The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
74
|
structure length |
74
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Chain Sequence |
GSSGSSGVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSESGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| molecule keywords |
Intersectin 2
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| publication title |
Solution structure of the second SH3 domain of human intersectin 2 (KIAA1256)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
74
|
| sequence length |
74
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-02-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VA7 A; 4Z8A A; 1SEM A; 2JT4 A; 2DL3 A; 1GL5 A; 4GBQ A; 2DLP A; 1AWX A; 2LX7 A; 3EG2 A; 2ED0 A; 1K9A A; 2KT8 A; 2P4R A; 2W0Z A; 1RUW A; 2YDL A; 2FO0 A; 2HDA A; 1WX6 A; 1W1F A; 1VYT A; 2V1R A; 4RTZ A; 1MV0 B; 1XOV A; 3VS2 A; 1B07 A; 4D8D A; 3PE0 A; 1PRL C; 1Z9Z A; 4HXJ A; 1M3C A; 1W6X A; 2DL7 A; 4JJC A; 1QCF A; 5I22 A; 1OPK A; 2D0N A; 2A36 A; 2YUP A; 1UE9 A; 1FYN A; 4EIK A; 1ZUU A; 2DM1 A; 2AZS A; 3VS6 A; 2K79 A; 1KSW A; 2X3X D; 1X27 A; 2KRO A; 3SHW A; 2CH4 A; 1K4U S; 3EG1 A; 1SRM A; 1X2K A; 4J9F A; 2O9S A; 1UJ0 A; 2D8J A; 4RUG A; 2CH4 W; 2DBM A; 1NLO C; 2C0T A; 2ESW A; 3UA7 A; 1NYF A; 2DL4 A; 2EQI A; 5L23 A; 1T3S A; 4LN2 A; 2DL8 A; 3H0I A; 4RTY A; 2PZ1 A; 1U5S A; 2DMO A; 1IO6 A; 1ZSG A; 1BU1 A; 2K6D A; 1SHF A; 3RBB B; 5IXF A; 2J7I A; 1ZBJ A; 2KT1 A; 2CT4 A; 3CQT A; 3O5Z A; 4LUE A; 2F2W A; 2KXC A; 3VS4 A; 5FWC A; 1I07 A; 2KRS A; 3REB B; 1WDX A; 1M8M A; 1UFF A; 2FEI A; 3QWX X; 5IHN A; 1X69 A; 1E7O A; 1WXT A; 3H41 A; 4OMO A; 4FSS A; 4J9H A; 1SPK A; 3GBQ A; 4X1V A; 1SRL A; 1PKS A; 2DIL A; 2A37 A; 2HCK A; 2O31 A; 1E6H A; 4AG2 C; 3H0H A; 1QKW A; 1RLQ C; 1GCQ C; 4J9G A; 4RTT A; 4J9B A; 4CC3 A; 1QKX A; 2EKH A; 1UUE A; 2EYZ A; 1WXU A; 4KRT A; 2L3Q A; 4K11 A; 1UHC A; 4LE9 A; 4WCI A; 4R0K A; 4AFU C; 1X6G A; 2I0N A; 2EVR A; 1AWW A; 1NLP C; 2ABL A; 2AKK A; 2FPF A; 2RPN A; 2JS0 A; 1AZE A; 1V1C A; 2RMO A; 2VVK A; 2L3S A; 2JMC A; 2M0Y A; 4HVV A; 5IH2 A; 1AEY A; 2YT6 A; 3M0T A; 2ENM A; 1ZUY A; 2OI3 A; 2RN8 A; 5IXB A; 2DA9 A; 5IHK A; 2B86 A; 2CRE A; 2LP5 A; 1W70 A; 1WIE A; 2DE0 X; 1KIK A; 2DBK A; 1ZX6 A; 4RTW A; 3TSW A; 4OMM A; 4J9E A; 2VWF A; 1GFD A; 4OMP A; 2KGT A; 1RLP C; 4CC2 A; 1T0J A; 2SRC A; 5I11 A; 2HSP A; 2K9G A; 3NMZ C; 1K76 A; 1GCP A; 2HEQ A; 2CUB A; 3EGU A; 2DX1 A; 2RNA A; 4JJD A; 1KFZ A; 2EGA A; 4ORZ A; 1GBR A; 4A63 B; 3I35 A; 3UA6 A; 2DRK A; 1K1Z A; 3I5S A; 4GLM A; 3EG0 A; 2RQW A; 1Y0M A; 1VYV A; 2KYM A; 1JEG A; 3I5R A; 1FMK A; 4RTV A; 2KYB A; 4LNP A; 5IHI A; 1B3Q A; 3IQL A; 3RNJ A; 4J9C A; 1HSQ A; 1WLP B; 3NPF A; 1UTI A; 1BK2 A; 1Y57 A; 2L2P A; 1OV3 A; 2CUD A; 2JTE A; 2EYX A; 2RQV A; 3M0Q A; 1NYG A; 2LJ0 A; 2LQW A; 2W10 A; 1BBZ A; 2L3P A; 1UDL A; 2GGR A; 2M51 A; 4JJB A; 3A98 A; 2BZY A; 3VS7 A; 3M0S A; 1UJY A; 2DYB A; 5GJW B; 1ZLM A; 2EPD A; 2AZV A; 2KRN A; 1X6B A; 4ESR A; 2EBP A; 1N5Z A; 3M0P A; 2G6F X; 3U23 A; 2MIO A; 2C0I A; 2J05 A; 1U06 A; 2LMJ A; 4IIM A; 1G83 A; 1X2Q A; 1G2B A; 4CC7 A; 2X3W D; 2JS2 A; 2L0A A; 2AKL A; 2XMF A; 1QWF A; 1Z9Q A; 1MUZ A; 4Z89 A; 2DNU A; 1AVZ C; 1T3L A; 1OOT A; 2CSQ A; 3C0C A; 2GTO A; 2O2O A; 4LUD A; 1RI9 A; 3TVT A; 1HD3 A; 2QDL A; 5ECA A; 2NWM A; 2O9V A; 1JXM A; 2A28 A; 1PRM C; 1QLY A; 2H8H A; 2NUZ A; 2GQI A; 1K0S A; 4JPB W; 1TG0 A; 3ULR B; 2GTJ A; 1YNZ A; 1GBQ A; 3M0U A; 2RQR A; 2FRY A; 3PVL A; 1ABQ A; 3JV3 A; 2ROL A; 2SEM A; 2DF6 A; 1VYU A; 3KFV A; 3TSZ A; 3R6N A; 1JU5 C; 2O88 A; 2KEA A; 1JO8 A; 1X43 A; 3SEM A; 2FG0 A; 1H8K A; 2DJQ A; 3NGP A; 1BB9 A; 2A08 A; 1YP5 A; 2K3B A; 2OJ2 A; 4DEY A; 2RF0 A; 1MV3 A; 2GBQ A; 1E6G A; 2LZ6 B; 4JZ3 A; 2DRM A; 2D1X A; 2BZX A; 3EHR A; 4J9I A; 2CDT A; 4AFS C; 1NEB A; 2KNB B; 3LH5 A; 3VRY A; 1M27 C; 1YWO A; 4AG1 C; 2F2V A; 2KRM A; 1J3T A; 2ROT A; 2KE9 A; 2CSI A; 3EG3 A; 2LQN A; 4OMQ A; 2K7A A; 2E5K A; 3VS5 A; 2JMA A; 1ARK A; 2J06 A; 2PTK A; 1YWP A; 4OMN A; 3VS1 A; 2RQU A; 1CKB A; 1WYX A; 2EGC A; 2FRW A; 2PNI A; 1KJW A; 1U3O A; 2KR3 A; 4ZNX A; 1AZG B; 2EYW A; 4F16 A; 1JXO A; 2BZ8 A; 5GJV B; 4AFZ C; 2KXD A; 1PNJ A; 1M3B A; 1PHT A; 2IIM A; 1HJD A; 4HCK A; 1UGV A; 4CC4 B; 1WI7 A; 2J6F A; 4F14 A; 4Z88 A; 1PKT A; 5EC7 A; 1UHF A; 1YN8 A; 2C0O A; 1WFW A; 4J9D A; 2EYY A; 1CSK A; 1OEB A; 4HVW A; 1WXB A; 2AK5 A; 2EW3 A; 1NM7 A; 3QWY A; 4QT7 A; 1ABO A; 1SSH A; 1PWT A; 4RTX A; 2ECZ A; 2DL5 A; 4D8K A; 2F2X A; 2LNH B; 2JW4 A; 1K0X A; 2JM8 A; 3VS3 A; 2KBT A; 2CT3 A; 2HBW A; 5FW9 A; 2YSQ A; 1NEG A; 1QWE A; 3FJ5 A; 1AWJ A; 1A0N B; 1S1N A; 2LJ3 A; 4DEX A; 3I9Q A; 1OPL A; 2MOX A; 2LJ1 A; 1TUC A; 2RQT A; 3PVQ A; 2YUQ A; 2YUN A; 4F17 A; 2BTT A; 2EGE A; 1AWO A; 1H92 A; 2JM9 A; 1NG2 A; 3M0R A; 1LCK A; 3H0F A; 1GRI A; 3VRZ A; 2JXB A; 1WA7 A; 1AOJ A; 1EFN A; 1UG1 A; 3NHN A; 2J6K A; 1YCS B; 5HCK A; 2K2M A; 4OML A; 1M30 A; 1GFC A; 2YUO A; 2GNC A; 4HVU A; 4JZ4 A; 4M4Z A; 1I1J A; 3UAT A; 3EHQ A; 1ZUK A; 1JQQ A; 1TUD A; 3REA B; 2V1Q A; 2DVJ A; 1CKA A; 2ED1 A; 2MCN A; 1M3A A; 2J6O A; 2FPE A; 3THK A; 4AFQ C; 1SHG A; 3ZL7 C; 3UF4 A; 4RTU A; 2OAW A; 2D8H A; 4IIO A; 1UEC A; 4Y92 A; 4E6R A; 1T0H A; 2LCS A; 5FWB A; 1AD5 A; 1GCQ A; 3VS0 A; 1H3H A; 1I0C A; 2VKN A; 2FPD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4Z8A A; 3RMS A; 2E5Q A; 2DTI A; 2L5Q A; 3CMA A; 2JT4 A; 2K2V A; 1GL5 A; 4GBQ A; 3OYD A; 2HL3 A; 1AWX A; 2LX7 A; 2LC4 A; 1RAE B; 3C4S A; 2P4R A; 4M75 F; 3OY9 A; 3FC3 A; 3RER A; 4M7D A; 2PUK B; 2W0Z A; 2DET A; 2FO0 A; 1S72 T; 2D6F A; 2HDA A; 3JCM Q; 3HRT A; 1WX6 A; 2OTJ Q; 5GAN 5; 1XOV A; 4FU6 A; 4D8D A; 1B07 A; 1PRL C; 1M3C A; 1W6X A; 1YJN T; 5I22 A; 1OPK A; 2D0N A; 4LD9 K; 1NZ9 A; 5AT1 B; 4XTU A; 4J6X A; 1FXX A; 4KH1 B; 1OQK A; 3CC7 Q; 1ZUU A; 2QQS A; 2DM1 A; 1BIB A; 1WJR A; 1GXI E; 1EX4 A; 2QEX Q; 1KSW A; 3SHW A; 3CCV Q; 1Q7Y R; 3UWN A; 1VQO A; 1X2K A; 1FMV A; 4PJL A; 3CBP A; 4LD6 A; 1QVP A; 3OYB A; 5GAM j; 1BIA A; 3GIB A; 4LN2 A; 5GAO m; 2DXU A; 5IT9 E; 2HZY A; 2DMO A; 2KQW A; 3VU3 C; 1VUB A; 4BE0 A; 2VYT A; 3RKY A; 1BU1 A; 3JCM g; 1AHJ B; 2AIR B; 2R58 A; 1VQM Q; 2LQ8 A; 4NS5 A; 4A4E A; 2ZPH B; 3OYJ A; 2CP3 A; 1LOJ A; 4VUB A; 3O5Z A; 3TQ7 P; 2HQX A; 3UPU A; 4M78 C; 4C8Q E; 1YI2 Q; 3VS4 A; 1QQJ A; 1N9S A; 4F7U E; 3OBW A; 3NTH A; 2KRS A; 2VB6 A; 2FEI A; 1VQ5 T; 3CCS A; 1M1K U; 1MMD A; 4FSS A; 4M7A E; 4RG2 A; 5KYY A; 3JCM X; 1ZQ1 A; 1VQL Q; 4IKF A; 4M75 A; 3H0H A; 1QKW A; 1U1T A; 2YRD A; 1VQP T; 1KQS S; 4QVC A; 1MMA A; 4J9G A; 3QJ6 A; 4CC3 A; 1B34 B; 1QP2 A; 2RHZ A; 3X25 B; 5CR2 A; 1D0Z A; 3I56 A; 4LE9 A; 1QVG S; 2EVR A; 1AWW A; 1JBM A; 1NLP C; 2AKK A; 2FPF A; 4M7D C; 2RMO A; 5IH2 A; 2JMC A; 1M8V A; 4IUU A; 3QDF A; 2JJ9 A; 1VIF A; 2YT6 A; 1NJI R; 1YJ9 Q; 2ENM A; 2RN8 A; 2DA9 A; 2CRE A; 1VQN Q; 1RAF B; 4QW2 A; 2DE0 X; 1ZX6 A; 4RMO A; 3JCM J; 1VQ8 Q; 4RTW A; 2E1H A; 2VGM A; 4OMP A; 1RLP C; 1QCO A; 4CC2 A; 5LJ3 g; 5J26 A; 2KK4 A; 4ZTF A; 3CCR A; 1PCX A; 4MML A; 4PJO F; 1PD1 A; 3EFO A; 5GAN d; 2HEQ A; 2RH2 A; 4ELY C; 2RHI A; 2HMA A; 3CCL Q; 3HRU A; 3WVD B; 4JJD A; 3G1J A; 1I8F A; 3BW1 A; 3M56 A; 3L2V A; 1M2V A; 3CC2 A; 2MAM A; 4PL6 A; 3I5R A; 1FMK A; 4R55 A; 2LX9 A; 1NPP A; 3ER0 A; 5IHI A; 3ZBD A; 2CYZ B; 1HSQ A; 1XJW B; 4KUI A; 4EMK B; 2CP6 A; 3X24 B; 4OGE A; 1Y07 A; 2EYX A; 2CGH A; 3AT1 B; 4DBF A; 1NYG A; 1UDL A; 2GGR A; 2M51 A; 2EQM A; 4M75 D; 3HFO A; 2BKD N; 2V8K A; 4XTV A; 3VYG A; 3S3M A; 2BZY A; 1BYM A; 3PTA A; 1WZO A; 2DYB A; 5GJW B; 3OYA A; 2EWN A; 3C12 A; 3QII A; 3JSC A; 1X6B A; 3CCM A; 4Z02 A; 4IUQ A; 3SB2 A; 3QHS A; 2G6F X; 3U23 A; 2C0I A; 4A53 A; 1U06 A; 3JB9 I; 3MPU B; 1XQH A; 5GAN f; 1G83 A; 3CCU A; 3OS0 A; 5GAN 7; 4FT4 A; 2GCX A; 3P8D A; 2DPP B; 2JS2 A; 2FL7 A; 1PD0 A; 2E70 A; 5J39 A; 2JNG A; 2CP0 A; 2KAF A; 1IHW A; 3I55 A; 1Z9Q A; 1QP3 A; 2EQJ A; 4Z89 A; 2P0P A; 3OSS C; 2GTO A; 2COZ A; 3N5B B; 4LUD A; 3M58 A; 1H3Z A; 1K73 C; 3TVT A; 2QDL A; 2NWM A; 1JXM A; 2HNI A; 2NUZ A; 1U8R A; 5GAN h; 2OTJ T; 1K0S A; 4PJO A; 1LNX A; 3WXM B; 2OX7 A; 3QO3 A; 2ZCF B; 1VYU A; 1OI1 A; 3KFV A; 1OX9 A; 3R6N A; 3CBM A; 5CCA A; 4J7I A; 2O88 A; 1JO8 A; 2I2L A; 2NUT A; 5GAM f; 2FG0 A; 4XU2 A; 3NGP A; 2A08 A; 3R6O A; 2DZC A; 2RF0 A; 1E6G A; 2LZ6 B; 2BZX A; 4C8Q F; 2CP5 A; 3CCV T; 4FYV B; 3LH5 A; 4N4H A; 3VRY A; 1M27 C; 4F7U F; 1VQ6 T; 1G3T A; 2ROT A; 2KE9 A; 1Q95 G; 4C0D C; 2VUB A; 3EG3 A; 1EZZ B; 4J6Y A; 3OYH A; 4M7A F; 3LGF A; 2L8D A; 3L2U A; 2K7A A; 3UDC A; 2LNV A; 4EMG A; 3OYC A; 2DJZ A; 2XHC A; 3G6E T; 3FRN A; 1WJQ A; 4O6J A; 1YWP A; 2DTO A; 2PNI A; 1KJW A; 4FYY B; 1QVF S; 1U3O A; 4ZNX A; 1TTH B; 4F16 A; 5GAM e; 1VQM T; 3RMQ A; 3VV0 A; 3JRZ A; 3NTK A; 4HCK A; 2F69 A; 3QXE B; 3QZ9 B; 4Z88 A; 2QXF A; 1YI2 T; 4J8O A; 4C92 G; 1PKT A; 2C0O A; 1WFW A; 2AHJ B; 4JJN K; 2L3R A; 4HT9 A; 2BIV A; 5I2S A; 1M4Z A; 1ABO A; 3HHT B; 2QI2 A; 2ECZ A; 1VQL T; 3CD6 T; 4Y91 A; 1WPY A; 4XQ3 A; 1KQS P; 3VKI A; 4ANJ A; 2CZ7 B; 2RI2 A; 2BUD A; 2GFU A; 3ZEH A; 4PJO D; 2QAZ A; 4JLI A; 1TUG B; 3BFM A; 3I9Q A; 2COY A; 1R0C B; 4X9D A; 3JCM e; 3PVQ A; 2YUQ A; 1D3B B; 3M59 A; 1QVG P; 2EGE A; 1AWO A; 2RHU A; 4NOY A; 1NG2 A; 3M0R A; 4JDS A; 1LCK A; 2QA4 A; 1GRI A; 3OYN A; 3D7S B; 1EFN A; 1UG1 A; 1BI1 A; 2WSF E; 4HVU A; 1YJ9 T; 3PMI A; 4KBM B; 5C6S A; 4C8Q A; 3EHQ A; 4QKU A; 4F7U A; 2XI9 A; 3REA B; 2DVJ A; 4PFZ A; 4N0A A; 4BI3 A; 3JAM E; 4M78 G; 5IAY A; 3SDZ A; 3M55 A; 1G3Y A; 2J6O A; 4L59 A; 2FPE A; 3PT9 A; 1NE8 A; 2D8H A; 1D1C A; 1UEC A; 2JZ2 A; 1G5V A; 3CCL T; 1D1A A; 4J5Y A; 1JJ2 S; 4GLK A; 1I0C A; 2FPD A; 1SEM A; 4C0Z A; 2RD1 A; 2DL3 A; 4KH0 B; 1Q82 C; 1OYX A; 4XTY A; 5FU7 C; 4IUP A; 1KK7 A; 2EJF A; 3H6Z A; 2R5M A; 2E65 A; 5C0M A; 1RUW A; 2RK2 A; 2LQK A; 3LH0 A; 1YHQ Q; 1U1S A; 2V26 A; 3PE0 A; 2H3E B; 3BE3 A; 2LVM A; 2A36 A; 2YUP A; 1FYN A; 3S3N A; 2QGG A; 1V29 B; 2EIF A; 4PFO A; 5GAO n; 2AZS A; 2DAQ A; 2K79 A; 2LCL A; 4E2F B; 3HKS A; 1X27 A; 3EG1 A; 2GFA A; 1SRM A; 3A8O B; 4A54 A; 4RUG A; 3I56 Q; 2DYI A; 2QQB A; 1SG5 A; 3OS1 A; 3KUF A; 3G4S Q; 3CCJ Q; 2DL4 A; 1BI0 A; 2EQI A; 4MZP A; 4M78 B; 4BY6 C; 2O4X B; 2K4Y A; 2RK1 A; 4PJJ A; 2XDD A; 2OTL Q; 2K3X A; 2RJE A; 1LJO A; 1ZSG A; 1D0Y A; 3SWN A; 1YIJ A; 3G7Z A; 2K6D A; 2Z0W A; 5IXF A; 1VQ4 T; 5CVI A; 5CAI A; 3QSU A; 4C8Q C; 2J7I A; 3CME A; 3CXC S; 2PVD B; 1K73 R; 1K9M C; 2CT4 A; 4LUE A; 2KXC A; 3CCR Q; 1X75 C; 4M7A C; 3UT1 A; 4XU1 A; 1DJ7 B; 1MGQ A; 4OF1 A; 3REB B; 1WDX A; 3OYY A; 3QKJ A; 1UFF A; 3LW5 E; 5DM7 R; 1SKU B; 3QWX X; 2E3I A; 8ATC B; 1E7O A; 1P92 A; 4J9H A; 4X1V A; 2XIC A; 1OU9 A; 4ZGD B; 2HCK A; 3G71 A; 4AG2 C; 5KYN A; 4E7J A; 3CC2 Q; 2ZPE B; 2ZPI B; 4FYW B; 4OMF B; 1UGQ B; 5LJ5 d; 2A7Y A; 3CPW S; 1QKX A; 1Q81 C; 2EKH A; 1UUE A; 4RG8 A; 2ZPG B; 2YLB A; 2L3Q A; 1UHC A; 4E7Z A; 1HYO A; 4WCI A; 1MMG A; 1TXQ A; 2I0N A; 2DER A; 2ABL A; 2JS0 A; 2VVK A; 4ATO A; 1BI3 A; 2L3S A; 4F04 B; 4DQ2 A; 8AT1 B; 4M77 C; 1QVF P; 4HCB A; 5GAN j; 2OI3 A; 2DXT A; 1TWB A; 2V8I A; 2LP5 A; 1W70 A; 3HTR A; 4FCY A; 3CCM Q; 3CCQ A; 1YJN A; 3JCM P; 1KQ1 A; 4JRI A; 1K73 U; 3P8B B; 3QPH A; 1KQS A; 5CQY A; 3CCU Q; 1R8O B; 5GAM g; 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