1LBL | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	247
structure length	247
Chain Sequence	PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	indole-3-glycerol phosphate synthase
publication title	The catalytic mechanism of indole-3-glycerol phosphate synthase: Crystal structures of complexes of the enzyme from Sulfolobus solfataricus with the substrate analogue, substrate, and product pubmed doi rcsb
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	96
structure length	247
sequence length	247
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2002-04-04

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1lblA00

3W1AA 3M5ZA 3TSDA 4UTTA 2UV8G 1H60A 3O07A 3UWVA 2TYSA 5I3JA 1A5CA 5IM51 3PBYA 4UUIA 1GVRA 4CQAA 2YW4A 3DHFA 2ZRZA 2TPSA 4UTWC 3W86A 2C15A 1SW7A 1NEYA 1TPFA 4MY8A 3G8EA 4DQWA 4NNAA 1WOAA 1EP2A 2CZ5A 4K37A 2NUXA 1PL9A 5KTLA 1T96A 1XUZA 3BVJA 2FPTA 4ZZ9A 1JQVA 3WK3A 3W72A 1W5PA 4HPJA 1LORA 2P0OA 2IQTA 2GUUA 4N6FA 4UR7A 3L5MA 2GOUA 3W73A 5LNRA 4NJKA 2RKXA 3W84A 4LOCA 1DL3A 3CPRA 4Z1CA 4Z0SA 5FEWA 1IXPA 3PSWA 3PS7A 2ZZ3A 2CLOA 4UTUA 1ZJIA 1GQNA 3NOEA 1W54A 2ABBA 2JKPA 4CCDA 3WFAA 3FYOA 2H6RA 5D2TA 4M5PA 3BLFA 3PC0A 1F05A 3HPSA 3HGSA 2VC6A 1KM2A 2AGKA 4IMGA 4HIBA 4QIUA 3S5ZA 3N73A 2G5WA 4UNKA 4FX8A 2CZDA 4O13A 1AL8A 5BRBA 3M5VA 4FXRA 5L6UA 5I3IA 1QPNA 3M43A 5H2ZA 4WQ6A 2GPTA 4O1DA 4HPXA 2E6FA 1CX9A 4G1KA 1R30A 5AHLA 1X1ZA 2ABAA 4OHQA 5EPDA 3CM4A 2QJGA 4DXVA 1TTIA 4ZVJA 3DBPA 2Q8ZA 3VI2A 4QSHA 5LGZA 3KRUA 4O18A 1TCDA 4NVTA 5EYWA 4J9JA 1ZAHA 4RR4A 1OK6A 3CC1A 1TV8A 5LNUA 1MEIA 5FF4A 3LRMA 2JKEA 2WV8A 1QWGA 3EWYA 3P81A 5CZ0A 2TSYA 3IGSA 3PWAA 1ZALA 1TPWA 2EAWA 4TIMA 2ZRXA 4M6VA 4Z08A 2R8WA 3CU2A 1ME9A 1TPEA 4K39A 1SU5A 1K3UA 2QDHA 5LNVA 2PC4A 4GUIA 4JDBA 1QO2A 1KM5A 2E77A 2ZDRA 4TMBA 1R2TA 1SZNA 1SUXA 3L66A 1D3HA 5D2YA 3W2LA 2QDGA 2VXNA 3W9ZA 1HG3A 1ICQA 1U5JA 4O50A 5DCBA 2DZSA 2P1FA 2NV1A 1RPXA 2A7RA 3GK0A 2C16A 4FNUA 1YDVA 5FESA 3BGGA 5LNSA 3LRKA 2RFGA 3LI1A 1N8FA 3TE9A 1TQJA 3LOTA 3TX9A 1K03A 1D9EA 4RZ5A 4JGDA 1I2NA 3TFXA 3W23A 3DFOA 4MFEA 1OG0A 5DY2A 3UWYA 1KBJA 2QCGA 1OX4B 2FDSA 2H3DA 4O15A 4AF0B 1FWSA 3W1UA 3M44A 1YTDA 3QJAA 1TIMA 1JCXA 3W7IA 5CPNA 2JK2A 1JQXA 3HO8A 2ZTJA 3S5YA 1SSGA 4O8RA 3M1ZA 4JN6A 2A4AA 2J24A 1I2PA 1FWNA 3WJYA 2B0MA 4GUHA 4BR1A 1BWLA 2YX0A 3EX1A 3HG4A 3UD6A 2EGZA 4O52A 4P61A 1NAL1 3LHTA 1VCVA 3CEUA 3KFTA 2VFFA 4PH6A 4IPJA 1EPXA 3RK8A 3IIZA 1OABA 1IXOA 3TJLA 3W70A 3ELFA 3PBUA 4ZQOA 4JYDA 5D03A 2ISVA 4N4PA 3N19B 1NF0A 3STFA 3RLVA 4I7WA 5AHMA 4ORMA 1Q6LA 4NUWA 1GPWA 1OF8A 3BLEA 3N2XA 5K4ZA 3PULA 4QISA 3R8RA 3W7CA 3NQMA 3W7HA 1U83A 3A24A 3QEZA 4NZJA 1C8VA 3USBA 1G67A 1VYSX 1FXPA 4BI6A 1V7YA 4HHPA 4QITA 5D33A 5L9FA 1W1ZA 2X16A 1K7EA 3QSTA 2ATMA 4JTEA 1AMKA 4O10A 2LLEA 3GDKA 3JS3A 4JR5A 2AAMA 1I2QA 3NM1A 5DY3A 3EKLA 4DBDA 3R13A 5EKYA 2RH9A 1VYPX 4WXZA 2QR6A 4XKYA 1XUUA 3DENA 4E2BA 4WXYA 1SQ7A 2FFCA 2QCEA 3EXSA 3LHUA 3NDOA 3OHIA 1F2JA 3W75A 1LLWA 1O95A 3FJ6A 4HKPA 3S9YA 2E5CA 1LP6A 4WJEA 4POCA 4WY0B 5AC6A 1SO6A 2NV2A 4UTIA 3CT7A 3BV4A 3O6YX 1M5WA 1WQ5A 5CSSA 4Y90A 2FTPA 4RCXA 3RFAA 5K9DA 1SO4A 3HIJA 5HNRA 1TO3A 3GDLA 3TV8A 4FX7A 4IXXA 1VR6A 3RMJA 1HL2A 3BW3A 3ATYA 1B3OA 3W7RA 1FWRA 3O16A 3C56A 2XN0A 3ABOA 4I7UA 5D37A 3LI0A 2ALDA 3HJZA 1Q45A 5AFDA 2WSQA 1SZFA 1GEQA 1JUKA 4AWUA 1KM3A 2DJXA 4JTTA 3ATZA 3G0XA 1TYGA 3NQAA 4KWWA 3KAOA 3NL2A 1VRDA 5DCEA 3HB9A 4MLJA 1BWKA 1G69A 2J9XA 3FFSA 1Q3NA 1FY6A 1KBIA 3O06A 3GKAA 1TSIA 3L0NA 2NLIA 3P74A 3G0UA 4PL1A 4PFMA 1KFLA 3SGUA 3W3OA 4MYXA 3W6YA 4JX5A 1GG1A 5D32A 2QUTA 1JR1A 1YXYA 2QUVA 3GB6A 4UR8A 3TH6A 4S1FA 4ALDA 1H5YA 1M6JA 5J5RA 1TPC1 4QM1A 3EWXA 1O94A 1FX6A 3EX4A 3GAKA 1AW2A 4XZ9A 1YDOA 3IGXA 2CLMA 3HQ1A 4JTUA 3NYZA 5E0KA 3TQ0A 4LY8A 4QNEA 5D05A 3W2JA 3P62A 2V2HA 3VKJA 1MSSA 4LVGA 1Q6QA 3A23A 2QCMA 4RJEA 3C8FA 3DGRA 2Y89A 1LZOA 3GDMA 3UYCA 2JKAA 5C6MA 1THFD 1OFPA 3HGOA 4HSOA 3QW4B 5LHFA 2ZBTA 4O1BA 3Q94A 2JGQA 3GXNA 3HGRA 2Y63A 3MP3A 3QC3A 5EBUA 4RXFA 1ICPA 1KM1A 4FNRA 3TC7A 1ZAIA 1X6UA 2X30A 3OEXA 4JY9A 2OCZA 3KHJA 4E0CA 5HWNA 4JTSA 5FF0A 2CW6A 2W0UA 1IXNA 4O14A 3LCXA 4A3UA 1KTNA 5DLCA 2X1RA 4UFMA 4LC8A 3QFEA 4LVBA 5K9XA 3FKRA 3S5OA 4Q32A 5J5DA 4HNNA 3GXTA 4BF9A 2DZXA 1RZMA 5LSMA 4FNPA 3BW2A 1XBVA 3N9SA 3GR7A 2WKJA 3A22A 3MYPA 3GLCA 1C9DA 3P80A 3HOJA 2WNNA 3LTPA 1XXXA 5HMSA 3M9YA 2CLIA 1RQHA 2YXGA 4GUFA 4LRTA 1KFEA 1WBHA 1G4TA 3E96A 2O7SA 4PC8A 2XN1A 4BK9A 6TIMA 1J2WA 4M7TA 3M7WA 2PRHA 4UTTC 1DKWA 2OMAA 5AHIA 3QM3A 1UBSA 3P7YA 1R46A 2NX1A 3FEMA 2Z1BA 5CPOA 1MEHA 1LM1A 2G96A 4K7YA 2NX9A 5U4NA 2V5LA 3SJ3A 4GBUA 2WO5A 1FDJA 3U8GA 1WXJA 3SZ8A 2Y7GA 3W7QA 4D2JA 2VENA 1QOPA 3EXRA 4AH7A 3KVKA 3I68A 2Y7DA 3H55A 1G7VA 4LVFA 1TQXA 3EX6A 1H7PA 4O53A 3R12A 2O7QA 5F4SA 1E51A 5I3GA 1KTCA 4C1LA 1F73A 3SECA 5C54A 3FYPA 3MI2A 3P67A 3O1NA 4N9CA 1WYIA 2YFOA 1LYXA 4UTKA 4AVFA 1M7PA 3A21A 4UTMA 3F1QA 3W1NA 4NXSA 2Y7FA 3VE7A 4M6QA 4IJBA 4ONVA 5CSRA 3W7MA 3EX3A 3GYEA 1GVSA 4O17A 1HO4A 1SZEA 4JY8A 5ABTA 3GDTA 3JRKA 3WJZA 4GWEA 4NJIA 3LERA 4RXGA 3SFKA 3P82A 4S2CA 2V8ZA 3FA5A 2RDUA 3NL5A 4GJ1A 1EP1A 4XBKA 2V81A 1EWDA 5D30A 2VFIA 2C18A 2V2CA 3KRZA 5KMYA 3L65A 4GUJA 5A5WA 2QEZA 4W9TA 1KLYA 3I7QA 1F6PA 4IMFA 3FKKA 3TXZA 5AC7A 3L68A 4FNSA 4BWLA 5KINA 2WJZA 4KFOA 4OT7A 5HR7A 3C2VA 2G97A 3NR0A 3NL3A 4I7VA 4MY9A 4ZL1A 4ICNA 4UTHA 4FHAA 3VNDA 3QMSA 3STGA 3HPZA 3PG8A 4MKNA 4LV9A 2E6AA 4MFDA 2CFFA 4H6KA 1ZFJA 1GYLA 5CZJA 3G3MA 3VCRA 1IIHA 1YLVA 1TV5A 4OU1A 1ZAJA 4K36A 2ZZ2A 3IVUA 1FDZA 1XDMA 1LBMA 4AHPA 4YLWA 3W7OA 5F4XA 3LGEA 5CZSA 3W88A 1OYBA 2C6QA 2OT0A 3MJYA 1IF2A 4AMAA 5KZMA 5G5IA 4JDYA 3PUOA 3LTYA 1SW0A 2A5HA 3B04A 4AXKA 5K4XA 1XBZA 3KXQA 4FB7A 4WZHA 3ZWSA 5MHBA 2ZYFA 1YTEA 5HJLA 2C1HA 3G1YA 4JTIA 1KFCA 2ZRVA 3LHYA 1RQBA 5BNKA 3C2OA 2VEMA 3C4UA 3L0GA 4A29A 4YCOA 2DJLA 2YYTA 5KITA 4O12A 1MZHA 5D02A 3M0ZA 3NZ1A 2Y62A 3RF9A 1TPB1 2VFHA 2R94A 4GRSA 1F74A 3UPWA 3O8AA 2BWGA 4IXHA 2F84A 4EVZA 4NJHA 1SZGA 2YW3A 4A2SA 5D2WA 1Z44A 1W3TA 2H90A 4LV4A 3BG9A 1XBYA 1Q6OA 1R2RA 4Y96A 4IOTA 1ALDA 3NQDA 4R7JA 3LV5A 3M5YA 3EB2A 4X9SA 3H54A 1IXQA 2VFGA 2B7PA 3PBWA 3SGZA 1QR7A 2W6RA 4DELA 2FJKA 4UTWA 3W7PA 4Z0JA 1H7NA 4GUGA 3T4CA 5KZDA 3W7KA 2QJHA 4BI7A 3LHWA 1DQWA 3CQ0A 3DXIA 3TCEA 3G1VA 4ZMGA 5DN1A 3PB2A 1WBJA 2X2GA 2YZRA 3STEA 3SIZA 3R2GA 1N55A 3LCLA 1JULA 4ZQPA 3MO7A 3BG5A 4FEZA 1JCLA 5FEXA 4O4WA 3BLIA 1BEUA 4JS3A 1F5ZA 2V0TA 3MHFA 4GC4A 4XQ6A 4Y9AA 4OQVA 1WX0A 3TXVA 4DEFA 4UC5A 3L2IA 4LUIA 4DPPA 1T8XA 3L21A 4MLRA 2NUWA 1VJIA 1W5NA 3LLDA 5CG7A 1F7BA 3NPWA 1JRBA 1PHQA 4BI5A 1TTJA 5FF2A 5D09A 4RX0A 1A5AA 3LCWA 5G2HA 1FWWA 3LHZA 2NWSA 3DFPA 3GVGA 1I2OA 1XCFA 4N9BA 3LM7A 5AB3A 5C2XA 3G22A 3G1FA 2DP3A 1P0KA 4OWGA 2BTMA 3WJXA 2H8XA 2DZPA 5K3VA 4M7SA 2A6LA 1PVNA 1TB3A 3UY7A 5I3KA 4GNJA 1XI3A 1N7KA 4UFLA 4EWND 2J6XA 3N9RA 3KX6A 4UIOA 1EEPA 3CIWA 2ZRWA 3I65A 4E38A 2CZFA 2Y61A 3OBKA 2I1OA 5AYYA 3DH7A 1KFKA 3ZS4A 2ZTKA 4MJZA 3W76A 2ZA3A 3CWOX 2DZUA 1FCBA 1W37A 1FBAA 4FNTA 1QAPA 3MW7A 1AW5A 2EKCA 4FNQA 1DJNA 3W87A 5CPMA 4HNTA 3L5LA 3QH2A 4L4LA 1W5OA 1LROA 1UCWA 3MI3A 1FCQA 3QMRA 4NNBA 4NQ1A 1AW1A 3LCFA 3PB0A 3S1UA 3V75A 2E09A 4JTGA 3IIVA 2VKZG 1JUBA 3E49A 1Y0EA 3S8HA 2CLLA 1R47A 3TA6A 3PY2A 2HSAA 2C3ZA 1GT8A 4A22A 5AYZA 3UNDA 3W7NA 2QAPA 2BZNA 1PE1A 5K7JA 1D3GA 4MUZA 2GVJA 4IX2A 4NZFA 4Z1BA 4OV9A 4N02A 1X1OA 4UXDA 2NXGA 4WOQA 4HNVA 3LTSA 1HFBA 4Y8FA 4ADUA 3A9IA 5BMWA 4K6AA 4XKYB 1UUMA 2ZFAA 3O6CA 1DJQA 4JX4A 2QAFA 3DI1A 4KKXA 4NJJA 5BOOA 2GJNA 3E12A 1PS9A 4E2DA 1GG0A 2FLIA 3GR8A 3LLFA 2I9EA 3QW3A 2ZZ7A 1TV7A 3HBLA 3BO9A 2TRSA 1DV7A 2WSRA 1WOBA 3W7DA 4MY1A 3P5ZA 1TJRA 1XM3A 2Q3OA 3LBCA 3KOFA 3MYOA 1OK4A 1G4EA 2VEIA 5HUPA 4MVAA 3WK1A 3EXTA 3P8IA 4YXGA 4XUGA 5G2WA 1BTMA 2C19A 3NO5A 1W5MA 5LNWA 2QF7A 3STCA 3NPXA 1IIGA 5F2GA 4CNOA 2YDAA 1O4UA 3M47A 4UTLA 2HTMA 3G0SA 3S6DA 4MZ8A 2QCDA 4HT3A 3SR7A 3TW6A 3DHDA 2Q8LA 2JGYA 4O19A 1YTKA 4S2BA 4N9DA 3HG5A 1GTEA 4JTLA 1TTQA 1EIXA 2GVGA 2GQ9A 3MP5A 1DHPA 3THQA 3RNDA 1KFBA 3B05A 1NSJA 3BK0A 3DKLA 3F4WA 5FF3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1LBLA

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