1ISXA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with xylotriose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 168
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1isxA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1isxA02
4IY8A 3VT1A 1BPLB 1E71M 3I3EA 3LPFA 3BAXA 4GZEA 1JT5A 2AFGA 2D0FA 3WF4A 3OLIA 4AD4A 4JQ0A 4XFUA 1C91A 3TONA 4U31A 3WH5A 3W25A 4HA4A 1RMLA 4DM1A 1WD4A 1TWMA 1VFUA 3KZSA 3POKA 3VD3A 1HJUA 4KRUA 1H2JA 5C71A 1VFMA 1V6VA 4AD2A 4KRTA 3WFZA 1YYNA 1EHAA 5A6KA 2E8YA 5LA1A 4IONA 3VGGA 3MUZ1 3LPGA 1QOXA 3FJHA 5A2AA 2XWDA 4H04A 2WHMA 1VEPA 1KBBA 4UR9A 3W6MA 3A3HA 3VDHA 1LL4A 1QI5A 2CIPA 3WFLA 3VX1A 1TVNA 5BROA 3BB2A 2J7BA 3FJDA 3THDA 1GOQA 1PAMA 2AAAA 2VOTA 1R85A 1V3HA 2DT1A 4MJ4A 4D6JA 3V0BB 1UZ4A 4NRSA 1BVNP 3ZC8A 2DSWA 1K9FA 1OB0A 1V0NA 1H09A 1C8QA 4WSJA 1Q03A 4UQAA 5F90A 1Z0HA 8I1BA 5A6AA 1XV8A 4Z2GA 4OIFA 2ESCA 4PEEA 2WCGA 3K1XA 2TAAA 3WDIA 5FL1A 3KWXA 2WKLA 3CH9A 5HPOA 3T0AA 1R87A 1EXPA 1NWTA 2YOCA 2UY4A 3GZAA 3ZMRA 1EPWA 3POHA 3M46A 1L2HA 1PZ3A 2E9MA 3NSMA 1W2PA 4JCLA 2CBUA 1HIBA 1XH1A 4AIOA 2YDRA 1ZJBA 3WDHA 4HTYA 5A8OA 1CNVA 3L4WA 21BIA 1VAHA 4I4YA 2NZ9A 2ZUMA 3AHYA 2BHUA 3PZGA 1CIUA 3K4DA 2E4TA 4XB3A 4J2YA 3L4VA 1OWQA 2WC7A 3ZIZA 3O5WB 1B3VA 2IXUA 2YDQA 2NTDA 5GAQA 2WRYA 1E6NA 4PTWA 1BHGA 4L4OA 1DWHM 1UA7A 1JI2A 1EQPA 3ARWA 1CGTA 2AOSA 3OLDA 2XVLA 3I2AA 4QBVA 2Y9WC 4I6IA 1GNXA 1ODZA 3WUEA 2VNCA 3VMPA 4DCKC 3RTJB 4X3AA 4TTUA 3VKKA 1W9VA 3FUQA 5FZYA 3HU7A 1H4PA 3FNDA 4QAWA 1PZZA 4D6HA 1VFFA 41BIA 2DSKA 2V5CA 3RIKA 4GP3A 3AH1A 6A3HA 3SCWA 4I4SA 3PZVA 4JKXB 2A3AA 1LL7A 3VU2A 5BRPA 3BAUA 2XFYA 1H1NA 1B3XA 3ARZA 3CQAA 1LJYA 3II1A 4MDPA 4HU0A 3VD9A 2D24A 5A6BD 2XM2A 1PX3A 4Z2KA 4YHEA 4P0JA 4H8VA 1J9YA 4PRWA 1SZ6B 2XSBA 3MUAA 4CCDA 4E4PA 1GGPB 1J0SA 4OEGA 4F83A 3KL5A 2BXYA 3ARTA 2GSJA 3ZT5A 1G01A 1DZDA 4TOQA 2ZX8A 1IV8A 3OLEA 2EEXA 1TTUA 1LL6A 31BIA 4J27A 2DREA 1JIBA 2QPUA 1SR0A 1EO7A 4MNLA 3H6RB 3PUBA 4CD6A 4A7KA 4EB2B 1HJXA 2ZX5A 3O44A 1S0BA 2YBUA 1E6ZA 6TAAA 2Y4SA 4OEFA 1KQZA 4NRRA 3AHXA 3CZKA 3VSFA 4DWSD 1SMAA 3VUPA 4FLSA 1C92A 2WK2A 4AZBA 1BVZA 3TTSA 4P7LA 2J25A 4NI3A 1WZMA 4J3UA 3SCVA 2HWMA 3WO2A 3IM6A 1MXGA 3UR8A 2MLLB 3O4AA 2V3DA 1R8OA 4EE9A 5FCZA 1E43A 3A07A 2WVTA 2A3EA 3ECQA 5IFPA 4CD4A 4TVUA 1RH9A 3VDCA 2XFFA 4FMVA 1UWQA 4P6AA 1X1NA 1Q6EA 4RE4A 3WEMA 3ARPA 4UZSA 4M24A 1XGZA 2Q9XA 1PZ2A 2DQXA 1E56A 4LPCA 5HPZA 2WXDM 4L4HA 5JMCA 4LO3A 4UOZA 1W3KA 1KXHA 2XIBA 4JFSA 4PTMA 1D2KA 2UY2A 1UH2A 5CQ1A 2VZTA 3AMLA 5HXMA 1KBKA 1ITXA 1AF9A 1BAGA 1JD9A 4J2XA 3RM8A 1BFBA 3EMQA 1QBBA 4PMDA 2DDXA 4J3XA 2JE8A 4FLQA 1ZBVA 4S3JA 4UQEA 3VGEA 2O9RA 4FF5A 3T0BA 4CKQA 1EGZA 4ZA3B 4WK9A 5A2BA 3SCRA 4PTVA 4AWEA 3T2PA 3OBRA 4CD7A 4ZBVB 1UOKA 3BC9A 3UCQA 1BYCA 3I2XA 1XYFA 2NYYA 2YL6A 3VT2A 3AZTA 4W5UA 3AJ7A 4BQ5A 1FP8A 1E6QM 3A6OA 5M5DA 5E0CA 5FKYA 4J23B 4QDMA 1BGGA 4FLOA 3VNYA 3AMGA 4M80A 2D7IA 2D3LA 3SCNA 1H41A 3FJAA 1H3GA 3KEHA 1OD8A 1OIMA 1VJZA 2EXOA 3PZIA 2J7HA 3PHZA 1K9TA 2CBVA 1FGAA 5FNWA 1RPKA 3ALFA 4V27A 5CJ5A 3N12A 4DUVA 4DENA 3A4XA 1B30A 1CXHA 1K9EA 3A23A 3AIVA 3MUIA 1W1VA 4W7WA 3OIHA 3O3QA 2EPMX 5CZKA 7CGTA 2VZVA 1WBCA 3WUBA 1UH3A 1WNOA 3HJEA 1VF8A 2O92A 3ZO9A 5EMYA 2WCSA 2OWXA 3RJYA 4D8HA 3BA4A 1BQCA 1WCGA 4UOJA 4R6UB 4AW7A 2IHOA 1LQ0A 1DFCA 1ESWA 1G0CA 4BQ3A 3V0AA 3T0DA 1GHRA 3DHPA 4PUEA 1CZ1A 2OWWA 4GO8A 1JXJA 4BQ2A 1JZ7A 1BGAA 3PZNA 3GBEA 4GINA 4DEPA 3U5YA 1XC6A 1YBIA 3VIGA 1JT7A 3AIWA 3V79C 2YL8A 2Y24A 3G6MA 4PC4A 4LX4A 1LG1A 3IM7A 2ERMA 4LQ1A 3JUTA 1B1YA 3VGFA 4B3KA 1I75A 3R4SA 2GO2A 1HP4A 2J75A 3S6TA 3D5HA 1GCYA 3AYSA 4HA1A 4ZFUB 4PSRA 4XZBA 1W9BM 3BH4A 2CCRA 3W6LA 1UD4A 3WQ4A 3VPLA 3ARYA 1MC9A 3EYPA 3AJ5A 3VOCA 4H7VA 3S8JA 3CUFA 4MPKA 5CLWA 1B0IA 1IOBA 1YHTA 1TOOA 6I1BA 1JF5A 1FFRA 1QNSA 1QHOA 3P6IA 2QPSA 5AYIA 3UJ4A 4RE2A 3PMEA 3E8LC 3ARQA 1UD6A 2YLLA 3ZSSA 7I1BA 1TE1A 2EJ1A 1DQOA 4I4XA 3AHZA 2J77A 4I0YA 3WINA 3CZ8A 3AS3A 4PMUA 1DIWA 4U2ZA 2XSAA 3IAPA 3SCQA 1MFUA 1W9DM 1Q6DA 4GO9A 1F31A 1TIEA 2E9BA 4TX8A 3VM5A 3OGFA 2QN4A 2ZQOA 3ZC9A 4QFUA 3WQVA 4RE3A 1UPSA 4HMDA 1HL8A 3WF3A 5A6JA 3WH7A 3EMZA 1GORA 3ZR6A 5CLTA 1RP8A 3CUIA 3MMWA 5AC4A 2G3NA 1JZ3A 2Z1KA 4J28A 5EFFA 1XH2A 5E0FA 3N18A 1U30A 3QR5A 3AMCA 4OUEA 1NWUA 1V6UA 3BAVA 4ZKTB 9ILBA 2WZHA 4XKIA 3SUVA 3W37A 1W1PA 4QKRA 4TX6A 1M16A 1UHVA 3APGA 3L4XA 1UKQA 3B8SA 2F2FC 2C8NA 2WWDA 2GZBA 3FJFA 3M07A 1MYRA 2OYMA 4M8UA 5EFDA 5ECUA 2HWAA 4R27A 4UQBA 1WB0A 1MWOA 2XG9A 4MNMA 2EQDA 4ACYA 1PWAA 1CGVA 1KXVA 4U2YA 1JZ8A 4Z8SB 1IZJA 4GI9A 3FUOA 2ZOXA 3TTYA 3HSMA 3P53A 5A8NA 2PI6A 4F9DA 2ESUA 3QOMA 1HJWA 1KQYA 1QXMA 3EBVA 1MQRA 4PN2A 4AEFA 1B3ZA 2ZX9A 4B9YA 2VMFA 4W8BA 5E6YA 4GAFA 1KGUA 1VENA 1UWSA 5HBFA 1NQ6A 3BADA 1PPIA 2R9KB 2Y9GA 2CNCA 1PIFA 4XZWA 1CGYA 3AJ6A 1HWPB 1RP9A 3MANA 5M17A 1QHPA 4W86A 3GBDA 5A69A 3W82A 3HN1A 2EO7A 1OT2A 1FWVA 5D9PA 5HOSA 1XRVA 3B9AA 3EDEA 2G3IA 2PC8A 3PTKA 3T8SA 5F7UA 2VCBA 3MSGA 2W5FA 1IRPA 1OGGA 3UESA 1E6XM 2VVNA 1OCQA 4M81A 4U5IA 5D63A 2BVDA 1CXLA 1TP0A 4AIEA 1MFVA 4ISRA 4W87A 3O6AA 4TLPA 1S0DA 2A3BA 2FHBA 4A4AA 4QCFA 4P7RA 1XZZA 3JUGA 2VVSA 1J12A 2A3CA 3VILA 1R7AA 2PWFA 1Q04A 4WKHA 3ZSTA 1RD6A 2ZWZA 4MNKA 4IZEA 1V0MA 3GTNA 3W81A 1ONKB 4UQCA 3OA5A 2KLLA 2F2FA 1CE7B 1GQLA 1XSIA 4W8LA 2G8ZA 4A3YA 3SUWA 2J7FA 2HZ9A 4QKSA 2WHLA 1CXIA 4QCEA 3SNVA 1HXJA 1XHBA 4ZFWB 2G41A 1DQGA 4GI6A 4ZOTA 2ZWYA 1WD3A 1NARA 2XGIA 4NF7A 3WNMA 3IM5A 1JQZA 5IHSA 1TVPA 1NOFA 2GDUA 1SFSA 1EH9A 1V3KA 4PCSA 5E9AA 6CGTA 3SEPA 1KWKA 4LYRA 2J3PA 2HVMA 3HN3A 3UD7A 4IYBA 3OZPA 3BRFA 2VRQA 3V0AB 2E0PA 1FN0A 4NZCA 1EYLA 2KI6B 3HALA 1II4A 1E70M 2WZIA 1CXFA 1WP6A 3OG2A 5IHRA 3PTMA 3WSUA 4LO1A 1FH8A 1X6NA 1I1EA 4JFTA 3CA1A 4XX6A 1AQHA 1EOMA 4D6CA 5G00A 2L5XA 3SCOA 5IFTA 2K43A 1GPFA 1DHKA 1W1TA 3R4UA 3AH2A 3PZOA 5BCAA 4EKXB 1G5AA 3WIJA 1G1YA 1UA3A 4M29A 1AVAC 4ATLA 5DF0A 2Z48A 1JNEA 2FDMA 4X38A 4JKKA 1TR1A 2RSTA 2Z1SA 3WF2A 3GH4A 3VMNA 1AFCA 3AZSA 1R8LA 1WZKA 4BF7A 3W24A 2DH3A 2AMGA 4L4IA 3UDAA 3AYRA 3CPUA 4ZEPA 3WNNA 2J7GA 3WN6A 1H5VA 1BASA 4B16A 3HMYA 1IT0A 4UOQA 4MJ2A 5A3HA 3UG4A 1W3FA 3UD9A 1R86A 4J3SA 1FHLA 1GHSA 4Q7NA 4HOZA 4F8XA 3BAHA 4X0NA 1FV2A 3C9ZA 2ZIDA 3I3BA 1UWTA 3O4CA 4TTGA 3O4OA 4JFUA 4HOXA 1K5VA 4D6DA 4G6MA 1GQJA 5CPSA 1ODUA 1UWRA 1UKOA 4G9MA 3WA1A 5D9MA 3BAJA 2J74A 5EHAA 1ZB5A 2J7EA 4P0LA 2Q8XA 2WKGA 3GXDA 4CN1A 4Q9PA 1JG9A 2XVNA 1DWAM 3RCNA 3U7VA 2A3HA 1UR0A 1FHDA 4NSBA 4TVDA 4JFVA 3FJIA 4G6JA 3ZT6A 3DYMA 3NIYA 4P7QA 2ZXBA 3POCA 4P7NA 4P8UA 3PTQA 1XD0A 4EANA 4U3AA 4YPJA 5BOWA 3WBEA 1AQ0A 1BTCA 1V0KA 3NBCA 4GZJA 3N15A 3RO8A 1OSEA 1QI4A 3T08A 3OGVA 5JLVA 1E0OA 3W27A 3IANA 1N82A 3WMSA 1GVIA 4PMRA 4CU6A 2BY1A 1ITBA 3OBTA 5I5RA 1JI1A 1KCLA 2WMHA 2VL4A 1T4QA 4BA0A 4Z9WB 5I79A 4TXEA 1R8NA 1V02E 3ARSA 3ZM8A 1AVAA 1B31A 1FH9A 3CZGA 3MS8A 1ZJAA 5LA2A 1W32A 2DPEA 1UR1A 1C3FA 3AMDA 2NP0A 3BX1C 4AZ7A 1OT1A 2ZICA 3WUGA 2DS0A 4LO3C 5I3DA 1QVBA 2CHOA 4HPGA 1UD2A 3N11A 2BFGA 1LG2A 4WF7A 1RG8A 4U3CA 3AROA 1NWSA 3TP4A 2P39A 3GXIA 3KL0A 1GQIA 4HZ7A 3UG5A 4I4QA 4J2SA 1JYWA 4JP0A 1NOUA 2XVKA 3CZJA 4C7DA 1G9DA 4FLRA 4CVUA 2DT0A 4LO0C 2BY2A 1ABRB 2RGMA 3EDJA 4UFIA 5CXPA 1OD0A 3PG0A 3VIOA 2J7CA 2CITA 4OKDA 4W5ZA 4PTXA 3BAYA 3IAGC 3NDYA 1JL8A 2PWHA 3H6QA 1W3JA 1J01A 1KGWA 3VD4A 3FJEA 3OGGA 1VJSA 1A3HA 1E1FA 2QMJA 4HMCA 5LA0A 2XUCA 3NBDA 4ZLBB 2C0HA 2WB5A 1GOKA 3WMBA 5I24A 3MV11 3IAQA 2NW0A 3VNZA 4E2OA 2X8RA 2UWFA 1L0PA 3VD7A 4QALA 1E4IA 3O4BA 1V3MA 1JZ5A 3AOFA 4F9JA 1QI2A 4DWSC 1S0LA 5GNYA 2D20A 5ABFA 4X0VA 2PWEA 3CBWA 4OEEA 1CDGA 2JALA 3K8LA 4UZUA 3LPOA 3NJ5A 3PBGA 1VEMA 2VX4A 4CD8A 2WPGA 4OW4A 2YA1A 3KL3A 5DT5A 1EA9C 1KGXA 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