1KLZA

Crystal structure of orotidine monophosphate decarboxylase mutant d70a complexed with ump
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
RLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIAAFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords OROTIDINE 5'-PHOSPHATE DECARBOXYLASE
publication title Mapping the active site-ligand interactions of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase by crystallography.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 81
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2001-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1klzA00
1LRNA 1C29A 4HNNA 4IXHA 4E2DA 3GDTA 3W86A 1PE1A 4CLMA 5IBXC 5HUOA 4O19A 3UNDA 3DZ1A 1LOSA 1Z41A 3L0GA 4LVFA 3IRDA 3P5ZA 3W1LA 3F1QA 3P84A 3W7OA 4N9EA 2OCZA 2VENA 1B9BA 3S5OA 1M6JA 1ICQA 2R91A 3SY5A 5LNSA 3O8AA 4FEZA 1XFBA 1AW2A 3M1ZA 4N4PA 1D3GA 2A21A 1LLZA 3E02A 1JRBA 3TSMA 2HS8A 3OEXA 3Q94A 1FCQA 3PUOA 3PSVA 3OA3A 2ZZ5A 4Y8FA 5F1UA 1WYIA 1XL9A 1W5QA 3W7RA 3KXQA 3HPXA 3CQ0A 4YMZA 1VLWA 3NQ8A 3IGXA 1YTEA 3CEUA 1GVSA 4LV9A 3UWYA 3L5AA 1NEYA 1XI3A 4HPXA 3W2UA 3RU6A 1P5BA 2OT0A 1KM3A 3LTPA 1LBFA 1TQJA 4XBKA 3TMQA 3NQ7A 1TPFA 4ZMGA 4DF1A 2NV2A 5AYZA 5F2LA 2ZRVA 3GR7A 3W1NA 2FPVA 3AO0A 1V5XA 1X1ZA 4UNKA 3GX9A 1OK4A 3DFNA 3WK3A 3EWUA 3GDRA 4JTGA 3LCGA 2LLEA 3NQGA 1G7UA 1GYNA 1DKWA 4MYXA 3BLEA 3KHJA 3C2OA 2Y62A 3DAQA 4O50A 2P1FA 2E6YA 4A21A 1VQTA 4Z0JA 2X16A 3F4WA 3HGJA 2E5BA 3LI0A 3FFSA 3EWXA 1HFBA 1I45A 4X3ZA 3MJYA 3L0NA 4JTLA 4UCGA 3TH6A 1R46A 2E09A 1TB3A 1VLIA 4DO4A 1W5MA 5HR6A 1LOQA 4BK9A 1TTJA 3N2MA 4RX0A 5K9DA 3UZJA 1FDZA 5DCEA 1I2PA 1KFEA 3BGGA 3ZS4A 5HWNA 3C6CA 4HT3A 2A1YA 1FDJA 2V9DA 3NOEA 3PBWA 3PBUA 1OF8A 1X6UA 4WD0A 3FJLA 1OFAA 4PC8A 2YYTA 1TRDA 1OFPA 1JQVA 4JTUA 1ZAHA 2FIQA 3C56A 3P8IA 3W1QA 2JKEA 4CCDA 2DJLA 1H7WA 4O0ZA 2FB3A 3GXTA 5CPLA 1JRCA 4K7YA 3HMJG 4HKPA 3QSRA 3SZ8A 1AG1O 4QM1A 3TNOA 1JCYA 1EB3A 2J24A 2Z6IA 4JYDA 1MZHA 2HTMA 3S5ZA 3O15A 2W0UA 3N2XA 4UR8A 4NQ1A 3NO5A 1T8XA 1GTHA 1XBXA 3W87A 3O6DA 3MO7A 1FWTA 3W9ZA 3ATZA 4JTFA 3E0IA 2G96A 5AOUA 2ZBTA 2RKXA 3B05A 4WOZA 1G4EA 3UY8A 4RZ6A 4KWVA 3IVSA 1RVGA 3F03K 2OJPA 3HGRA 2EPHA 3TMLA 4MJMA 4FIQA 1UASA 2PRHA 4TMBA 5D03A 1GOXA 1TPC1 4KWWA 1MSSA 4GUGA 4MVAA 3FOKA 4DXVA 5KZDA 2V2HA 4HPJA 3A23A 1V7YA 2WO5A 3GK0A 3C2VA 1Q6OA 1XC4A 3B8DA 3PC0A 1Y0EA 4E0CA 1OFEA 1A5BA 3TXZA 3PVFA 1K7EA 3NG3A 3SIZA 4EOUA 1H5YA 5IBXA 1LCOA 3O6YX 4LS2A 4OGZA 3WJZA 4NJKA 4MZYA 3NQDA 2H3BA 4LC8A 2NUYA 3L65A 3GAYA 4IMFA 4DELA 3NZRA 1K8YA 1JR1A 1A5CA 3DHDA 1OYBA 3W2NA 3VCRA 3WK1A 2GUUA 1TTQA 1FBAA 3LCHA 3LGEA 3C61A 3T44A 4TIMA 2FLIA 3LXAA 4M7SA 1IXPA 4GUIA 4FHAA 2A7RA 2DORA 2HS6A 1TV5A 3M6YA 3UPBA 1Q45A 1ZCOA 1IXOA 3HPZA 1H7XA 1TCDA 4X2RA 1MXSA 3IV3A 4UTJA 4MUZA 2NUXA 3V75A 4AWUA 3I65A 3G1FA 4POCA 2P0OA 1I2OA 4UNLA 4BI7A 4DO6A 4EIVA 5DLCA 5E1QA 3EXRA 4UFKA 1RQEA 4JICA 2Q3OA 2WNNA 3JR2A 5HUPA 5J5DA 4ZL1A 3CTLA 1SO6A 1JULA 1AL8A 1TYGA 4IWWA 5A8GA 4GUJA 1SO5A 2PCQA 5CZJA 5G2WA 1LROA 4IUOA 3G1SA 5CPMA 3CM4A 4MOZA 1S3HA 4FIRA 1BWLA 4AEOA 1K02A 4A22A 1G4TA 5AHFA 5U7SA 3NZ1A 4FNPA 1O5KA 2I14A 3VFLA 2PE4A 3LRMA 1H50A 3LHVA 1JCJA 1WOAA 3NPWA 2D73A 4O16A 1SW0A 4S2BA 1OG0A 3HF3A 3CHVA 1QOPA 2KZHA 4I7VA 3WJYA 4FX7A 3IVTA 1J5TA 4UTWC 1VCFA 4JX5A 4OBTA 2C13A 3T78A 3W2KA 2FQIA 2JK2A 5KZEA 1EX5A 2QCDB 4BFAA 3W72A 3YPIA 1JUEA 2NX9A 3HJZA 1EPXA 4FX6M 2BX7A 3EKZA 2ZTKA 1Z48A 1U83A 2J9YA 4XWUA 3T7VA 5CPNA 4I7WA 1I8JA 4DQWA 2VFDA 4KKXA 3IIPA 4JGDA 3QQ1A 2QDGA 5H2ZA 3W1RA 3LCLA 3L0KA 4UMCA 4I9AA 3SECA 1EP1A 1H7RA 1E51A 2B7NA 5EYWA 2FPYA 1FXQA 3BO9A 3UWWA 3PG8A 1FWNA 3QPYA 1LRTA 4NVTA 2CLMA 3NM3A 4LV4A 5D38A 1W3NA 4H4IA 2J9ZA 1F73A 3M0ZA 3W71A 2I1OA 4K8HA 5DN1A 4UFMA 5K9CA 1KTCA 1YXDA 3SJ3A 2GVGA 1JCXA 1ONRA 3L68A 3KX6A 3LRLA 4IGHA 3RK8A 1C9DA 4UMAA 2Y6ZA 4UTUA 3TUUA 1TPH1 4U28A 3O63A 1M7OA 3UZ5A 1SFLA 3KRZA 3A5FA 4UFIA 3LBMA 3MUXA 3TKFA 4O4VA 1FDYA 3HG4A 3W7HA 5LHFA 3AJXA 2YR1A 3HQ1A 2GQAA 3PM6A 1KV5A 1VCVA 2CW6A 3FYOA 2DP3A 3HG5A 3P67A 5D2VA 3Q58A 2A5HA 4YCOA 1L6YA 2A6LA 4MFDA 4UUIA 2WSYA 3UWQA 4CCCA 5G4EA 5K9XA 4O11A 2WKJA 1OFQA 1R2SA 5D32A 4UMBA 2E6FA 1QOQA 4R53A 1H63A 1MO0A 4NJHA 1ME9A 1KFJA 2ABAA 5C6MA 3S1WA 4S2CA 4CNOA 2GOUA 1QPNA 3TSDA 3U8GA 4O13A 1QFEA 1YPFA 3TJLA 2YSWA 2TMDA 1FX6A 1QDSA 3DFPA 3LOTA 1KW1A 3W6YA 4RK8A 4X9SA 2CLOA 3ELFA 1GYLA 2DZXA 3BARA 4EF9A 4WXYA 2TPSA 3MP5A 1I2RA 2B7PA 2GJNA 2Q8ZA 2BTMA 4NZFA 1SUXA 3QMRA 3R89A 3GB6A 1IXNA 1VHCA 3DFQA 3EX6A 2X1SA 3LHUA 3GXNA 3TW7A 3TC6A 1NFBA 4IX0A 3PG9A 1ZFJA 4NJIA 3NQVA 3TAKA 3G1VA 3W3OA 1GWJA 3NQEA 1ICSA 1W5NA 1YDVA 5BOOA 3W1PA 5C55A 4IPJA 3STFA 4RCXA 4H3DA 1CX9A 1AMKA 5G4WA 4D2JA 5AC7A 3BG9A 4DF2A 1GTEA 1KFBA 3EX3A 4AXKA 1NSJA 1HO4A 1KM2A 2ZZ2A 3NAVA 3USBA 2ZRWA 4IMCA 4L4MA 1LP6A 3NPUA 2V5BA 5HWJA 3L67A 5AC8A 1XUZA 1W5OA 4DBDA 3B04A 1DJNA 3GLCA 3UD6A 3M5VA 3NGJA 1VYRA 3EX4A 1N7KA 4C1LA 2E77A 4LUIA 1QWGA 1EUAA 2NXHA 4AHPA 1BTMA 4FX8A 1ZJIA 1Z44A 1DV7A 3S8HA 3GR8A 4OV4A 1I2NA 3SSJA 4LU0A 5AFDA 3L21A 1G69A 4M6QA 3GIYA 1NAL1 1I2QA 3L66A 4FXRA 4HN4A 1LBMA 4K37A 5C5YA 5HNRA 1F05A 6TIMA 4JTTA 5HINA 5CG7A 3EB2A 5I3JA 3B0UX 3S5NA 1AW1A 1KM0A 1H60A 1OYAA 4PTNA 1GG1A 1B4EA 4JTJA 3S6DA 4KFPA 3EKLA 4LRTA 1VH7A 5HR7A 5AYXA 3IEBA 2FPTA 1W3TA 1FWSA 4N4QA 3NM1A 4QIUA 2OZ0A 2YZRA 5G5IA 1SO3A 2ZRYA 1F2JA 1B57A 2GJLA 3W2MA 3DI1A 5J5RA 4Y6GA 3W7GA 3C3NA 2PRLA 4O52A 3KOFA 3QZEA 4JN6A 1GT8A 4WY0F 2NWSA 2YDAA 3FKKA 4Z1BA 5AHNA 2DZVA 3DXIA 2X2GA 4NZJA 3JRKA 5HQEA 2EAWA 1WA3A 3GNNA 4JX6A 4GWEA 4K8EA 1H7PA 3ABSA 1JUKA 2V0TA 3NDOA 6ALDA 1C8VA 3QW3A 3R12A 4UTTA 3VI2A 2BLEA 3CB8A 4O0KA 2OT1A 3W7IA 1LORA 1VC4A 3LXCA 3W22A 3B06A 3BLIA 4TMCA 1WDWA 4HNUA 1JVNA 1WXJA 1GVOA 3M44A 1ZY9A 5K3VA 5I3FA 4O12A 1WX0A 2G5WA 5F2MA 4NX0A 3EWBX 5CZ0A 4IMEA 1TV7A 1WV2A 3EWWA 2Y85A 1UB3A 3LB0A 4PH6A 5L6UA 5F1VA 3G22A 1GQNA 1K7XA 2ZZ1A 4FNRA 2Z0IA 3IIVA 1VGAA 3WJWA 4LVGA 3UWVA 2C1HA 2FFCA 5EY5A 1QCWA 4AVFA 3W1XA 4R7JA 4YCPA 3E12A 3PB0A 2VFGA 1IF2A 4UXDA 2H90A 3DKJA 2CFFA 4ALDA 5AHIA 3WK0A 1S5TA 1G67A 3SW6A 1OFOA 3TQVA 2Y7DA 3PUEA 3R8RA 2Z2UA 4HNTA 3LV6A 5K4ZA 3SGUA 3PAJA 2Y7GA 1R47A 2CLIA 3CPRA 2E5DA 4M6PA 5F4XA 2V30A 1P4CA 1K7FA 1PS9A 5FF0A 2A2IA 4LS0A 2XN0A 1A5AA 3LI1A 4NXKA 4YL2A 1O5XA 3TFCA 5FESA 4LTSA 2VFIA 2YGYA 3P81A 3H53A 3MBDA 8TIMA 3O05A 5D09A 2O7SA 1F76A 3L5MA 1N8FA 3IVUA 3NYZA 1FWWA 1XBVA 1XDMA 1OJXA 3S1XA 5G2IA 4JEQA 3KAOA 4M19A 2PC4A 4NT0A 4QITA 1H1ZA 3G0XA 4BI6A 1AL7A 4GRSA 1OVDA 5KSWA 4QSHA 4QQ3A 4IMDA 5D33A 3QQ0A 3T55A 4OQVA 3W7QA 4PCFA 1W1ZA 3M7WA 3E9AA 4WOQA 4MJZA 3TW6A 3DH7A 1J2WA 3UWZA 1PL9A 1TSIA 4HHPA 1W37A 3LXBA 2QAPA 1ZENA 3NQCA 3O16A 1ZAIA 1EWEA 5CGQA 2Y70A 3S5YA 4ADTA 5E0KA 5L9FA 3NL5A 1WQ5A 2H3DA 2QJIA 3C2RA 2YX0A 4HNVA 5G2HA 4GUFA 2VEPA 4IQLA 4YWIA 1LBLA 1DL3A 4MY8A 3TQKA 4Q4KA 5D30A 1YLVA 4FNUA 4YXGA 4X22A 4CQ8A 1ME7A 2JGQA 3DFTA 5HMSA 1L2UA 4RJEA 1GVFA 4JIQA 2ZZ3A 2BXVA 1OFRA 1LZOA 1UUOA 3LCXA 5DCBA 4N9CA 4Y90A 1YXCA 3FIGA 2E6AA 3TCEA 4JTSA 1SSDA 2E5CA 2QCFA 4IPIA 2QCLA 1DQWA 5TBOA 3W84A 2PRMA 2WNQA 3CU2A 2QCMA 3NEVA 1TRIA 1TPEA 1YDOA 1IIHA 5FEWA 4UR7A 4ZQMA 4OT7A 3CWOX 3M43A 1K3UA 4P61A 5LNRA 3G1YA 4O14A 1SSGA 2XFWA 4IXXA 3TJXA 3P61A 4WX2A 3NL6A 2WSRA 3MP4A 3BW4A 4FF7A 2YFNA 3BK0A 1TPDA 5EL1A 3BW3A 5CKSA 4MZ8A 1VYPX 1N55A 2ZRXA 3I7SA 3W7PA 1KBIA 1D3HA 2ABBA 2RFGA 3EWYA 3G0UA 3QMTA 4H6KA 3PY2A 3W1TA 2VKZG 3GYEA 3LDVA 4XZ9A 1KLYA 2J27A 4NJGA 4XKYB 1TREA 1XDLA 1JCLA 1OYCA 1TV8A 1ZALA 3B03A 3KVJA 2Q3RA 2WPBA 3NQAA 4HSOA 3LHYA 4DEFA 2QCGA 2C19A 2V2DA 3NXFA 1B3OA 3VE7A 3C2EA 2F7FA 4PL1A 4JY9A 4O10A 4DPPA 1RQHA 5AHLA 5DXXA 2UV8G 1P0KA 5D02A 1Q6LA 1SPQA 1T0OA 4GFSA 3UXDA 5D05A 1P0NA 3R2GA 4Z0SA 2G95A 2RDWA 3SGZA 4MPQA 1OX6A 1Q6RA 3QPZA 3LHWA 5D37A 2ISSA 3LM7A 1TIMA 1KM5A 4XUGA 4AB4A 2DU2A 1A53A 3DFOA 4P2VA 4WUIA 3TIMA 1FCBA 4FB7A 2ZRZA 1QPQA 5C2XA 1BWKA 3PWAA 4O57A 4MYAA 2NV1A 2DZWA 3LERA 4TU1A 4Y96A 3EXSA 1X8FA 3BLFA 4WQ6A 5G1YA 1G4PA 1PIIA 2R14A 2CLEA 4O4WA 3IIZA 3CT7A 5KTLA 3BVJA 1W5PA 4DBEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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