1KV1A

P38 map kinase in complex with inhibitor 1
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
348
structure length
331
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords p38 MAP kinase
publication title Inhibition of p38 MAP kinase by utilizing a novel allosteric binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 331
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2002-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1kv1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1kv1A01
4FKOA 3VWAA 3DAEA 3V8WA 4EWQA 3PVUA 3R1SA 4ZZOA 4J1RA 3PY3A 4ANOA 3EZRA 2YIWA 1Q97A 5BYLA 5E8SA 5KMLA 3U55A 2JKMA 3FI4A 4XV1A 4BDAA 2GSFA 1WBOA 5IUHA 5KMJA 4IW0A 4EI4A 2WTKC 3WYXA 3O7LB 3MH0A 1YVJA 5CNOA 3E63A 5DHJA 4O1OA 3UPZA 1WBSA 2BAKA 4TKSA 4B7TA 2EXEA 2GQGA 2X1NA 1YKRA 4OBOA 4X0MA 4QQTA 3NVKI 2O65A 5FD2A 2HELA 4Z55A 4AS0A 4YO6A 1XH5A 4A9TA 2CGWA 3D5XA 5J95A 4CLIA 4QMZA 5JFWA 5K4IA 3I7BA 4JNWA 3OZ6A 4EYMA 2XIRA 5EQPA 5AUYA 3RK7A 1IAJA 2BZIB 3PE1A 2GNHA 3IW6A 2VTOA 3NUXA 2E9NA 3WZEA 5M4CA 4ZJIA 3PDTA 3D83A 3WF5A 4I6BA 3FXWA 2Y4IB 3ZM4A 2OZAB 3DJ6A 3ORTA 4FEXA 3R83A 5HTBA 1Q62A 4EHVA 3QBNA 4B8LA 4F7NA 2YM3A 3UOHA 5HI2A 4U0IA 2VGOA 3DBFA 3JUHA 2P0CA 2HY81 4YJUA 3E8NA 3RJCA 2XP2A 3E93A 3UDBA 3LOKA 1TQIA 2WGJA 3B8QA 1KOAA 2JDOA 3FPMA 4QP4A 3R9DA 3F69A 3EFWA 4AU8A 3RKBA 2QOKA 5HG9A 1WCCA 1OL2A 5CEPA 4D0WA 3R9OA 3D9VA 1OECA 2YCFA 1XH4A 2PVFA 3EFKA 3LZBA 4FV2A 2BHEA 2VU3A 4ZK5A 3OWPA 3LFCA 5KBRA 3QD0A 3FZTA 4FZFB 3WF9A 1BI7A 4NM7A 1Y6AA 2ZV8A 4E20A 3PP0A 5IF1A 1UWJA 3SW7A 3B2WA 4CFUA 4BTFA 3AC8A 2R3HA 4FZ6A 4EK6A 4D2SA 4E8AA 4YZ9A 4TWCA 1CTPE 3FDNA 2I0EA 3QZGA 3IOKA 1YXSA 4EOJA 1U5QA 1WBNA 4BWKA 4FL2A 4GCJA 2ZOQA 3MY5A 3F2RA 2W1ZA 5FP5A 4F0IA 4JXFA 3MYGA 4FTKA 1H24A 5I9ZA 2QOHA 2IG7A 4II5A 2OU7A 1P14A 4MF0A 4JRNA 4O21A 2XA4A 2UZDA 2CGXA 3NWWA 5ETFA 2CLXA 4GU6A 2ZMDA 2WMVA 5AR8A 4H05A 4XUFA 3DA6A 3FJQE 4FSTA 4R6VA 4XOZA 2HY0A 4E4NA 1P5EA 4QTCA 5D11A 3D94A 5HCXA 4F1MA 3VUMA 3GQIA 2E9VA 1H01A 1BUHA 2JDRA 3GFEA 3WE4A 4IADA 2PZRA 3MS9A 5KKRB 1NT2A 2VWUA 3FMDA 4C58A 5I9WA 4FTAA 3E92A 2OF2A 2QQ7A 2C68A 5HBHA 4DG2E 3ORMA 3VW6A 5FXSA 1ZYLA 4R3PA 2ETKA 2J5EA 3M11A 4CFMA 4IVBA 4IZYA 5HVYA 2AC3A 2QO7A 3TZ8A 2RKUA 4EH2A 3EKNA 1XJDA 1SMHA 2XK7A 3P9JA 4G3CA 2F9GA 4G6LA 1LUFA 3H0YA 1NA7A 2PMLX 3LFAA 4GEOA 5AWMA 4AOIA 5KNJA 3CTHA 4BCQA 3LKMA 4R8QA 1ZXEA 2XCHA 5I5ZA 1ZMWA 3NIEA 4JL9A 4WOVA 4HYIA 1KV1A 3HVCA 4I93A 4OTIA 4HPUE 4IXPA 4U80A 4BCGA 5JFXA 5LCJA 3Q2JA 3I1AA 4QMNA 4GL9A 1ZYDA 1OB3A 3VS1A 3QUPA 5EI8A 3W2SA 2WMSA 2OICA 4MD8E 2X7FA 3ORIA 5F94A 5CY3A 2PMIA 5IUIA 3POZA 3QX4A 3O50A 4W4YA 5HKMA 3UO6A 3C4FA 5E8XA 5IQHA 4FYNA 2VWXA 2VWYA 3P7BA 3ITZA 4M13A 4ACDA 4RX7A 4ZZMA 3TN8A 3AG9A 3ZZEA 5JEBA 3OFMA 3ORPA 3WE8A 1BLXA 3CC6A 2XRUA 4IAZA 2Z2WA 3DQXA 3ULIA 1NW1A 1JSVA 2WTWA 3FZSA 1H0VA 1PHKA 2YIQA 2FSLX 2FYSA 2JAVA 4IACA 4IDVA 5D41A 3DV3A 4O2PA 3LIJA 2UW3A 2AUHA 4FMQA 4O0XA 3BELA 4WO5A 4IZ5A 4YC3A 3ZFMA 1GZKA 3QKMA 3E8EA 1P2AA 3RK5A 5CSPA 4YGAA 4FV7A 2QKWB 4GV1A 2CLQA 3BEGA 5IA5A 2XNBA 1WBVA 4PL4A 2VWZA 1WBTA 3PUPA 4ONAA 4ANLA 5E1EA 2WOTA 5KMOA 3JY9A 4I5MA 2X2LA 4FKUA 4NW6A 3ROCA 4F0GA 1CDKA 3UTOA 3F82A 2YLEA 4ANQA 4CEGA 2X8DA 5DT3A 2XYNA 1FPUA 4CV9A 3AMYA 4O91A 2C0OA 2OJFE 2J0IA 5CSVA 1U4DA 4RX5A 4FEWA 2ZYBA 4FKQA 3IDCA 2ITTA 4ANNA 5DR9A 2AYPA 3IO7A 5HG5A 3U9NA 2HIWA 4FSQA 4I5HA 3ZDUA 4FVPA 4XLIA 1Q8YA 3EFLA 5TE0A 1KE7A 2ETRA 4GH2A 2CN5A 3DZOA 4ITHA 3PIYA 4OT5A 3G9LX 3BRBA 4TW9A 4FOBA 4X21A 2A27A 3VUIA 4Z7HA 2VNWA 4RLLA 4RA4A 5AP1A 3R01A 2VWBA 4A07A 4BFMA 2VTPA 3F3UA 1K2PA 2BDFA 3CTJA 4IEBA 2IW8A 4R3RA 5AUTA 4F7SA 4E7WA 4RSSA 2ZB0A 4L43A 3WBLA 4X7QA 4C57A 4DGNA 3C9WA 2W05A 4FG8A 3PXKA 3CKXA 4DAWA 1H0WA 4BC6A 3NAYA 3HP5A 4IX4A 1GY3A 1M17A 5HNIX 5GIPE 1B39A 3RAWA 4NM5A 3DTWA 4LGHA 5LCKA 2J5FA 3IGGA 3ORLA 3L8VA 4R1VA 5L8JA 5BX0A 5FDXA 3LMHA 4D2PA 4TT7A 3BGPA 2CNVA 4L7FA 5AA9A 3QF9A 3EOCA 3I5NA 4RJ3A 3ENMA 4CKIA 2WOUA 3TL8A 3EN7A 4YLJA 5HIDA 1RJBA 3RAIA 4C61A 3DKGA 3HEGA 3PTGA 4JR7A 1IR3A 1W7HA 2PL0A 2JIIA 3Q5IA 4G9CA 2J0KA 2P2HA 1R1WA 3CPBA 3HLLA 3JVRA 4TWNA 4EH9A 2OW3A 4FKTA 2CCIA 5KMMA 3QC4A 4TRLA 3A8WA 4F9CA 2EB2A 4TXCA 3MTFA 4PL3A 5IPJA 1Q41A 3IW8A 4LGGA 2WZJA 4LOQA 1UKHA 3PLSA 2JITA 5E4HA 2UW7A 3R9HA 3ZS5A 2PSQA 2B0QA 3FYKX 4RIYA 2ZAZA 1FGIA 3W18A 2WKMA 3PPJA 5DPVA 4W4WA 1OPJA 3ORNA 4I23A 3UG1A 4PPCA 4QPMA 1XWSA 2W9FB 4PF4A 3PWDA 2OFUA 4CQGA 4EJNA 1OL5A 2GPHA 3L8SA 5CSXA 2WU7A 5DRBA 5J87A 5FTOA 3KXZA 4CMUA 4G2FA 1PMUA 3FSFA 1MRVA 3KXGA 4I4FA 1Y8GA 2QG7A 3R1NA 3PJ2A 4DT9A 3FKOA 2BR1A 4WG5A 4JX7A 1MRYA 2GTNA 3T8OA 2FSTX 2VX0A 3BYOA 3EKKA 3COHA 3A99A 3O96A 5GZ8A 2ACXA 4NKSA 2YAAA 4Q5HA 3IQ7A 4I20A 5CXZA 3LFBA 3SW4A 4FYOA 2YISA 1Z57A 4CG8A 4OUCA 4D9TA 4B6LA 3SA0A 5CVHA 2FGIA 4Y83A 4QD6A 1Q99A 5IMEA 4HNFA 1Q4LA 2PZYA 3O2MA 3R30A 2EB3A 1O9UA 3MVMA 3R1QA 4CFVA 5A4EA 3QALE 2A19B 3FZ1A 5BVEA 2UZNA 4FV4A 4KB8A 3AD6A 3P78A 4EH5A 3LCKA 3F66A 3O17A 3DDQA 2RFEA 3DY7A 3MY0A 3UBDA 4BDEA 3HMMA 3KMWA 1P4FA 2XEYA 1H26A 2WO6A 3KULB 3MH3A 4XP0A 2VTSA 4M7IA 3DGKA 5E90A 4N57A 2GHGA 4ZMFA 5L2IA 1JSTA 1O6KA 4G5PA 3FKLA 4GJ2A 5CF8A 4C8BA 5J79A 3DBEA 3K5VA 4XMOA 2OFVA 5ICPA 2RIOA 5TOZA 1FINA 4C4GA 4CMTA 3HDMA 4FTUA 4J96A 5CU0A 2WMQA 3AMAA 1GIIA 4XG7A 3S3IA 5EFQA 4AW5A 3ZSGA 2A2AA 4XNEA 4B0GA 5CF5A 5M57A 3FAAA 1M14A 4Y8DA 4TYHB 2EXCX 5L8KA 1Q3WA 4KRDA 4Z3VA 3T3VA 3W16A 1BKXA 2YN8A 3A7JA 5LOHA 3LM0A 2R3NA 3EN5A 4UALA 2PUIA 4BICA 3OWKA 4RC2A 4CRSA 3OY3A 4BHZA 5IMXA 1Q8TA 1M7QA 5E92A 3SRVA 4BDDA 1YXXA 2XBJA 1H1WA 3OT8A 3W8LA 3M1SA 2P33A 4YC8A 5EKOA 2WHBA 3JPVA 4UYNA 2QOQA 4NCTA 4YBJA 2DWBA 5KZ0A 3V5LA 4A4XA 1I09A 1YDTE 2OH4A 4GIHA 5JFVA 2UZBA 2C6LA 3NR9A 4J98A 2W7XA 3ZRKA 4UMRA 3MPMA 5M55A 4PPBA 2WMTA 4IZ7A 2C6TA 1XH9A 5CI6A 5TO8A 2W1IA 2FH9A 4X2JA 3BV2A 2C69A 5EK7A 3SDJA 4NT4A 3VRZA 4OTRA 2VTIA 3F7ZA 3HRFA 3I6UA 4RIWA 1SZMA 5CENA 4RWLA 4GFGA 5FQDC 3H3CA 4XG2A 1XH7A 4R7BA 4YHJA 2Z02A 3EB0A 3R7VA 2NNWB 2WQMA 4LUEA 2ITUA 4ZJJA 5KCVA 4HPTE 3F5PA 4O7SA 3IECA 4GT5A 5AP7A 4C4FA 5E9EA 3DLSA 4W4XA 1DI8A 4PP7A 1SVEA 2CJMA 2JC6A 3GQLA 1ZY4A 1AGWA 1QPEA 3AXWA 4U3ZA 3HRBA 3DQWA 5HGIA 4AZSA 1PKDA 3C51A 2JGZA 3QQFA 1BI8A 5F9EA 3AC1A 4JOAA 4F4PA 2F4JA 4JDIA 3TNHA 2ERKA 3VS3A 4DLJA 2R3GA 3EWHA 3RPVA 2Z8CA 3U6HA 5DOSA 5AX9A 4FV9A 2ZDUA 3QTZA 4LUDA 4TYEA 4NK9A 4BYJA 3MESA 2YCQA 3CTQA 3HMIA 1TQMA 4V0GA 2G2FA 3O23A 4NTTA 4EZ7A 3BWFA 3QTUA 4U6RA 2GNJA 2OGVA 1YWRA 3ZUTA 5D9HA 3GVUA 3TV6A 2ZM4A 4QTBA 2ITPA 2YEXA 3W2PA 5HU3A 1F0QA 4QMVA 2W5HA 3KU2A 1OBDA 3WILA 4FKRA 1PMEA 3QWJA 5AUWA 1URCA 4IM3A 4Y73A 3VN9A 4JQ7A 5DT0A 4DCEA 5CAOA 4JAIA 4WHZA 3P86A 1S9IA 3S1HA 2HK5A 4GRBA 5DRDA 5H9BA 1RDQE 1UU3A 4QMLA 2PE0A 3L9MA 3RCDA 3N4VA 4AF3A 3C4EA 5EG3A 5IUGA 2J90A 2KTYA 1PXLA 2YWPA 5FWKK 4U97A 2GTMA 3ZHPC 5JQ8A 3AOXA 2UW5A 5CQWA 1V1KA 4FKWA 4FV8A 3VQHA 1O6LA 3LFQA 3DBCA 3R8UA 3RGFA 3RPRA 4PTGA 4CLJA 3UP7A 3OTUA 3QCQA 4QPSA 3WZDA 3IDBA 5IA0A 2ZDTA 3LFNA 1OMWA 1H07A 3A7HA 4U43A 5AIKA 2CKQA 4AA4A 4MXYA 4ZSGA 2YJRA 2R3QA 3I81A 3PXRA 4K11A 1JKLA 4FL1A 2W4JA 5D1JA 5L2QA 5ACKA 3SXSA 5LJJA 5H8BA 4CMOA 2QD9A 5BMSA 2PVRA 2H9VA 2XIZA 4DEGA 3ZH8A 3LFDA 4MWIA 4GVAA 4P7EA 3ZFYA 4EOOA 4Z7GA 3PY1A 2CGVA 1UA2A 3GU5A 3FY2A 2W0JA 4JS8A 1XHAA 4KBCA 4AQCA 2OXDA 4RLKA 4YTFA 1KUTA 4JRVA 2PULA 4YO4A 3OW3A 3DJ5A 3PIZA 4F65A 5BNJA 2H6DA 3BX5A 4M97A 3FZPA 4K2RA 3OW4A 1HOWA 2GHMA 3DBDA 4WNKA 4CYJA 3C4XA 4KINA 2FA2A 4XRJA 5D12A 4DEEA 5K0XA 3EH9A 4C02A 3MA6A 5DG5A 5K5NA 3TCPA 3KN5A 4FIGA 5JN2A 4FTTA 2W4KA 4GT4A 5DT4A 4O81A 3FC2A 5HLWA 1PJKA 2QI8A 3PJ1A 3QTRA 3PJ3A 1GIJA 3AGMA 3HA6A 3PG1A 4AAAA 4DLIA 2XK6A 4QTDA 4AGUA 4M12A 4ARKA 3ROYA 4ACMA 3PY0A 4XBUA 3UVRA 4BDFA 4RQVA 3TI1A 3UVQA 4MNEB 1DAWA 2PE1A 3CBLA 1U54A 3PXYA 3PLAE 1Q8UA 3KXHA 5B2LA 1VYWA 4EYJA 4WUAA 4PDYA 4Q2AA 4DH7A 4ZTRA 2W17A 4USFA 4FICA 3C0HA 5A6NA 4JQ8A 4BDCA 3C0IA 2WAJA 2X2KA 4FA2A 3FLSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FKO A;  3VWA A;  3DAE A;  3V8W A;  4EWQ A;  3PVU A;  3R1S A;  4ZZO A;  4J1R A;  3PY3 A;  4ANO A;  3EZR A;  2YIW A;  1Q97 A;  5BYL A;  5E8S A;  5KML A;  3U55 A;  2JKM A;  3FI4 A;  4XV1 A;  4BDA A;  2GSF A;  1WBO A;  5IUH A;  5KMJ A;  4IW0 A;  4EI4 A;  2WTK C;  3WYX A;  3O7L B;  3MH0 A;  1YVJ A;  5CNO A;  3E63 A;  5DHJ A;  4O1O A;  3UPZ A;  1WBS A;  2BAK A;  4TKS A;  4B7T A;  2EXE A;  2GQG A;  2X1N A;  1YKR A;  4OBO A;  4X0M A;  4QQT A;  3NVK I;  2O65 A;  5FD2 A;  2HEL A;  4Z55 A;  4AS0 A;  4YO6 A;  1XH5 A;  4A9T A;  2CGW A;  3D5X A;  5J95 A;  4CLI A;  4QMZ A;  5JFW A;  5K4I A;  3I7B A;  4JNW A;  3OZ6 A;  4EYM A;  2XIR A;  5EQP A;  5AUY A;  3RK7 A;  1IAJ A;  2BZI B;  3PE1 A;  2GNH A;  3IW6 A;  2VTO A;  3NUX A;  2E9N A;  3WZE A;  5M4C A;  4ZJI A;  3PDT A;  3D83 A;  3WF5 A;  4I6B A;  3FXW A;  2Y4I B;  3ZM4 A;  2OZA B;  3DJ6 A;  3ORT A;  4FEX A;  3R83 A;  5HTB A;  1Q62 A;  4EHV A;  3QBN A;  4B8L A;  4F7N A;  2YM3 A;  3UOH A;  5HI2 A;  4U0I A;  2VGO A;  3DBF A;  3JUH A;  2P0C A;  2HY8 1;  4YJU A;  3E8N A;  3RJC A;  2XP2 A;  3E93 A;  3UDB A;  3LOK A;  1TQI A;  2WGJ A;  3B8Q A;  1KOA A;  2JDO A;  3FPM A;  4QP4 A;  3R9D A;  3F69 A;  3EFW A;  4AU8 A;  3RKB A;  2QOK A;  5HG9 A;  1WCC A;  1OL2 A;  5CEP A;  4D0W A;  3R9O A;  3D9V A;  1OEC A;  2YCF A;  1XH4 A;  2PVF A;  3EFK A;  3LZB A;  4FV2 A;  2BHE A;  2VU3 A;  4ZK5 A;  3OWP A;  3LFC A;  5KBR A;  3QD0 A;  3FZT A;  4FZF B;  3WF9 A;  1BI7 A;  4NM7 A;  1Y6A A;  2ZV8 A;  4E20 A;  3PP0 A;  5IF1 A;  1UWJ A;  3SW7 A;  3NFG B;  3B2W A;  4CFU A;  4BTF A;  3AC8 A;  2R3H A;  4FZ6 A;  4EK6 A;  4D2S A;  4E8A A;  4YZ9 A;  4TWC A;  1CTP E;  3FDN A;  2I0E A;  3QZG A;  3IOK A;  1YXS A;  4EOJ A;  1U5Q A;  1WBN A;  4BWK A;  4FL2 A;  4GCJ A;  2ZOQ A;  3MY5 A;  3F2R A;  2W1Z A;  5FP5 A;  4F0I A;  4JXF A;  3MYG A;  4FTK A;  1H24 A;  5I9Z A;  2QOH A;  2IG7 A;  4II5 A;  2OU7 A;  1P14 A;  4MF0 A;  4JRN A;  4O21 A;  2XA4 A;  2UZD A;  2CGX A;  3NWW A;  5ETF A;  2CLX A;  4GU6 A;  2ZMD A;  2WMV A;  5AR8 A;  4H05 A;  4XUF A;  3DA6 A;  3FJQ E;  4FST A;  4R6V A;  4XOZ A; 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