The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
CYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
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| publication title |
Changing protein backbone topology: Structural and dynamic consequences of the backbone cyclization in SH3 domain
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
6
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-06-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UFF A; 2GQI A; 1ABQ A; 1GFD A; 2LNH B; 1E7O A; 1PKT A; 2K7A A; 5IHN A; 1W1F A; 2KT1 A; 2A08 A; 2LJ0 A; 1A0N B; 3KFV A; 1SHG A; 1SHF A; 5L23 A; 4JZ3 A; 2BZ8 A; 1VA7 A; 2FRW A; 1E6H A; 2RMO A; 2DL5 A; 2M51 A; 3VS0 A; 4LNP A; 1YCS B; 3NPF A; 1AVZ C; 2KRN A; 3VS3 A; 3THK A; 1GCQ C; 1B3Q A; 1VYV A; 2CUD A; 3ULR B; 2JT4 A; 2CDT A; 4LUD A; 2HSP A; 4OMN A; 2C0O A; 1RI9 A; 2ED1 A; 4HVV A; 2D1X A; 2GBQ A; 2EGC A; 3H41 A; 1QKX A; 1NM7 A; 3UA6 A; 3PVL A; 1AEY A; 1MV0 B; 1ZSG A; 1GCQ A; 2L0A A; 1K76 A; 1FYN A; 4K11 A; 1WFW A; 1TUD A; 2RQR A; 1T0J A; 3I35 A; 1YP5 A; 1G2B A; 4DEX A; 4J9B A; 4AFS C; 2HEQ A; 2D8J A; 2J05 A; 1WLP B; 3VS7 A; 2DF6 A; 2ENM A; 2LCS A; 2ABL A; 4AFZ C; 2K3B A; 2QDL A; 1AOJ A; 2MOX A; 4E6R A; 1YWO A; 4CC4 B; 4OML A; 2BZY A; 2EYZ A; 2JMA A; 4EIK A; 2YUP A; 2RF0 A; 1UGV A; 2RQV A; 4Y92 A; 1SPK A; 1SRM A; 2F2X A; 1M8M A; 1ZX6 A; 1WXB A; 3EHR A; 3REA B; 4OMP A; 1ZBJ A; 2VWF A; 2EVR A; 2OAW A; 2K9G A; 4LUE A; 4CC3 A; 1I1J A; 4HCK A; 2KR3 A; 2KXD A; 2O88 A; 1M3B A; 1IO6 A; 2YUO A; 3EG0 A; 4JJD A; 1AWW A; 2DL7 A; 1WDX A; 2AKK A; 1UEC A; 2EQI A; 3RBB B; 1G83 A; 1J3T A; 3EHQ A; 4J9G A; 2F2V A; 4KRT A; 1UJY A; 2GGR A; 1PRL C; 2SRC A; 2DBM A; 3VS6 A; 1T3L A; 2L3P A; 1UUE A; 2HDA A; 5IH2 A; 2YT6 A; 2EW3 A; 4J9F A; 2JW4 A; 1OV3 A; 2EPD A; 1U3O A; 2L3S A; 4M4Z A; 2L3Q A; 3VS2 A; 2JXB A; 3QWX X; 3O5Z A; 4IIM A; 2DVJ A; 1HSQ A; 2CSQ A; 2MCN A; 1ZUY A; 1PWT A; 4Z8A A; 5ECA A; 1UDL A; 2AK5 A; 3EG1 A; 1GRI A; 2KNB B; 4RTV A; 2J6K A; 4AG2 C; 5FWB A; 2KRS A; 2PZ1 A; 1ARK A; 1H3H A; 1WXU A; 3GBQ A; 1NG2 A; 1K9A A; 1KJW A; 3VS1 A; 2YUN A; 1JO8 A; 4AG1 C; 1Y57 A; 1H8K A; 2C0I A; 1OOT A; 2K6D A; 4J9C A; 3SHW A; 1M3A A; 2E5K A; 1EFN A; 2DIL A; 1UE9 A; 3I5S A; 4ZNX A; 1NYG A; 1OEB A; 3IQL A; 1U5S A; 4J9D A; 2KGT A; 5GJV B; 1CKB A; 1T0H A; 2DL3 A; 2M0Y A; 2LZ6 B; 3EG2 A; 3CQT A; 2DX1 A; 4R0K A; 5I11 A; 2EKH A; 4F16 A; 2FEI A; 2VVK A; 5EC7 A; 2F2W A; 4DEY A; 1X43 A; 2KBT A; 1PRM C; 4RUG A; 1LCK A; 1K0X A; 2H8H A; 1SSH A; 1NEG A; 2LQW A; 2RQT A; 1YNZ A; 2DL8 A; 1QCF A; 1WA7 A; 2O2O A; 4GBQ A; 1X27 A; 2CUB A; 2KT8 A; 2DA9 A; 1K1Z A; 3JV3 A; 1AWJ A; 2DMO A; 2EBP A; 2KEA A; 2SEM A; 4IIO A; 1VYT A; 1ZUK A; 2RQU A; 1I07 A; 1K0S A; 3M0Q A; 4F14 A; 4GLM A; 2JM9 A; 1VYU A; 1NYF A; 4OMO A; 4Z89 A; 1N5Z A; 2LX7 A; 1QWF A; 1UTI A; 1Z9Q A; 2P4R A; 1GBQ A; 1M27 C; 2GNC A; 1TG0 A; 1HD3 A; 5IHI A; 2VKN A; 4ORZ A; 1ZLM A; 3RNJ A; 2J6O A; 2JS0 A; 3H0H A; 4CC7 A; 2FPE A; 2RPN A; 3NMZ C; 2JM8 A; 1GBR A; 1QKW A; 1X69 A; 4J9I A; 2RNA A; 2LJ3 A; 3ZL7 C; 1ABO A; 4JZ4 A; 1V1C A; 1GCP A; 4J9H A; 1KIK A; 1X2K A; 1GFC A; 3TSW A; 1HJD A; 2EYX A; 1WX6 A; 2W10 A; 3PE0 A; 1PKS A; 1NLO C; 1JXO A; 2DL4 A; 2K79 A; 2NWM A; 3NGP A; 4FSS A; 4JJC A; 3LH5 A; 2HBW A; 2O31 A; 3NHN A; 2FPF A; 3M0U A; 1B07 A; 3REB B; 2X3X D; 1SRL A; 1UHF A; 2CSI A; 3QWY A; 2KRM A; 1YWP A; 2DRK A; 4HVU A; 2DBK A; 1WXT A; 5I22 A; 2EYW A; 1KSW A; 1NEB A; 3H0F A; 1YN8 A; 2LJ1 A; 2OJ2 A; 3VS4 A; 1OPL A; 2CH4 A; 2J06 A; 2KE9 A; 4RTU A; 2KRO A; 2XMF A; 4Z88 A; 3TSZ A; 1H92 A; 2L2P A; 4RTW A; 2AZV A; 1E6G A; 2FG0 A; 1BBZ A; 4D8D A; 1AZG B; 1I0C A; 1AZE A; 4RTT A; 2DM1 A; 2DLP A; 2FO0 A; 3PVQ A; 2ECZ A; 3A98 A; 1PNJ A; 1WYX A; 2O9V A; 2K2M A; 2J6F A; 2DRM A; 2D8H A; 1BB9 A; 2AZS A; 4J9E A; 1TUC A; 3UF4 A; 1W70 A; 2JS2 A; 2KYB A; 2ED0 A; 4AFU C; 2YUQ A; 2IIM A; 4JPB W; 2A28 A; 2EGA A; 1MV3 A; 1RLP C; 1T3S A; 4OMM A; 1M3C A; 5IHK A; 2BTT A; 5HCK A; 1X6G A; 5IXB A; 5FWC A; 1NLP C; 2PNI A; 2YDL A; 2AKL A; 2BZX A; 2CH4 W; 3EG3 A; 1QLY A; 1MUZ A; 1QWE A; 1ZUU A; 2GTO A; 2EYY A; 2J7I A; 2DJQ A; 2MIO A; 1BU1 A; 1PHT A; 1X2Q A; 3U23 A; 2KYM A; 2HCK A; 3UAT A; 1S1N A; 2C0T A; 1W6X A; 2GTJ A; 1JQQ A; 2G6F X; 1JEG A; 2DNU A; 1Z9Z A; 2FRY A; 1AD5 A; 3VRY A; 1M30 A; 3VRZ A; 3TVT A; 4OMQ A; 1JXM A; 2PTK A; 4A63 B; 1UJ0 A; 2ESW A; 1XOV A; 1AWO A; 2B86 A; 1BK2 A; 2LQN A; 2O9S A; 4RTY A; 4RTX A; 2FPD A; 4LE9 A; 3M0S A; 2RQW A; 1UHC A; 3SEM A; 2NUZ A; 2A37 A; 3FJ5 A; 3M0T A; 2LMJ A; 5FW9 A; 2W0Z A; 1RUW A; 2X3W D; 2D0N A; 3I9Q A; 2CT3 A; 1WI7 A; 1Y0M A; 2RN8 A; 2I0N A; 2A36 A; 2CT4 A; 4HXJ A; 3M0R A; 2LP5 A; 4QT7 A; 4WCI A; 5IXF A; 4AFQ C; 2KXC A; 3EGU A; 2DYB A; 2ROT A; 2CRE A; 1CSK A; 2V1R A; 2V1Q A; 1AWX A; 3UA7 A; 4JJB A; 1UG1 A; 4X1V A; 4D8K A; 3VS5 A; 2OI3 A; 1RLQ C; 2DE0 X; 3R6N A; 1FMK A; 3I5R A; 1WIE A; 1U06 A; 3H0I A; 4RTZ A; 2JMC A; 4LN2 A; 3M0P A; 1KFZ A; 4ESR A; 2YSQ A; 5GJW B; 4CC2 A; 3C0C A; 4HVW A; 4F17 A; 1JU5 C; 1GL5 A; 1X6B A; 1SEM A; 1K4U S; 2EGE A; 1CKA A; 2JTE A; 1OPK A; 2ROL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Q86 R; 1ABQ A; 3OYM A; 2LNH B; 2K4Y A; 1SG5 A; 1W1F A; 1JBM A; 4KH1 B; 2A08 A; 2LJ0 A; 1PM3 A; 2Y4Y A; 1MMD A; 1P92 A; 5I21 A; 5LJ3 h; 2BZ8 A; 1VA7 A; 2RMO A; 3CPF A; 1RAC B; 1Y07 A; 3QDR B; 1YCS B; 3A8L B; 1W2B A; 1WGS A; 3NPF A; 2RD1 A; 3VV0 A; 1F1B B; 1D1A A; 3WXM B; 1VYV A; 3ULR B; 4FYW B; 4M78 B; 4ME7 A; 2CDT A; 4LUD A; 1YJW A; 1TUG B; 3CC2 A; 4F7U E; 4J7I A; 1VQO A; 1VQL Q; 1YIJ T; 3HSB A; 2E6N A; 5FU6 C; 2MWO A; 1KHI A; 2RQR A; 2ZPH B; 5KYY B; 3HRU A; 2DZC A; 2RI3 A; 2HEQ A; 2FZC B; 1OZ3 A; 1VQK A; 1WLP B; 4J6Y A; 4FT2 A; 3UWN A; 1N9R A; 2K3B A; 1AOJ A; 2O4X A; 4EPC A; 1C0M A; 1YWO A; 3TEE A; 2BZY A; 2EYZ A; 2NUT A; 2RQV A; 2Y90 A; 2HNI A; 1O9S A; 1BIA A; 3SFM A; 5DM7 R; 3EHR A; 1WXB A; 1OU8 A; 5CKF A; 1Q82 R; 3REA B; 2DKG A; 1ZBJ A; 2VWF A; 1YCY A; 2DAQ A; 3CD6 Q; 2OAW A; 3G1J A; 5FLX E; 4E2F B; 1QVG A; 3CME Q; 3MHX A; 1TTH B; 4HT8 A; 4HCK A; 4ZN1 A; 4HCZ A; 3OA6 A; 3CC2 T; 1M3B A; 5M9O A; 2YUO A; 1VQO T; 4E7K A; 3VYH B; 3RMQ A; 2AKK A; 4F7U G; 1UEC A; 2QQR A; 4PJM A; 4NS5 A; 4J9G A; 2X4J A; 3WVD B; 2DD5 A; 2GGR A; 1W2B P; 1FMV A; 2E10 A; 2DBM A; 4J7F A; 2E70 A; 5A0D A; 1T3L A; 1VQK T; 1UUE A; 1C6V X; 2YT6 A; 3A8H B; 2EW3 A; 4JRP A; 2BIV A; 2HMA A; 2L3S A; 4M4Z A; 2EYQ A; 4M77 C; 2QQS A; 4IIM A; 2DVJ A; 2RI2 A; 4DBR A; 4FM4 B; 3SDZ A; 3JCM Q; 2HBP A; 2WAC A; 1ZUY A; 4FL6 A; 4C0D C; 4R55 A; 5ECA A; 2RA2 A; 4C92 F; 4QVZ A; 1BYM A; 4AG2 C; 5GAN 2; 3OYF A; 4EMG A; 2KRS A; 4D6W A; 5GAN h; 2JJ9 A; 1KHC A; 4J5Y A; 1YFN A; 1WXU A; 2DVE A; 4X9C A; 4C8Q E; 1G3S A; 1K9A A; 1MMN A; 2X51 A; 1KJW A; 2X4Y A; 3VS1 A; 2PQW A; 2C0I A; 2XK0 A; 3JRZ A; 4M7A E; 4BD3 A; 1YJN A; 4AMC A; 7AT1 B; 3I5S A; 2GF7 A; 4OGE A; 4ZNX A; 5LJ5 g; 4LDU A; 2KVQ G; 3IQL A; 1U5S A; 4MZM A; 4DOV A; 2KGT A; 1YIJ Q; 1CKB A; 2DL3 A; 2MWP A; 4X9D A; 1YHQ A; 1QVG P; 1RAE B; 3QHS A; 4BE1 A; 2ZPF B; 3EH2 A; 2FEI A; 4WTO B; 2DET A; 2PVO B; 4XU1 A; 1X43 A; 5FRM A; 1PRM C; 4M75 A; 4RUG A; 4IUR A; 4BY6 C; 2EJF A; 5AYF A; 1WA7 A; 2XDP A; 1TSF A; 1JJ2 S; 4GBQ A; 2KT8 A; 2DA9 A; 5DY9 A; 2CZ0 B; 2YRC A; 2DMO A; 4CI0 C; 3E9G A; 4C8Q G; 1I07 A; 1JRI A; 1NYF A; 1LPL A; 2JN0 A; 2KQW A; 3AHU A; 1Z9Q A; 4LD6 A; 4M7A G; 3CC2 Q; 1TWB A; 1WHH A; 1VQO Q; 1G3W A; 2E4H A; 2H3E B; 2OTL A; 2CS7 A; 4C0F A; 2DIG A; 5J3B A; 1YHQ T; 2YRD A; 3D7S B; 2RHI A; 2JS0 A; 3OW2 A; 2RO0 A; 1QKW A; 4J9I A; 1ABO A; 4DA4 A; 1GCP A; 1VQK Q; 4J9H A; 1KQ2 A; 3E1S A; 1RAD B; 1IZ6 A; 1WX6 A; 1PKS A; 1NLO C; 3WVE B; 2K79 A; 1V29 B; 5HY6 A; 3NGP A; 3CXC A; 4JJC A; 1K9M C; 1I5L A; 1I81 A; 1KQS P; 1WQ7 A; 3REB B; 1MND A; 3QUI A; 1BI2 A; 2KRM A; 3H6Z A; 2DRK A; 1D3B A; 2EWN A; 3H0F A; 1YN8 A; 2CH4 A; 1VQ7 T; 2J06 A; 3L2Q A; 2QQA A; 2VC8 A; 2XMF A; 2K5I A; 4RCC A; 3M57 A; 3MPU B; 2LCL A; 3UT1 A; 2OTL T; 1E6G A; 1VQP A; 4MDX A; 1I0C A; 1RAA B; 2GCX A; 4RTT A; 3PVQ A; 1WHL A; 4OB0 B; 2BKD N; 2J6F A; 4MML A; 1BB9 A; 3URG A; 4XQ3 A; 4J9E A; 4Q5W A; 3V8K A; 3QDF A; 2E5Q A; 1SF9 A; 4F7U B; 5FU7 C; 3HTR A; 2KYB A; 3CCQ A; 2E41 A; 4IKF A; 4KUI A; 3F70 A; 2IIM A; 1PC0 A; 4JPB W; 3CCE A; 3MEA A; 2L8D A; 3EAE A; 2XD0 A; 5FU7 B; 1KC8 U; 2F69 A; 2HKQ B; 2YXY A; 5HCK A; 5IXB A; 2DXB A; 2AKL A; 2BZX A; 3GLX A; 1QLY A; 3OYY A; 1K8A C; 1QWE A; 1ZUU A; 2J7I A; 5KYX B; 2DJQ A; 3A8M B; 1BU1 A; 4M7A D; 3INZ A; 2NUP B; 2YHT A; 2HQE A; 3G6E A; 3L2Z A; 1S1N A; 4A53 A; 1W6X A; 1JQQ A; 2G6F X; 1KC8 R; 4L59 A; 4EMH A; 2DNU A; 2COY A; 1Z9Z A; 3CCM A; 2QTV A; 1VQP T; 4LDY A; 3RER A; 1UJ0 A; 2ESW A; 1XOV A; 2RJC A; 3CXC P; 1TS9 A; 2B86 A; 3P8H A; 2DIQ A; 2LQN A; 2O01 E; 4RTY A; 4RTX A; 2FPD A; 2JTF A; 3G71 T; 2BE9 B; 4EMK C; 3SEM A; 1UGS B; 2RB6 A; 4M7D A; 3M0T A; 1UGQ B; 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1G2B A; 2RK2 A; 4DEX A; 3S6W A; 3EFO B; 4BI8 B; 5GMK l; 2XI9 A; 4PFP A; 2QGF B; 4KGX B; 2LX9 A; 1VQP Q; 1KD1 C; 3OYE A; 4V2S A; 5CAI A; 2WSF E; 2ENM A; 3HL8 A; 2LCS A; 4AFZ C; 1G3T A; 1WQW A; 4BDZ A; 1K9M U; 4BE2 A; 2MOX A; 1IRX A; 1ZHI A; 3E19 A; 2KK4 A; 4DBH A; 3VUZ A; 4OML A; 3G71 Q; 2JMA A; 4PLL A; 2QYZ A; 4OGC A; 2RJF A; 1D0X A; 1SPK A; 3CCQ Q; 1K9M R; 1KQ1 A; 4Y91 A; 2HQH A; 1C1A A; 2E6Z A; 2XU8 A; 5GAM g; 2EIF A; 1I1J A; 3ER0 A; 2HQX A; 3L2U A; 5GAO q; 4MZP A; 1AWW A; 1R8O B; 2DL7 A; 3GNG A; 3MJX A; 4QQ6 A; 1RI0 A; 4XK8 E; 3EHQ A; 4A4K A; 3CCM Q; 4KRT A; 3CCS A; 4J6W A; 1PRL C; 1IGQ A; 1QVF A; 2HL3 A; 3VS6 A; 3NFC A; 5LJ5 d; 1H3Z A; 2HDA A; 5IAY A; 5IH2 A; 2IVW A; 4J9F A; 1U3O A; 4DQ2 A; 2K2V A; 5GAN 6; 3FLG A; 2E3I A; 2JXB A; 3O5Z A; 4A4G A; 4II1 A; 2FZK B; 4JUV A; 2CSQ A; 3CCJ T; 3M56 A; 4Z8A A; 2KI7 A; 4NL3 A; 1I5O B; 2JVV A; 1WHG A; 4B9W A; 5C6S A; 5LJ5 e; 2J6K A; 1D1B A; 5LJ3 g; 1H64 1; 5FWB A; 1K8A R; 1NJI C; 5I2S A; 4IUU A; 1ARK A; 2YUN A; 4AG1 C; 1H8K A; 1OOT A; 3FJP A; 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