The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
72
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structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADKAYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Protein L
|
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Finegoldia magna
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| total genus |
11
|
| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4HKZ E; 5HI1 A; 1P7E A; 5BMI A; 1KH0 A; 2GB1 A; 2JWU A; 4GLS C; 2N9K A; 3GB1 A; 1MHH E; 2RPV A; 2LGI A; 5HFY A; 3FIL B; 4MAC A; 2JXT A; 1MVK A; 2LHE A; 1MI0 A; 2IGD A; 2IGH A; 4OZC A; 4OZA A; 4D2K A; 5HG2 A; 4KGR A; 2JSV X; 1PGA A; 1YNT E; 2PTL A; 3UI3 A; 1PGX A; 1YMH E; 1K53 A; 1JML A; 1PGB A; 1P7F A; 5BMH A; 2PLP A; 1ZXH A; 2NMQ A; 4IOI E; 2LHD A; 1QKZ A; 2QMT A; 5HHD G; 2PW9 A; 1HEZ E; 1GB1 A; 1UWX A; 1MPE A; 2KWD A; 1F2R C; 1Q10 A; 4KGT A; 1D4B A; 1GB4 A; 2IGG A; 2I2Y A; 2JU6 X; 2ZW1 A; 2ZW0 A; 2KQ4 X; 1XCQ L; 1MHX A; 1XCT L; 1K51 A; 2JZP A; 2LUM A; 1HZ5 A; 4OZB A; 1IBX A; 3FIL A; 2J52 A; 2N7J A; 5BMG A; 1F2R I; 1FD6 A; 4KGS A; 2ONQ A; 4WH4 A; 1FCL A; 1IGD A; 2GI9 A; 2QSD A; 5JXV A; 1FCC C; 1HZ6 A; 1EM7 A; 3V3X A; 4HJG E; 1K50 A; 2EEL A; 2J53 A; 1K52 A; 1IGC A; 1XF5 L; 2ON8 A; 2N9L A; 1IBX B; 2K0P A; 3MP9 A; 2KDM A; 2KN4 A; 2OED A; 1C9F A; 2KAC A; 4IKG A; 2RMM A; 2I38 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2V4I B; 3QX1 A; 1TIF A; 2KQ7 A; 2X8X X; 4KKI A; 4II3 B; 2I1J A; 2GB1 A; 3RMK C; 3X23 A; 2C7M B; 4LNI A; 3TUO A; 1S1Q B; 4X57 B; 1V49 A; 4W9J A; 1N60 A; 1MHH E; 3PRP B; 1L5P A; 4RM8 A; 2NVU I; 1JWU D; 1KF6 B; 4BOZ B; 2IO2 B; 4XZ4 A; 1WFY A; 3ZRC A; 1WYW B; 3M95 A; 1KLV A; 3DHH C; 3H8H A; 4E71 A; 3AEE B; 1R4N I; 2O6V B; 2W54 A; 1RWS A; 2DBY A; 3DBH I; 4ZRP A; 3DHG C; 3V6C B; 4F7Z A; 2N9X A; 1XLQ A; 2KDF B; 3EUB 2; 1U4A A; 1NEN B; 2ZNV C; 1ROE A; 2PE9 A; 3DPD A; 2NS5 A; 5H92 C; 1NI2 A; 3T3N A; 1J0G A; 4KSK C; 3W5V B; 2Y5P A; 1Q10 A; 1D4B A; 3GP7 A; 2I2Y A; 3P4Q B; 1XCQ L; 4NZL B; 2FUH B; 4MEM A; 4W9F A; 3TEZ A; 1P9D U; 5FR6 A; 5E6N A; 3UF8 A; 2KDI A; 2MX2 A; 5TR5 A; 1NDD A; 1F77 A; 1NEK B; 2V9H A; 5J2R A; 4NAW A; 3CIR B; 1FCL A; 4WQO B; 3VTW A; 2LRU A; 4MT5 A; 4FJY A; 5HKH A; 4HKQ A; 2DAF A; 2OOB B; 5IAA C; 1I35 A; 1XLO A; 3BK2 A; 4MEL A; 2K1F A; 2K39 A; 3KLS X; 1F0Z A; 2JYE A; 2RMM A; 3WA0 A; 3IAS 1; 2KFK A; 2KJ6 A; 3APC A; 5BMI A; 3ZUN A; 4A90 A; 2DWQ A; 5DPW A; 4FUL A; 4YSY B; 4OVV A; 2RDH A; 1AN8 A; 4LDT D; 3KH0 A; 1FPY A; 5D3I B; 1MVK A; 1LO5 D; 3QWZ B; 4DXF A; 5GXG B; 3U8Z A; 2QIL A; 3QAR A; 5L95 C; 4MJS A; 3TEX A; 1TTN A; 3RN9 C; 1OQR A; 3S2A A; 1ET6 A; 2QJL A; 2MJD A; 4GDL B; 2MLB A; 2KN5 A; 5BYR A; 1K53 A; 2WXF A; 3BVM A; 1L0X B; 2AQ3 B; 2O6V D; 1WGH A; 1P7F A; 1WGK A; 1L0V B; 1QOF A; 2VRR B; 1OFF A; 4NY0 A; 4US8 A; 1TGZ B; 1P1A A; 1GB1 A; 3H6N A; 3Q8C A; 4TKN A; 2KD0 A; 2KX0 A; 3VRA B; 1L4D B; 3RNB C; 4DDI D; 2WU5 B; 3PGE A; 5G5G A; 2JRH A; 2ZVO A; 1RLF A; 2BKF A; 1FD6 A; 2W82 A; 2YEP F; 4YTM B; 4M8M A; 4W9E A; 2QIE B; 3MJ5 A; 4M02 A; 3MFG A; 3VUY A; 1YN3 A; 5IKC M; 3V3X A; 2Q5W D; 3Q3J A; 2J4X A; 4URK A; 2MW5 A; 5G55 A; 2BWE S; 2K0P A; 1E7U A; 3TSS A; 3Q3O C; 3EEC A; 2GBR A; 3NG0 A; 1RAX A; 2FE8 A; 4N9F 4; 1WR6 E; 2IO1 B; 3BYT B; 4EZK A; 1WI0 A; 1YJI A; 5G2N A; 5D2M B; 3GOE A; 2FCN A; 1AAR A; 2BS4 B; 2VH2 A; 3A1Q B; 1SE3 A; 1WY8 A; 3V6E B; 1MI0 A; 3RNA C; 2RPQ A; 2GBJ A; 1R4N B; 1PGA A; 3DBH B; 3U4E G; 5DPS A; 3UI3 A; 1WMH A; 4HRS A; 1HA5 A; 4HPM B; 2XN9 C; 1SXT A; 1NYQ A; 4IWP A; 1MG8 A; 3LB8 C; 4ZRJ A; 1B1Z A; 4W9H A; 4YSX B; 3IT6 B; 2PW9 A; 3ZYY X; 1UWX A; 1SGH A; 4G0N B; 2LVP A; 1T0Q C; 1SE9 A; 3SDL C; 3DBL I; 2KNB A; 1ZUD 2; 2ZNV B; 2XBB C; 1SJH D; 3TBL D; 1JRO A; 5BYS A; 3PLU A; 1ZPS A; 2BVC A; 3I63 C; 1JAL A; 1JWS D; 2RGF A; 2N4F A; 3HK0 A; 4MSQ B; 1N6Z A; 2Z59 B; 2KDB A; 3DBR I; 2WX0 A; 1TS3 A; 3OWE B; 1FRR A; 1Z5S B; 2EEL A; 2K3U A; 3AE3 B; 1BML C; 3WAM A; 3B08 A; 3R3M A; 2ON8 A; 2YLM A; 1VJK A; 3NRZ A; 2KDM A; 2OJW A; 3FAH A; 1GOZ A; 3WAP A; 5LXH A; 3QHT A; 3KYD D; 2WWZ A; 2J0K A; 3I5J C; 5HI1 A; 4GGQ A; 1E8Y A; 3JW0 X; 4ANX A; 4ZDV A; 4ZRK A; 4GXB A; 1V97 A; 5HFY A; 1BT0 A; 3GZN I; 2L32 A; 2Y3A A; 1FM0 D; 3RNF C; 2KOX A; 4ARI A; 4KSL C; 5JHA A; 5DPR A; 5EE1 A; 1BUI C; 3ZRF A; 4AOF A; 5AUI A; 1J19 A; 3VTU A; 4XWW A; 4P1C C; 4WJP A; 3ZTC A; 3H7P A; 2M0A A; 4C7Y A; 2MA9 B; 1RFA A; 3ZVV A; 2QHO A; 2CJN A; 4XWT A; 2QMT A; 2A4Z A; 2HDE A; 3PSE B; 1K8R B; 1TKY A; 3A9J A; 4P16 A; 1ET9 A; 1T0R C; 2MH7 A; 2UWQ A; 3JVZ X; 4BOS C; 3PZ7 A; 4WQM A; 5I4D A; 1C77 A; 4ZYN A; 1PYW D; 5BO4 B; 1V2Y A; 1WXA A; 4K81 A; 2FID A; 3AEA B; 3MJW A; 4RF0 A; 2G9H D; 4WWO A; 4NNJ B; 2RR9 A; 2KAJ A; 1HZ6 A; 1V9J A; 4KX6 B; 3IBE A; 2Y5C A; 1SB3 C; 4B0M A; 1V6E A; 1E6E B; 2V1Y A; 3RT3 B; 2WS3 B; 2H88 B; 1LQB A; 2LWP A; 3N20 C; 4RM9 A; 2CHX A; 3UGB B; 1VZ6 A; 4LK0 M; 2WHI A; 2LUE A; 3KYC D; 4DHJ D; 3ZXR A; 2LGD A; 2WP9 B; 1YQB A; 4BFR A; 1WIA A; 4ZHO A; 2REX A; 4FJV B; 2JPH A; 3BZD B; 1HE8 A; 3DOW A; 3ABV B; 4ICU A; 4REZ A; 2V0G A; 1GC6 A; 3FIL B; 2IY0 B; 4OHJ A; 4JIO U; 2PE6 B; 5KHQ A; 3ZQ4 A; 3HM6 X; 2JZ3 B; 5IN7 A; 3QK0 A; 1XLP A; 1DOI A; 2EMT A; 2PKO A; 5HG2 A; 1AWD A; 4IWQ A; 4EZJ A; 1PGX A; 2GBK A; 2V3S A; 3ZNH B; 1PGB A; 3MC0 B; 3BIN A; 1TS5 A; 5FK9 C; 4WUR A; 1H8C A; 2WXI A; 5LXI B; 1JWB D; 4N6E B; 3NOB A; 1VCB A; 3DBL B; 1KM7 A; 1I4G A; 1C78 A; 4MH8 A; 4IM0 A; 1PUT A; 1F2R C; 3VQI A; 3H7P B; 3P4P B; 1TZ1 A; 1IUE A; 4XDC A; 1WGR A; 3U2S C; 4HRO A; 3VAW A; 2D5G A; 3SD5 A; 4BKS D; 4NJ7 A; 2N7J A; 4DK5 A; 1F2R I; 4JL9 A; 3A9J B; 2JVC A; 2KQS A; 2KHW B; 1N61 A; 2QEJ C; 3VRB B; 4B9K A; 3AE9 B; 3ZIM A; 1WJN A; 2JF5 A; 4JWU C; 3M3J A; 2NTT A; 2W3S A; 1XF5 L; 4NQK E; 2CU3 A; 3I3T B; 4NAM A; 1SIJ A; 3KUZ A; 4MM3 B; 4WWP A; 1ZW7 A; 2NR2 A; 1J8C A; 1FIQ A; 3RI7 C; 3RPF C; 1E10 A; 1V5O A; 5JZE B; 2IDY A; 2KTR B; 1VZ8 A; 3OG5 A; 5AZG A; 2R2O A; 1M4V A; 3R2I A; 4P1B C; 3GB1 A; 2UU7 A; 2PMV A; 3I9V 1; 4K7U A; 2RPV A; 1NYR A; 3GZN B; 3L08 A; 2XK5 A; 1GNU A; 2WYQ A; 2JXT A; 2ZVN A; 4FAD A; 1D5X C; 2D3A A; 4NQL B; 2N1V A; 4RF1 A; 1J7C A; 2LAS A; 4S0R A; 3AM9 A; 3ML8 A; 3ZTD A; 4I6L B; 4YTP B; 4JPS A; 3MC9 A; 1UGJ A; 2PEA A; 2HJ1 A; 2KFJ A; 4LDT B; 4K3C A; 1HTO A; 3A9K B; 3PS6 A; 3VR9 B; 5IP4 D; 2L8J A; 2SAK A; 3DVG Y; 4RGM A; 5FR3 A; 2G4D B; 4BBN C; 2WDT B; 4A3O A; 1IP9 A; 2D3G A; 3APF A; 5D7G A; 5AZH A; 4DHZ B; 1WGG A; 1XEE A; 1KOT A; 1UBI A; 2ZW0 A; 2ZEQ A; 3IFW B; 2Z0E B; 1T0S C; 3TMP B; 4HLE A; 4ACF A; 1WWT A; 1DOY A; 4ARC A; 2MBE A; 4M01 A; 4MGZ E; 1C3T A; 4HPP A; 3AEC B; 2KC1 A; 4HJG E; 2D2Q A; 1K50 A; 1TT5 B; 1MJD A; 4BBN F; 1XXG A; 2NCN A; 1UZX B; 1ZXI A; 4B0E A; 2MJ3 A; 1XQQ A; 2KT7 A; 3WAL A; 4E3C A; 1PQS A; 2DZK A; 3PV1 A; 1WX8 A; 5EE3 A; 1P98 A; 4W9D A; 4KIK B; 1T0Y A; 3VR8 B; 2A5U A; 3NUH B; 4HKZ E; 1XO3 A; 2LVQ A; 3PRZ A; 4C4V B; 4F1S A; 5C23 A; 2AWT A; 4ICV A; 2ICI A; 1E0Z A; 3ZW3 A; 4UDU C; 3HVZ A; 3UIO B; 5KHO A; 4XGA B; 2L1A A; 3AU5 A; 2PVO D; 2ZCB A; 2MBB B; 2KWU B; 2PIA A; 3V05 A; 4HCP B; 2IGD A; 2N7E A; 3Q8A A; 4L2Y A; 4D2K A; 3O13 A; 4XE0 A; 3ZNZ B; 2K6Q A; 3QQ8 B; 3EA6 A; 1WJ6 A; 1SE2 A; 3E9S A; 2NPT B; 5MPO A; 2J0M A; 3T8M A; 3A4R A; 4MH0 E; 5IOI A; 1WRI A; 2XK5 B; 1QZE A; 2ZJD A; 2O2V A; 2X38 A; 5DPT A; 4CHK A; 4LJO B; 1UEL A; 3DQV A; 4W9G A; 3L10 B; 4A6Q A; 1TY0 A; 2NMQ A; 2OJR A; 4IWO A; 2M17 A; 5G5H A; 2L3Z A; 1V86 A; 3CMM B; 1HQR D; 3AH7 A; 2ZW1 A; 3L13 A; 4LJP B; 2DZI A; 4HXD A; 3TEW A; 5L83 A; 2LUM A; 2B3A A; 3ZNG C; 1UWM A; 2GLS A; 3MHS D; 4JGH B; 3RUI B; 1WX7 A; 4A3P A; 3LJ3 A; 1WE7 A; 2AQ2 B; 5C2T B; 2QSD A; 2JUO A; 2BS2 B; 2BB6 A; 5AZF A; 4AP4 C; 3AE8 B; 1EWY C; 1RM6 C; 4DDG D; 2BYF A; 4Q2J A; 2LGY A; 4DHZ E; 4WAA A; 3BYY B; 2L05 A; 1KLU D; 2OED A; 2MJE A; 2DAJ A; 2PJH A; 3R2T A; 4LTU A; 3QCA A; 4RMA A; 4JX1 C; 1P0R A; 3IVF A; 3TJP A; 4FLH A; 4C56 C; 3CSF A; 5CHW A; 2JWZ A; 2RDG A; 4MAC A; 3I57 A; 2CS4 A; 3WAO A; 3HIZ A; 4NAW B; 3KWL A; 4KKJ A; 3E56 A; 2KYW A; 3AEF B; 2K8C A; 2K9X A; 1E7P B; 4TQ1 A; 1J7B A; 1WGY A; 3Q69 A; 3P1M A; 2BYV E; 1JML A; 3R7R A; 1KRH A; 2D10 A; 2HTM E; 4DXA B; 1X1M A; 2HTH A; 1E8Z A; 1VRA B; 4LCD E; 3W2D A; 3PPA A; 2LHD A; 3NZU A; 2KFK B; 3JSV A; 4K1R B; 3NS1 A; 1Y8R C; 1EF5 A; 2N7D A; 2O2V B; 1XD3 B; 4WJQ A; 1Q0W B; 2WNM A; 4NPN A; 5LNK 1; 1HZ5 A; 3M62 B; 4IM3 A; 2KO3 A; 1JRU A; 4KGS A; 3ETR A; 1D6E C; 3R66 C; 4MJS B; 2TSS A; 5C1Z A; 5JXV A; 3BVZ A; 3KVF B; 3TEY A; 1QQR A; 4M0W A; 3UIP B; 4DBG A; 4DWF A; 3SHQ A; 4RCO A; 4XYC A; 2KMC A; 1ZGU B; 4LNK A; 2GBM A; 3R7Q A; 3UQB A; 2R61 A; 1STE A; 2LVO A; 4W9I A; 3V62 A; 4ANW A; 3AB5 A; 3VH4 B; 1Y56 A; 4PYZ A; 2WXJ A; 4GMV A; 3B2F A; 1Q5W B; 2IO3 B; 2R2Q A; 2EMS A; 4JLC A; 4BKT A; 2WDV B; 3B0A A; 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3J9C A; 3B2G A; 2M56 B; 5DCN A; 4EKU A; 2BGF A; 1WGD A; 3GS2 A; 3KUC B; 2WLB A; 2HE7 A; 1C76 A; 3W1Y A; 3U52 E; 1GJZ A; 1MPE A; 3BVG A; 2KVR A; 2MWS B; 3DVN U; 2YVC A; 2ZPN A; 1JW9 D; 1GG3 A; 1XCT L; 2NBV B; 1TZO A; 1IYF A; 3DBS A; 1QT9 A; 4KZC A; 3H7S A; 1XT9 B; 4M8N A; 1DGJ A; 1DOX A; 3RFZ B; 1S3S G; 4US9 A; 3SR6 A; 1A70 A; 1FFV A; 1YN4 A; 3V61 A; 3N30 A; 4ITK A; 2L0F A; 2O6V A; 3ZJU A; 4PYU A; 4G50 A; 2M19 A; 5BYQ A; 3OAW A; 2QDF A; 3VTV A; 3QA8 A; 1WXM A; 1TY2 A; 4RGT A; 4GIV A; 4EFO A; 2AQ1 B; 4J3O D; 3PHX B; 3ZJV A; 1SE4 A; 2AYO B; 2KWC A; 4HK2 A; 1N5X A; 4R3D A; 3AE1 B; 2L00 B; 1WXQ A; 3HRD D; 4B6W A; 5E6J A; 3U7D A; 2EKI A; 3SEB A; 2ASQ A; 3FKY A; 4ANV A; 4W9K A; 3DDC B; 2GOW A; 2JQR B; 1WM2 A; 2L52 A; 4BKG A; 3AU4 A; 4NJ6 A; 2M0X A; 1E9M A; 2QC8 A; 1ZP0 B; 3AXC A; 2C7N B; 1M94 A; 4HDO A; 2KWV B; 4ZOH C; 2AEH A; 5C3J B; 3C0R B; 1ZXH A; 3CWI A; 2WXL A; 1LFD A; 4IW0 A; 4K7S A; 1KTK A; 2AL6 A; 3M63 B; 2JXX A; 4KDL B; 1CK1 A; 4AJW A; 2L0T A; 1F52 A; 2VZK B; 1GUA B; 3QC8 B; 4RFB A; 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