1L8TA

Crystal structure of 3',5"-aminoglycoside phosphotransferase type iiia adp kanamycin a complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
AKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Aminoglycoside 3'-Phosphotransferase
publication title Substrate promiscuity of an aminoglycoside antibiotic resistance enzyme via target mimicry.
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus faecalis
total genus 80
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.1.95: Kanamycin kinase.
pdb deposition date 2002-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1l8tA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 1l8tA02
4FK3A 4X7QA 1WBSA 4MH7A 4AZWA 2NNWB 4H39A 4JDIA 5KMMA 5AJQA 4ONAA 5TKDA 3D5VA 2YCRA 2BCJA 2QLQA 2HXQA 2W1DA 5FP6A 2C1BA 1Q8UA 3HMNA 3KXZA 3QWKA 3DK7A 4BDCA 2EXMA 3EQRA 5J95A 1BX6A 1PKDA 2C69A 1WBTA 4K8AA 3F61A 4P5ZA 3OXZA 4S34A 4S2ZA 4JX7A 5K5NA 4ZJJA 5IDPA 3D14A 4O0RA 4PL4A 4X2FA 5H2UA 2KULA 2YN8A 2VX1A 3WZKA 2RGPA 4CRSA 3LFQA 4WIHA 4EYMA 3UDBA 2OJIA 2GS6A 4ENXA 3RNIA 2PUPA 3TI1A 3N4VA 2W0JA 3LQ3A 1KOBA 1QL6A 1OKZA 2X8IA 3I5ZA 3MH2A 4JBVA 3GU5A 3W8QA 5HICA 3AT2A 3TJCA 5DE2A 2XK9A 3GCPA 1KV2A 2OK1A 4X3JA 5HESA 3HRBA 3R7YA 5IQGA 3LVPA 1GIHA 3KKVA 3PJCA 4M8TA 4C4FA 4F09A 3DK6A 3W2RA 2VTRA 4BDGA 4H36A 2C5YA 3NNXA 3VF8A 5L6OA 2XM8A 3WIGA 1IA9A 3DKCA 2R3FA 4FSQA 2C47A 1GZKA 2GU8A 2X7GA 5ANEA 2J5FA 3AMBA 2I0YA 3ZZWA 3R7EA 2VU3A 4J8NA 4EK5A 4DBXA 2OZAB 3W8LA 2B55A 4IX6A 3BIZA 5L2IA 1KV1A 3E8CA 3JYAA 4O0WA 3ORNA 3PA5A 3W1FA 5HE3A 3LFAA 2VTQA 1BL7A 5IH4A 1Y6AA 3D15A 4G3DA 4F6WA 2X6DA 4QMOA 4BCMA 3LAUA 4MKCA 3MIYA 1HCLA 1FBNA 2I6LA 2PVRA 3QRJA 4L42A 4E4MA 5DEYA 3D4QA 3G6HA 3BHHA 3HV4A 1GNGA 3W0PA 2OICA 3IW8A 2UVYA 3KXGA 3MVLA 3NUPA 1KE7A 4KAOA 4OTIA 3NVMB 4BTKA 3IPHA 4V05A 5GJFA 3SV0A 3P0MA 2OIDA 4FG9A 4F9CA 1Q3WA 5BUIA 3EKKA 4FV2A 3DJ5A 3OP5A 3A7JA 4Z55A 2OJGA 3ETAA 4IM2A 3AC3A 4AZEA 3QZGA 2X9EA 5EDRA 2OW3A 3GC8A 3O17A 4YTCA 3ZBXA 4IAAA 3C50A 4DF3A 2UZDA 3FHRA 3MS9A 4B7TA 4BBFA 5F95A 2ITWA 2E2BA 2CJMA 4LRKA 2J51A 3EQFA 3D9VA 2Z7RA 2W05A 4YZDA 2RFNA 1JKKA 4O82A 5IQIA 2WEIA 1XJDA 4FKGA 5E92A 4YMJA 4F7JA 3AT3A 1GZNA 2YABA 3UMXA 3W16A 4I6BA 5FGKA 2AYPA 4MWHA 3BZ3A 4OTDA 4XP2A 4GS6A 3BLQA 5L6PA 2JBPA 5E8XA 3AT4A 2PU8A 4PTCA 4QMQA 4O2ZA 4C4IA 4ZY5A 2GNIA 4W4VA 5E1SA 2YAKA 3BQCA 5EKOA 1H8FA 3QC9A 3LFBA 4A9TA 3OW4A 4GT4A 4CFNA 4N4SA 3VUHA 4FKUA 2WMXA 3Q04A 3ODYX 2PE1A 3K2LA 2C6LA 4IMYA 3MPMA 2GDOA 3KXMA 4X2JA 2YIWA 5A4TA 4XV3A 4I41A 3BCEA 4U45A 2R3GA 3MTFA 4X6QC 1R0EA 4FT5A 4YJUA 4ZIMA 4GKHA 4JX3A 4RIWB 4WUNA 4YHJA 3TTJA 3ULZA 3QZFA 5F1ZA 5KE0A 4H3BA 3DXNA 3GXLA 3NW7A 1ATPE 3JXWA 3RAHA 1GIJA 4K33A 4L00A 4Z9LA 5M08A 3R04A 5C03A 3PRIA 3Q4ZA 4PRJA 3UQFA 2XVDA 3PWDA 2C6KA 3NIZA 3QBNA 4AQCA 2WFYA 4O22A 3JR1A 4D5KA 3PY3A 4ANBA 4KWPA 2CKQA 4DH1A 4BDFA 5KCVA 2XBJA 3FAAA 5T6KA 4ZTQA 2BZJA 2WTWA 4D5HA 3G9NA 3R73A 1JSVA 3MDYA 3PPZA 4U0IA 4UXQA 1OZ1A 3S00A 4EZ7A 4UN0C 4YJSA 5AM6A 3S2PA 3PJ1A 3GP0A 3VS0A 3G51A 3O2MA 4CZUA 5EW8A 5CAUA 2QOKA 3O51A 4W4WA 2P4IA 1A48A 3COHA 3OCSA 2OKRA 4NFMA 4NYEA 2GNFA 1OL1A 3E64A 4O7YA 4KKHA 2XKFA 3G0FA 3VNTA 4BF2A 2QOIA 1URCA 1YI6A 2WTKC 1Q41A 3GOKA 3ZDIA 5EI2A 3TJDA 3OUNB 3TV7A 1FOTA 1KUTA 3D5XA 3PSBA 5GNKA 2ZM4A 1REJA 3TUBA 1P5EA 4FKSA 4U7ZA 5ANDA 4W4YA 4YTHA 4G5JA 4QP7A 3ACKA 3T9TA 4RRVA 3HLLA 4F0IA 2YWVA 3AC4A 3OY3A 1APME 2JD5A 4QTBA 5F4NA 3TG1A 3EFLA 2A0CX 2H34A 5HORA 4P7EA 3A7HA 5HVKA 3AC1A 4ASEA 5JKGA 5E8WA 4DFBA 2Y4IB 4Q5EA 5EYKA 3JVRA 4DC2A 4U5JA 4TW9A 3E5AA 3VUIA 1I09A 2RKUA 3LE6A 4FUXA 4FNXA 4RVKA 5HVJA 2XF0A 4FGRA 2W5AA 1YDTE 2A19B 3FI4A 1BUHA 5AAEA 4FSYA 5HTBA 4QTCA 4BDEA 2PMLX 3SRVB 3WE8A 1CKIA 4R78A 3NUYA 4CMOA 2YCQA 3FY2A 4R5SA 3R7VA 5IG1A 2XUUA 5DOSA 4LYNA 3DDPA 5LWNA 3F2AA 2HY81 1J1BA 3TT0A 3COMA 4YJTA 4U94A 2VO7A 3P08A 4OW8A 4WOVA 5H9BA 3HMOA 3V8TA 1PW2A 3H9RA 3JUHA 2R3QA 4BCIA 3WYXA 1YI3A 5JRSA 4DFLA 3UOLA 4PP7A 1M2QA 3DKFA 3NCGA 2HXLA 3BBTB 3FI2A 3FYKX 3ANRA 4AOIA 4E20A 2IZTA 1YXXA 3CC6A 2QG5A 5L6WL 3E92A 3UGCA 4QYGA 4TYEA 4AS0A 1H01A 4FTOA 1YOMA 2BDWA 2X81A 5I9WA 1AQ1A 3AD6A 4AGDA 4FT3A 3BELA 5FBOA 1ZYCA 2BZIB 3Q4TA 4LGHA 2HOGA 2W06A 2FVDA 3PVBA 2WQMA 1XH7A 3FMDA 4Y85A 4O7ZA 4F64A 4HYIA 4G6LA 4KINA 5BVNA 2E9NA 2ZMDA 3R9HA 3Q4UA 3ZLSA 5K5XA 4CZTA 5CVFA 2PL0A 4PTEA 3C51A 3D7TA 5FDPA 3LXNA 4M3QA 4GFOA 4GVAA 2LGCA 4OGRA 4TNDA 5G1XA 4O2PA 4DEBA 2C3LA 4AACA 4IDVA 3NMUF 2QLUA 5E8SA 1YDSE 2WTIA 4M14A 4PDOA 5BYZA 2XIZA 3G0EA 5L3AA 3NDMA 3VS5A 1XHAA 4JRNA 3OD6X 3QRKA 2PVNA 3LFSA 3KC3A 4YO6A 3MH0A 2GNJA 5E9EA 3NCZA 3O50A 4J7BA 4RJ8A 5A4EA 1JVPP 3LM5A 2ITOA 3E8NA 3HMIA 1BL6A 4BCPA 4DN5A 3EZRA 5DPVA 2WKMA 3DKGA 4LI5A 2XZSA 2QO2A 5HU9A 2XNEA 2CKOA 4IFGA 2IW8A 2QVSE 4CMTA 4HPUE 3V6SA 4MXZA 1YDRE 1IA8A 3FMNA 2QO9A 4BCJA 4BCOA 2WEVA 5HLNA 1R0PA 3ZH8A 3Q5IA 4KSPA 4ALVA 4R6VA 4EHGA 3C0GA 4AG8A 3QGYA 4QMTA 1Q8ZA 4L8MA 5EDQA 5C26A 3NUAA 2W99B 2Y4PA 3FXWA 3MESA 2JIUA 4IE9A 1KSWA 5C9CA 4IJPA 2J2IB 3R8PA 2ZV9A 5FTGA 4XOYA 3GU7A 5ACBC 2IZRA 3UTOA 4M0YA 2GNHA 3L9LA 3VBQA 1Y91A 3G15A 3QFVA 2FH9A 2C30A 3OWJA 5I9UA 1VYWA 3C5UA 4RMZA 4AT5A 2W1EA 4USEA 3SDJA 1CSNA 4X3FA 4PMPA 4KS7A 3A61A 5HG7A 3ZEPA 3ZRKA 4YSMA 3GCVA 4R3PA 2W4OA 4Q2AA 3POOA 3D5UA 4NUSA 3U87A 2PMOX 4IVBA 4E4LA 2WMQA 5J5SA 1MRYA 5DHJA 1V1KA 3NIEA 2OFVA 5JN2A 3NUNA 3NVKI 3NYNA 4AZVA 1OUKA 4ITIA 2XK8A 1ZZLA 2C6IA 4MAOA 4QP6A 4YZNA 5E8UA 3OBGA 4F63A 3LJ2A 4HVDA 3PIXA 2ITYA 5GJGA 3WF9A 4ZS4A 1BKXA 2XA4A 4MQ2A 4USDA 5F94A 3W2QA 4YHFA 4ITHA 5DT4A 4FZFB 4AN2A 1OITA 3CJFA 4I5HA 3U4WA 3O8UA 5T3QA 5IUGA 5M53A 1U5QA 2Q83A 1K3AA 3UOKA 3VO3A 3V5QA 4ZZNA 1PY5A 1YRPA 4FBXA 4D1ZA 3GC7A 4RA5A 2IPXA 4M12A 3D2KA 1PXKA 3QX4A 4KBKA 3IGOA 1XBAA 2R3HA 3V8SA 4FG8A 4DH8A 4JS8A 1OVEA 2C3JA 3NNWA 2DWBA 4U80A 3UNJA 2G2HA 4RZWA 1GAGA 3PJ8A 2VN9A 3O71A 5FEEA 3ZSHA 4XRJA 3E88A 4GIIA 2GS2A 5L2TA 2B54A 4DGNA 4ANQA 4G3EA 4ZY4A 2QOCA 4CG9A 2FA2A 3EQBA 4FTKA 3KGAA 4FTMA 1UU9A 2PZPA 4X2KA 4EOMA 4IH8A 4QTEA 3BYUA 5CANA 2XJ0A 4GK2A 5DNRA 2HW7A 3VN9A 1BMKA 1FPUA 3IOKA 3W33A 2ZVAA 3DBDA 3R2BA 4RJ7A 3ZRMA 4I23A 2V55A 4AGCA 2BRHA 4U79A 1B39A 2OJJA 5CVGA 5L2WA 2CHLA 2PVLA 1H00A 3HRFA 4EYJA 2O63A 3N4TA 4YZCA 5C4KA 2W1ZA 3E3PA 2PWLA 4NTSA 3I0QA 4NW5A 4PMSA 4CFWA 3Q9XA 4DFZE 5A46A 4DCAA 1HOWA 1M52A 4NK9A 4Q9SA 5CU6A 1TQPA 4NU1A 1H0VA 5H8GA 2PVHA 4CFFA 3ZONA 3WILA 1YKRA 3HV7A 5AV0A 3RHKA 4PP9A 3UPZA 2F4JA 4RX8A 3TACA 1NA7A 4YC3A 5D10A 3UP7A 5D7AA 4CRLA 3R8LA 4IQ6A 3I6UA 3TNQB 4AW1A 1PF8A 3QZIA 4ZMEA 4ZTLA 3RAKA 3LLTA 5LVPA 3R1SA 5EDPA 4XV9A 4F7NA 2R3OA 4RJ4A 4BB4A 4YPSA 5GHVA 5CAPA 4L44A 4ZK5A 4M67A 3ULIA 1IAHA 2ITUA 2FGIA 2WQOA 3ORLA 4FIHA 4IM0A 4LOQA 5AP3A 2X7OA 3RPSA 5FM2A 2W7XA 5HE2A 4I0TA 3R7OA 3SGCA 3I81A 2CKPA 4B9DA 5F9EA 1R3CA 4BCGA 5M09A 4YC6A 3VBVA 3NEWA 3W10A 4CMUA 5FEQA 3MPAA 3OWPA 2PE2A 3CY3A 1A06A 3U8WA 1YW2A 3D94A 2KTYA 1XKKA 4FSUA 1JAMA 2H8HA 4AA4A 3O8TA 3OOGA 1O6LA 4QMLA 4TWNA 3FEGA 3H0ZA 3DXQA 4RIOA 2VTHA 3MJ1A 2EXCX 4GU6A 4MWIA 1EH4A 3HV5A 5CX9A 5DRDA 2FSOX 3FLNC 2Y9QA 4IB3A 4C4GA 4H1MA 1SYKA 3MY5A 3QD3A 4L01A 2ZV7A 5EQPA 1Y8YA 5EM5A 4L6QA 3QA0A 2VWYA 3GC9A 4L46A 3BV3A 3C4FA 2X4FA 2R3MA 4W4XA 5TR6A 2OXXA 4FYNA 3TIZA 3EFKA 2XIYA 3JY9A 2W4KA 5I5ZA 5HX8A 3GI3A 1G8AA 4P5QA 5G6VA 3QRIA 3BYOA 5CU2A 4TRLA 3M1SA 1U46A 2XIRA 4I6HA 3CLYA 3QCSA 4FL3A 5TF9A 5HCZA 2O64A 4FL2A 2XCHA 3L8XA 2NPQA 2WELA 4YLLA 2ZM1A 4C7TA 5FBNC 4II5A 3MFRA 3HP5A 3DNDA 3GCUA 4OTFA 5K4IA 1ZMVA 2UV2A 4OBPA 4PV0A 4ZSAA 3AMYA 5KNJA 4J71A 5KO1A 4RJ6A 2PUUA 3NSZA 4FTJA 4GK3A 2BHEA 3NAXA 3VHKA 4HYUA 4BDHA 5IQEA 5CASA 4M15A 4FNWA 3RTPA 4B4LA 2WNTA 2UW7A 3R71A 2XIXA 3DV3A 4IWOA 2IW9A 3UG2A 3U54A 4G6NA 1REKA 4F9WA 5CAVA 2XNGA 2Z8CA 3LJ1A 4LGGA 4BDDA 2OWBA 4WZYA 3R1NA 4NL0A 3FKLA 5AUZA 4ZLZA 5CYIA 5HG5A 3ZOSA 4IX3A 4D4RA 2GCDA 3QQFA 4MQ1A 3WARA 4AGWA 4EQUA 3FSFA 2FSLX 3F3VA 1KE9A 2W4JA 3F6XA 3OZ6A 4IZ5A 3SOCA 5AV3A 4FSNA 3P5KA 1YXSA 2VWVA 3SVVA 1CM8A 2VWUA 4QP3A 3V04A 4C34A 2BFXA 3G9LX 2UZTA 5AV1A 3F2RA 2YIXA 4IWPA 3OXIA 5JFXA 4TT7A 3RCJA 5M4FA 4RC4A 4JR7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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