1LL4A

Structure of c. immitis chitinase 1 complexed with allosamidin
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
392
structure length
392
Chain Sequence
GGFRSVVYFVNWAIYGRGHNPQDLKADQFTHILYAFANIRPSGEVYLSDTWADTDKHYPGDKWDEPGNNVYGCIKQMYLLKKNNRNLKTLLSIGGWTYSPNFKTPASTEEGRKKFADTSLKLMKDLGFDGIDIDWEYPEDEKQANDFVLLLKACREALDAYSAKHPNGKKFLLTIASPAGPQNYNKLKLAEMDKYLDFWNLMAYDFSGSWDKVSGHMSNVFPSTTKPESTPFSSDKAVKDYIKAGVPANKIVLGMPLYGRAFASTDGIGTSFNGVGGGSWENGVWDYKDMPQQGAQVTELEDIAASYSYDKNKRYLISYDTVKIAGKKAEYITKNGMGGGMWWESSSDKTGNESLVGTVVNGLGGTGKLEQRENELSYPESVYDNLKNGMPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITINASE 1
publication title THE STRUCTURE OF AN ALLOSAMIDIN COMPLEX WITH THE Coccidioides IMMITIS CHITINASE DEFINES A ROLE FOR A SECOND ACID RESIDUE IN SUBSTRATE-ASSISTED MECHANISM
pubmed doi rcsb
source organism Coccidioides immitis
total genus 152
structure length 392
sequence length 392
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1ll4A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ll4A01
3L2LA 1QW8A 3B9AA 1PPIA 4PMZA 5D9PA 4CN1A 4LGXA 3AZSA 1HJXA 2J78A 4U3CA 1H41A 4NSBA 7TAAA 4LYQA 4IPLA 4PRWA 2QPSA 1UOKA 1JGIA 2XM2A 4JL1A 1E0WA 3CZ8A 1CPUA 5BCAA 3AXXA 1CZ1A 4OOZA 4QLLA 2A3HA 5ABEA 1QNPA 2EEXA 2DIEA 1EQPA 2PWEA 3AIWA 5M5DA 3PZVA 3A6OA 1QI4A 3BAJA 2Y4SA 1HKJA 1UH3A 2VRQA 1NH6A 4CN6A 1M7XA 2F8QA 3MV11 4D6CA 2V38A 4M1RA 4ZE4A 3DYMA 4Q7NA 2VR4A 1JAEA 1GORA 1V02A 2PI6A 1DWAM 4MJ2A 4UFMA 1JZ7A 1JYXA 4DWSB 3SCWA 3WDJA 3L4TA 2JF7A 1NWSA 4QLKA 4N0RA 2BFGA 3FNDA 5E9AA 3VUPA 4ATWA 2IXUA 1XRVA 2QLYA 4XX6A 4D6HA 5A2CA 1LQ0A 1E6QM 4QP0A 1UR9A 2BVDA 1CXKA 3WH5A 1LG2A 3CZLA 3D5HA 3VIIA 4HU0A 1PZ2A 3WFZA 3MUIA 1UUQA 3BSGA 1B1YA 4WIWA 4AZIA 4H7VA 4OKDA 1CDGA 4MB4A 1WB0A 4OBSA 3WF0A 1SMAA 3AOFA 3CO4A 2QMJA 4QCFA 3WNKA 9CGTA 4GQQA 1VBUA 4PTVA 1JD7A 4NI3A 3PZIA 3DC0A 4L4PA 1EO7A 4QCEA 2D20A 2ZUVA 2VX5A 2ESCA 2YDSA 4H8UA 4EAMA 3AIBA 3G6LA 3WQWA 1CLVA 2WC3A 1DWFM 4CN4A 1V3LA 4PEEA 3EYPA 3PZGA 1KBBA 3FHAA 3ZSSA 5A6BA 4U2ZA 5A6SA 3BCFA 1VENA 4AIUA 5BRQA 3CUFA 1UKSA 4M8UA 1D3CA 4CKQA 4KRUA 2W62A 4MDPA 1K9DA 2D22A 4ATDA 4B9YA 3CUJA 5I24A 3RCNA 1IV8A 2D0HA 4FLSA 5EFDA 3EDDA 1B2YA 4AD4A 1GHRA 4BQ4A 1C7SA 1E4IA 3WEOA 2J7EA 4AD1A 1TCMA 1KR1A 1TG7A 4UCFA 1PIFA 1WZKA 6CGTA 3K4DA 3VIPA 2WWDA 2XVLA 4WF7A 5EB8A 4W7WA 1OGGA 2GVYA 5DT7A 3WFLA 1J9YA 3AROA 2WLYA 1B31A 2DSVA 2G3JA 1FH7A 2W61A 5FKYA 4UTFA 1E43A 3GM8A 5JBFA 1U30A 4AZHA 2QHAA 4UNIA 3WDIA 3AHXA 5A6KA 1V03A 1GOIA 5LYRA 2D3LA 2EJ1A 4B9ZA 1CTNA 3PZOA 1EOMA 3W24A 3PBGA 3LPPA 2J8FA 4DWSC 3AZRA 1EQCA 1KXTA 3AS0A 3VMNA 4PMXA 5A8NA 3L4ZA 3ZQ9A 1WCGA 1BQCA 4MNKA 1HL9A 3UG3A 1PX8A 3ZT7A 1E6RA 1XH1A 2BV9A 3SCSA 3VGEA 4WSJA 2GSJA 1PZ3A 3FAXA 3BH4A 3BSHA 5A69A 4HA1A 3RJXA 4LXFA 1E3XA 1N82A 3THDA 2E0PA 3WQ4A 1HJWA 4P8VA 2GJRA 3TTOA 2TAAA 1OT1A 2D0FA 3WH6A 1Z32X 1UWSA 2J25A 2YOCA 1WAWA 3VDBA 3WDQA 1FH8A 2V5DA 2UY4A 5A6AA 1WDQA 1UKPA 2XSAA 4MB3A 1C91A 3AXHA 2EXOA 1GZJA 3ZJKA 1JYNA 2Y2WA 1UR0A 1JG9A 4AC1X 1VRXA 2QPUA 1ISYA 5C71A 5CG0A 1B3XA 3OZPA 2VCCA 2GDUA 2XPKA 1KBKA 1W3KA 1DP0A 1QHOA 2EPMX 3DYOA 1HP4A 1G94A 4P8XA 3SCRA 1CGYA 5AYIA 3AHVA 1KGXA 2BXZA 3AIRA 4RE2A 5HBFA 1E6SM 1G0CA 1PAMA 2F61A 4U5KA 4BZYA 4CVUA 4MJ4A 1V6YA 2ZUNA 1OT2A 4P7NA 3VX1A 1VEMA 3OB8A 4PTXA 3EMQA 4WSKA 3WUEA 3RM8A 1LLOA 3PN8A 1HVXA 1XD1A 1E9LA 1MW2A 3F5LA 3EDEA 1X1NA 3J7HA 1HKKA 4W85A 5CLTA 1IZKA 3PZ9A 4H2CA 5GNYA 2BY0A 2VX6A 1BG4A 4Z2JA 4JFVA 3AIQA 2J74A 5BXPA 3PZMA 3WKZA 3GXFA 2VCAA 4CCEA 1BVZA 1PEZA 3WDRA 3KL5A 2DT1A 1GQJA 2E8ZA 2WHJA 3JUGA 2Y8VA 3DYPA 1OSEA 2VNCA 1US2A 3NUKA 1UG6A 1QI2A 4UQ9A 1ISXA 2QV4A 1DHKA 1G01A 1MQQA 2X05A 4J3TA 1CXIA 4ZFMA 2E3ZA 1E55A 1L8NA 1EH9A 1ISWA 4Z2KA 5A2BA 1UR8A 1BYBA 3TA9A 5IXEA 2CBJA 1LWJA 1KGWA 4FMVA 2W63A 3WDPP 4UOQA 2ZXAA 2ZOXA 1JZ2A 3N13A 3O6AA 1SR0A 2NT0A 4RE3A 5E6ZA 1AQHA 5EBAA 2ZX7A 3MMUA 1OCQA 3WMBA 1PX4A 3ARZA 4ZXLA 1BFNA 2WHKA 5I6SA 2BVTA 4HA4A 1BGAA 4AXNA 2OSYA 4NZCA 3RM4A 4PMUA 1D7FA 3EBVA 1Q4NX 1NOFA 1EDGA 1HNYA 1WO2A 4UQCA 1BYAA 1OGSA 1OINA 2VTFA 2VQTA 3HMCA 4MB1A 4LX4A 5M17A 2DDXA 1BSIA 1DWHM 1ODUA 1QBBA 1WDPA 1UD2A 2AAAA 2E9MA 3QGVA 5CJ5A 1V6XA 1W9UA 4ACYA 2HVMA 3W25A 2C8NA 3CMGA 3IANA 1UZ4A 2EPLX 5DMYA 1CENA 4TUFA 3W53A 1H1NA 2X2YA 4AZ7A 3WEZA 3ZSTA 2JEQA 3WNLA 3WQ8A 3F5KA 4M24A 1E0VA 3SEPA 1JZ6A 3SURA 4TTUA 3UETA 2D3NA 1V6WA 1HJSA 3FXYA 3CUIA 2WMIA 5BWFA 1E72M 4HMDA 3ZJ8A 4AIOA 2BHZA 3ZT6A 3VIJA 1V6VA 1PBGA 4A4AA 4UFKA 2VO5A 2O92A 2E9LA 1LWHA 5IHSA 3MMWA 1CXEA 3ZMRA 1DWJM 4P8WA 4TX8A 4W89A 3W29A 5JH8A 2V3EA 2PF0A 4M81A 2XGIA 3CGTA 1E0XA 3GZAA 1XH2A 5BROA 1NWRA 2VX7A 4A3YA 3GNPA 1CBGA 3F5JA 3MANA 3VMOA 2XIBA 1XC6A 3MKKA 5AC5A 2O9PA 1VFMA 2V3FA 1S46A 2EBNA 4UFLA 1C8XA 2BY2A 4Z2LA 5ABGA 2F2HA 1JAKA 1AQMA 1ZU8A 1E5JA 3SCPA 2WB5A 5FD0A 1E4LA 1J11A 4JL2A 3CHFA 1KXQA 2GFTA 1CGWA 1JI2A 5LA1A 2FHFA 1O7AA 5JIPA 1TZ7A 3OLEA 4U33A 2VR5A 4D6DA 4C7DA 4R5EA 2WHMA 1NM9A 4M82A 3L4UA 1B3VA 1E5NA 1V02E 3OGVA 1OBAA 2ZXDA 3ZJ6A 5DFAA 3AZTA 1EGZA 5I78A 1QOXA 2EPNA 4FF5A 3DHPA 1KWKA 2WANA 5BXTA 4BQ2A 3WNMA 2BNJA 3KL0A 4TOQA 3W6MA 1IT0A 3W27A 2ZE0A 1UQZA 3OGRA 2ZX5A 3VILA 2VOTA 2WC4A 3IJ9A 4PMVA 4AIEA 2WVSA 3WNNA 3NSNA 4J27A 4JCMA 1MYRA 4JFSA 4AY1A 4E8DA 4B3LA 2OWXA 2YL5A 5D9NA 5JUVA 2YKKA 1TUXA 3N1AA 4FK9A 2VCBA 1PIGA 1UKOA 3EMCA 3ZM8A 4UQEA 4PBGA 4XUYA 1GPFA 2CEQA 4IUGA 2WC7A 1EDQA 1JYVA 4N42A 2WMGA 3VDCA 2VUYA 1NWTA 3K46A 2NW0A 1NWUA 5A1AA 2A3CA 5CLWA 2ZUMA 2D2OA 3S6TA 1E15A 1W9VA 1UYQA 4UOJA 3BLKA 1CXFA 1JXJA 3WN6A 3WBEA 2XSBA 5I0DA 2WMFA 4F8XA 1FHLA 4D6JA 3BC9A 1UWIA 2EQDA 4PUDA 3GH4A 3U5YA 3AICA 1E4NA 2WBKA 3VU2A 4HOXA 1V3MA 4PMQA 3W82A 1BYCA 3UR7A 1Y7VA 5E0CA 3ZIZA 1BTCA 4W8AA 1EDTA 3LMYA 2YA0A 3BGAA 3AYSA 2CHOA 5HXMA 3AMGA 5EMYA 1R87A 1FP8A 1E1FA 2CCRA 4ZEPA 4HOZA 3QOMA 1ZB5A 2Z1KA 4XZBA 4D6GA 1WDSA 3WMCA 5E6YA 1NQ6A 3I3BA 3UG4A 1HJVA 3VX0A 2B31A 1RD6A 1BGGA 3CZKA 1EA9C 1M53A 1J0HA 1V3JA 3BAWA 2CERA 4CGTA 2G41A 2CHNA 4UFJA 3WL1A 5HDRA 1VIWA 4HMCA 2BS9A 4HTYA 1GVIA 3WNPA 1BLIA 3ALGA 3K1DA 3VGHA 3RM9A 3WDHA 2WMIB 4XV0A 3VDHA 2VMFA 2IUZA 5CPSA 1XD0A 4NF7A 2V5CA 3VMPA 3WMSA 1XV8A 2J7CA 4AD3A 1C90A 5A8QA 3BAKA 1K9EA 4AD0A 1VFFA 3WUBA 1FP9A 2XUCA 1W32A 1JZ8A 4ML4A 3VGGA 3WF4A 1RP8A 3WUFA 3AHTA 3LPGA 1WZLA 2DH3A 4E2OA 1E6NA 2VT0A 1W1YA 1JDCA 3OZOA 2VRJA 4PYSA 1BG9A 1O6IA 3ZR6A 2G3NA 5I79A 1ITXA 1UD5A 3NJ3A 3VD7A 3SCQA 3K8MA 1QI0A 2VURA 1GQIA 3AMDA 2WVTA 4PMDA 1MXGA 2J79A 5I3DA 4BS0A 3B8SA 3WBAA 3OG2A 2FHCA 1FOBA 3MSGA 1JIBA 2FDMA 4JHOA 4P7QA 2GK1A 3GYCA 3MUAA 3FN9A 1OWQA 3VIHA 3ARTA 4HZ8A 1JI1A 1TA3A 1E4MM 3CPUA 3OLIA 2XWDA 2ZUUA 4BCEA 3ARWA 4MNLA 1UHVA 3OGSA 3ARYA 2DH2A 5E0FA 1VFUA 2GUYA 2FH6A 4TTGA 2IXVA 2WZIA 4M56A 1RH9A 4Z2GA 4TVCA 1ZBCA 2C7FA 2OYKA 2XG9A 3AYRA 3RILA 3HU7A 1V3KA 1ZS2A 1J01A 1UR4A 3TTYA 2PBOA 3KE0A 1E70M 2OSXA 4M29A 3AJ7A 1AQ0A 1UWTA 3WF2A 5IFTA 1QI3A 5CXPA 1FHDA 4MNJA 4GZJA 4B3KA 4J3XA 1GOWA 4P8UA 1H0GA 1R85A 1JF6A 4OBRA 3CLWA 4Z2IA 3PZQA 4KH2A 2OSWA 5A6JA 2WVVA 2BY3A 3VIKA 3MUZ1 3AS2A 2JFEX 5ECUA 3W26A 4B16A 4GI8A 1E6ZA 3PZTA 4KGJA 4S3JA 3N04A 4GINA 4UZSA 2CKRA 1HT6A 4HMEA 4FLRA 3GH5A 4NRRA 2Q8XA 4HOWA 2X8RA 3IJ7A 1GOOA 1Q6EA 3CHCA 4KWUA 1QVBA 3WD3A 1XH0A 5A2AA 3AIEA 2VVSA 3W28A 1JDDA 1W2PA 5BYWA 3VINA 1V3HA 1QI5A 3OBAA 2DSWA 2WBGA 1JD9A 3T2QA 1VJSA 4J3SA 4K68A 2WXDM 1HX0A 5A8MA 5FL1A 3K8LA 2ZXQA 1CYGA 1QNRA 3U57A 3L4WA 3GXMA 8A3HA 1F4AA 4UQBA 2DT3A 1UD3A 2ZIDA 4GKLA 4GPNA 5A8OA 2YL6A 3PZNA 2RGLA 5DF0A 4PUEA 3PTQA 1NOWA 1XCWA 4HU8A 1AMYA 3SCVA 4AD5A 4GZIA 4LYPA 4OIFA 1E3ZA 1KGUA 2YL8A 3CZJA 2BXYA 4R27A 3VIOA 1G1YA 3U7VA 1WKYA 5A3HA 1UA3A 3IJ8A 2Z1SA 4TVDA 2X0YA 4DUXA 3L4XA 3TTQA 3WNOA 4LQ1A 1TVNA 1U33A 3DECA 4CD5A 3VGDA 4FLQA 1H11A 1VAHA 1CXLA 4F9DA 3VDAA 3W4RA 3HJEA 1W1TA 1QHZA 1VEPA 3FHQA 3N17A 1UWRA 3APGA 3W38A 1W9PA 3AHYA 1V0NA 5GQBA 2D0GA 2X0HA 5A94A 1LF1A 1G9HA 3M7SA 1ZJAA 2NSXA 2PWFA 3K8KA 3VGFA 3WQVA 3GXIA 2XVKA 3CBWA 2BVYA 1QNOA 5TD4A 1X6LA 1MQPA 3UEQA 2W91A 4XZWA 3RMEA 1JF5A 4AISA 2GK1B 3SUSA 3CUHA 2BHUA 4W5ZA 2VI0A 5HPCA 3AQUA 1H4PA 4YPJA 4JFWA 3S2CA 2WPGA 1UQYA 1E6PA 2WKGA 1YHTA 4TVUA 2HISA 2UY3A 2W67A 2UWFA 1HP5A 3T0DA 4AWEA 4WK9A 3GTNA 3PTMA 2GJPA 1FH9A 2FHBA 3ARSA 1CGTA 1PJ9A 5HOSA 1B0IA 1ZL1A 3HN3A 1WPCA 4OZOA 3BAIA 2JIWA 3WY1A 3NDYA 3NSMA 1E1EA 1GNXA 1CEOA 3ARRA 3GXDA 2E4TA 3CUGA 3ARUA 1BPLB 1KXHA 4DUWA 4UOZA 5AY7A 4PSRA 4W88A 2YLLA 1TVPA 4WKFA 1UKQA 2WZHA 3I3DA 4U5IA 4GO9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1VBR A;  3BAX A;  3TON A;  1GJU A;  4W5U A;  2ZUT A;  1CNV A;  1HIZ A;  1BYD A;  3T0B A;  1EHA A;  2GDV A;  4MB5 A;  4OOU A;  3WEN A;  2AMG A;  2A3A A;  2WCS A;  2YJQ A;  4GXP A;  1EOK A;  1KR0 A;  2J62 A;  3WSU A;  2BHY A;  4PCS A;  3MU7 A;  2FH8 A;  1CLX A;  3ARP A;  1HN1 A;  5BXS A;  3W0K A;  2CKS A;  2XVP A;  2YIH A;  1B30 A;  2WM0 A;  2NT1 A;  2XGB A;  2VRK A;  3WD1 A;  2WYS A;  1HL8 A;  3IK2 A;  1CGU A;  1XSI A;  4UZU A;  3AHZ A;  3N15 A;  4NRS A;  2WNW A;  4EK7 A;  2D23 A;  4D72 A;  2O9T A;  1CWY A;  4RL3 A;  2W4X A;  4D1I A;  1V08 A;  5CPQ A;  3MS8 A;  1CGV A;  5LA0 A;  5LA2 A;  1US3 A;  5IHR A;  4AZG A;  4ACZ B;  1ZBV A;  3T2O A;  1GW1 A;  1V3I A;  3K4A A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FWJ C;  4DYE A;  1G6C A;  4CN1 A;  1Q45 A;  4FXS A;  3LCG A;  3F4D A;  4U3C A;  2C1I A;  3HBL A;  3KVJ A;  7TAA A;  4KKX A;  4IPL A;  4MG4 A;  1S2U A;  1RV8 A;  1JGI A;  2GLK A;  1CPU A;  2PV1 A;  3G0U A;  7ENL A;  2A3H A;  1QNP A;  3M0J A;  3O63 A;  2QJN A;  2I57 A;  3A6O A;  2Y4S A;  3CLM A;  3ZR4 A;  1C9H A;  1HQT A;  1KRB C;  1NH6 A;  2F8Q A;  3CEU A;  1YXC A;  4N4Q A;  4L1W A;  4IGM A;  4PBE A;  4WDT A;  3UWV A;  1TPH 1;  4DWS B;  3I4K A;  4HSO A;  4AIB A;  3SCW A;  3M0H A;  4N0R A;  2XP9 A;  2BFG A;  3M5Z A;  1LLZ A;  1UB3 A;  3TV8 A;  3HQO A;  5A2C A;  1SVD A;  1FKG A;  4QP0 A;  1UR9 A;  3WH5 A;  1CXK A;  4Q8N A;  3D5H A;  3VII A;  4FNQ A;  4MFE A;  4WIW A;  1K03 A;  3GAK A;  4OKD A;  4MB4 A;  1SFJ A;  5H6H A;  3CGN A;  3KWS A;  1X8C A;  3O1N A;  9CGT A;  1TSI A;  2G95 A;  2PDW A;  4NI3 A;  3PZI A;  3DC0 A;  4L4P A;  3VAV A;  3M5Y A;  2ZUV A;  1YRR A;  2PMQ A;  1F7B A;  2YDS A;  1UC4 A;  2NSO A;  1OK4 A;  2R1N A;  4EAM A;  3S5Z A;  3G1R A;  1DTN A;  3UWY A;  3QZE A;  3EYP A;  2A3L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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