The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
49
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Structures of human oxy- and deoxyhaemoglobin at different levels of humidity: variability in the T state.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
49
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BJ2 B; 1MYZ A; 1KD2 B; 5KDQ B; 2FAM A; 2OH9 A; 2D5X A; 5E83 A; 3ZJH A; 4MXK A; 2PGH B; 1QSH A; 2D2M D; 3SZK B; 1A4F A; 1HSY A; 3SDH A; 2W72 A; 3UHY A; 1EBC A; 1MZ0 A; 2MYC A; 1PBX A; 2BNL A; 3E55 A; 1FSX A; 3ONZ B; 4F6B A; 1HJT A; 1O1I B; 5EYJ A; 1M6C A; 1A0U B; 3VAU A; 3U3E A; 1JZL A; 1MKO A; 1LFL B; 1J3Z A; 3MN0 A; 4IRO A; 3QJB A; 1Y8H A; 1B0B A; 1QXD A; 1BVD A; 1Y4R B; 2G3H A; 1NZ5 A; 1MYM A; 4FH7 A; 3BOM B; 4XS0 A; 3B75 B; 2EB8 A; 3AT6 B; 1ABS A; 2ZLW A; 2W31 A; 3ZJQ A; 1SI4 A; 1EBT A; 3UHE A; 1BBB A; 1O1M B; 1YE0 A; 5CNF A; 3UHD A; 2MGK A; 5E6E B; 3GOU A; 5CNE A; 2M6Z B; 2B7H A; 1OUU A; 3MVC A; 1NZ3 A; 1HCO A; 1Y22 B; 5HY8 B; 2ZSY A; 3UHZ A; 1S0H B; 3MBA A; 2QSP A; 4GZG A; 1JL6 A; 1RSE A; 2GKN A; 2VM0 A; 1A01 A; 3PI9 B; 1MBN A; 1V4X A; 3GKV B; 1N9H A; 3ODQ B; 2HHD A; 1RVW A; 1CH2 A; 3GYS A; 3PT8 A; 1MOA A; 1LHT A; 1FSL A; 1T1N A; 4NI0 A; 3A2G A; 3CIU B; 1G0B A; 1XYE A; 1I3D A; 1FDH A; 3WCU B; 3OGB A; 4XS0 B; 2BMM A; 1J7W A; 4JAC A; 2Z6S A; 1X9F A; 5B84 A; 1GBV B; 1GJN A; 2W72 C; 1DXC A; 2EB9 A; 2V1F A; 1Y7Z A; 1YE0 B; 1HGB A; 1A6N A; 1JP8 A; 1YHR A; 1BZZ A; 1JP9 A; 2VLZ A; 1MLM A; 2MGM A; 3V2V A; 1Y4Q A; 3QJC A; 1VXD A; 1YH9 B; 1MBA A; 1YVQ A; 2MGA A; 3PIA B; 1YGD A; 1LA6 A; 4U8U A; 1UIW B; 1GCV A; 1RTX A; 5C6E B; 2ZS1 A; 2ZT0 A; 2GRH A; 3UHQ A; 1K1K B; 1C40 A; 1YEU A; 1Y0W B; 1J52 A; 3EU1 A; 4G1B A; 2C0K A; 2HZ2 A; 6HBW A; 2AA1 B; 2HHB A; 2HBF A; 3BJ3 A; 3UHI A; 4N7O A; 1MBC A; 5AZQ A; 1YFF A; 2DHB A; 2O5M X; 2G0R A; 1Y45 B; 1YG5 A; 3AQ9 A; 5KER B; 1JEB B; 2R50 A; 3R5I A; 3UHN A; 3GLN A; 3ZOL A; 1LFT B; 5KKK A; 3LR7 A; 1FHJ B; 1X9F D; 3AQ8 A; 1FAW A; 3DR9 A; 2NSR A; 1JY7 B; 1OUT A; 2VLY A; 1UVX A; 2GNW A; 1Y4P B; 4TYX A; 1MNI A; 2V1G A; 3QJD B; 1A6K A; 4MBA A; 1R1Y B; 3K8B B; 1XQ5 B; 2ZLU A; 4MQH B; 1Y85 A; 5HU6 A; 4HSW A; 1Z8U B; 4U8U D; 1QI8 B; 4O1T A; 4ROM A; 3IC2 A; 2ZS1 D; 3G46 A; 1ABY B; 1S5X A; 3QZZ A; 3ECX A; 1YEN A; 1RTE A; 3PI2 A; 1CBL A; 1S6A A; 2FRF A; 1X9F C; 2ZSP A; 1VXF A; 1QSI A; 3GQG A; 1UMO A; 3WCV A; 5ILM A; 3UHC A; 5F2A A; 1Y2Z B; 2HHB B; 1NEJ B; 3IC0 B; 4OF9 A; 1HV4 A; 4HRR B; 1CH1 A; 1AJG A; 1DO4 A; 2HZ1 A; 3NG6 B; 1MLH A; 1CMY B; 1CLS A; 2ZS1 C; 4L7Y B; 1LH3 A; 1MLN A; 1JDO A; 2D6C A; 3WTG B; 1GCW A; 3D1K A; 4F68 A; 1DLY A; 1IBE A; 1A3N B; 1Y7C B; 1CP5 A; 1V75 A; 5SW7 A; 3ZH0 A; 1ASH A; 5EOH A; 4FWX A; 1EW6 A; 2DN2 A; 1CH7 A; 5JGG A; 1GLI B; 1RQ4 A; 1LFZ A; 1SDL A; 1BUW B; 1R1X A; 1YOI A; 3H58 A; 2BW9 M; 3K9Z A; 5EET A; 1KFR A; 1Y5J B; 1JWN A; 3WCV D; 2V1J A; 1XXT A; 1HBR B; 4G1V A; 1A00 B; 1J7S A; 2YRS A; 1HBS A; 2ZSZ A; 3GQG B; 1BVC A; 4NK2 A; 1A3O B; 2SPL A; 2AV3 A; 1URV A; 1DO7 A; 3IA3 B; 1JF3 A; 1BZP A; 3G4R A; 1HV4 B; 2QSS B; 3WR1 A; 2ZSO A; 3MOU A; 3WHM B; 3ZJL A; 3PI1 A; 1DKE B; 1A6G A; 1QXE B; 2O5Q X; 1DXT B; 2SPO A; 2ZLX B; 2V1H A; 4NS2 A; 1FN3 B; 5ILP A; 2VYZ A; 2OHB A; 3ZOM A; 3PI8 A; 4NXC A; 3WCV C; 3OO4 A; 1C7D A; 3QM6 A; 2V1K A; 3NFE A; 1CG5 A; 3E4N A; 3TLD A; 1NIH A; 3WCW A; 1NS6 B; 1LFQ A; 2H8F B; 4ODC A; 1V07 A; 2BLJ M; 3G4Q A; 1MYF A; 1Y83 B; 5CN9 A; 3D17 A; 1V4U B; 2ZT4 A; 1XZ2 A; 1HGA A; 4PQC A; 1CO9 A; 2MYE A; 2YRS B; 4F4O A; 3BCQ B; 1NS9 B; 4OOD A; 1ABW B; 4F6G A; 1CPW A; 3FS4 A; 3GQR A; 1NQP A; 4M4B A; 103M A; 2VHB A; 1CIO A; 2BLH A; 3NL7 B; 1NGK A; 1BZ0 A; 2G0S A; 1Y35 A; 4YU3 B; 3UHK A; 1YDZ B; 3OZW A; 2ZLT B; 2D60 B; 1S61 A; 1CBM A; 3QQR A; 1EWA A; 4H2L A; 4L2M A; 3WCP B; 2DXM B; 1RQA A; 2OHA A; 1JP6 A; 1Y8K B; 3HEN A; 1LH7 A; 5CNC A; 3RJ6 A; 3WCW D; 1EMY A; 1XZ5 B; 1MLO A; 1Y0A A; 1DUK A; 4ROL B; 2FRI X; 1O1P A; 2HBE A; 2ZLV B; 1BAB B; 4MQC A; 1MLF A; 1THB A; 2ZFO B; 4ODC B; 2G0X A; 2NX0 A; 3HEP A; 1BIN A; 102M A; 1J7Y B; 3DHR B; 3S66 B; 5CN4 A; 5AB8 A; 1VXB A; 2O5S X; 1TES A; 3PEL B; 5CN7 A; 3OZU A; 4HBI A; 3HYU A; 1FLP A; 5HBI A; 3HHB A; 1Y8I A; 2LH3 A; 1HDS B; 4N7P A; 1LJW A; 3E5O A; 1UC3 A; 2H8D A; 2MGL A; 3LB2 A; 3WCW C; 3QMA A; 2BWH A; 2HHE A; 1BZ0 B; 5E29 A; 101M A; 1YIE A; 1QPW B; 3HRW B; 1GBU B; 2WY4 A; 3ED9 A; 1RQ3 B; 1Y31 A; 2O5L X; 1LFV A; 2W6V B; 4G51 B; 3S65 B; 1Y0D B; 1IOP A; 3GQP A; 3A0G B; 1MNK A; 4HHB A; 1YVT A; 4AVE A; 1V4W A; 1MTI A; 4MQC B; 3ARK A; 1BIJ B; 2ZSS A; 3GDJ A; 2MYD A; 2XKG A; 2DN3 A; 3A59 B; 2AV0 A; 3KUO A; 1NXF A; 1Y7G B; 2W6X A; 4MQJ A; 2FRK X; 2OIF A; 2G0V A; 4XDI A; 3MJP B; 1YZI B; 1IDR A; 3FH9 B; 3D4X A; 1YIH B; 3G4Y A; 1HDA B; 2D2M B; 1YEQ B; 3ORD A; 4ZVB A; 4YU4 A; 4SDH A; 3P5Q A; 2Z6N A; 1SDK B; 1HBH B; 1XZ4 A; 1HDB A; 3OO5 A; 4FWZ A; 5C6Y A; 1J40 B; 1Y8W B; 3DUT B; 1DTM A; 1M9P B; 1XZU B; 5E29 B; 2PEG A; 3MYM A; 1AJ9 A; 2HBC B; 5AZR A; 3LB3 A; 1YEO B; 104M A; 4FH6 A; 5D5R A; 2ZFB A; 2D2M C; 3DHT B; 1IWH B; 3HEO A; 3CY5 B; 3UH7 A; 1LH5 A; 1A9W A; 1O1N A; 3M39 A; 1G9V A; 3MJU B; 1XY0 B; 1KR7 A; 1MBI A; 2NRM A; 2HCO A; 1HHO A; 1SPG A; 2LH5 A; 4TWV A; 3WCT A; 2D5X B; 3ASE A; 1HAC A; 2O5O X; 5E83 B; 4NI1 A; 3VRG A; 1HAB A; 1QSH B; 4N8T A; 1GDK A; 2MGB A; 1Q1F A; 4O4T A; 1IRD A; 1COH A; 3W4U A; 3LQD A; 1W92 A; 1A4F B; 1MNO A; 2W72 B; 1G08 A; 1YMB A; 2MGH A; 3O89 A; 1PBX B; 1JL7 A; 2MGJ A; 2R1H A; 1FSX B; 2GKM A; 4UUR A; 1DXV A; 1IRC A; 2XKI A; 1Y5F A; 1MKO B; 2VLX A; 2H35 A; 3D1A A; 1IT3 A; 1J3Z B; 4DWT A; 3R0G A; 4IRO B; 3QJB B; 3UBC A; 1Y8H B; 1QXD B; 1G09 A; 1MTK A; 3UHH A; 4MQK A; 4UZV A; 5D1V A; 3QJE A; 1NZ4 A; 2EKT A; 4NK1 A; 2ZLW B; 1UVY A; 1SI4 B; 3UHG A; 1SWM A; 1BBB B; 4UIQ A; 1B86 A; 3AQ5 A; 2AUR A; 3GOU B; 2B7H B; 1OUU B; 3G4U A; 1IT2 A; 3WCT D; 3QM9 A; 2Z85 A; 3UGZ A; 1HCO B; 1VRF A; 4DWU A; 3ZHW A; 1Y09 A; 1HGC A; 2QSP B; 2ZT1 A; 1CH5 A; 4N7N A; 3BJ1 A; 1A01 B; 1HBA A; 3EDA A; 3UGY A; 2MGD A; 1V4X B; 2HHD B; 3ZJO A; 1O1K A; 1XZV A; 3K3U A; 1J41 A; 3VRE A; 1RVW B; 4FC3 A; 3D1A B; 3GYS B; 3PT8 B; 2Z8A A; 4WCH D; 1T1N B; 2BKM A; 4NI0 B; 1G0B B; 1XYE B; 3WCT C; 1LFY A; 2VYW A; 2D5Z A; 4H0B A; 1CH4 A; 1J7W B; 1Y4V A; 3HF4 A; 1X9F B; 1RPS A; 3TM3 A; 2AUP A; 1WVP A; 1Y7Z B; 1HGB B; 3ECZ A; 3SDN A; 2MHB A; 1OR4 A; 3OJ1 A; 1YHR B; 1BZZ B; 1MGN A; 1I3E A; 5EE4 D; 1SPE A; 2E2Y A; 1NPG A; 1Y4Q B; 3QJC B; 1A0Z A; 1K0Y A; 1YVQ B; 1Y0T A; 4ESA A; 1XCH A; 1YGD B; 1NPF A; 1LA6 B; 4U8U B; 1GCV B; 3NML A; 3G4W A; 1MLK A; 2ZS1 B; 2D2N A; 2NRL A; 1S56 A; 1C40 B; 1YEU B; 2GLN A; 1X46 A; 3EU1 B; 2HZ3 A; 2EVK A; 1YHE A; 6HBW B; 3M3B A; 2BK9 A; 1J3Y A; 5HLQ A; 2HBF B; 3BJ3 B; 4N7O B; 1YFF B; 3PT7 A; 5CHR A; 2DHB B; 1N9F A; 1MOC A; 2W6Y A; 5CMV A; 1YG5 B; 4MQI A; 2O5T X; 3R5I B; 1MLQ A; 1HBB A; 1YE2 A; 1JF4 A; 4U8U C; 2HBD A; 1Y46 A; 1CQ2 A; 1UX9 A; 2Z6T A; 1FAW B; 1O1L A; 2R4W A; 1OUT B; 1U7R A; 4C44 A; 3UH5 A; 2MGI A; 1G0A A; 5IKS A; 1CQX A; 3WFU A; 1YGF A; 2ZLU B; 1Y85 B; 1M6M A; 5HU6 B; 2RI4 A; 1VRE A; 1NWN A; 2ZS0 A; 4ROM B; 3IC2 B; 1Y5K A; 1Y4B A; 2D2N D; 1GVH A; 3NMM A; 4IT8 A; 1S5X B; 2G14 A; 3MKB A; 5HLU A; 1YEN B; 112M A; 1PMB A; 2EVP A; 2SPM A; 1QSI B; 1MLJ A; 3WI8 A; 111M A; 3WCV B; 3M38 A; 1LUE A; 105M A; 4HSX A; 1N9I A; 1BZ6 A; 1GZX A; 1BZ1 A; 1JW8 A; 3ZJP A; 4KN3 A; 1MOD A; 1YE2 B; 1NZ2 A; 3HXN A; 3D7O A; 4MXL A; 1CLS B; 1YEV A; 2D2N C; 2HBG A; 2QFN A; 4JYQ A; 4KJT A; 1GCW B; 1Y4F A; 3D1K B; 1Y0C A; 1JZM A; 1IBE B; 1CG8 A; 3MYN A; 2QLS A; 2ZS0 D; 3LB1 A; 1V75 B; 2QMB A; 107M A; 5SW7 B; 1VXH A; 4X0L A; 1GDL A; 2DN2 B; 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3B75 A; 5JDO C; 4AVD A; 1MLG A; 3AT6 A; 2MB5 A; 1YHU C; 4MBN A; 3PI3 A; 1Y0A B; 1O1M A; 1O1P B; 2LHB A; 2HBE B; 1THB B; 2QU0 A; 2G10 A; 5E6E A; 2M6Z A; 2ZWJ A; 1GDJ A; 1HLM A; 3AQ6 A; 1S69 A; 5EYS A; 1Y22 A; 5HY8 A; 1S0H A; 1V5H A; 1MLS A; 1MLL A; 3ZJR A; 2MGG A; 1DLW A; 3HYU B; 6HBI A; 1H97 A; 3PI9 A; 2IN4 A; 3HHB B; 3GKV A; 3A5B A; 1Y8I B; 3UH6 A; 3TM9 A; 4N7P B; 2O58 X; 1LJW B; 3ODQ A; 2H8D B; 1H1X A; 2HHE B; 1YIE B; 3ECL A; 1L2K A; 2NSS A; 2GRZ A; 1Y31 B; 4LPI A; 3CIU A; 1LFV B; 1LH6 A; 1MYH A; 3ARL A; 3WCU A; 1HLB A; 2ZSN A; 1MWB A; 3GQP B; 1U7S A; 1UFJ A; 4MU5 A; 4HHB B; 1YVT B; 1GBV A; 1V4W B; 4WJG A; 5CNG A; 5JDO F; 2QU0 B; 3GDJ B; 2DN3 B; 1ITH A; 2CMM A; 1OFJ A; 4MQJ B; 1YH9 A; 5CN8 A; 1ECD A; 2WTH A; 1HBI A; 3WFX A; 1MBD A; 3PIA A; 2G12 A; 3D4X B; 1UIW A; 2G0Z A; 2ZSX A; 2LH1 A; 1DXD A; 4YU4 B; 5C6E A; 1Y01 B; 2V1I A; 3P5Q B; 2Z6N B; 1K1K A; 1Y0W A; 1A9W E; 1XZ4 B; 1HDB B; 2V1E A; 3OO5 B; 1WLA A; 2AA1 A; 3G4V A; 2PEG B; 1AJ9 B; 2KSC A; 1Y45 A; 5KER A; 1JEB A; 5HAV A; 3WCU D; 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