The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
72
|
structure length |
72
|
Chain Sequence |
MHHHHHHAMEEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTFEKATSEAYAYADTLKKDNGEWTVDVADGGYTLNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Protein L
|
| publication title |
Single-site mutations induce 3D domain swapping in the B1 domain of protein L from Peptostreptococcus magnus.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Finegoldia magna
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| total genus |
20
|
| structure length |
72
|
| sequence length |
72
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-10-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JSV X; 1IBX A; 1MVK A; 4KGS A; 1K52 A; 1D4B A; 1XF5 L; 2QMT A; 2QSD A; 1P7F A; 1HZ5 A; 1MHH E; 1Q10 A; 3MP9 A; 1GB1 A; 1YMH E; 1KH0 A; 4KGT A; 2I38 A; 1IGD A; 2ONQ A; 1F2R I; 5JXV A; 5BMI A; 2LGI A; 2J52 A; 2IGH A; 2JZP A; 2LHD A; 2J53 A; 2N9K A; 2IGD A; 1PGB A; 1MHX A; 1HZ6 A; 2PLP A; 1ZXH A; 1F2R C; 5HI1 A; 2GB1 A; 1QKZ A; 1FD6 A; 1XCT L; 3FIL A; 4GLS C; 2EEL A; 2KAC A; 2RPV A; 2JWU A; 2GI9 A; 2ZW0 A; 1IBX B; 1JML A; 1HEZ E; 2RMM A; 1UWX A; 1MI0 A; 3FIL B; 1K51 A; 2K0P A; 4HJG E; 1FCL A; 1IGC A; 3UI3 A; 1P7E A; 5HFY A; 2OED A; 2ON8 A; 1XCQ L; 4D2K A; 2KQ4 X; 2LHE A; 2NMQ A; 2KN4 A; 2LUM A; 1YNT E; 4OZC A; 1GB4 A; 2KWD A; 5HHD G; 3V3X A; 1MPE A; 4IOI E; 2KDM A; 4IKG A; 1PGA A; 1EM7 A; 4OZB A; 2PTL A; 3GB1 A; 5BMG A; 1K53 A; 2ZW1 A; 5BMH A; 2N7J A; 4KGR A; 4WH4 A; 2IGG A; 4MAC A; 2JU6 X; 2N9L A; 4OZA A; 5HG2 A; 1C9F A; 1FCC C; 2PW9 A; 2I2Y A; 4HKZ E; 1PGX A; 1K50 A; 2JXT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QCZ A; 3BYY B; 1Y56 A; 2D07 B; 2L0F A; 3HHM A; 2MBQ A; 1K52 A; 1K8R B; 3BY4 B; 4ZHP A; 2BB6 A; 1BXT A; 1LXD A; 4MH0 E; 2WXL A; 1E8W A; 2ZVO A; 3NS8 A; 4BBN C; 4A9A A; 1C1Y B; 3L10 B; 4XWW A; 2D10 A; 1D5X C; 4G3X B; 1KM7 A; 2KD0 A; 1I4R A; 1WXS A; 5FR6 A; 2D11 A; 2KMM A; 2Y5P A; 2ZJD A; 5C3J B; 1LQB A; 1Y8R C; 2M19 A; 1YQB A; 2ZPN A; 4NNJ B; 2KAJ A; 2WDQ B; 1E0Z A; 1FIQ A; 2LGY A; 2DAJ A; 3EGR A; 3MC9 A; 3L54 A; 3KQ4 A; 3UIO B; 3N3K B; 2DWQ A; 1UWX A; 4Q2J A; 4YL8 A; 4WWN A; 4LJO B; 1L4Z B; 4M8M A; 2HE7 A; 1VRA B; 1V6E A; 3NS1 A; 2JRH A; 4HJK A; 3GP7 A; 3PRM B; 3VUY A; 1TS3 A; 5DPW A; 3A9J A; 5LLI A; 4YSZ B; 3OG5 A; 3KW5 B; 1TKG A; 1P1A A; 2JY6 A; 4P1B C; 3SFD B; 1TS4 A; 1JWA D; 2KWU B; 3R2I A; 5D7G A; 1MFW A; 2N7E A; 4YTP B; 3ZW3 A; 1WGK A; 3DWM A; 2NS5 A; 4HPL B; 3NUH B; 2WXH A; 4WAF A; 4ANV A; 2N7J A; 3IXS A; 1TKE A; 4YTN B; 4HXD A; 1J7B A; 1SE9 A; 2DHZ A; 1SIJ A; 1GAQ B; 2JF5 A; 1C9F A; 1VD2 A; 4LNN A; 1IPG A; 4R3D A; 1JQ4 A; 1ESF A; 3AE1 B; 2FUG 1; 3R3M A; 3MC8 A; 5EDS A; 2H88 B; 2KC2 A; 2FCQ A; 3CMM B; 1TYG B; 2KNB A; 3H7P A; 3X0W A; 4RGN A; 3EHV A; 2QSD A; 1EF1 A; 2YVC A; 1WMH A; 2L00 B; 2BQQ A; 1GPX A; 1WYW B; 4TQ0 A; 2IO1 B; 3LJ3 A; 2AQ2 B; 3ZUN A; 4IUM B; 4IW0 A; 2WDT B; 4ACF A; 3BVG A; 4XGA B; 2GB1 A; 1PQS A; 1WZ3 A; 4GN1 A; 4WJQ A; 3WAO A; 1J0G A; 2WXP A; 3APD A; 4XE0 A; 2O6V A; 4KKI A; 2ZZP B; 2RMM A; 1KRH A; 2QC8 A; 3AV8 A; 2V4L A; 3H1U A; 1MI0 A; 1PDX A; 2DLB A; 1LGR A; 2QIE B; 3OLM D; 2V1Y A; 2N0S B; 4IWP A; 4WWM A; 2J0M A; 2QEJ C; 4PK1 A; 3LXF A; 1V1P A; 2MW5 A; 3NZU A; 3R8B A; 1MG8 A; 4IKG A; 4GOC A; 2NVU I; 3QCA A; 4FJV B; 2V0G A; 3RCZ A; 4HEA 1; 4M00 A; 3HVD A; 4EE2 A; 5BMH A; 3ZRC A; 3ZDT A; 1WYG A; 3DBL B; 2JWZ A; 2NBV B; 4C7Z A; 3CST A; 2VRR B; 3M95 A; 1GOZ A; 3MHZ A; 5GMV A; 1WR1 A; 2PW9 A; 1B1Z A; 2IO3 B; 2JXX A; 3QQ8 B; 2AL6 A; 3ZJT A; 4RMA A; 1V2Y A; 2W55 A; 1UNS A; 5CHV C; 1AWD A; 3VVW B; 1E7U A; 4O1N A; 2M8S A; 4FBJ B; 3KH0 A; 2X38 A; 3HM6 X; 3MP9 A; 3JYU A; 2C7M B; 3AN1 A; 3VHT C; 1CZP A; 1VDV A; 3UIN B; 1T5X D; 4WQO B; 2EKI A; 1SJE D; 2TSS A; 3NJT A; 3VTW A; 1WF9 A; 1VLB A; 2W54 A; 1Q0W B; 1QKZ A; 3NHE B; 3QJZ A; 1UBI A; 3KUD B; 2CJO A; 2WXM A; 3L17 A; 2EEL A; 4KKJ A; 3L0W B; 2BYT A; 2GI9 A; 4II2 B; 4TKN A; 3A4R A; 5E6O A; 4HDO A; 3AE7 B; 2BT6 A; 2RDH A; 2Z8L A; 2LEK A; 1WGG A; 2N1W A; 3ZTD A; 4LDT B; 3EA6 A; 5L95 C; 2LGS A; 3P1M A; 4HJG E; 4XWT A; 1FCL A; 3IBE A; 3M62 B; 1WM3 A; 2M17 A; 4MGZ E; 5EE1 A; 1WSP A; 2ON8 A; 1XCQ L; 4D2K A; 1TZO A; 4PT5 A; 1YIW A; 1BML C; 4OZC A; 4WUR A; 3WAL A; 2KMA A; 3V3X A; 2FCM A; 2KFK A; 2V3P A; 5IO9 A; 2GBK A; 1EM7 A; 2HJ8 A; 1WRI A; 2L52 A; 1M4V A; 1E7V A; 2GOW A; 1TS2 A; 1E8X A; 2RGF A; 2BYE A; 2NBU A; 4EZL A; 1BUI C; 3QHT A; 5JHB A; 2KVR A; 4HKZ E; 5J17 A; 3AEF B; 3UGB B; 4PS8 A; 2MBE A; 1PGX A; 2JX5 A; 4F1S A; 3D32 A; 1SIF A; 3A9J B; 1D4B A; 2IZV B; 3DQV A; 3RD2 A; 3DCG A; 4HPP A; 4ANU A; 4ZYN A; 2KDE B; 2LXA A; 2V4I B; 4K7S A; 4KGT A; 1VJK A; 4DXG A; 4JX1 C; 2N1V A; 3DVN U; 2DZM A; 2LXC A; 3B2G A; 2K9X A; 3K9O B; 2PLP A; 4C4V A; 2K39 A; 4G0N B; 1V8C A; 2G4D B; 2K22 A; 4ZRJ A; 1RLF A; 4WWP A; 3TCA A; 3BZD B; 1I4Q A; 2INN E; 2RPV A; 3Q8A A; 3VQI A; 1DGJ A; 2OOB B; 3N9Y C; 2NBW B; 1WZ0 A; 3AEC B; 1WMH B; 2A5U A; 1QOG A; 1N5W A; 4DWF A; 3Q8B A; 1T0Q C; 2JYT A; 1I7H A; 3MJW A; 2M1M A; 3P4R B; 2NCN A; 4BOZ B; 2K1F A; 2IDY A; 2FE8 A; 4YWG G; 4AQ7 A; 3R7R A; 2RD0 A; 2MX2 A; 3GB1 A; 5G2N A; 2D3C A; 1CJE A; 3W5V B; 3AEA B; 5J2R A; 1ZUD 2; 2O6V B; 4P6V F; 4OVV A; 3JW0 X; 1C76 A; 4DHZ B; 1YJI A; 5AZF A; 2KAN A; 1WM2 A; 5E6P A; 2GRI A; 3VH4 B; 1D5M C; 1HQR D; 1UF0 A; 3N1X C; 3EFC A; 4RF0 A; 3HVZ A; 3RNG C; 1V1P B; 2I2Y A; 1N6Z A; 2WXQ A; 2IYD B; 1C77 A; 1IBX A; 5C1Z A; 2CU1 A; 2D3G A; 2PPH A; 3TEW A; 4MEL A; 1YN5 A; 2QDF A; 1KJT A; 4IM2 A; 3SU8 X; 1P7F A; 2JZZ A; 2MRP A; 3ALB A; 4LDT D; 3RI7 C; 1GB1 A; 4B9K A; 4BKT A; 2SEB D; 2WS3 B; 1HTQ A; 5BMI A; 1ACC A; 3W1S A; 1NI2 A; 1JWB D; 2N9K A; 1WRD B; 1QF6 A; 3PHX B; 3I5J C; 2PVG C; 2INC C; 3OAW A; 2ZCB A; 2KTR A; 5L83 A; 3T3O A; 4GLS C; 4REZ A; 2IO2 B; 4ZRI A; 1WGD A; 2ZW0 A; 4W9J A; 2HTM E; 4NJ6 A; 1HEZ E; 2BW2 A; 1WJ4 A; 4A3P A; 5LXI B; 1F77 A; 4JWS C; 3RUI B; 3ZLZ A; 4HDQ A; 4W9K A; 2M56 B; 3U4E G; 1V1O A; 4NAW A; 4YSX B; 2MP2 A; 1N62 A; 1FXI A; 1ZDV A; 3MHS D; 2WU5 B; 2V9H A; 5AZH A; 2B3A A; 3V62 A; 2KDM A; 5JHA A; 4I6N B; 1E10 A; 2L05 A; 4H2A A; 5BMG A; 2WP9 B; 3PLU A; 2QHO A; 2DZK A; 1B9R A; 2XK5 A; 3CF6 E; 5H92 C; 2MQJ A; 3ZYY X; 1EWC A; 4XDD A; 1AAR A; 4XC2 A; 1R4N I; 1JAL A; 1XD3 B; 2XN9 C; 1PUT A; 2JSV X; 4GMV A; 2WYQ A; 3NVY A; 3FC4 A; 1A5R A; 1YX5 B; 1V9J A; 2KFK B; 5BYR A; 3DOW A; 3ENE A; 4RF1 A; 4GB9 A; 4QAY A; 4G11 A; 4K7U A; 2XEW A; 3TEY A; 2MLB A; 4GDK B; 3TBL D; 4C7Y A; 1UEL A; 3AMZ A; 2I1J A; 3GE3 C; 4JE3 B; 5C23 A; 4RM8 A; 4MDK E; 3ML8 A; 2V3S A; 3KWL A; 1WGH A; 3QWZ B; 4TV3 A; 3HIZ A; 2GMI C; 2KX3 A; 2K25 A; 2W3R A; 3DBL I; 2K6D B; 5TSS A; 3ECI A; 2O6V D; 1L0X B; 1FXT B; 1J7A A; 3IVF A; 1HA5 A; 3EEC A; 3ZNI D; 2N4F A; 3PZD A; 2FUH B; 4GDL A; 4NPN A; 4C80 A; 5EE0 A; 2KKC A; 2NR2 A; 3C8Y A; 4RH6 A; 4W9H A; 4AWJ A; 2WXN A; 2W3S A; 4XX5 A; 5HHD G; 2L7R A; 1YN3 A; 4C4V B; 3T9L A; 2YEP F; 2KT7 A; 4EEW A; 3B9J A; 3OJ4 B; 2RDG A; 1GC7 A; 3DBH B; 1YOV B; 3BK1 A; 4M01 A; 2AQ3 B; 3Q8E A; 1NYQ A; 4MAC A; 2BTE A; 4DBG A; 3NZ3 A; 4MH8 A; 2Z0D B; 4ZRQ A; 3H7S A; 2IO0 B; 4PYU A; 4RCO A; 4HCN B; 3ML9 A; 4RGO S; 1X1M A; 3W1S C; 1JCK B; 5HKH A; 4GGQ A; 4KGS A; 1H4R A; 3Q3N C; 4IWQ A; 3PHW B; 1JWS D; 3RNE C; 3H8H A; 1SB3 C; 3NZS A; 4AS1 A; 1KH0 A; 5JXV A; 2J52 A; 1N60 A; 3PO0 A; 4HK2 A; 5E6J A; 2SAK A; 3J9C A; 2NTS A; 1E8Y A; 1HE8 A; 1EF5 A; 1SE3 A; 4ZRP A; 3BK2 A; 5HI1 A; 1QLB B; 1D3Z A; 3AM9 A; 3AE2 B; 2ZNV B; 2CU3 A; 4ZYS A; 2MH7 A; 4II3 B; 4DDI D; 2ZVN A; 3AE8 B; 1IBX B; 3GOE A; 1R7S A; 1JML A; 1L6V A; 1TBE A; 3EFU A; 4OHJ A; 1NEN B; 3TEX A; 4MM3 B; 1K51 A; 3UF8 A; 3RN9 C; 3CIR B; 3SEB A; 1EU3 A; 1CK1 A; 4F7Z A; 3A9K A; 2MHJ A; 1FEH A; 2MBB B; 2N7D A; 1PFD A; 2LI5 A; 3KVF B; 3VRA B; 1QT9 A; 2QJL A; 1YQ3 B; 2C5L C; 2N9X A; 1FMA D; 1R4N B; 1PGA A; 2M4N A; 2KTR B; 2L83 A; 2WXI A; 4FHJ A; 4OZB A; 2PTL A; 4DDG D; 3APC A; 3NG0 A; 4NQK E; 2K5P A; 4X57 B; 3RNB C; 2JU6 X; 2CHZ A; 1FFV A; 1E5W A; 1HTO A; 2BS3 B; 4DHJ B; 1F52 A; 1VCB A; 4G50 A; 3WCQ A; 4FAD A; 3KWV A; 5D2M B; 3RZF A; 3RMK C; 4NAW B; 2MP2 B; 2WXJ A; 2L32 A; 3IAM 1; 1OQY A; 1A70 A; 3U7D A; 3PRE A; 3BVM A; 1TJE A; 2W82 A; 3IAS 1; 3N1Z C; 3ZO5 B; 1Q1O A; 2LJI A; 3U8Z A; 2I1K A; 2XK5 B; 2WNM A; 2O2V A; 4DK5 A; 3I63 C; 4NAM A; 5IP4 D; 1CQV A; 1L6U A; 2DNF A; 2GBN A; 1N5X A; 1FO4 A; 4NJ7 A; 1C4C A; 3TMP B; 4ANX A; 1Q5W B; 1LM8 B; 2L3Z A; 2KFJ A; 1UH6 A; 3RFZ B; 1H8C A; 4IWO A; 1J8C A; 2Y5B B; 3UI3 A; 4EOY A; 2PMV A; 1MJD A; 2BB5 A; 3R7Q A; 4B95 A; 1ZXI A; 1E7P B; 2WXG A; 5KHO A; 3ZXR A; 1GB4 A; 4S17 A; 1FM0 D; 3U7Z A; 3P4S B; 3TJP A; 2L1A A; 2MCN B; 4ICU A; 1JRP A; 3W1Y A; 4ICV A; 3QIJ A; 1ZPS A; 3TEZ A; 4I6P A; 4A8X C; 4N58 A; 1R4M I; 4MGK E; 2EMS A; 4LK0 M; 1WY8 A; 2R61 A; 4JQW C; 2YLM A; 3RNA C; 2KTF A; 1OFF A; 4W9C A; 5HG2 A; 4GDL B; 1QOB A; 1WX8 A; 2ZEQ A; 2KDI A; 1MG4 A; 3T3N A; 3B1L X; 3V61 A; 2D3A A; 3HK0 A; 2RSU A; 5GXG B; 2OHF A; 3MC0 B; 5BYQ A; 1P98 A; 4KIK A; 4GDK A; 3QAR A; 2K6Q A; 5CHF A; 1LFD A; 2DZI A; 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2WX1 A; 1PGB A; 4TSS A; 3PVL A; 2JZ3 B; 1WXV A; 2C7N B; 5IA7 A; 4GU2 A; 5DPR A; 1BT0 A; 1E9M A; 1FD6 A; 4MSQ B; 3DBH I; 3P2B A; 4MM3 A; 4NZL B; 4KDI C; 1UWM A; 1D5Z C; 1OQR A; 4KZC A; 1RM6 C; 2JT4 B; 4N6E B; 4HLE A; 1L7Y A; 1E8Z A; 5IAA C; 4CHK A; 1VZ7 A; 3QX1 A; 1OTR B; 4EUT A; 1R4M B; 5D6J B; 4XDC A; 4RNA A; 2KJR A; 3EC8 A; 3T8M A; 4FA6 A; 1YD8 U; 3Q3O C; 4BKS D; 4IC7 B; 2O2V B; 2MJ3 A; 1E90 A; 1XT9 B; 1NEK B; 5FR3 A; 4TMA B; 1IUE A; 3CWI A; 2Q5W D; 1OGW A; 3ZGZ A; 2ZW1 A; 4BZA A; 2WXO A; 4KGR A; 4GIV A; 4WH4 A; 2WX0 A; 3RYT A; 2KHW B; 2EKE C; 1FRR A; 3PSE B; 5TR5 A; 2LJ5 A; 3P4Q B; 4HWI B; 4ZDV A; 2HDE A; 3DBR B; 3IFW B; 2DYM A; 1K50 A; 1I4H A; 4B0M A; 2LFI A; 2VZK D; 2L8J A; 5T8I A; 3PLV A; 4M0W A; 3BIN A; 2K8B A; 1SE2 A; 5KHQ A; 2KK8 A; 3Q3F A; 4UDU C; 3AE3 B; 5CHW A; 5FKA C; 1WXQ A; 2IGH A; 2JZP A; 3AU4 A; 3NRZ A; 4DXF A; 1J19 A; 3ABV B; 4HRO A; 3A1Q B; 3LYY A; 1S3S G; 1UGM A; 1DOY A; 3I3T B; 3WA0 A; 3AE9 B; 3V05 A; 5DPS A; 4A3O A; 3RNF C; 1XO3 A; 2FAZ A; 3N32 A; 5DPT A; 4A6Q A; 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