1LBFA

Crystal structure of indole-3-glycerol phosphate syntase (igps)with reduced 1-(o-caboxyphenylamino)-1-deoxyribulose 5-phosphate (rcdrp)
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
publication title The catalytic mechanism of indole-3-glycerol phosphate synthase: crystal structures of complexes of the enzyme from Sulfolobus solfataricus with substrate analogue, substrate, and product.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 93
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2002-04-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1lbfA00
1GVOA 4PA8A 3NPVA 3P61A 1CX9A 1EPXA 1H62A 4S2CA 3OVPA 3NQMA 1W5NA 1I8JA 2NWSA 1I2RA 1LTDA 1TYGA 1G4EA 2J88A 4HSOA 1UUOA 2TPSA 3C2RA 2F84A 3UPBA 3W71A 1GQNA 1H1YA 1UJPA 1OFEA 1X7FA 2HS8A 3LTYA 1TCDA 4UR8A 4UTWA 2RKXA 1LROA 4QQ3A 1O5XA 1LCOA 4RCXA 1T99A 3RU6A 3S8HA 4CQ8A 1YDOA 4O53A 4YXGA 5K3VA 2BWGA 5HWNA 2DORA 4O15A 4M6PA 5U4NA 5BMXA 1EP3A 4PEKA 4N4PA 1G4SA 4X22A 5I3IA 1OJXA 3USBA 5AYYA 4O13A 3UXDA 3S5NA 1C29A 5D2WA 2GJNA 3QEZA 1NF7A 1FDYA 3P5YA 3G18A 3EKLA 5F4WA 1XDLA 5K9XA 5CGQA 5BOOA 1H7NA 3DKJA 5DLCA 3LBCA 5L6UA 3SIZA 2H90A 3LI1A 4A3UA 1ZENA 3W1XA 5D05A 3SW6A 3MJYA 1YDNA 3EXTA 3ATZA 3PBWA 5EMUA 3O6YX 4MYXA 5EKYA 2OT0A 3W2NA 2CZEA 3W72A 2E5CA 2G97A 3EWWA 3LCHA 2YXGA 2P0OA 4H6KA 4GJ1A 4UMCA 4RK8A 4MVAA 4XBSA 2A7PA 1A5BA 3C3NA 3DFNA 3DZ1A 3O15A 4O8RA 5DCDA 3B8DA 1C8VA 2XN1A 4Y8FA 1IXOA 1DVJA 2I14A 1LOLA 1W1ZA 1FCUA 2W79A 4UUIA 3FKRA 2QCCA 2ZZ1A 1GVRA 1GVSA 5AC7A 1ICQA 1GEQA 4BK9A 2Y6ZA 1TPWA 2PRMA 3OHIA 2ZZ7A 2B7QA 2FDSA 2X16A 4H4IA 1TPFA 1OX5A 2J27A 2Y88A 4NJJA 3G1FA 4LW7A 2WO5A 1X6UA 1JCYA 1F7BA 1DKWA 3TC6A 1TQJA 3G3MA 4JS3A 3KX6A 3M5VA 3OEXA 3MO7A 3EWXA 4TMCA 5KMYA 1H1ZA 1UB3A 1FDJA 4O14A 4I7VA 4CCCA 1IXPA 3BW4A 1WQ5A 2OCZA 4UIOA 4WOZA 3HGOA 3NVTA 3DAQA 4UR7A 4IPJA 4P2VA 1C9DA 3IIXA 1H7XA 3LTSA 5FF0A 3W7GA 1KW1A 4WXZA 3C2FA 3SZ8A 1VHCA 3GDTA 1H51A 3S42A 3LHZA 3W86A 1ZJIA 3QH2A 5AHFA 1QR7A 1NSJA 4JTSA 3TXVA 2Y7FA 4JEQA 3N73A 5ABTA 3IRDA 5LGXA 1VQTA 4K7YA 2Y62A 3NA8A 5KZEA 3MP3A 5J5DA 2A2IA 4EWND 2A85A 3BARA 3IGSA 3S1XA 5D02A 3NM3A 1OK4A 5I3GA 1H7WA 3W75A 3PM6A 3BG9A 3RLVA 1OF8A 2YZRA 1WX0A 3LRMA 1QPNA 4FNSA 1JQVA 1TTQA 3W7DA 1X1ZA 4BI7A 4WY0A 2AGKA 4JTJA 4N9BA 2VFFA 1KFKA 4HKPA 3TQVA 2WKJA 4AHPA 5CPLA 2BTMA 4TU1A 4Q4KA 5EBUA 3S6DA 2QAFA 3S5OA 3W7LA 3W7JA 1YADA 1FWNA 3MI3A 1MZHA 1PE1A 1R2SA 5LZLA 3TFXA 3W2JA 1GT8A 3ANYA 3LCIA 3LBMA 2WNQA 3NL3A 1DV7A 1W3NA 2WNZA 2H8XA 4TR9A 3KVMA 1KLYA 3SGUA 3BK0A 5FEZA 3CEPA 2BLEA 5I3HA 3B0VC 4WY0B 3CM4A 3WJWA 1K8YA 4DBEA 2VFGA 5D09A 1XBXA 1KM1A 4MFEA 2E09A 2GUUA 4LTSA 3TSBA 1LRQA 3PULA 4JXCA 1ME8A 1Q6RA 2PRLA 1AMKA 4N6EA 1SO3A 2BSLA 3F4WA 1J5TA 3VFLA 3KRUA 3BG5A 3E12A 5K2ZA 1K8ZA 1X8FA 3TV8A 1XL9A 1KV8A 1ICSA 4WUIA 2YDAA 1GG1A 3GX9A 3DHDA 1BKSA 2VFDA 3WK2A 4GUJA 2CZDA 3EWBX 3ZWTA 1GJPA 1TPDA 4DF1A 4NNAA 5G4EA 1TPUA 4DPPA 1RQHA 4NU7A 5CPMA 1LOQA 2JKAA 2ZA2A 3RNDA 3LHWA 3UQNA 1AK5A 1N55A 5D32A 4KWVA 1I2PA 3NEVA 3LV5A 1RD5A 4XBKA 4JTUA 3P80A 1FQ0A 3WK1A 2ZRYA 3T78A 1Q45A 3MP5A 3GDMA 1JR1A 4GUIA 4N2YA 2WSRA 3H55A 1UASA 3T40A 3WJZA 2GQ9A 1OYAA 4YCPA 4CLMA 1ZFJA 2QKFA 5BNKA 3W84A 3EX1A 1MSSA 2KZHA 4ZQPA 1PCKA 4OE7A 3CLMA 1AG1O 1VCVA 5CSRA 5BW6A 5DXYA 3QQ0A 3LCFA 3MBFA 3DFPA 4O4VA 5EY5A 2OT1A 5AN7A 1OK6A 3W7PA 3UWVA 2CLIA 1F6KA 2V82A 1XKYA 2VEIA 1ZY9A 1OFPA 2Y7DA 3BVJA 1NF0A 4BWLA 1MEWA 5F2GA 4KFOA 2CLHA 2VELA 4R53A 3NR0A 3W1TA 4JNMA 3TCEA 3C8FA 3P7YA 2C0AA 3MHGA 4JYEA 4Z0SA 3LB0A 4ZMGA 3HG2A 3TNOA 5AYZA 3A9IA 4UMAA 4BWLC 2GVGA 2NV2A 3TQ0A 1O95A 3IV3A 3MMTA 5AHMA 3PUOA 3STFA 3UD6A 4AWTA 5BRBA 3HMJG 2Y7EA 1QOPA 3W3OA 5LHEA 1KV5A 1G7UA 4HPJA 5C5YA 1QO5A 2A0NA 1EUAA 3DFQA 3CWOX 2G96A 3TR2A 1F05A 3CIWA 4IUOA 3NQCA 3MW7A 2EKCA 1ICPA 4M6VA 3LI0A 4A21A 1DQXA 2ATSA 4OV4A 4JYFA 3TIMA 3PUDA 4O50A 3QRHA 1WOBA 3W74A 3LDVA 2Z6JA 4DQWA 5HJLA 4IJBA 3FOKA 3CEUA 3TC7A 3MHUA 3G3DA 3FYPA 2Z0IA 3M7WA 3RK8A 4EVZA 3YPIA 3W7IA 1SPQA 8TIMA 2FIQA 5H91A 1RR2A 1E51A 3PAJA 4O1BA 3IIZA 4XTDA 3IVUA 4FF7A 4M6QA 1GYLA 3C61A 4RXFA 2Z6IA 1HO4A 2FTPA 2WPBA 1O5KA 3MWAA 3HGSA 2HS6A 4B5NA 2Q8LA 4S1FA 3NXFA 4KFNA 4PL2A 3GDLA 1SQ7A 4N6FA 1QPOA 1VHNA 4UTMA 3N9SA 1GZGA 5E1QA 3TUUA 1Q6QA 4MY9A 1LOSA 3K30A 5AOUA 5FF3A 1LBLA 1FCBA 2H8ZA 4RZ6A 1IGSA 4UTUA 3TAOA 3BO9A 5CG7A 3T4CA 3TW6A 4D2JA 4ADTA 3AO0A 1TQXA 3QPYA 3PWAA 2Y7GA 3W76A 1FWTA 4RKAA 1SFLA 5FF2A 3IIOA 4XZ9A 3UY8A 5LSMA 3S5YA 3BG3A 4FHAA 4UTLA 3LLDA 4FEZA 5F1UA 1O60A 2A5HA 3HG5A 5DY3A 5F2MA 3EWZA 6TIMA 2G5WA 4NJIA 2Q3RA 4JICA 3BGJA 3HGJA 3W1RA 4NX5A 1O4UA 3OVRA 3QF0A 3KFTA 4JX6A 4MPQA 3A5VA 3GVGA 3EXRA 1NFBA 4Y6GA 2J9ZA 3LERA 1WDWA 5AYXA 3NM1A 5LNUA 2ABAA 4O1DA 1U83A 1DORA 1KFLA 2Q8ZA 1LLWA 3G1HA 3HOJA 1A50A 3FJ6A 2NX9A 3H53A 1SO5A 3O8AA 2V81A 1W5PA 1B4KA 1VRDA 1TTPA 2RH9A 2ZA1A 3TE9A 5CSSA 3MI6A 3MUXA 4ZQNA 2C6QA 1H50A 2CLKA 4N9CA 1K7EA 4IX0A 1TRDA 1EX5A 1G69A 1W8SA 1A53A 3N9RA 2GVLA 4WX2A 4E2BA 3EXSA 4CQAA 3U2OA 4NNCA 3IGUA 4O1AA 1G6CA 5G5IA 4ICNA 1TPC1 4MY1A 1SZGA 5HINA 3LXAA 3DH7A 4O52A 1XUUA 1XI3A 4GUHA 2ZBTA 4XUGA 5FEPA 3NQ2A 2ZZ3A 2X1RA 3E96A 3WJSA 4Y96A 1EA0A 4QNEA 4GXMA 4O16A 2QCHA 4AH7A 3O63A 4LUIA 3LCGA 1M7OA 3NAVA 4M5PA 4QJ1A 4FX6M 2R8WA 4HNVA 1G4TA 1W54A 1JUEA 4AWSA 3N3MA 1W5MA 3ZWSA 1QFEA 3NPXA 4FNQA 4KWWA 4XQ6A 4LY8A 3BLEA 3QMSA 1QWGA 2WV8A 4HNUA 5F2IA 2H3DA 4WJEA 3WJYA 2I1OA 1YTDA 3KRSA 2B7NA 1EWDA 3GR7A 4NNBA 1EIXA 4GBUA 3EEGA 4MZYA 4UTWC 4Z1AA 1FY6A 4ZZ9A 4IWWA 3U6WA 3W23A 3JS3A 1VYPX 5D37A 4ZL1A 1GYNA 4LU0A 2YPIA 3PB2A 1KFEA 5CZSA 3I65A 3DFOA 3DKLA 3CPRA 4JTFA 4Z1CA 4Z0JA 1TRIA 4AHOA 2FPVA 3GR8A 2RDUA 3ZR4A 3MYPA 4K8EA 4MY8A 1TJRA 4CNOA 1YPFA 3RLUA 2YR1A 1ZALA 1FX6A 3C52A 4M19A 3UWWA 3HJZA 2A21A 3PSWA 3O05A 1G67A 3W7HA 1SSDA 3TMLA 4IOTA 4TX9A 4K8HA 1GPWA 2QJGA 4N4QA 4UC5A 5LGZA 4DF2A 3D0CA 3HPZA 3DENA 1YXCA 5CZTA 4OGZA 2WQPA 3KHJA 3EX3A 5D30A 1SO4A 3THQA 4OWGA 4JTEA 1K8XA 5DN1A 5EYWA 3C56A 4HNTA 2B7PA 3UPWA 3IVTA 3ELFA 3HB9A 3SGZA 1DOSA 3U8GA 1EEPA 2VFHA 4IX2A 3W1MA 3UYCA 3QPZA 4NT0A 1VCGA 3NYZA 3FA5A 1KM5A 1EP2A 1YTKA 3M1ZA 4K36A 4WD0A 4YLWA 2ZRXA 1TTJA 1NVMA 4ALDA 1K03A 2A4AA 2G95A 3VE9A 6ALDA 4YL2A 3NOEA 3CIXA 3EKZA 1MO0A 3NO5A 1HUVA 3G8EA 3W7EA 5A8GA 4MYAA 1XCFA 3MHFA 3NGJA 5LNSA 3UZ5A 5HNRA 4JTTA 5AC8A 1JQXA 2R94A 3S5ZA 1P4CA 1PV8A 2D73A 2X1TA 4JTKA 4I9AA 3HO8A 1B57A 1O94A 1P5BA 3VCRA 2YW4A 3G1SA 3W7MA 1PHQA 4QAIA 4HIBA 1VLIA 2R14A 3TMQA 3NPUA 4C1LA 4ORMA 4POCA 2TSYA 2P1FA 4LS1A 1G4PA 3LOTA 1SSGA 3W1LA 1CW2A 3LHTA 1TPEA 3QQ1A 1OHLA 2YSWA 2E6AA 4R34A 3HQ1A 3O1NA 4U28A 3P84A 4MOZA 3B4UA 3TU9A 3LGEA 3QW3A 4H3DA 3IVSA 1J2WA 1KM3A 4MIMA 3QW4B 2VFIA 4AXKA 4AMAA 2JGQA 5T26A 2IQTA 1W3TA 4TMBA 3Q58A 1L6YA 2E77A 4XTIA 2QCMA 5K4ZA 1AL8A 2ISVA 1OFRA 3LXCA 3M47A 4O11A 1KA9F 3PVFA 3E0IA 1ZNNA 4BI5A 4AF0A 4DBDA 4ORIA 2A6NA 1B4EA 2XFWA 3E02A 3GXPA 3B03A 1XDMA 5HMSA 4NVTA 4E0CA 1B9BA 3N34A 3UWZA 4MZ1A 4Z08A 2QCGA 2YYUA 1I45A 1A5SA 4P61A 1LBFA 1LYXA 2JBMA 3CQ0A 1Z44A 1AL7A 5H2ZA 4FX8A 3NG3A 1A5CA 1KM4A 3NQDA 3G1YA 2A7NA 1XUZA 4OV9A 4LVBA 2VKZG 4OHQA 5L9FA 2PC4A 2ZRVA 2XN2A 4IMDA 3A22A 2DZPA 3OA3A 4JX5A 3GNDA 3WK0A 1XFBA 4L4MA 1S5WA 5G1YA 2QCEA 3NL6A 1FWRA 1L6SA 1W31A 3V75A 2NXHA 4LWWA 4AF0B 3FS2A 3NPWA 3P8IA 3QSTA 3T55A 4OT7A 3W7QA 3FJLA 1L9WA 3CC1A 4OQVA 1ALDA 4Z1DA 1D9EA 2ZZ6A 3M9YA 1LRNA 4EF9A 2OZ0A 4CCDA 1ZCOA 2YCEA 4GC4A 4WQ6A 3VNDA 3PBUA 3NZRA 4WZHA 3GXNA 1TSIA 3DGRA 4FIRA 4QIUA 1A5AA 3TROA 5KITA 2NUYA 5FEXA 3W83A 4R7JA 1BWKA 2NX1A 1IXQA 4HN4A 2E6YA 1R30A 2Y89A 3EWUA 7TIMA 1LORA 3N19B 3AJXA 1JRCA 1S5TA 5D03A 1SZNA 1XBYA 2DU2A 2ZQ0A 3DI1A 3P62A 1EP1A 4O1CA 2GOUA 1TO3A 2CLLA 4UFHA 4JYDA 1FCQA 3L65A 2QF7A 4IMFA 3QYQA 3GK0A 4UMBA 3SFKA 1JCJA 1VH7A 4K38A 1FCVA 2E5BA 5HQEA 3M5YA 5TBOA 3G24A 3O06A 3T7VA 3M5XA 4E38A 1WBJA 1GTEA 1PHWA 1AW5A 4ZVJA 4AEOA 1SZEA 4X9SA 1GOXA 1OFOA 5CZ0A 3KRZA 1QMLA 2VEKA 2ZZ4A 4RV8A 3LV6A 1P0KA 5EA9A 4YCOA 3ABOA 4JD4A 4OU1A 1ONRA 1F2JA 1Q3NA 3CU2A 1XBZA 2ZFAA 1XC4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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