The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
51
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Structures of human oxy- and deoxyhaemoglobin at different levels of humidity: variability in the T state.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
51
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1F63 A; 3UHK A; 3TM9 A; 3HYU B; 1YFF B; 2MYA A; 1O1P A; 1JEB A; 4YU4 B; 1VRF A; 1HBI A; 4FWX A; 3BOM A; 1CH1 A; 2AUP A; 1MNK A; 5CNE A; 1GZX B; 1C7B B; 1COH B; 1YGD B; 1MKO B; 1MZ0 A; 3D1K B; 1A3N B; 1N9F A; 1PBX B; 1O1N B; 2ZLW B; 1YEV A; 2D2N A; 1SDL B; 3MBA A; 1SPE A; 2ZFB B; 4O35 A; 1MWB A; 3LQD B; 3WFX A; 2GNV A; 3PT8 B; 3IA3 B; 1A9W A; 3UHH A; 3ZJO A; 1K1K A; 1LFZ B; 3UHW A; 1MOD A; 3KUN A; 1LJW A; 3CY5 B; 5CNF A; 3IXF A; 3MOU A; 1Q1F A; 1FN3 B; 4DC7 A; 1Y5J A; 4QAU A; 5MBN A; 1DXV A; 3ODQ B; 1AJH A; 5JDO E; 1DTM A; 2SPL A; 1GDI A; 2C0K A; 1C40 B; 5KKK A; 2MYB A; 5EQM A; 1QSH B; 1J7Y A; 2AUO A; 5CND A; 1YEU A; 2H8D B; 1MLR A; 3ARK A; 3P5Q B; 1HDS B; 1HHO B; 4O4T A; 3AQ5 A; 3QMA A; 3WCU C; 3HC9 A; 1RVW B; 3ZJQ A; 3EOK B; 1MNH A; 1XYE A; 5IKS A; 4MBN A; 1X9F A; 5JGG A; 1YCB A; 1BZ0 B; 1Y2Z A; 4NI0 B; 4MXK A; 4X0L B; 112M A; 2WTG A; 1NQP B; 3HYU A; 1IBE A; 1QXD B; 4YU4 A; 2R4Y A; 2FRK X; 1MLN A; 1FHJ B; 1Y8H B; 1SHR A; 1O1I B; 2D2N D; 1OJ6 A; 1DUK A; 1IT3 A; 1MLM A; 4WJG A; 3UHI A; 1Y7C A; 5EUI A; 1XZ5 A; 2MYD A; 5CN7 A; 2G0V A; 1J41 B; 1G0A B; 3UGZ A; 3UBV A; 1VXC A; 1DKE A; 3D1K A; 1YG5 A; 1Y0A B; 3NG6 B; 3WCP A; 1PBX A; 3QJC A; 1HBS B; 1MYM A; 2AV3 A; 1DWT A; 1VXA A; 4KJT A; 4HHB A; 1SDL A; 1U7S A; 104M A; 1ABY B; 2HBG A; 4F4O B; 2LH3 A; 1YH9 B; 1QXE B; 2ZS0 A; 4PQ6 A; 1M6M A; 2QSS A; 4M4A B; 2ZWJ A; 1LFL B; 3ZHW A; 1GBV B; 2HBE A; 3WCW C; 1WVP A; 5C6E A; 1BBB A; 1MLK A; 2YRS A; 3CY5 A; 3VAU A; 2VLX A; 3AT6 A; 1FN3 A; 2D5Z A; 1UVY A; 1MLL A; 1Y4V B; 2OHA A; 1IWH B; 1SDK A; 1ABW B; 3ZH0 A; 2RAO B; 1THB A; 3G46 A; 4F6G A; 4F68 A; 2ZLV A; 1DWR A; 1XZU A; 2V1G A; 4NK1 A; 1X9F D; 4NS2 A; 1QSH A; 3OZW A; 1O1L A; 1YGF A; 1G08 A; 5HY8 B; 1OR4 A; 5CHR A; 2MYC A; 3ARJ A; 1QPW B; 5JOM A; 1TES A; 1LFY A; 1AJ9 A; 1I3D A; 3GQG B; 3D1A B; 1G09 A; 3HHB A; 4H0B A; 1MBI A; 1YHE A; 1RQ4 B; 1MLU A; 1JWN A; 3EOK A; 107M A; 1XXT A; 1Y22 A; 4IT8 A; 3ZJH A; 1BZ0 A; 3QM6 A; 1LUE A; 3WFW A; 1T1N B; 5F2A A; 1S5X A; 4MQI B; 1QXD A; 2LH6 A; 2OH8 A; 4TWV A; 1EWA A; 5JDO C; 2G0R A; 3MKB A; 4F6I A; 2ZLU A; 1Y7Z B; 2MGM A; 1LH5 A; 3MJU B; 2H35 A; 2OH9 A; 2ZS0 D; 5CN9 A; 1MLF A; 5E6E A; 2DC3 A; 4MBA A; 1CLS A; 1J7W B; 3HEN A; 1ECN A; 1J7S A; 3LB1 A; 2SPO A; 3MVC A; 3NG6 A; 1YHU B; 1HBS A; 1LHS A; 1KD2 A; 4MQC B; 1LA6 A; 1MBD A; 4XS0 B; 1A0U B; 1F65 A; 1HLM A; 1FLP A; 3IC0 B; 4B3W A; 4M4A A; 5HU6 A; 3S66 A; 1LFL A; 1XZ2 B; 3ZOL A; 1CO9 A; 1O1J B; 4MQG B; 2OHB A; 1BUW A; 4WJG 1; 1URV A; 5KER A; 3A5A A; 3OO4 B; 4KN3 A; 1FDH G; 1HGB A; 1LH2 A; 5CNC A; 1YE2 A; 1LFT A; 4AVE A; 1XZ7 B; 3OGB A; 3V2Z A; 4F6D A; 1HBA B; 5ILM A; 2ZSQ A; 3FS4 A; 2ZSO A; 3W4U B; 3G4U A; 3A0G B; 5CNG A; 2HBD A; 1DO7 A; 4ROM B; 2D2M C; 3UHB A; 3MYN A; 3A59 A; 1LH7 A; 2LH7 A; 1GCV A; 3SZK A; 3G4R A; 5AZQ A; 1JL6 A; 4N7P A; 1V5H A; 5HY8 A; 1Y0W B; 4ODC A; 3PI9 B; 1BZZ A; 1RTX A; 2HCO B; 1Y7D B; 6HBW A; 1QPW A; 5HLU A; 2MGH A; 3HF4 B; 2D6C A; 4H2L B; 1BVD A; 1HDB A; 3WCU A; 3WCV B; 2ZSY A; 5EOH A; 4H07 A; 3OO5 A; 1NZ3 A; 1V75 A; 5B85 A; 4WCH D; 1N9X A; 1GCW B; 1BVC A; 3ZJL A; 2FRF A; 1CH3 A; 2NX0 A; 1R1Y A; 1HDA B; 2DN3 A; 1LFQ A; 1Y09 A; 1Y85 A; 1YDZ A; 1QSI A; 3HRW B; 1J3F A; 1Y4P B; 4ROL B; 3UHZ A; 1YIH B; 4MQI A; 1G9V A; 3BJ2 B; 1HGA B; 1YMA A; 2AUR A; 3ZJR A; 1YVQ B; 4F6F A; 1GLI B; 1XZV B; 3UHY A; 2EB9 A; 1MLS A; 2Z6N B; 1HV4 B; 4MQJ B; 2EVP A; 4PQB A; 5ILR A; 3PEL B; 1KR7 A; 1Y4F B; 3UHQ A; 4ZVB A; 2XYK A; 4N7O B; 3GKT A; 1R1X B; 1BZ1 B; 1MLH A; 1NS6 B; 1Y01 B; 3GQR A; 1RPS B; 1A0U A; 1JP6 A; 3QM5 A; 3PI3 A; 2QSP B; 1JZL A; 1URY A; 1NXF A; 4NXA A; 1O1J A; 1Y5F B; 2W31 A; 1SI4 A; 4FC3 A; 1MLQ A; 1O1O B; 3WCW A; 3ARL A; 1Y4Q B; 2HZ3 A; 3BJ1 B; 1VRE A; 3E5I A; 2ZSX A; 5MBA A; 3QJB A; 3ONZ B; 2DXM A; 3GLN A; 2BNL A; 1MOC A; 1IRD B; 5ILE A; 3R5I B; 1Y4G A; 3QZZ A; 2PEG B; 1FSL A; 2R1H B; 3AQ7 A; 3WCU D; 3PT7 B; 1O16 A; 1VWT B; 2GL3 A; 3LB2 A; 2O5O X; 3AQ6 A; 2SPM A; 2HHB B; 1Y0W A; 2ZT1 A; 3PI9 A; 3GKV B; 3UH3 A; 3S48 C; 2HBC A; 2DHB A; 1A00 A; 2LH1 A; 1J40 A; 1JY7 B; 5JDO F; 2OLP A; 1CH2 A; 3UHS A; 1B86 B; 1NZ5 A; 2WY4 A; 2DN2 B; 3G4Q A; 1BIJ B; 3UH5 A; 4L2M A; 1MDN A; 1CIK A; 1MOB A; 2AA1 B; 4HSW A; 1PMB A; 3GYS A; 1G0B B; 1RTE A; 1HBH B; 2ZLX B; 4C0N A; 1B0B A; 1O1M A; 2HHD B; 1GLI A; 1Y8K B; 4UZV A; 1EW6 A; 1H1X A; 1Y5K A; 3PI8 A; 3VRE A; 1Y0T A; 2G10 A; 2GKN A; 2ZLT B; 3WHM B; 1BAB A; 4MQH A; 2DN1 B; 1Y8W A; 1AZI A; 4N7O A; 3WCW D; 3RJ6 A; 3WR1 A; 1BZ1 A; 3UI0 A; 3EU1 A; 3DHR A; 3KMF C; 2G12 A; 1Y45 A; 3AT5 B; 1A0Z A; 2V1I A; 2MHB B; 1RPS A; 1DXD A; 1C7C B; 1YE0 A; 1UC3 A; 3VRG B; 1XZ4 B; 1UVX A; 4G51 B; 1YIE B; 4N8T A; 2MGA A; 1N9H A; 1Y46 B; 1YVT B; 1A6M A; 3GQP B; 3DR9 A; 3K8B A; 3M39 A; 5AB8 A; 1K0Y B; 3LR7 A; 1CBM A; 1QI8 B; 2Z85 A; 3WCT B; 3D4X A; 1IRC A; 3CIU A; 3B75 B; 2KSC A; 3UHX A; 4HSX A; 1TU9 A; 1V4W B; 1Y35 A; 3QQR A; 1CG8 B; 3QJE A; 5KDQ B; 1JF3 A; 3WTG B; 1CP0 A; 1VWT A; 2D2M A; 1M9P A; 1HBB A; 4O2G A; 2O5T X; 3MN0 A; 1NZ2 A; 1NAZ A; 3GKV A; 1J3Z A; 1BZ6 A; 1MOH A; 1HGC A; 1DXT B; 1HAB A; 3G53 A; 1NWN A; 1A3O A; 1S69 A; 3GK9 A; 1CH7 A; 1V4U A; 4N7N A; 2HZ2 A; 1LTW A; 1S56 A; 1WLA A; 1YFF A; 3BA2 A; 1L2K A; 1IDR A; 2MGF A; 2XKI A; 1MYI A; 5JDO D; 1CH5 A; 1VXH A; 4YU3 B; 3GOU B; 3TM3 A; 2GTL B; 1XY0 B; 3NL7 B; 1LH1 A; 5CNB A; 3UHN A; 1GZX A; 1C7B A; 3EDA A; 1VXG A; 1COH A; 1YGD A; 1MKO A; 3QM7 A; 1A3N A; 2ZS1 C; 2W72 B; 2V1J A; 1YHU C; 1Y8I B; 1O1N A; 2ZLW A; 2NRL A; 4NI1 B; 3NFE B; 1M6C A; 4KMV A; 1ECO A; 4MU5 A; 3O7N A; 2PGH B; 2ZFB A; 2ZFO C; 3OJ1 A; 3LQD A; 1V4X B; 1S61 A; 1WMU B; 1JDO A; 1OUU B; 1GDL A; 4C44 A; 3PT8 A; 1O1K B; 2VYY A; 4HRT B; 5CN8 A; 4OF9 A; 4L7Y B; 2CMM A; 1LFZ A; 4ZVA A; 3MJP B; 4U8U B; 2FAL A; 5EYS A; 2M6Z B; 1MBN A; 1HBR B; 1LFV B; 4FWZ A; 2BLH A; 2R4Z A; 2IG3 A; 3BCQ B; 4G1V A; 1YIE A; 5CMV A; 3ODQ A; 2GRH A; 1HAC B; 4B4Y A; 2AUQ A; 1FAW B; 2ZT0 A; 2MGC A; 1K0Y A; 2D2M D; 3ZJP A; 1C40 A; 3OVU C; 5B84 A; 3WCT A; 1YEO B; 2HBS B; 1CH9 A; 1A01 B; 2H8D A; 1RQ3 B; 1YMB A; 3OK5 A; 3P5Q A; 1CMY B; 1HDS A; 1HHO A; 3DHT B; 5SW7 B; 1YOH A; 3WCV C; 3LB4 A; 1UT0 A; 1RVW A; 1MLG A; 1CIO A; 2VYW A; 3G4W A; 1MBC A; 1OFJ A; 1Y7G B; 2XKG A; 1MYZ A; 3G52 A; 1DXC A; 3PI4 A; 1BJE A; 4NI0 A; 4UIQ A; 4X0L A; 3UHV A; 1NZ4 A; 1NQP A; 1GBU B; 2LHB A; 3UHC A; 2W6V B; 1OUT B; 3UGY A; 1JZK A; 3ECZ A; 5M3S A; 1FHJ A; 103M A; 1Y8H A; 2BLI A; 1O1I A; 1Y4R B; 1YZI B; 3NL7 A; 4NZI A; 3UHT A; 1W92 A; 1J41 A; 2W6W A; 1G0A A; 1Y0C B; 2V1F A; 3NMM B; 1Y0A A; 1GJN A; 3UHR A; 2ZS1 B; 1C7D B; 2V1H A; 3IC2 B; 3UHD A; 1JZM A; 2HHE B; 1J3Y B; 2VYZ A; 1BIN A; 5EU2 A; 1ABY A; 1RQA B; 2Z8A A; 4F4O A; 4ESA B; 1YH9 A; 1QXE A; 2ZFO B; 1LH6 A; 2VEB A; 3RJN B; 1NEJ B; 2ZSP A; 1GBV A; 1MBO A; 1VXE A; 5ILP A; 5E29 B; 1XQ5 B; 3MJP A; 1MWD A; 1A4F B; 3AQ8 A; 3KMF A; 1S0H B; 4HRR B; 2GLN A; 2BWH A; 1Y0D B; 1Y4V A; 1IWH A; 1DO1 A; 3QM8 A; 1ABW A; 1HAC A; 2QU0 B; 4GZG A; 2RAO A; 1MLJ A; 1Y83 B; 1HBG A; 4DWU A; 1ITH A; 3TLD A; 1CBL A; 1KFR A; 3K3U A; 111M A; 1A01 A; 3PIA B; 1NWI A; 3GQG A; 3D1A A; 3QJD B; 1V9Q A; 1RQ4 A; 3HEP A; 5F0B A; 4IRO B; 3FH9 B; 3VRF B; 1CG5 B; 2XKH A; 1Y4B B; 3D7O B; 2R80 B; 4MQK B; 4SDH A; 1JL7 A; 4NXC A; 4DWT A; 2MYE A; 1T1N A; 1O1P B; 1JEB B; 1DM1 A; 2MGJ A; 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1XZV A; 1MYG A; 1V07 A; 2ZFO D; 3M38 A; 2Z6N A; 4MQJ A; 1HV4 A; 1DKE B; 2EKT A; 2Z6S A; 1CPW A; 2HBF B; 1YG5 B; 3WCP B; 1N9I A; 3QJC B; 3PEL A; 1UX9 A; 1Y4F A; 5EE4 C; 3M3A A; 1R1X A; 4U8U C; 4HHB B; 1VXB A; 2BK9 A; 1NS6 A; 2ZSS A; 1YEN B; 1A6G A; 2ZS0 B; 1IOP A; 2QSS B; 2JHO A; 3D17 B; 2GRF A; 2QSP A; 2QLS B; 2HBE B; 1JF4 A; 1ASH A; 1Y5F A; 5C6E B; 1BBB B; 1SWM A; 1HJT A; 2SPN A; 2YRS B; 1O1O A; 4O1T A; 1Y4Q A; 3AT6 B; 1MYF A; 3BJ1 A; 5E83 B; 2D5Z B; 1MNO A; 2LH2 A; 2MGK A; 3ONZ A; 1SDK B; 5CN4 A; 2D5X A; 2ZT2 A; 3UHE A; 3SDH A; 1THB B; 1IRD A; 1J52 A; 3R5I A; 2PEG A; 4O4Z A; 4HBI A; 4M4B A; 3LB3 A; 1VXF A; 2R1H A; 2ZLV B; 1XZU B; 1YCA A; 1MCY A; 1CO8 A; 1VHB A; 2H8F B; 3WCV D; 3PT7 A; 5HLQ A; 1O1L B; 1A9W E; 1YGF B; 1G08 B; 1DXU A; 2HHB A; 1LFY B; 2BKM A; 1AJ9 B; 3BJ3 A; 1G09 B; 3HHB B; 1ECD A; 1YHE B; 1A6N A; 2MGI A; 2R4W A; 3SDN A; 2OIF A; 1JY7 A; 1DO4 A; 1B86 A; 2DN2 A; 3ECX A; 1XXT B; 1YHR B; 1BIJ A; 2EF2 A; 3VHB A; 1Y22 B; 2WTH A; 2AA1 A; 5HLX A; 3DUT A; 3ASE A; 1G0B A; 2ZST A; 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