1LF1 | Genus

Total Genus 109

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	109
sequence length	298
structure length	296
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGITVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKETVEAAIDLGIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWDNQIKPYAEEVIPVIRDNDPNNIVIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Cel5
publication title	A novel combination of two classic catalytic schemes. pubmed doi rcsb
source organism	Bacillus subtilis
total genus	109
structure length	296
sequence length	298
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2002-04-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1lf1A00

1W3LA 2D20A 4J28A 4GI8A 3AZRA 4GKLA 2X2YA 3FAWA 4J3SA 1UR9A 4A3YA 1WAWA 4DUWA 2QPUA 3RPMA 2D1ZA 1G94A 1ITXA 4RE4A 1MW1A 1MQPA 3CZJA 4PTVA 5GQBA 5AC4A 3ZT6A 5I5RA 2Z1KA 4HA3A 3KZSA 1QBBA 2ZX8A 4JHZA 1BAGA 4HZ8A 1E72M 1MW0A 1HJUA 3CGTA 3BLKA 1GQJA 1ISVA 1UHVA 4W8BA 5CLTA 3VM5A 2A3BA 2G3IA 2E8YA 4EK7A 2Q8XA 1QVBA 1VB9A 4WSJA 5IHRA 3VNZA 4CN6A 4CVWA 1IZJA 5HOSA 1HVXA 1BG4A 4AIOA 4AW7A 4TVCA 3MUAA 1BLIA 1VBRA 1F4AA 1UKSA 4CCEA 2VJXA 4Q22A 3OGSA 2WPGA 5E6YA 3EMZA 1C8QA 4J7RA 1UH4A 1V03A 1EDGA 3EDDA 2VVNA 3L2LA 1GJUA 4IPLA 5CLWA 4H7VA 4IPNB 1QI5A 1KWGA 4CVUA 2GK1A 1ZL1A 3VGDA 4C7FA 3NDYA 4J3TA 3RIKA 4JIEA 5EBAA 4GZIA 4X0VA 4ZE4A 2J7EA 5M3WA 3UG5A 4PTXA 3VDBA 3KEHA 1V0LA 4KH2A 3TONA 2BY1A 5FCZA 1V3JA 1K9FA 3A4XA 1KQYA 1EH9A 2QMKA 4DUXA 3AISA 2CBUA 1JG9A 1NOFA 3RILA 4L4OA 3TA9A 4MNMA 3THCA 3WBAA 1KQZA 1BGAA 1H49A 3OG2A 1RP9A 4L4PA 1B31A 2ZX6A 3VUPA 2VCCA 1BQCA 1E73M 1GUVA 5C71A 4IM4A 3CIVA 1J0YA 1HT6A 4GI6A 3W37A 2WMGA 4DWSA 3QHMA 4PBGA 1E4NA 2W92A 3CHEA 1EHAA 2OYMA 2WNWA 1M03A 1VEMA 1VRXA 1EHNA 4CGTA 5DFAA 2J4GA 4ZEPA 2WXDM 4WJXA 2CNCA 4OKDA 4CD7A 5CJ5A 1JFHA 4AMCA 4PTWA 2V5CA 4F8XA 2FH8A 4BA0A 4CD4A 2FGZA 2WYSA 3AS0A 3KL0A 2CHNA 5JUVA 2JF7A 2YLAA 3WUBA 4D72A 4CKQA 2BNJA 3II1A 3CHCA 5CGMA 2AOSA 2UWFA 2DSUA 3IAQA 2VZTA 3UG4A 1B1YA 4PTMA 1QNRA 2WHMA 4LYQA 1D7FA 4AZIA 4HOWA 1FP8A 1KCLA 3SCOA 2G41A 1WB0A 3BAJA 4CU8A 1MW3A 1CPUA 1NWTA 1BYBA 1OGGA 4M8UA 3GH7A 2VO5A 4JFWA 1V6UA 3MV11 4D6DA 1BTCA 3CZLA 2WZIA 3ECQA 2G4FA 1LL4A 2W91A 3VINA 2ZUNA 3CPUA 2YJQA 4W8LA 3POHA 4Z2IA 2GSJA 4WIWA 3BCFA 3MV01 3UEQA 3WDQA 1J0IA 2OYKA 1DHKA 3HU7A 6A3HA 1C90A 1MXDA 3AMCA 3KL5A 2J62A 1WDRA 3AICA 3HJEA 1W2PA 2V3GA 3A6OA 1PIFA 3VDHA 1XSJA 3DYPA 1LLOA 1BSIA 4CUCA 1E0XA 1LL7A 2AAAA 2ZUUA 3VX0A 3WF4A 4Z2LA 2WHJA 3AMKA 4N42A 2VR4A 5AYBA 3BAXA 2BXYA 1QHOA 3ARXA 3CUHA 4D1IA 1TVNA 1MVYA 2E40A 1V02A 4B3LA 4U2YA 1E6SM 3FAXA 3MUZ1 4UOJA 2W4XA 1U30A 4TUFA 4ACYA 4OIFA 2CERA 2OSWA 2QV4A 3W4RA 3WDHA 3VIPA 1Q6FA 2E3ZA 2J8FA 5HPOA 3T08A 2X0YA 2JEPA 3KWXA 3MUY1 3W29A 2W66A 1WZMA 4AIUA 4E8CA 3N11A 5A2CA 3NSXA 2W63A 3CTTA 1PIGA 1QPKA 1GNXA 1HJQA 1PZ3A 3B9AA 3VIIA 3UESA 2NT0A 1F4HA 3GH4A 5E6ZA 4HP5A 3L4XA 3VNYA 5E0CA 1V0NA 4QLJA 1KB3A 3EMQA 1KR0A 1HN1A 5ECUA 1V3KA 2XWDA 3VVGA 3B9DA 3BCDA 1DWIM 4UZSA 3OZPA 3VD3A 4W88A 4GIAA 2XVLA 3WQ5A 2HISA 3ZO9A 2OSYA 3WNPA 2VTFA 1WZKA 4J3UA 3A4AA 4PUEA 1NH6A 3GYCA 4PSRA 1QI3A 1EDQA 4JFSA 3W38A 1KBKA 3AFBA 3VILA 5KZ6A 3AZSA 2VURA 1Q6CA 1ITCA 3BSGA 4LGXA 4N0RA 3A47A 2D0HA 3L4WA 4RL3A 3WEOA 5AY7A 3WL1A 3WD4A 1DWAM 2WMIB 4AZ6A 2VL4A 1XCWA 1R86A 4JCLA 4XX6A 1JYNA 1ZBWA 1HJSA 1AQ0A 4QFUA 4W7VA 3VD4A 3TTOA 3WH5A 1KCKA 2VRKA 5A69A 1E71M 1UR2A 5TD4A 5HPCA 4U5KA 5DT5A 5CPSA 4OBRA 1FA2A 2J25A 2XM2A 5EFDA 1JZ6A 1QOXA 5GNYA 3WF2A 1JAEA 1GQLA 3BAIA 1DWJM 1CEOA 1NWUA 1I75A 2V5DA 2OWXA 3VIJA 1WCGA 1HJVA 2D23A 4LYRA 3A4WA 4AY1A 1G9HA 4HPGA 3RM8A 3WDPP 4NI3A 1OT1A 2OLHA 2X8RA 3OLIA 4UFMA 1QNSA 3VD9A 3U5UA 1TUXA 2XG9A 1G1YA 1JDCA 2NT1A 1ZBKA 3WUEA 3O2LA 4CCCA 2GFTA 1W1VA 1TZ7A 1CGVA 3RJYA 4HOZA 3VTRA 2WAGA 3FY1A 1WPCA 3AIBA 1CXIA 3GBEA 2J7FA 1WZLA 3WFZA 1V3HA 4HMEA 3CZGA 1C8YA 5D8ZA 2ZOXA 3SCWA 4V2XA 2VUYA 1VEOA 1UWTA 1E6PA 2WVVA 4B3KA 5LYRA 1UWUA 5I79A 2V38A 2WKGA 5E0FA 3RO8A 1KGUA 2BVTA 4ATWA 4PCTA 1GHRA 3ZJ7A 4JKLA 4PCSA 4YHGA 1B90A 2YA0A 1E4LA 3EMCA 4UOQA 1V3IA 4MDOA 3W26A 5ABFA 1ZB5A 2QLYA 2E9MA 3VMNA 1DTUA 2ZXDA 1EDTA 4WKFA 1UQZA 2V3DA 7TAAA 2Y5EA 1UWSA 1E6QM 1CXEA 1V0MA 1DWHM 1JYWA 3RMEA 4BQ5A 1KXVA 3AXHA 2BY0A 1EO5A 5A6BA 3FHAA 1J01A 1XC6A 4M1RA 4YN5A 5ABHA 4BS0A 5BYWA 3WN6A 2F2HA 3EDEA 3EBVA 3GXIA 4AD2A 5A6LA 1VJZA 3MS8A 4MPKA 1OBAA 3SUWA 1GOOA 3BGAA 5A95A 3VGEA 1CGXA 2ZUTA 2VX5A 3K8MA 3MMUA 2YIHA 4GXPA 1CXHA 1UD5A 3HMCA 1NP2A 4LYPA 3U7VA 4HA1A 1VBUA 1R85A 4J3WA 3VIMA 1BG9A 1ISZA 1W1YA 1E4MM 1JI2A 1CIUA 1ESWA 4BQ2A 4P8VA 1CGWA 4MJ4A 3GTNA 1MXGA 3MO4A 1JXJA 3OGVA 4FF5A 2WB5A 4JAWA 2DT2A 4TVUA 1Q6DA 1W9XA 5A8MA 4H8VA 4FMVA 4AD0A 4J27A 4MB1A 1EA9C 5KEZA 4D6FA 1BVNP 1X6NA 2EQDA 3GXMA 1FFQA 1JZ5A 3BAKA 3PZTA 2GVYA 1JD9A 3SCVA 3WH8A 4OBSA 3D5HA 2GJXB 2O9OA 1U33A 2X1IA 4MNLA 1QHPA 2DGAA 4U3CA 4P8UA 3VX1A 5A8PA 4FK9A 4D1JA 1N82A 3FNDA 1JZ7A 3BAYA 1OIMA 1WP6A 2ZX7A 4V27A 1OB0A 1LG1A 4W85A 1MFVA 1RP8A 2O92A 2YDSA 1W3JA 4UQAA 2ZXQA 1BYAA 1VENA 3KE0A 5CGTA 2WM0A 1K9TA 5CXPA 4LQ1A 4F79A 1CYGA 1HKIA 2C7FA 4R27A 3F5KA 4MB5A 3WQ8A 3NSNA 1W1TA 7A3HA 1GVIA 3IK2A 4K68A 4RE2A 2ZICA 2XIIA 2VT0A 4KGJA 2DSZA 2BY2A 3WBEA 5E09A 3AMLA 2DT1A 1TR1A 4HMCA 1JIBA 3CH9A 3L2MA 4F9JA 1PX3A 1JZ8A 3CUIA 1AMYA 5C70A 1CXFA 2DT0A 1WNOA 4NF7A 1FH8A 4MB4A 5IHSA 1QI0A 2DSWA 1HP5A 1O7AA 1H0GA 2W5FA 3F5LA 2XVGA 2VCAA 4AD3A 1PPIA 4U31A 3SCRA 2XYLA 5FOOA 2XJ7A 3VPLA 2CBVA 1TA3B 3WD2A 3AS2A 4D6JA 3W28A 1EIBA 1J0ZA 4OOUA 5E70A 3U5YA 1EOMA 2FGLA 5LA0A 2EEXA 5FKYA 1OD0A 3IANA 3VDCA 2WMHA 3BLPX 3POCA 3UR7A 1RPKA 2WMFA 1TG7A 1VFUA 2X05A 2XGIA 1B3XA 3QHNA 3AMGA 2VI0A 1E4IA 5A6SA 3WKZA 1KFWA 1V6YA 2VZVA 4UFJA 3I3DA 2ZUWA 1BPLB 3T0DA 2PC8A 1E1FA 4MNJA 1W9PA 1W9UA 1XH2A 3DC0A 1JF6A 4W7WA 1BGGA 1A47A 1QBAA 1Q6GA 2C8NA 1E5JA 2UY2A 4BZYA 2WLYA 3SCSA 6CGTA 3VIKA 4CN1A 2UY4A 4IUGA 3W6LA 1JZ4A 5A8NA 1PX4A 1V0KA 4HZ7A 1EQPA 4WK9A 1HJXA 3VKKA 1CGUA 1RH9A 3CBWA 2DH3A 3F5JA 5CSUA 4JKMA 1UA7A 4D6CA 4KWUA 3J7HA 2BXZA 1MWOA 2ZWZA 1H2JA 4AC1X 1V02E 1BHGA 2IXUA 1CENA 3APGA 2CETA 1OT2A 1R8LA 3T2QA 2J7DA 1NM9A 1B3VA 3AZTA 3VO0A 3MANA 1E15A 4H8UA 1E55A 3QOMA 4MDPA 4QLLA 4A3HA 2D2OA 3N13A 5GPRA 1PBGA 2J77A 3WDRA 3QHOA 3IAPA 5EMYA 3UETA 4F66A 2YA1A 1UWRA 2QHAA 2ZXAA 2FHCA 1GORA 1AQHA 5DEZA 2WC7A 4LXFA 3L4TA 1W3KA 2DIEA 4JCMA 4PRWA 1XH0A 2EPOA 5IFPA 2ZUSA 4FLSA 3ARVA 3WDIA 3WNNA 5LA1A 3U7BA 3WNLA 1AQMA 4DM1A 2J7BA 3LMYA 3CMGA 2VX4A 2ZIDA 3W27A 3MSDA 1XH1A 2YBTA 3AQUA 3ZQ9A 5C8BB 5JIPA 2X09A 2Y4SA 1LF1A 3PZMA 3BC9A 4TXEA 3O6AA 3KL3A 2ZXBA 4AZHA 5I24A 4GINA 4AZGA 3WQ4A 5D9OA 5HDRA 2BHYA 1XD0A 3FHQA 2YLLA 5CSYA 5A6JA 3NDZA 2OWWA 1R7OA 5FL0A 3K8KA 2D24A 2GDUA 1WDSA 3FW6A 1XSIA 1E9LA 4H2CA 1LQ0A 2DIJA 1VFMA 3PN8A 1UQYA 2EXOA 5CZKA 2J8GA 2PWEA 4B16A 2TAAA 2W61A 3MMDA 2WWCA 4ML4A 5JBFA 3WENA 1PEZA 4C7DA 2CBIA 3IJ8A 4GO8A 4W87A 1U2YA 3K46A 2IUZA 1Q6EA 2XTKA 4XZWA 1W2VA 1ZBVA 1OIFA 3WNMA 3ARSA 4PMVA 4PMNA 2MANA 1H09A 1OGBA 2FHFA 3GNOA 4AEEA 4U2ZA 1UKTA 5I0DA 2VRQA 3WQWA 3PZ9A 5I2UA 1XHGA 1WZAA 4KRTA 2XM1A 5BXTA 4KRUA 1GOIA 2JE8A 1GVYA 1C93A 1YQ2A 1K9EA 1UR1A 4QCFA 4U3AA 3VGGA 1I1XA 2CYGA 5BRPA 3M7SA 1HKMA 4HU8A 1BF2A 3K4DA 1GOKA 2XUCA 3T0BA 4CCDA 2E4TA 3L4ZA 3LPPA 3SUTA 4BQ4A 1E6ZA 3N04A 7CGTA 1J11A 1UKPA 4GPNA 1MW2A 4GQQA 1MQRA 1C92A 1WE5A 5M5DA 3AIUA 2Y8KA 1NWSA 1W3HA 2GDVA 3G6LA 1RD6A 2VZSA 1NARA 4GZJA 3SCPA 1ISYA 2VX6A 1JNDA 5A6AA 4TX8A 1KXHA 2CKSA 2BFGA 1UD3A 3WEMA 4GZEA 4CU7A 2VRJA 1O6IA 5FIPA 1SYTA 4ATLA 3WNOA 3NJ3A 5M17A 1E5NA 5AC5A 3CMJA 3WY1A 2G8ZA 2ZX9A 3TTSA 3ALGA 2J79A 2WVVB 4Z2JA 3QGVA 2FDMA 4JL1A 1J18A 2PBOA 2XFYA 3OLGA 4AZ5A 4HOXA 1EO7A 1GJWA 4PYSA 2UY3A 1SMAA 1E1EA 1UD4A 5ABFB 3ZSTA 2FHBA 3PZGA 4DWSD 1XRVA 1ODZA 1TFVA 2JEQA 5DMYA 1UZ1A 1JZ3A 4UFHA 1VJSA 3ARQA 3PHAA 1Q4NX 3GNPA 1GOQA 1S46A 1GOMA 1FP9A 3E1F1 4P7LA 2A3HA 1KXTA 1WKYA 2WZHA 4W93A 1C8XA 2CXGA 4AZCB 2PF0A 5IXEA 1C3FA 4EANA 3ARZA 5DO8A 3RM9A 5M03A 2O9PA 5DT7A 3BH4A 2E0PA 3ZOAA 3PBGA 1G0CA 3AI0A 1IT0A 5HNNA 4F9DA 3CUJA 3WF0A 4J3XA 1MQQA 3WH9A 2F8QA 1B3WA 2EPKX 2ZUVA 4Z2GA 3AHVA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1A3H A;  2J7C A;  4PMZ A;  2G3J A;  4JL2 A;  6TAA A;  4UQC A;  3OZO A;  3EDJ A;  3WUF A;  3PZV A;  3ARP A;  2XPK A;  3IJ7 A;  2BS9 A;  1M01 A;  4GQR A;  1JDD A;  2WMJ A;  3AYS A;  4Z2K A;  3BSH A;  1HNY A;  3GM8 A;  1VFF A;  2CKR A;  1G5A A;  2XHY A;  3N1A A;  5BCA A;  4B9Y A;  2WLZ A;  2A3A A;  1K6A A;  3QR3 A;  3AS1 A;  5HXM A;  1NP0 A;  1L8N A;  2VMF A;  5AYI A;  1WDP A;  1CLX A;  4W8A A;  4TVD A;  1J0K A;  4CN4 A;  2UY5 A;  3UG3 A;  1TVP A;  1NOW A;  3AJ7 A;  4D6E A;  3CZE A;  4PMR A;  1J12 A;  2ZE0 A;  3DEC A;  4UQB A;  1BYC A;  5D9P A;  9CGT A;  4Z2H A;  2WC3 A;  1D2K A;  1QNP A;  4UQE A;  3NIY A;  2F61 A;  3I3E A;  2OSX A;  4U5I A;  4YPJ A;  2PI6 A;  1TE1 A;  5FL1 A;  4W5U A;  1E6N A;  4TTU A;  2EPM X;  3ALF A;  1VFO A;  3TP4 A;  2DSK A;  1OD8 A;  1JDA A;  3M6D A;  2QMJ A;  4OJY A;  5A6M A;  1KXQ A;  1GPF A;  3ARO A;  1ZJA A;  4AXN A;  2WSP A;  1VEP A;  3WF3 A;  4JZ5 A;  5D4Y A;  3GDB A;  2BHZ A;  5JIW A;  4NRS A;  3AHX A;  3WIJ A;  5A2A A;  2WZE A;  3VIG A;  3OLE A;  3UER A;  1BYD A; 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 3SUV A;  4FLO A;  2E8Z A;  1SFS A;  5E9A A;  3SIM A;  1M7X A;  1XCX A;  2D3L A;  4E8D A;  3S6T A;  4MAV A;  5I23 A;  4M82 A;  3RDK A;  4ACZ B;  2PBG A;  2YL6 A;  4A4A A;  3PZI A;  1CXL A;  2JF6 A;  3CZ8 A;  1K9D A;  4AIE A;  3ZJ6 A;  3AIR A;  4PMU A;  3GXD A;  1YHT A;  3WFL A;  3DYO A;  1UOK A;  2WAN A;  2BVD A;  4M81 A;  2WMI A;  4JHO A;  3K4A A;  1XGZ A;  5ABG A;  3QOK A;  4BCE A;  4UFK A;  3OA5 A;  5I77 A;  1PX8 A;  3PZO A;  2BV9 A;  1HF6 A;  1DWG M;  3T0A A;  3WMB A;  3UR8 A;  2A3E A;  4LX4 A;  1UD6 A;  4AD4 A;  1PZ2 A;  4JFT A;  4GI9 A;  3OLD A;  4AD1 A;  2J7H A;  5BXS A;  3TOP A;  1HIZ A;  2ESC A;  1V3M A;  3T09 A;  1E56 A;  1UD2 A;  4AWE A;  3LPO A;  2CES A;  1EQC A;  2CCR A;  3OBA A;  4QDM A;  5EFF A;  1E3Z A;  5GNX A;  3N12 A;  3UCQ A;  3AIQ A;  3JUG A;  1HL8 A;  2XSB A;  3DYM A;  4XUY A;  4CD6 A;  2WCG A;  4AZC A;  4UZU A;  5CG0 A;  5F7U A;  3WEL A;  1LJY A;  4ZXL A;  4URI A;  2RGL A;  1CEC A;  1QNO A;  4IIS A;  1FH9 A;  2YL8 A;  4EE9 A;  1KGX A;  4UOZ A;  4HPH A;  2WC4 A;  3AHT A;  3ZM8 A;  1FFR A;  4PMQ A;  1B30 A;  2DEP A;  3WMC A;  3VDA A;  1CTN A;  1W1P A;  1KWK A;  2W67 A;  4UFL A;  1EXP A;  1ZU8 A;  3WD3 A;  2V3F A;  2EJ1 A;  1GHS A;  1ODU A;  3N18 A;  2YBU A;  1FHD A;  3F4V A;  1FHL A;  4PMD A;  3VGF A;  1UR4 A;  1LWJ A;  1EGZ A;  3AIV A;  1W91 A;  2YL5 A;  4D6H A;  4HU0 A;  4NZC A;  3VGB A;  3THD A;  3AHY A;  4WKH A;  5BRO A;  2HVM A;  2XFR A;  4WSK A;  1E0V A;  2X0H A;  3CLW A;  1Z32 X;  1V6W A;  4UNI A;  4CD8 A;  3N15 A;  4UFI A;  2C0H A;  1Y7V A;  2XIB A;  2XSA A;  2XFF A;  2WBK A;  5CPT A;  1E6R A;  1QHZ A;  3K1D A;  4OZO A;  4MJ2 A;  5A8O A;  4DWS C;  2YDR A;  4BF7 A;  4M80 A;  3AIE A;  2ZWY A;  1CNV A;  1E70 M;  2XVK A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1LF1A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations