The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
EEVTIKANLIFANGSTQTAEFKGTKEKALSEVLAYADTLKKDNGEWTIDKRVTNGVIILNIKFAG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
protein L
|
| publication title |
Accurate computer-based design of a new backbone conformation in the second turn of protein L.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Finegoldia magna
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| total genus |
18
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-11-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5HI1 A; 1P7E A; 2PW9 A; 3FIL A; 2QMT A; 4KGR A; 1C9F A; 5BMH A; 3UI3 A; 2ONQ A; 1HZ6 A; 2N7J A; 1MHH E; 2JSV X; 1YMH E; 2NMQ A; 1IBX A; 2IGG A; 1F2R I; 2EEL A; 1IBX B; 1UWX A; 2RPV A; 2LHE A; 1GB1 A; 2QSD A; 2RMM A; 2LUM A; 2PTL A; 5JXV A; 2IGD A; 1YNT E; 1FCC C; 1XF5 L; 2ZW1 A; 4HKZ E; 5BMI A; 1KH0 A; 1XCQ L; 5HG2 A; 4D2K A; 1PGB A; 2JU6 X; 2LHD A; 1K50 A; 2J52 A; 4OZA A; 1PGX A; 2J53 A; 3V3X A; 4IOI E; 4OZB A; 1IGD A; 4KGT A; 1PGA A; 4OZC A; 1P7F A; 5BMG A; 2KAC A; 2N9K A; 1F2R C; 2KN4 A; 1XCT L; 2ON8 A; 1K51 A; 1IGC A; 1QKZ A; 1Q10 A; 2OED A; 2GI9 A; 5HHD G; 1FD6 A; 2PLP A; 2ZW0 A; 4WH4 A; 2I38 A; 2IGH A; 1MPE A; 2JWU A; 3GB1 A; 2KQ4 X; 1MHX A; 4HJG E; 4GLS C; 1MVK A; 1FCL A; 1MI0 A; 2KDM A; 1K52 A; 1K53 A; 3MP9 A; 3FIL B; 2JXT A; 2N9L A; 2K0P A; 1D4B A; 4IKG A; 1HEZ E; 1GB4 A; 1JML A; 4KGS A; 1EM7 A; 2JZP A; 2I2Y A; 2LGI A; 5HFY A; 4MAC A; 2KWD A; 1ZXH A; 2GB1 A; 1HZ5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KHW B; 3KWL A; 1TZ1 A; 2WXN A; 5BMH A; 4CO7 A; 4BOZ B; 2CKH B; 3NZ3 A; 3TUO A; 1EF1 A; 3A1Q B; 2KAJ A; 4GMV A; 3MTN B; 3AN1 A; 3Q8C A; 3TIX A; 2MX2 A; 3NVV A; 5G5H A; 3PZ8 A; 3ZYY X; 3RNB C; 3SHQ A; 2KJR A; 4XWW A; 2IND C; 1UWX A; 2PVG C; 4IDI A; 1V9J A; 1L4D B; 4PK1 A; 3R7R A; 1CQV A; 1ZP0 B; 2V9H A; 5FR6 A; 2I1J A; 3LXF A; 4IM3 A; 1AN8 A; 2J52 A; 4OZA A; 2K39 A; 1FFU A; 2PJH A; 4YXD B; 1YQ4 B; 4AQ7 A; 3LYY A; 3H8H A; 3T3O A; 2AEH A; 3A4S C; 4IUM B; 3A9K B; 3R3M A; 2V4I B; 4DHJ D; 3P4R B; 2N7D A; 4WAF A; 4FAD A; 1TKE A; 3DBH I; 3RNG C; 3OG5 A; 1KTK A; 4A9A A; 2MH7 A; 2NBW B; 5CHW A; 5E6N A; 4RGO S; 3H9D A; 3CWI A; 3AV8 A; 1L0Y B; 1ZOY B; 4JIO U; 4YSY B; 2YVC A; 2WDR B; 1P98 A; 1FCL A; 4RGN A; 3W2D A; 2LRU A; 2IO0 B; 2DX5 B; 1SIF A; 1J8C A; 4ASW C; 3VDZ A; 3PRM B; 4H2A A; 1GUA B; 4JQW C; 4DHZ E; 1D4B A; 2FAZ A; 4EUT A; 2INN E; 4FUL A; 4KKI A; 3CST A; 4REZ A; 1ENF A; 2DYM A; 2GB1 A; 4DHZ B; 3E9S A; 3NRZ A; 5AUK A; 3EEC A; 1E7V A; 3PGE A; 1ZKH A; 3A4R A; 1UBI A; 1KLU D; 2MCN B; 2IGG A; 1TY2 A; 1UF0 A; 2ZNV B; 3LJ3 A; 4W9L A; 4AJW A; 3TL5 A; 2LHE A; 1GB1 A; 4A3P A; 3VAW A; 1Z2M A; 2DZM A; 4JX1 C; 4FLH A; 1HQR D; 3K9P B; 1YD8 U; 2WDV B; 4B6W A; 2FUG 1; 2ZZP B; 2NCN A; 3GZN B; 3UIN B; 2MRP A; 4KGT A; 1JWU D; 4HXD A; 1WR6 E; 4HK2 A; 2JZZ A; 1WGG A; 4F8C B; 2E6X A; 2JVC A; 1SE2 A; 4YL8 A; 3SFD B; 1R4N I; 2O2V B; 2QJL A; 4TUU A; 1WYW B; 2YEP B; 4N6E B; 2FBW B; 1FD6 A; 1GG3 A; 1WSP A; 1GNU A; 2L32 A; 3R2T A; 4MT5 A; 3VRA B; 3C19 A; 2K1F A; 4J3O D; 2K3U A; 4TV3 A; 2WXJ A; 3DBS A; 4LCD E; 1T5X D; 4YSX B; 3DVG X; 4HCP B; 3I63 C; 4N58 A; 3JVZ X; 5L95 C; 2CU3 A; 1FRD A; 2GMI C; 2KMM A; 1FNV A; 2INP E; 4KSL C; 5EE3 A; 1WGH A; 2MBE A; 3UI3 A; 1JRU A; 2NTS A; 1WRD B; 1EU3 A; 2X38 A; 4DDI D; 2W82 A; 1TZO A; 3RUI B; 1WM3 A; 1KF6 B; 2BVC A; 1QOF A; 2JZ3 B; 4USA A; 1V81 A; 4HRS A; 3AB5 A; 3KLS X; 1FNW A; 1S3S G; 2CR5 A; 5CTR C; 4FHJ A; 4LNO A; 2MP2 A; 5HKH A; 3ML9 A; 4DXG A; 1D5X C; 2ACZ B; 3ZKJ C; 2DZJ A; 4EZK A; 2KT7 A; 3JSV B; 4PYZ A; 2JRH A; 4RCO A; 4ZHP A; 2LFI A; 3L54 A; 1QIL A; 1AAR A; 4C00 A; 4EEW A; 3RCZ A; 3VR8 B; 3U8Z A; 1V1P A; 2K9X A; 2WXO A; 2DHZ A; 3UIP B; 4YTM B; 5BYS A; 3WIM A; 3ENE A; 1N61 A; 1JRO A; 5E6P A; 4PS3 A; 1LXD A; 2IY0 B; 4LNI A; 2OED A; 2RPQ A; 2IBI B; 3UQA A; 4BBN F; 3PZ7 A; 3RN9 C; 3ZO5 B; 4YT0 B; 5LXI B; 2YEP F; 4AS1 A; 2C5L C; 2LJI A; 3EUB 2; 3L16 A; 2JWZ A; 3VQI A; 4W9G A; 1RFA A; 2L8J A; 1WRI A; 4MJS A; 1JWB D; 3BK2 A; 3NZS A; 3CSF A; 4XE0 A; 1TS2 A; 1UGJ A; 2IO3 B; 1F0Z A; 2WXH A; 1WH3 A; 2WNM A; 1YOV B; 2I2Y A; 4P7I A; 4ANU A; 3N1Y C; 1WXA A; 5BO4 B; 2FCQ A; 4PS8 A; 2KC2 A; 3AE7 B; 2A4Z A; 1E10 A; 3B2F A; 5GXG B; 2WXI A; 2C7H A; 1TIF A; 5G5G A; 3N3K B; 4KX6 B; 3IFW B; 3DHG C; 3AI5 A; 2OHF A; 4MDK E; 3ZDM C; 3ML8 A; 1XLO A; 2KZR A; 2EEL A; 2BT6 A; 2XNA C; 1ROE A; 2IPK D; 2WX1 A; 3W9C B; 3GE8 C; 2V3S A; 4NQL B; 1C77 A; 2TSS A; 2KXJ A; 2QSD A; 1UUP A; 4MM3 B; 3J9C A; 3MJW A; 3Q6B A; 4HDQ A; 2GBM A; 3VH4 B; 2H88 B; 1YNT E; 2VZK D; 2SAK A; 3OJ4 B; 3AEG B; 1T0S C; 1I4G A; 2LWP A; 4GDK B; 1N63 A; 3R66 C; 1TY0 A; 2J7Q B; 4A55 A; 4XDD A; 3IBE A; 2C9W B; 3I5J C; 4W9D A; 2GOW A; 4OZC A; 2RDG A; 5DPS A; 4J6I A; 3L08 A; 3VFK A; 4BAX A; 1X1M A; 1J7A A; 3ZQ4 A; 2KN4 A; 3QWZ B; 1CK1 A; 3APC A; 2RDH A; 2BS4 B; 4IM2 A; 1K51 A; 5J17 A; 3GP7 A; 2JQR B; 2WX0 A; 4JWS C; 2G3Q B; 3C8Y A; 4JL9 A; 4EZJ A; 4YWG G; 5EE9 A; 2Y5C A; 2L0F A; 4GIV A; 3AXC A; 4MH8 A; 1STE A; 2NS5 A; 2R61 A; 2M17 A; 1MVK A; 3PLV A; 1JRP A; 3BK1 A; 2IZV B; 2SEB D; 1V86 A; 2Z0D B; 1WXV A; 4NAW A; 2V3P A; 4W9F A; 3DBR B; 1NEN B; 2KVZ A; 1C78 A; 5E6J A; 1TS5 A; 3QX1 A; 4WQM A; 4MAC A; 4K81 A; 1WJ4 A; 2VH1 A; 4AP4 C; 1QT9 A; 4HDO A; 1C9F A; 2BB5 A; 1YN5 A; 5MPO A; 5IKC M; 2D07 B; 5JH5 C; 3DVN U; 4N9F 4; 1U4A A; 1LGR A; 2KKC A; 2PE9 A; 3Q2A C; 4P1C C; 2OOB B; 1T6B X; 2L7R A; 4L2Y A; 2CU1 A; 3JW0 X; 1PYW D; 3N9Y C; 1T3Q A; 4MGI E; 3U7D A; 4KVG B; 2MEK A; 5JXV A; 2K8C A; 1YN3 A; 5BMI A; 3VVW B; 1WX9 A; 5D3I B; 3BZD B; 2FIF A; 1L6U A; 1SE4 A; 1NEK B; 3PLU A; 1UD7 A; 2WXF A; 2FUH B; 4W9C A; 1JWS D; 1L5P A; 1P7F A; 2QIL A; 2MBH A; 1L4Z B; 4IG7 B; 3AE1 B; 4RGT A; 1FO4 A; 2BB6 A; 3ECI A; 2KFK B; 5FR3 A; 3ALB A; 2NPT A; 4WJQ A; 1WJU A; 1P9D U; 3LDZ E; 2WDQ B; 1MPE A; 2L3Z A; 4A20 A; 4RNA A; 4GLS C; 1XXG A; 3PTF C; 3WAO A; 4NJ6 A; 5LNK 1; 2N4F A; 2IY1 B; 2RGF A; 1WR1 A; 4TQ1 A; 4AWJ A; 3U2S C; 2UWQ A; 1GB4 A; 2LAS A; 1ET6 A; 2KYW A; 4URK A; 2PMV A; 1HZ5 A; 2J4X A; 1ZUD 2; 1OFF A; 2WYQ A; 2DWQ A; 2ONQ A; 5IOI A; 3ZNH B; 1EUV B; 4K7W A; 2KN5 A; 3DVN V; 3D32 A; 3VTV A; 1I4P A; 5LLI A; 3L4P A; 3TEZ A; 3H1U A; 2UU7 A; 3H7P A; 3PT2 B; 4IM0 A; 1Z5S B; 1FM0 D; 4W9H A; 3VTW A; 4RF1 A; 2QC8 A; 2JPH A; 1WI0 A; 4TKN A; 2N0S B; 3TBL D; 1WMH A; 2PTL A; 2M19 A; 2KVR A; 3PHW B; 3AEA B; 3IXS A; 2LVO A; 1OGW A; 2D5G A; 3GOE A; 5EE0 A; 4C4V B; 2DAJ A; 2BGF A; 2G45 B; 2IDY A; 3V3X A; 5D7G A; 4AOF A; 4HKQ A; 2KDI A; 3EC8 A; 2M0X A; 3R2I A; 4JPS A; 1XCT L; 3A33 B; 4WJP A; 2ASQ A; 2G1E A; 2WHI A; 2KOX A; 3QA8 A; 4DQO C; 4EFO A; 4II2 B; 1ZW7 A; 1XQQ A; 3HIZ A; 2MQJ A; 1FNU A; 4XYC A; 3MC9 A; 2I38 A; 2L1A A; 1N6Z A; 4A6Q A; 3RNE C; 1J0G A; 1MHX A; 3WCQ A; 1V6E A; 2H89 B; 1WZ0 A; 1MG8 A; 2BKF A; 2WP9 B; 3I9V 1; 2W55 A; 2JXT A; 3M62 B; 2R2Q A; 3RZW C; 2E3T A; 4ANV A; 2ZNV C; 2KO3 A; 2LXC A; 5J18 A; 2BBC A; 2OJR A; 4G11 A; 1ZE3 D; 4ICU A; 3VUW A; 3WAP A; 5HFY A; 1PFD A; 1SJH D; 2NVU I; 1HA5 A; 3EHV A; 1VR9 A; 1TS4 A; 5EE1 A; 3PZD A; 3M3J A; 1C1Y B; 2MLB A; 1HTQ A; 4KDL B; 1OEY A; 1WX7 A; 2BYF A; 1B1Z A; 5C23 A; 4W9E A; 4G3X B; 3B9J A; 3AU4 A; 4CYE A; 2N1W A; 4DBG A; 1L2N A; 3AEB B; 3P4P B; 2BYT A; 5IO9 A; 4JWU C; 2WXK A; 5TSS A; 4BBN C; 2YLM A; 1MJD A; 2GLS A; 2ZW1 A; 3GE3 C; 2XEW A; 3DQV A; 3MHS D; 5EDS A; 3MHZ A; 1C79 A; 1K8R B; 4XC2 A; 4C7Y A; 3N1Z C; 3Q3O C; 4M02 A; 4LNK A; 1VCB A; 4IOI E; 4L23 A; 1IP9 A; 3P63 A; 1NBF C; 1CMX B; 5BMG A; 2KDB A; 2XBB C; 3RFZ B; 1TTN A; 3NY5 A; 4NY0 A; 5CHF A; 1FEH A; 3NJT A; 3RI7 C; 3TJP A; 3B1L X; 3SFE B; 3DCG A; 4TQ0 A; 4WWO A; 1TJE A; 2NBU A; 4ZHO A; 1RRB A; 4GXB A; 3MFG A; 3U52 E; 1YJI A; 3EA6 A; 3H6N A; 1MFW A; 4W9K A; 2C7N B; 4MGY E; 5JZE B; 2L0T A; 1F1H A; 3Q3J A; 1CZP A; 2CJO A; 3RUL A; 4C56 C; 2V0G A; 2ZJD A; 4M00 A; 2PEA A; 1KM7 A; 4FJZ A; 3N32 A; 3RYT A; 5AZG A; 1GC6 A; 3NS8 A; 4KZ0 A; 2LGX A; 2L76 A; 3TEY A; 3AE9 B; 3FIL A; 4NPN A; 2HTM E; 1FXI A; 3IAS 1; 1E7U A; 2LVQ A; 1WX8 A; 4MGZ E; 5E6O A; 2KC1 A; 1P1A A; 4LJP B; 1D5M C; 3VHT C; 2EMS A; 1WFY A; 2KD0 A; 3ZNZ B; 3ZNI D; 1J7C A; 4P16 A; 1LO5 D; 3DBL B; 2RMM A; 2LUM A; 1E8X A; 2JUO A; 1J19 A; 3DPD A; 3FC4 A; 3QIJ A; 3U4E G; 5D6J B; 3PSE B; 2MJD A; 4FJY A; 4IWO A; 2FCM A; 4D2K A; 4LNF A; 4GOC A; 1R4M I; 4NJC A; 4RF0 A; 4JLC A; 1JWA D; 1OQR A; 1RFK A; 3Q8A A; 4C80 A; 1XT9 B; 4LDT D; 3IG3 A; 1LM8 B; 3PRE A; 2N9K A; 3KH0 A; 3V60 A; 2IO1 B; 3V6E B; 5KHQ A; 1PDX A; 1Q10 A; 2WQY B; 3UQB A; 2GBN A; 3K9O B; 3AEC B; 2MJ3 A; 1SIJ A; 3IAM 1; 1SE3 A; 3TEW A; 3B0A A; 2L05 A; 3AUL A; 1E5W A; 2KWU B; 1EWC A; 1QZE A; 4KKJ A; 4MEM A; 4A3O A; 1C4C A; 2LVP A; 2DAF A; 1Y8R C; 4LNN A; 3OLM D; 4KIK A; 2FID A; 2BPS A; 3A9J A; 2K6D B; 1VDV A; 1ZXI A; 4DK5 A; 2WDT B; 4OVU A; 4XWT A; 4ARI A; 1GAQ B; 2K8B A; 3AE4 B; 4EKU A; 3O65 B; 3AED B; 4A8X C; 2FNJ B; 2NMQ A; 4QAY A; 3PRP B; 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4M0W A; 2KJH B; 1SSN A; 1T0R C; 3ZNG C; 1WGD A; 2O6V D; 4RH6 A; 2MBB B; 2ZEQ A; 1R4N B; 4MEL A; 3LB8 C; 3ZXR A; 3ZJT A; 3FKY A; 1T0Q C; 1XCQ L; 3C0R B; 4K7U A; 4XX5 A; 4UDU C; 3NZU A; 2LHD A; 2M1M A; 4E71 A; 1QOA A; 3Q3N C; 2D11 A; 4LK0 M; 3HUI A; 2INC C; 1WGK A; 3RT3 B; 2LZ6 A; 3NS1 A; 4NQK E; 3ZLZ A; 4ACF A; 4DXA B; 1KOT A; 1FMA D; 1VLB A; 3L17 A; 1F2R C; 3RNF C; 4ZOH C; 3NG0 A; 3CMM B; 2ZCB A; 3M95 A; 1UBQ A; 2WXQ A; 4NAW B; 4WQO B; 5D3D A; 3T9L A; 3OWE B; 3AU5 A; 3V05 A; 1E9M A; 3FAH A; 3Q8B A; 2JF5 A; 3O13 A; 5C1Z A; 2GBJ A; 2D2Q A; 3APD A; 4KSK C; 1E0Z A; 2BQQ A; 2CS4 A; 1QQR A; 2RDB C; 5C2T B; 4CHK A; 1V2Y A; 2K0P A; 4WUR A; 1WXS A; 3ZW3 A; 1I4H A; 1FIQ A; 1P7E A; 2Z0E B; 2N7E A; 3KVF B; 4XDC A; 2WU5 B; 2BTE A; 4HLE A; 3T3N A; 2ZPY A; 4RM8 A; 3KQ4 A; 2KTF A; 2AQ1 B; 4GU2 A; 1XLN A; 2K25 A; 3ZVV A; 1TGZ B; 2HE7 A; 4YSZ B; 2KX3 A; 4HPL B; 1GC7 A; 1QF6 A; 2D3A A; 2HD5 B; 3A1Q A; 1FFV A; 2L00 B; 2Y5B B; 2KDE B; 3QQ8 B; 1V1O A; 5AZF A; 3WAL A; 1KH0 A; 3KWV A; 5HG2 A; 4JGH B; 2WWZ A; 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