1KFKA

Crystal structure of tryptophan synthase from salmonella typhimurium
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
267
structure length
251
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
publication title On the role of alphaThr183 in the allosteric regulation and catalytic mechanism of tryptophan synthase.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 94
structure length 251
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1kfkA00
3HQ1A 2QJHA 1TYGA 5FEPA 3S0CA 2CZ5A 3UPBA 2GPTA 1EA0A 3TA6A 2PCQA 4LUIA 3W7DA 3GR7A 5AC7A 4LC8A 1OF8A 4DO4A 3DKLA 3E9AA 3MHFA 1WOBA 2YFOA 4JTHA 4CQ9A 1KTNA 5C2XA 1H1YA 1WBJA 3P82A 3F1QA 3QFEA 4MLRA 4ZQMA 2DU2A 4IPIA 5FESA 1SSDA 1HG3A 2RHGA 1AW1A 2A5HA 5K9XA 1LBFA 1OG0A 1LLZA 3NQFA 3FOKA 4LS1A 5HUPA 5F4XA 3GLCA 4WY0A 3CTLA 4N2YA 3NGJA 3W71A 4UTWA 4QJ1A 3G8EA 3KRSA 3CIXA 5HR6A 1FXPA 4JTUA 1J5TA 2X30A 1PE1A 3DHFA 3QW3A 3TK7A 4FB7A 2RFGA 3G1FA 3WK2A 3FS2A 2VFGA 1YPFA 2W0UA 1WYIA 5HWMA 1G7UA 4Y96A 5AYXA 4XBSA 1X7FA 2QJGA 2WNQA 3LHTA 4OV4A 1LP6A 3TXZA 5BNKA 4D2JA 2Z1BA 3IV3A 3BG5A 5IBXA 2QCHA 4O15A 1SU5A 3OHIA 4KFPA 3CC1A 3ZWTA 2Y63A 4WOQA 3ABSA 3SECA 3W2KA 2R91A 3M44A 3NVTA 1XXXA 3O6DA 2VFDA 3FYPA 4GRSA 4RK8A 4LU0A 4UTMA 3RMJA 4X22A 1PVNA 3EX1A 2H3DA 3O05A 4MYAA 3LBMA 4FIQA 3IIZA 3WK0A 3O6CA 2NXGA 3W1PA 5G2WA 3LTSA 1ICSA 1VCVA 2YYTA 1KLYA 4JTKA 3ZR4A 3WJZA 4UTIA 2ZDRA 3OA3A 1OABA 1ZY9A 5I3IA 1PS9A 2J9ZA 4UFLA 2B7NA 1OFDA 1JJKA 4ZMGA 1CX9A 1VRDA 4LTSA 1JRCA 3IVUA 5D09A 3CT7A 3QH2A 1F5ZA 3EEGA 5HULA 3W76A 2YGYA 2ZTJA 4UTHA 3NPXA 1ICQA 3PC0A 5FF0A 3MI2A 4RLIA 2B4GA 4E0CA 1H7NA 1LBLA 2KZHA 3EX2A 5LNUA 2YDAA 4UFKA 3F03K 5DY3A 2V82A 4HT3A 4KFOA 5TQLA 3TAKA 1ZAHA 2FB2A 4I7WA 5BRBA 3S1UA 2PC4A 4DEFA 4GUHA 4PEKA 5EKYA 4YMZA 3U6WA 4BFAA 3LHUA 2O7QA 2V30A 1ZAIA 3OG3A 1WV2A 3TAOA 2X1SA 4RKAA 2GVJA 4O19A 2CW6A 3MMTA 4RJEA 3RNDA 1W8SA 4JY8A 1N7KA 4ML9A 4JY9A 4QQ3A 4O14A 2JKPA 3T7VA 2YFNA 1BTMA 1OVDA 1OFOA 1EP2A 5AHIA 3HGRA 2E6AA 5EBUA 2ZYFA 4ORIA 4GWEA 4FX7A 3PBYA 1I4NA 2QUTA 1X8FA 1P0KA 4K8EA 3MHUA 3ELFA 5KZMA 2AGKA 2VKZG 1GYLA 1M7OA 3LCFA 3I65A 3EWUA 1MXSA 4ONVA 2J24A 3BW3A 3NQAA 3TKFA 2PE4A 3NQDA 4O0ZA 4C1LA 2QR6A 3GDTA 4LS0A 4UTTC 1DOSA 1T99A 1GPWA 1N55A 3NPWA 3L65A 3BVJA 1Q6QA 1P1XA 4L4LA 1IXOA 5EMUA 1FWWA 3HG3A 5I3JA 4HSOA 2QCLA 2DJXA 2NUYA 3O06A 1AW5A 3NM1A 4QNWA 3W2MA 5I3FA 3STEA 2C15A 3G22A 3LI0A 3IIOA 4EVZA 1OHLA 1S5WA 3EWWA 2JBMA 1AW2A 1KM3A 1SW7A 2HS6A 4IX2A 4JTEA 3EWYA 1KM6A 3UXAA 4X3ZA 4UR7A 2WOQA 2VFEA 2H8ZA 1P4CA 3BO9A 4YXGA 4JTJA 1UBSA 4P61A 1GTHA 5CSRA 3W2NA 3GNNA 3ATZA 3SJ3A 3Q58A 4JTGA 2G97A 1QFEA 1KM4A 4QISA 5K9CA 1H7XA 3W87A 1MEIA 3PBUA 3C2VA 2HMCA 5AHMA 5D37A 2J9YA 3L5MA 1QCWA 2ISVA 3GDKA 3TJXA 3C2OA 4JX6A 3WJYA 2NXHA 3G18A 2ISSA 4RXFA 5A8GA 2VXNA 3EWZA 1ZFJA 5DXYA 5DCBA 3THQA 2A7PA 2FDSA 1P5BA 3TFCA 1TJRA 3F4WA 1EX5A 1RPXA 3PUOA 3UQNA 2CLIA 4JS3A 1F2JA 4GJ1A 4NU7A 3C6CA 3BGGA 3LRLA 3M5VA 3OVPA 4GNJA 3S5NA 4MFDA 1TPH1 3KFTA 5D30A 3PG8A 3PBWA 3HIJA 2WSYA 4JR5A 4E2DA 1IXPA 3BG9A 3TV8A 5BMXA 4FF7A 1QOQA 1A5SA 1XL9A 1VZWA 2J88A 1W37A 4NX5A 1TV7A 4NJGA 2AQWA 1F7BA 4A29A 4PA8A 3BLIA 4E2BA 4AWTA 4IMDA 2G5WA 3SR7A 2YSWA 3QJAA 3S5OA 2QUVA 2P0OA 4RCXA 4LVGA 1CW2A 3UWQA 3B0VC 3PM6A 4LV4A 3P80A 3W1XA 2BZNA 3G24A 5E93A 1OJXA 2VEMA 4YWIA 3HPXA 4AB4A 4O1AA 5LGXA 1TREA 3H54A 2E77A 5KTLA 2ZRZA 4ZVJA 2X1UA 4JDYA 5G1TA 3LX9A 4O54A 1L6SA 4QSHA 4RV8A 3L0NA 1KBJA 4NJIA 1GVFA 3M47A 4CNNA 1Q6RA 3A5VA 1VCGA 3BG3A 2QCMA 3E49A 3VFLA 3W07A 4Z1AA 4UXDA 4ADUA 1BEUA 4WD0A 5DY2A 4HHPA 3UWWA 5BOOA 2FPYA 4MVAA 2VFHA 7TIMA 3QYQA 4CCDA 4BI5A 3N73A 3VNDA 3FA5A 1OYBA 1DJQA 2PRLA 4LVAA 3W73A 1W3NA 2Z6JA 3NA8A 1G67A 1IXNA 3NXFA 3NM3A 3DU0A 3D0CA 5DCEA 2EKCA 1YLVA 2ZRWA 3NQGA 1SQ7A 4M5PA 2WQPA 1JUEA 5AHFA 2JK2A 4CNOA 1XCFA 2AAMA 5DCDA 1K8XA 1HL2A 1QOPA 3O6YX 2QCEA 3CWOX 4FNUA 3N14A 1O94A 3LRMA 4OU1A 4UMCA 4NNAA 1KFCA 4RX0A 3PWAA 3WJSA 3LB0A 1JQVA 1RQHA 4GBUA 4LVBA 1FWNA 4UNKA 1H7OA 3C8FA 4JTTA 1VYRA 5D04C 3EXSA 1M6JA 4Z0SA 1H5YA 4TMBA 4M19A 3KVLA 5AFDA 5C5YA 1KV8A 3UWUA 2A21A 2GJNA 2GQAA 3FEMA 2EGZA 3CIWA 3KX6A 1B3OA 4OQVA 2QCNA 3LHWA 3T55A 3W7JA 5EYWA 2E09A 1T8XA 4LRTA 3EWXA 4UFMA 2Y7GA 3L0GA 3NQ2A 1R47A 4N9BA 1Q45A 1EUNA 3PUEA 3MYPA 5HJLA 1SO5A 5LKYA 5DXXA 2GUUA 3L21A 2FPTA 1VH7A 3L9CA 4Y9AA 4AWSA 1WBHA 3C2FA 5LSMA 1HO1A 3MI3A 4UFHA 2ATMA 2WNZA 1G4EA 1TQXA 1XKYA 2GVGA 2VEPA 3LERA 3U8GA 5AYZA 3GDMA 4O0KA 3KRZA 1EEPA 2ZZ7A 1WAUA 3MYOA 3W7RA 4TO8A 5D2VA 2R94A 5C54A 3P8JA 3IVTA 5FEXA 4CCCA 3I6RA 4IQLA 1FBAA 1LRQA 3MP5A 5SWUA 3SGUA 2E5DA 4GXMA 2JKEA 3GDLA 4PL2A 3W7EA 5KINA 1LORA 1FQ0A 4ZQRA 5HINA 1JUKA 2E5BA 1SUXA 3NO5A 1H7PA 2YCEA 3LHZA 2CFFA 3NQVA 4LV9A 4O57A 1AMKA 5CZ0A 5LNRA 5FEZA 4Z08A 3W70A 1TPUA 4P2VA 3W23A 2ZFAA 3PUDA 2QUUA 3L5LA 2QKFA 3BARA 4MLJA 1OF6A 3IVSA 3PVFA 1DL3A 1K03A 4I9AA 1VQTA 1K02A 3M41A 4FNTA 4TX9A 3G1HA 4KFNA 3RK8A 5G2IA 5EY5A 1RV8A 2JKAA 1H63A 2YYUA 3PF3A 1W3TA 3UYCA 1C9DA 1FDJA 3LV5A 3TX9A 2VFIA 1QO2A 4ORMA 1TMHA 1MSSA 1EB3A 2WSRA 5AYYA 1OFPA 2F84A 4R33A 1ZNNA 1KV5A 3JS3A 2YXGA 3W1MA 3DENA 4DXVA 2A7RA 4O50A 1QPOA 3VE9A 2CU0A 3P5ZA 3PAJA 2ZZ2A 1O4UA 1G4TA 1TRIA 2DZTA 2WV8A 3TCEA 1N8FA 3G3DA 4UTUA 4DBEA 3B8DA 1K8YA 1VR6A 3MI6A 3MHGA 4WQ6A 4MZ1A 1ICPA 2DJLA 2UV8G 3W1RA 1HFBA 5FF2A 3LHVA 3NQ7A 3STGA 1Z48A 1LZOA 3GAYA 3W7HA 5F2GA 4UTLA 3CM4A 1RVGA 3M5YA 1BKSA 4K39A 3STFA 4DF0A 4O12A 4LUJA 4AWUA 3P8IA 4AHQA 1Z44A 3UY7A 1NEYA 3E12A 5CGQA 4WXZA 5K7JA 3HPSA 2B7QA 3Q94A 5AC8A 2ABBA 1GVOA 3TSDA 4Z1DA 3QF0A 3W86A 4TU1A 1QPRA 3GXNA 4ADTA 3L66A 1V5XA 3A23A 4LW7A 5EPDA 1LM1A 5KZDA 3T40A 3EKLA 3M1ZA 1SZEA 3M43A 3MWAA 1KM2A 1QMLA 3QSRA 3IIXA 4BR1A 3B0UX 5CSSA 4O16A 1NVMA 2CWNA 3LOTA 3M16A 1VLIA 2WKJA 4O52A 3ZFHA 3AO0A 5LZLA 1ML1A 4Q4KA 4JTFA 4CQ8A 4AEOA 5CPLA 1GG1A 1ME8A 1TRDA 1ONRA 3FIGA 5F2IA 1W5NA 3EX6A 1DV7A 3LXAA 4IJBA 1TQJA 1QPQA 3CEUA 4OT7A 1OK4A 1RR2A 3CHVA 1LRNA 6TIMA 4PODA 4AH7A 3A22A 3DFOA 4UIOA 3R5EA 3G0UA 3G1DA 1X1OA 3P74A 2QEZA 4TR9A 3EB2A 5LGZA 5AC6A 4MIMA 3KVMA 4RZ4A 1TPFA 5D32A 3B06A 3M6YA 1GTEA 1TSIA 1KTBA 3USBA 1HTIA 3LM7A 3B05A 4CQAA 1VYSX 1LOLA 3TMLA 3NR0A 4X2RA 3NPUA 2JGYA 5EA9A 1RQBA 4JTSA 2VENA 4H4IA 3UD6A 4NVTA 5EL1A 4M6PA 1R2TA 2ZA3A 5CPOA 2B7OA 4OGZA 2RDUA 1OYCA 1EIXA 3S1VA 3KAOA 4LC6A 5D2TA 4XWUA 3L2IA 1QDSA 4FNQA 5LNWA 4XTDA 1OFBA 3DFPA 3DGRA 4A3UA 1KW1A 2GOUA 5L6UA 1KM0A 1GOXA 4GUGA 1DJNA 3WJWA 4AHOA 2FLIA 4PTNA 5HQEA 4UMBA 3GB6A 2ZA2A 5AHLA 2E5CA 4NXKA 3W9ZA 2WNNA 4HNTA 1PCKA 3W1UA 1DQWA 3LDVA 5K2ZA 3GXTA 1UCWA 4KWWA 1FWSA 3STCA 2ZCGA 5F1VA 1KLZA 2QF7A 4JIPA 1FWTA 3R2GA 4MJMA 1IIHA 2A6NA 1S5TA 4HSNA 4KWVA 1KTCA 2VEKA 1FY6A 1R2RA 5F4SA 1FUYA 1O5XA 3G8RA 3HF3A 2RDWA 3G1VA 2E68A 1DHPA 2B0MA 1SO4A 1NF0A 1W5MA 4GUIA 2Z2UA 1YTKA 3QZEA 2PURA 3JR2A 4X9SA 3MBFA 4WOZA 1EWDA 4Y8FA 3PS7A 5AB3A 1VLWA 3S5YA 2HSAA 3L5AA 2RH9A 1GYNA 3TH6A 4JICA 1O60A 1QO5A 1I45A 2A0NA 3LTYA 4R53A 3NDOA 1YADA 3GK0A 1GJPA 1WA3A 4DO5A 3NNTA 3UXDA 4OE7A 5G4WA 1VYPX 1XBVA 1XFBA 5F4WA 4IMFA 2V5BA 3LV6A 2I14A 1FXQA 1A53A 1OX4B 3NQ6A 1LYXA 3S9YA 3SY5A 1WX0A 1GQNA 1GT8A 3H53A 1SW3A 3UWVA 5D02A 2ZRVA 3TC6A 2ZZ6A 2C14A 4GC4A 4IMGA 5DBTA 1KFEA 3QSTA 5LHFA 2VELA 3B4UA 3W83A 1A5BA 3DI1A 1F05A 1HO4A 3V75A 2OCZA 3DFQA 3TE9A 1H60A 1XC4A 3PG9A 3MUXA 4O13A 4L4MA 2NWSA 1W56A 1DVJA 1UJPA 1JVNA 4LNYA 1M5WA 2WJZA 4O1DA 1PHQA 1T0OA 2ZZ3A 1WDWA 3WK3A 2OZ0A 4LOCA 3CU2A 2YW3A 1H61A 2V5LA 2FPVA 3P62A 3P81A 4IX0A 4PC8A 4AAJA 3W88A 1GZGA 2H3BA 1LCOA 3C56A 2DZWA 3PR2A 3TNOA 3LCGA 1LBMA 3KXQA 1EP1A 4LRSA 3MBDA 2A1YA 3GIYA 4JD4A 1Y0EA 3KVJA 1F74A 4JN6A 3C2EA 5K9DA 1SR9A 3E02A 4HNVA 3QPYA 5HUOA 2FB3A 5CZJA 4CLMA 3QMSA 3W85A 2V2HA 1VJIA 3EX3A 4IMEA 4WXYA 4JEQA 2QAPA 5DLCA 4K37A 2C19A 1KBIA 3S1WA 4O53A 3NPVA 2Y61A 1A50A 3NQMA 4A2SA 3VI2A 3V1PA 5AHNA 1FCVA 5IM51 3T78A 3DH7A 3S6DA 4YCPA 4BF9A 2P1FA 4O11A 4A2RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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