The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
122
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structure length |
112
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Chain Sequence |
NNSQLVVSVAGTVEGTNQDISLKFFEIDLTSRPAMPHKLEKADLLKAIQEQLIANVHSNDDYFEVIDFASDATITDRNGKVYFADKDGSVTLPTQPVQEFLLSGHVRVRPYK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase activator
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| molecule keywords |
PLASMINOGEN
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| publication title |
Effects of deletion of streptokinase residues 48-59 on plasminogen activation
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
24
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| structure length |
112
|
| sequence length |
122
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QQR A; 1L4Z B; 1C4P A; 1L4D B; 1BML C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1OGW A; 4GGQ A; 4KKJ A; 1F9J A; 3V60 A; 1VZ7 A; 3JSV A; 1HXY D; 2N7E A; 4E71 A; 1P9D U; 1TZO A; 3P4S B; 2JYT A; 5FR3 A; 3VVW B; 2PEA A; 3V61 A; 1NYQ A; 2GBK A; 4GU2 A; 1D5X C; 2KDE B; 4MSQ B; 3TIX A; 2BS2 B; 4C7Y A; 4K7S A; 3NZ3 A; 5E6O A; 2G3Q B; 3QAQ A; 1WGH A; 3RUI B; 2KJ6 A; 3RZW C; 1STE A; 1H8C A; 1GC6 A; 1JWM D; 3QC8 B; 4WQM A; 3Q3M C; 4RF0 A; 2GOW A; 3TMP B; 1V5T A; 1WXA A; 3FKY A; 2XN9 C; 2BB5 A; 2JX5 A; 3PVL A; 2D3B A; 4LDT D; 1TYG B; 2HD5 B; 4P6V F; 4F1S A; 4MGZ E; 1MG8 A; 5EE3 A; 2IND C; 3UIO B; 2DNF A; 1QLB B; 1KLV A; 1T0S C; 1V1P B; 4JL9 A; 3ABV B; 5KHO A; 3TSS A; 3ZNZ B; 2KX0 A; 3B08 A; 2CKH B; 2NVU I; 1WX9 A; 1WGG A; 1M94 A; 2K6D B; 2N9X A; 4OVZ A; 1FFU A; 3QX1 A; 4KVG B; 4AP4 C; 3P4P B; 1VZ8 A; 3VXW A; 3KUZ A; 2QJL A; 4EE2 A; 3AE6 B; 2H88 B; 4RGN A; 1UUP A; 1WI0 A; 5IOI A; 4FA6 A; 3DHI C; 5IKC M; 2W9N A; 3IAS 1; 2KDB A; 4R3D A; 1E7U A; 2C5L C; 1LGR A; 3KUC B; 2LAS A; 3V6C B; 3CIR B; 4EZK A; 2CHW A; 4NZL B; 1D5M C; 3DBR I; 1LM8 B; 1JAL A; 2KMM A; 4ZOH C; 4K7W A; 2QIE B; 1WMH B; 4DHZ E; 4RGM A; 3M62 B; 5LNK 1; 3Q3N C; 3U4E G; 2ZJD A; 1L6U A; 5J18 A; 5BYS A; 3U30 A; 2PTL A; 3PHX B; 1I4P A; 1I42 A; 1WZ0 A; 3T3O A; 1WGR A; 2BYV E; 4FJV B; 2D3A A; 3X23 A; 1WE7 A; 3L08 A; 1J7A A; 2FUH B; 3KUD B; 4G50 A; 4A8X C; 2N1W A; 2QCZ A; 5AZH A; 2KYW A; 3PLU A; 3ZKJ C; 3W5V B; 3EHV A; 1D4B A; 1FO4 A; 3W5U B; 1V86 A; 1VRA B; 4WJP A; 4RNA A; 4J6I A; 1XCQ L; 2WP9 B; 2VZK D; 4X57 B; 3NOB A; 1N5W A; 4PS3 A; 4IUM B; 3VH3 B; 5JZE B; 3BVG A; 1MPE A; 1KJT A; 1E9M A; 4OZB A; 1KLG D; 4HJG E; 5C1Z A; 4OW0 A; 3SHQ A; 4NQL B; 2MBH A; 4ANU A; 2HTM E; 4YSX B; 1KOT A; 1VJK A; 3H7P A; 3B9J A; 3V05 A; 1WJ6 A; 1RFA A; 4KGT A; 2G4D B; 2GBR A; 4WWN A; 4ANV A; 3TEZ A; 2KVZ A; 3ENE A; 1ZXI A; 2MHJ A; 1F52 A; 2MEK A; 2BB6 A; 3NHE B; 1RAX A; 2J7Q B; 3ZDM C; 4MM3 A; 4W9F A; 2G9H D; 1FPY A; 1E0Z A; 3EFC A; 1GUA B; 3NJT A; 1N61 A; 3DOW A; 3AI5 A; 3UGB B; 1DOX A; 2RD0 A; 3MJ5 A; 3AED B; 3P63 A; 2DZM A; 1OQY A; 1QT9 A; 3RFZ B; 3E56 A; 3R66 C; 3KWV A; 3AEG B; 3NUH B; 4E74 A; 3T9L A; 4PYZ A; 2BF8 B; 2IGH A; 1U4A A; 2K8C A; 4K3B A; 1YMH E; 2L05 A; 4LNK A; 4NPN A; 3DHH C; 2ZPN A; 5CHV C; 4W9I A; 3RNG C; 4KDI C; 1L0X B; 2EKI A; 2BT6 A; 2N9K A; 2JWZ A; 1OQR A; 3DHG C; 1E8Y A; 1FMA D; 3QIJ A; 1TZ1 A; 4YWG G; 2BWF A; 1GG3 A; 1L7Y A; 2LUM A; 1UD7 A; 1SB3 C; 3T3N A; 2JUO A; 1ZE3 D; 5BO4 B; 3UIP B; 2Y5B B; 1C77 A; 1XLO A; 2LUE A; 3APF A; 3IBE A; 3I3T B; 4AQ7 A; 2N9P C; 4S0R A; 1Y56 A; 3CMM B; 3H9D A; 3I5J C; 4EUT A; 3Q69 A; 1E8X A; 2X8X X; 3K9O B; 5LXI B; 2V3N A; 2QEJ C; 4YT0 B; 4FJZ A; 2BYT A; 3A9K A; 2K8B A; 2LGS A; 1R4M B; 2KAJ A; 2YLM A; 1WE6 A; 4KIK B; 3Q6B A; 2LEK A; 4BKS A; 2FNJ B; 1N6Z A; 4TSS A; 3RUL A; 4GXB A; 2DZJ A; 4A9A A; 5GMV A; 2DYM A; 2KDI A; 2BBC A; 1FXA A; 4ZRQ A; 4NAW B; 3PGE A; 3CWI A; 1L6V A; 2UYZ B; 4AS1 A; 5D3I B; 1FXI A; 2VH2 A; 2MWS B; 3B2F A; 2K1F A; 4BVU C; 4M01 A; 4PS7 A; 3GE3 C; 1D3Z A; 1SXT A; 2ZW1 A; 5DPT A; 1N62 A; 1WGK A; 3TEY A; 4URK A; 1XF5 L; 5FR6 A; 1WXM A; 2KZR A; 3AE4 B; 1Q5W B; 3AH7 A; 3HVD A; 4WJO A; 2MBQ A; 2AEH A; 2V9H A; 2KT7 A; 1LO5 D; 4DK5 A; 1BXT A; 3DBH I; 2DLB A; 2B3A A; 1YN4 A; 2PKO A; 3Q8F A; 3AMZ A; 3RNF C; 1OQQ A; 4H2A A; 1AW7 A; 4HPL B; 3WIM A; 5I4D A; 2O2V A; 3QCA A; 4D2K A; 2WQY B; 2WWZ A; 4LTU A; 4P1C C; 4W9E A; 3MTN B; 3ZQ4 A; 3DVN U; 3N1X C; 1HE8 A; 2KTR B; 3DBL B; 4MGY E; 2WS3 B; 3NS8 A; 2KFK A; 1SIJ A; 3GP7 A; 4YSZ B; 2XEW A; 1EWC A; 5D2M B; 1WXQ A; 2IZV B; 2D2Q A; 3U8Z A; 2JT4 B; 2O6V A; 2VZK B; 3AE1 B; 2INC C; 1UWM A; 3M3J A; 5EDS A; 4WQO B; 1YQ3 B; 1KLU D; 3EGR A; 3VH4 B; 4RGT A; 4L1B A; 3DCG A; 2V4L A; 3DVN V; 2MBE A; 3L16 A; 1VCB A; 2CHZ A; 4EEW A; 3OAW A; 1QKZ A; 3HUI A; 4E3C A; 1YQ4 B; 5CTR C; 4AJY B; 3GS2 A; 2WDT B; 2E3T A; 4LJP B; 1OTR B; 3B0A A; 4MEL A; 5D3D A; 2Z0D B; 1YQB A; 1WX7 A; 4DHZ B; 1G6J A; 1WMH A; 1E7P B; 2KN5 A; 3TEW A; 3KYD D; 4BBN C; 2ZPY A; 1ROE A; 1WR1 A; 3L4P A; 3NY5 A; 1D5Z C; 2D10 A; 2WYQ A; 4B95 A; 4TMA B; 2A5U A; 4USA A; 2BKF A; 4LNF A; 2M4N A; 1SIF A; 4GIV A; 3VUX A; 1JQ4 A; 2FIF A; 1FNV A; 4LCD E; 1GNU A; 1TTN A; 1FFV A; 2WXL A; 3TBL D; 2V4I B; 3WAM A; 4FUL A; 1L2N A; 4TKN A; 1IP9 A; 2G1E A; 3BII D; 2IDY A; 3HIZ A; 2NS5 A; 5AZG A; 2N7J A; 2N9L A; 3H8H A; 3ZDT A; 5D7G A; 5E6P A; 4OVU A; 2FE8 A; 2OED A; 1FNU A; 2BTE A; 2BQQ A; 2KOX A; 3KLS X; 4EZJ A; 1FRR A; 2BKR B; 2B76 B; 4WH4 A; 4US9 A; 1LFD A; 4GDK B; 3UF8 A; 5IO9 A; 4TV3 A; 3Q8B A; 5EE1 A; 1JWB D; 2M17 A; 3N3K B; 3APC A; 4GDL B; 4L2Y A; 4N9F 4; 4XC2 A; 2KWV B; 1K51 A; 2MW5 A; 1AWD A; 4KSK C; 2N4F A; 4W9D A; 2ZNV C; 3FAH A; 1BT0 A; 2L8J A; 3E9S A; 2J0J A; 2JQR B; 1MVK A; 2PLP A; 4FBJ B; 1L4D B; 3UQA A; 1YX6 B; 3I57 A; 2D07 B; 3IHP C; 5E6N A; 3V6E B; 4BZA A; 1NDD A; 4PS8 A; 2JYE A; 2IGG A; 1A70 A; 3OG5 A; 2IO0 B; 2KTF A; 3JYU A; 1R7S A; 2LZ6 A; 2WU5 B; 3IAM 1; 2ON8 A; 2KVR A; 2IY0 B; 2PE9 A; 5AUK A; 1WXS A; 3TJP A; 2AL3 A; 4IDI A; 1WH3 A; 1N60 A; 2EKE C; 2YVC A; 2XK5 B; 3A4S C; 4JE3 B; 1Q10 A; 4I6P A; 2HE7 A; 2LVQ A; 2L0F A; 5BYQ A; 1ZGU B; 2KKC A; 4EFO A; 1XQQ A; 3DBH B; 5DPS A; 3ML8 A; 5H92 C; 2L83 A; 5D6J B; 3FIL A; 4FHJ A; 1ZW7 A; 2NBW B; 2D3G A; 3PHW B; 3ZIM A; 2DWQ A; 2DEN B; 2Y5P A; 1CK1 A; 3B1L X; 3VHT C; 2ONQ A; 2MSE D; 2BS4 B; 1TKG A; 4FN2 A; 1UEL A; 2UU7 A; 1XEE A; 2Q5W D; 2KQ4 X; 4W9K A; 2ZCB A; 4BOS C; 4HWI B; 4M8M A; 5KHQ A; 1UBI A; 2A4Z A; 2LXA A; 4UDU C; 2VH1 A; 5J2R A; 1XCT L; 3BIN A; 4MAC A; 3QK0 A; 4KIK A; 1L4Z B; 3RNA C; 4HVB A; 1DOI A; 1J7C A; 1J7B A; 1P0R A; 5IN7 A; 1YJI A; 2LRU A; 3ZJT A; 3ZW3 A; 3VFK A; 4LK0 M; 1QOF A; 2QC8 A; 1R4M I; 2IYD B; 3K9P B; 3L17 A; 4RF1 A; 2BVC A; 4NAW A; 5HG2 A; 2LI5 A; 1LQB A; 3AE5 B; 2IPK D; 3P42 A; 1MFW A; 3APD A; 4B6W A; 2LGY A; 1PDX A; 3A9J B; 2KHW B; 4XWT A; 3WAN A; 1YD8 U; 3AE9 B; 2WXK A; 2GBN A; 3ZRF A; 3EUB 2; 3N30 A; 3Q8C A; 1A5R A; 1PFD A; 4WWP A; 4ZYS A; 3CSF A; 2KQS A; 4ASW C; 1QF6 A; 4DDG D; 2SEB D; 3AE3 B; 3H1U A; 1E8Z A; 1IPG A; 1EU3 A; 2LVP A; 2JXX A; 1WY8 A; 4WIP A; 2BWE S; 1I7H A; 1K52 A; 4YTM B; 3PPA A; 2CS4 A; 3AE8 B; 4II2 B; 2K39 A; 3VRA B; 4MJS A; 4RCO A; 2PMV A; 1QQR A; 4ZHP A; 2MBB B; 1NYR A; 4ANW A; 2CU3 A; 2W55 A; 1IBX A; 4M0W A; 1ESF A; 3VQI A; 1KFY B; 3RZF A; 3ZTC A; 3PT2 B; 3H6N A; 5C3J B; 2NTT A; 3SD5 A; 2IO3 B; 3DBL I; 4GSW A; 5T8I A; 1GB1 A; 3P1M A; 4HKZ E; 1KRH A; 2HTH A; 2AQ3 B; 3VUW A; 4IWQ A; 3KVF B; 4KGS A; 2PW9 A; 3IXS A; 2R2Q A; 2N1V A; 4NY0 A; 2KC1 A; 3W1Y A; 3ZVV A; 2DYO A; 1QOA A; 2ACZ B; 1WYG A; 4AOF A; 2Y5C A; 3L0W B; 3PRZ A; 2QMT A; 2IO2 B; 1V49 A; 1PQS A; 3BWU D; 5TSS A; 4HXD A; 4BKT A; 1XXG A; 4K1R B; 1VZ6 A; 4BOZ B; 4C7Z A; 1PUT A; 2RDG A; 3V3X A; 1ET9 A; 4YXD B; 4DBG A; 3AE7 B; 4P7I A; 3AXC A; 1TBE A; 2L00 B; 2JPH A; 3NZU A; 4YTN B; 4ZRI A; 3LXF A; 2C9W B; 4LNO A; 3OLM D; 3QWZ B; 1IGD A; 3R3M A; 4HPM B; 2WXP A; 1GC7 A; 1UZX B; 1I4G A; 2AYO B; 2NBV B; 1WF9 A; 4G3X B; 1TS4 A; 4ACF A; 1JCK B; 3MFG A; 2I2Y A; 1PGA A; 3KWL A; 2ASQ A; 3DBS A; 3N1Y C; 1NVI D; 3ETR A; 3EFU A; 4MDK E; 4M00 A; 2AX5 A; 1EO6 A; 1MG4 A; 4P1B C; 2INP E; 2NPT B; 2RDH A; 4DXG A; 1PGB A; 2L3Z A; 4JX1 C; 4GMV A; 4WAA A; 4DHJ D; 3TL5 A; 2XNA C; 3I63 C; 4IKG A; 4B0M A; 3KH0 A; 4NJ6 A; 2K22 A; 1OEY J; 4KX6 B; 3Q3F A; 1QOG A; 3BYT B; 4GDL A; 4BFR A; 2XBB C; 3TUO A; 3KQ4 A; 3RNC C; 2QIL A; 1CZP A; 3DVG X; 1ZKH A; 2MA9 B; 2QDF A; 2PIA A; 1YIW A; 4C4V B; 4HLE A; 4LDT B; 4A3P A; 1V1O A; 1F77 A; 2CR5 A; 2GBJ A; 1SE3 A; 2KWU B; 4IG7 B; 1XLQ A; 3Q8A A; 2WXQ A; 2MJD A; 2ZCC A; 2IO1 B; 4NJ7 A; 2AQ2 B; 4MGI E; 5DPW A; 3RNE C; 2R2O A; 1IGC A; 2J53 A; 3LJ3 A; 2MP2 A; 3BY4 B; 2KN4 A; 3DQV A; 1VDV A; 4ARC A; 2KWD A; 3PRM B; 4NAM A; 2SAK A; 4N6E B; 1V9J A; 1WXV A; 3SFE B; 4MEM A; 4K3C A; 2XK5 A; 1UH6 A; 3AU4 A; 2WLB A; 2KWC A; 1ZOY B; 5FK9 C; 3CF6 E; 5AZF A; 3UQB A; 1ZDX A; 3RMK C; 2FID A; 2KDM A; 5BMI A; 3EC8 A; 1FIQ A; 1JWU D; 1IYF A; 1I4Q A; 3IFW B; 1P1A A; 1YN3 A; 2WXJ A; 2KFJ A; 3SFD B; 1XLP A; 2WXH A; 1C4C A; 4BKS D; 4GN1 A; 3VTW A; 2GBM A; 4FHK A; 4DDI D; 1MJD A; 1C3T A; 1T3Q A; 3AEE B; 4OVV A; 3QAR A; 3SDL C; 1WR6 E; 1BML C; 2D5G A; 4KDL B; 4MH0 E; 1V8C A; 1WWT A; 4ZRP A; 2C7M B; 2KC2 A; 3BK2 A; 1NEK B; 2FUG 1; 3A4R A; 1UWX A; 3U7Z A; 2JRH A; 1JML A; 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1TY0 A; 2AL6 A; 2CJO A; 3MC9 A; 2M0X A; 4KZ0 A; 3AV8 A; 3R2T A; 1FCL A; 3HM3 A; 1JWS D; 3N9Y C; 3PLV A; 4OZA A; 5IP4 D; 2RR9 A; 3AM9 A; 3AUL A; 5HKH A; 2D3C A; 2DYB A; 1HZ5 A; 1NI2 A; 3TEX A; 5JH5 C; 4XGA B; 1UF0 A; 1C76 A; 4B9K A; 4N59 A; 3RPF C; 4HCP B; 2KXJ A; 3U52 E; 4JIO U; 2K6Q A; 1HEZ E; 4KSL C; 1VD2 A; 1SBB B; 2WDR B; 3ZGZ A; 2YEP F; 3MJW A; 5EE0 A; 3W1S C; 2GI9 A; 1JRO A; 2Y3A A; 4Q2J A; 3PRP B; 2Z8L A; 4REZ A; 2JZP A; 1XO3 A; 1AAR A; 3NZS A; 4G0N B; 4A3O A; 1I35 A; 2NPT A; 3ZXV A; 3ZRC A; 3WCQ A; 1WJ4 A; 4IWP A; 2MBO A; 4IM2 A; 2WGS A; 3A9K B; 1XLN A; 3VTU A; 4ITK A; 2EEL A; 4C80 A; 1ZP0 B; 2LHD A; 1HZ6 A; 2KO3 A; 2W3R A; 2YEP B; 2DX5 B; 3RCZ A; 3IVF A; 2C7H A; 2WXM A; 5D94 A; 3W2D A; 2G4S A; 2Z0E B; 3OJ3 A; 3ZLZ A; 1E6E B; 2WX1 A; 1JWA D; 2QSD A; 1SF0 A; 3O13 A; 4C4V A; 3L13 A; 1PYW D; 5FKA C; 3DWM A; 1NI3 A; 2L7R A; 1FM0 D; 2KD0 A; 3IT6 B; 2RPV A; 1UNS A; 3WAL A; 1WGD A; 1SE9 A; 2FBW B; 3ZNH B; 4EOY A; 2CU1 A; 1J0G A; 2IJ0 A; 2LFI A; 2HJ1 A; 4TQ1 A; 1TT5 B; 5L95 C; 2IBI B; 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