1JCFA

Mreb from thermotoga maritima, trigonal
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 110
structure length 336
sequence length 336
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcfA03
1S22A 3AY9A 3LDLA 5AFUH 3OHRA 4L3QA 4BRFA 4EIAA 2QW9A 4M7XA 4RCHA 2P9IA 1T44A 3QFPA 4XH4A 3CI5A 3A5LC 4FO0A 4CI6A 1V4TA 1NGAA 3I8BA 1HUXA 3ZX0A 1JCEA 4BRDA 1Y64A 1KXPA 5KPZA 4B1VA 1ZXOA 3I33A 4DB3A 5AQJA 4BGBA 4AM6A 3WQUA 2P9SA 4ISFA 3VERA 2FSJA 5AR0A 3ZX3A 4PKHA 5AQRA 5AQFA 1P8ZA 2W40A 4QS8A 2ASPA 4BC3A 3L0QA 5LJWA 4B1WB 4FWSA 2FXUA 2YI1A 5AQNA 5AQVA 5B8HA 1C0FA 1DGKN 5LY3A 3UKRB 5AQQA 2Q36A 4JD2B 2P9NB 4A2AA 4FSVA 1ESVA 3GE1A 2ASOA 1T6DA 2EWSA 3CETA 2V52B 5E26A 2P9UA 3QMLA 3R8EA 4BG9A 2E1YA 3CJ1A 3D2EA 5F1XA 4CZIA 3VEXA 3VPZA 4O8KA 3HI0A 1NGCA 3FZMA 4H5WA 4BRPA 3EO3A 4BC4A 2V7YA 1WOQA 3BP8A 4H0XB 4BRIA 1E4GT 4MO4A 5ELZA 2P9PA 1NM1A 5AQWA 5EY4A 2V51B 1WUAA 1JCFA 5FPDA 5JLFA 2NRHA 1HLUA 3QBXA 3VGLA 3KHYA 3B8AX 3ID8A 3FZLA 4NB4A 3U4LA 2GWJA 5FPEA 3TPQA 1GLBG 2VWBA 1ATNA 2BUPA 4PKIA 2E2OA 3SLCA 3A8YA 4FWNA 3VEZA 5LJVA 3WEEA 3BF1A 3HSCA 4DHYA 1GLAG 4H5VA 3J8AA 2A3ZA 2QWMA 4FWPA 4C23A 3FLCO 5FPMA 2E2PA 2CH6A 3TU5A 3P4IA 3ULEB 5AZJA 5AQXA 4FOEA 3O1BA 2E20A 2QWRA 3EZWA 4CBUA 2P9KA 4IWVA 4CZHA 3MN7A 1NGDA 2V7ZA 4BRCA 3MDQA 4H5RA 2KHOA 4MO5A 1K8KA 1TUUA 3LDOA 4PL8A 1YAGA 1NBWA 2A41A 1BOTO 1HJOA 3DXKB 3VEYA 5AQUA 3LDQA 2DPNA 1U6ZA 3M3ZA 2E2NA 3WXIA 2YJEA 4WQ4C 5AFUA 3VENA 2A6AA 2HOEA 4K41A 4BGAA 4PKGA 2HF3A 4FPAA 4I6MA 1XUPO 3VGKA 3UKRA 3MCPA 3LDPA 3FZFA 4BR7A 1XC3A 4WQ4A 5BRFA 1GLFO 3VEOA 3GG4A 3QFUA 4NO7A 3KZBA 3ATUA 2YCHA 1NWKA 1SAZA 1E4FT 1U2VB 2AP1A 2I7PA 1NMDA 3O8MA 1BA0A 1DEJA 3H3NO 3LL3A 1GLLO 1BU6O 3CERA 3O4WA 4JHDA 2QWQA 3SJHA 3QICA 4BQZA 2W41A 4RTFD 4CD3A 4CZEA 4JNEA 3ZEUB 2FSKA 1QQMA 2YHWA 2PBDA 3FR0A 4K43A 4FWRA 2E2QA 3VETA 4A62A 5KPTA 4CZFA 3C7NB 4BRHA 5AQKA 3ATVA 3ENOA 4CD1A 3FZHA 2ZGZA 1NGHA 2QXLA 5AQLA 3W3DA 1TUYA 5AQMA 2IVOA 2WUSA 2QM1A 3CJCA 3EKUA 3D2FB 3ZX2A 1RDWX 5ADXH 1BUPA 2P9LB 1NGIA 1NGEA 2IVNA 3SMPA 5AQSA 1TYQB 5KPRA 2PAVA 2FSNA 4B1YB 5AQHA 4BR9A 3FZKA 4H0TB 3H46O 4H03B 1Z6RA 3O08A 2A5XA 3MMVA 2QWNA 4IJNA 2GTDA 3U8XA 5I9EB 3A5MC 3MN6A 4H0PA 4K25A 2P9IB 1X9JA 5F2RA 3H3OB 4BRMA 3A5NC 2E1ZA 2ZF5O 2UYTA 4CZGA 1KAXA 3ZETA 1QHAA 5BPNA 4BRKA 3IUCA 2Q31A 2OANA 3HTVA 3IDHA 3JXUA 5AZIB 3VEVA 3L4IA 3MN9A 5BN9A 4F9OA 2P9SB 3RSEB 4GNIA 1V4SA 4XH5A 3IFRA 3H6EA 4H5TA 4CJ7A 1ATRA 2BTFA 5BREA 4WQ5C 1KAYA 5AQIA 2A42A 1JCGA 3LDNA 2A40A 3GOIA 3F9MA 4KBOA 4FWMA 2GELA 4EHTA 5AQPA 4BG8A 4CZLA 4DQ8A 4FWKA 4WQ5A 4LC9B 2J4RA 1NLVA 1OKJA 1QQNA 2P9UB 1C0GA 5AQOA 1DKGD 1GLJO 3D2EB 2VCPA 2IIRA 1SZ2A 5CE3A 3A5OC 1GLDG 5FPNA 3EL2A 4M63C 2FF6A 2FLOA 2Q97A 4XEIA 1HKCA 5JLHA 4BRAA 1KAZA 5AQGA 2CGLA 2Q2RA 3EKSA 1GLCG 4JD2A 2P9NA 4BROA 2VYPA 2QWOA 3O1WA 4CZMA 5BPLA 1X3NA 3EN9A 2E88A 5EX5A 5BN8A 1LOTB 1HPMA 3H45C 4Y0WA 3G25A 2HF4A 3GDQA 1TYQA 3WUHA 5BPMA 3QB0A 5EXWA 3WEEB 1J6ZA 5KQDA 4IJAA 4B1UB 4XH1A 1H1VA 4BC5A 4O5FA 3CQYA 3ENHA 4EHUA 3S41A 4HTLA 1NGGA 4BR2A 1NGBA 2ASMA 2ZWHA 4FWOA 4H0YB 4JAXA 1QZ5A 4H0VB 4PL7A 1RFQA 1HX1A 3W0LA 4QS7A 4WYBA 1HKBA 5AZJB 3SMSA 3AAPA 2NZTA 3AAQA 1X3MA 3LM9A 3UKUB 4BVPA 5BRHA 4M7YA 3VOVA 5JMVA 3HM8A 3LM2A 1G99A 2P9KB 2GUPA 4ISGA 3SK3A 3C0BA 4BC2A 4CBWA 5ADXA 4B1XB 3VEWA 1K8KB 4FL9A 5AZIA 3CJBA 3RSEA 1MWMA 3R9PA 3M6GA 2D1KA 1CZAN 4EFHA 3UB5A 3QBWA 3CJ7A 4BR0A 2HMPA 3DAWA 3DXMB 4IO8A 1IG8A 1GLEG 4YDUC 4A2BA 3D7EO 4BR4A 2QWLA 3ULEA 3WT0A 5BR9A 5AQTA 4CZJA 3WQTA 2AA4A 3WXKA 1BWFO 3BF3A 3L6QA 4I6MB 3H1QA 5AQYA 4RWTA 4IZ9A 2I7NA 4YDUA 2YHXA 1BDGA 1MDUB 4JN4A 2H3GX 3CJ9A 5TKYA 1LCUA 1BG3A 3VF6A 3MK6A 3DXKA 3H1VX 3WXLA 1Z05A 2F9TA 1BA1A 2YJFA 3BUZB 4JHDB 1EQYA 3CHWA 2D0PA 1HKGA 5KQ8A 3CIPA 1T6CA 2CGJA 3DJCA 3AARA 2FF3B 1IJJA 3GBTA 2D0OA 5EVZA 1MWKA 3U9DA 4ISEA 5E84A 4BR5A 4K42A 4BRGA 3O80A 4GY2B 1ZC6A 1Q18A 1NGJA 3VESA 3UE5A 3U9ZA 2NLXA 3FE1A 4E1JA 2CGKA 5EOYA 1U2VA 4BREA 3QDKA 1NGFA 4A61A 2ITMA 1YUWA 3BEXA 1MA9B 3HBTA 3O5BA 4AM7A 4FPBA 5AQZA 2Q0RA 3VGMA 4CZKA 3VF2A 4BQLA 2D4WA 4EAHD 1RGIA 4CBXA 4B1ZA 3FGUA 1D4XA 3FFKB 4HWIA 3ZEUA 4H0OA 2E8AA 2IVPA 4H5NA 4FOIA 4MLEA 4B9QA 5JICA 2Q0UA 4FWQA 3VF4A 5BRDA 3UKUA 2F9WA 4BRQA 4IXCA 1ZBSA 3KVGA 3C7NA 2GWKA 3IMXA 1R59O 2P9PB 4MLHA 4J8FA 3GL1A 3DWLA 2YHYA 3JS6A 2ZGYA 5F0XA 1ATSA 4BRLA 4Z94A 3MN5A 4FWLA 1YVNA 2Q1NA 4BRNA 1XQSC 3CJAA 3HZ6A 2GEMA 3D2FA 4BVOA 4QS9A 1QQOA 3CQXA 2P9LA 3ZETB 1BO5O 4DCHA 3M1FA 1QZ6A 3DXMA 3WXJA 3O6WA 1S3XA 2QWPA 2CH5A 1SQKA 3A0IX 1YXQA 3R6MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4QA 4YOYA 4N5SA 3OYEA 5AFUH 4BRFA 5JVGL 2QW9A 4JKCA 1C1CA 1A5XA 3CI5A 3DOLA 2R7YA 1XMQK 3ZX0A 3QESA 3OS1A 5KPZA 1VQON 2D5RA 4B1VA 5AQJA 4BGBA 4AM6A 2UXBK 3SQ1A 3WQUA 2FSJA 3J7ZO 3L2VA 2B4JA 5AQRA 3SUQA 4QS8A 3AVFA 3I0SA 3CQ8A 4M3RA 1JLQA 1JJ2M 4DQPA 3OYBA 2FXUA 3CC2N 4CJSA 1DGKN 3C6AA 4NLBA 1K6YA 4FSVA 1T6DA 4OJRA 4FW1A 4CEAA 3E1YA 4C8MA 3SV4A 4FVUA 3G6EN 3FZMA 4H5WA 4M41A 3EO3A 1WOQA 4DFJA 4H0XB 5HROA 5DMRA 3DI6A 3NF7A 1EWRA 3EEQA 3CPWM 4BDZA 2QA4N 2V51B 1WUAA 5FPDA 5JLFA 4CK3A 1HLUA 2HBLA 3QBXA 5H1SQ 4HHTA 4LH4A 4NB4A 4Y1CA 1ZBLA 4ZTJA 4FWNA 3QNNA 3WEEA 3BF1A 4DSEA 4K0KK 1GLAG 3KD1E 1DTTA 4K8ZA 4JI7K 3OS0A 3VN5A 4YOXA 1RT4A 2O4GA 3L3VA 5C42A 3SAFA 3P4IA 3O3GA 1KLMA 4C1NK 3O1BA 3EZWA 4J2DA 3OBWA 2P9KA 3AO2A 4IWVA 3AA3A 4CZHA 4CHNA 1U47A 4CE9A 4DSIA 5M1FA 1NNEA 2KHOA 1LW2A 3DLBA 4C8LA 3LDOA 4ELTA 3VQ8A 1VQKN 4JKEA 4ELVA 1BOTO 1RCHA 1DT9A 3JAMO 4CJUA 4FJXA 4CW7B 3LDQA 2DPNA 3O9SA 4LD0A 2Y1IA 1JL1A 5AFUA 3CCSN 1U4BA 3MX5A 3UKRA 3MCPA 3OYGA 5FDLA 4Z4GA 3QIOA 2BANA 2YCHA 3OS2A 1SAZA 4PWDA 4Q5VA 1U2VB 1SL2A 5BR8K 2OPQA 3PX4A 3MXMA 1GLLO 1TK5A 3NVKA 2OPRA 3LP1A 4JHDA 1W0HA 4CHPA 4M3WA 2FBYA 4GV3A 3O3HA 4CD3A 1VSMA 4JKBA 4OGEA 4CEDA 3ZEUB 3OY9A 3C6HA 3K9KA 2YHWA 3FR0A 5HRNA 3VQEA 3QNOA 2E2QA 3CYGA 4A62A 3NHGA 3OYCA 1IBLK 4AQYK 5AQKA 3ATVA 1XNQK 4Q0BA 4CFCA 4E7KA 4DQSA 3THYB 2ZGZA 4NLCA 4JEPA 5AQMA 4LFCK 2QM1A 3ISNC 3D2FB 2O8DB 3RTVA 3OJUA 1BUPA 2IVNA 1ZBFA 4KV8A 4DSLA 5KRTA 3VQ4A 1SKRA 4QOZB 1CLQA 3HO1A 1MU2A 4W5TA 3T1HK 2PYJA 2WBNA 3FZKA 4H0TB 4OPHA 4H03B 2P5OA 2A5XA 3MMVA 3KIOA 3TSQA 3CFPA 1KSPA 2QWNA 1VQ6N 4CIGA 2XO7A 1NOZA 4W5OA 2UXDK 5C0YA 3SQ0A 3CPEA 4DR7K 2P9IB 1SL0A 5F2RA 1QHTA 3LANA 4A57A 1BHLA 1Q7YO 4DFKA 1TV6A 4DU3A 4RW9A 1QHAA 4BRKA 1T7PA 1OH5A 1P90A 2OANA 3JXUA 4WF9L 3L4IA 3U6FA 3MXJA 5BN9A 4YFUA 1V4SA 4R5PA 3V81A 4DUZK 3IFRA 5GADP 4E19A 1HR0K 1VSDA 2HB5A 1YJWN 5BREA 4C8NA 1KAYA 1OH7A 4CFBA 2A1SA 3GOIA 3VQBA 1M90O 4V19S 3KJVA 4BG8A 2WTUA 1DLOA 1LWCA 4B9TA 4B9VA 2P9UB 1C0GA 1DKGD 1S9EA 4CJKA 3OYMA 4FJMA 4F4KA 1FKOA 1VQ4N 1SZ2A 1NKEA 4JYAK 4X64K 4PHTX 4AH9A 3P38A 4OPJA 2FF6A 2FLOA 1R0AA 5JLHA 4HUEA 2HHXA 5M1OA 1IKVA 3P1GA 3SV3A 5FRNA 3WXMB 4BROA 1Z25A 1QVGM 1TKTA 3O1WA 4OVLA 1D9DA 3HJFA 4E1MA 4B9LA 3EN9A 5BN8A 3PX6A 1NJWA 1VQMN 4PUOA 1JLAA 3WNGA 4CEFA 4OLAA 3AVAA 4BWMA 4GVMA 1TYQA 4DS4A 3KKRA 2GBZA 5EXWA 4KHNA 2RF2A 4LSLA 1J6ZA 4YOWA 1Q9YA 2RHKA 3OW2M 4DTRA 1J5EK 4O5FA 3CQYA 1WSEA 1OH8A 4BR2A 5C10A 2ASMA 3T1AA 4JAXA 4JI5K 1W2BM 1RFQA 3HM9A 3AVNA 3EYZA 4QS7A 3CF5L 4WCEL 2D0BA 5AZJB 3SMSA 3AAPA 1X3MA 3LM9A 1BL3A 4FLXA 4E89A 4E3SA 3LM2A 2Y1JA 5SWMA 3THWB 4B9SA 3VEWA 1K8KB 3F73A 3AA2A 1N32K 1GOCA 1XMOK 3ZSOA 4FJ5A 4ELUA 1HNXK 2OCEA 4B3OA 1TKDA 3M6GA 2X74A 2HHWA 3QBWA 2JWLA 3DAWA 3KLEA 4A2BA 4BR4A 2Z1HA 4JKAA 4AHVA 1RBSA 2VG7A 3HP9A 2VQEK 3L6QA 4I6MB 3H1QA 4RWTA 2ATQA 1YJNN 1I94K 2I7NA 4B3RK 1KQSM 1VSIA 3NH0A 4JN4A 4KHQA 2QKKA 3NFAA 3Q7CA 1RDDA 2H3GX 5TKYA 2JWKA 3CCUN 4CESA 1Z05A 4IOAL 3SYZA 4LF8K 5D3GA 1K9MO 4LFAK 2QTDA 3SBGA 2UXCK 3CFOA 1HKGA 4X66K 4HCBA 5A2QO 4Y1DA 3U9DA 2G8VA 4BRGA 3O80A 3CD6N 4GY2B 1QSSA 2EX3A 4AHUA 3U9ZA 2CGKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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