1JCMP

Trpc stability mutant containing an engineered disulphide bridge and in complex with a cdrp-related substrate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
MQCVLAKIVADKAIWVEARKQQQPLASFQNEVQPSTRHFYDALQGARTAFILECKKASPSKGVIRDDFDPARIAAIYKHYASAISVLTDEKYFQGSFNFLPIVSQIAPQPILCKDFIIDPYQIYLARYYQADACLLMLSVLDDDQYRQLAAVAHSLEMGVLTEVSNEEEQERAIALGAKVVGINNRDLCDLSIDLNRTRELAPKLGHNVTVISESGINTYAQVRELSHFANGFLIGSALMAHDDLHAAVRRVLLGENKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL-PHOSPHATE SYNTHASE
publication title Stabilization of a (betaalpha)8-barrel protein by an engineered disulfide bridge.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 90
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2001-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
P PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1jcmP00
1OYAA 2ISVA 4DO4A 2XN0A 1FCBA 4PL1A 5LSMA 4O15A 5AHMA 3M7WA 3NL6A 2QCEA 3I65A 2CLKA 1QFEA 3QW4B 3KVMA 1HTIA 3G1FA 4JDYA 1F6KA 4NUWA 2A7PA 4JTKA 4L4LA 3C2RA 3SGZA 1VRDA 4K8EA 2Y62A 5HQEA 1HFBA 4PA8A 4N6EA 5AN7A 4A22A 4DBEA 2VENA 4UXDA 2EHHA 4JNMA 2QF7A 4JX6A 2JKAA 3WJWA 2DU2A 2LLEA 1LTDA 1DJQA 1RQEA 2E6DA 5AYXA 1LROA 1LM1A 1KTBA 3B0VC 5C54A 1YPFA 4Y6GA 4Z1AA 1L6YA 2H90A 3LDVA 3N34A 3NQMA 3FEMA 4O1CA 2GQ8A 1XFBA 3TXZA 5F2MA 3BW4A 1WXJA 4WUIA 1SO6A 2ZRXA 3UWYA 3W7EA 1MZHA 4HKPA 5K9CA 1I2RA 2C3ZA 2BX7A 1TTJA 2RH9A 3KAOA 5HJLA 3LXAA 1QWGA 4UTLA 1OG0A 4YLWA 3PB2A 1J4EA 3O6CA 3R13A 5AHFA 3PSVA 1FUYA 3P5YA 1TV8A 1H7OA 3G1DA 4TX9A 4GFSA 5E1QA 3DFQA 1OFPA 2OZ0A 4NXKA 1I45A 2UV8G 1F6PA 3MHGA 2OJPA 1IXOA 4NNBA 3BGJA 3SW6A 1OFQA 3ABQA 1G4SA 4QITA 3SGUA 1TPFA 2GVJA 4BF9A 1XDMA 2OMAA 2WNNA 3W7DA 1T96A 2Z6JA 4UTMA 5H91A 3TX9A 3NPWA 3W2MA 1EPXA 4LVFA 1JCMP 5D32A 2DZWA 3W7GA 2EF9A 3EWWA 3TC6A 3SR7A 2FFCA 4YCOA 4NVTA 1YLVA 3EWXA 3TU9A 3UWZA 1BTMA 3W76A 4GUGA 3LXCA 4IGHA 1I2OA 3G22A 3HGJA 2W6RA 3A24A 3CWNA 4O8RA 2PCQA 3IIOA 2TYSA 2ABAA 1QO2A 3O63A 3T40A 1H62A 5G4EA 4HHPA 1I2QA 2A1YA 2VFHA 1H51A 2VFDA 3AO0A 4Y96A 5AC8A 5J5DA 3IVTA 3P8JA 1KM0A 2X1UA 3G0UA 1A5SA 5IM51 2Q3RA 4NZJA 2CZ5A 1IIGA 2A5HA 5I3HA 4AF0A 1EB3A 3TROA 3INPA 1KFCA 1Z41A 5LGZA 1IGSA 1EP2A 2WNQA 4LRTA 2YDAA 3LHVA 1W8SA 5FEPA 1XBZA 2NV2A 2ZRZA 3FJLA 4O1AA 1ZJIA 4LWWA 4BR1A 1QOQA 2DORA 2RHGA 4PODA 2NXGA 5KSWA 1QR7A 3CU2A 3O07A 5KINA 4JTTA 1K8XA 4J9JA 4MJMA 2Y63A 2XN1A 4MYXA 4ORIA 2CLLA 4CNOA 4K39A 3S6DA 1LOLA 1DKWA 1ZALA 2NLIA 2QCCA 5CZSA 1SSGA 4R53A 1VYPX 1O5XA 5TIMA 4RJEA 4EIVA 1BWLA 1SO3A 4HPJA 5F1VA 3SFKA 5FF3A 1LBFA 3LHYA 3HPXA 2YFOA 2BLEA 2ZZ4A 3G24A 1H61A 2ZTKA 5LNRA 3NPUA 1UUOA 2TRSA 2VFEA 3PVFA 3W1UA 1H7PA 4JDBA 5I3GA 2OT1A 3L5AA 4LVAA 4ZQPA 3HG3A 1SW7A 3P74A 3FJ6A 4M7SA 2ZZ6A 4GUJA 3SI9A 4I7WA 1VQTA 1FX6A 4OQVA 1ZY9A 1B3OA 1BEUA 3STFA 1F2JA 5HR6A 2ZRVA 2J24A 2QCDA 3W1MA 4BI5A 2P10A 2CU0A 3G18A 4OT7A 4NJIA 4O28A 2CFFA 2FQIA 3RLVA 2V8ZA 3L5MA 3LRLA 3CT7A 5KZEA 2G96A 4O1DA 4NJKA 3VNDA 3NZ1A 1LBLA 4MY1A 2QKFA 3MJYA 4DF2A 1TPDA 1HO4A 3O16A 3OBKA 3KFTA 3PS7A 3W23A 3EX1A 5LHFA 1ME7A 3CEPA 4K36A 1LCOA 1TRIA 4UFMA 1TJRA 5F1UA 2GQ9A 1N8FA 1RR2A 3MI2A 2B4GA 4JS3A 3W1XA 3NEVA 4IPIA 3DHDA 1OX6A 3IIVA 4UCGA 1AL7A 2NUXA 1RQHA 1QO5A 4FIQA 3GNDA 2C1HA 3NL3A 2C16A 1RVGA 2VFIA 1VGAA 4RLIA 4JTLA 4GXMA 4OV4A 4AB4A 1XI3A 4BWLA 4DEFA 4JYEA 2GUUA 4O1BA 6TIMA 3MYPA 3ZWSA 2RDWA 5D05A 4Q33A 3F03K 4JTIA 4EF8A 1OFRA 5D37A 5EL1A 1B4KA 1AMKA 3T4CA 3WJXA 4XTIA 2B7OA 1EWDA 2QDHA 4RXGA 3NPXA 5FEZA 1SFLA 1W54A 5D30A 3W1PA 3G1AA 1A53A 3QSRA 1VCFA 2XFWA 5F2GA 1RPXA 3M43A 3N3MA 4A29A 3PB0A 3UPWA 3PBVA 4GUHA 1OF8A 1AW5A 1SZFA 3OHIA 3QJAA 5D09A 1J5TA 4Z1DA 3M16A 3WK3A 3JRKA 2E1DA 2Y7GA 2FIQA 3VFLA 2OT0A 3W3OA 4FXSA 1KBJA 4K8HA 3C0JA 1JQVA 3NQFA 3L67A 2CLIA 4HNTA 1W3NA 3W7PA 4ZZ9A 4TR9A 3R89A 3GAKA 2YX0A 2DP3A 5DCEA 3BLFA 3B8DA 3W2JA 4Z08A 3NAVA 3PG9A 3W7MA 3CQ0A 1MEIA 3IGSA 4AHQA 2WOQA 1B57A 3UY8A 5D04C 3OVQA 4WZHA 4TMCA 3LTSA 4O10A 5AFDA 1KFJA 1GZGA 3EWUA 1ICPA 2JGQA 2C13A 3IVSA 3QMSA 3NQDA 1KA9F 1QMLA 5DBUA 2H3BA 3KVJA 1D9EA 3KRSA 1BKSA 4IX0A 4ADUA 2FB3A 1K3UA 2ISSA 3B04A 4LVBA 4UFIA 3LHUA 3GAYA 5HWJA 3Q2DA 3TQ0A 2OCZA 1Q6QA 3P61A 5CG7A 1XL9A 4A21A 1VLIA 2E5BA 3GKAA 5TQLA 2NUWA 3DXIA 2KZHA 3NNTA 3NXFA 4UR7A 5MHBA 3PBUA 3LBCA 3WJSA 3N2MA 3VE7A 1W31A 2BXVA 4AWTA 3GVGA 3OVPA 4NU7A 1EIXA 4IJBA 2ZCGA 4PL2A 3PR2A 4ZQOA 4JGDA 1SW0A 1IIHA 1KM3A 3QZEA 1K7FA 1XC4A 3EX2A 4FX7A 4RCXA 3LHZA 3N2XA 4RZ5A 1DBTA 1I4NA 5I3KA 1ME9A 3C3NA 3P82A 2CLOA 1OK6A 1U5JA 4UTJA 5K4XA 1EUNA 2E68A 3DFSA 3LM7A 3LHWA 4UTWA 4UNLA 1Q3NA 2YXGA 5I3IA 4HN4A 1W5QA 2YR1A 4Z1BA 2I14A 4XUGA 5CSSA 1S5TA 1C9DA 1B4EA 2QEZA 4GE8A 3TXVA 2FPYA 1ICQA 3W07A 3C2EA 1KM6A 2YYUA 3EKZA 4GUIA 2AAMA 1KFBA 3W87A 4RZ4A 1WA3A 2HSAA 1DVJA 2R8WA 2CLMA 4IPJA 2WV8A 2FB2A 5FF7A 1YDVA 1W1ZA 2YGYA 4CNNA 1K02A 2JGYA 2RDTA 3GNNA 3W7OA 1O95A 2R14A 2WPBA 4HT3A 3S5ZA 1KM4A 1UJPA 4M6PA 3SY5A 4A3UA 1FWNA 4MPQA 2Z6IA 3W72A 5BOOA 3I6RA 2QUUA 3W70A 5CZ0A 2A4AA 4PH6A 1E51A 1GJPA 1K03A 3S5OA 2JK2A 1FDYA 3LCXA 5CPMA 2D73A 5DELA 1GPWA 4XBSA 1L6SA 5D2WA 5KTLA 3ATYA 3EXTA 1XXXA 1R30A 3A22A 2Y7FA 1SZNA 1WV2A 3CLMA 3LGEA 3ABOA 3TMQA 1TPEA 1F73A 2E5DA 1GOXA 3O6YX 5KZMA 1L6WA 4JTHA 4JTGA 4XWUA 2CZEA 1Z48A 4UFHA 1RQBA 3SSJA 3DZ1A 3PC0A 4QNEA 5KZDA 5HUOA 1I2NA 2QJHA 1F7BA 3OIXA 1G4EA 4BI7A 3GB6A 5BMWA 1OK4A 1TTQA 5D33A 4CQ8A 1AK5A 1OX4B 2E6YA 3DFNA 3KXQA 4H3DA 4Z0JA 2WO5A 3SZ8A 4H6KA 4IXHA 1H63A 2Q8ZA 3G8EA 3C52A 4O53A 4FNRA 4O52A 3RFAA 4LS1A 4Y8FA 2CW6A 3GX9A 2QCHA 3M1ZA 1OABA 1GTEA 2GOUA 3W85A 3HOJA 3S1XA 3C2VA 1FQ0A 4UTTC 3W2KA 4CCCA 3EKLA 3JS3A 3S9YA 1JRBA 3M5YA 1JJKA 2VXNA 2E5CA 1DL3A 1NEYA 1H7WA 4GNJA 3WFAA 3GDLA 4MKNA 3S1WA 3LCGA 4AWUA 4PCFA 3TR2A 3TFCA 3DU0A 4O18A 4RXFA 3E02A 4O0ZA 2H8ZA 5KITA 5CGQA 2EKCA 1RV8A 4G1KA 1ICSA 4O16A 3MO7A 1FCQA 3LBMA 2DZUA 3M47A 1R2TA 3ZR4A 3NDOA 3BK0A 2I1OA 1PCWA 4Q32A 1LLWA 1PIIA 1VC4A 3VE9A 4MY9A 2HS8A 4LVDA 3E9AA 5CKSA 3CPRA 2Y88A 3RMJA 4L4MA 3LI1A 5LKYA 3JR2A 1PVNA 3KHJA 3G8RA 1O4UA 4IUOA 2ZDRA 4FO4A 3HQ1A 3LX9A 3LLDA 3E12A 3P60A 1YTDA 2V9DA 3LHTA 3W2NA 1LORA 5F4WA 4FNSA 2E6FA 3HO8A 1YXYA 1W3IA 3L65A 1GYLA 1KLYA 1NF7A 5J5RA 3QSTA 1HO1A 2C19A 3NQEA 2PC4A 2CLFA 2FLIA 3NL2A 3EWYA 4M19A 3HPSA 4C1LA 2GJNA 4IX2A 1JR1A 1HUVA 3C61A 1NVMA 4JD4A 2I9EA 1OYCA 4TO8A 3G1HA 4JN6A 4CLMA 3EXSA 1PE1A 1DV7A 4KFOA 5K4ZA 1SR9A 3PWAA 4WXYA 4Y9AA 1PS9A 1TJPA 1R2SA 3UWWA 3LB0A 2YW3A 2F84A 4KFPA 4N9DA 4O50A 1LOQA 3L66A 3CTLA 1YDOA 1JUKA 3W7QA 3FKKA 5DLCA 3B06A 4IXXA 1EX5A 5CZJA 2Z1BA 3GDTA 4TIMA 3QYQA 2X30A 2QCMA 3UWQA 4I7VA 3S1UA 3HJZA 3OVRA 3ZWTA 1GT8A 1UASA 4N6FA 4OGZA 2HMCA 1VHNA 3W7JA 4KWWA 2GQAA 4ADTA 2C18A 4DO5A 2FDSA 4X2RA 3R8RA 2ABBA 1FWSA 1ZENA 5G5IA 5G2WA 2H3DA 4KFNA 2NWRA 2CZDA 4MYAA 4GBUA 1VPXA 5K3VA 1MEWA 4CCEA 1O94A 4OU1A 4FNQA 2ATMA 3NZRA 4UMAA 3EB2A 4QIUA 1S5VA 3A5VA 1TYGA 4NNCA 2RKXA 4NJJA 4PEKA 3TSMA 1SPQA 2G97A 4FF7A 3PM6A 5EYWA 3TCEA 2F7FA 1VZWA 4JY9A 1XUUA 1XBVA 4IQLA 1YPIA 1PHQA 4LS2A 3C8FA 3OG3A 4YL2A 5G4WA 1ML1A 3ATZA 1L2UA 2FPTA 1SO5A 4CQ9A 3S5NA 4X9SA 3UNDA 2V82A 3DFTA 2YZRA 1TB3A 3CWOX 4HNNA 3W86A 4A2SA 1SSDA 3W1NA 5HULA 3GDMA 2B7QA 1IXPA 3GDKA 1OFBA 1YYAA 3PAJA 1T99A 3TDFA 4QJ1A 2CLEA 3LCIA 4WJEA 4DBDA 5EPDA 4MIMA 3STCA 4UIOA 5IBXC 1CI1A 2J6XA 4MFDA 3T7VA 4FEZA 3W7HA 2A0NA 3W2UA 1VH7A 1VCVA 1ONRA 2ZQ0A 1LP6A 4O13A 1F5ZA 3EWZA 1R47A 5A5WA 4S1FA 1LOSA 1KLZA 1SU5A 4UTTA 2PRHA 3LV5A 1Q45A 3R5EA 1H5YA 4S2BA 3TKFA 4MZ1A 4X22A 1FDJA 1OFDA 2G5WA 3E49A 4HSNA 2ZZ1A 1OX4A 3I7SA 1THFD 3HGSA 2HTMA 2DZPA 4ZQCA 4N9BA 4LOCA 1H7RA 4MOZA 3ELFA 3C6CA 4LV9A 4XBKA 2R91A 3A5FA 3O1NA 3DFPA 4R7JA 4AWSA 2A7NA 4UTUA 1WAUA 3NQ7A 1K8ZA 2EPHA 3UZJA 3TSBA 2NX9A 3GLCA 3V1PA 1G67A 1AW1A 4Y90A 2QUVA 4FNUA 3TA6A 4MJZA 3I7RA 3BO9A 3L0NA 2QCNA 1ZAHA 1IXNA 2H8XA 3GK0A 1R46A 1IXQA 3QM3A 3Q58A 1QDSA 4JTEA 3FYPA 5K9XA 4BFAA 2A85A 2Y7EA 2ZA2A 3IEBA 3NG3A 5F4XA 4YMZA 1OX5A 2NXIA 1DOSA 3EX3A 3NM1A 4IMEA 2QCFA 4NZFA 1UBSA 3GDRA 4OV9A 1X6UA 4LV4A 2VEIA 1VYRA 4AH7A 4H4IA 5LHEA 3QEZA 3M9YA 1EP1A 4Z1CA 3PULA 3M5ZA 3TJXA 5AC6A 3I68A 5HR7A 2DJLA 3PBYA 3Q94A 5D2XA 3DH7A 3HF3A 3RF9A 3QMRA 3UD6A 3NGJA 4JYFA 1W37A 1G4TA 3IRDA 3S42A 3AJXA 3G3DA 3O15A 3Q37A 1MEHA 2QDGA 2XN2A 4K7VA 3W22A 4LRSA 3W83A 2Y70A 4UMBA 2ZA1A 2B0MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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