A; 1HGC A; 1VXF A; 1A6G A; 2O5M X; 3QJE A; 1HDA A; 3ZJP A; 1PBX A; 2D2M C; 2W72 A; 2SPL A; 5HLU A; 3TLD A; 1HV4 B; 3WFT A; 4U8U B; 1NWN A; 3WCW A; 3A59 A; 1NQP B; 1SDL A; 1HBH A; 3PT8 A; 1Y7D B; 2D2M B; 1LFQ A; 3WR1 B; 1LFV A; 2W6Y A; 3WFX A; 2G12 A; 1LJW B; 2ZS0 D; 3NG6 B; 1V4W A; 2MGC A; 2G0V A; 3BOM B; 1NZ2 A; 1G0A A; 1QI8 B; 3NMM A; 1MWD A; 1DWS A; 1HBB B; 4IRO B; 1B86 B; 4UZV A; 1MNJ A; 2MGF A; 3D17 A; 2LH7 A; 1NS6 B; 1F5P A; 2FAM A; 1C7C B; 2ZFO C; 3ARL A; 2HBE B; 3OO4 B; 4U8U A; 3UHD A; 2HHB A; 3D1A B; 3G4R A; 1BVC A; 1NQP A; 1THB B; 1Y7D A; 1HAC A; 1MLR A; 5HY8 A; 2D2M A; 2ZFO B; 2O5B X; 3WCW D; 1JZM A; 1OFK A; 1LJW A; 1SWM A; 2IN4 A; 4F6B A; 1Y4B B; 3NG6 A; 1Y4F A; 2MHB B; 2NX0 A; 3MN0 A; 1FLP A; 1OUT B; 1DM1 A; 1QI8 A; 1R1Y B; 1HBB A; 1BIJ B; 4WCH D; 3ZJL A; 1O1P B; 1B86 A; 2GKM A; 3EOK B; 3HYU B; 3PEL B; 1HJT A; 1YMB A; 2ZFB B; 5B85 A; 1CIK A; 3P5Q B; 1O1K B; 4UIQ A; 3O89 A; 1Y7C B; 1YZI B; 1NGK A; 1GDL A; 1NS6 A; 1CH3 A; 1ECD A; 1HHO B; 2HBG A; 3IXF A; 1Y0T B; 1BVD A; 1MOC A; 1G09 B; 1YH9 B; 5CNC A; 1Y8K B; 3OO4 A; 3UHB A; 1THB A; 1LH7 A; 4JYQ A; 4MQJ B; 1QSH B; 2ZFO A; 3WCU C; 1JZL A; 1DKE B; 2GNV A; 2R80 B; 3VRG B; 1X3K A; 1MYH A; 1COH B; 1R1Y A; 1TU9 A; 1BZ6 A; 1A6M A; 2MGB A; 3WCU B; 1O1P A; 5IKS A; 1J41 A; 3EOK A; 3PEL A; 1MOD A; 2VEB A; 2ZFB A; 3P5Q A; 1O1K A; 1Y7C A; 1YZI A; 1A0Z B; 1ABW A; 3RJN B; 1HHO A; 3NML A; 3FS4 B; 3ED9 A; 5JDO E; 5E83 B; 1LH1 A; 3PI4 A; 3G4U A; 3K8B B; 1G09 A; 1YH9 A; 6HBI A; 1XZ5 B; 1Y8K A; 2EKU A; 5EV5 A; 1C7D A; 2GKN A; 1MYJ A; 1JP8 A; 1YEQ B; 4MQJ A; 1QSH A; 1M6M A; 1GCV B; 1YGD A; 1CG8 A; 3A5A A; 1NWI A; 3HEP A; 5ILE A; 1J7Y A; 1UMO A; 3WCU A; 1NEJ A; 3K3U A; 5F2A A; 2ZSS A; 3QQR A; 1EMY A; 4XDI A; 3OO5 B; 1U7S A; 2DN2 B; 3GQG B; 1LH3 A; 5JOM A; 1K0Y A; 2ZLU B; 3FS4 A; 2MGI A; 5E83 A; 1CQ2 A; 1GBU A; 102M A; 1ITH A; 1MYI A; 1RSE A; 1XZ5 A; 1GVH A; 2ZT1 A; 4MQG A; 3UHK A; 5CNG A; 1HRM A; 5HBI A; 1YEQ A; 1UIW B; 5JDO D; 1MLF A; 1UC3 A; 3LHB A; 4ILZ A; 3DHT A; 3WI8 A; 1MGN A; 3O7N A; 3IC0 B; 4HSW A; 1EBC A; 4OF9 A; 1CIO A; 3GOU A; 1JY7 B; 2LH1 A; 3LB1 A; 3UI0 A; 1YHR B; 3WCP B; 4MQK B; 1HAB B; 2ZSP A; 1X9F C; 4XS0 B; 101M A; 1XZ7 B; 3D4X B; 1KR7 A; 2LH5 A; 2ZLU A; 1FSX B; 5C6E B; 3UHI A; 2QSS B; 3B75 B; 1DTM A; 4F6G A; 1CLS A; 2D2N D; 3DR9 A; 1HBA B; 3BJ1 B; 1J40 A; 1Y46 B; 1X9F B; 1FN3 B; 1J3F A; 3ZJO A; 4PQ6 A; 2DN1 B; 2AA1 B; 3MJU B; 2MGD A; 2ZLT A; 4ROL B; 2QSP A; 2O5S X; 1YHU D; 2AUR A; 3VRF B; 4JAC A; 1JY7 A; 4NI1 B; 1YHR A; 2MYC A; 4SDH A; 3WCP A; 4MQK A; 1BBB B; 1HAB A; 5HLQ A; 5AZQ A; 1DXU B; 5B84 A; 1S0H B; 1XZ7 A; 3UHR A; 5C6E A; 1DXV A; 3B75 A; 3WCV C; 103M A; 1YIH B; 2O58 X; 1DO3 A; 2OIF A; 1YFF A; 2MGM A; 3KUN A; 1S61 A; 1SPE A; 2Z6S A; 4G51 A; 1X9F A; 1WLA A; 3ZJM A; 1HBI A; 1YE2 A; 3ZJI A; 5JGG B; 3WCV B; 4YU3 A; 3AQ6 A; 4ROL A; 1Y7G A; 1IRD B; 2HBF A; 1V75 B; 1HGA B; 1URV A; 3VRF A; 4DC7 A; 1Y5K A; 1YMC A; 3U3E A; 3FH9 B; 2AV3 A; 4YU4 B; 1JEB B; 1A4F B; 4NI1 A; 1J52 A; 3MYN A; 1MZ0 A; 1S0H A; 3LR7 A; 2WTG A; 1ECO A; 2D6C A; 1YIH A; 1GDI A; 1F5O A; 3DHR B; 5EE4 C; 3GKV B; 5HAV A; 1Y5F A; 2HHE B; 1SHR B; 2GRF A; 3QM5 A; 3W4U B; 1IT2 A; 1MBS A; 3WCV A; 3ECX A; 3VRE B; 1IRD A; 5KER B; 1HGA A; 2D60 B; 3S1J A; 2GTL D; 1GDK A; 3EDA A; 3S66 A; 3FH9 A; 3BJ3 B; 4HRT B; 4GZG A; 5HU6 A; 4YU4 A; 3TM3 A; 2HBS B; 1JP6 A; 2YRS B; 4OOD A; 2MYB A; 1CG5 B; 1UVX A; 1CBL A; 4AVD A; 1HBS B; 2ZLV B; 1BIN A; 4O2G A; 2ZS1 C; 2HBC B; 3QJC A; 2VHB A; 4FH6 A; 1Y4R A; 3PI3 A; 1YEV A; 1SDK B; 1JF3 A; 4MAX A; 3WFW A; 1NS9 B; 3G4W A; 2H8D B; 3G53 A; 1V4X B; 3H57 A; 3ZJR A; 2HHE A; 1OR6 A; 3HHB B; 1JF4 A; 2ZS1 B; 3A9M A; 1A0U B; 3VRE A; 1DXC A; 3GQP A; 3CY5 B; 5CNB A; 3SDH A; 5KER A; 2D60 A; 1V4U A; 4NK2 A; 4N7P A; 2EVK A; 1LHT A; 4HRT A; 3QMA A; 1H1X A; 1MLQ A; 1RQA B; 2ZWJ A; 2HBS A; 1G0B B; 3UBC A; 3EU1 A; 2JHO A; 2NSS A; 2H35 B; 3UH5 A; 1CH9 A; 2VLX A; 3UHV A; 4HRR B; 1Y0W B; 1DO1 A; 3NFE B; 3E55 A; 3PI8 B; 1GLI B; 1MWB A; 1C40 B; 3QM9 A; 1NZ4 A; 1LTW A; 3UGY A; 2ZS1 A; 1VRF A; 4H0B A; 6HBW A; 3HEN A; 1O1O B; 1A0U A; 3ECZ A; 2DXM B; 1Y4P B; 1YEN B; 3CY5 A; 2G0X A; 2B7H B; 2V1I A; 5KDQ A; 1FHJ B; 1G0B A; 3UHT A; 1XYE B; 2NSR A; 3MOU A; 2VYY A; 3QM7 A; 3A5G A; 1Y8H B; 1YG5 B; 3S48 C; 2H35 A; 1DLW A; 1A3N B; 4HRR A; 3MJP B; 3D7O A; 3UHX A; 1Y0W A; 3AT5 A; 3NFE A; 2D5X A; 1T1N B; 3QJD B; 2Z85 A; 1G08 B; 3PI8 A; 1GLI A; 3GYS B; 1BZ1 A; 2V1E A; 2MGA A; 3UHZ A; 3ODQ B; 1LFL A; 3UHQ A; 1YVT A; 111M A; 1NPF A; 3WFU A; 1DXT A; 2DXM A; 1PMB A; 1RPS B; 1Y8I B; 1XZV B; 2R4X A; 1Y4V A; 4N7N B; 109M A; 1LH6 A; 2GLN A; 4TYX A; 3BJ2 B; 1MLJ A; 1SPG B; 1Y2Z B; 1Y8H A; 4FWY A; 3WCT C; 1Y0D B; 1A3N A; 1HV4 A; 1NPG A; 3MJP A; 3PI2 A; 4FH7 A; 1Y83 B; 2XYK A; 1OBM A; 3DUT B; 2LH2 A; 2MGJ A; 5AB8 A; 1DTI A; 3WCT B; 3WR1 A; 4NXC A; 3ODQ A; 1MLK A; 3HEO A; 4N7O B; 2EF2 A; 3BOM A; 3UH3 A; 2ZST A; 2W6V B; 5ILM A; 2HZ2 A; 4LPI A; 1RPS A; 1Y8I A; 1VXA A; 4IRO A; 1XZV A; 1OUU B; 4L7Y B; 4O4Z A; 1DLY A; 1GBV B; 1C7C A; 1FCS A; 1Y0D A; 3V2Z A; 2QFK A; 2HBE A; 1YVQ B; 5ILP A; 2GNW A; 3D1A A; 3UHY A; 1Y83 A; 2MYE A; 1RTE A; 3PI9 B; 4H07 A; 4AVE A; 2VM0 A; 4U8U D; 3DUT A; 2MGK A; 4FWZ A; 1YCA A; 1A3O B; 3QQQ A; 3WCT A; 4B4Y A; 1KD2 B; 1QXD B; 4ZVB A; 1Y4B A; 2D2M D; 2BLI A; 2MHB A; 1AJG A; 1OUT A; 1ABS A; 4N8T B; 2MYA A; 1OR4 A; 1Y0C B; 1BIJ A; 2H8F B; 1UVY A; 108M A; 2W6X A; 4MBA A; 1MBN A; 1OUU A; 4L7Y A; 3HYU A; 1GBV A; 3M38 A; 3ZJJ A; 104M A; 1VXH A; 2QU0 B; 1MBI A; 2QMB B; 1QSI B; 1Y0T A; 3LB4 A; 3R5I B; 3SDN A; 4NS2 A; 4G1B A; 5C6Y A; 4B3W A; 1FDH G; 1N9X A; 1VXC A; 1MYG A; 4HSX A; 1Y8W B; 2ZSX A; 2EKT A; 4F6D A; 2AUO A; 1DKE A; 1QXD A; 2R80 A; 3VRG A; 3CIU B; 2ZFO D; 2Z6T A; 1URY A; 4F4O B; 1COH A; 4NXA A; 1MBA A; 1Y0C A; 3OK5 A; 2H8F A; 1LFY B; 4NI0 B; 5CN5 A; 2C0K A; 3KMF C; 5CNE A; 1A0Z A; 2MB5 A; 3ZJH A; 1W92 A; 2G14 A; 4L2M A; 5HLX A; 3R5I A; 3K8B A; 1CP5 A; 1AJ9 B; 3PIA B; 5KKK A; 2FRJ X; 3HF4 B; 1MNI A; 3HRW B; 4MQC B; 3UGZ A; 3D1K B; 1Y8W A; 2QLS B; 1YHE B; 1LUE A; 1CMY B; 2XKI A; 4MQH B; 1XZU B; 1GCV A; 1KFR A; 3CIU A; 3S1I A; 1Y22 B; 4MU5 A; 2NRL A; 1CP0 A; 4O1T A; 4F4O A; 2ZLX B; 107M A; 4MXL A; 1LFY A; 4NI0 A; 4MBN A; 1VRE A; 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1HLB A; 1X9F D; 1UX9 A; 1R1X A; 2FRK X; 3OZV A; 1OFJ A; 1V75 A; 1VWT B; 1YDZ B; 1WMU B; 1YEO B; 2Z6N B; 5CN9 A; 1S69 A; 3MKB B; 1C7B A; 2ZSQ A; 1JEB A; 1A4F A; 5EUI B; 2AV0 A; 2G10 A; 1Z8U B; 1BZR A; 1J7S B; 1HBR B; 1Y85 B; 3SZK A; 3UBV A; 1IDR A; 1MBC A; 1S5X B; 1MLL A; 1GDJ A; 1NXF A; 3IC2 B; 5CN4 A; 4F6I A; 3DHR A; 1A01 B; 2ZS0 C; 3GKV A; 1YOI A; 1CPW A; 1SHR A; 3IA3 B; 1AJH A; 3W4U A; 3V2V A; 3QJB B; 1JZK A; 2OH8 A; 2RAO A; 2HZ1 A; 3HC9 A; 2BNL A; 1Y4G B; 3ZHW A; 1YEU B; 2ZS0 B; 1BUW B; 2D5Z B; 1YDZ A; 3UHG A; 3WCV D; 2Z6N A; 1RTX A; 3BJ3 A; 2GRZ A; 4KMV A; 5EUI A; 3UH7 A; 2YRS A; 1CG5 A; 1MOH A; 1MYZ A; 3AG0 A; 1VHB A; 1J7S A; 1HBR A; 1HBS A; 2ZLV A; 2R4W A; 1J3Z B; 1S5X A; 2MYD A; 5CNF A; 2HBC A; 4TWU A; 2LH6 A; 1U7R A; 2R1H B; 1HGC B; 1SDK A; 3AQ5 A; 2HZ3 A; 1NS9 A; 3QJE B; 2H8D A; 1V4X A; 2VYW A; 4ODC B; 3HHB A; 2SPN A; 3A0G B; 5EYS A; 2V1H A; 4NK1 A; 1BJE A; 4KJT A; 1EBT A; 2SPO A; 4H2L B; 3WCW B; 3A59 B; 1A9W A; 2ZS0 A; 1LFQ B; 3ONZ B; 1M9P B; 3GQR B; 2CMM A; 1RQA A; 4F6F A; 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