1KFEA

Crystal structure of alphat183v mutant of tryptophan synthase from salmonella typhimurium with l-ser bound to the beta site
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
268
structure length
252
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
publication title On the Role of AlphaTHR183 in the Allosteric Regulation and Catalytic Mechanism of Tryptophan Synthase
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 96
structure length 252
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1kfeA00
4JTGA 3SSJA 2CLOA 4DXVA 4IX0A 1G6CA 1B3OA 5IM51 1Q45A 4FXSA 1TPFA 4UXDA 3LCGA 4LUIA 1F5ZA 5D2TA 1TRDA 3HBLA 3W7HA 3KVJA 1WX0A 4KKXA 2FTPA 3MI6A 4HPJA 1AW1A 4JDBA 4TMCA 4ORMA 4Y9AA 5D2YA 1AMKA 1RV8A 3W70A 3C61A 2VKZG 2ZZ1A 3Q58A 4UMCA 1IXOA 4ZQRA 3P61A 5DCBA 4NZFA 4ZQOA 3G0UA 2QDGA 3LV6A 4JEQA 5HJLA 3O63A 3O15A 4EF9A 5BW6A 2G96A 3LHVA 4K8HA 3F4NA 1JRBA 4QAIA 3CLMA 3BG9A 3ZR4A 3TE9A 3IGUA 3Q37A 3LBCA 1LLWA 3CEUA 3QPYA 1YXCA 4N4QA 5K2ZA 5LKYA 1JUKA 1DBTA 2B0MA 3P84A 1XI3A 2JKAA 3UWVA 1TPH1 4UFMA 3CIXA 1G4PA 4HSOA 3FJLA 4LVGA 4GFSA 2FPTA 3M5XA 4OU1A 2F7FA 3M5ZA 3S1WA 4O54A 2WSRA 1KM4A 5EPDA 1JR1A 3NL6A 2V30A 1LLZA 1UB3A 4UNLA 2X1SA 4LY8A 3TV8A 3UWQA 3P8IA 5DBTA 1EPXA 1NFBA 1I2QA 2H3BA 1JUBA 2CWNA 4CQ9A 1THFD 4HPXA 1LBFA 3C2EA 4A2SA 4A22A 4FNQA 1IIHA 4MFEA 3S5NA 4JDYA 2V2DA 1K03A 2O7QA 3GAKA 3W7OA 3BGJA 3BO9A 1SFJA 4S2BA 2NLIA 2IQTA 3QPZA 3S1XA 4O16A 3GXPA 3SFKA 1DOSA 3L66A 3WK2A 4LUJA 4O0ZA 3O1NA 2ZCGA 1TSIA 1PE1A 2G95A 3PVFA 3G8EA 3QW3A 3GLCA 2NXHA 3M5YA 3KX6A 1F7BA 1OK4A 5D37A 1L9WA 3U8GA 4PCFA 3QFEA 3S5ZA 3T7VA 4EF8A 3UWYA 3QZEA 4CNNA 1VGAA 3LCWA 3W72A 4A21A 3GDMA 2DZXA 4GUIA 2HSAA 4N9DA 4WUIA 3W7JA 4ORIA 1A50A 1I2OA 2ISWA 3M0ZA 5AHMA 2B7NA 2WSYA 1G4EA 1KFEA 3PG8A 3DFPA 1KFCA 4WOQA 1WV2A 4JICA 3PB0A 1K8XA 4BK9A 1K3UA 1AL8A 3M7WA 3QQ1A 4FNSA 4Y6GA 1KTBA 2ABAA 2ZRXA 3PSVA 1W3TA 3C2FA 3D0CA 2ZA3A 4QIUA 1P0NA 1H7NA 5KZEA 3L5LA 1Z48A 3HG3A 5CKSA 1Q3NA 1SSGA 1JJKA 4GNJA 2FPVA 4U4MA 1LRQA 1SW3A 3UWUA 2EAWA 1WXJA 1W5QA 1VS1A 1XL9A 1AG1O 1SFLA 4GBUA 2A5HA 5HQEA 3U6WA 3MW7A 3E12A 4NVTA 3TCEA 2P1FA 1S5WA 4H3DA 5EYWA 1N7KA 4R34A 3DHFA 4JXCA 3G24A 1SU5A 4B5NA 5DN1A 1D9EA 2NUXA 1EP1A 1KM2A 3W7NA 1R30A 4O52A 2I14A 4IPJA 1H50A 4N9BA 3W1LA 5BMXA 1VCVA 3HMJG 3NNTA 3CTLA 4RKAA 3NQDA 4UCGA 5D02A 1VC4A 4Z1AA 4IWWA 3DAQA 2QDHA 2V81A 1GEQA 3O6YX 1MEIA 1ML1A 4OBTA 2QCFA 2VENA 2ZZ5A 3M6YA 3G1AA 4UTJA 1F6PA 4XQ6A 4P61A 1VZWA 3H53A 1SO3A 3MBFA 5D2VA 3NOEA 3GXNA 3OVPA 3VE9A 3QYQA 1T99A 3HPXA 3PB2A 3A24A 3PS7A 4MKNA 5G4WA 3LHUA 1YXYA 4BFAA 5IBXC 4LRSA 4JN6A 3INPA 3NQCA 4XBSA 4RXFA 3NL2A 1ICPA 1TV7A 5BNKA 5F4SA 3RMJA 4N6EA 2BTMA 3TJXA 1K02A 2B7OA 4FNRA 5FEPA 5HMSA 1I2PA 5I3KA 3V75A 3B4UA 2VFGA 4UTIA 4HNNA 3M16A 2J24A 2BWGA 4LTSA 3NL3A 3DH7A 3TAKA 4KWVA 4XZ9A 3GDLA 1TB3A 3LRMA 5G2HA 5HWMA 5K9CA 1JVNA 2E6AA 1UASA 2QCCA 4LW7A 4XTIA 4DQWA 3E02A 2GJNA 2DZWA 3W75A 3UQNA 1H7OA 4JTUA 1H7RA 3DI0A 3KFTA 3IEBA 4FF7A 2QCNA 3DU0A 1DV7A 4LC6A 5EMUA 4AHOA 4MIMA 1GVOA 2W79A 3LBMA 4TX9A 2VELA 1FDZA 4N4PA 4ZQPA 1LRNA 1YXDA 4IMGA 3A21A 1GG1A 3LM7A 5D03A 2VFHA 5DCDA 3SGZA 3HG5A 3L5AA 2ZA2A 1KW1A 3W1PA 1W5OA 4R7JA 3VNDA 2GQAA 3CT7A 3ELFA 1TV8A 3C8FA 4HHPA 1KBIA 5FF0A 3S42A 3O6DA 2NV2A 4ADSA 3ATZA 4MZ8A 4ZQMA 1QR7A 3S1VA 2BSLA 3ANYA 2G5WA 4PL1A 3CWNA 2V2CA 3UXAA 3DZ1A 1A5AA 4O13A 1D3HA 4CCEA 1TPB1 4C1KA 1AW5A 3HO8A 3WJZA 3TC6A 3ATYA 3UPBA 3NZRA 3NQEA 3PWAA 4NUWA 1X1OA 2PRMA 3U2OA 3W07A 1X8FA 3W23A 3B05A 2I9EA 3FJ6A 1LZOA 3LCIA 2Z6JA 2H8XA 3TK7A 4DF1A 1YTDA 3DFOA 4QM1A 1F05A 4IMFA 1KFJA 1Z44A 2DORA 4DPPA 1ALDA 4LU0A 2B4GA 2E5DA 3E49A 1TQJA 3G1VA 3LCHA 5HUOA 3QJAA 3IIXA 1YDNA 3CHVA 3K30A 1OFPA 4IQLA 4WJEA 4TU1A 5MHBA 2ZRWA 3DFNA 4DO5A 4JTKA 2JGQA 4NQ1A 2P0OA 1FCVA 1H7XA 4MYXA 5D04C 3C2RA 3NM3A 4JR5A 2GQ9A 3NAVA 3G22A 2NUWA 2DJLA 2V9DA 1FWSA 1RVGA 2WSQA 3LHTA 1M7OA 4A3UA 3OIXA 3S8HA 1J5TA 1E51A 3QMRA 1U5JA 4AHQA 2E6DA 1LRTA 1XC4A 5LNVA 3UPWA 2OJPA 3CM4A 2PCQA 2FQIA 2CZDA 1QOPA 1C29A 2QAPA 1W5MA 2Y63A 3W2MA 3TXVA 4E38A 1ZNNA 5ABTA 1GOXA 2E5BA 1R2TA 4ZVJA 1YPFA 3C4UA 2WOQA 2ZDRA 1YADA 4DBEA 2PRHA 1KM0A 4JTFA 3EWZA 5L6UA 2J9ZA 5I3GA 1RQBA 6ALDA 4QNWA 2ZTKA 5KZDA 3GYEA 2V82A 4MYAA 1GVFA 1YDVA 1TREA 3DI1A 2FLIA 3G1FA 2QEZA 1EIXA 3N14A 3TMQA 3PUEA 3G8RA 3LCFA 1QNVA 3SJ3A 3A5VA 4UFKA 3WK0A 3W22A 2O7SA 2OT1A 4JTLA 3PBVA 2C15A 4W9TA 3MYPA 1Z41A 2Y85A 1A5BA 1TV5A 2C13A 4O10A 1OYAA 4K7VA 5F4XA 4BI5A 2V5LA 5CSSA 5CG7A 1JUEA 3TJLA 1B9BA 4HIBA 1F76A 2RDTA 2H90A 2C16A 5I3FA 4N9CA 4FX8A 2PRLA 3TSDA 3EEGA 1Q6LA 3FS2A 3UYCA 4UFLA 4TR9A 4JTJA 5C6MA 1JCNA 3L67A 2WNZA 4CNOA 1XDMA 2NX1A 3CWOX 1HO4A 3MMTA 3B8DA 4H4IA 1SQ7A 5J5RA 3NQAA 5G1TA 2OX1A 3S6DA 3EX2A 1QDSA 3NPXA 5DLCA 1PCKA 3PAJA 4MFDA 1K8ZA 4MVAA 4YMZA 1QWGA 4HSNA 4PA8A 4NNCA 1X7FA 3HG2A 4UTWA 4KFNA 3BPWA 5LHFA 4NJIA 4DF0A 3LGEA 1SZEA 1EWDA 4ZL1A 1W1ZA 3L21A 3NPUA 4MJMA 3QSRA 1BWKA 2NUYA 3W2UA 1A53A 1G69A 2H3DA 5LNRA 1JCYA 3DXIA 2FFCA 3O07A 3PUDA 4DF2A 5LGXA 1GWJA 3WJWA 1MO0A 4NT0A 4LRTA 1IXQA 1W31A 1SO5A 4CQ8A 1K7EA 2NV1A 4DO6A 1L6SA 4PH6A 3FYOA 4Z1DA 3G1DA 3L0KA 1HG3A 2V5BA 1EP2A 2FIQA 1F2JA 4JD4A 3W7PA 2YSWA 1GVQA 1TPUA 4LS2A 3W1UA 2E1DA 2EPHA 3CIWA 3MI2A 4GC4A 1MEHA 3W74A 4KFPA 1W37A 4JX4A 2J9XA 3SIZA 3GNNA 5D09A 5DY3A 3DHDA 1KM1A 1XFBA 1OK6A 3BG3A 3P8JA 3L65A 1OFOA 4RCXA 4IXXA 2X16A 3EX3A 1FCUA 1GPWA 4QNEA 2WNNA 5TQLA 1QPQA 4O28A 2PURA 2VFIA 2TMDA 2G97A 3PUOA 3NL5A 4FO4A 3LX9A 3NM1A 3UZJA 3HJZA 3G18A 2X2GA 4GUJA 4UMBA 2ATMA 1P1XA 1R2RA 1JCJA 4JIQA 1C9DA 4MJZA 3THQA 2GJLA 3YPIA 3GVGA 1BWLA 2GOUA 2RH9A 1PL9A 5D2WA 4A2RA 3SW6A 4MUZA 2FDSA 1M5WA 3P7YA 3TC7A 4O1DA 1F73A 4K38A 1QPNA 2Y88A 4ONVA 2AAMA 5TBOA 5DCEA 2X1UA 1SUXA 1P4CA 3I7SA 3L2IA 1EA0A 3LXBA 3R8RA 3STFA 1FWWA 2BZNA 1P5BA 3B03A 3N73A 3EKZA 3EX6A 1PCWA 3FLUA 4UFJA 2YXGA 2J6XA 2Y62A 4LC8A 1TMHA 3LLDA 1ONRA 2A2IA 3LXCA 4UTMA 3IIOA 4FIQA 3PC0A 1HFBA 3W1XA 5K9DA 1CX9A 1D3GA 3LXAA 4N2YA 3P5YA 4QSHA 5AHIA 3RF9A 3LDVA 3NEVA 1R2SA 2ZZ3A 4X2RA 3WK3A 2Y89A 4O1AA 1I2RA 1JQVA 4AWSA 1DJNA 4AWTA 2W0UA 2ZRUA 1YYAA 2V8ZA 4PC8A 4TO8A 3IVSA 1TPWA 1RQHA 1DL3A 1H63A 3W1RA 4I7WA 3GK0A 1OFEA 3LRLA 4O50A 1L6YA 4Z0SA 4QISA 5A5WA 3FFSA 5T26A 4HNUA 3IGSA 2FJKA 3P81A 3QH2A 1FCBA 2CZFA 5FF4A 1LBMA 4XWUA 1VCGA 4UUIA 3HGJA 5CZSA 1V7YA 2JK2A 2BX7A 3L68A 3NQ7A 4JX5A 3S9YA 1NF7A 3B04A 5LNSA 2JGYA 1DQXA 3GX9A 3LI1A 1VCFA 3LTSA 1H61A 4L4MA 4FIRA 1KM6A 2Z1BA 1TTJA 2QKFA 3OBKA 3IGXA 4O15A 2WJZA 4O57A 1L2UA 3VKJA 3HG4A 5EL1A 5CSRA 3HB9A 5BMWA 2H8ZA 2QCDA 1ICSA 4WQ6A 4PFMA 4FX7A 4NNBA 4ZMGA 3NR0A 2ZRZA 3LCLA 1M6JA 4IJBA 1VR6A 1SW0A 3QMTA 5DXYA 2ISVA 2ISSA 3NQ8A 2EGZA 3QRHA 3EB2A 3NQVA 2J88A 1IXNA 4MLJA 1MXSA 4K8EA 3QF0A 4EVZA 4O4VA 3NQ6A 2QCEA 3BLIA 3EXRA 5K9XA 4DEFA 3W7QA 4WX2A 3WJXA 3PR2A 1OFBA 4RR4A 4UTKA 3UZ5A 4S2CA 4DBDA 4JY9A 3NDOA 2C19A 2YX0A 4ZQNA 1ZALA 2FB2A 4Z08A 1XBZA 3CB8A 1GVRA 4NJGA 2JKEA 3STCA 1B4KA 1KFKA 1X1ZA 2QUVA 3UWWA 4UTUA 4BWLA 3R89A 1VPXA 2J9YA 1QO5A 3N9RA 4JTTA 4O17A 5HULA 1OYCA 2VEIA 4FX6M 3EWYA 3MWAA 3MUXA 1LOLA 5K3VA 4FXRA 1W3IA 1LTDA 4N6FA 2GVGA 1ZHAA 3GAYA 5LHEA 4RZ5A 4Q32A 5FEXA 1TIMA 1OF8A 1QMLA 2CLEA 1FWTA 3H54A 1JCLA 4JYFA 5C5YA 2C14A 3DGRA 4HNVA 1WDWA 3PM6A 4KFOA 1QCWA 4U28A 3KRSA 5G1YA 2Q3OA 1QPOA 1ZENA 3NQ2A 3NZ1A 4Y96A 5I3HA 4IPIA 3W7IA 1NF0A 1CI1A 2CFFA 1O5XA 4NZJA 1SZNA 2QCLA 3P82A 3DFTA 4Z1BA 1XBXA 1YTEA 4OQVA 3FOKA 3SI9A 3HGSA 5G4EA 3G1HA 3IRDA 5LNUA 4TIMA 5EBUA 4O19A 1KA9F 2B7PA 1VHNA 3HF3A 2V0TA 1ZAJA 4WY0A 3O16A 4UTWC 1KTNA 4ALDA 2EHHA 2ZQ0A 1PIIA 3LV5A 3W7DA 4JS3A 3TU9A 1TPVA 3P67A 4WXZA 4K6AA 3MHUA 5BRBA 3W2LA 4OT7A 3W1TA 4ZZ9A 3GDTA 4NNAA 1G7VA 5HINA 4XBKA 2CLFA 2XFWA 1AL7A 5AC7A 1OFQA 3EWBX 1OX4A 3HGOA 2YW4A 4ZQCA 4GUGA 3C3NA 5FESA 1AK5A 3C2VA 2XN1A 3QMSA 2VEPA 5FF7A 2E09A 4N9EA 3KHJA 2Y61A 3M1ZA 4JGDA 2YYTA 3N19B 5AHNA 5F2IA 2PC4A 1OFRA 3GXTA 3A9IA 3O6CA 2YR1A 3MHGA 5DBUA 3KXQA 4FNUA 5AYZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FWJ C;  4DYE A;  1G6C A;  4CN1 A;  1Q45 A;  4FXS A;  3LCG A;  3F4D A;  4U3C A;  2C1I A;  3HBL A;  3KVJ A;  7TAA A;  4KKX A;  4IPL A;  4MG4 A;  1S2U A;  1RV8 A;  1JGI A;  2GLK A;  1CPU A;  3G0U A;  7ENL A;  2A3H A;  1QNP A;  3M0J A;  3O63 A;  2QJN A;  2I57 A;  3A6O A;  2Y4S A;  3CLM A;  3ZR4 A;  1HQT A;  1KRB C;  1NH6 A;  2F8Q A;  3CEU A;  1YXC A;  4N4Q A;  4L1W A;  4IGM A;  4PBE A;  4WDT A;  3UWV A;  1TPH 1;  4DWS B;  3I4K A;  4HSO A;  4AIB A;  3SCW A;  3M0H A;  4N0R A;  2BFG A;  3M5Z A;  1LLZ A;  1UB3 A;  3TV8 A;  3HQO A;  5A2C A;  1SVD A;  4QP0 A;  1UR9 A;  3WH5 A;  1CXK A;  4Q8N A;  3D5H A;  3VII A;  4FNQ A;  4MFE A;  1K03 A;  4WIW A;  3GAK A;  4OKD A;  4MB4 A;  1SFJ A;  5H6H A;  3KWS A;  1X8C A;  3O1N A;  9CGT A;  1TSI A;  2G95 A;  2PDW A;  4NI3 A;  3PZI A;  3DC0 A;  4L4P A;  3VAV A;  3M5Y A;  2ZUV A;  1YRR A;  2PMQ A;  1F7B A;  2YDS A;  1UC4 A;  2NSO A;  1OK4 A;  2R1N A;  4EAM A;  3S5Z A;  3G1R A;  1DTN A;  3UWY A;  3QZE A;  3EYP A;  2A3L A;  3PZG A;  1KBB A;  3FHA A;  3V36 A;  5A6B A; 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