1IT0A

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with lactose
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 161
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1it0A01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1it0A02
1JZ3A 1QQKA 5A8OA 3I29B 4TLPA 2JEPA 4II0A 3FN9A 6CGTA 3WH8A 2JIWA 4DM2A 4H7VA 4Z2HA 4JFUA 4ZFWB 3SCVA 3QHNA 4LO1A 4ZE4A 2ZR1B 3TA9A 2WMGA 3W29A 4TVUA 1SFSA 4D72A 3MS8A 2F2FA 3ARPA 1Q1UA 3A23A 4IZXA 1K6AA 2CBJA 1SYTA 4MNMA 2BY0A 4L4PA 2ZE0A 1HJXA 4GI8A 1UPSA 3C9ZA 1WBAA 1WDSA 1UKOA 3R4SA 4JFTA 2NSXA 1US2A 3OLIA 1W2PA 1LWHA 3KL5A 1QNSA 3BA5A 2OLHA 1KQZA 1B31A 4I3NA 4KGJA 3SUVA 1JZ8A 3V0BA 4Z9WB 2J8FA 1GVYA 3CAHA 1W9BM 3GM8A 3AZRA 3WD3A 3A3HA 2D1ZA 4ISRA 2MLLB 4U2ZA 3AFBA 1W9XA 2XSBA 1FHLA 4ZGRB 2E4TA 3CU1B 3P6JA 2OSXA 5B2HA 4AZBA 1B2YA 1DWIM 2WHJA 4CVWA 1XSIA 2V3DA 2WBGA 1GOWA 1HN1A 1V0KA 1FMMS 1JTCA 2WYSA 1ODZA 3K1DA 5HBFA 5ABEA 2BEAA 5CPQA 3IJ7A 1VF8A 5D61A 1M04A 3NBEA 1JT4A 3FJ8A 5JMCA 3L4XA 3VINA 3I3BA 2QMJA 2FH6A 3B9EA 1MFVA 4I1BA 4Z2KA 3K46A 3BA7A 4XB3A 3K1XA 4D8HA 1Q6EA 5CXPA 1CEOA 2AMGA 3E8LC 1BFFA 4J2KA 1O7AA 3ARXA 5BXSA 2IXUA 4MJ4A 4UFLA 3U5YA 3VTRA 2VSEA 4X39A 2WVTA 2O9OA 1DTUA 3FJHA 3BGAA 4EK7A 4OZOA 6A3HA 1W3HA 1Q4NX 3VNYA 2UY3A 4OEGA 2WLZA 1H3GA 1W3JA 1BGGA 3LPOA 3MV11 4ZENA 5EFDA 3WQ5A 1VFUA 1OT2A 3PTQA 1DWHM 1JYXA 1HL8A 1XH0A 4P7OA 1G9AA 4EKXB 3NSXA 1C7SA 3AIBA 1G0CA 1JY0A 3AH2A 4LO2A 2AOSA 2JF7A 3NIYA 4JZ5A 2PWHA 1JIBA 1EO7A 3WN6A 3GH7A 2XTKA 3WF2A 1KWKA 2FHFA 5GNZA 2DEPA 1E1EA 1BQCA 1XGZA 1E55A 2PF0A 1ZJBA 5JIWA 4BF7A 2BVYA 1UD5A 2DSVA 2A3HA 3OA5A 1WO2A 5EFFA 1GORA 3W0KA 1KGWA 1VFFA 1BARA 3MPPG 4HZ6A 4R6UB 3HU7A 4OBRA 3IANA 2MIBA 1VIWA 5GPRA 5AC5A 1GQKA 1Q6DA 3HSMA 3WNNA 1UOKA 1HWNB 3S8KA 1BVNP 5JLVA 1UKPA 1WDRA 3TTOA 1NP0A 5C8BB 2NP0A 4TTUA 2GJRA 4ZFMA 3WKZA 4BS0A 2XVNA 4F9DA 3A6OA 4IM4A 4AZ5A 1CYGA 1FH9A 2HWMA 3BAIA 2NM1A 3EYPA 3ZJ7A 4PMZA 4J27A 3ZSTA 1QNRA 1TR1A 1BASA 3PG0A 4GPNA 3T09A 2VZUA 2JEQA 5DMYA 2E9LA 1Z32X 1HJSA 1CPUA 4D6HA 2CESA 3OG2A 1BYBA 2F61A 1AXMA 3ZR6A 1DQGA 3MU7A 4AZCB 1EDGA 5G00A 2J25A 2JF6A 1EH9A 41BIA 2ZX7A 2CCRA 3N1AA 4HOZA 1HKIA 4ATLA 3BCFA 1WDQA 4AW7A 4F66A 2BEBA 1EDQA 2ZXAA 2E3ZA 1UD4A 2ZUUA 4LO3A 4MNKA 2VCBA 3ZM8A 1G9DA 3PTKA 4CN1A 1NWTA 3ZT5A 3GXIA 4MB4A 1HIZA 3WIJA 3ALGA 4NZCA 3AS3A 31BIA 3O9NA 1XV8A 1BYAA 1C8XA 1KWGA 5A95A 2XVLA 4WKFA 2WNWA 4AZ7A 3A4WA 4DCKC 1E6PA 5A6SA 1M03A 1CGXA 1C91A 3BSHA 4UOQA 3G6MA 1UKTA 3BAUA 1TOOA 4JKKA 3IK2A 1ISZA 1KQYA 3THCA 3ILAA 4U3AA 3FJ9A 5CGMA 1H0IA 5BROA 2WVUA 4JRAA 1CGVA 2KI4A 1MXDA 2WMIA 3VPLA 1VEMA 4U31A 2WCGA 4LO1C 5KEZA 1HKNA 2YA0A 1E3ZA 4LO0A 1KGUA 3NDZA 4JCMA 1JYVA 2F2FC 1HKJA 4UQCA 1J0JA 4QFUA 1V6UA 2XGIA 4JL2A 3AJ6A 1ESWA 1ISXA 1JAEA 1KCLA 1CWYA 3V0BB 3B9AA 3AZSA 1R8OA 1MW1A 4CJMA 3WF1A 2VCCA 1ISWA 1W3GA 4GI9A 3BRDA 3FJEA 1OQLB 1E3XA 4E2OA 3AZVA 3L4TA 3PZVA 1TWEA 4CUCA 2VR5A 1CVSA 1HVQA 3VD9A 1HJVA 3AKGA 4JPZA 1BGAA 4PYSA 2J74A 4J3VA 1HJUA 3VD7A 4AIUA 2VZTA 4UQ9A 4Z2JA 2DPEA 4UFIA 1C8QA 1GW1A 4H8UA 4W87A 2ZX6A 4X0NA 2QLYA 1K9EA 1OWQA 3PN8A 5GAQA 5LA0A 4QD2B 4IPLA 1E73M 1KGXA 1GQJA 1GHSA 3CHFA 3EDJA 4I6IA 2YJQA 3FJJA 4LPCA 1XCWA 3ZOAA 2G3NA 1ZU8A 4QD2C 2X1IA 3ZIZA 1LG1A 3U57A 1QHPA 2OSYA 2VL4A 1E6NA 4YHGA 1Q04A 3H6RA 3QOKA 4P8VA 5DO8A 3VMPA 4AIOA 3OZPA 2Y8KA 2EPMX 1QHZA 4KMQA 1H0GA 4D1JA 2GDVA 3FJAA 1B90A 1HJQA 1OSEA 3VUPA 3N7LA 3AIVA 1G5AA 1WP6A 2QV4A 1J18A 4OIFA 2QPUA 3MMDA 4EANA 3A4AA 3CRHA 1LLOA 1MQRA 4I4OA 4QALA 3KWXA 4MDOA 2D7IA 3POKA 3ZT6A 2GZBA 3I3DA 1VFMA 3IJ9A 1R86A 1GONA 4AD0A 3N04A 4I4PA 1GJUA 4H41A 3WH9A 4AYSA 4W8AA 1O6IA 2A3EA 1ITCA 4AD4A 1IRAX 2Z1SA 1RMLA 1PX3A 4I96A 1ISVA 2JFEX 1Z4SA 4D6DA 2W5FA 1CTNA 1EXPA 1OINA 3W28A 1AVAA 2YDRA 3WF3A 3O4DA 2WC4A 5I77A 2YL5A 3ZXDA 2CNCA 2PBOA 4Q7NA 2D43A 4CU7A 3AROA 4OWKA 3ZX7A 3VMOA 1QI4A 1Q03A 4JHZA 4PMRA 4AMCA 3SUWA 3RCNA 3IJ8A 1UD8A 3CA3A 3CZLA 5AYIA 5HXMA 3VSFA 4W85A 1V6WA 4USPA 3CRGA 1HWPB 2FGLA 2WMKA 4UQBA 2WMJA 3T2PA 1QVBA 5DEZA 1W9PA 1W91A 1JAKA 3O4CA 1VENA 4GP0A 5BXPA 1PZ2A 3AYSA 4W84A 2NW0A 1NOWA 4CD8A 4ISQA 4KEIA 3PZIA 4A7ZA 2WWCA 3EMQA 4BQ4A 1J0KA 3SUUA 3FJKA 5ECUA 2VVSA 1BFCA 5A6LA 4D6FA 2XIIA 1OGSA 4P0KA 2D0HA 5I5RA 3ARQA 3VM7A 3AS1A 3ARWA 3LLPA 3VGHA 2DIJA 2D20A 2FGZA 2YBUA 1KCKA 3VOCA 1A3HA 3WNLA 5E70A 3KZSA 2RSTA 4FVVA 3VIHA 3M46A 4OWJA 1FV3A 2Z49A 2VNCA 4GOYA 4M82A 2VLCA 5A8QA 2ZOXA 1AF9A 3FAWA 3R4UA 4BZYA 2XOAA 3VIKA 1GOOA 1MW2A 3EDKA 3OB8A 5C70A 1WCGA 1OB0A 4OWLA 3CMJA 4KRUA 1NOFA 4K68A 3H6QA 1JT3A 4J3SA 4HR6C 2CKRA 4HU0A 3UD7A 3EBVA 3K8LA 3SCWA 2VXRA 3WDJA 1GCYA 2B31A 3WFZA 1HJWA 1ZL1A 3EDDA 4ZEPA 3CLWA 5A1AA 1U30A 3IM5A 4A4AA 5F8YA 3P6IA 1PX4A 1EPWA 2HW9A 4KRTA 3MUAA 2DRZA 2EBNA 5CPSA 1E0XA 4W5ZA 5GNXA 1JF5A 4LO0C 3VIOA 4PCSA 3ZR5A 3NSMA 2VQUA 3IAGC 3PZUA 2OYKA 4CCEA 2FGFA 1R8LA 1KNMA 4G9NA 3CH9A 2PWGA 4JHOA 1QI5A 3CUFA 2HVMA 4Z8SB 4XV0A 4EFQA 3FJFA 1VFOA 4B15A 3CHEA 2EEXA 4L4IA 1Q6GA 2Z1KA 2M49A 1HCDA 5HDRA 4H9WA 1IHKA 1PJ9A 3RIKA 1MYRA 2GK1A 1XD1A 1XSKA 4PMDA 3LMYA 3FXYA 5AY7A 3VGDA 1UZ1A 1JDDA 3FW6A 4W8BA 1UR9A 1W3AA 1XG6A 4HPGA 5I23A 3VSZA 1D3CA 1XYFA 1R87A 5D8ZA 3RTIB 1FOBA 3CA1A 1UH3A 4DM1A 2J3PA 4LYPA 1E0VA 5A6KA 1ITBA 5IFPA 2ZX5A 3N18A 4ZXLA 1D2KA 1R8NA 1W9DM 1QXMA 1MC9A 3DECA 3H6RB 1ZBKA 4IPNB 2J7FA 1W3KA 2YA2A 3ZQ9A 3SUSA 3N15A 2YA1A 2G3JA 4LO7B 5I1BA 3AXHA 3AHVA 3CZKA 4QO3A 5GNYA 4HA4A 4LO7C 4OUEA 1VEPA 8A3HA 8CGTA 3THDA 1JF6A 3L2MA 1LJYA 1JZ7A 2VR4A 3WNMA 3S8JA 4WSJA 5DSSB 1ISYA 5DF0A 3Q7YA 1GPFA 1B30A 5CGTA 4JKMA 3U7BA 4MNLA 1JD9A 1UZ4A 4W7UA 2VCAA 4GKLA 4MNJA 4M24A 4QAWA 3Q7XA 2BY3A 4PMYA 1CXFA 4UFHA 1WDPA 3D5HA 4CD6A 3MUIA 1GVIA 1S0GA 3FFZA 3WQ8A 1UKSA 4TVCA 3PBGA 4B3KA 2Y9FA 3WQ6A 1ECEA 1C90A 3CZGA 2VUAA 3AZTA 4I1EA 1TUXA 1AVAC 2WANA 4HMCA 1FGAA 2NT0A 4J28A 2WZEA 3L4ZA 3CBWA 4QDMA 1NWSA 1UWIA 4LYQA 3QR5A 4P0JA 4PEEA 1JNEA 1ZJAA 2QF8A 3GBDA 4CN4A 3IAQA 2DSUA 3W81A 3ZSSA 1H1NA 2DREA 3VD4A 2Q3NB 4MADA 2W63A 4PSRA 3WY1A 4RE4A 2CITA 4U5KA 3RM4A 4AD5A 5JIPA 4CD4A 1UWSA 2VX4A 1B9ZA 3PZNA 5D8WA 3B8SA 4UOJA 2J62A 2Y5EA 1XHBA 1K9FA 3MO4A 1DWAM 2VZVA 1AMYA 2VRKA 2UY2A 4PC4A 2WHKA 3I2XA 5E0FA 2VMFA 2FHCA 1DWJM 3V79C 4I4UA 3CA5A 3W6LA 1JI2A 2ESCA 3OJVA 2WXDM 1QI3A 4ZKTB 5CJ5A 3WL0A 1PC8B 1N82A 1ZBCA 3S2CA 3U7VA 2XWEA 3BA4A 1E6RA 2E4MA 1R85A 4B16A 2E9MA 4MTVA 3AOFA 3AISA 1D7FA 4FLSA 5A8NA 3BAJA 2F2HA 4W7WA 3WDQA 1NH6A 2NT1A 1NUNA 3GNRA 1HF6A 4W5UA 3MSDA 5HPOA 1LL6A 2GJXA 3D7WB 4MPKA 1MQQA 5EBAA 1FA2A 4V28A 3WH5A 4ZXOA 4HU8A 4D6JA 2EXOA 1V3MA 3FHQA 5DFAA 2G8ZA 1HNYA 3BAWA 4N0RA 2BHYA 2E40A 3QHMA 5HNNA 4PMQA 1CXHA 3CIVA 5A6BA 2AXMA 1EGZA 3OLDA 5I79A 1E4NA 1CGTA 2W61A 3AH4A 2CBIA 1H49A 3VDCA 3VDBA 3J7HA 1E40A 3FGMA 3GYCA 4ZFYB 3A21A 4IISA 1PZZA 4QKRA 1K9TA 1QQLA 1FV2A 4USOA 4JAWA 1BFGA 1RPKA 4HOXA 3N11A 2GK1B 1M53A 2X2YA 2XFFA 3AMCA 1AQHA 4QBVA 2X09A 4MB1A 1JLYA 2J75A 3VDAA 4I4YA 5E24E 3W82A 1ZS2A 3LTQA 3POHA 1YQ2A 3CUGA 2WCSA 4PSPA 1B0IA 2ZWYA 4FMVA 3WSUA 3NBCA 3SCUA 1HL9A 4Q9GA 4J3XA 3PUBA 1KR1A 5CQ1A 2WVVA 3EF2A 2CHNA 2FHBA 3N0KA 4P8WA 5HPZA 3O4OA 1DZCA 3AMKA 3W38A 3LPGA 1JG9A 1UHVA 1IT0A 3SCSA 4ZBVB 4EKJA 3UEQA 2LIEA 4AZHA 4BQ5A 1VJSA 2ZX9A 2XJ7A 2XIBA 4PMXA 2IWTB 1AVUA 4G9MA 3RTJB 1E9LA 1UG6A 1WE5A 2CBVA 4GOVA 1DJSB 4GQQA 1Q6CA 2W4XA 1UWQA 1I1EA 3SCQA 4FLOA 1BF2A 1L2HA 1R7AA 2ZUWA 1VCLA 2DSZA 3BC9A 4M8UA 2J77A 5CSUA 3VGBA 1SMDA 1K9DA 3T2OA 1BG9A 1UR1A 2BS9A 4IUGA 4C7FA 4WF7A 2YBTA 3TTQA 3NBDA 1B1YA 1A8DA 2XGBA 4RE3A 3TTYA 2D3LA 3RILA 1W32A 4UQDA 3W6MA 4P7NA 3HMCA 3ALFA 4W88A 1VAHA 1VBRA 3BMVA 4AEFA 3VEQA 1EYLA 2R9KB 2Y8VA 4MJ2A 1KB3A 3AXXA 3SCOA 2VJXA 2VTFA 1JD7A 4NSBA 4XFTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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