The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
SIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLLLTKEDFRYRSPHSGDRLYELLQHILKQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transcription
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| molecule keywords |
TRANSCRIPTION FACTOR ETV6
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| publication title |
Native interface of the SAM domain polymer of TEL.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
24
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| chains with identical sequence |
C, E
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-04-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L5Y A; 2F44 A; 3TAD C; 4PZN A; 1V85 A; 4PZO A; 3TAD A; 1OXJ A; 1SV4 A; 3HIL A; 1SGG A; 1WWV A; 2DKZ A; 1X40 A; 3BS7 A; 5JRT A; 2K4P A; 2EAM A; 3SEN A; 2KIV A; 2EAP A; 1Z1V A; 2ESE A; 2B6G A; 1V38 A; 4RQM A; 2KSO B; 2DKX A; 4MHV A; 1COK A; 1OW5 A; 2Y9U A; 2ES6 A; 2EAN A; 2QB1 A; 2EAO A; 1WWU A; 5F3X B; 5JTI A; 2QAR A; 3TAC B; 2QAR B; 1SV0 C; 1SV0 A; 2D8C A; 2Y9T A; 2F8K A; 2LMR A; 2JV3 A; 1UCV A; 1B4F A; 3BS5 A; 1X9X A; 1PK1 A; 2F3N A; 2QB0 A; 1KW4 A; 2E8M A; 2QB0 B; 1SXE A; 4NL9 C; 2E8N A; 1F0M A; 1UQV A; 4NL9 A; 1SXD A; 1LKY A; 1LKY B; 2GLE A; 2LPE A; 5J8Y C; 4RQN A; 2E8O A; 3K1R B; 3H8M A; 5JU5 A; 1X66 A; 1DXS A; 2KMD A; 4NJ8 A; 2FE9 A; 1B0X A; 1PK3 A; 3IDW A; 3BS5 B; 2YTU A; 3SEI A; 1PK1 B; 4IS7 A; 3KKA C; 2KG5 A; 3KKA A; 2DL0 A; 1RG6 A; 2QKQ A; 2D3D A; 2K60 A; 5L1M A; 5KNI A; 3BQ7 A; 2KE7 A; 5J8Y A; 2KSO A; 2E8P A; 1JI7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ECW A; 4XA5 A; 4DLG A; 3SQI A; 4ECS A; 3TAD A; 3RH6 A; 4UAZ A; 4Q44 A; 2V4R A; 4C8M A; 4YXM A; 4DOC A; 2IA6 A; 5KFJ A; 3F53 A; 5KFX A; 2F2A B; 2B0C A; 2W55 A; 1WG8 A; 3MAB A; 4TUP A; 1BNO A; 4NM1 A; 2Y1J A; 9ICR A; 7ICN A; 3C2K A; 4RQM A; 2RDI A; 1COK A; 2W9C B; 1JXL A; 4ICA A; 2ISO A; 1M6Y A; 3IN5 A; 3LYS A; 5ALY A; 7ICK A; 3SV4 A; 5KG6 A; 3TKA A; 3A0B U; 1JIH A; 1TAM A; 2ZG6 A; 3G6V A; 3GII A; 3RH5 A; 1Z1B A; 2IOF K; 3RJK A; 4F5R A; 5DB8 A; 2KD1 A; 2ZIW B; 1UHU A; 3QEA Z; 3NVZ A; 1S76 D; 3C5G A; 1KTQ A; 4DWI A; 5JUM A; 5AKE A; 3C29 A; 4ECQ A; 4US9 A; 4F92 B; 4ZH4 A; 3V6J A; 3F2C A; 1TV9 A; 4RT2 A; 3QU4 A; 5J8Y C; 2K89 A; 3GV5 B; 4PHP A; 3CYM A; 4P0P A; 1QQ7 A; 1ZET A; 1PK3 A; 2KIC A; 1J2N A; 1O03 A; 2F1H A; 5KG5 A; 4I2G A; 4FBT A; 7ICR A; 3ISD A; 1ZQL A; 4BXO A; 1S77 D; 1T8E A; 4MFA A; 2N1R A; 5AK5 A; 1ZJN A; 4PGY A; 3BQ7 A; 4QW9 A; 2WF5 A; 1ZXI A; 2ZTD A; 1BPE A; 3TAD C; 3H0L B; 4PZO A; 5EOZ A; 3QYP A; 2C22 A; 5KFL A; 3U26 A; 5KFF A; 4RZR A; 1PVR A; 3BZC A; 4US8 A; 2HHW A; 3H0R B; 1X40 A; 1S9F A; 1B43 A; 4ELU A; 4I2H A; 3CRX A; 1QSY A; 3LDA A; 1YT3 A; 4O3R A; 2M0N A; 4O5C A; 1DOQ A; 5DLG A; 5AK6 A; 4O5E A; 1L3S A; 1JN3 A; 2PMZ C; 3PSI A; 2ES6 A; 8ICZ A; 8ICR A; 1ZQS A; 5KFK A; 2KJ9 A; 5G5G A; 2XCP A; 2KFZ A; 3UQ0 A; 3AQE A; 2W54 A; 3H0M B; 2HVH A; 3HWT A; 1KEJ A; 1RYU A; 4UAT A; 2MAX A; 3AUO A; 2EH9 A; 2MUT B; 4MEX A; 4NLK A; 2Y9T A; 4QWC A; 2YMQ A; 3NVW A; 3C23 A; 4QIW C; 3OJU A; 4OJP A; 4GC6 A; 4Y2J A; 4I2F A; 1PK1 A; 5KG3 A; 2XI9 A; 8ICO A; 5KFU A; 3MFH A; 2BPC A; 4F4Y A; 4NLG A; 4ED1 A; 2WAQ C; 2ZIV A; 3N7P D; 1MQ2 A; 4C80 A; 3LWL A; 4KN4 A; 4Z6D A; 1K5O A; 5BOL A; 2HBJ A; 4FO6 A; 5D4B A; 1TK0 A; 5ALR A; 2JEF A; 2KG5 A; 1IIP A; 4ED3 A; 3I1Y A; 4NWI A; 3PO4 A; 5J2D A; 3RR7 A; 4RQ0 A; 2G5H B; 4YD1 A; 3ED5 A; 3ONN A; 2HHX A; 2P66 A; 3GU3 A; 1SWW A; 2LKY A; 4F5P A; 2W7O A; 2G06 A; 1Z4N A; 3M9M B; 4RQ5 A; 2V4Q A; 4EZ6 A; 3MGI A; 2D6F C; 4O9M A; 2F44 A; 3QNM A; 8ICT A; 4OJ6 A; 9ICP A; 7ICS A; 3HIL A; 3M8S A; 3BZK A; 2AGO A; 1TAQ A; 2KHV A; 1VDV A; 1TK8 A; 3GZF A; 1TKD A; 9ICA A; 5JRT A; 1SKR A; 1Z3E B; 3NVY A; 4KLS A; 4M6W A; 3HRD D; 5CEH A; 2BKE A; 2NV3 A; 5EWG A; 1S0O A; 2KSO B; 5B5E U; 4PL1 A; 5DLF A; 4KX3 A; 4DS4 A; 1ZQZ A; 3MR5 A; 2WB1 C; 1YZ7 A; 4OD0 A; 4UB3 A; 4TQR A; 1T4G A; 1BVS A; 2YQE A; 5DQI A; 5KFE A; 3PV8 A; 3QXG A; 2KOB A; 7ICQ A; 3D2Q A; 2ALZ A; 4DCC A; 3IRU A; 8ICF A; 2W9M A; 4RUA A; 3B9J A; 1URJ A; 4KLI A; 3PY8 A; 4O3O A; 5ALD A; 1WUD A; 3BQT A; 2AH5 A; 4GFJ A; 4QZA A; 1UT5 A; 3TAN A; 1A76 A; 1CEZ A; 3QX7 A; 1SXD A; 3GIL A; 2OHF A; 4R66 A; 1ZQF A; 3UMC A; 9ICL A; 4RQN A; 7ICU A; 5ALO A; 2LYB A; 3HKZ C; 3MR3 A; 2KVC A; 1V9P A; 4XRH A; 4B9S A; 3KTQ A; 5E79 U; 4IQT A; 3SEI A; 4CGZ A; 9ICC A; 1KL9 A; 4O3S A; 3WU2 U; 2K4H A; 3PMN A; 2GOL A; 4BXO B; 3D2S A; 2NO5 A; 3PZP A; 4B6J A; 2R18 A; 3QUT A; 3WKB A; 2W8L A; 2YMM A; 1BPY A; 2H5X A; 3ISC A; 5IIK A; 3ZI4 A; 5DBC A; 2PKE A; 1SV4 A; 4ECY A; 3QUQ A; 2CXY A; 5J2K A; 1NKC A; 3BS7 A; 4KLG A; 1FEZ A; 3J81 j; 1H38 A; 2HOF A; 1WCN A; 2JEJ A; 1CRX A; 5KT2 A; 2B6G A; 5J0S A; 1V38 A; 4UB6 U; 3GFK B; 4M9H A; 2BCR A; 2KZ3 A; 4USA A; 5CB1 A; 1RPL A; 2XCA A; 3F2B A; 5ALF A; 4FZM A; 2W9A A; 1ZQC A; 3NRW A; 2QB1 A; 2EAO A; 2ZIU A; 4JV2 A; 2YMP A; 3RRG A; 1Z00 A; 4RQ3 A; 5DG7 A; 1YZ6 A; 4DEZ A; 3RB4 A; 5T14 A; 8ICW A; 4TUQ A; 3HX0 A; 3OPX A; 4DOA A; 1N5X A; 5A0L A; 5DBB A; 4QZD A; 5DG9 A; 4DL7 A; 1ZRM A; 1AQ6 A; 3LVV A; 3H8W A; 4PH5 A; 5DB9 A; 1N56 A; 2NRZ A; 2I5H A; 1S8O A; 1NJZ A; 9ICV A; 2VA8 A; 1JRP A; 4EZ9 A; 5DB7 A; 2GLE A; 5AIA A; 4CRX A; 4ED0 A; 9ICQ A; 5J0Y A; 1X66 A; 2KMD A; 2IHN A; 1MC8 A; 4I2D A; 2ZUC A; 1KFT A; 4P4M A; 3MGV A; 5HR7 A; 2F8L A; 4RQ8 A; 1TE2 A; 3EPI A; 3CP8 A; 4YFK A; 5CRX A; 3H7I A; 1RG6 A; 4F2S A; 2AHO B; 2O6K A; 4J9R A; 2KHQ A; 5KFG A; 4IQU A; 4F8R A; 4ED2 A; 2VJ4 A; 4C4S A; 2GWS A; 4P4P A; 1JI7 A; 4NM2 A; 2NRW A; 1ZQX A; 7ICL A; 1VJ5 A; 3K75 D; 5EE0 A; 4F91 B; 4KLL A; 4F93 B; 3RF9 A; 4GLX A; 4DQS A; 5KFS A; 2ZUD A; 1JX4 A; 4F5O A; 2HHS A; 4AYB C; 1ZQR A; 4DL4 A; 2I1Q A; 4K4G A; 7ICM A; 1F44 A; 3TI0 A; 4P4O A; 3MR6 A; 3T5J A; 7ICV A; 3OGU A; 1A6S A; 4BWJ A; 1ZQA A; 5L1K A; 3BJY A; 2HHT A; 4JB3 A; 2B21 A; 4R8U A; 9ICI A; 4EEY A; 4I27 A; 4Y2R A; 1L7N A; 1L7P A; 3SAF A; 4B9M A; 3SZ2 A; 2EDU A; 3JPS A; 1F5S A; 4ACO A; 2VKQ A; 2WFA A; 5J2G A; 1B4F A; 4TUR A; 1X9X A; 2AGQ A; 2E3T A; 5J0X A; 2JH1 A; 4UAU A; 2E8N A; 2BHN A; 4CDG A; 2C28 A; 4C4T A; 5CP2 A; 3RB6 A; 7ICG A; 3DEE A; 1ZQP A; 2UVW A; 3MDC A; 4DSI A; 4F5Q A; 2DGZ A; 1DXS A; 3Q8M A; 1ZQB A; 1RDF A; 3BS5 B; 3ZD9 A; 3V72 A; 5AKZ A; 5C5J A; 5J0O A; 2VJ5 A; 2K60 A; 5TZV A; 2ZIX A; 5G5H A; 1WYG A; 4JV0 A; 5J8Y A; 1ZD3 A; 3RJH A; 4QZE A; 2ZJ8 A; 2KK0 A; 5J2H A; 4J9M A; 2IMW P; 4I28 A; 5J2B A; 1NJY A; 2LHT A; 1DK2 A; 5KFO A; 5ALW A; 3AN1 A; 4JMU A; 2VAN A; 4MF8 A; 5AM3 A; 5DB6 A; 3KZI U; 2EAM A; 5F9N A; 1ZQQ A; 3D6J A; 4DFJ A; 2HW3 A; 3ETR A; 4Y2S A; 4UB4 A; 4DSL A; 3TFR A; 2DKX A; 3KD3 A; 1UA0 A; 1QH9 A; 2KEY A; 1X6J A; 4UBC A; 1FO4 A; 2OWO A; 3OTQ A; 4C8L A; 1NI3 A; 4RPY A; 1XO1 A; 2DWQ A; 3BQ0 A; 9ICK A; 2OH2 A; 3C5F A; 5J0T A; 4O3P A; 5F3X B; 5IIM A; 3GV8 B; 3WK8 A; 1N61 A; 5DDY A; 1Z00 B; 1HEK A; 4DQP A; 2A1A A; 4F50 A; 1K1S A; 2FPL A; 3N7R C; 4O3N A; 3IV6 A; 4R65 A; 4RQ2 A; 5KL8 B; 2F8K A; 2YB1 A; 2XY5 A; 3T5L A; 2H3I A; 1T94 A; 2KZM A; 2BCS A; 2PMZ F; 1NK9 A; 3PW0 A; 1U45 A; 3AQF A; 5KFM A; 1XSN A; 2CPR A; 1KN5 A; 4PPX A; 4F72 A; 1ARO P; 1GO3 F; 3SAH A; 3EZ5 A; 2DUY A; 4QZH A; 4NLC A; 4Z6F A; 3ZDC A; 1X9W A; 5J0Q A; 4QIW F; 9ICH A; 5AM5 A; 1RZT A; 4NJ8 A; 2W7P A; 4KLT A; 4EX7 A; 1Q46 A; 2E1E A; 3HPO A; 4KLQ A; 1P7D A; 4MEY A; 4KLM A; 3E0F A; 4C7Z A; 2QKQ A; 2WAQ F; 5III A; 4ECW A; 2H3Q A; 8ICC A; 4J9S A; 4RNO A; 3TAR A; 3RAX A; 1QLN A; 1L3T A; 5DBA A; 2W9B A; 2XVT A; 4PHE A; 2HBK A; 2JZB A; 5AI6 A; 1BPX A; 3QEB Z; 4RQ1 A; 3C28 A; 1WWV A; 2BPG A; 4RNM A; 4EEL A; 2NO4 A; 4QW8 A; 4KX5 A; 2XGQ A; 4YQW A; 1ZQT A; 4QNL A; 4DFM A; 8ICI A; 4U6P A; 2IOF A; 4Q45 A; 3C21 A; 2HOI A; 1RXW A; 2KP7 A; 4QZI A; 3E58 A; 1UPH A; 3WK9 A; 4I29 A; 5CR0 A; 4NV0 A; 3MBY A; 4YR2 A; 4X5V A; 9ICF A; 3WKC A; 8ICE A; 2HHU A; 9ICG A; 4UAV A; 1ZOL A; 4B9T A; 3F5A A; 1QCK A; 2YML A; 3GIK A; 3KHR A; 3QUC A; 1PUZ A; 1KFD A; 1J97 A; 3RRH A; 4O3M A; 1JAL A; 3T79 A; 2K4E A; 4QWD A; 2WB1 F; 1Q8K A; 3H4D A; 3FDS A; 2H3F A; 2DFL A; 2IOH A; 4RPX A; 3PML A; 8ICB A; 2K8A A; 3JPT A; 4YVZ A; 3N28 A; 1TVA A; 2DQN B; 3EWA A; 5JU5 A; 1RYR A; 2W3S A; 5DKW A; 3C1Z A; 2OEH A; 3KFU F; 4UB8 U; 1ZQM A; 2W04 A; 2F77 X; 8ICH A; 4CNQ A; 5HHI A; 5ALM A; 5AHX A; 2VA2 A; 5DGA A; 4UAS A; 1QSL A; 4KIT B; 2R8H A; 1TFR A; 9ICO A; 1CI4 A; 3PSP A; 2KE7 A; 3HKZ F; 1XWL A; 1BNP A; 4FZL A; 2W03 A; 2FLP A; 1U48 A; 2K8C B; 3RBE A; 4F3O A; 1SGG A; 2HSZ A; 3HP6 A; 2I9G A; 5AIB A; 5C0Y A; 3NRZ A; 5ALV A; 2WF6 A; 4NXZ A; 1SL1 A; 1RM6 C; 4FS2 A; 4KLO A; 3RBD A; 9ICB A; 2BCV A; 5J2J A; 5EWF A; 2KIV A; 2OXO A; 2P6R A; 4M9N A; 5KT3 A; 2XO7 A; 2XY6 A; 4IR1 A; 2Y9U A; 3N4M B; 4YMO A; 2GO7 A; 3FYH A; 5AKX A; 3IP4 B; 5KAF U; 4BDP A; 1XSP A; 5J2C A; 2ZXI A; 5AKL A; 1NJX A; 2KN7 A; 5ALI A; 5EWE A; 4F4Z A; 4P2H A; 2Y0S C; 4UB1 A; 2DPI A; 2WTF A; 4BGD A; 2JV3 A; 5AI8 A; 2G07 A; 3SAG A; 1L7M A; 1S97 A; 3BQ2 A; 4I2A A; 8ICQ A; 5ALX A; 1KW4 A; 1X9S A; 2ASL A; 4IQV A; 4I2I A; 3HT3 A; 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4YP3 A; 1U9L A; 3O0F A; 1XO0 A; 1NKB A; 5KT4 A; 1X2I A; 4DFD A; 5F9L A; 4Y2Y A; 1KSP A; 3EYZ A; 2JEI A; 1PK1 B; 2BR0 A; 1KRP A; 3KKA C; 8ICK A; 4F5N A; 4MF2 A; 3A0H U; 2ZIV B; 1N5W A; 3GDX A; 1IXR A; 4J9Q A; 2L5Y A; 2R8I A; 5HNK A; 2W9C A; 1V85 A; 3RJG A; 4BWM A; 4NLN A; 2RQ5 A; 3V7J A; 8ICV A; 4RUC A; 2DKZ A; 5EE1 A; 5CWR A; 3OJS A; 4IRC A; 2NYV A; 3SEN A; 4QZG A; 1PZN A; 5KFD A; 3FC4 A; 2RHF A; 2BCU A; 2I6X A; 3Q8Q B; 2ZIW A; 3RTV A; 1JXE A; 5EE3 A; 3Q8P B; 2C2E A; 1SB3 C; 2JHD A; 2F76 X; 2MSN A; 3Q8L A; 1S0M A; 1D9F A; 3KHH A; 1PVQ A; 4KLH A; 5KT7 A; 3Q8S B; 5JTI A; 1LVH A; 4YG2 A; 2C2R A; 2D8C A; 1T3Q A; 4M6W B; 2LMR A; 4UB5 A; 1A77 A; 2G5I B; 3MGH A; 2WHE A; 2WF8 A; 2A19 A; 3SI8 A; 4BJQ A; 5ALK A; 2HBL A; 4RQ6 A; 4EBD A; 3RB0 A; 5KFT A; 4J9P A; 2A1J B; 5KG0 A; 2R8G A; 4J9N A; 2HMX A; 3ALR A; 1NZB A; 2K4I A; 1JUD A; 1ZQJ A; 2YTU A; 2XY7 A; 1NK6 A; 4ELT A; 1MQ3 A; 4IS7 A; 2PFN A; 1COO A; 4C8O A; 3PX6 A; 4J9L A; 5CJ7 A; 2XGP A; 4DF8 A; 5L9X A; 4C0Z A; 3M6K A; 2FMP A; 5EE9 A; 9ICE A; 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