1JCGA

Mreb from thermotoga maritima, amppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
MLRKDIGIDLGTANTLVFLRGKGIVVNEPSVIAIDSTTGEILKVGLEAKNMIGKTPATIKAIRPMRDGVIADYTVALVMLRYFINKAKGGMNLFKPRVVIGVPIGITDVERRAILDAGLEAGASKVFLIEEPMAAAIGSNLNVEEPSGNMVVDIGGGTTEVAVISLGSIVTWESIRIAGDEMDEAIVQYVRETYRVAIGERTAERVKIEIGNVFPSKENDELETTVSGIDLSTGLPRKLTLKGGEVREALRSVVVAIVESVRTTLEKTPPELVSDIIERGIFLTGGGSLLRGLDTLLQKETGISVIRSEEPLTAVAKGAGMVLDKVNILKKLQGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Prokaryotic origin of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 98
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1jcgA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1jcgA03
4FPAA 5JMVA 4BQZA 5B8HA 1Y64A 4BG8A 1GLJO 3VOVA 2YHYA 4B1ZA 5E84A 2FSJA 3H1VX 4A62A 2P9SB 4WQ5C 3U8XA 5F1XA 4FWSA 5LJVA 4B1XB 5KPTA 4Z94A 4EIAA 1D4XA 1T6DA 2GTDA 4FWNA 4XH4A 3UKRA 1ZBSA 3O5BA 1IG8A 2BUPA 3MDQA 3ENHA 2Q0UA 4H03B 5AQKA 1LCUA 5E26A 3VPZA 2E2PA 3FZMA 3S41A 5AZIB 3A5NC 3DXMA 2AP1A 4LC9B 3AAPA 3VGKA 3AARA 2Q0RA 3WQTA 3W0LA 1TUYA 3CQYA 2A6AA 4XEIA 4BRGA 1NGBA 3VGLA 5KPRA 1LOTB 4K41A 3CJ7A 5AFUA 1BWFO 1R59O 1XC3A 2F9WA 4CZFA 1HKCA 2QWRA 4DCHA 3DXKA 3O6WA 4O5FA 2EWSA 4CBWA 3A5LC 3R6MA 4H0VB 3U9DA 4B9QA 2YCHA 1MWKA 5AQWA 4H0OA 1XQSC 4MO4A 3UB5A 4HWIA 3CJCA 5AQIA 4CZHA 2Q2RA 3OHRA 1QZ6A 5LY3A 1X9JA 4NB4A 3FZKA 2HF4A 4BR4A 4CZJA 1YAGA 2Q1NA 4H5VA 1BDGA 4FWOA 2P9SA 2A42A 5AQYA 3I33A 5AQVA 1NGDA 3M3ZA 1CZAN 4IWVA 5FPNA 3L0QA 4BQLA 1C0GA 1BA1A 1X3MA 2FLOA 3VEZA 3DWLA 4BVOA 3AY9A 3A8YA 5AZIA 2AA4A 2VWBA 3VF6A 2E88A 2QWLA 3M6GA 4BREA 2A40A 2ZWHA 1MWMA 1DKGD 5AQTA 5BN9A 5AFUH 3H45C 4PKGA 1P8ZA 1ZC6A 5AQQA 4IXCA 3B8AX 5JICA 3QB0A 3O1WA 4B1UB 2J4RA 1IJJA 3ATUA 5ELZA 5BPNA 3CJ1A 3KVGA 3GL1A 5KQ8A 1ATRA 1HLUA 4FWMA 3J8AA 1QHAA 3IDHA 5AQMA 4BRIA 3QICA 1MDUB 3FE1A 3QBXA 3QMLA 2VCPA 2QWNA 3CHWA 3L6QA 4GNIA 1QZ5A 2P9NB 4YDUA 3FZHA 5BRDA 5AQOA 3ZETB 1WOQA 4BRKA 5EXWA 2P9KB 5BN8A 2YHWA 2E8AA 4IJAA 3GDQA 2QXLA 3BUZB 4H5WA 3IFRA 3MMVA 1K8KB 1GLDG 4CZIA 4B1YB 5ADXA 3EZWA 3O8MA 3LM2A 2ZF5O 3H46O 3SMSA 3ZEUB 4CZKA 1YUWA 4RWTA 3TPQA 4B1WB 5EOYA 3SJHA 1H1VA 4IZ9A 3P4IA 2I7PA 2IVOA 3MN6A 1NGEA 4H0XB 2P9IA 3G25A 2FF3B 1YVNA 3C7NB 2V7YA 4ISFA 4BGAA 3EKUA 1KAXA 5FPMA 2P9PB 4H0TB 3VEYA 5AQZA 3CERA 4JHDB 4BRNA 2KHOA 5AQLA 1KAYA 2A5XA 3CIPA 4M7YA 3UKUB 4CD1A 2FSKA 3WQUA 4RTFD 3FZLA 5EVZA 2QW9A 3FZFA 1ATSA 2Q36A 1NWKA 2A41A 2GELA 4CI6A 3LDLA 3GOIA 4FPBA 1KXPA 3A0IX 1ESVA 2CH5A 2E1YA 1NGGA 2V51B 3D7EO 3CJBA 2W40A 2CGKA 4IJNA 4FSVA 4K42A 3U4LA 3ZETA 2P9KA 3H1QA 3VENA 4QS9A 4M63C 4MO5A 3HI0A 4A2BA 2D1KA 4BGBA 4FWRA 4BRLA 3QFPA 3MCPA 1K8KA 5AQXA 4EHUA 4AM7A 4EFHA 1HKBA 3RSEB 2H3GX 1RGIA 1OKJA 4MLHA 2CH6A 2ZGYA 4GY2B 4BRFA 2IIRA 5KQDA 3LDOA 4ISGA 3R9PA 1NLVA 4FOIA 4BC4A 4BRDA 4I6MB 3EO3A 4BG9A 2ASOA 3WUHA 5CE3A 3IUCA 5AQRA 4H0PA 3LDNA 3C7NA 4PKIA 3MN5A 2HOEA 3O80A 4KBOA 2P9PA 3ZX0A 3VF2A 4FO0A 2D0OA 4H0YB 5AQFA 2P9LB 4H5TA 3GBTA 1T44A 4O8KA 4FL9A 3UKUA 1G99A 3DAWA 3MK6A 2HMPA 4WYBA 3VESA 4BRHA 3VGMA 3VEOA 4B1VA 1GLAG 4BC3A 5BPLA 2Q97A 1NGIA 3BEXA 4FWQA 5BRHA 2IVPA 2BTFA 4H5NA 3ZX3A 5JLHA 1T6CA 1GLLO 1NGJA 4BR5A 2QM1A 5AQJA 3BP8A 5BREA 3WXKA 4CZMA 3UKRB 1DEJA 2DPNA 2YHXA 3QFUA 4BR9A 4BRQA 3VF4A 1QQOA 3SLCA 5EX5A 1BU6O 1EQYA 2QWOA 4BR2A 3RSEA 3DXMB 5EY4A 5F2RA 1SZ2A 2WUSA 4CBUA 1U6ZA 2P9UB 3HTVA 4WQ4A 3ZX2A 2GWKA 4YDUC 1QQNA 1NGCA 2NZTA 4I6MA 1Z05A 4F9OA 4PL7A 3A5MC 3FR0A 4BR0A 1NGAA 3VETA 4DHYA 2P9LA 5AQPA 3W3DA 2OANA 3KHYA 4XH1A 1MA9B 3DJCA 4CZGA 1BO5O 4RCHA 3LDPA 4PL8A 4FOEA 4A61A 5BPMA 4K43A 3QBWA 1JCEA 3LM9A 5BR9A 3HZ6A 3WEEB 4A2AA 1HUXA 1YXQA 2QWPA 4WQ5A 3D2EB 3ENOA 4QS8A 1S3XA 1BG3A 2PBDA 4EHTA 3U9ZA 1BA0A 2GUPA 2VYPA 3AAQA 4E1JA 3FFKB 2W41A 3WXJA 2QWMA 2YI1A 4FWLA 3I8BA 4BR7A 1V4SA 1NGHA 3JXUA 1GLEG 2ZGZA 3WXLA 1BOTO 3ULEB 2FSNA 4IO8A 4XH5A 3CETA 5F0XA 1E4FT 4CJ7A 1HPMA 2E2OA 2P9NA 4MLEA 3VERA 2FF6A 1SQKA 1NMDA 4JD2B 2F9TA 5AQHA 2P9UA 4QS7A 1RFQA 3WT0A 5ADXH 3EN9A 3GG4A 5FPEA 4CZEA 1JCGA 2CGLA 1C0FA 2E2NA 4M7XA 2PAVA 2FXUA 1SAZA 2ASMA 2E20A 3SMPA 1GLBG 3FLCO 3IMXA 3HM8A 2A3ZA 3BF3A 3EKSA 4JNEA 4BROA 2YJEA 1GLFO 2HF3A 5AQNA 3ZEUA 2D4WA 4BRMA 3H3NO 4EAHD 2NRHA 4C23A 1RDWX 4CD3A 4CZLA 1TYQB 3UE5A 1E4GT 1WUAA 1NGFA 1X3NA 1S22A 3L4IA 3A5OC 2ASPA 2V52B 4HTLA 2NLXA 3GE1A 3VEVA 1HJOA 3O4WA 4Y0WA 3HSCA 3MN9A 3WEEA 5BRFA 3D2FB 4L3QA 4JHDA 3SK3A 2YJFA 1DGKN 3D2EA 3HBTA 2UYTA 3ID8A 1BUPA 1ATNA 1U2VB 4K25A 3BF1A 4H5RA 3VEXA 1J6ZA 1TUUA 4JAXA 2I7NA 3WXIA 2D0PA 5AZJB 3O1BA 5AQUA 5AR0A 3FGUA 4ISEA 4BRPA 3MN7A 4JN4A 4FWKA 3ULEA 3M1FA 4BVPA 5I9EB 1QQMA 3O08A 2CGJA 4PKHA 3ATVA 2GWJA 1JCFA 2V7ZA 4JD2A 1NM1A 2E2QA 3CJ9A 2P9IB 4DQ8A 1V4TA 2GEMA 3TU5A 3CQXA 4BC5A 5AQSA 1GLCG 4CBXA 5FPDA 5KPZA 3LDQA 5LJWA 3H3OB 3JS6A 1TYQA 3F9MA 4BRCA 4BRAA 5JLFA 1XUPO 2ITMA 2QWQA 3CI5A 3QDKA 4BC2A 4WQ4C 3VEWA 1NBWA 3C0BA 3LL3A 4AM6A 5TKYA 3D2FA 1HKGA 2E1ZA 2Q31A 3DXKB 1HX1A 1U2VA 5AQGA 2IVNA 3KZBA 4DB3A 1ZXOA 1Q18A 3R8EA 3CJAA 4NO7A 4FWPA 1Z6RA 3EL2A 3H6EA 5AZJA 1KAZA 4J8FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LF5K 4BQZA 3EZ5A 4BG8A 4K8ZA 1B9DA 2YHYA 3NGIA 1C1CA 3KK7A 2FSJA 3H1VX 4B9MA 2IDOA 1YTAA 2OPQA 2P9SB 4KHUA 4OLAA 3NDKA 1X1PA 3G10A 4WFAL 4XH4A 3UKRA 4E19A 1Q82O 1HNIA 2F8SA 3E66A 3HP9A 4JI6K 4B3RK 5M1PA 4QAGA 5C42A 3CPEA 2WTUA 3AAPA 5FLXO 3AARA 3LWLA 3W0LA 1TUYA 1VSEA 4OO1J 2A6AA 4BRGA 3EYZA 2RE2A 1U4BA 4KH4A 4PA1A 4KREA 1RT7A 3TI0A 3WNGA 1XC3A 3O9QA 1VQNN 2F9WA 4CZFA 1NU0A 2F7TA 4W5OA 3DXKA 1L3SA 4CBWA 4DS5A 2XY7A 3A5LC 3U9DA 2UXDK 4X64K 5FRMA 3TTFA 4TSXA 1QZ6A 1VQPN 5LY3A 1X9JA 4IDKA 4NB4A 2HBJA 1IG9A 4BR4A 5C2DA 4KHSA 1BDGA 1ASVA 1HNWK 3CPWM 2ZJPL 2P9SA 2A42A 4AQYK 1NGDA 3M3ZA 1ZBHA 2QA4N 5FPNA 3SBGA 4O4GA 5E41A 1XMQK 3VEZA 3DWLA 2FBTA 3C6TA 4A5BA 3CCUN 1BQMA 2D0CA 3SUQA 4CEFA 2VWBA 3AGRA 4CEOA 4BREA 1I39A 1MWMA 3DOLA 1DKGD 3SPZA 5AQTA 1HNXK 3PX4A 3KLHA 2VG5A 4CFCA 1RTDA 3QB0A 3SJJA 1JLFA 3QEXA 4B1UB 5IT9O 4DQIA 3HVRA 3J8AA 1NOZA 5AQMA 3P39A 1ZBUA 4BRIA 3FE1A 3TSUA 3OYFA 3HYFA 4EP4A 1OH8A 4YDUA 3FZHA 5BRDA 2DFEA 2D0BA 1WOQA 2YHWA 1RDCA 1TKXA 3AVJA 1S72N 2QXLA 2WBNA 2BANA 4IEEA 4H5WA 3RRHA 3KK1A 3MAQA 3ZSQA 1S5JA 2ZF5O 4Z0UA 1WLJA 3NVMA 4DR2K 4CJEA 3SJHA 4YOWA 1SL2A 3G25A 2FF3B 2GUIA 2V7YA 3EKUA 3ITHA 3HPGA 4FLWA 1KAXA 2P9PB 4WCEL 4LF6K 5AQLA 4FLTA 1KSPA 4CD1A 1LW2A 3V6DA 1JLCA 1VQ8N 5EVZA 2QW9A 5JVGL 1VRTA 1S9EA 4QCLA 3ZSXA 5GAEP 1ESVA 3L8BA 4DTSA 1S1XA 4ELTA 3OYLA 2Z1JA 1DT9A 4IJNA 1BGXT 4M45A 4PY5A 1B9FA 2ZJQL 3CF5L 1KVCA 4FWRA 4FW2A 1JLQA 1QS4A 5AQXA 4CJPA 4EHUA 4AM7A 4YNQA 4DU1A 2HMIA 1LV5A 2OYQA 1N32K 1OKJA 3SNNA 4CEQA 4MLHA 3AVMA 4M3ZA 1BI4B 5DK5A 2DTUA 2HBKA 1NK6A 2ZE2A 1JLAA 3EO3A 4BG9A 2ASOA 3WUHA 1HYVA 3IUCA 4O8UA 1VQ9N 5AQRA 4PKIA 1VSDA 2B6AA 2FBXA 4FLVA 1WSFA 2P9PA 3N4QA 4H0YB 1YIJN 4MFBA 4O8KA 5HROA 3SQ2A 1YVUA 1G99A 1S1TA 2HMPA 4FVUA 3SCXA 3NF8A 3VEOA 3THYB 4C8OA 3LZJA 1KLNA 2Z1HA 1VQMN 4FK0A 2RF2A 3SAGA 2F8TA 4FJIA 2E6MA 3ALYA 5JLHA 1EO1A 1T6CA 3AO1A 1RBTA 5AQJA 3LANA 3U3YA 1FW6A 1OH7A 2QTDA 1DEJA 2DPNA 3C95A 3QFUA 4BR9A 4BDZA 5KGXA 1NNEA 3TANA 5EX5A 4YOTA 1BU6O 4B9UA 1EQYA 3ZCMA 3D6RA 4FJLA 2KZZA 3K5LA 4YOXA 4M3YA 5HLFA 1BI4A 1BHLA 4AHUA 2GWKA 4DSFA 4DTJA 3WNHA 2HHVA 1RDBA 1SL0A 5KRTA 3ZT0A 3D0PA 1TAUA 4Z4IA 2G8UA 3VQEA 1NGAA 1VSMA 2QEXN 3O4NA 3MWTA 4I2PA 2XRIA 4DHYA 3NF9A 5C15A 4Z4HA 2YNFA 2IOCA 2HBMA 3LDPA 1VAZA 4LY7A 4A61A 3NBPA 3THYA 3CFPA 3WEEB 4A2AA 2VG6A 2QWPA 1DTQA 3ULDA 4QS8A 1VHXA 2EHGA 1TK8A 4FM2A 1BG3A 5LL6Z 3U9ZA 3K0SA 2VYPA 3IS9A 2XO7A 2PYLA 4DQQA 3RMCA 4EZ6A 3S3MA 4BR7A 4FK2A 1GLEG 2ZGZA 4IDHA 3V9ZA 1YJWN 3ULEB 2BH1A 4IO8A 3V1OA 2G8WA 2Z1GA 2E2OA 4I7FA 4DR5K 5GAHP 2F9TA 3WNFA 4CVNE 4OPKA 3WT0A 3GG4A 2CGLA 3ZSOA 3RMBA 3KK3A 2PAVA 1IKXA 2ASMA 3QIPA 2E20A 2KW4A 4G9ZA 2O8CB 3HM8A 4N41A 4BECA 4BROA 1GLFO 1WSGA 5AQNA 3H3NO 1FKOA 1Z26A 4DTXA 1RNHA 4RW8A 4CZLA 1S1UA 3IKMA 3UE5A 1E4GT 1NGFA 1I3AA 1X3NA 3OTOK 4AHRA 4CK2A 3D45A 4CGHA 4KHPK 3KK2A 3L4IA 3CCEN 3GE1A 3WEEA 3HSCA 3MN9A 1CLQA 3D2FB 2VG7A 1BIUA 4IKFA 3HBTA 3ID8A 4M3UA 4KFBA 1FJGK 4JKCA 1CZBA 5AZJB 3L2QA 1NJWA 1R0AA 3FGUA 3BDPA 1SKWA 4FWKA 2VWKA 2HHXA 3ULEA 4BVPA 4B9SA 3KLEA 4IBNA 3O08A 3ATVA 4JI2K 2YKNA 3CC2N 4W5TA 2E2QA 4KHYA 2P9IB 3EEQA 4CECA 5J2NA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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