1JV0A

The crystal structure of the zinc(ii) adduct of the cai michigan 1 variant
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
DWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFRVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE I
publication title Crystal structure of a zinc-activated variant of human carbonic anhydrase I, CA I Michigan 1: evidence for a second zinc binding site involving arginine coordination
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 68
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2001-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1jv0A00
3P44A 1BNMA 3S8XA 2HD6A 3F8EA 4Q7WA 2X7UA 1DMYA 4UOVA 3R16A 4CNXA 3M2ZA 4YXIA 3K7KA 3V3JA 4ZAOA 4RFCA 4KNIA 4Z0QA 3D8WA 1BN3A 1G52A 4HEWA 2ILIA 1YDDA 4QIZA 1UGBA 4IDRX 1XQ0A 2HL4A 3QYKA 5BNLA 12CAA 4TWLA 3V5GA 4GL1X 5E5UA 4PZHA 1G48A 3S75B 4MO8A 3KIGA 4BCWA 3D0NA 2WD2A 1TTMA 4YGNA 4WW6A 3M1QA 5SZ5A 4MDMA 1BV3A 1KWQA 3KKXA 4R5BA 4YGLA 5SZ1A 2WEHA 3MNKA 3RYJB 5JG3B 4K0SA 1THKA 1RZCA 3F7UA 4Z1NA 5E28A 1CCTA 5FNJA 4FU5A 2NWPA 1OKMA 5EKHA 2CABA 5G0BA 3IBUA 1CALA 5DSPA 3S73B 5FNGA 1BN4A 4KNNA 4QK2A 1YDBA 3NJ9A 3NB5A 4K0TA 4L5VA 4RIUA 4XIXA 4QIYA 3RZ8A 1BZMA 1CAZA 4Z1KA 3T82A 3S78B 1JD0A 1YO2A 4RIVA 3JXHC 1FR7A 3DD8A 4QSAA 5EKJA 1Y7WA 3V3GB 4Q83A 3ML2A 1RZAA 4Q81A 3RGEA 4YGKA 3IEOA 3P55A 1JCZA 3V2JA 5G03A 1IF6A 2POVA 4JSWA 4K13A 1FQNA 3M1KA 1AZMA 1FQLA 1IF4A 4ZX0A 1RZBA 1Z9YA 4QSIA 5DSJA 1BNWA 1OQ5A 3KONA 3U45X 4Q07A 3BETA 1J9WA 1CANA 3HKUA 1G1DA 5DSNA 1OKLA 3RZ0B 1H9QA 1I9NA 3M14A 3M96A 2VVBX 3DBUA 3S74B 3DV7A 1I91A 4JSZA 2NNOA 4PYXA 4FL7A 5E2NA 4KAPA 1I90A 4QEFA 4RFDA 1CZMA 5BRVA 1HUGA 4HEZA 5DSOA 4QJOA 3M2YA 2CBDA 1CVAA 2FW4A 3RYVB 3MHCA 5FLPA 1HECA 3TVNX 9CA2A 3RG3A 3K2FA 4QY3A 3SBHA 4COQA 5DOHA 5FDCA 3IBIA 1KOPA 1RZEA 5E2KA 3KWAA 5FL6A 4PQ7A 4Q7VA 2H15A 2X7TA 5AMLA 4Q6DA 5DSKA 4CACA 3S9TA 5HPJA 4C3TA 1ZSCA 3FE4A 3D9ZA 2WEGA 4ETQC 5EZTX 1BNTA 5DVXA 2OSMA 2AX2A 4MLXA 2WD3A 4N16A 2QP6A 4Q87A 3PYKA 3SBIA 3M40A 1DCBA 2IT4A 1HCBA 4Q78A 3RZ7A 1G4OA 4Q8YA 4E3HA 1CNGA 2GEHA 1LG6A 4N0XB 1I8ZA 2FMZA 3V3HB 2NN1A 5JEGB 1ZSBA 1TB0X 2FOYA 3JXGA 1Z97A 5EH7A 4QTLA 1IF8A 3DCCA 4FRCA 1YO1A 2ABEA 4KNMA 5FLOA 3FW3A 5FLSA 3T83A 1CVHA 3RG4A 1CCUA 1A42A 1ZGEA 1F2WA 1CNHA 2NXRA 4KP5A 4XZ5A 4RN4A 3HKQA 1TG3A 3UYQA 1ZFQA 2EZ7A 7CA2A 1CNWA 1H9NA 4Y0JA 5FLTA 1DCAA 5EHEA 5C8IA 3MZCA 2QOAA 4M2RA 3U3AX 3M5TA 1CAIA 3RZ1B 1CNXA 1CVFA 1ZNCA 3N4BA 1FSRA 5EKMA 1BCDA 4L5UA 4WUPA 4ILXA 3S77B 3T5UA 5AMGA 3T5ZA 3M2XA 2O4ZA 1URTA 1G0FA 1I9MA 4Q9YA 1HUHA 3M04A 4RUZA 3KLDB 3KS3A 5FL4A 1RJ5A 3OYSA 4E5QA 2FOSA 4CA2A 4E3GA 4XFWA 6CA2A 1YO0A 3F4XA 1V9EA 1G0EA 3MNIA 3MNJA 5SZ7A 5DSIA 4JS6A 1CAMA 2EU3A 3M2NA 3ZP9A 1TBTX 2HFWA 5LMDA 2POUA 2ZNCA 3OKVA 4Q8ZA 4QK1A 3V3IB 1FLJA 4Q7SA 1G54A 4XE1A 2HNCA 5BYIA 3PJJA 3U7CA 2NXTA 3N3JA 3D92A 2CBBA 3JXFA 3Q31A 3TMJA 5BRWA 4KUWA 4E49A 2W2JA 1AVNA 2QO8A 5SZ3A 4RH2A 3F7BA 4E9OX 1BICA 3M5EA 1CNYA 4M2WA 3B1BA 1HVAA 4E3FA 1YDCA 5FL5A 3KNEA 4YGFA 3W6IA 1RZDA 1HEDA 4MDGA 4YGJA 4M2UA 1CRAA 5JGSB 4RUXA 4R59A 5FNHA 4CNRA 5EH5A 1CAYA 1BNQA 4LP6A 4M2VA 2CBCA 1TE3X 5FDIA 3W6HA 8CA2A 3MDZA 3IGPA 1CVDA 2FOUA 5DOGA 2H4NA 1CAJA 3M1WA 4K1QA 5L6KA 1BN1A 4ITOA 3P5AA 4Q0LA 1CNBA 1TEQX 1UGAA 4FVNA 4MTYA 2NMXA 2Q1BA 4ZWIA 1LUGA 3HKNA 3MMFA 1FSQA 3VBDA 3OKUA 1TH9A 4Q09A 1EOUA 1OKNA 4FVOA 3P58A 2NWOA 2FOQA 4HEYA 3EFTA 5DSRA 3M67A 3IAIA 4YXOA 3KOIA 4HF3A 1CNIA 4BF1A 3RLDA 3DVDA 1V9IC 3HFPA 5SZ0A 1ZH9A 5EHWA 4Q49A 4ZWYA 3EFIA 1RJ6A 2FOVA 1ZGFA 3ZNCA 5L3OA 3HKTA 1UGFA 1CA2A 4JSSA 1UGDA 3M5SA 3DAZA 3V3FA 1CRMA 3T85A 1XPZA 4G0CA 1HEBA 3P4VA 1I9OA 5E5RA 1ZSAA 2NN7A 4WW8A 1G6VA 3FFPX 5FNKA 1ZFKA 4R5AA 5A6HA 4MDLA 5JGTB 3IBNA 1G4JA 1I9QA 3MHLA 1G45A 1CAHA 5JEHB 4QJPA 3OIMA 3M3XA 3N2PA 5JESB 1RAZA 3MNAA 2POWA 4HU1A 5G01A 3DVBA 5SZ2A 5G0CA 2GD8A 1DMXA 3MNUA 4WR7A 5J8ZA 1CAOA 5SZ6A 4PYYA 4E3DA 1G46A 2CBAA 1LZVA 2NNSA 5EOIA 3V7XA 2NXSA 1CNCA 5FNIA 4DZ7A 3DD0A 4Q06A 4G7AA 2FNKA 4DZ9A 3DA2A 5EIJA 4LU3A 1UGEA 1CCSA 4K0ZA 4QK3A 3B4FA 3MWOA 4WUQA 4CNVA 1KEQA 4RUYA 3N0NA 2CA2A 2EU2A 5DSLA 4QJWA 4PXXA 2FNMA 2HKKA 1CVBA 1MOOA 3R17B 5DSMA 5JEPB 5BRUA 3IBLA 3L14A 1T9NA 1CAKA 3S71B 3OILA 3P3JA 4MLTA 1H4NA 1CVEA 1I9PA 2NWZA 1CNKA 1FR4A 1CNJA 2Q38A 4KUYA 3GZ0A 3SAPA 3S76A 3NI5A 3RJ7A 1IF5A 1FSNA 1G53A 1TEUX 1ZE8A 2FMGA 1XEVA 3S72B 1IF9A 1XEGA 4E4AA 4ZWZA 5AMDA 5E2MA 1LG5A 4JSAA 1BNVA 2CBEA 5FNLA 3DVCA 1TG9A 1BNUA 4ZX1A 1G3ZA 2Q1QA 5FNMA 3ML5A 1CA3A 3MNHA 4Q8XA 5EH8A 5FLRA 3PO6A 5JQ0A 4QSJA 3MHOA 5JQTA 3CYUA 3HLJA 3S97A 4YVYA 3DC9A 1CILA 3OIKA 4HBAA 3HS4A 4IWZA 5E2RA 4CNWA 2NNVA 1KOQA 4Q90A 3TVOX 3BL0A 5JG5B 1YDAA 3UYNA 2OSFA 1LGDA 2HOCA 3LXEA 3M98A 3MYQA 3MHIA 5DSQA 3KOKA 5CA2A 3DC3A 5DRSA 4QJ0A 3SAXA 3RYXB 3OYQA 4YHAA 4LHIA 4YWPA 1JV0A 2VVAX 5E2SA 5JDVB 2FNNA 1I9LA 4WL4A 1RAYA 3K34A 5SZ4A 3CAJA 4CQ0A 3V2MA 1IF7A 4BF6A 4Q7PA 1CIMA 3P5LA 4YXUA 1FQRA 4FIKA 3U47A 3BL1A 4KV0A 4YX4A 3M1JA 1HCAA 1UGGA 2WEJA 4Q08A 2NWYA 1FQMA 4XIWA 1UGCA 5CACA 4Q99A 3DCSA 3P3HA 3RZ5A 5EHVA 4Z1EA 4KUVA 4QSBA 1AM6A 2F14A 4Z1JA 1MUAA 3RYYA 3T84A 4QJXA 4ZWXA 1KWRA 3CZVA 5CLUA 3MHMA 5A25A 1HEAA 3C7PA 4ITPA 2AW1A 5IPZA 4HT2A 1BNNA 1CINA 2X7SA 4KP8A 3RYZA 4X5SA 3D93A 4QJMA 4YYTA 4KNJA 4Q6EA 4FPTA 5FLQA 3CA2A 2WEOA 4HT0A 3DCWA 5CJFA 1Z93A 2NNGA 4TWMA 4L5WA 3OY0A 1CVCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P44 A;  1BNM A;  3S8X A;  2HD6 A;  3F8E A;  4Q7W A;  2X7U A;  1DMY A;  4UOV A;  3R16 A;  4CNX A;  3M2Z A;  4YXI A;  3K7K A;  3V3J A;  4ZAO A;  4RFC A;  4KNI A;  4Z0Q A;  3D8W A;  1BN3 A;  1G52 A;  4HEW A;  2ILI A;  1YDD A;  4QIZ A;  1UGB A;  4IDR X;  1XQ0 A;  2HL4 A;  3QYK A;  5BNL A;  12CA A;  4TWL A;  3V5G A;  4GL1 X;  5E5U A;  4PZH A;  1G48 A;  3S75 B;  4MO8 A;  3KIG A;  4BCW A;  3D0N A;  2WD2 A;  1TTM A;  4YGN A;  4WW6 A;  3M1Q A;  5SZ5 A;  4MDM A;  1BV3 A;  1KWQ A;  3KKX A;  4R5B A;  4YGL A;  5SZ1 A;  2WEH A;  3MNK A;  3RYJ B;  5JG3 B;  4K0S A;  1THK A;  1RZC A;  3F7U A;  4Z1N A;  5E28 A;  1CCT A;  5FNJ A;  4FU5 A;  2NWP A;  1OKM A;  5EKH A;  2CAB A;  5G0B A;  3IBU A;  1CAL A;  5DSP A;  3S73 B;  5FNG A;  1BN4 A;  4KNN A;  4QK2 A;  1YDB A;  3NJ9 A;  3NB5 A;  4K0T A;  4L5V A;  4RIU A;  4XIX A;  4QIY A;  3RZ8 A;  1BZM A;  1CAZ A;  4Z1K A;  3T82 A;  3S78 B;  1JD0 A;  1YO2 A;  4RIV A;  3JXH C;  1FR7 A;  3DD8 A;  4QSA A;  5EKJ A;  1Y7W A;  3V3G B;  4Q83 A;  3ML2 A;  1RZA A;  4Q81 A;  3RGE A; 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