1KFJA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with l-serine
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
267
structure length
253
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
publication title On the role of alphaThr183 in the allosteric regulation and catalytic mechanism of tryptophan synthase.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 98
structure length 253
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1kfjA00
4HPXA 3FIGA 4LC6A 4YWIA 4FIQA 1O4UA 3LV6A 4UUIA 1NFBA 5A5WA 1P0NA 3NOEA 3LCHA 2Z0IA 3U8GA 1O5KA 3P60A 4JEQA 4ZVJA 1TCDA 2VEMA 1SFLA 3HGSA 2QUVA 5C2XA 5A8GA 1DQWA 5CPLA 3PUDA 1G7UA 2ZYFA 4IMEA 1H7WA 4Q32A 1FUYA 3IVTA 1K8ZA 4MLRA 5LSMA 1KFKA 3CLMA 1T96A 2UV8G 1VYSX 1XBYA 2DZWA 4N9DA 5D02A 2XN1A 4JX6A 4UTTC 2JBMA 2H8ZA 4OV4A 4UTLA 3S1XA 3MWAA 5TIMA 1G67A 4WY0B 4UFIA 3DFPA 1GVRA 4MUZA 3G1YA 3P67A 2Y88A 3P81A 4ZMGA 4YL2A 3HB9A 1VH7A 4N4PA 4HN4A 4Q33A 4UCGA 4ALDA 2FB3A 5KINA 4M19A 2A1YA 1SU5A 4JY8A 2E1DA 5BMWA 3W1RA 4WUIA 1W5NA 4GWEA 5GVJA 1KFLA 1W5OA 1W8SA 4FIRA 4IMCA 1DJNA 5CZ0A 2PC4A 2P1FA 4JTUA 3W1AA 4LY8A 3UZ5A 1GT8A 3IIXA 1YPFA 1PIIA 4M6PA 2C0AA 1KM3A 2E5CA 3O05A 2BZNA 3HGOA 1DHPA 1GVQA 2YCEA 1XXXA 1FDJA 2YZRA 4HNVA 2CLHA 2E6FA 3WK3A 2C3ZA 5E0KA 1X1ZA 3HG2A 4XTDA 3CEUA 2E77A 4TR9A 5U4NA 1GTHA 3DKLA 3E02A 3H55A 3NA8A 2ZA3A 5H2ZA 1P1XA 4GE8A 2WQPA 5K9DA 3ABSA 2CLMA 4JX4A 1AW1A 1Q3NA 2YFNA 3UWZA 1W54A 2WNNA 4QSHA 4A3UA 4ZQMA 2YDAA 1M7OA 1ZHAA 3DKJA 4NUWA 1W3NA 4FX7A 1QPOA 1NVMA 3G22A 1H1YA 5G4WA 3DAQA 3IRDA 4O12A 1XUUA 2PRMA 3IVSA 3EX6A 1A5AA 1UASA 2CWNA 2ZZ4A 4GJ1A 3TFCA 2C13A 1B3OA 2EKCA 3BGGA 4O18A 4OQVA 3GXNA 5EBUA 5HWJA 1CI1A 4XWUA 3CU2A 3LRLA 2PURA 3PB0A 3CM4A 1KBJA 2ISVA 3SJ3A 4HPJA 1P5BA 4X3ZA 4RR4A 2ATMA 5FF0A 3QW3A 2E68A 1Z44A 3P82A 1J5TA 3MBDA 3CEPA 3W7PA 3W74A 4DPPA 4Z1AA 4UTWC 2P0OA 1R2SA 2JKEA 4NNBA 4N9BA 1WV2A 1X7FA 1ZALA 3GXPA 4OU1A 1TRDA 4UFHA 2AAMA 5CSRA 5FEZA 2Y89A 5G4EA 4O1AA 2WOQA 1Z42A 1KM5A 4O11A 1FXQA 5HJLA 4RV8A 3IGSA 2ZDRA 1WQ5A 4RLIA 1UBSA 2PE4A 1B4EA 4DXVA 3L5LA 1PHQA 3MHGA 4R34A 3TCEA 1KA9F 1ZAJA 4CQ9A 1MSSA 1UUOA 3NL2A 4MJMA 4UR8A 3UWWA 1IXNA 2VFEA 1QPRA 3H53A 1LLZA 2NLIA 4LVGA 4N6FA 1TQJA 1W1ZA 3W87A 2BSLA 5F2IA 4O57A 3LHVA 3KRZA 4ZQNA 4K8HA 4TIMA 5D2WA 3S42A 2DP3A 2GJLA 2GUUA 2Q8LA 5C5YA 2QJGA 1O5XA 3VKJA 3MUXA 4I7UA 5DY2A 3W7DA 1OYBA 4K6AA 1PVNA 3RNDA 2B7NA 3S5ZA 5IM51 3GK0A 5IBXC 4JD4A 2JGQA 4UNLA 2P10A 4HNNA 3KRSA 3W7HA 1ZNNA 1KTBA 4K7YA 5F1UA 3PAJA 5EMUA 1N7KA 3C2EA 1JQVA 1DVJA 3C0JA 4PL2A 2C14A 2NXHA 1TSIA 1L6WA 4LUIA 1KFBA 4IMGA 3A9IA 4S2CA 1H7NA 3NL5A 1SQ7A 2AGKA 5AHMA 3I6RA 4MOZA 4WQ6A 4XBKA 3QSTA 1LTDA 2A85A 1H62A 1W37A 4LC8A 2QJHA 2VENA 1R46A 3THAA 4ICNA 4Y6GA 1S3HA 2C19A 4L4LA 5FI8A 1JRCA 3R89A 5BRBA 1LRNA 2WKJA 2ZCGA 1LOLA 3HGJA 2AQWA 2V2DA 4ADUA 1H50A 3IGUA 2B0MA 2X1TA 1KM6A 4K39A 3QQ0A 4RXGA 1XBZA 1M7PA 1OX4B 2OT1A 3LCLA 3UY8A 1OK6A 4JNMA 1EWDA 1DV7A 3CT7A 2H6RA 4MZ1A 3RLVA 3S9YA 3VE7A 1ME9A 2VEKA 3LCGA 2ZZ2A 2Y7GA 3W7KA 1K7FA 2D73A 4JXCA 4E38A 1QAPA 2X16A 4BWLA 4CNPA 3M7WA 4DO6A 3GDRA 3KVKA 5I3IA 3EEGA 3OEXA 3TIMA 3B0PA 1L2UA 1NAL1 4BFAA 3L66A 4H6KA 1VCFA 3MP4A 3NZ1A 2H90A 3S5YA 3A24A 4OT7A 4NVTA 4LVBA 1J4EA 1TRIA 4MFDA 2E5BA 5FESA 4CCEA 1ICPA 1TTIA 3DI1A 3O07A 3W07A 3GNDA 4O8RA 3W84A 1TPVA 3LLDA 5U7SA 1RVGA 5EL1A 3TSDA 5J5RA 5C54A 3PS7A 4DF2A 2YX0A 1I2OA 3C2FA 4MJZA 5G1YA 1H63A 5AYZA 2V8ZA 3NVTA 3M9YA 1YXYA 2B4GA 5FEWA 2J6XA 4MY9A 4NX5A 1SO6A 3M5YA 2HMCA 1FXPA 4NXSA 2V5LA 3O6CA 4O15A 4NNCA 3EX4A 3BPWA 4K38A 3STEA 1ZY9A 1TTJA 3HPXA 3NPXA 4H3DA 4JTJA 1D9EA 2I9EA 1F74A 1SSGA 4AWUA 4O54A 2RFGA 3MBFA 4UNKA 3W23A 2NXIA 3S5OA 3FLUA 3LHYA 2G5WA 2FJKA 2QCNA 1JULA 4Z1CA 3W9ZA 4O4WA 3O6DA 3SZ8A 1QCWA 2NZLA 3LRKA 2C16A 3BLEA 5F4XA 5LGXA 1T99A 1WOBA 1LORA 4FNQA 5FEXA 3TK7A 1HO1A 2VELA 5G2WA 3PWAA 3PB2A 2ATSA 2W6RA 1N8FA 3P61A 2E5DA 1K3UA 1K03A 3W7RA 3UQNA 2V2CA 2O7QA 2A5HA 3TQVA 3CIXA 2QCMA 2VXNA 3L0KA 2QR6A 3GLCA 3NGJA 3STCA 3HG4A 2FPYA 1PHWA 3HIJA 3ATZA 3TFXA 4AHOA 2NUYA 4HKPA 1W56A 3NQFA 5K3VA 1DKWA 1I2NA 2B7QA 3M6YA 1H61A 3LCIA 3C52A 3DFOA 3G1HA 1UCWA 2RHGA 2J9XA 3W2UA 2VEPA 3OVRA 4IGHA 4TO8A 4FX6M 1Q6LA 2CLFA 3T44A 1H5YA 1VQTA 4R7JA 1TPEA 1TV8A 2VC6A 3I7SA 3LOTA 1KTNA 4O16A 4JTFA 1TPB1 5DLCA 2LLEA 1NF0A 1G69A 3G1DA 2XN0A 5DBTA 3T7VA 1PV8A 4JGDA 1MZHA 4A2SA 1T8XA 1C8VA 4FB7A 5C6MA 3UYCA 2VFGA 3LLFA 4LRSA 1LBMA 3DI0A 3QJAA 1RQBA 1LRQA 2QCDA 3P8JA 3THQA 4AWSA 2Y70A 3FJLA 2PRHA 3B06A 2I1OA 3RF9A 3I65A 4S2BA 1OYAA 2NWRA 2TSYA 3TJXA 1VYRA 3TW6A 5KSWA 3B4UA 1AL8A 4EF8A 4ZQOA 2X1UA 3P74A 3L2IA 3BG9A 4HSNA 3HGRA 3W88A 3NEVA 1TTQA 4ONVA 2A7RA 2ISWA 5DY3A 4M7TA 3DFQA 2TYSA 3FKKA 5DBUA 5AYXA 1ICSA 3EWXA 2DZUA 4DBEA 4UTKA 2V0TA 4GRSA 4J9JA 2ZZ5A 3GNNA 1KM2A 1TYGA 3LGEA 3PBYA 3QW4B 4R33A 3R8RA 3UNDA 1LP6A 1I4NA 3JRKA 3UD6A 5D33A 4B5NA 2G97A 4NT0A 6TIMA 2R8WA 2YPIA 1OFBA 3UWQA 2FTPA 3P80A 1DJQA 1YLVA 5KZDA 2FPVA 5CKSA 1QOQA 3GX9A 4NX0A 2QJIA 3M43A 4LOCA 1QFEA 1QO5A 3V75A 1VC4A 1CW2A 4M5PA 2CU0A 3INPA 1SSDA 4UFMA 1KV8A 1VS1A 2OX1A 3LB0A 1OX4A 4X2RA 2JKPA 3W7EA 3TNOA 1K8XA 3PF3A 3LTSA 3M0ZA 3PY2A 5I3KA 3E12A 3ZR4A 3SSJA 3STFA 1TREA 3KVJA 4N9EA 3GR7A 2Y7EA 2NWSA 3F03K 4LW7A 5KMYA 1LCOA 3BV4A 5AOUA 3RMJA 3CC1A 4JTHA 2EHHA 3QEZA 3G1AA 4AVFA 4BWLC 3DENA 1Q6QA 1G4PA 5D09A 1GWJA 4FXSA 1S5VA 3LXCA 4ADSA 5DN1A 1KW1A 1EUNA 4C1KA 3I68A 4EOUA 1SZGA 1FCUA 3W83A 2A21A 1SZFA 3D0CA 3LBCA 1RQHA 3MMTA 4IXXA 1H60A 3NPWA 3EWWA 3TQ0A 3NQAA 2EPHA 1OYCA 4MLJA 1AMKA 4OWGA 4FNRA 1DORA 3L67A 3FJ6A 1WX0A 1HFBA 3TJLA 3IGXA 2OJPA 1ICQA 2DJXA 3P5ZA 3TE9A 3W3OA 1AL7A 3TAKA 4HSOA 3W1MA 3HQ1A 4LS2A 1Q6OA 4LT9A 3BARA 4GUJA 3FKRA 4AHPA 3P8IA 5LNWA 4MY1A 3N9SA 2YW3A 3SIZA 2GQ9A 3CPRA 3EB2A 1M5WA 5G1TA 5KTLA 2ABBA 2QUUA 2B7PA 2HS8A 1JCNA 3W2KA 1MXSA 3W7GA 2ZQ0A 3W7CA 1EP3A 1TPFA 2CW6A 4IXHA 2ZA2A 4O28A 1OX6A 3E0IA 4MKNA 1IXQA 1OF8A 1T0OA 3O06A 2WV8A 1FWWA 1C29A 1LBLA 4MIMA 3BW4A 1XL9A 3DZ1A 5HUPA 1LROA 1SZNA 5AHIA 1H1ZA 2VFIA 1EA0A 2EAWA 3A5FA 5AYYA 3LXBA 1XCFA 6ALDA 1F7BA 1OVDA 3NQ6A 4E2DA 5CGQA 4O0KA 5CPNA 3N2XA 4FNTA 3OVPA 2VFHA 2CZDA 4A21A 3MI6A 3WK1A 1MO0A 1ALDA 3LBMA 1JCJA 2DZSA 4YLWA 4FNUA 1HG3A 3U2OA 4UTMA 1ZCOA 3ZFHA 3L5MA 5DCBA 3F4NA 5D05A 2YR1A 3MYOA 4DQWA 1F2JA 3B0UX 2OCZA 3MHUA 3IVUA 3SGUA 1W3TA 5LNVA 4HNUA 1DOSA 3P7YA 3PC0A 5AHFA 2Q3RA 3W22A 3SGZA 1YDVA 1EP2A 4LVFA 3LCFA 3L68A 5AN7A 4FO4A 1XFBA 1LOSA 1PCWA 2C6QA 4UFJA 3F4WA 5D38A 3LHTA 1KTCA 1DQXA 3C56A 3T40A 3B05A 4A29A 3WK2A 3MI3A 4FHAA 2YYUA 4LVDA 4O53A 3EWYA 3TR2A 4TMBA 3M5XA 3O15A 3PSWA 5D2YA 2F84A 1VPXA 1IF2A 1L6SA 1G7VA 1AW5A 4PCFA 2JGYA 1JQXA 3LV5A 4E2BA 2YXGA 3RFAA 1RV8A 1VYPX 3DFTA 4PEKA 4GXMA 2RDWA 1VR6A 3RK8A 4LV4A 2QCDB 3NZRA 2G96A 5E93A 3T78A 2CFFA 3LCXA 5CZSA 3LCWA 3NQ2A 2DJLA 3OHIA 4DEFA 1OFDA 3DXIA 3I7QA 1OHLA 1F6PA 3MJYA 1L6YA 1Z41A 1GG0A 3S1UA 3F1QA 1YDOA 2HSAA 1GTEA 5HINA 2E6AA 3MP3A 3L0GA 4JX5A 2ZA1A 3NPUA 3GB6A 4XUGA 1TTPA 3ANYA 2Y7FA 3M41A 4L4MA 3CTLA 4EVZA 4DBDA 1SR9A 3GIYA 5AHEA 2OT0A 3N3MA 4NJJA 5LHFA 3BLIA 4QIUA 3DU0A 4LS1A 5HULA 1B9BA 3TDFA 1S5TA 1WA3A 3VI2A 3OIXA 3M44A 5F4WA 4Z1BA 3S8HA 4WX2A 2WSQA 3N9RA 2R14A 3G8RA 2QCCA 3BG5A 4IX0A 1TPH1 2H3DA 2BXVA 4WOQA 2QAFA 3GDKA 3W7QA 1F6KA 4RXFA 3S5NA 4UTJA 1MEIA 2XFWA 2WNQA 2NX3A 3PG9A 4FF7A 5C55A 1J2WA 1XKYA 3TX9A 4CNNA 1BWLA 3M1ZA 2X1RA 4N2YA 5BMXA 3QQ1A 2QDHA 5LNUA 2GQ8A 2A7PA 1SUXA 3QMSA 4M6QA 4AAJA 3W2JA 5LHEA 5LNRA 3GAYA 1VGAA 1FDZA 1OFPA 5D2XA 4JY9A 1FBAA 5K9XA 5K4ZA 1OABA 1L9WA 3VNDA 3STGA 4FEZA 4OHQA 4GBUA 3MP5A 4IX2A 5HUOA 3RU6A 2R94A 1GJPA 3TH6A 4JS3A 2H3BA 3Q37A 4JICA 5K9CA 2WPBA 2NX1A 5HWMA 1F73A 3SW6A 2FLIA 7TIMA 2OZ0A 1R47A 3EKZA 4ZQRA 4UTHA 4NJHA 4P61A 3NQDA 2QCHA 5ABTA 4JIQA 1U5JA 2QDGA 4CQ8A 2QUTA 4AB4A 2X1SA 1QPNA 1OJXA 4MZ8A 4LS0A 1B4KA 1R30A 1AK5A 4HT3A 4EIVA 4AF0A 2ZRVA 5G5IA 4N6EA 1YXDA 3PUEA 4O4VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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