The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILKQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
|
| molecule keywords |
ETS-RELATED PROTEIN TEL1
|
| publication title |
Polymerization of the SAM domain of TEL in leukemogenesis and transcriptional repression.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
20
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| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-06-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Z1V A; 2EAP A; 1WWU A; 2JV3 A; 3IDW A; 2K4P A; 2QAR A; 2KIV A; 2DL0 A; 3HIL A; 2QAR B; 5KNI A; 2KSO A; 1X40 A; 4PZO A; 5JU5 A; 2F3N A; 1V38 A; 5L1M A; 1SV0 C; 4MHV A; 2Y9U A; 3H8M A; 1KW4 A; 2LPE A; 2KSO B; 2YTU A; 3BS7 A; 2QB0 B; 2ES6 A; 3TAC B; 2F8K A; 1SV0 A; 4RQN A; 1B4F A; 1PK3 A; 1X9X A; 1COK A; 2E8P A; 1F0M A; 2KG5 A; 2DKZ A; 2FE9 A; 2B6G A; 4NJ8 A; 3KKA C; 2DKX A; 2KMD A; 1JI7 A; 1WWV A; 1OW5 A; 2GLE A; 1SXE A; 3KKA A; 5JRT A; 1SGG A; 2K60 A; 3K1R B; 2EAM A; 1SV4 A; 2E8N A; 1PK1 A; 1DXS A; 2D3D A; 2D8C A; 1PK1 B; 2EAN A; 4RQM A; 2E8M A; 1OXJ A; 2LMR A; 1UQV A; 2QKQ A; 2KE7 A; 1B0X A; 4NL9 C; 4IS7 A; 2E8O A; 5JTI A; 1V85 A; 2ESE A; 1SXD A; 2Y9T A; 5J8Y C; 1LKY A; 3TAD C; 1UCV A; 1X66 A; 2QB1 A; 4NL9 A; 4PZN A; 2EAO A; 1RG6 A; 3SEI A; 3BS5 A; 3SEN A; 2QB0 A; 1LKY B; 5J8Y A; 3TAD A; 2F44 A; 2L5Y A; 3BS5 B; 5F3X B; 3BQ7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5FP0 A; 5KFP A; 2ZIV A; 2AGQ A; 2AQ4 A; 5AKY A; 4ELU A; 2MU2 A; 3ISD A; 5KG6 A; 1HEK A; 1DK3 A; 5IIO A; 2QAR B; 5KNI A; 2PKE A; 5AIC A; 4U6P A; 4J9O A; 1KW4 A; 3CNH A; 1Y88 A; 3IP4 B; 2YTU A; 4DFM A; 1ZQI A; 3N7R C; 2QLT A; 4J9M A; 3GIM A; 3ZDC A; 2FLL A; 1X9X A; 1U4B A; 1NKC A; 1ZQP A; 4NLK A; 4RNN A; 2DFL A; 3RJG A; 4PHD A; 2YMM A; 3KHH A; 1N2X A; 2MAX A; 4YG2 A; 2KK0 A; 5HMM A; 3Q8S B; 3I76 A; 2FJ6 A; 1KEJ A; 2ZXH A; 4U7C A; 1A0P A; 2FDR A; 1QH9 A; 8ICE A; 2PI4 A; 1MN8 A; 5TZV A; 4RQ0 A; 4Y2Q A; 4NLZ A; 4CGZ A; 5JRT A; 1DGJ A; 2I6X A; 2K60 A; 4QWA A; 1KN5 A; 5CR0 A; 5AKI A; 3SMV A; 4ED8 A; 5IIK A; 4F5N A; 1CUK A; 4PJ0 U; 1IIP A; 3GU3 A; 8ICQ A; 4Y2P A; 1N63 A; 1T4G A; 2RLT A; 2P66 A; 2EDU A; 3PY8 A; 1B0X A; 4DLE A; 1XNS A; 2HHU A; 2FPL A; 5HNK A; 4YP3 A; 3MC1 A; 2PFQ A; 4OD0 A; 7ICI A; 4DF8 A; 4JWN A; 2E1E A; 2A1J B; 1SL2 A; 2EZX A; 4RUC A; 5DB7 A; 4YXM A; 1CEZ A; 3UM9 A; 5GTH U; 1K5O A; 3V7L A; 4PHP A; 4P0P B; 5KL1 B; 1XU4 A; 1B43 A; 3T5H A; 3JPT A; 3N28 A; 3C1Y A; 1Z4O A; 2B0C A; 4ECW A; 2BCR A; 1RDF A; 3OHA A; 3M8R A; 1COO A; 3TAN A; 4CF4 A; 4J9K A; 4KX5 A; 2AH5 A; 3ETR A; 2H3I A; 8ICO A; 2KSO A; 3GII A; 5JU5 A; 1N61 A; 5D49 A; 2WAQ F; 3UXP A; 2UVU A; 2LPE A; 4KIT B; 2R8J A; 1T7P A; 4RPZ A; 2P35 A; 3BZC A; 4QZH A; 3RJJ A; 1SV0 A; 4QW8 A; 5KG7 A; 4I2D A; 4NM1 A; 4ICA A; 1FO4 A; 1KBU A; 2JR5 A; 2NRZ A; 5AKG A; 4RU9 A; 3UQ2 A; 5BPC A; 4ACO A; 1D8B A; 4TUP A; 2JEG A; 4QZE A; 1FIQ A; 1VJ5 A; 2IOF K; 4ECQ A; 2KHQ A; 4RNO A; 1S9F A; 4UBC A; 1N5X A; 1YZ7 A; 3ISC A; 1RPL A; 1TKD A; 4F2S A; 3RJF A; 1SGG A; 3QU2 A; 5AK6 A; 2XIC A; 3PX4 A; 4CNQ A; 3SAH A; 5AKX A; 1UPH A; 2D8C A; 3V72 A; 3QU9 A; 3PW2 A; 1GO3 F; 3KBB A; 1WUD A; 4CDG A; 4ECV A; 5KG1 A; 4MF2 A; 5AKL A; 3RB4 A; 3C28 A; 4UB1 A; 2M9N A; 3QZ8 A; 3LYS A; 1ZQJ A; 3WK8 A; 5BOL A; 2JGA A; 9ICR A; 3IM1 A; 3RBD A; 2WB1 C; 3TAD A; 1S0O A; 3UPQ A; 4KN4 A; 2W9C A; 3I28 A; 5ALH A; 4I2C A; 5KFZ A; 2KJ5 A; 4YMO A; 4UB4 A; 2QAR A; 2JZB B; 3ZI4 A; 2FMS A; 2DL0 A; 2Z7J A; 4QJF B; 5AHX A; 4R63 A; 3ZDD A; 3O0F A; 3HP6 A; 1SWV A; 2EZZ A; 4YCX A; 3F2B A; 2BKE A; 4Y2S A; 4KLL A; 4KTQ A; 1SKW A; 2BR0 A; 3TAR A; 5H2F U; 5J0X A; 1ZET A; 1ZXI A; 1QSY A; 4BWM A; 5AI6 A; 2IMW P; 3Q8K A; 1FFV A; 1ZD3 A; 5AIA A; 1OUQ A; 2DPI A; 8ICX A; 2B6G A; 4Z6D A; 3KFU F; 2HHV A; 3EPI A; 4AP9 A; 5HP4 A; 3WK5 A; 5AI4 A; 3D2N A; 3SD7 A; 3NVY A; 3QX7 A; 3OJU A; 7ICN A; 4IR1 A; 2HBJ A; 4R8U B; 3SZ2 A; 3NVV A; 4ECU A; 2NRV A; 4F4X A; 4F4Z A; 4DWI A; 2ZXI A; 1JX4 A; 4MEY A; 5KAI U; 3PR5 B; 3PZP A; 1L8L A; 4F8R A; 2LMR A; 1BPY A; 2KE7 A; 3RJH A; 3N7P D; 2A1J A; 4J9S A; 1SWW A; 3WKE A; 2E8O A; 4I2E A; 1KRP A; 4I2H A; 5ALS A; 2YX8 A; 1UCV A; 3KHG A; 4G9B A; 4M6W B; 4RQ1 A; 2IOF A; 3S6J A; 4IRD A; 3GV8 B; 2V4R A; 9ICS A; 2OWO A; 5KFM A; 4Q8E A; 1BPX A; 1WCL A; 2ZIW B; 1VLB A; 3K4G A; 5EE9 A; 1LVH A; 1RXV A; 1S97 A; 2J6S A; 4RQ6 A; 3FAH A; 5AM3 A; 2LKY A; 1TAM A; 4EZ6 A; 4QIW F; 5J0R A; 2JXJ A; 4KMO B; 1UA1 A; 2KJ8 A; 3BQ2 A; 4QZC A; 1IM4 A; 1ZJM A; 1NZP A; 2W04 A; 8ICA A; 5BOM A; 1KFD A; 2DQN B; 3C21 A; 3ORY A; 4LZD A; 8ICY A; 2JRZ A; 3Q8M A; 5C0Y A; 2LI6 A; 5IIM A; 3VC8 A; 2LM1 A; 2OCE A; 4DOC A; 3EUB 2; 4R66 A; 3IRU A; 3LVV A; 1ZQL A; 1ZQO A; 3NRW A; 3RJE A; 4FBU A; 2KVS A; 4UB6 U; 4YN4 A; 2Y1J A; 1LV5 A; 1D8L A; 5KG3 A; 2KZM A; 4AYB C; 2GOL A; 1ZQE A; 3PSF A; 5ALR A; 4FO6 A; 4C4R A; 5J2H A; 4UW9 A; 5ALE A; 3BDP A; 3FM9 A; 3G6V A; 1X9M A; 1Q46 A; 3JPO A; 5J8Y C; 2XID A; 1X66 A; 1SIJ A; 2R8H A; 5D46 A; 1V97 A; 4ECY A; 4C0Z A; 5KFV A; 4ECX A; 4YR3 A; 2KNJ A; 4ED0 A; 5AK5 A; 2KV2 A; 7ICF A; 2L5Y A; 8ICV A; 4O3M A; 4IR9 A; 2WFA A; 2EAP A; 1X42 A; 2JZB A; 3H4B A; 1XS9 D; 2IHN A; 1NNL A; 5KT6 A; 3HIL A; 5J0O A; 4DQS A; 3HKZ C; 4FE3 A; 2HOQ A; 9ICI A; 4MFF A; 4EYI B; 5EE1 A; 4EEN A; 4B9M A; 4PPX A; 3TAC B; 5KT2 A; 1L7N A; 4DSJ A; 1B4F A; 4BWJ A; 3C23 A; 2R8G A; 2W7P A; 1L7M A; 4DQP A; 4KLF A; 2W03 A; 4YR2 A; 8ICK A; 4DFK A; 4C8M A; 1ZQA A; 5GTI U; 3B0Y A; 1VDV A; 4US9 A; 2W9A A; 4LVS A; 2BCU A; 3ISB A; 4UAV A; 7ICR A; 3PO5 A; 2EQY A; 1IG6 A; 1U47 A; 2LYH A; 4O9M A; 2XCA A; 2W3R A; 4QNL A; 4C8L A; 2NRW A; 1DRG A; 4FZM A; 2NRT A; 4Y2Y A; 1ZQZ A; 3GIK A; 5EWG A; 4QZG A; 3DDH A; 1K1S A; 2VIX A; 4UAT A; 3F5E A; 4M9N A; 2HHX A; 4QW9 A; 2UVV A; 7ICK A; 2HHT A; 5AKH A; 4F4Y A; 5AI8 A; 4US8 A; 1T94 A; 1PVR A; 1ZQR A; 2XCP A; 1TAQ A; 3SAF A; 3PSI A; 3QU5 A; 4NL9 C; 1U49 A; 3T5J A; 2NO5 A; 2K4E A; 3BQT A; 4EYH B; 4GFJ A; 4M6W A; 2PFN A; 2JEJ A; 4M2Y A; 3PR4 A; 3M6Z A; 2EAO A; 1WCN A; 2ZIW A; 3SEN A; 2PI5 A; 1TFR A; 2F2A B; 2F44 A; 3F2C A; 5ALP A; 2W54 A; 5AKZ A; 1WWU A; 1NK0 A; 3V7K A; 3LVW A; 4QZ9 A; 2BDU A; 3GIL A; 4X5V A; 2BGW A; 4DF4 A; 4J03 A; 9ICP A; 4ED7 A; 4KLQ A; 4K4G A; 2ZIX A; 5J2J A; 1Z3E B; 2ZTD A; 1S77 D; 1PZN A; 3RF9 A; 2IOH A; 2WAQ C; 4QZD A; 5DLG A; 4DL7 A; 3GDX A; 4JV0 A; 2FMQ A; 4IQV A; 3EYZ A; 2W9C B; 4ED3 A; 4B9L A; 3HPO A; 1TK0 A; 5ALJ A; 1UA0 A; 2WF5 A; 2RHF A; 2FPK A; 4F4W A; 4B9S A; 1NK4 A; 4TUS A; 3M1Y A; 2JH1 A; 2KJ9 A; 9ICQ A; 7ICP A; 1XSL A; 4QWD A; 4LJX A; 5J0P A; 3AM9 A; 2RDI A; 1RXW A; 3ZDE A; 2KKP A; 4GC6 A; 5J2D A; 1JI7 A; 1OW5 A; 5EE3 A; 4KLI A; 1TVA A; 1ARO P; 3AU6 A; 3K1R B; 2UVW A; 5AI5 A; 4P0Q B; 4FFD A; 3WU2 U; 3EWA A; 1OXJ A; 3MDC A; 2BZF A; 2A3V A; 5L1I A; 4IS7 A; 2K89 A; 4DSI A; 2BCQ A; 4CF3 A; 4DCC A; 4Z6C A; 2KP7 A; 4UB5 A; 2IA6 A; 2LBO A; 5IIJ A; 2WF6 A; 4PL1 A; 3CP8 A; 4BXO B; 1RQL A; 3UMB A; 1O03 A; 3SYZ A; 2HI0 A; 3ZD8 A; 3JPR A; 4M0A A; 4JV2 A; 8ICF A; 2EH9 A; 3B0X A; 4ELT A; 4EBD A; 4BDP A; 4Y2U A; 4KLH A; 4DQR A; 3KHR A; 3MGH A; 2KIV A; 2KVC A; 3T5K A; 1ZRM A; 4B9U A; 4IRC A; 2W9M A; 4M9J A; 4PH5 A; 4MHV A; 3T3F A; 1ZQC A; 5CB1 A; 1S10 A; 3F5A A; 4M9L A; 4BX9 C; 4CCH A; 3N4M B; 1N60 A; 9ICL A; 4OJ5 A; 4KLG A; 1PK3 A; 4O5K A; 4RQ4 A; 3OJS A; 2RRD A; 2WF7 A; 2HOI A; 5DG9 A; 1N56 A; 5ALM A; 1SL0 A; 3M9M B; 4Z6F A; 4M9H A; 3MAB A; 4C8K A; 2FE9 A; 4G3I A; 5K4L A; 1H38 A; 3RB3 A; 5AKE A; 2KIC A; 7ICS A; 5DDM A; 1Z00 B; 3SQI A; 4KLT A; 3Q8P B; 3EW9 A; 3K75 D; 4OCZ A; 9ICJ A; 3EPG A; 3F53 A; 4YXJ A; 5DDY A; 3T79 A; 1K1Q A; 2D3D A; 2KTQ A; 3ZDB A; 4F91 B; 3AQE A; 4ZOH C; 5ALK A; 4EBE A; 4DQQ A; 2KIW A; 4O3N A; 2HBK A; 4QWC A; 1F5S A; 1Q3U A; 5JTI A; 5DBC A; 1L3U A; 3H7I A; 5ALU A; 2ODG A; 1SXD A; 2VAN A; 4ECZ A; 4MEX A; 3E2E A; 3OTQ A; 3PML A; 2HSZ A; 8ICU A; 9ICT A; 4UAS A; 5IIL A; 1XSN A; 2OEH A; 1S0M A; 4DO9 A; 1AQ6 A; 1ZRN A; 4FZN A; 2BCS A; 4NLB A; 5L1J A; 3KTQ A; 4OO1 J; 4I28 A; 5ALO A; 4QIW C; 1NJW A; 5J2A A; 9ICA A; 3GZF A; 5CA7 A; 4GLX A; 3H8M A; 1NK5 A; 3A0H U; 2BQ3 A; 5DG8 A; 9ICX A; 1ZQB A; 3NUQ A; 2PMZ C; 4QZI A; 4K4I A; 3H0L B; 1COK A; 2VA8 A; 4DFP A; 3V6K A; 1JMS A; 2HVH A; 3RB0 A; 3JPQ A; 2J6T A; 9ICU A; 5KFK A; 5KFG A; 4ECR A; 3RBE A; 4IQW A; 3RRH A; 9ICN A; 4J9Q A; 3PMN A; 3TAQ A; 3MR6 A; 5DB8 A; 3T5L A; 3HWT A; 4OJO A; 4B9V A; 4ED2 A; 4YD1 A; 2ZTE A; 1ZJN A; 3GV7 B; 4RQ5 A; 2G5I B; 1BVS A; 5KFY A; 4C4S A; 5ALD A; 1NKE A; 2NV3 A; 2HBL A; 4P2H A; 4P0Q A; 1RYS A; 5HHI A; 2D6F C; 2JEI A; 1Q8K A; 2E8N A; 1EXN A; 3Q8L A; 1TK8 A; 2XO7 A; 2FPM A; 5EOZ A; 3ONN A; 4LZG A; 1Q3V A; 5KFA A; 9ICB A; 2DPJ A; 8ICL A; 3OPX A; 4O5C A; 2QKQ A; 7ICU A; 2K4I A; 4XQ8 A; 3D2Q A; 3QXG A; 4NXZ A; 3QUQ A; 4BXO A; 4O3P A; 4OJP A; 4Y2X A; 4CRX A; 1RG6 A; 3E0F A; 5J8Y A; 2ZJ8 A; 1TK5 A; 2YB1 A; 4DSL A; 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2I5H A; 5KFQ A; 1ZQH A; 5HR6 A; 4B9N A; 1JIH A; 3KZI U; 2JV3 A; 4PHE A; 4Q43 A; 2XY5 A; 4MFC A; 7ICL A; 4Y2T A; 4DFJ A; 4KLD A; 2G09 A; 4RQ2 A; 4KLO A; 2K8A A; 1JRO A; 2HHQ A; 8ICM A; 1S0N A; 1RYU A; 1NJZ A; 4EBC A; 2F8K A; 1J97 A; 1MC8 A; 2F1H A; 1NJX A; 4QWE A; 3OSP A; 3IHQ B; 3QUC A; 5KG2 A; 8ICS A; 4TQS A; 4F5O A; 5KFN A; 1DK2 A; 2LM4 A; 3Q8R B; 4MF8 A; 4RPX A; 4Y2V A; 1RZT A; 2KFN A; 2H3Q A; 3QE9 Y; 1N48 A; 4F5P A; 2KMD A; 1A77 A; 8ICH A; 3GQC A; 1L3S A; 3PW4 A; 3TKA A; 2EAM A; 2H3V A; 4BUG A; 3PW7 A; 1QTM A; 2YN4 A; 3C5F A; 4ECT A; 3ICX A; 5F9L A; 4I2F A; 4RZR A; 3LWM A; 1PK1 B; 2EAN A; 5KFL A; 1JXL A; 3V6J A; 2H3F A; 1JXE A; 3WK6 A; 3U26 A; 2RP5 A; 4JWM A; 4C8O A; 4RT3 A; 2BHN A; 1KLN A; 2VA3 A; 3KHL A; 2M0N A; 2EZY A; 4ZH4 A; 4UQG A; 2OXO A; 2K8B B; 4DSK A; 4Y2J A; 1NK7 A; 3F2D A; 2N1R A; 2H5X A; 5J2E A; 1UT8 A; 2W9B B; 1XC9 A; 3BS5 B; 3RR7 A; 5F3X B; 2I9G A; 2W11 A; 4KLE A; 1KSP A; 4O0I A; 1KTQ A; 8ICP A; 1CI4 A; 2KHV A; 5ALG A; 1HIW A; 2ZUD A; 5J2I A; 5TIS U; 4O3R A; 2Y9U A; 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