1LOSA

Crystal structure of orotidine monophosphate decarboxylase mutant deltar203a complexed with 6-azaump
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
SRRVDVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGDPGETLRFADAIIVGASIYLADNPAAAAAGIIESI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords orotidine monophosphate decarboxylase
publication title Crystal structures of inhibitor complexes reveal an alternate binding mode in orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 80
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2002-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1losA00
1PV8A 4RXFA 1OFAA 4GJ1A 3UY7A 3S8HA 1A50A 3SR7A 5I3KA 3W7LA 3W2LA 4TU1A 3W07A 1RD5A 1D9EA 2E5DA 3KOFA 1F6KA 2BZNA 4UXDA 3NYZA 5C55A 3STGA 3W7PA 1B3OA 4O16A 3DKJA 3CIXA 2PRLA 2VFEA 4MJMA 3GDLA 4LT9A 1JUKA 1ALDA 4Z1BA 3TDFA 4DELA 2Q3RA 1LOQA 2O7SA 2J6XA 2ZA2A 4FX7A 4O19A 3P8JA 1FDJA 4GUHA 4ZQPA 3NQCA 1YLVA 3ABRA 4DO4A 3UWVA 1ZNNA 1K7XA 4A22A 1G6CA 1FDZA 1BTMA 3UY8A 5LHEA 3OG3A 1J4EA 2NWSA 3JS3A 3UXDA 3PS7A 3W22A 1XI3A 4JYDA 3TIMA 3HJZA 2YX0A 2CZEA 3A9IA 3B03A 4MYXA 3W2KA 2OX1A 3KVJA 5GVJA 5KTLA 1AK5A 1G4EA 4A29A 3L5AA 1A5CA 4ALDA 3TMLA 3NA8A 3NR0A 1M5WA 3W70A 1FWRA 1YTKA 2CW6A 4O4WA 4ZL1A 1ICSA 3ZFHA 1SFJA 4IMCA 4UTMA 1R30A 4P61A 1B4KA 3BLIA 2E09A 1EIXA 3M16A 1A5AA 1FXQA 4MVAA 1PL9A 3QSRA 2I14A 2CLEA 4Z1AA 1G4SA 2OJPA 3IIOA 3DHFA 4JS3A 1UASA 1IIGA 3LERA 1ME9A 5KZMA 4NZFA 2Z2UA 3B0UX 1HL2A 4DO6A 4WUIA 2Y7EA 2WSQA 3A24A 1TQXA 1ZAIA 2A7RA 1EB3A 2GQ9A 3LCXA 4AMAA 2NUXA 5K9CA 4R7JA 3NO5A 4XBKA 4O15A 3M5XA 4NZJA 4IPIA 4MPQA 1RV8A 4N9EA 5BRBA 4WXYA 2B7QA 3NQVA 1S5WA 3C2RA 5DCBA 3LTYA 3NZ1A 1LOSA 3S42A 2B4GA 1OABA 1MEIA 1R2TA 3FKRA 1ZENA 1SZNA 3DZ1A 5FEZA 4IMDA 4K7VA 3OVPA 2WPBA 1H5YA 1XCFA 5D30A 2H3DA 2V0TA 4XZ9A 3TQKA 1JCMP 4XTDA 1OYCA 5A8GA 4FNUA 1I2NA 5HWJA 3PR2A 5EBUA 4RZ6A 5I3HA 3P7YA 4LVGA 4CNOA 5AHMA 3GAYA 4I7WA 2QCDB 3M0ZA 4FX8A 2Z1BA 2ZBTA 3TC6A 1JR1A 1YDOA 7TIMA 5F4WA 5AB3A 4FXRA 1QWGA 5FEPA 3UPBA 2X1TA 3W1MA 3LCGA 1VCVA 4UTTC 5HJLA 3W75A 1S3HA 3O63A 4IGHA 4YMZA 2QCEA 1RPXA 3W7KA 1NF0A 1QPQA 3BARA 2DZWA 2GVGA 2Y63A 3GR8A 3ABSA 4FNRA 1FWTA 4FNTA 5LSMA 4X22A 3BLEA 1A5SA 3F1QA 4WOQA 1QPRA 4NJJA 3SFKA 1K3UA 2DU2A 4MY1A 4HSOA 5DLCA 1SO4A 4NNCA 3EX6A 1JULA 3L0GA 3AO0A 5F2IA 4NUWA 1KLYA 4JYEA 1XBVA 4DPQA 3G1SA 2QDGA 3QRHA 3G3DA 1JCYA 1OF8A 5LKYA 1NVMA 1V7YA 3HGSA 4IOTA 3CLMA 1O5KA 1FCBA 3P8IA 4N9BA 4UUIA 4WOZA 3B04A 1GZGA 4K6AA 2PRMA 3C0JA 4JTEA 1LRNA 3UNDA 3W2NA 2DZXA 4WQ6A 2TMDA 5CZTA 5T26A 2DZPA 2E5CA 4ORMA 3W7IA 3A21A 4O12A 1G7UA 2CFFA 3BO9A 3UWQA 3P62A 4S1FA 1EWEA 1GPWA 3UD6A 1AW5A 4S2BA 3V1PA 1TREA 4UFKA 3W85A 1PE1A 1QDSA 1LBLA 1PCWA 3B4UA 2ZQ0A 3CC1A 4IMFA 3EKLA 1X7FA 3GLCA 4IX0A 2YFNA 5FEXA 4MIMA 1L9WA 2C16A 4EIVA 4JTGA 4AWSA 1MXSA 4BR1A 2P10A 4GFSA 1SZEA 3A5FA 2DZVA 3C56A 3LBCA 4E38A 1PCKA 4UTHA 2IQTA 2JKPA 2EF9A 1LLZA 4PH6A 5HUPA 3R2GA 3LCFA 5D04C 3INPA 2O7QA 4OWGA 3C2VA 1O94A 1TPWA 4OU1A 1ZALA 1IXNA 4BK9A 1YTDA 2VC6A 2NX1A 3W1NA 3C4UA 5DCDA 3OEXA 2ABAA 4H6KA 2ZRXA 1DORA 1KM0A 1IXPA 3R89A 2TYSA 1KFEA 1LM1A 2YZRA 4GC4A 3EWXA 2V5LA 5FI8A 1OHLA 4IX2A 2DZTA 3ZWSA 4QAIA 1JCXA 1SSDA 1GT8A 1I2PA 4UFMA 4OQVA 1CX9A 1EUAA 4LVAA 3TXVA 3NQEA 3G18A 3CPRA 3G8RA 4UTJA 3LI1A 2G97A 3IIVA 1OFPA 5HQEA 2VEPA 1H7NA 3BG5A 5G2WA 1TYGA 4WY0B 3W9ZA 5G4WA 1EP1A 5K4ZA 3ATZA 4B5NA 1O5XA 4NJGA 2ZA3A 3GR7A 3NDOA 4UMCA 1KTBA 1FWWA 3UWZA 3TFCA 3T7VA 1WAUA 2AAMA 2FQIA 2JBMA 2E68A 3I65A 1PVNA 5LNRA 2V30A 4ZQMA 1OF6A 2XFWA 3SZ8A 4WXZA 1JUBA 4GNJA 1GJPA 4QITA 3QPZA 3VI2A 4UTIA 4DEFA 1U5JA 3EWBX 3LHYA 4IQLA 3N3MA 3FYOA 2Z6IA 3N9RA 4XUGA 3B8DA 3C61A 3G1FA 2V2DA 2ZTKA 1WX0A 1BWKA 3HPZA 3W6YA 3E49A 3P60A 1OFRA 1W56A 3ABOA 1SFLA 3TSBA 3NPVA 1GVOA 2CLOA 4E2DA 1XL9A 1L2UA 2ABBA 3M47A 4XKYA 4LY8A 3QQ0A 4AWTA 3DFQA 1DBTA 4Y6GA 4CNPA 4UFHA 1OFDA 1SSGA 3LV6A 2QUUA 3TCEA 3C2OA 3W73A 4PC8A 2DZSA 5CKSA 1H7PA 2NXGA 3SW6A 2HMCA 1YYAA 2Q8ZA 3CHVA 1F7BA 5CPOA 4FO4A 4JX6A 3GDMA 4LS2A 2BLEA 1T96A 2ZYFA 1V5XA 1DQWA 3THQA 1T99A 2BX7A 2XN0A 3M44A 1I4NA 5D2YA 3WK0A 3YPIA 5HWNA 4AXKA 4HNUA 1KM1A 2GOUA 5F4XA 3S0CA 1Q45A 1FX6A 5U7SA 4O18A 3KX6A 1S5TA 1VCFA 3M5ZA 4O28A 2J24A 3BLFA 4XWUA 4BI7A 3RFAA 4O57A 2GVJA 1TPDA 1VR6A 2ZZ5A 3DGRA 3P61A 5BNKA 5C54A 3HOJA 5KSWA 5DY2A 2Y62A 1HTIA 1E51A 1QO5A 1MEWA 3LXCA 3STEA 3I7SA 2C1HA 1F6PA 2NXHA 3EX2A 1VCGA 5AHEA 3S5NA 3IVTA 4DPPA 4JGDA 4OV4A 2BTMA 4AHQA 5G2IA 3CM4A 1IXOA 3WJWA 2B7NA 1W8SA 2J9XA 3OVQA 5HULA 3GNDA 4CLMA 3I6RA 3IIZA 3W1RA 1JQVA 2F7FA 3GVGA 2Y85A 4KFPA 4M6VA 3M43A 2NWRA 3P5YA 1IIHA 4UNLA 5DELA 4ZVJA 3MYPA 4UTWA 4O1DA 3W86A 5L9FA 4PL1A 4WY0F 1IXQA 2YSWA 5EPDA 4GUJA 3CQ0A 1GTEA 3W1PA 4IUOA 2GJNA 3TW6A 4ZQNA 4RJEA 4MLRA 4J9JA 1TV7A 2UV8G 4Q4KA 4RX0A 3W83A 5L6UA 2RHGA 3BVJA 2RKXA 5EKYA 1ME8A 4NVTA 3G0XA 1OYBA 2EGZA 1KV5A 1UJPA 1EUNA 1QOPA 2PCQA 5E0KA 5EYWA 2QEZA 4LU0A 1YXYA 2HS6A 4XTIA 3TQVA 2ZCGA 5E93A 3B0PA 1KBIA 3RU6A 3TMQA 3G3MA 4O10A 4Z0JA 3JR2A 3CWOX 1F76A 1RZMA 2VFDA 4Y96A 2QCMA 1C9DA 4O1BA 2V2CA 1TRDA 2H90A 3G1VA 2J27A 3UYCA 1JJKA 5AC6A 3UPWA 1W5OA 2ISWA 2JGQA 1JCNA 2H8ZA 3LLDA 4YL2A 2YR1A 5C6MA 4CCEA 3N14A 3VNDA 5D2TA 4NU7A 2B7PA 5G4EA 3LXBA 4MY9A 2GPTA 5LNWA 3STCA 1Z44A 2V5BA 3C3NA 2VKZG 4JN6A 4N6FA 5KINA 3QM3A 4E2BA 4JD4A 2VEKA 2X2GA 3G1AA 5AFDA 3E0IA 4X3ZA 2YGYA 4N9DA 1K7FA 4IWWA 3FYPA 5LZLA 3EXSA 3GDKA 3W87A 1EWDA 4JR5A 4LVDA 4NT0A 4EOUA 3NQ2A 2CLFA 1TCDA 3S9YA 1LDCA 1FY6A 2B7OA 3SGZA 1XM3A 4KFOA 1LCOA 3LCWA 1AMKA 1IGSA 1ZJIA 4JTHA 2QJIA 4HHPA 4GRSA 1WOBA 2RDTA 3N2MA 3WJXA 2QDHA 1VZWA 4LS0A 3VKJA 1RQBA 1SW7A 4AHPA 3W72A 1TSIA 2A0NA 4QM1A 1EEPA 3W2UA 3KAOA 3R5EA 3NPXA 3TC7A 4LV4A 2OT1A 4NJHA 2ZFAA 1KTCA 1I45A 3PUOA 4G1KA 3RF9A 5TQLA 1AW1A 2CLHA 3SGUA 5CGQA 3NQ6A 3P74A 3R13A 4M19A 4TO8A 5D09A 1H7RA 4Q33A 4YCPA 3PUEA 1TPUA 2WO5A 1W0MA 3PBVA 4A3UA 3MBDA 3C2EA 4PCFA 3QQ1A 1UB3A 3PG9A 1GVFA 1K03A 4FX6M 2EPHA 1G4PA 3Q37A 4OT7A 3TFXA 4ORIA 3NQAA 3W1XA 1H60A 1YXCA 3NM1A 1TIMA 1FUYA 3NQFA 2X30A 1ZHAA 2H3BA 1O4UA 5HUOA 3O6DA 3R8RA 4FNPA 1PHQA 3U6WA 4P2VA 1LP6A 5AN7A 2RDWA 1K8XA 4UNKA 3C52A 3TH6A 3EWYA 3O06A 4MYAA 2YXGA 2X16A 4O54A 1DV7A 4K7YA 5F2GA 3EWUA 3QYQA 3DENA 1FWNA 1SUXA 4JEQA 3LCLA 3PULA 4AF0B 2WQPA 4O0ZA 5EL1A 2OCZA 3O8AA 5ABTA 4LUIA 4AH7A 3O05A 3MI3A 1JRCA 5AHIA 1SO6A 3QFEA 4UC5A 5I3IA 1R46A 5CZSA 3HGOA 1VHNA 2Y7FA 4TX9A 4DO5A 4UTWC 4ZMGA 2DZUA 4JXCA 4NXKA 1BKSA 3IVUA 3FJLA 3PM6A 4UFJA 2WOQA 2NX3A 5AYZA 5FF4A 3QF0A 3BG3A 2A6LA 1FXPA 3SI9A 3W7GA 4JIPA 3HPSA 4NQ1A 2FPVA 1A5BA 2A7NA 3LBMA 4DXVA 1JCJA 1AW2A 1GG1A 4JTFA 3S5ZA 1KM6A 1K7EA 3NQ7A 3FFSA 1W3NA 2NV1A 4CNNA 3PSWA 3TSMA 4YXGA 3ABQA 1Q3NA 4UMBA 4FF7A 2Y70A 3MHFA 3W1LA 3HG5A 1TJRA 4JTJA 2QAFA 3N2XA 1TO3A 1F74A 1YXDA 4LVFA 1ICQA 1KLZA 1LBMA 1X8FA 4CCCA 4JTSA 2ZZ7A 1OFOA 5HINA 4NJKA 2GVLA 3H53A 4M5PA 4YCOA 3NL5A 1OX4A 1EP3A 5AYYA 4R53A 5LHFA 5IBXA 2OT0A 4ADUA 1QO2A 4WD0A 5D2XA 4IMGA 2J9ZA 5TIMA 1K8ZA 4Z08A 4D2JA 1WA3A 1PIIA 1S5VA 3V75A 1H50A 3DBPA 2FIQA 3PWAA 4UFIA 5H91A 4IXXA 3L68A 2A21A 1VLIA 1H1ZA 2X1UA 3FIGA 4RKAA 3TUUA 3M5VA 5K4XA 4GUIA 2A4AA 3NQDA 4LTSA 4UTKA 3SSJA 4W9TA 2QUVA 3LOTA 4PL2A 1M6JA 1ZY9A 2DORA 5FESA 4DF0A 1QAPA 4K8HA 3PUDA 3IRDA 1XXXA 2FFCA 2WSYA 4BI5A 3FA5A 2NV2A 4JICA 1H1YA 3T4CA 4N02A 2X1RA 4BFAA 3LHZA 1KM2A 1QOQA 1ICPA 4HNVA 5D38A 1OVDA 3N19B 2NX9A 4N9CA 1XBXA 2QCLA 3TW7A 2BXVA 4O53A 2QCNA 2FPTA 1IF2A 1Z41A 3U2OA 5LNSA 1XFBA 1W3TA 3OHIA 1SW0A 1N55A 3GDRA 2Y61A 5KMYA 2Y89A 1GWJA 3WJYA 5LNVA 4R33A 1GQNA 3IGUA 3OIXA 3S5OA 5I3GA 1DJQA 3DFSA 1KA9F 3VFLA 1THFD 4WX2A 4MZ1A 4JY8A 2QF7A 4ADTA 3MI2A 3FEMA 3G0SA 1XBZA 5F1UA 4DF2A 3LM7A 1YADA 3DFNA 3QMSA 4UMAA 1W5QA 3G1XA 3NL6A 1KW1A 1UUOA 4M6PA 2RFGA 3C6CA 3QW3A 4LNYA 3GB6A 3TNOA 1NEYA 1XDLA 5D37A 5CPLA 1WBHA 3W7DA 4GXMA 3W1TA 3W7EA 2NUYA 1GVRA 1VGAA 5F2LA 5FF0A 4I9AA 1J2WA 4LVBA 3KVLA 1EPXA 3GKFA 4X2RA 3K30A 3W74A 4K36A 1SW3A 4LWWA 4LUJA 5G1YA 3T44A 1QCWA 3WK3A 1W31A 4JTIA 3CTLA 3ANYA 2FJKA 1ZFJA 2ZZ3A 4U28A 4KWWA 8TIMA 1DJNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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