1LCKA

Sh3-sh2 domain fragment of human p56-lck tyrosine kinase complexed with the 10 residue synthetic phosphotyrosyl peptide tegqpyqpqpa
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
DNLVIALHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Complex (kinase/peptide)
molecule keywords P56==LCK== TYROSINE KINASE
publication title Structure of the regulatory domains of the Src-family tyrosine kinase Lck.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 35
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1994-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1lckA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1lckA02
1GL5A 2VWFA 4U17A 1W6XA 2RMOA 1WXUA 2BZ8A 5EC7A 1GCQC 4F17A 1NM7A 2FPFA 2SHPA 3ZNIA 2EGCA 5GJIA 2IUHA 5IHIA 2LNWA 1Y1UA 5I6VA 4LE9A 1OEBA 2YSXA 3OVEA 1YVLA 2RNAA 1O46A 1K0SA 2RQVA 1SHDA 2KT1A 2YU7A 2LZ6B 4J9EA 5DF6A 1W70A 1I3ZA 1GBRA 5DC9A 4HVWA 3FJ5A 2LQWA 2KR3A 1O42A 4HXJA 1BHHB 2RVFA 2EW3A 2QDLA 4J9HA 5L23A 3VS2A 4U1PA 2KRMA 1J3TA 1M27A 2LMJA 3EG2A 3VS1A 2GE9A 1LCJA 3H41A 1SKJA 1O43A 1UJYA 1W1FA 2JS0A 3PVQA 3IN7A 1BG1A 4RTTA 1KIKA 4E68A 1P13A 5FWBA 4DGPA 4CC2A 2M0YA 4EY0A 4QT7A 2CREA 2EO6A 2HEQA 2LCTA 5HKZA 2LJ1A 4RTZA 1ZUYA 1UHCA 3VRYA 2HMHA 2DF6A 1FU5A 2XP1A 1KSWA 2C0OA 4NWGA 1AEYA 3TSWA 1O4RA 1HCTB 2W0ZA 2MC1A 2QMSA 1KFZA 2EO3A 1SRLA 4OHHA 4RTWA 2YT6A 4H34A 5DC4A 4WCIA 4JJDA 1JYQA 1HD3A 1WYXA 2YUOA 2SEMA 1JU5A 4HVVA 4HVUA 3UATA 1ABOA 4JEGA 1CKBA 3H0FA 3SHWA 2IZVA 1KJWA 1WI7A 2GQIA 3BUXB 2O2OA 1X0NA 1O4FA 1RI9A 1ZX6A 2A37A 1X6GA 1WFWA 3NPFA 1UUSA 2KYMA 2DLYA 2RQTA 2OAWA 1R1SA 3EG0A 1UTIA 1ZBJA 5FWCA 2CI9A 3BUNB 3PJPA 2NUZA 1GBQA 4F59A 1LUIA 1O49A 2YUPA 3VRQA 2EL8A 1QLYA 2JM8A 1K1ZA 2NWMA 4OMQA 2EQIA 1RPYA 2IUIA 3CBLA 4AFUC 1AYAA 1QADA 3VRRA 2RQWA 1IJRA 1LUKA 1SRMA 1T0HA 2VVKA 4XZ1A 1BLJA 1I0CA 5AULA 1O41A 1M3CA 1HJDA 1UG1A 3OP0A 2YSQA 2K7AA 3M7FA 3MXYA 5D0JA 3EACA 1PRLC 3PLFB 3JV3A 1CJ1A 1OV3A 2DL5A 4L1BB 4FSSA 2H46E 1AD5A 2Y1NA 1Y0MA 2ECDA 4AG2C 1SHGA 4GLMA 4J9BA 1AOTF 1JXOA 4F16A 1NZVA 1K0XA 1PKTA 3UA7A 4RTUA 4DEYA 2EYVA 3NHNA 3CXLA 1SSHA 2O88A 1NYFA 3REAB 3N7YA 2DL3A 1B07A 3VS4A 1FBZA 1QWEA 1O4JA 3BUWB 1UDLA 3IMDA 1FYNA 4AG1C 2AOBA 1XA6A 2B3OA 2VIFA 2AKLA 3M0PA 2H5KA 4X1VA 5EEQA 2EGAA 3NMZC 1M3AA 2FRWA 2DYBA 4D8DA 5EG3B 4EIKA 2ECZA 3R6NA 1NZLA 1M61A 1YN8A 4GWFA 5IHNA 1NEGA 3RBBB 2ED0A 2EYXA 1O47A 2KT8A 1O4AA 3LH5A 1ABQA 2A08A 5GJWB 2CDTA 3OB1B 1CWEA 1GCPA 1I07A 1XOVA 2D8JA 4LUEA 1AWWA 1A0NB 5I22A 2CBLA 4X6SA 1AYDA 1YNZA 1YCSB 1OPKA 1PNJA 2LP5A 1LUNA 4F5BA 1U5SA 2X3WD 1AWOA 3CD3A 3THKA 3EG1A 2DE0X 2F2XA 2Y3AB 5IXFA 2EKHA 1SHBA 2P4RA 3IQLA 1H3HA 1X43A 2K79A 1H8KA 3UA6A 3GBQA 2KNOA 2ABLA 2KEAA 1BM2A 4J9FA 1BMBA 1PKSA 1VYTA 1A1BA 2RSYA 1GCQA 3N84A 2AZSA 1RLPC 2LJ0A 3T04A 1UGVA 3EHRA 1MUZA 5J3XA 3PQZA 2EYWA 3S8LA 2RQUA 3PFVA 3PE0A 1A1EA 3BKBA 2J6KA 1RJAA 5AXIA 2GTOA 2KNBB 4M4ZA 1G2BA 3KFVA 3VRZA 2XMFA 1Z9ZA 2FEIA 2DBKA 2W10A 4OMMA 2CH4W 2DVJA 2PNIA 2FO0A 2KXCA 4NWFA 2GSBA 4E6RA 1O4CA 2PNBA 4JZ4A 1KA7A 2CSQA 5IXBA 4GPLB 2PZ1A 3VGOA 1ZSGA 3PVLA 1YWOA 1GHUA 4A63B 2FRYA 5EELA 3H0HA 2JMCA 1X2QA 1BHHA 1OO4A 2DRMA 2E5KA 3VS0A 1YWPA 2K2MA 1PRMC 1BKMA 4AFQC 1G83A 2DM0A 4IIMA 2DCRA 2LCSA 1E6GA 3NGPA 2YUNA 1KC2A 1NYGA 2MQIA 1UURA 1IS0A 5I11A 2HUWA 4CC7A 4JZ3A 2LNHB 2D8HA 4LUDA 2ESWA 1JU5C 1OPLA 3SEMA 2ED1A 3S9KA 2EGEA 2F2WA 1WIEA 4TZIA 4HCKA 3UF4A 4JGHA 1E6HA 1IO6A 1RLQC 1Y57A 1RUWA 2K3BA 4QSYA 1K9AA 1FYRA 2C0IA 1AOJA 2IUGA 2JYQA 1AZGB 2MRJA 1Z3KA 1S1NA 1WX6A 3KFJA 1JYRA 3I5SA 4JPBW 4DGXA 1CSYA 5IHKA 2K7AB 4ESRA 3CWGA 2FG0A 3EGUA 1SEMA 4JJCA 1SHAA 2YDLA 2L3QA 3C0CA 1TUDA 3PS5A 3EG3A 1O4MA 1CSKA 3GXWA 4J9GA 2PNAA 3QWXX 2DRKA 4AFSC 1O4LA 2V1QA 2L4KA 1ZUKA 2DX1A 4P9VA 1K4US 4J9DA 1BBZA 2DM1A 4ZNXA 1O4BA 1VYVA 2BBUA 1VYUA 2EKXA 2DILA 4OHLA 3O5ZA 1ZUUA 4RTVA 1JXMA 4Z88A 1UE9A 2CT4A 1O4NA 2B86A 1O48A 2AUGA 2MRKA 1A08A 2L2PA 1FMKA 3OV1A 1NEBA 1I1JA 1EFNA 2A36A 2J06A 3N8MA 4D8KA 1AZEA 2FCIA 2AKKA 4K11A 1B3QA 1JO8A 1QKXA 2JT4A 4RUGA 1V1CA 1MILA 2GTJA 1OOTA 5KAZA 1M30A 1H9OA 2C0TA 3GXXA 2O31A 2EPDA 3VRPA 4EIHA 1FU6A 4CC4B 5GJVB 1D1ZA 1O45A 3GQIB 1ZLMA 1U06A 1O44A 2DMOA 2ETZA 4GL9E 1UFFA 4P9ZA 2DNUA 4R0KA 1A09A 1VA7A 2EVRA 3U23A 1UECA 3VS7A 5IH2A 4E93A 2GNCA 2HSPA 2PLDA 1K76A 1A81A 5ECAA 2K79B 5CDWA 3S8OA 4H1OA 1ARKA 3WA4A 1X2KA 2ROTA 2EYZA 1R1QA 1BU1A 3TVTA 1CKAA 3H0IA 5HCKA 1HSQA 1LCKA 3VS5A 1WQUA 1BKLA 5HKYA 2KBTA 1WXTA 1O4PA 4WWQA 4KRTA 4OHDA 1LKKA 2J6FA 2HCKA 1FHSA 2KROA 2G6FX 2LNXA 2CS0A 3A98A 3TKZA 4F5AA 3TL0A 2J7IA 1BLKA 5BO4A 1T3SA 1X69A 1QKWA 3REBB 4K44A 2DL4A 3RNJA 4K2RA 4AFZC 1PHTA 1O4QA 5DC0B 1PICA 3EAZA 2JTEA 4FBNA 2L3SA 1WDXA 4JE4A 1BFIA 1CSZA 2DLZA 1M27C 1BF5A 1O4OA 1D4WA 3ZL7C 2LQNA 2PLEA 4A4CA 2EYYA 1H92A 2MOXA 1O4IA 5HKWA 2K6DA 1AWXA 1A1CA 2LX7A 2JXBA 4FL2A 3I9QA 3M0UA 2CI8A 1QG1E 1QCFA 1AYCA 1SPRA 2ROLA 1AWJA 2IIMA 4IIOA 2DX0A 2GGRA 3VS6A 5EHRA 2DJQA 3M0RA 1JWOA 4Z89A 4A4BA 2RF0A 4RTXA 2H8HA 1O4GA 2BTTA 1TUCA 3BUOB 5FW9A 2L0AA 3M0SA 4LNPA 3VRNA 4CC3A 2RORA 4OHEA 1AOUF 2HDAA 1NRVA 2KGTA 2JW4A 2CR4A 1WA7A 1T3LA 1LUMA 1O4HA 1M3BA 1SHFA 2SRCA 1FBVA 1BHFA 1NLOC 2KYBA 2HBWA 3ULRB 1ZFPE 2AOAA 3QWYA 4LN2A 4GBQA 3K2MA 1SPKA 2FPDA 4OMNA 3IN8A 1MW4A 2HDXA 2CUDA 2OJ2A 2L3TA 2C9WA 2FPEA 2JS2A 3I5RA 1AB2A 1O4DA 4OMPA 3PSJA 2EBPA 1RQQC 3C7IA 1BFJA 3VROA 2J05A 1N5ZA 2KRNA 2KRSA 3CQTA 1UJ0A 2ENMA 3M0TA 4OMLA 3UYOA 2JM9A 2L6KA 2OQ1A 1F1WA 2AZVA 2BZXA 1NG2A 1X27A 3S8NA 2PTKA 2Y1MA 3BUMB 2MCNA 3OB2B 2K9GA 1HCSB 2CSIA 1YVHA 2A28A 1KA6A 1M8MA 4J9CA 1R1PA 4JJBA 1JYUA 2RMXA 1X6CA 1AVZC 4OHIA 1T0JA 1O4KA 1UUEA 2CT3A 2EU0A 2YUQA 1TZEE 4OMOA 1A07A 3VS3A 2KK6A 2I0NA 1MV3A 2O9VA 1GRIA 1OO3A 4FL3A 1GFDA 4J9IA 2RPNA 2LJ3A 1BB9A 1D4TA 1LKLA 2M51A 2KXDA 2CH4A 5IBSA 2EOBA 3MXCA 1U3OA 2AK5A 2BZYA 2OI3A 4Z8AA 5IBMA 2MIOA 3HIZB 4ORZA 1MV0B 1TG0A 1Z9QA 2CRHA 1WXBA 2X3XD 1SPSA 1JEGA 3HCKA 3HHMB 5GJHA 3IMJA 1GFCA 1TCEA 1QWFA 2CUBA 2CIAA 2DL7A 3US4A 2OZOA 1B47A 2RQRA 1A1AA 3M0QA 2D0NA 2DA9A 3MAZA 2RN8A 4F14A 4Y92A 4XZ0A 1YP5A 1X6BA 3TSZA 2JMAA 2KE9A 1PWTA 1F2FA 2HDVA 2J6OA 3EHQA 1NLPC 1BK2A 1UHFA 1WLPB 2GBQA 1O4EA 2O9SA 2DLPA 2F2VA 4RTYA 2MK2A 2DBMA 2V1RA 1AYBA 4K45A 1JQQA 1E7OA 1CWDL 5EHPA 4ROJA 3PSKA 2VKNA 3I35A 4DEXA 2L3PA 2D1XA 2DL8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W6XA 2RMOA 1WXUA 4M77E 1NM7A 2DPPB 1IHWA 2DXCA 5GJIA 2OTLT 4FT2A 3RKYA 4MMLA 5KYUA 1K0SA 2RQVA 1SHDA 3OYNA 5DC9A 3VKIA 5AT1B 1OZ2A 2RVFA 2F1LA 5LJ3j 4U1PA 3S3NA 1LCJA 1OYXA 2EYQA 3H41A 2VC8A 3A1PA 3SDZA 1KIKA 4E68A 4DGPA 4CC2A 5GANj 2CREA 2XU8A 2CZ0B 2HEQA 4F04B 3HSBA 3HTRA 3OYDA 5HKZA 2LJ1A 1ZUYA 4JS5A 1WJSA 4J5YA 4KULA 1FU5A 2DJZA 1HCTB 4OP0A 2YT6A 3OBWA 1WYXA 2YUOA 3JCMW 1KD1C 2SEMA 1TTHB 1CKBA 3H0FA 2QEXQ 1BIBA 3E2UA 1ZX6A 1WFWA 2DD4A 4M78D 2OAWA 1JJ2P 1UTIA 1ZBJA 1JB0E 2EFIA 3BUNB 1YITA 1M90R 2YUPA 2E4HA 5GAN5 4VUBA 2IUIA 5D6YA 3CBLA 4ZN1A 2H3EB 5LJ5h 1LUKA 2VVKA 1O41A 2RJCA 3MCAB 2YXYA 3OP0A 1KC8R 2E6NA 1KQSP 1D0ZA 2H46E 3HFOA 2PVDB 2K5FA 2RK1A 3CCRT 3MO8A 3UWNA 4AG2C 4M78B 3CCEQ 3SD4A 4BI3A 2CYZB 1NYFA 3REAB 5GAMf 3N7YA 1OI1A 3IMDA 1QWEA 3BUWB 1U8RA 4PLLA 1Y96A 1C6VX 4AG1C 1Q86U 4LD6A 1NBEB 2YWWA 2QDYB 1C0MA 4D8DA 5I2SA 5LJ5d 1QVFS 4RG2A 3R6NA 3CMEQ 4A53A 1YN8A 4M77G 1VQ5T 4EMGA 4F7UE 2EYXA 5CKDA 3E19A 1O47A 2KT8A 2BIVA 2K3XA 1ABQA 5HKCA 2CDTA 3TREA 1CWEA 2JTMA 2CBLA 4C8QF 4FCYA 2QAZA 1PNJA 1G3SA 5GAOm 1X6OA 1ACMB 1N9RA 3THKA 2WSFE 3ASKA 2DE0X 3CCET 5CKFA 3KBGA 3HRTA 5CIUA 1H3HA 1M4ZA 3KXTA 1WPYA 2HBPA 1BMBA 2MYSA 4C8QB 4MZMA 3T04A 2P84A 3EHRA 4M7DF 1RADB 2EYWA 3VYHB 2DIGA 3CMET 3SFMA 3J80E 5GAOr 3A8MB 3QPHA 3VRZA 1Z9ZA 1Q86C 3MP1A 4LDWA 2FO0A 5D6WA 2GSBA 4J6YA 1O4CA 3AT1B 2CSQA 3VGOA 3QHSA 4A63B 9ATCB 2DXUA 1W2BP 1MMAA 3VUZA 4M7AE 4RG8A 1YJ9A 1BHHA 1OO4A 2K5LA 5L8RE 1Y7XA 3HHTB 1OQKA 2LX9A 1MNDA 3JB9I 3NGPA 3BDLA 2MQIA 1IS0A 3I55Q 4JZ3A 3LLRA 2D8HA 4LUDA 1JU5C 4QVCA 1ZSZC 2KY9A 4FT4A 2RD1A 4V2SA 1VQ9Q 2F2WA 1M5Q1 4R55A 2XDPA 2DAQA 3LW5E 3OA6A 1V76A 4FYVB 1JJ2S 1PC0A 3RKWA 1RLQC 4QSYA 1FYRA 2C0IA 1AZGB 2DFUA 4L5GA 3CC7Q 3I5SA 2Y4YA 2PUOB 4JPBW 4A4KA 5IHKA 2CP6A 2FG0A 2R58A 2LNVA 3PS5A 4GLKA 3X24B 1KQSS 3MEVA 4FW1A 1ZUKA 4RCBA 1NJIC 1LPLA 1VYVA 2NUTA 3OYFA 4JLGA 3OYHA 2EKXA 3I55T 2Y4XA 1PD0A 4RTVA 4KH0B 1UE9A 2DIQA 4F7UG 2B86A 1OZ3A 2AUGA 4C92D 1A08A 3OV1A 1NEBA 3G71Q 3V7CA 4ANJA 1VQ6T 3WVEB 2VXEA 4D8KA 1LJOA 2FCIA 3EGDA 1JO8A 2JT4A 3CC7T 1MILA 1OOTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GL5 A;  2VWF A;  4U17 A;  1W6X A;  2RMO A;  1WXU A;  2BZ8 A;  5EC7 A;  1GCQ C;  4F17 A;  1NM7 A;  2FPF A;  2SHP A;  3ZNI A;  2EGC A;  5GJI A;  2IUH A;  5IHI A;  2LNW A;  1Y1U A;  5I6V A;  4LE9 A;  1OEB A;  2YSX A;  3OVE A;  1YVL A;  2RNA A;  1O46 A;  1K0S A;  2RQV A;  1SHD A;  2KT1 A;  2YU7 A;  2LZ6 B;  4J9E A;  5DF6 A;  1W70 A;  1I3Z A;  1GBR A;  5DC9 A;  4HVW A;  3FJ5 A;  2LQW A;  2KR3 A;  1O42 A;  4HXJ A;  1BHH B;  2RVF A;  2EW3 A;  2QDL A;  4J9H A;  5L23 A;  3VS2 A;  4U1P A;  2KRM A;  1J3T A;  1M27 A;  2LMJ A;  3EG2 A;  3VS1 A;  2GE9 A;  1LCJ A;  3H41 A;  1SKJ A;  1O43 A;  1UJY A;  1W1F A;  2JS0 A;  3PVQ A;  3IN7 A;  1BG1 A;  4RTT A;  1KIK A;  4E68 A;  1P13 A;  5FWB A;  4DGP A;  4CC2 A;  2M0Y A;  4EY0 A;  4QT7 A;  2CRE A;  2EO6 A;  2HEQ A;  2LCT A;  5HKZ A;  2LJ1 A;  4RTZ A;  1ZUY A;  1UHC A;  3VRY A;  2HMH A;  2DF6 A;  1FU5 A;  2XP1 A;  1KSW A;  2C0O A;  4NWG A;  1AEY A;  3TSW A;  1O4R A;  1HCT B;  2W0Z A;  2MC1 A;  2QMS A;  1KFZ A;  2EO3 A;  1SRL A;  4OHH A;  4RTW A;  2YT6 A;  4H34 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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