1JRCA

The n67a mutant of lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase a
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSIASMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords dihydroorotate dehydrogenase A
publication title Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function
pubmed doi rcsb
source organism Lactococcus lactis
total genus 115
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2001-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 1jrcA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1jrcA01
1BKSA 4JEQA 3BLEA 2WKJA 2JKEA 3P74A 1OFAA 3VI2A 4HSNA 5LNSA 1OFPA 2FLIA 4O1AA 1XM3A 4AEOA 3W7RA 1EX5A 3O1NA 1ZNNA 3G8RA 1XBYA 2V2HA 3DFSA 3TSBA 1DV7A 1F7BA 1GVQA 4WOZA 5KITA 2PRLA 2E6AA 4NU7A 2WQPA 5C54A 1G7UA 1T96A 1Q6LA 4K7YA 4QQ3A 5AC8A 3C6CA 3GDTA 4BR1A 2VFFA 1LBFA 3NL5A 3GLCA 1SW7A 2E68A 1EA0A 3RMJA 1G4EA 2BZNA 3PF3A 1T99A 3P5YA 5F2LA 2G95A 3IGUA 4ADSA 1H62A 3ZR4A 1F73A 4O13A 3HGRA 4X9SA 4UTMA 4K36A 3G3MA 3W7LA 3E0IA 5A8GA 1C9DA 1SO6A 3KVMA 1HUVA 2QUVA 2C13A 2X1TA 4FNSA 1SZEA 2Y63A 3HF3A 3CWOX 4WX2A 2C19A 4A3UA 3VNDA 3KVJA 2ISWA 1LLWA 3C8FA 2VKZG 4JIPA 3LXCA 4UTUA 3TNOA 1R2SA 4CQ8A 3N2MA 3GXTA 3HPXA 5AN7A 1JCNA 3IIZA 5K7JA 1KFLA 2QF7A 1Z48A 3W1RA 3GDLA 4N9CA 1QCWA 3PUOA 4DPPA 1SFJA 3B04A 2E5DA 3C52A 4G1KA 2ZRWA 1C8VA 3BG3A 4ZVJA 2Z6JA 1OFBA 3TH6A 3UYCA 3M0ZA 5D2WA 3SSJA 4UXDA 4DF2A 1MSSA 4MPQA 3G22A 3G1VA 3O63A 2QJGA 3QPYA 4NX5A 2ATSA 3SGZA 1GQNA 3DXIA 4MFDA 6TIMA 4N6FA 4TMBA 1SPQA 3GVGA 3O6YX 1NVMA 4FXSA 3LM7A 4UMBA 1YDVA 4UTKA 4LW7A 2YW3A 1KM4A 2ZZ2A 4JYDA 2HMCA 3DFTA 1ZAIA 5F2IA 3BPWA 1LBLA 1JCXA 3NVTA 3PS7A 2X2GA 3A5VA 3FOKA 3NQ6A 1SW0A 1EIXA 1QOQA 1X1OA 3P82A 3SECA 5BNKA 1FY6A 3UWZA 2YZRA 1EP1A 1FWNA 3L21A 2VFEA 1WOAA 5DBTA 4UFIA 4FNQA 4EWND 4JYFA 4LY8A 2GVLA 1KLZA 1VGAA 1FDZA 4Y96A 4AB4A 3L0GA 4Y90A 4QAIA 3PAJA 1JVNA 1NFBA 1QDSA 4KWVA 1K8ZA 2GQ9A 5D33A 1VS1A 3LCGA 4JY8A 2R91A 4CCEA 3LLFA 1PHQA 4IMDA 5EMUA 1R30A 3GKAA 3M47A 4PEKA 4IUOA 3H53A 1ZENA 2E77A 5LZLA 1DQXA 4WY0B 4OT7A 1WBHA 4O0KA 3L2IA 3T7VA 4FX6M 3PBVA 3RK8A 1KFEA 5D32A 3W76A 1AL7A 3GDMA 1YDNA 3W2NA 5G2IA 3UXAA 4Z1BA 1ML1A 5SWUA 3CEPA 2YYUA 4GJ1A 1GG0A 3LHVA 1EWDA 3QPZA 3KXQA 2RDTA 4O1BA 4Y6GA 4A2SA 2CLMA 4HSOA 5D03A 3TW7A 3TSDA 1VYPX 3BLFA 4JTJA 3ZFHA 1JCMP 3FJLA 1I2NA 1AW2A 2GPTA 1YXCA 3A22A 4JGDA 4H6KA 3OVRA 4UFHA 3LV6A 4QNEA 1MZHA 4CCDA 4AVFA 3PY2A 3CHVA 4CNOA 1U5JA 4NT0A 4DO5A 2H8ZA 4O54A 3HG2A 4JX5A 5L9FA 4MJMA 3QW4B 2YFNA 4LVFA 5F4SA 4BWLC 3F03K 2Y61A 1ZFJA 1DJQA 4LVGA 2ZFAA 5HR7A 2WNNA 3H55A 4YL2A 3MJYA 3DFPA 3TKFA 1O5KA 1GVOA 2Y6ZA 1C29A 3DFOA 2FIQA 4O19A 1LOQA 1H63A 2Q3OA 3OA3A 2CLLA 3I65A 3G24A 2HSAA 4ZQMA 4YMZA 3TUUA 1GTEA 4OGZA 4QSHA 1K7XA 3PSWA 4UTWC 4RR4A 3V1PA 4NVTA 1OFQA 3W1QA 3W83A 5BRBA 1UUMA 3O15A 2CZFA 3W74A 4ZL1A 4TR9A 2WSRA 5D37A 3C0JA 2YYTA 1K8XA 4FHAA 2ZRVA 3FA5A 4IXHA 1KV8A 4DF0A 3IIVA 4IQLA 1SFLA 3PC0A 1JCYA 3YPIA 2YDAA 3B0PA 1J5TA 2PRMA 4MYXA 3F4NA 5CSRA 3EX2A 1KM6A 3IV3A 2VFDA 2RH9A 1VLWA 3WK0A 3W88A 2VENA 1P0NA 1I45A 2E1DA 4MOZA 1RV8A 1IXQA 3NQCA 3G8EA 3M43A 1TPEA 2E09A 2J9XA 3W84A 2P10A 3T78A 3I7QA 5AYZA 1GVSA 1UASA 2W79A 4O1CA 4MYAA 5AHFA 4KFPA 3NGJA 1GVFA 5TIMA 3S1XA 3EXTA 4TMCA 3MI6A 3NOEA 1VZWA 3WK3A 1BEUA 1OFOA 1R2TA 3AJXA 1TRDA 3G18A 3NEVA 3IEBA 4O53A 4JTGA 1TIMA 5E1QA 2A0NA 1M7OA 3L5MA 2ZA2A 3EWZA 3GZ3A 4GBUA 2DJLA 1LBMA 5LHEA 3NG3A 4K8EA 3HGSA 2Z6IA 3TAKA 3WK1A 3W1TA 4PL1A 4GUFA 4Z1DA 3TE9A 3TMLA 1KFCA 4W9TA 1GG1A 3UZJA 2NWSA 2W0UA 4RX0A 2ZZ4A 4ORMA 4H4IA 3ABRA 3E9AA 3C2EA 4DF1A 2EAWA 4OQVA 3S9YA 1JUEA 2B7QA 2Y7FA 2QJHA 1FBAA 4PA8A 3S1UA 4M6QA 1TPDA 2BX7A 5F1VA 3W7CA 2OX1A 1G69A 3G1AA 3MO7A 1Q45A 2DZVA 3BV4A 2YGYA 3TSMA 2A7PA 2CLOA 2JGQA 4Z0SA 5L6UA 3LCHA 4YCOA 1N55A 4ZQOA 3BG5A 3W9ZA 2C1HA 4NNCA 5FF4A 3CLMA 2OZ0A 2BTMA 3LLDA 3EKLA 1CX9A 3PR2A 1YXYA 1LOSA 3PB0A 4L4MA 1OK6A 1MEWA 2V5BA 3OG3A 3UWYA 1W5QA 3S5ZA 3N34A 5KZDA 3W7JA 1AW5A 2YFOA 5BOOA 1RR2A 3QYQA 3E96A 3WJZA 1L6WA 3DZ1A 1WOBA 4UMCA 3W6YA 1SZGA 2ABBA 3MP3A 1UUOA 2CLKA 3G1YA 4JICA 1DBTA 4Q4KA 1B4KA 3LRLA 5K4ZA 2YPIA 4UFMA 4DPQA 2F84A 4FF7A 4WQ6A 3LERA 4GRSA 5FF2A 3LXAA 4NJKA 1YLVA 2DZWA 2CLFA 3GB6A 1XUZA 1RPXA 1DJNA 1HL2A 2Y85A 2O7SA 1VH7A 3UWUA 4Z0JA 4YCPA 5FF7A 4NNAA 1W5NA 2KZHA 5I3IA 3WJWA 2LLEA 2AGKA 2E6DA 1W3TA 4MFEA 1K7EA 1EB3A 3B05A 2EKCA 5BMXA 4JY9A 4MLJA 5GVJA 1AMKA 4U4MA 3CIXA 3NA8A 5HQEA 1KTCA 1D3GA 4K38A 4UTLA 5EBUA 1I4NA 1G67A 3HG4A 2G5WA 3UWQA 3Q2DA 1UJPA 1SO5A 3THAA 3INPA 1FCVA 5D02A 2TPSA 1I2QA 4ML9A 4MKNA 5HUOA 4ADTA 4CNNA 1L2UA 1RD5A 2V0TA 1BWKA 4NZJA 4HPJA 3HMJG 3BW2A 3NQVA 4LC6A 3K30A 2CLIA 3M1ZA 3OVQA 4KWWA 4UIOA 1TYGA 2A4AA 2VEPA 3LBCA 1W0MA 3CC1A 2H3DA 2QAPA 1QO5A 3FKRA 2RDUA 1B57A 1YTKA 1XDLA 3IVTA 4TO8A 3TAOA 3GXNA 2NV1A 1QNVA 4LVBA 2I14A 1PV8A 1JQXA 2Q8LA 5DXYA 5J5DA 4JTTA 3QH2A 4R34A 1X6UA 1G4SA 3MYPA 1QWGA 3SFKA 1Z42A 3SIZA 5G5IA 1HTIA 3SI9A 4X3ZA 1KTBA 2PC4A 3G1XA 4LC8A 3LOTA 3NQGA 2FB2A 4Z1AA 2RKXA 3MWAA 5IM51 4PH6A 1ME8A 5AHLA 3M44A 1N8FA 3FJ6A 4K39A 1MXSA 3M5VA 4O28A 1G4PA 3SGUA 3TV8A 3L0KA 2ZA1A 4C1LA 1MEHA 4PFMA 1H7OA 3C2FA 3EXSA 7TIMA 3LCIA 3KRSA 3C4UA 5I3FA 4RZ4A 1LRTA 3DKJA 1ICQA 3SZ8A 2TYSA 1ADOA 5FF0A 1H7WA 4N9EA 3W7OA 3FIGA 3PB2A 3N19B 5LNWA 4M6PA 2WOQA 2C0AA 3LRMA 4AHPA 1GVRA 4LT9A 1AK5A 3QQ1A 1O95A 3P84A 1A5CA 1OF8A 2BWGA 1KM3A 1H1ZA 3S5OA 3M5YA 3W23A 1CI1A 1H7RA 1TPUA 1EPXA 1LORA 2ATMA 3KVKA 5HINA 5CZ0A 5G2HA 3W85A 5C5YA 1KFKA 1OX5A 2ZA3A 3OIXA 3FKKA 2C15A 4NZFA 2V81A 2XN1A 3OVPA 2ZRUA 2OT0A 4RJEA 4K7VA 4E0CA 3TXZA 4BF9A 3NR0A 4EOUA 1VCGA 5MHBA 2RDWA 3CEUA 1WYIA 1QPNA 2ZZ3A 3W1UA 1JR1A 5LNUA 1V7YA 2FPVA 1XFBA 3A21A 2OT1A 3QMRA 1VQTA 2QUUA 3B8DA 4JS3A 5K2ZA 5H2ZA 2Y89A 3DENA 5CG7A 1KBIA 1KM2A 1QOPA 3EX4A 2Q3RA 5G1TA 3R13A 1WAUA 5CGQA 3SY5A 1RQBA 3KOFA 1V5XA 4CQ9A 2FQIA 1TMHA 1M5WA 4IWWA 2ZRZA 4GE8A 3IVSA 5DCDA 4EIVA 4O17A 3W7QA 1L6YA 2XN2A 3PWAA 5AHMA 1H7XA 3U8GA 1DKWA 3HG3A 2DU2A 3TIMA 4HN4A 4NJIA 1HG3A 1OX4A 2D73A 2V8ZA 3LV5A 4FEZA 3NZRA 4N9BA 2R8WA 3HGJA 3B0VC 4LNYA 4AHOA 3EWWA 1Q6QA 1IGSA 4UTIA 5HJLA 3W3OA 3G1FA 3GNNA 2AQWA 4P61A 1EUNA 2QCLA 3DHDA 3UXDA 1IF2A 3EX6A 3NZ1A 3QJAA 5G4EA 3O8AA 1OF6A 3TXVA 1XBXA 3DKLA 1FWSA 3B0UX 2NX1A 2ALDA 1AL8A 2FDSA 3T40A 2VFGA 3BK0A 3M5XA 3TW6A 2NX9A 2A2IA 2P0OA 3C2RA 3L9CA 3EX1A 3NM3A 5DBUA 2ZTJA 3HQ1A 1O60A 3MBFA 3H54A 2X1UA 4OE7A 1VJIA 2ABAA 4LRTA 4UNLA 4DO6A 5AYXA 5C55A 3W1PA 4LS0A 3N9RA 1D3HA 1NF7A 2XFWA 5KINA 1W54A 2F7FA 3NDOA 4YWIA 1JULA 1W31A 2TMDA 3O16A 1LTDA 3P67A 3PSVA 3CM4A 3ATYA 1QR7A 2H8XA 2OCZA 4OV4A 3FFSA 1KM1A 1TSIA 4DXVA 3E49A 4M7TA 1F05A 2B7PA 3JR2A 3LCLA 5KZEA 2X1SA 5DN1A 2WJZA 1KFBA 4I7UA 4R53A 1DHPA 2J6XA 2VELA 3QC3A 4IPJA 1A5BA 3RNDA 2ZDRA 2TRSA 4QIUA 1B3OA 1ZCOA 2QCDA 1B9BA 3W1MA 2QCMA 1GWJA 3A23A 1ME9A 4AXKA 3W7EA 3MW7A 2I9EA 3CB8A 3ELFA 5CSSA 1FXQA 4GUJA 4GUGA 3T55A 2X30A 2OMAA 2WNZA 3QFEA 4C1KA 1JCJA 1HFBA 3GAYA 1BWLA 3MP5A 3NYZA 3TC7A 3BLIA 3TCEA 1VCVA 3P62A 4FNTA 1H1YA 3R12A 1Q6OA 5G2WA 1WQ5A 2GQAA 2IQTA 4FNPA 5FEPA 4O11A 1FWRA 3QMTA 5D2VA 5AC6A 3UPWA 5I3JA 4ONVA 2Z0IA 5IBXC 3SW6A 1A50A 3NXFA 3QMSA 2NUXA 2ZCGA 3DGRA 1FXPA 2A5HA 2X1RA 2NXGA 1Z41A 3KFTA 3OBKA 1IXNA 4KFNA 3GK0A 5TBOA 3QRHA 1H51A 3EEGA 2E5BA 3LCWA 3FLUA 1KA9F 4AWUA 4NX0A 3QZEA 1O5XA 4OV9A 1X8FA 2ISVA 3MP4A 5D2TA 5D2YA 4U28A 2WO5A 3MBDA 3G0XA 4ZQPA 1AG1O 3PUEA 2C18A 4TU1A 5LGXA 2QUTA 1VHNA 2QCEA 3Q94A 1ZHAA 3TFXA 3TK7A 1YPIA 2RHGA 2Y7GA 3UWVA 4MLRA 4XZ9A 5E93A 2JKAA 3MHFA 1THFD 3VE9A 3B4UA 4CQAA 2V30A 4MUZA 3GNDA 5LKYA 2YSWA 5KZMA 2TSYA 3WK2A 4R33A 4D2JA 4XWUA 1VRDA 4MJZA 4WXYA 2DJXA 3S1WA 4A29A 4JTLA 3GIYA 2JKPA 1YTDA 4LOCA 1T8XA 4AHQA 1KBJA 3B03A 2Y88A 3V75A 3BO9A 1ZY9A 4ZQRA 3TR2A 3TJLA 3QW3A 1IXPA 1OX4B 5DCBA 2DZSA 1ALDA 1FX6A 3IRDA 2R14A 5ABTA 1H7NA 4E2BA 1TO3A 3STCA 1G4TA 4UC5A 4HT3A 4UR8A 4JNMA 1EEPA 1TPH1 1XDMA 3P80A 3PVFA 3I6RA 1EUAA 4LTSA 1GOXA 3LXBA 1XBVA 2ZBTA 3N9SA 3QSRA 1QPOA 1P0KA 1XUUA 3BARA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3A4W A;  1BRL A;  3CLW A;  3BLE A;  2WKJ A;  3VIF A;  1HKV A;  1NDV A;  1TWZ A;  3P74 A;  4F0M A;  1ZGD A;  6ENL A;  3NO1 A;  1BYA A;  5GPR A;  2FLI A;  4O1A A;  1MUC A;  1VPY A;  4LXF A;  2VGF A;  4IIS A;  2V38 A;  2GUY A;  2JQX A;  1DV7 A;  2E6A A;  1QNQ A;  1B3X A;  4GG9 A;  2X1I A;  3CPG A;  3T9P A;  1Q6L A;  4K7Y A;  3GDT A;  3H7V A;  4BR1 A;  2E68 A;  4Y9P A;  5CBB A;  4JFT A;  4GXW A;  3RMJ A;  3GTX A;  4ZBC A;  5F2L A;  1OGS A;  3NZP A;  3G3M A;  1W8G A;  1C9D A;  1KR0 A;  3KVM A;  1QNS A;  4FOJ A;  2C19 A;  5M03 A;  2IS7 A;  3KVJ A;  3PZO A;  3QOM A;  2R1M A;  1E6Q M;  3TNO A;  3QVQ A;  3ARQ A;  2ZXD A;  1TE6 A;  5A6T C;  2QF7 A;  1MWO A;  4C6I A;  2J7F A;  3MCO A;  4YWS A;  4W8A A;  3LSC A;  2CXG A;  5I00 A;  3NOY A;  1Z3N A;  4DPP A;  3C52 A;  5HQL A;  3GY1 A;  4X61 A;  1OFB A;  3RRX A;  4B5T A;  3TH6 A;  4JFW A;  5D2W A;  3SSJ A;  3CQJ A;  3O63 A;  3W82 A;  1ITC A;  4H6Q A;  1Q6G A;  2PWF A;  2ATS A;  3DXI A;  6TAA A;  4Z2J A;  3DN5 A;  4MFD A;  4TMB A;  1SFT A;  3ZLH A;  4DWS D; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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