1JUE | Genus

Total Genus 116

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	116
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	dihydroorotate dehydrogenase A
publication title	Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function pubmed doi rcsb
source organism	Lactococcus lactis
total genus	116
structure length	311
sequence length	311
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2001-08-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	1jueA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1jueA01

4K37A 4UR7A 3CWOX 3G1SA 4M6PA 3W7QA 1R47A 2QCDB 5AC8A 1GZGA 2TMDA 4HN4A 3LBMA 1BKSA 4UFKA 1SUXA 5CSRA 3GLCA 1H60A 5DBUA 1F76A 2YZRA 3B0VC 3S6DA 4KFNA 1P0KA 2FB2A 2WNZA 1RQBA 3E12A 3M1ZA 1AK5A 3LHVA 3N9RA 4IMGA 3QMRA 3TJLA 2PC4A 4FX7A 3EWUA 3CEPA 1ZENA 4O57A 5AFDA 2WQPA 1IGSA 1TPH1 2CZFA 3LRKA 1TTPA 5EA9A 5LGZA 3R13A 3FEMA 2V5BA 3O15A 3RK8A 5CZSA 5E0KA 3R2GA 5U4NA 4UFLA 4UNKA 5DY3A 5DBTA 4ORMA 2W79A 3L0NA 1VYSX 5KITA 1M7PA 2ISSA 1U5JA 4GFSA 4HNNA 3KVLA 2V2CA 5K4XA 4I7UA 4GC4A 4HPXA 2ZZ6A 5K4ZA 3W2LA 5AC7A 1ZFJA 2ZA1A 3QSTA 3ZR4A 1SSDA 3HGRA 3UWVA 3SR7A 1R30A 3LGEA 4DO5A 4JX5A 3W74A 1THFD 2E5CA 1SW7A 1SSGA 2VENA 1H50A 2B4GA 2Y7EA 5BMWA 1LOLA 1T0OA 5DCDA 3DAQA 1KW1A 1JR1A 2V8ZA 3NQMA 3OG3A 2VFDA 2HMCA 1YTKA 1M7OA 2WSQA 2ZRUA 1QMLA 4GJ1A 1C9DA 3CHVA 3W7LA 4YMZA 1BWKA 1Q6RA 4WOQA 2Y7GA 1J2WA 4X3ZA 3S5YA 3KVMA 2VEIA 3EWZA 3TNOA 3KRUA 1NAL1 3L65A 2NLIA 2Z2UA 1W5NA 4JS3A 3THQA 2GOUA 3HJZA 4MYAA 2NX3A 3S1XA 2JKPA 3W1UA 3IVUA 1TREA 4IMDA 3GNNA 4OV9A 1MEHA 1P5BA 1NF0A 2A7RA 4O12A 5F4WA 4U28A 4LRTA 2YGYA 2P0OA 4XQ6A 1VLIA 3PR2A 1JQVA 3NL3A 1WV2A 3RNDA 3MYPA 4IPJA 2GQAA 3IIZA 1TYGA 5TQLA 1H7OA 3QFEA 4X9SA 4O8RA 5G1TA 1SPQA 3B0UX 3DH7A 4O13A 1OYBA 3P5ZA 1OG0A 2BWGA 3V1PA 4DF2A 3B05A 2B7PA 3I65A 1I4NA 3NNTA 3M5XA 3H55A 3MO7A 4X2RA 5KSWA 1F6KA 3E9AA 3FJLA 5CG7A 4ZZ9A 4GUFA 3W75A 1H7XA 1YYAA 1MO0A 2OZ0A 3W1PA 1XI3A 1VHCA 4U4MA 3QF0A 3GKFA 2OT1A 3LBCA 3EX4A 3JR2A 2V0TA 3I7RA 1TCDA 1IXNA 1XBYA 4AXKA 4PODA 4MY1A 1RQHA 3LI0A 1CW2A 2QEZA 3L5MA 4YL2A 1TPUA 2WSYA 4N6EA 3PBYA 3BV4A 4TX9A 5EPDA 3LXBA 2ZZ1A 3IIVA 1XBVA 2EPHA 1WYIA 4POCA 4XUGA 1KFJA 1QNVA 2VXNA 3S0CA 1RR2A 1KM6A 3CEUA 4GUHA 3EX1A 5BNKA 5DY2A 3BLFA 3C56A 3MYOA 3O07A 1PCWA 3G24A 3PWAA 3RFAA 3UWUA 4JX4A 2DP3A 2H3BA 5AHNA 2RDTA 3KOFA 1K8XA 4GNJA 1VCGA 1GVOA 5IBXA 3DI1A 3G0SA 2A1YA 1O5XA 2RH9A 4E2DA 4MOZA 1KV5A 2Y89A 1V7YA 3DKJA 5DN1A 3UZJA 5C54A 4XKYA 4LVGA 3Q37A 2NV2A 4R33A 2NUWA 2EKCA 4IWWA 1T96A 1A5AA 1MEIA 4JN6A 4CCEA 3LCXA 2WV8A 3PVFA 3N9SA 3TC6A 3W7HA 4HSNA 3L67A 3WK2A 1YDNA 3M0ZA 1ME9A 4FNPA 3RF9A 2NUYA 3S42A 3TW7A 3C0JA 4I7WA 2QAPA 1W8SA 1U83A 3LLDA 2QCDA 4TU1A 2I1OA 5FF0A 2Y6ZA 2CZDA 3UPWA 1KFBA 3GDKA 5EL1A 4P2VA 3WJWA 3CLMA 2E68A 2CZ5A 3CIXA 4LVBA 4BK9A 3S5NA 2C18A 3TQKA 3H54A 3HGOA 1KLZA 4GUJA 3MP3A 1QCWA 5BRBA 1XCFA 3F1QA 3HB9A 3LTPA 4LUIA 5C55A 4I9AA 1FQ0A 1GTHA 1SO6A 4LU0A 5DCEA 4ML9A 2P1FA 3LXAA 3NR0A 4NNAA 4AAJA 5CZJA 4S1FA 1QO5A 3O6YX 5LSMA 3TMQA 1K7EA 2ISWA 5F4XA 3B03A 4DELA 4AVFA 2C3ZA 5EY5A 3NQVA 4RV8A 3T7VA 2FTPA 3U2OA 1SR9A 3P67A 1ZAJA 3HPXA 2X30A 3G1AA 3TA6A 3W7CA 3W83A 4MJMA 1ML1A 4ZQPA 1KM3A 1PS9A 1DOSA 1LP6A 4NT0A 3NPUA 1FDYA 3DENA 3LCHA 5D2VA 4UXDA 2QCHA 4NJGA 2DJLA 3W7JA 1B4KA 3AO0A 4JICA 1ONRA 3GNDA 4Q32A 4LVAA 1W1ZA 1VYRA 3P84A 1MSSA 3QRHA 1IXQA 2A21A 4R53A 4K7VA 1VR6A 5LNUA 2YDAA 2ZA3A 3LHUA 3W2UA 3NAVA 1EEPA 5U7SA 1F2JA 2V81A 3OBKA 2NX9A 2X1UA 4NJHA 4YWIA 3FIGA 4OWGA 1G7UA 3W07A 5AHIA 4MYXA 4ADSA 1GYLA 3NQ2A 2J9XA 1TTQA 5F1VA 4UFJA 1ICPA 1RQEA 2QUTA 4DQWA 5K9XA 3M9YA 1OFPA 1LDCA 2QDGA 2WNNA 3WJSA 2VEPA 4MIMA 1F74A 4A2SA 1OHLA 4A3UA 4XZ9A 2F84A 2J9YA 3USBA 2FQIA 3EXSA 3TX9A 3PM6A 3PULA 1LM1A 1YDOA 3D0CA 3QSRA 1OYCA 4JY8A 4A2RA 5F2LA 2NX1A 4HHPA 3UY7A 2E6AA 1XUUA 4UTTC 1KTNA 4M5PA 1UB3A 4NZFA 1Q3NA 4M6VA 4AWTA 1QPQA 3F03K 3W1LA 1RPXA 3SECA 1SZGA 4UCGA 2H3DA 5BW6A 2FB3A 1JVNA 4RXGA 5T26A 3GDMA 3W72A 2XN2A 3W7KA 4FEZA 3CM4A 1LBLA 4LV4A 4JTHA 3IGSA 2Y7DA 5CPOA 5K9CA 1OF6A 1SQ7A 2A7NA 1YLVA 3QQ1A 4AWUA 1VHNA 3Q2DA 5HWJA 2OJPA 1JULA 2W6RA 2HS6A 2IQTA 2DORA 5FESA 5A5WA 3KVKA 3L2IA 1G4PA 4NNCA 4LWWA 1M5WA 4WXYA 3R8RA 3NPVA 5TIMA 2J6XA 5E1QA 1FWTA 4UIOA 2RDUA 2E5BA 5TBOA 2PRLA 2YSWA 3STCA 1J5TA 5C2XA 1W3NA 3N19B 2ZBTA 5I3JA 2ATSA 3NVTA 1JCXA 2DZXA 3EKZA 1F6PA 5DCBA 3TMLA 2Y63A 1ZHAA 3PSVA 4GWEA 3SGZA 3MHFA 4A29A 3BGGA 2YX0A 4WZHA 5CPLA 1IXPA 1TJPA 1FUYA 3M43A 2GPTA 1C8VA 4N6FA 3W7PA 1MXSA 2FLIA 5G2HA 3W7EA 3SW6A 4O14A 2F7FA 3G1DA 4LS0A 2RFGA 3TSBA 3GAYA 4S2BA 5D2TA 1LLWA 3EX2A 4N4PA 4X22A 1W5OA 4JY9A 3HG3A 4JIQA 4TMBA 3KRZA 3RLVA 1EUAA 4ZQNA 2YYTA 4CCDA 4PL2A 2WO5A 1AW1A 1H51A 2QJIA 3GR7A 3K30A 3WJXA 4E2BA 2E6FA 1IIGA 3HG5A 1OABA 1TMHA 3QPYA 4JYFA 1TSIA 3VE7A 2DU2A 2CU0A 4UTTA 4OQVA 2WSRA 2QAFA 2E1DA 2H90A 3U8GA 4N9EA 4FNUA 2QUUA 2A2IA 3FLUA 1P0NA 1JRBA 3YPIA 3PBWA 4MZYA 2NXIA 3NDOA 3PY2A 3PSWA 4JTFA 4ZQRA 5HWNA 2AQWA 3ATZA 2VFIA 1TPC1 3L21A 3EXRA 3BLIA 2ZDRA 2ZZ4A 1O4UA 4ICNA 4N2YA 1DJNA 1Y0EA 3EWYA 3LXCA 4XKYB 4UTLA 3OVRA 1LOSA 1XFBA 1GQNA 1LYXA 5FEWA 3QQ0A 1BEUA 5G4EA 1LCOA 2C6QA 2ZYFA 3HOJA 1M6JA 1RD5A 4JIPA 1K8YA 4JTLA 5L6UA 4E0CA 3EWWA 5D2YA 3M16A 3W2KA 3NA8A 3NGJA 3DFNA 3BG9A 4LT9A 4BR1A 4JR5A 1UUOA 3LV5A 4JTTA 2ZFAA 4MZ8A 2Z1BA 3W1TA 4QNEA 3THAA 5HNRA 1Z48A 5AOUA 1FCVA 4L4LA 1LRQA 3A22A 4EVZA 1PVNA 1T99A 2JBMA 4Z0JA 5G4WA 2OCZA 5K3VA 2H8ZA 3CPRA 5HULA 2XFWA 3PG9A 3DHDA 1CI1A 1H61A 3IGUA 4O52A 4K8EA 4QNWA 3GX9A 1R2TA 4FB7A 2Z6IA 3G1VA 3PUDA 1ZY9A 3W7NA 5ABTA 2HS8A 4RXFA 2J27A 2TYSA 4FXRA 3UWZA 7TIMA 1I2RA 1AL8A 1F73A 4HSOA 1N55A 2PURA 1EP3A 3NQCA 3T78A 3NQ7A 2CZEA 3HIJA 3SGUA 1W5PA 5HQEA 2ZZ3A 3KFTA 4MLJA 4MVAA 2QCEA 3E96A 1SU5A 1PHWA 1XBZA 2LLEA 2C14A 4K7YA 1FBAA 3TK7A 2NUXA 3TC7A 3VKJA 3LX9A 3BG5A 1XM3A 4G1KA 2Y62A 4DBDA 3W1RA 3DFPA 2Q8ZA 2FJKA 3G1YA 2YR1A 2WPBA 1I2QA 1DKWA 1WOBA 4Z0SA 3MHGA 1WAUA 1JJKA 3I7SA 3S5OA 2H6RA 1GYNA 4HNTA 3S9YA 4L4MA 4LW7A 2YPIA 3UYCA 4K38A 1KM4A 1GWJA 4IX0A 5HMSA 2CLEA 2ZTJA 2PE4A 2CLIA 3NEVA 3P7YA 3I68A 5D30A 5I3KA 2NV1A 3UXAA 4RZ5A 2E5DA 3NQEA 2ZZ5A 1SO4A 3NM3A 1L9WA 3E0IA 5IBXC 3QYQA 5D33A 3WFAA 4LS1A 4EOUA 4HNUA 3C8FA 3DXIA 3HGSA 3TQ0A 3CTLA 2Y7FA 3PC0A 5LNSA 1JQXA 3HBLA 4FX6M 5DXYA 2X2GA 1UJPA 3FA5A 3GXNA 1T8XA 1O94A 2ZZ2A 3HO8A 4UMBA 5I3IA 1FXPA 2ZTKA 3Q94A 1ME7A 1S3HA 3C4UA 4O1CA 4IMFA 2CFFA 5LNRA 2X1TA 1JCMP 1KM1A 1QPRA 4Y90A 1EP1A 1OX5A 1UASA 4IJBA 5G2IA 2J88A 1VH7A 3U6WA 2QCLA 5KZMA 5AYYA 1YXDA 4AWSA 2X16A 4I7VA 1SW0A 1GJPA 1K8ZA 4UTWC 1KLYA 3L9CA 3EWBX 2JGQA 1GVFA 3LHTA 4LC8A 4QIUA 1EB3A 2NXGA 1H7NA 2CLKA 4OBTA 3QW3A 1FDZA 1I2NA 3C61A 2OMAA 1SZNA 2BZNA 4FIQA 2H8XA 4Z1CA 2GQ9A 1K03A 4NX5A 3ZFHA 2G96A 2V5LA 1Q6LA 2YYUA 5KMYA 3G1FA 3IEBA 3M44A 1D9EA 3IVTA 4WXZA 4Y96A 2KZHA 3DFQA 4O1BA 4N02A 4A22A 1XL9A 3M41A 4NZJA 1YADA 3UY8A 3ATYA 1ZAIA 4ZMGA 4IUOA 4HT3A 4MFEA 1RVGA 2RKXA 4MY8A 3HG4A 6TIMA 1TV8A 1OFOA 1SZEA 4QQ3A 3C2RA 4UTUA 4AHPA 3N2MA 3C52A 4JGDA 1TPDA 4NNBA 4LC6A 3KXQA 2I9EA 1LRNA 2V2HA 4NJJA 4WY0B 3CC1A 2RDWA 5CZTA 5AHLA 3W86A 4PL1A 4CQAA 3C2VA 3W9ZA 1F7BA 4MPQA 2A7PA 4P61A 1B57A 4GXMA 3MMTA 4JD4A 1W56A 3BW3A 1QFEA 5FI8A 3NL5A 3W1QA 4BI7A 1HL2A 4GRSA 3UWYA 1KFKA 2WOQA 5J5DA 2VFGA 4GE8A 3A5FA 3HF3A 4WOZA 3M7WA 2YFNA 4UFMA 1AG1O 2VFFA 3TXZA 4LTSA 3O06A 1TQXA 3KAOA 5HUPA 1QR7A 4UTWA 2DZSA 2VFHA 1X6UA 3N14A 4BWLA 3BW4A 4FNRA 3LERA 1PV8A 5DELA 4H6KA 1FWWA 1B9BA 4K8HA 4CQ8A 3BLEA 3ELFA 2R94A 4RR4A 5HWMA 5LKYA 1DHPA 1RZMA 2GJLA 1GPWA 1KFEA 1VCFA 4BI5A 1EX5A 3G8RA 3GZ3A 3B0PA 2A6LA 4QISA 5H2ZA 3FS2A 5AN7A 3MP4A 3LCGA 4EF8A 1Z44A 3C2EA 4O50A 1ICSA 2GQ8A 4ADTA 3TXVA 4Z1AA 3LM7A 4DXVA 1KFLA 1QO2A 1TO3A 1JCYA 4UTKA 2QJHA 1JUKA 2GVLA 3JRKA 5AB3A 3SIZA 3CWNA 1FX6A 3MHUA 3LB0A 1OK4A 3BW2A 5KZDA 6ALDA 4OGZA 4ZQOA 5KTLA 4RLIA 4IQLA 1HUVA 4UTJA 1S5VA 1WBJA 1GOXA 3GAKA 1LZOA 4AHQA 1OFBA 1OFRA 5F2MA 4ADUA 4AHOA 2A5HA 1HO4A 2ATMA 2QCGA 1X7FA 3O6CA 3IIXA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1JUEA

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