The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
40
|
structure length |
40
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Chain Sequence |
TITEWSVNMYNHLRGTGEDENILFSPLSIALAMGMMELGA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
NEUROSERPIN
|
| publication title |
Crystal structure of neuroserpin: a neuronal serpin involved in a conformational disease.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
8
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| structure length |
40
|
| sequence length |
40
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-07-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix hairpin bin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M93 A; 1JJO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1FXK B; 1Z2G A; 3F5T A; 1M1K W; 3SJC C; 2ATK C; 4X1K B; 2N74 A; 3LNN A; 2KG7 B; 3KCX A; 1BQZ A; 3K5O A; 2JJ1 G; 4B3S B; 2BTQ A; 5KHI A; 3E22 B; 3A0B Z; 4AIL C; 4JI1 B; 3AG3 C; 1N8R W; 3CXC U; 4P30 A; 1MA1 A; 5D5P A; 1GN3 A; 2IW5 A; 2PY5 A; 2QWN B; 4FLV A; 3FAV B; 2W6I G; 1H38 A; 4JI4 O; 2VWK A; 3W7W A; 2EIL B; 1OZ0 A; 1PL0 A; 3ZHT A; 2H3O A; 2WLJ A; 2WPD G; 4NKG B; 5IYZ B; 3N2G B; 1GH6 A; 1YIJ V; 2W0F C; 3ZS8 C; 5BR8 B; 5ITZ A; 3SPJ A; 3H1H H; 1JQ0 A; 1ZSP A; 1R3I C; 3JD1 A; 4FIP C; 2A3Q A; 4Z1V A; 3ETG A; 2X6A A; 3DXR A; 3K3W A; 1JVM A; 2UXB O; 1VF6 A; 4H37 A; 4YHH B; 2ZDI C; 3K5L A; 5JCO C; 2X6C A; 2QWO B; 3SPI A; 4H44 B; 2IJK A; 2CAZ C; 4DV2 O; 2CGN A; 4DK0 A; 4IT5 A; 4JTA B; 2VQF B; 3ZRW B; 4WFG A; 5H6Q A; 2HVJ C; 2YI8 A; 3A0R A; 4UUJ C; 5CBH A; 5KHJ A; 2UUC B; 3OR6 C; 3ASO C; 3N2K A; 1K9M W; 1PV0 A; 4LR3 A; 5IE9 A; 5B1A C; 4X1Y A; 1TVK A; 3ABL C; 3BA9 A; 3CYO A; 4OPA A; 4FZ0 A; 3JAM N; 3ABU A; 1I7F A; 4LWS A; 2WLI B; 5LL6 Y; 1XHX A; 2ZE6 A; 3L71 H; 1XMO B; 2DJV A; 5J2T A; 3JD0 A; 1J5E O; 3AK3 A; 1OCR B; 5KA5 A; 1IXB A; 2HHH O; 2P4V A; 3LSS A; 4J7J A; 3X2Q C; 1B06 A; 2R72 A; 4JYA O; 2JJ2 G; 1VF6 C; 1K5S A; 4MW8 A; 3W7T A; 4NYK A; 3RVZ A; 2JDI G; 1PNL A; 2A79 B; 2UXB B; 2PI4 A; 4R7C A; 3SPC A; 4B7K A; 1PPJ H; 1JPX A; 2EJ7 A; 3R65 A; 4G2K A; 2JGD B; 2Z5U A; 4X66 O; 1K97 A; 3A2F A; 1TA8 A; 4PI2 A; 3I5D A; 4IHJ B; 3U11 A; 1NS1 A; 3L75 H; 5GTI Z; 4JI7 O; 4DV7 O; 1M9N A; 5LXT A; 3SYQ A; 1YSC A; 2N05 A; 5KMG B; 3F7V C; 4TUY B; 4UXN A; 3IC9 A; 3ZHR A; 1ZWI C; 4JAA A; 4JV5 O; 4CH6 A; 2IU0 A; 1V55 B; 4JYC A; 1P4R A; 4PA3 A; 2HJF C; 2ZIN A; 4LFB B; 2JS3 A; 3CCL V; 3UO3 A; 1CPY A; 3K06 A; 2JK5 C; 1H2S B; 4N23 A; 1JOY A; 2XTA A; 5FLX N; 4GYC B; 4LF8 B; 2YEV A; 4JI0 O; 1H2N A; 1S5J A; 3FKS G; 5L3D A; 1K73 W; 4QJF B; 5LMN O; 1D5N A; 3CCM V; 1IBL B; 3FB8 C; 1G6U A; 1YCI A; 3E86 A; 3FYI B; 2M6Y A; 3VQX A; 5JJN B; 1BS3 A; 2QGN A; 2GTA A; 1X4T A; 4EB6 B; 3OUF A; 3JAL A; 1IUR A; 3AG1 B; 1VQP V; 2GUZ A; 4YY3 O; 2QKS A; 1YJW V; 4PD4 F; 3AG4 B; 4X9Q A; 1LR1 A; 4A5U B; 3M8A A; 3OEH G; 4DV5 B; 4YJ3 B; 1KP3 A; 5CBF A; 2A7W A; 5LP6 B; 4JTD B; 3RVY A; 2A9H A; 3AG2 B; 1EZV H; 1HNW O; 3ZCC A; 3FYE B; 2AGA A; 3QO7 A; 2VQE B; 4ZI7 B; 3MAQ A; 1WP7 A; 2Q4P A; 2HP8 A; 2LW1 A; 4EKW A; 3O9O A; 4YIO A; 2E5L O; 3G4S V; 4AQY B; 2Q73 A; 5KX5 B; 2RQ6 A; 4U3J A; 2CTR A; 5J2U A; 3RYF B; 1Y76 B; 3G6E V; 4IYH A; 1KU9 A; 2DYR B; 2YXL A; 4WFE A; 1IXM A; 3W7U A; 4LCU C; 3OTO O; 1RFY A; 1BMF G; 4JI0 B; 1QQC A; 4LF5 O; 5BMV B; 1OV9 A; 3APQ A; 2Q9L A; 4X65 O; 4WF9 V; 5A9G A; 3S3W A; 3CD6 V; 1HNX O; 4DV6 B; 1LUW A; 4DYL A; 5H6R A; 2UU9 B; 3SJQ C; 1V54 C; 2B1I A; 5H5N A; 3JAW A; 4JI8 O; 3RBZ A; 1S3J A; 4TQD A; 3ZMS A; 4KXR A; 4PEL A; 2EIN C; 2YUA A; 1TUB B; 3RYC A; 1DK1 A; 4NXM B; 5EBM C; 4X1I B; 3CRA A; 3KKY A; 2WLK A; 4X20 B; 1FKA O; 4D6T H; 4XDK A; 2XAS A; 3WB1 A; 4B3M O; 1R3J C; 5DM6 V; 4Q20 A; 1SKV A; 5B3S B; 3DC5 A; 1M57 B; 1XMQ B; 1I94 O; 4JAV A; 2DYS C; 3CS5 A; 1JFF B; 1N32 B; 1K34 A; 2R9I A; 1BHA A; 3CCS V; 1VQ7 V; 1IZ3 A; 2EZP A; 2UXN A; 1FXK A; 2ZIO A; 2V7Q G; 3AK1 A; 5B1B B; 2ZNJ A; 2UUA B; 4ZHQ B; 1OCZ C; 4X1K A; 1EZJ A; 2KG7 A; 3E8G A; 5IWA B; 4DR3 B; 1QVF U; 2HFE C; 2V4D A; 1AI7 A; 1VQ6 V; 4N21 A; 2YSU B; 4CH4 A; 3E22 A; 3E83 A; 1JCH A; 1K33 A; 1US6 A; 1K3E A; 2K1E A; 2YIA A; 5IYC O; 3M99 B; 3FAV A; 4DR2 O; 4X62 O; 1NH2 B; 1QLE C; 1WAZ A; 2UUB O; 2CTQ A; 1QNM A; 4L8J A; 2DN9 A; 3ZED A; 3SYA A; 5IYZ A; 3N2G A; 1JX9 A; 2P22 C; 3RN4 A; 1XEQ A; 4PHZ A; 5K1X A; 4GUN A; 4UCV A; 3QO5 A; 4DUY O; 2EZO A; 4EFE A; 5LXT B; 3ZN1 A; 3N27 A; 3QO8 A; 1B04 A; 2NR5 A; 3B77 A; 1UPG A; 3G67 A; 2WAM A; 4FLU A; 3CP1 A; 5EYP B; 3ZHQ A; 1FXK C; 2ILM A; 4UCS A; 1FD9 A; 1E1Q G; 3AG7 A; 1XQ8 A; 4NXN O; 2F1M A; 3ZRW A; 3F5W C; 2PYL A; 1VP7 A; 4YIP A; 4RQF A; 2ODM A; 1YIT V; 1HNZ B; 1NZ6 A; 2QR4 A; 5A2Q N; 3JSL A; 2P7T C; 1VQ8 V; 1VQO V; 4PA6 A; 1WP8 A; 3K5N A; 3FX7 A; 5CA1 B; 3J7A U; 4Q6G A; 5LMU O; 5JJJ B; 2EIL C; 2XAH A; 2CTP A; 2P6J A; 5H9C A; 1GM7 A; 2WA3 A; 4G28 B; 1W2B U; 2QWQ B; 4O2B B; 4JI2 B; 5KHK A; 2LW7 A; 2WLI A; 4KHP O; 5L3G A; 1AR4 A; 2DMX A; 2PTM A; 1K7D A; 2LQT A; 1G8M A; 3ABM B; 4JZG A; 1XHZ A; 1COW G; 1SF9 A; 4JYB A; 2GV9 A; 4DR1 O; 3TK1 A; 4JI5 B; 4DR7 O; 5EC1 C; 2IH3 C; 4JAU A; 2JRI A; 1IBK B; 1WPB A; 3OM3 B; 3T1H O; 4O2A B; 1ZUQ A; 3SPG A; 2CE4 A; 3W7X A; 1FFX B; 3CPW U; 2JGD A; 2Y0P A; 3MDS A; 4IHJ A; 4J7Z A; 5AG2 A; 4WFA V; 5KMG A; 1LUV A; 3BVO A; 4FJC C; 1KKD A; 4TUY A; 1FAF A; 2FYU H; 1P49 A; 4B3S O; 3CCE V; 1GN2 A; 1Q86 W; 4ABM A; 1KBH A; 2EX3 A; 2OCH A; 3FB6 C; 3CCV V; 4LFA B; 4JI1 O; 1KD1 W; 2CUG A; 4PDM A; 2XAF A; 4JGS A; 3U10 A; 4LH6 A; 4LBE C; 3RFR A; 4IYI A; 1GAX A; 2FKX A; 4R50 A; 4YJ2 B; 1L1F A; 1KUQ A; 1NR7 A; 2Q8V A; 1MZE A; 4LF9 B; 1F4N A; 1AP6 A; 1CP9 A; 5KUM A; 1GTO A; 1ZLZ A; 4FMT A; 3A0H Z; 3ZN0 A; 1D2D A; 1OCC B; 3UM7 A; 5JVD B; 4EB6 A; 2P4K A; 1RP3 B; 5LHI A; 2VWJ A; 5BR8 O; 2PZS A; 1H8H G; 1YEW A; 2YIC A; 4X64 B; 4XBF A; 5EIB C; 3LSU A; 2HG5 C; 1F7Y A; 2LGQ A; 1AR1 B; 1XOU A; 3T1H B; 2OTJ V; 2ARH A; 3RWR D; 4YJ3 A; 2E75 B; 1O9G A; 4MVZ A; 5LP6 A; 1NI8 A; 3I56 V; 1GM9 A; 3OUS A; 2RDC A; 3SYP A; 2VQF O; 4ZI7 A; 4J7K A; 2A06 H; 1MOF A; 4K8Z A; 1Q6H A; 4PDL A; 1V55 C; 2CK3 G; 5KX5 A; 1FYJ A; 1F4M A; 4I7Z B; 2UUC O; 3B40 A; 3RYF A; 1Y76 A; 3K5M A; 1FJG B; 1AJQ A; 1BCC H; 3D3I A; 4FM2 A; 4IIJ B; 4IL6 Z; 5BMV A; 3EHB B; 3RYI B; 1BHB A; 2RNB A; 3ABT A; 2DW4 A; 3OGC C; 3HKB B; 5C93 A; 2QSA A; 4CS4 A; 1XMO O; 4LF7 B; 2F95 B; 1N33 B; 2Q0O C; 3CCR V; 3P3N A; 3JAR B; 1JR9 A; 1URF A; 2ZNI A; 2ZXW B; 3AG1 C; 4PA9 A; 4MSW C; 3B09 A; 4CS2 A; 1TUB A; 1QHT A; 3AG4 C; 1ZTE A; 2OYQ A; 3AK2 A; 4ZIB A; 4MTF A; 1BZK A; 1ZL8 B; 3I55 V; 5LP6 C; 4X1I A; 4CH5 A; 2V1D A; 3ETQ A; 3AG2 C; 4X20 A; 2ZE7 A; 3QG5 A; 1I5Y A; 5CMU A; 1R6T A; 4CH3 A; 1WNS A; 3K03 A; 2QKA A; 1XNR B; 4MW3 A; 1VQM V; 1R3K C; 1JFF A; 5JQG B; 1ROP A; 2DYR C; 2YIB A; 1NTM H; 1BQ0 A; 4I9W A; 5LGT A; 5IJ0 B; 2FTK A; 1K8A W; 4UCO A; 2UXC O; 4ZHQ A; 4LFB O; 2HVK C; 5B1O A; 2QDO A; 2QM7 A; 1Q81 W; 2X6B A; 2JS5 A; 4C7U A; 4LF8 O; 1BGY H; 4O4H B; 2OTL V; 2RJZ A; 4MTX A; 1TGO A; 3UT5 B; 1DF4 A; 1NR1 A; 4LF4 O; 3IC7 A; 2N04 A; 4HNA B; 1IBL O; 4FLX A; 4FM1 A; 3CC4 V; 1YTF B; 2GBO A; 3HKD A; 4H13 B; 4B7E A; 4IGG A; 1XBL A; 1SQB H; 5LGU A; 1S0V A; 1O9H A; 2QJ1 A; 4RQE A; 3CB2 A; 4ZOL B; 5EBW C; 1RSO B; 4DV4 B; 2LFS A; 1IX9 A; 2XUM A; 2YC0 A; 4DV5 O; 5B3S C; 1M57 C; 3LDE A; 2ZE8 A; 3A8T A; 1MNG A; 4GCZ A; 3E8F A; 1KB9 F; 2AHZ A; 2RMK B; 3H1L H; 5TIS Z; 4F4L A; 2VQE O; 2BOB C; 4GKK B; 1Q90 D; 1SQF A; 4DV1 B; 3B4S A; 3G80 A; 1NBM G; 2W0X A; 5EYP A; 4AQY O; 5B1B C; 2ITD C; 1YI2 V; 3JD4 A; 2WLL B; 4DUZ B; 3CMA V; 1GN6 A; 3OW2 U; 3SJA C; 2UXC B; 2F66 C; 4GX1 A; 1ENV A; 4KUM A; 4AHC A; 1ORQ C; 3DC6 A; 3E8B A; 1H2G A; 3QNE A; 1Q8I A; 4O4I B; 4LF4 B; 2Y48 A; 2QM4 A; 4K3A A; 3ZRS A; 4DV6 O; 1XRE A; 5CA1 A; 3JSN A; 2UU9 O; 3SYC A; 5CA3 A; 4WCE V; 5LA6 B; 4O2B A; 3SGI A; 2MK3 A; 4UB6 Z; 1QBZ A; 1M5I A; 3K59 A; 3KZI Z; 5LYJ B; 1YJN V; 1S5H C; 2LJ2 A; 4NXM O; 5EBL C; 4X89 A; 2ZIM A; 1FXH A; 1Y74 B; 3DSQ A; 4RUF A; 3VBB A; 3L70 H; 4J10 A; 4XDL A; 3H9V A; 4FLW A; 4MVR A; 1XMQ O; 1M93 A; 2ZCE A; 1I08 A; 4O2A A; 3JCZ A; 1VQL V; 4MVU A; 4NR1 A; 3VOU A; 3WB0 A; 2KQX A; 1FFX A; 3ML0 A; 1N32 O; 4FLT A; 1VEW A; 3RT3 C; 1PM9 A; 1Y6X A; 4HYO A; 2UUA O; 1SER A; 4B3R B; 5IWA O; 4DR3 O; 2YS8 A; 4NTY A; 1H2L A; 1WA8 B; 4PA7 A; 5JJE B; 1WPX A; 4P2Z A; 1HWY A; 2ADP A; 2Z0A A; 1E79 G; 2BE3 A; 3OMN B; 2A0L A; 4JI3 B; 3VQW A; 2Q68 A; 4DR5 B; 3CC2 V; 1FXV A; 4YJ2 A; 2QTO A; 3ZX6 A; 3F7Y C; 3WG7 B; 1WB8 A; 1IDS A; 2BSK B; 1VQN V; 4D7T A; 4FK5 C; 3P3P A; 3CJH B; 3HKC B; 1TAE A; 4UCU A; 4UB8 Z; 4AI8 A; 3ASN C; 3E35 A; 3FFQ A; 5JVD A; 1SA0 B; 4QIW F; 1PNM A; 4PJ0 Z; 1AI4 A; 3BHP A; 5IYB O; 4RO2 A; 3ZHU A; 1M90 W; 2KB1 A; 2BCC H; 3L72 H; 4UV9 A; 4NTW A; 4WFH A; 3BAA A; 5LOV B; 2X7R B; 2PGG A; 1N36 B; 1MZF A; 4FFB B; 1KP2 A; 1AJN A; 4UFZ A; 3CRR A; 2IH1 C; 1XL6 A; 3BAB A; 2WLM A; 3CRQ A; 3O65 A; 5JH7 B; 4BIU A; 4I4T B; 4GKJ B; 3C3T A; 1M4U A; 3ABK B; 2AZ2 A; 3M7M X; 1HNZ O; 1VAR A; 1PKX A; 3EVK A; 1EM1 A; 2QE7 G; 4LH7 A; 4IIJ A; 3HKD B; 4MTG A; 2WWW A; 5L3E A; 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3OMI B; 3UO2 A; 2LGW A; 3T2M A; 3HR0 A; 2ZR2 A; 2Q0A A; 3BA8 A; 1R6N A; 2GTS A; 2CDY A; 2GHY A; 5L3F A; 3JAS B; 3APO A; 4EFB A; 1JA8 A; 4CS3 A; 5CA0 B; 2EIM B; 3ZRV A; 4WFB V; 1RM1 B; 2WLL A; 1FJG O; 1Q6I A; 3BRC A; 2Q67 A; 2UXX A; 1H2K A; 3STL C; 4O4I A; 5B1N A; 5IJ9 B; 3MHH C; 3JCU Z; 4DR4 B; 1UJW B; 3TET A; 3VQY A; 3QVN A; 2IJI A; 1OCR C; 3CWB H; 4K8X A; 3K58 A; 4UVC A; 4LF7 O; 3OGI B; 1K4C C; 1N33 O; 1R73 A; 2DWD C; 3S3X A; 4HAM A; 4JPR A; 5FPO A; 4MT8 A; 3BCC H; 1GO3 F; 5LA6 A; 2CTW A; 4DV3 B; 1SQG A; 4LC1 A; 1FPO A; 4PV1 B; 2YDE A; 5LYJ A; 3K9A A; 2AW9 A; 2XND G; 2R9A A; 2K9P A; 1GN4 A; 1SC5 B; 2QTS A; 4CBC A; 4QNH B; 2KKW A; 4PA4 A; 1R6K A; 3AEI A; 1XNQ B; 1Y74 A; 5LHH A; 1NTK H; 2EIK B; 1SS3 A; 1EBO A; 4FLY A; 1ZX3 A; 5KLV H; 4MS2 A; 4I55 B; 5IDJ A; 2PI5 A; 2IM9 A; 1XNR O; 3ZMU A; 5K1P A; 3L74 H; 3JD3 A; 2UXD B; 1OCO B; 3DTU B; 1L0N H; 3K08 A; 3H1J H; 4I5S A; 3OTF A; 3K0G A; 1M56 B; 1NU1 H; 1QR9 A; 1KKC A; 1R1B A; 1MG1 A; 4U7N A; 3C3S A; 1G1X B; 1L0L H; 4JZ2 A; 1WA8 A; 1Z5W A; 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