1JULA

Indole-3-glycerolphosphate synthase from sulfolobus solfataricus in a second orthorhombic crystal form
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
publication title The crystal structure of indole-3-glycerol phosphate synthase from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus in three different crystal forms: effects of ionic strength.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 95
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 1996-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1julA00
1OFRA 3A23A 4P2VA 5HWNA 3W75A 4LVGA 4PA8A 2VFFA 3TJXA 2VXNA 1ICQA 1HO4A 3DH7A 3G24A 1GZGA 4MLRA 1HUVA 1W54A 4JYFA 2VEIA 3L0GA 2QR6A 1ALDA 3FLUA 3SGZA 3B0VC 2Z0IA 1R47A 3U2OA 4CCCA 1G4SA 4BI7A 4Q4KA 4GE8A 4DXVA 1K8ZA 5H91A 3P62A 3E0IA 5AHIA 3WJXA 3D0CA 2NUXA 1H5YA 3M16A 3NL5A 3LCFA 1OX5A 3W1QA 1P1XA 1LYXA 5AYZA 2R91A 3TX9A 2HS6A 2A7PA 2DU2A 4OT7A 3TROA 4O19A 1NFBA 4N9EA 3M5XA 1TPH1 3BW3A 4QQ3A 3ZS4A 5D2YA 1I2QA 1TTPA 1KFKA 4UUIA 5DBTA 2Y7EA 5HMSA 4WQ6A 2CW6A 5EYWA 5HINA 1NEYA 1IXQA 2ZA3A 3THAA 4LVBA 4M6QA 4GUJA 4FIQA 2Z6IA 1FWWA 3LV6A 3W1TA 2AQWA 3LTYA 4JGDA 3PUEA 3G0XA 1NF0A 3MI3A 6ALDA 1G4EA 1WBJA 2GVJA 3QSTA 2WSQA 1YTKA 2FB2A 4FHAA 4X9SA 2NX9A 3VCRA 3QZEA 1OF8A 3W23A 4GFSA 4I7WA 1KLYA 5AYXA 1KM3A 2FLIA 4ZMGA 2FIQA 3B03A 3DFNA 3NL6A 3R2GA 3EWBX 1GEQA 5D37A 4O11A 2H90A 2B7OA 2C16A 3TC6A 1H63A 3UY8A 2ZRWA 4DF0A 2QCDA 2ZZ1A 2VEPA 4XBKA 2PRHA 3MI6A 2FPTA 2PRMA 2CZEA 1LP6A 3KAOA 2JKPA 3PF3A 3I7SA 2Y61A 3GDLA 3B0UX 1KBIA 3RNDA 3LHYA 3W7NA 3S5YA 1YPFA 4DO6A 3NXFA 3HF3A 4NVTA 1LBFA 2WSYA 5J5RA 1A50A 5I3IA 3HOJA 1T96A 3R89A 1I4NA 3NAVA 5CZJA 5I3KA 2NXHA 3MO7A 3GX9A 3TMLA 3CEPA 4CQ8A 3DXIA 1MZHA 5KZEA 2R8WA 4N9BA 2X1TA 4FF7A 3IRDA 3W7EA 2J27A 1QMLA 1OHLA 4XUGA 3C2OA 1L2UA 4PCFA 3EX2A 1QCWA 2X1UA 4UIOA 3QYQA 1J2WA 1Z48A 1GYLA 1TIMA 3UWQA 2QAPA 1OF6A 4K38A 3NQGA 1FWTA 3TA6A 3G1DA 5LSMA 1FX6A 3MJYA 4GC4A 1GOXA 2ZRUA 1T8XA 5K9XA 4PEKA 1OVDA 4JS3A 2A0NA 3S6DA 3C56A 2CLFA 3LRKA 4LVAA 3BG9A 4E38A 5I3JA 1J5TA 3KVKA 4C1LA 4PFMA 4O28A 1YXCA 3NQMA 4O57A 4JYEA 3S42A 4O16A 1DORA 2QEZA 2RFGA 3TXZA 5CKSA 1Q6OA 3HG3A 1G69A 4WJEA 2E6YA 4AH7A 2V9DA 2CZDA 2RDWA 5F1VA 5BW6A 3LCLA 3HBLA 1YDOA 5ABTA 4NJJA 1EEPA 3GB6A 4ORMA 5DXXA 2QJIA 3QQ1A 3N2MA 1OFBA 4NXSA 1R2SA 1YYAA 5KSWA 1JCYA 2G95A 3LI0A 3OVPA 3QMSA 2C0AA 1A5AA 3Q2DA 3CWNA 4K36A 2NXGA 2A6NA 1QDSA 1I2NA 1FCVA 1RD5A 3PUDA 4UTWC 3QW4B 3BG3A 4FNTA 2NXIA 4UNKA 2QDGA 1KA9F 5LZLA 1SO6A 3IGXA 2RHGA 4A2RA 2J24A 1AG1O 2EHHA 3HPSA 3EWUA 1K7FA 1LM1A 3W70A 3V75A 3VNDA 2ATMA 5F4SA 1TPEA 1LLZA 1GTHA 1ZY9A 5D02A 4ZVJA 5CZ0A 4FNRA 1JRBA 1K7EA 4O54A 1O5XA 3F03K 5FEZA 1G4TA 4H4IA 1TQXA 1K02A 3P8JA 3LTPA 3R13A 3R12A 2EGZA 4KKXA 3S0CA 1IIHA 2Y70A 3L2IA 1WYIA 3LM7A 3Q94A 4YWIA 1WA3A 3C2VA 3P82A 3MP3A 1TPDA 3ELFA 1WAUA 4PODA 1O95A 4RZ4A 4K37A 3EX6A 1H7OA 1VJIA 4QAIA 1OK4A 4UTLA 5DBUA 3W88A 2Y7GA 3CC1A 1WDWA 1SUXA 3PVFA 4FNQA 2RDTA 3P7YA 5SWUA 1QPOA 4RX0A 3ABRA 1ZAHA 1DBTA 2E6AA 2ZRYA 4ADTA 1C8VA 3ANYA 5E0KA 3W83A 4AEOA 2GJNA 4NZFA 5D05A 4JY8A 1JCJA 4A21A 4DF1A 1R2TA 5IBXA 2HS8A 2H6RA 1TPC1 1TTJA 3NZRA 1I45A 2YW3A 2EKCA 4RR4A 1UUOA 1WXJA 1CI1A 5DY3A 2VFHA 4KWWA 1TPUA 1DOSA 4LU0A 2C14A 4MY9A 3W1LA 2ALDA 1KTCA 5EBUA 3Q37A 3N19B 1WX0A 4BK9A 2EPHA 2GJLA 2ZBTA 5HWJA 1SFJA 4HPXA 4JXCA 4UC5A 4S1FA 2D73A 5AHNA 5FI8A 1PHWA 3QMRA 4IPJA 1EP2A 1PV8A 4M19A 5I3HA 5F2GA 3LGEA 4UTTC 3W7IA 2Y89A 1G4PA 1GVFA 4DF2A 4O13A 5I3FA 2FQIA 1KLZA 4JEQA 1XBVA 3UZ5A 4ADSA 3C2RA 3EX1A 3FS2A 1DKWA 3W85A 4RXGA 1GWJA 1TJPA 1EWEA 2W79A 4O52A 5FEPA 3IVUA 3L21A 4OV4A 3HMJG 3EWZA 1B3OA 3ZFHA 5FF7A 4FX6M 1B57A 3T78A 4LV4A 2NUWA 4UR8A 3L5LA 5E1QA 1D3HA 2J9ZA 1R46A 2JGYA 1T99A 4NZJA 1SZFA 2NLIA 4B5NA 1IXPA 3W7LA 5T26A 1F73A 2JK2A 5BNKA 5G2HA 3C2FA 3LTSA 3H53A 3LLDA 3IIVA 1FUYA 1GQNA 3P74A 4UXDA 3JRKA 2HSAA 3LCWA 4CNPA 3A9IA 3TAKA 3TE9A 4ZZ9A 3L0NA 3LBMA 2WV8A 2ABAA 4K39A 4R7JA 3MW7A 1GVOA 5DLCA 2DZPA 2P10A 2NUYA 3O6DA 2YYTA 3UWYA 3SGUA 3E96A 1LOQA 4J9JA 4JYDA 2QCDB 2RH9A 1X6UA 3S5NA 1BWKA 4Z0SA 3M47A 5A5WA 3NPVA 4NNBA 4WXYA 3TSBA 3PC0A 3CWOX 2FFCA 1X1OA 3PAJA 2ZTJA 1HG3A 1XI3A 3OBKA 4PTNA 3B06A 4U4MA 4AWSA 3NQ2A 1S5TA 3DGRA 3EXTA 4M5PA 2X1SA 3A24A 3QJAA 4HSOA 5DN1A 1PS9A 1F74A 4FNPA 3LHUA 3W22A 4AHPA 4O17A 4DO4A 4O50A 1YDVA 2EAWA 2J9YA 3GNNA 3GAKA 4HSNA 1FCBA 1LCOA 3LX9A 5AB3A 1KM2A 3LHVA 3PG8A 1K8YA 1C9DA 3W3OA 3USBA 1H61A 1X8FA 2P0OA 4WZHA 1VYPX 4N02A 2TPSA 4IMFA 3E9AA 1OFEA 2QCLA 4ORIA 2ZCGA 4KFNA 5F1UA 1JCLA 3BLEA 3PM6A 2OX1A 3B05A 1T0OA 2A5HA 3LRLA 4O1AA 3WJWA 1SW7A 3N2XA 2B0MA 2WNQA 4LTSA 1VC4A 3SECA 4MFDA 3F4WA 4UCGA 5BRBA 3B04A 1ADOA 5GVJA 4RKAA 4JTGA 3G1AA 3F1QA 3GDRA 1TTIA 4E0CA 1TTQA 5EMUA 4YLWA 3TC7A 4HIBA 2WNNA 4MZ8A 4IMCA 3IIZA 4ZQRA 2E6DA 2C15A 3STCA 1R2RA 1OK6A 3R8RA 4RCXA 1ZAJA 4AF0B 3L9CA 4UFHA 4GJ1A 4LC8A 2W0UA 2P1FA 4UTMA 4CLMA 1QPRA 4IMEA 1TREA 3JR2A 3ABSA 1I2RA 3EEGA 4E2DA 1PIIA 3DFOA 1VQTA 5HQEA 3O15A 1AW1A 5G2WA 4GNJA 4MYXA 3KVMA 4Q33A 2B4GA 1TPWA 4HNNA 2ZZ5A 2YPIA 1Q45A 1F5ZA 3NA8A 2FB3A 2GQAA 1G67A 1VZWA 4JTLA 4OBTA 4KFPA 4JTUA 1FQ0A 1SFLA 2CLLA 4ZQMA 3P5ZA 2GVGA 1TRDA 1UB3A 1M5WA 2AGKA 5FF2A 3S5OA 5HWMA 3LCHA 1ML1A 2YCEA 1RPXA 1V5XA 2R14A 5CGQA 2ZQ0A 1F6KA 4EWND 1AW2A 4W9TA 2E5DA 3TNOA 3TCEA 4IPIA 1WOBA 2RKXA 1JULA 4AHQA 4UFIA 3IIPA 4YXGA 3ZR4A 1PL9A 1LOSA 3TFXA 4UMBA 4BI6A 2ABBA 3O16A 5G1TA 4NX5A 5D09A 3EXRA 4K8EA 1PVNA 1SW0A 1UBSA 3G1VA 2YX0A 5CG7A 1LRQA 5AN7A 3NQ7A 4ML9A 2DZWA 1Y0EA 2TSYA 4N2YA 5BMXA 3C6CA 4N9DA 1H51A 4A29A 2QUTA 4LW7A 3NVTA 5LNWA 4Z1AA 1OFPA 5DXYA 1B4KA 1YLVA 4MVAA 3EWXA 3PB2A 3HPXA 1S5VA 5AC6A 1LLWA 2DZXA 1RQEA 2A21A 2FPYA 3BO9A 2ZFAA 3TSDA 1MEIA 2DZVA 1YADA 1JVNA 3I65A 4HPJA 2KZHA 2CZ5A 1BKSA 3CPRA 3O1NA 3L68A 3NNTA 4Y6GA 3NO5A 4UTJA 1FWNA 2B7NA 1U5JA 1KM0A 3W1PA 1THFD 5K3VA 1IXOA 3IGUA 1H7PA 1WBHA 4RXFA 2BXVA 2I14A 5DELA 2A6LA 3RMJA 5CSRA 5KINA 4LUIA 2V2HA 4GWEA 2DP3A 3LV5A 4AXKA 3ZWSA 3FKRA 4HNTA 1VHNA 3C8FA 5D04C 4QNEA 2WPBA 4I9AA 4NUWA 4JTHA 2QCHA 1CX9A 1GPWA 3NQFA 4JTFA 4CCEA 4BWLC 5LGXA 1ICPA 3G1XA 3IV3A 2CLEA 3O6CA 2H8ZA 3PB0A 3W7GA 1OFQA 1X1ZA 3N34A 4OQVA 1XBZA 3C4UA 4BR1A 2ATSA 1KM4A 1XFBA 4OWGA 3HJZA 3TR2A 2VOMA 4LS2A 1LORA 3OVQA 3AO0A 1TJRA 4LOCA 4TR9A 2Y63A 1UASA 5U4NA 3OIXA 3QQ0A 1MSSA 3NL2A 3G8RA 4RJEA 2OMAA 5C55A 2HTMA 2NX1A 3PULA 4JIQA 3UD6A 4I7VA 3M44A 3QMTA 5LHEA 1N55A 3P67A 5I3GA 1DHPA 1FXPA 1O94A 3W2UA 2QCGA 3W1RA 2YFNA 3BW4A 4Z0JA 3NR0A 3DU0A 1V7YA 3SZ8A 3MI2A 5HJLA 3TU9A 1VCVA 2J88A 4RZ6A 3DAQA 3HG2A 4XTDA 3LERA 5CPMA 3W7CA 5FF4A 1AK5A 4FO4A 2J6XA 4AF0A 4O0KA 3M9YA 3M5YA 4XBSA 3UQNA 3UPBA 2NZLA 4A22A 3I68A 3MUXA 4DO5A 3MYOA 4NX0A 1QPNA 1QO5A 3HIJA 4RV8A 4Q32A 3NQ8A 1XDMA 3GK0A 4IMGA 4I7UA 3G22A 4IJBA 1TPB1 5K4ZA 1F7BA 2WO5A 3LHWA 5K2ZA 3DZ1A 5D2WA 4JR5A 3W73A 3UXDA 4N6FA 5D2TA 2VEKA 1SO4A 1VR6A 3IGSA 3LDVA 2QCFA 4K7YA 4NNAA 3UWVA 3H54A 4JNMA 3L67A 2ZZ4A 4ZL1A 3HGJA 1OYCA 2A85A 2W6RA 3EKLA 3FYOA 4UNLA 2V2DA 4HN4A 3A5FA 3FIGA 5EY5A 4X2RA 2E68A 4ZQPA 3W07A 4XKYA 3CM4A 4AWUA 3SJ3A 3LXCA 4OE7A 1FXQA 5F2LA 2QAFA 4XWUA 4K8HA 2VELA 4TO8A 4L4MA 1I2PA 3UY7A 1IF2A 2CLIA 4A2SA 3STGA 1W8SA 4HNUA 1ICSA 3PBYA 3MYPA 2YFOA 2DZSA 4UTWA 3O05A 3B0PA 4QM1A 3TSMA 4EOUA 3THQA 1HFBA 2G97A 5J5DA 4QSHA 3BV4A 1EB3A 4TMCA 1P4CA 5LNRA 2NX3A 3H55A 4S2BA 1UUMA 2PURA 3FOKA 1H7WA 5IM51 3G1FA 1H7XA 4O4WA 3GDKA 2QDHA 1D9EA 3G0UA 2XN0A 4R34A 3VI2A 3P84A 2BSLA 1SR9A 2ZRXA 1D3GA 5G4WA 1JUBA 1K03A 4IWWA 3MHFA 4M6PA 2VC6A 3CIXA 4MYAA 3QH2A 3JS3A 3CEUA 4FB7A 2YXGA 1W31A 1ZHAA 1LOLA 1PE1A 2TRSA 3UWZA 1W5OA 4PL1A 5KITA 4TMBA 2V81A 1TRIA 4NJKA 2PE4A 5L9FA 3HPZA 1PHQA 1SZEA 1VH7A 3B4UA 5G5IA 2YSWA 4LT9A 1SPQA 4AMAA 4LY8A 3ZWTA 3CHVA 3DHDA 1ZJIA 3NZ1A 1VCGA 2O7QA 2ZTKA 3LLFA 3HG5A 2NV1A 5K4XA 1P0NA 1XUZA 3TQKA 4WY0F 3NQEA 2VKZG 4OV9A 5TIMA 1RZMA 3LRMA 4O15A 3OHIA 4N4QA 1AL7A 3NEVA 2PRLA 2QF7A 5FF0A 1Q6RA 5FEWA 1A5CA 4A3UA 2CWNA 2WSRA 1XUUA 1QOPA 3CB8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KCZ A;  1J6O A;  1OFR A;  3VOJ A;  4CVU A;  4KGL A;  5JBE A;  3ARP A;  1GZG A;  3CZG A;  5EMY A;  2VEI A;  2XGI A;  3TTQ A;  3GC2 A;  3SGZ A;  3B0V C;  4GKT A;  4KEU A;  5HAO A;  3QOK A;  3WLT A;  2R1P A;  1J0J A;  1JZ2 A;  3CZK A;  1BQG A;  4DXV A;  3P62 A;  5CLT A;  1FKW A;  3D0C A;  3N2B A;  2J13 A;  2C1I A;  2Q6Z A;  1H5Y A;  3M16 A;  3NL5 A;  2KX9 A;  3EMQ A;  3ARX A;  1UQY A;  1DXI A;  2HS6 A;  2DU2 A;  1J0K A;  3GM8 A;  1NFB A;  4N9E A;  1WZM A;  1WKE A;  1CXF A;  5DBT A;  4GAC A;  1R7O A;  4WQ6 A;  1NEY A;  1BG4 A;  3WF4 A;  1IXQ A;  2REQ A;  4GUJ A;  1FWW A;  2PDY A;  1XG4 A;  3E6E A;  2CHO A;  3B9E A;  3MI3 A;  1E5N A;  3WDI A;  4YHG A;  1FWA C;  4HOW A;  3NZQ A;  2FB2 A;  1Q8J A;  3VCN A;  4GNV A;  3UJF A;  3W23 A;  4Z2H A;  5AYX A;  4UOQ A;  2XVK A;  2FLI A;  4ZMG A;  2CXG A;  2PD5 A;  2VYO A;  3NL6 A;  3R2G A;  1JFH A;  4M80 A;  2I5I A;  3MJM A;  2XG9 A;  5CPT A;  3TC6 A;  1H63 A;  4ERI A;  1IEX A;  2ZZ1 A;  2PRH A;  1IR2 A;  1FHU A;  1ZLP A;  1GQJ A;  5CH9 A;  3BJF A;  3I7S A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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