1LUGA

Full matrix error analysis of carbonic anhydrase
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic Anhydrase II
publication title Atomic resolution studies of carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
total genus 79
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2002-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1lugA00
2VVAX 3RGEA 1BNUA 4IWZA 4FU5A 4Z1KA 4L5VA 5BYIA 3S9TA 1CAOA 4QEFA 1JD0A 3RZ8A 2NWOA 3MNKA 1IF6A 1G0FA 1RAZA 1BN1A 4HEWA 3KS3A 1AVNA 1CALA 1KOPA 4QJWA 1Z93A 1DMXA 5JQ0A 1CNXA 3V3JA 4E49A 3S71B 4LP6A 6CA2A 5DOGA 4K1QA 4WR7A 4ZX0A 4YYTA 3NJ9A 1CAKA 3T83A 2EU2A 2NWYA 2CBCA 3W6IA 2HD6A 3M2ZA 3K34A 3P5LA 3U45X 4Q07A 3Q31A 1UGAA 1CNYA 1YDCA 1RJ6A 4YWPA 1CANA 1FSQA 1OKNA 4QK3A 4Q9YA 1BNTA 4Q8YA 1RZBA 3S75B 4Q90A 2NNVA 1THKA 1G4OA 2POWA 4Q7PA 5JDVB 3LXEA 5AMGA 3RLDA 5FL4A 3HKUA 4LHIA 4X5SA 5DSRA 1BZMA 3MMFA 3M5SA 5DSQA 2O4ZA 1I8ZA 4MO8A 5E2KA 4R5BA 4ITOA 5EH5A 1LUGA 3MNHA 1HEBA 4CQ0A 4MDLA 1YO2A 4Q6DA 4BCWA 3EFIA 1UGBA 4Q99A 5LMDA 1LG6A 4ZX1A 1BNWA 3P3JA 5EH8A 2Q1QA 5G0BA 4MDMA 3T5ZA 3V5GA 2X7SA 3P5AA 5AMLA 3MZCA 3HS4A 2WEOA 3V3HB 4BF1A 4YGKA 4Q08A 5JG5B 4PZHA 3F8EA 5FLSA 1ZSAA 2QP6A 4RFDA 4MDGA 4C3TA 3DD8A 3N4BA 3KLDB 4RH2A 5E2RA 5FNKA 3CYUA 4Z1NA 1RJ5A 4L5WA 3HKTA 3JXHC 4QTLA 5E28A 5EKMA 4K0ZA 1G54A 3ZNCA 4YGFA 4R5AA 4Z1EA 2FOSA 3B4FA 4Q09A 5L3OA 1YDAA 4RUZA 3B1BA 1HCBA 1G45A 1I9OA 2NXSA 4JSWA 4WW8A 4E4AA 4ZWYA 4ZWZA 1H9NA 1FQLA 2HNCA 4ITPA 2HL4A 1HUHA 5FNJA 3DCSA 3F4XA 1OQ5A 3UYNA 2WD3A 3TMJA 3SAXA 4E5QA 4KUYA 4Q49A 3S74B 4JSZA 5E2MA 3JXFA 5SZ3A 3MDZA 3RYXB 1I9QA 4RN4A 2CBEA 4Q81A 5J8ZA 2POUA 4Q7WA 4XIXA 3BL1A 2EZ7A 1KOQA 3T84A 4DZ7A 1OKMA 1TEUX 3TVOX 3DC3A 4PQ7A 1BN3A 1BNMA 1HEAA 4JSSA 3M98A 4Q87A 1IF8A 2HKKA 1CAMA 1IF4A 3SBHA 4Q6EA 3S73B 3ZP9A 3W6HA 3U47A 3SBIA 1YO0A 5SZ5A 5EHWA 4Q7SA 1BNNA 4ZWXA 1I9MA 2ILIA 3KNEA 3P58A 1UGDA 3DVBA 3M1QA 5A25A 5L6KA 5CA2A 3RZ7A 5FL6A 1BCDA 5JEGB 1G0EA 3HLJA 3M3XA 5DSMA 3RYJB 3M67A 3M1JA 4Q8XA 4CNWA 2AW1A 2Q38A 5G01A 4E9OX 5DVXA 3BL0A 3BETA 3IEOA 1CNIA 1T9NA 3M04A 4QSBA 2X7UA 5FNGA 1TBTX 3DCCA 4FVOA 3DD0A 3RYZA 1FQNA 3P44A 1CAZA 2NXTA 4LU3A 1ZSCA 2NNSA 4WL4A 5DSKA 4FPTA 5JQTA 3L14A 4YXIA 3DVDA 4QSAA 1CCTA 3IBNA 5FLRA 3RZ5A 3V7XA 2CBDA 2NMXA 4N0XB 3D93A 5DSNA 3N0NA 5C8IA 2HOCA 3UYQA 4KUVA 1G46A 3M2YA 1CNHA 4HU1A 3V3FA 3C7PA 5SZ1A 1CNWA 1ZFQA 2NN1A 3M40A 4HF3A 4QJMA 2QO8A 4HEYA 1TH9A 1CRMA 1CVDA 1CVCA 4KNMA 5BRVA 3S8XA 5BRUA 1F2WA 4WUQA 1LG5A 4JS6A 3RG3A 3CAJA 3RZ1B 3M1KA 4QK1A 3MHMA 2CA2A 3DBUA 1RZDA 4Q8ZA 1TEQX 3M14A 1I9LA 4RIUA 1BN4A 4QJOA 4E3FA 1JCZA 1HUGA 2Q1BA 2W2JA 4QSIA 4WW6A 3KOKA 1UGEA 1CAYA 1IF7A 4MLTA 4YX4A 1XEVA 3V2MA 4E3DA 1FLJA 4RFCA 2NNOA 3ML5A 4YVYA 4XIWA 5SZ4A 5FLQA 3FFPX 3KKXA 3RZ0B 1XPZA 5FLPA 5EIJA 4BF6A 1RZEA 1CINA 3FW3A 2F14A 1DMYA 3MNJA 3OY0A 1CILA 5BRWA 2NNGA 3M96A 1LZVA 3DVCA 3FE4A 2QOAA 5FL5A 4KAPA 3S78B 1ZGFA 1RAYA 4Z0QA 1I9PA 1TG3A 1CNJA 3M5TA 3DAZA 3EFTA 4MTYA 5G0CA 1HVAA 3QYKA 5SZ2A 3T85A 4KP5A 5DSIA 5FDIA 1UGCA 4CA2A 4QJPA 5FLTA 4RUYA 3TVNX 4RUXA 5E2SA 1KWQA 4M2UA 1TTMA 1Z97A 1G48A 4QJ0A 4Z1JA 3HFPA 2WD2A 3MNUA 3D9ZA 2NN7A 2NWPA 3CA2A 3HKNA 4HEZA 3OYQA 4TWLA 4CNXA 1Y7WA 1CCSA 2FNKA 2NWZA 4E3HA 3P3HA 3KWAA 8CA2A 4WUPA 5EH7A 3OIMA 3K7KA 3KONA 2CBBA 1ZH9A 3IBLA 4FIKA 4R59A 4PXXA 1YO1A 1FSNA 3KIGA 5EHEA 4IDRX 3VBDA 2H4NA 3M2NA 3DCWA 1I91A 1G6VA 2OSFA 1MUAA 5DSOA 2FOQA 1ZE8A 2VVBX 1CNKA 1CAHA 4KV0A 3U3AX 3PYKA 1TB0X 4N16A 2FMGA 2CABA 4KNIA 5DSLA 4QY3A 5AMDA 5JGSB 4Q83A 4E3GA 3P4VA 3NB5A 3R17B 3S76A 3D8WA 3RYVB 3IBIA 4G0CA 5BNLA 1G52A 3D0NA 5IPZA 3OIKA 2EU3A 5JGTB 4KNJA 1CA3A 3P55A 1A42A 3GZ0A 1IF5A 2IT4A 1G3ZA 4XFWA 5EKJA 5EOIA 4YGNA 4G7AA 1ZNCA 1ZSBA 1BICA 1KWRA 4QIYA 1KEQA 2NXRA 4L5UA 1AM6A 1YDBA 5DOHA 1XEGA 1EOUA 3K2FA 1H4NA 1LGDA 5E2NA 4KNNA 4M2VA 4UOVA 5EHVA 3DA2A 3MYQA 3S97A 3V3GB 1CVAA 1HCAA 1I90A 1CNGA 5CACA 2H15A 3SAPA 5E5RA 4ZAOA 1CNBA 1V9EA 2HFWA 3ML2A 3IAIA 4Q78A 3CZVA 1CVHA 4TWMA 4YGLA 1URTA 5DSJA 1UGFA 4CNRA 4K0SA 1BV3A 4K13A 1TE3X 1FR7A 1UGGA 3PJJA 5A6HA 3OILA 4CACA 4FRCA 2POVA 2FNMA 4CNVA 1ZFKA 4FVNA 3IGPA 3MNAA 4QIZA 2CBAA 4YXUA 2FW4A 2OSMA 3RG4A 4HBAA 3D92A 1V9IC 3OKVA 3S77B 2FNNA 5SZ0A 3V2JA 2X7TA 4YHAA 3T5UA 4ETQC 1FQMA 2WEHA 3JXGA 3MHOA 3RJ7A 1DCAA 2AX2A 5SZ6A 4QK2A 4RIVA 1CVFA 1FSRA 4MLXA 4COQA 3MWOA 3R16A 1XQ0A 5CLUA 5SZ7A 4M2RA 5CJFA 1CAIA 1FR4A 1AZMA 1BNQA 1TG9A 12CAA 5JG3B 3DV7A 4Q06A 2WEGA 1MOOA 3N3JA 2ZNCA 1CA2A 1JV0A 1HEDA 3OYSA 4QSJA 1CVEA 3N2PA 5JESB 1Z9YA 1G4JA 4PYYA 4XZ5A 4KP8A 4PYXA 5FLOA 2FOUA 1IF9A 1I9NA 2GEHA 3PO6A 4FL7A 2FMZA 2FOVA 1FQRA 1G53A 1YDDA 5FNLA 5EKHA 4QJXA 1HECA 4ZWIA 5FNIA 5EZTX 5FNHA 3F7UA 1DCBA 4Y0JA 2GD8A 3MHLA 3T82A 1CCUA 1CNCA 1RZAA 4DZ9A 2WEJA 1RZCA 5JEPB 1G1DA 5HPJA 4M2WA 4XE1A 4YGJA 3OKUA 3MHIA 5FNMA 7CA2A 1CZMA 2ABEA 3M1WA 4YXOA 9CA2A 4Q7VA 1BNVA 3DC9A 3MNIA 3IBUA 4JSAA 3NI5A 3M5EA 5JEHB 5E5UA 1H9QA 1ZGEA 1CVBA 5G03A 3M2XA 3U7CA 4GL1X 3KOIA 4HT2A 5FDCA 1OKLA 1CAJA 3RYYA 3V3IB 1CRAA 2FOYA 4HT0A 1J9WA 3MHCA 4ILXA 4K0TA 1CIMA 4Q0LA 5DRSA 3F7BA 3HKQA 3S72B 5DSPA 4KUWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VVA X;  3RGE A;  1BNU A;  4IWZ A;  4FU5 A;  4Z1K A;  4L5V A;  5BYI A;  3S9T A;  1CAO A;  4QEF A;  1JD0 A;  3RZ8 A;  2NWO A;  3MNK A;  1IF6 A;  1G0F A;  1RAZ A;  1BN1 A;  4HEW A;  3KS3 A;  1AVN A;  1CAL A;  1KOP A;  4QJW A;  1Z93 A;  1DMX A;  5JQ0 A;  1CNX A;  3V3J A;  4E49 A;  3S71 B;  4LP6 A;  6CA2 A;  5DOG A;  4K1Q A;  4WR7 A;  4ZX0 A;  4YYT A;  3NJ9 A;  1CAK A;  3T83 A;  2EU2 A;  2NWY A;  2CBC A;  3W6I A;  2HD6 A;  3M2Z A;  3K34 A;  3P5L A;  3U45 X;  4Q07 A;  3Q31 A;  1UGA A;  1CNY A;  1YDC A;  1RJ6 A;  4YWP A;  1CAN A;  1FSQ A;  1OKN A;  4QK3 A;  4Q9Y A;  1BNT A;  4Q8Y A;  1RZB A;  3S75 B;  4Q90 A;  2NNV A;  1THK A;  1G4O A;  2POW A;  4Q7P A;  5JDV B;  3LXE A;  5AMG A;  3RLD A;  5FL4 A;  3HKU A;  4LHI A;  4X5S A;  5DSR A;  1BZM A;  3MMF A;  3M5S A;  5DSQ A;  2O4Z A;  1I8Z A;  4MO8 A;  5E2K A;  4R5B A;  4ITO A;  5EH5 A;  1LUG A;  3MNH A;  1HEB A;  4CQ0 A;  4MDL A;  1YO2 A;  4Q6D A;  4BCW A;  3EFI A;  1UGB A;  4Q99 A;  5LMD A;  1LG6 A;  4ZX1 A;  1BNW A;  3P3J A;  5EH8 A;  2Q1Q A;  5G0B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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